4F82A

X-ray crystal structure of a putative thioredoxin reductase from burkholderia cenocepacia
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
171
structure length
171
Chain Sequence
HHHMIQVGDALPDAQLFEFIDDAREGCTLGPNACSVRDQVAGKRVVIFGLPGAFTPTCSAQHVPGYVEHAEQLRAAGIDEIWCVSVNDAFVMGAWGRDLHTAGKVRMMADGSAAFTHALGLTQDLSARGMGIRSLRYAMVIDGGVVKTLAVEAPGKFEVSDAASVLATLTS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title X-ray crystal structure of a putative thioredoxin reductase from Burkholderia cenocepacia
rcsb
molecule keywords Thioredoxin Reductase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Burkholderia cenocepacia
total genus 46
structure length 171
sequence length 171
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4f82A00
2XBIA 3HD5A 3CMIA 5IMAA 1SD9A 4OWYA 4POMA 4ML1A 1SENA 2C3TA 1H75A 1XZOA 1JZDA 3US3A 1ON4A 1GTBA 4PURA 2VIMA 1SD8A 2J9HA 1A2JA 1USBA 5CRDA 4ZB6A 5KEJA 2FNOA 2I9HA 4PX1A 3CRTA 1XVQA 4KW6A 2GTUA 3LGCA 2RUEA 1DE1A 3FYGA 3KZQA 1TRUA 5CAXA 1ERVA 2JSZA 4TKYA 3EMXA 4EF0A 3GSTA 1R7HA 2YOIA 1M9BA 3APQA 1PRXA 3DKSA 3F3RA 1PL1A 5IPHA 2IMFA 4KB3A 1KTEA 4I2UA 1G6WA 4PQIA 2PPTA 1AXDA 3E3EA 1K0MA 2VLUA 4ZILA 2ON5A 1X5DA 1GSFA 1T4ZA 4MH2A 3QOUA 4EVMA 4OD7A 5ECOB 1A0RP 5KN2A 2IFQB 1A8LA 5B6MA 2LQQA 3DMLA 4D73B 3ZIJA 2K8SA 5LCZA 3PGTA 2DJKA 1JFUA 4DSQA 3UVTA 1RW1A 2OKAA 3KH7A 3QAVA 1EP8A 3IAM2 3GKMA 1PX6A 1GSUA 3EVIA 1FG4A 3UL3A 4IGJA 4IP6A 4WETA 2HZFA 3F6FA 3FKFA 2PN8A 1OAZA 2H6ZA 4DEJA 1LU4A 1J08A 2BTOT 1OYJA 2N5AA 5DVBA 1ML6A 1ZYQB 2JSYA 1Z6MA 2NDOA 3IHQA 1EV4A 3D4TA 2H74A 1T4YA 5ECKB 4TRXA 3OR5A 4ECIA 3ISOA 2L57A 4G2EA 3A2VA 3GURA 3PINA 14GSA 1Z9HA 2FA4A 3VURA 2H75A 4GSTA 2FY6A 2CV4A 1K0DA 2C3NA 5DCGA 2O7KA 2HRNA 1SK1A 4K7IA 1ABAA 5DALA 4TVEA 2LKUA 2WCIA 2B1KA 3TKPA 3VPQA 4I2TA 4GRFA 3U6VA 2LS5A 3HJOA 4N10A 3HJMA 3IDVA 3EU4A 2HE3A 2YZHA 3TJBA 3HZ4A 2DJ0A 2R5GA 4GQCA 1GSDA 3EYTA 3FR9A 3LG6A 1X5CA 2C4JA 3FZ9A 3GA4A 1U6TA 2H70A 3UVHA 4OFMA 4GTUA 2HXKA 4HOJA 1G7OA 2OA7A 2M72A 3O6TA 2F51A 1TDIA 4WBJA 2AHEA 1PMTA 2GZZA 3M3MA 1ZGNA 3TOUA 1PQNA 1QXHA 1SYXA 5EY6A 2X8HA 5JCWA 4O32A 1PN9A 1TRVA 1WPIA 1E2YA 4PQHA 5D9XA 3R2QA 2H73A 3C71A 4GWRA 3CBUA 3H4KA 2LUSA 4CW9A 6GSSA 1FVKA 4QL9A 1AC1A 1Z5YE 3DWVA 4GSSA 2CT6A 4O7HA 2FUG2 6GSYA 3D0ZA 3W8JA 5DAKB 5CNWA 2MMOA 4HU9A 3HVVA 3FW2A 1QFNA 3KTBA 4NAXA 3KM6A 5A4WA 4GF0A 2LNTA 2OE3A 3ZVJA 1EOGA 4LL1B 5AIXA 4ZL8A 3C7MA 3CTFA 1B9XC 1X9WB 1XOBA 3EC3A 2GT5A 3KH9A 5IOXA 16GSA 1ST9A 3GKKA 5GZZB 4CHSA 3K8NA 4RQRA 4PNGA 2R37A 3UBKA 5J3RA 3FY7A 5F06A 1YF1A 3ZLPA 2E0QA 2LTKA 1XWKA 5AGYA 3UMAA 5DJLA 5GAND 2YWNA 5IIZA 1OC3A 3LQ7A 4TR1A 2F8FA 3TKRA 4NMUA 3GH9A 2VO4A 2P31A 4OCEA 4YQUA 5ENUA 1VGLA 6GSTA 2BMXA 4GQFA 5G1LA 2PWJA 2HSHA 2B5XA 1GLPA 2L59A 2LJAA 4F0CA 2TIRA 1T7PB 4EKZA 1UN2A 3CSHA 5ABRA 2VL9A 4K2DA 4KSOA 4BA7A 5IMVA 2PVOC 1M2AA 1GTUA 3DEXA 2B7KA 3C1RA 3ZRDA 1AW9A 1AQXA 1B4PA 1HYUA 2AUVA 3W6GA 3FHKA 3H79A 3ZMLA 1PL2A 1YZXA 2LJKA 1WE0A 2FA8A 1DBYA 1QMVA 1F3AA 1HNBA 2IPAA 4IJ3A 3LXTA 3HA9A 1F2EA 3GX8A 1GSQA 4H86A 3GYKA 2VCWA 3I6AA 4KA0A 1K0AA 5ECLB 4MLYA 2C3QA 5ECMB 5GSTA 1MDKA 3RHBA 3CRUA 3GX0A 4N30A 2WB9A 5D8IA 3C73A 2FHEA 4X1UA 3ERGA 4N0ZA 4PUFC 2FLSA 1EWXA 1PGTA 2IMIA 2K9FA 5IO0A 4PGTA 4DVCA 2IFQA 3TUEA 5ECIB 4K8MA 4D73A 4F82A 1YQ1A 3ZTLA 3P8WA 3HHVA 1HNCA 1G7EA 5B8AA 1IYIA 3EURA 4GSNA 3I43A 2JACA 2GVPA 3WGDA 2X64A 3DVXA 17GSA 1CQGA 2G2QA 3QCPA 3P90A 3IK9A 3NZNA 4K1FA 2M80A 2IIYA 4POBA 2QKEA 1TRWA 5D9WA 3L9VA 1O85A 3D22A 2H30A 13GSA 2FD3A 2AV4A 3J7Yb 4NPBA 5LD0A 2B6MA 4NXIA 4KCAA 3J7Yk 5G31A 4AJ6A 3APOA 1TOFA 3DD3A 3QPMA 4TR0A 4KNDA 3GHAA 3NOFA 2GGTA 3ERWA 2GQLA 1SK0A 3HZ8A 1VF4A 4MZBA 4OO5A 1KBNA 1WP0A 5FHIA 4IKHA 3E9JB 3UAPA 1WRYA 2ZNMA 2ON7A 4HZ4A 5KN1A 1K0OA 3EINA 3FEUA 5ELGA 1C72A 4POLA 2CX4A 1TJDA 4FH8A 5DBQA 5LNKe 3FR6A 1EGRA 4K0NA 4KDUA 3F4RA 1MD4A 1ZZYA 1QGVA 4YQMA 1TU8A 1GL8A 1OKTA 1BEDA 4BL7A 4KX4A 1JLVA 3DYRA 4KAEA 1Q98A 5C00A 1OC9B 3GV1A 4NHWA 5B8BA 2K18A 1TI1A 5J9CA 2VL2C 3G7IA 1R4WA 3A2XA 1M99A 5F07A 1K3LA 4OO4A 1B48A 4L5LA 4F03A 3KP9A 5CRHA 3F6DA 1M2BA 2R3XA 4K0GA 2GQMA 5D9TA 2C0EA 2CAIA 5JWOB 3SWLA 5D73A 1JZRA 4WF4A 2F3MA 1I9DA 1M2DA 2V32A 2XC2A 3RPPA 3L78A 1JZOA 2X8CA 2ALBA 2V2GA 3LXZA 2HZEB 2BJXA 4MABA 5H5SA 3GSSA 5HR3A 4XRDA 1NM3A 3ED3A 4TOPA 2V1MA 4JRRA 3DRNA 5HFIA 1GUKA 2V6KA 2V6OA 5JCUA 4KE3A 5DAKA 20GSA 2NBSA 4DSSB 1VF3A 2CVKA 1WJKA 4OFNA 4ZXGA 4I6XA 4EO3A 1YKAA 1GNEA 2VCTA 1GSYA 1KEBA 4HQZA 4I8BA 3TDGA 4ZBDA 4RQXA 2YV9A 4Q5NA 2DJ3A 4MA9A 2R4VA 3KGKA 2YZUA 1DUGA 1X9SB 2IWTA 3E0UA 3LEFA 4DSRA 3KEBA 5KN0A 3AY8A 3ME8A 1XWCA 4BWSA 2RLIA 1EZKA 2EIRA 3WGEA 2PERA 2E2GA 1XFLA 5EL8A 4QQ7A 3F8UA 3BOAA 4HI7A 1JHBA 2YN1A 3QD9A 3HKRA 4JBBA 4ZL7A 2CZ2A 2H0HA 5IQYA 2OACA 3TJJA 1BQ7A 2LQOA 4HJ2A 4O5RA 4ULXA 2C8UA 3IOSA 3KP8A 4K7OA 3TKSA 4MP4A 1MDJA 1CQHA 2XHFA 4NV5A 4I5QA 2B5EA 1M9AA 4ID0A 5ECPB 1XW6A 3FZ5A 1V57A 1AIUA 1B9YC 2FWFA 4KDYA 2YCDA 4ZIJA 5ECSA 3TB2A 3TKSE 4YQVA 3GL3A 4IJIA 4EUYA 3VWVA 1O6JA 2H8LA 2VD1A 3L9SA 4POKA 5DJMA 4LMVA 3D4MA 3IXRA 2E7PA 3RPNA 2I81A 3GN3A 2OE0A 2NPBA 4MPGA 3ZMKA 2YJ7A 2A2SA 3VWUA 2GQKA 4IHUA 6GSXA 1O8XA 4TR4A 2RM5A 2FWGA 4V1Ag 4JR6A 2DSAA 4MCUA 2EIQA 2KP2A 3HXSA 2AAWA 4EXJA 1GNWA 3FRCA 5G1KA 2H6XA 1V9WA 4G19A 2DBCA 8GSSA 2KHPA 5GAPD 5IM9A 12GSA 3M8NA 1M0UA 3TCOA 4FO5A 2WULA 1OKDA 4RI7A 1TK8B 1SYRA 4N0VA 3GKXA 4V2NA 4XS4A 2A2RA 3CTGA 1GUMA 1A2MA 4X0XA 5INYA 2J23A 5D93A 3H1NA 4PQ1A 3F4SA 4XIHA 2FWHA 3WGXA 1YEXA 2N5BA 1GWCA 1N2AA 1OE8A 1VF1A 4ECCA 2CQ9A 2LEGA 4KUNA 1QUWA 2B3SA 3IC4A 4ZB8A 3L4NA 4L0WA 4F2IA 4WKWA 2GDRA 2VLVA 1N8JA 2VL2A 2Z9SA 2YP6A 1HNAA 4X43A 2VCXA 2AJQB 3H8QA 3D5JA 4Z7XA 3IK7A 2C0DA 5IOWA 3HYPA 4AF2A 2WDUA 1T3BA 4XRAA 1FHEA 1FB6A 2RUFA 4BPYA 4TR3A 1NW2A 2H01A 2H19A 4TW5A 3QMXA 4EC0A 3O76A 1R5PA 3UOMA 3TOTA 3LSZA 5IMZA 5G5EA 3PR8A 3BCKA 4IW9A 1GUHA 2PGTA 4MZCA 2QGVA 4YAVA 4MPFA 4L5OA 4V1Ap 2LJRA 1OC9A 5AIVA 1ZOFA 4JU5A 4MH3A 5G30A 1GP1A 1BJXA 2TRCP 5HFGA 1WMJA 2QC7A 1U88A 1K3OA 2I3YA 5HFKA 4RI6A 2I1UA 2LRNA 2O87A 1M7TA 2HYXA 3DIEA 1FOVA 4YH2A 4NV2A 4MJCA 4MJEA 4IP1A 4WEYA 1GLQA 3VFIA 3KCMA 1YF0A 2HZEA 1PA3A 1GH2A 1YDKA 3MAKA 2P5RA 5IMCA 3RBTA 2H72A 1K0CA 5KN3A 3IE3A 4GCIA 2IN3A 1MEKA 1AUCA 2IMDA 4MDCA 4DSSA 1EP7A 4J57E 2DIZA 5DALB 2VD0A 5DCHA 2WGRA 1VRSD 5L71A 4HS1A 5ELAA 3LYKA 4EE0A 1SJZA 2IL3A 2TRXA 4V2MA 3ZZXA 2JZTA 2F9SA 1PX7A 3RHCA 2KUCA 6GSWA 3VWWA 3FZAA 1EGOA 3V1WA 1MD3A 4FYUA 2HI7A 3M9KA 3HDCA 1XVWA 4IELA 2H71A 3ZVJD 3D21A 2YNXA 3DGQA 1SK2A 3ZREA 5D96A 2OADA 1T8EB 1THOA 4BVXA 1O73A 4ZL9A 5JWQB 3GRXA 3M9JA 3EE2A 5JWRB 2WJUA 2P5QA 3L0HA 2YWMA 1ZCPA 2IMEA 4TXOB 4AGSA 1R5AA 1GSEA 2X8GA 5JCGA 2FWEA 3LYPA 3A3TA 3A5WA 2VAFA 1Y25A 3P2AA 1IYHA 5EVOA 4TXVA 2LV3A 4Q5RA 1Z7PA 5ECRB 1G0TA 4L0UA 4HJMA 4NHZA 2QSIA 4AJ7A 3RDWA 1V98A 1EV9A 2XBQA 5IMFA 1TK5B 4WR5A 2GS3A 1ERWA 2H76A 3DXBA 5A4VA 3GUSA 2L4QA 3HVSA 1TK0B 1R26A 2EC4A 3FK8A 2O85A 3MWHA 3PH9A 3Q74A 2GSRA 3RAZA 2LSTA 2DJ1A 4IS0A 4KGIA 3JCML 2VCQA 3D6IA 2PMTA 2DJ2A 2X99A 2XPDA 18GSA 2AB6A 3IAS2 3BD2A 4Q5QA 3M1GA 2DJJA 2DLXA 3TRXA 3TJFA 2EIOA 1RK4A 2OE1A 1F9MA 4HQSA 4PUAA 22GSA 4OFTA 1O7UA 5EPFA 3TJGA 4GXZA 1SJIA 1TRSA 2MBTA 1XXUA 1XWBA 4G9HA 1B4QA 3WYWA 1UC7A 5D9VA 5HR0A 3F9UA 1XCCA 4P3YB 1U3IA 1X5EA 3LWAA 4OCFA 4XS6A 5CO3A 2N5FA 1PKWA 5CP1A 4ISDA 1JLWA 2VM1A 5G5FA 3ZITA 1J0FA 2IJYA 2KP1A 3I9V2 4MF7A 7GSSA 2MBSA 1O8WA 3TGZA 2CA8A 1V40A 5J4UA 2B7JA 4K7NA 4K9ZA 4LMWA 5J41A 1OVNA 1AQVA 2PUKC 1SL1B 5ID2B 1OE7A 2L6DA 5DDLA 4EL1A 1WIKA 1UVZA 3HY2A 5B7CA 1WOUA 1XWGA 4HEA2 5HR1A 5ECHB 1SKRB 1K0NA 1TI3A 4IVFA 5CYYA 1NHOA 3M0FA 1SL0B 5CRWA 2HSYA 2LRTA 4MJBA 3KMNA 2L6CA 2GSTA 4AJ8A 1KNGA 2H1GA 4ECJA 1QK8A 2F8AA 4WR4A 2VM2A 4V2LA 2R6KA 2B5YA 3GFKA 2GSSA 2VOCA 4LL4B 1PD21 4O92A 1V2AA 4PXOA 1W4VA 5H5RA 3TRPA 1DE2A 4EDZA 2CAQA 6GSUA 2GT6A 3ZIVA 4JR4A 2JU5A 3GIXA 2VLTA 4FYCA 3TKQA 2RM6A 11GSA 2DMMA 1AQWA 3IA1A 4ACSA 4J2FA 3CSJA 5A5KA 3WD6A 1DSBA 5IO2A 4K6XA 3EWLA 2D2ZA 2HNLA 1ZYEA 3Q18A 3H93A 2YJHA 3HCZA 4ZBBA 5GSSA 4WF5A 3GTUB 3W8SA 1TXXA 2VCVA 3IRAA 2KLXA 2G0FA 2PU9C 3ZL5A 4JZQA 1T00A 5IPGA 3GNJA 4JE1A 2JADA 3LJRA 4KDXA 1GTIA 10GSA 2JL4A 1F3BA 1EEMA 1VF2A 1Z6NA 1G6YA 4IBPA 4BVYA 2B1LA 3QAWA 2P0GA 3KJYA 2H66A 2PVQA 3L9UA 3BCIA 3F3QA 1XBSA 3KXOA 3MNGA 6GSVA 1A24A 2O89A 1H4OA 2ZUPA 5A4UA 3Q19A 1SJ6A 2CZ3A 2MMNA 3GMFA 4TXOA 3C1SA 4GLTA 1TW9A 3NIVA 4HDEA 2LNSA 3CXGA 2A4VA 1ACVA 4MZWA 1ILOA 2ZCTA 4OMVA 2K8VA 3C8EA 1B8XA 1XPVA 4MF6A 2R2JA 4RUVA 5AISA 3VI7A 1FAAA 2IMKA 3MDKA 2YPMA 1ZMAA 4ECBA 2HRFA 4XCSA 2AYTA 5ECNB 5FT3A 3HVXA 3IV4A 1TU7A 19GSA 3FR3A 1SL2B 2YWIA 4FIWA 4IN0A 4E8HA 1FVJA 1A0FA 4CDOA 1ERTA 2GSQA 2WZ9A 3N5OA 2GLRA 4ML6A 1Z7RA 5DQYA 5COHA 1AAZA 1URMA 1UA5A 1GSSA 1K0BA 5J9BA 4XHMA 1BAYA 4HUAA 3F63A 4KCEA 5CRGA 2HT9A 3UJ1A 3MSZA 4F9ZA 2DIYA 1W89A 2H1BA 3WT2A 3I69A 4ILFA 3TRQA 1HD2A 1TP9A 3UARA 2VCZA 1LBKA 2O8VB 4QL7A 2FGXA 5C04A 5CREA 4YAPA 2H1AA 2C0FA 1EEJA 1FW1A 1JZWA 1FO5A 3QDNA 3ERFA 2MZCA 3F0IA 3KIJA 5F05A 3G9BA 1XOAA 2VL3A 5H5QA 4WXTA 3BBYA 3TJKA 3BJ5A 1A2LA 3Q6OA 1SKSB 1YJ6A 5B6NA 1BYEA 2L4CA 2WRTA 2RIIA 5E59A 2DC5A 3QFAC 3VK9A 1E6BA 4HU7A 1I5GA 4MJAA 2NVLA 3APSA 5F8BA 1BX9A 4G10A 2CX3A 3ZFBA 3QAGA 1Z3EA 1THXA 2CVBA 1U87A 2PBJA 1O81A 4MMMA 1SKWB 4TN8A 2OJLA 2WS2A 3EMPA 1S3AA 1BG5A 3FZ4A 2C80A 1QQ2A 1SU9A 1S3DA 3GKNA 2LRCA 1V58A 1A23A 2HLSA 5E4WA 9GSSA 5G2ZA 3ZFLA 1YKCA 1GTAA 4EDYA 5ID2A 1MTCA 3TKSC 2VUPA 5J5NA 4ZB9A 2CVDA 2JZRA 3P7XA 2H6YA 1K3YA 1A8YA 1OC8A 2ES7A 3F4TA 2K6VA 3GL5A 3A2WA 5AN1A 2YANA 3DVWA 1YEPA 1GULA 5DQSA 1YY7A 4KH7A 1MDIA 1GRXA 1PKZA 2YWOA 1NHYA 5HQPA 4KSMA 4N11A 1F37A 4XS4B 1XW5A 2MMZA 4PNFA 2L5OA 1ERUA 3N9JA 3UEMA 5F0GA 3UIWA 1XIYA 1WWJA 1NSWA 1U3AA 2C1YA 2NTOA 2V41A 4NWYA 4WBRD 2OBIA 3QR6A 2KOKA 2DMLA 4IQAA 3VPTA 3ME7A 4HZ2A 4Q5FA 4XS1A 1TTZA 4E8EA 2YV7A 3HJPA 2GZPA 2REMA 4LA1A 4XTSA 3LORA 3CSIA 2GZYA 2M46A 5FWGA 2XPEA 1S3CA 3KTLA 3O3TA 2JZSA 1J9BA 3CYNA 4L8EA 3VLNA 2WFCA 4BWQA 2FCHA 3IPZA 1Q4JA 4JEDA 2HFDA 2I4AA 1Y6EA 4J56E 1X9MB 3GTUA 5IMDA 1FB0A 4MF5A 3LFLA 2E2MA 1X0RA 3QFBC 3EU3A 2MYGA 3U5RE 4F0BA 3GH6A 1LJRA 3UBLA 1PSQA 3VI5A 4MK3A 1XWAA 4TR1B 3WT1A 2OBKA 1EOHA 2H0IA 1T1VA 3G7YA 2H1DA 2MMAA 1HQOA 4I97A 3IBHA 1ZL9A 4FYBA 1XW9A 3G7JA 5ECQB 3IR4A 2H0GA 3KMOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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