4FO5A

Crystal structure of a thioredoxin-like protein (bdi_1100) from parabacteroides distasonis atcc 8503 at 2.02 a resolution
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
141
structure length
136
Chain Sequence
KLTEGVNPGDLAPRIEFKASFHNQLGRYTLLNFWAAYDAESRARNVQLANEVNKFGPDKIAMCSISMDEKESIFTETVKIDKLDLSTQFHEGLGKESELYKKYDLRKGFKNFLINDEGVIIAANVTPEKLTEILKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a thioredoxin-like protein (BDI_1100) from Parabacteroides distasonis ATCC 8503 at 2.02 A resolution
rcsb
molecule keywords thioredoxin-like protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Parabacteroides distasonis
total genus 38
structure length 136
sequence length 141
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13905 Thioredoxin_8 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4fo5A00
4NAXA 4GSNA 5J5NA 2YJHA 1FAAA 1JZWA 4TR0A 1K0AA 1ZL9A 2E2GA 4X0XA 1TU7A 5ECPB 4WF5A 2MMNA 3HYPA 1F9MA 1V2AA 5GAND 5C00A 2KHPA 5DAKA 2YWOA 3TCOA 4TXOB 4MJEA 2LRNA 3RHBA 2KLXA 3FYGA 2H0GA 3DYRA 2LQOA 4XS1A 2N5AA 4RI7A 5ECRB 1SL1B 4ZB9A 4YQMA 4AGSA 3WGXA 1H4OA 1GTAA 2FA8A 5D9WA 1F37A 1NM3A 2JU5A 2YPMA 4RQXA 1T7PB 2E0QA 2DJ1A 4GF0A 2JADA 1EOGA 2CVKA 2VCQA 4ID0A 1QFNA 1THOA 2VL9A 1Y25A 3TJFA 1ZMAA 3BBYA 2AV4A 3ZFBA 2XHFA 4HQZA 2WDUA 3D0ZA 5F8BA 4IBPA 1HYUA 1MEKA 4YAVA 1GSUA 2RM5A 1QK8A 3GA4A 4PNFA 2B5YA 4QL7A 5KN3A 4JEDA 1SL2B 5IIZA 1X5CA 2MMOA 4J56E 4KCEA 1X9MB 4IP6A 5DCGA 1SYRA 1TK5B 1OAZA 2H72A 1M0UA 3GKXA 1NSWA 4WF4A 1ABAA 5CYYA 2IL3A 4DSRA 4QL9A 1I5GA 3C7MA 5CAXA 3I43A 3LQ7A 1B4QA 2RIIA 2H66A 1UN2A 3I69A 2WS2A 3ZMLA 5D8IA 3HJOA 1M9BA 2MBTA 5F06A 2H74A 5B8AA 2LNSA 1XW6A 4HS1A 2BJXA 4ML6A 1RK4A 3GRXA 2WGRA 2GSQA 2C0GA 3VWUA 1WRYA 2M46A 4GXZA 1OKDA 2JSYA 1K3LA 4XCSA 4EL1A 2YOIA 1KTEA 3U5RE 1ST9A 4MF5A 1FG4A 2CVBA 1FHEA 5E4WA 4MJBA 3IBHA 4D73B 3FY7A 2V6KA 2OE0A 1WPIA 4F0BA 3CTFA 4HOJA 2OA7A 5B8BA 2GQLA 2NBSA 1XPVA 1PKWA 1ILOA 3A3TA 2H70A 3P2AA 2H0IA 2HLSA 1R4WA 1E2YA 3C8EA 4HJMA 5GSTA 2JZRA 4HDEA 2DMLA 3VPQA 2GDRA 3UOMA 1FVJA 3IR4A 5LNKe 3D4MA 1ON4A 3KTLA 1T4YA 1O73A 4K2DA 4L0WA 2OJLA 4WKWA 1A2JA 1ZZYA 4ULXA 6GSVA 4JR6A 1U6TA 2GSTA 5CNWA 1X5DA 2VUPA 2IPAA 2H71A 2C3NA 2KP2A 3DKSA 4MLYA 18GSA 1Z9HA 3GHAA 2ON7A 1PX7A 5HQPA 3L78A 2P31A 2PGTA 2LNTA 4JRRA 3RDWA 2R4VA 5IPHA 2HT9A 3DGQA 1T4ZA 4KX4A 16GSA 1ZYEA 4V2NA 1WOUA 1SL0B 3OR5A 3EU4A 3RHCA 19GSA 3TRXA 2GQKA 4EVMA 1SU9A 2DJ3A 2QKEA 2PWJA 2VO4A 2VLTA 3TJBA 4DEJA 3P7XA 3E9JB 5DVBA 3EE2A 5HFGA 1K0NA 4J2FA 3MAKA 2GGTA 3VLNA 1EWXA 2O7KA 6GSYA 4GLTA 1GUKA 1YF0A 1F6MC 2CX3A 2AUVA 4Z7XA 2N5BA 3FZ9A 4ZXGA 2PVQA 4NXIA 1F3AA 3W8JA 4N0VA 1EGRA 5H5SA 3H93A 1GSDA 1JLWA 1YEXA 5DQYA 5J4UA 6GSXA 1JZRA 2P5QA 3VPTA 3EINA 3IV4A 3PGTA 1MD3A 1AXDA 5A4UA 2H0HA 3KZQA 1JHBA 4KUNA 2V6OA 2YV9A 1TRWA 1F2EA 3GMFA 5F05A 3F63A 3N5OA 1R7HA 4G10A 3LSZA 2YWIA 1DSBA 1XXUA 1YDKA 2HZEA 1GRXA 1YKAA 3GKNA 2YANA 4K0NA 5G1KA 5JCWA 3QDNA 3NZNA 1O8WA 1THXA 2I81A 3UVHA 4KW6A 1A8LA 2CX4A 3EC3A 2R5GA 1A2MA 4F2IA 1GUHA 2E2MA 1BX9A 3SWLA 1PKZA 2FUG2 5IO0A 2YZUA 1A24A 2DIZA 1J08A 4OMVA 1WJKA 4YH2A 2LRCA 1O6JA 3LXTA 1O85A 4LL4B 4CHSA 4DSSB 1M99A 3KGKA 1GNWA 4GTUA 4K6XA 4FIWA 4MDCA 2HE3A 4TVEA 3CSJA 2FWHA 1MDKA 3CBUA 2VCZA 3A2XA 2M72A 4PNGA 5D93A 1YY7A 2TRCP 4TXOA 9GSSA 4KGIA 2K18A 3CTGA 3GNJA 5C04A 2FWEA 3F6FA 3ERGA 5CRWA 3F4RA 2GT5A 4WEYA 2FHEA 3GSTA 5IMZA 1Z5YE 3Q74A 4GRFA 2CVDA 4NWYA 5ECMB 5DJLA 1TW9A 2FLSA 2YWNA 3UBLA 5IQYA 3KMOA 4FYBA 1BAYA 2PUKC 2VCVA 2L59A 2I1UA 3O76A 5IMCA 1CQGA 6GSTA 1KEBA 2PBJA 3BJ5A 1MTCA 4OFTA 4OFMA 1GTIA 2A4VA 1SJZA 1T1VA 3KMNA 1C72A 4MF7A 2DIYA 1WE0A 4OWYA 1A0RP 3GL5A 2VL2C 2B7KA 1OE8A 3GFKA 4MABA 2DJKA 3FW2A 20GSA 1ML6A 1TK0B 2H1BA 1G7OA 4TN8A 4HJ2A 1USBA 2N5FA 3IHQA 3EWLA 4EXJA 3FEUA 3C1SA 1EEJA 3VURA 5JWOB 3DVXA 4PGTA 4ECIA 5JCGA 1PD21 3GH6A 2K6VA 4GCIA 4XIHA 3FRCA 1M9AA 2HRNA 4KSOA 1PL2A 3IC4A 4I6XA 2C4JA 3TJKA 3KH7A 1T8EB 2AAWA 2X8HA 2WFCA 1FW1A 3PH9A 1XCCA 3G7JA 3ZRDA 4HUAA 2HSYA 2V41A 4TR4A 4KNDA 4HEA2 2WJUA 2CQ9A 2I9HA 5FHIA 1YKCA 4DSQA 3TRQA 1URMA 3M9JA 2DC5A 5E59A 4L5LA 3E3EA 1OC8A 4D73A 5B6NA 1AAZA 3LYKA 1PA3A 5COHA 1TDIA 4PXOA 3A2WA 3MSZA 4TRXA 2P0GA 4BVYA 6GSSA 3Q19A 1T00A 1XOAA 2LV3A 4GSTA 1VF2A 4I2UA 1CQHA 3HJPA 4H86A 3FHKA 2VLVA 2OBKA 4V1Ag 3LYPA 17GSA 5EPFA 2NPBA 4L8EA 1A2LA 4ZBDA 1GH2A 1Z3EA 2L6DA 1EV9A 3F4SA 2DJ2A 1OYJA 4IS0A 1I9DA 2XC2A 12GSA 3TOUA 4TOPA 4OCFA 3GKKA 1B48A 5LCZA 3GL3A 1SKRB 5AN1A 2DBCA 1PRXA 1GUMA 4I2TA 4HZ2A 2KP1A 2WRTA 3ZFLA 2RUEA 2WCIA 5JWQB 3ZTLA 2JZSA 1AQVA 2XPEA 5AIXA 3W8SA 4N0ZA 5IPGA 4I5QA 3UVTA 2X8CA 5LD0A 1BEDA 1X9WB 3VWVA 2ES7A 3QCPA 3HD5A 3ERWA 1ERWA 1XBSA 4TKYA 2JL4A 1AC1A 2FGXA 3MWHA 2IN3A 1EOHA 5CREA 3DXBA 2PMTA 4RUVA 4MPGA 1SK0A 2C80A 1G6YA 3ISOA 1EP8A 3I9V2 1SK1A 4OCEA 3QAWA 2CZ3A 2IMKA 1VRSD 3P90A 4NV2A 1FB0A 4Q5RA 5HFKA 4BVXA 2MYGA 1K0DA 1HNAA 4ECBA 4IJIA 3WT1A 1Z6MA 2LJAA 3KH9A 3VI7A 2FD3A 1HD2A 2F51A 4ECCA 2R2JA 2B1KA 3TDGA 1V58A 4E8EA 3DVWA 1Y6EA 3GURA 2H6ZA 1TJDA 3QOUA 5FWGA 13GSA 1U87A 5D73A 2G2QA 4XHMA 4EKZA 2LQQA 1TRSA 6GSWA 1G7EA 5IMVA 3A5WA 4HU9A 3GH9A 1XW5A 3K8NA 4KA0A 1GLQA 3NIVA 2L5LA 11GSA 4OD7A 4KDUA 1MDIA 4K7IA 5DQSA 3L9UA 3MNGA 5J3RA 1XWKA 4QQ7A 3CXGA 3GKMA 5A5KA 1BYEA 4LMWA 4RQRA 1M2DA 3EMPA 2C0DA 3ZITA 2VCXA 1Q4JA 4L0UA 2LS5A 4YQUA 4V1Ap 4DSSA 2O87A 1AQXA 2CAIA 4O5RA 3CSIA 5EVOA 3TKQA 1GTUA 2IFQB 2CA8A 1K0MA 2C3TA 2FNOA 4XS4B 4GWRA 3EURA 1SENA 4ACSA 3Q6OA 2HSHA 5IOWA 1RQMA 2HRFA 1PX6A 3G9BA 3LORA 4WR4A 2J23A 3CSHA 5HFIA 1PL1A 4MZCA 4AJ8A 3D21A 5ECSA 3HDCA 3D5JA 1TTZA 2L6CA 1GTBA 4ZL9A 2XBQA 3D6IA 5HR0A 4K7OA 3HCZA 3LXZA 1JLVA 3IA1A 1NHYA 5HR1A 4JU5A 2NVLA 4EE0A 1YJ6A 3L4NA 1V57A 2VLUA 2RM6A 3FZ5A 1Q98A 5ECOB 2OE1A 6GSUA 1VGLA 1XVQA 2CV4A 2X99A 1EP7A 3F3QA 2EIOA 2K8VA 4OFNA 1E6BA 2RLIA 5KN0A 2AYTA 3TKSA 1DBYA 1BQ7A 3HJMA 4TR1A 3M1GA 2FCHA 4MMMA 4JR4A 2AHEA 4CDOA 2VOCA 3U6VA 2JZTA 1UVZA 2H8LA 4IP1A 1EGOA 3KTBA 2IJYA 1K0BA 1OC3A 4CW9A 3F8UA 1B9YC 4HI7A 2GS3A 2H1GA 1ZOFA 3QD9A 3VWWA 3LGCA 3IRAA 3NOFA 2C3QA 1G0TA 1PSQA 4PURA 2HZFA 3QPMA 3ZZXA 3E0UA 1JZOA 3APOA 2YWMA 1FB6A 3ZIJA 1KNGA 2B1LA 4MPFA 4MK3A 2LUSA 3HVVA 2CZ2A 5KN1A 5F07A 1WWJA 5IMDA 10GSA 1O81A 1QMVA 2E7PA 4EF0A 5G2ZA 3LWAA 3IAS2 4GQCA 5ECNB 2AB6A 2VD0A 2IMFA 2A2SA 3HA9A 3V1WA 2LKUA 3VWXA 1ZGNA 4KDXA 5AGYA 4K9ZA 2H6XA 2MMAA 1W89A 2C1YA 4RI6A 1AW9A 2H01A 5CRGA 4IN0A 2LTKA 3TRPA 4OO4A 2OBIA 2PU9C 4IGJA 5HR3A 1S3AA 5IO2A 1TKDB 4X43A 3C71A 3BD2A 3O3TA 3QFBC 3JCML 3DIEA 5HR2A 1K0OA 1B4PA 3ME8A 1ERUA 1O8XA 2F3MA 4EUYA 4KAEA 2V1MA 1V98A 4NHZA 3GSSA 2PN8A 1GSQA 4F0CA 1B9XC 4MJAA 3RBTA 3HKRA 5CO3A 1SKSB 1G6WA 1V40A 3H8QA 3HVSA 3HZ8A 2HNLA 4ZB8A 2L4QA 1Z7PA 1A0FA 4N11A 1DE1A 1XFLA 1XVWA 4PUFC 3AY8A 3GV1A 2VIMA 3TJGA 2PPTA 2VM2A 3L0HA 1IYHA 4AJ7A 5IOXA 4XRAA 5JWRB 4TR1B 2DJJA 4KE3A 3I6AA 2GSSA 5B7CA 2MMZA 2R6KA 2L4CA 4GQFA 2O85A 4F82A 2GSRA 3WGDA 1X5EA 5G30A 3FKFA 2B5XA 4ZL7A 4F03A 5EY6A 1UC7A 4ZBBA 1IYIA 3ZMKA 1SKWB 3DD3A 5EL8A 4AF2A 4YQVA 1QGVA 4JBBA 5J9BA 1AUCA 4IW9A 5D9VA 1XIYA 3ZIVA 1FOVA 5GZZB 5G1LA 4K0GA 4MZBA 1MDJA 5CP1A 4TW5A 2VL3A 4MH2A 2QGVA 5G5EA 3S9FA 2IWTA 3KM6A 3KJYA 22GSA 3Q18A 1K0CA 1OC9A 2YV7A 5ECKB 3F0IA 4TXVA 2C0EA 3EVIA 2PERA 5IMAA 1JFUA 4Q5FA 3KXOA 3ED3A 3DRNA 5B6MA 1HNCA 1J0FA 3GTUA 3CMIA 2B3SA 5DJMA 8GSSA 2OE3A 5A4WA 5DBQA 5A4VA 2MBSA 5DALB 5JCUA 3CRTA 5D9TA 3F9UA 4K8MA 1NHOA 2BMXA 1DUGA 3TKRA 2H30A 2H73A 1A23A 2IMIA 2LSTA 4DVCA 4WBRD 2Z9SA 4WBJA 4K7NA 2EIQA 2H1AA 1R5AA 3TJJA 3TB2A 2JACA 4IELA 3QR6A 3KIJA 2QSIA 4HZ4A 2MZCA 3PR8A 4BL7A 3WGEA 3BCKA 3J7Yb 2C0FA 5D9XA 1YZXA 3F6DA 2GQMA 3RAZA 3HY2A 1HNBA 4ECJA 4HU7A 1MD4A 1YQ1A 5CRHA 2IFQA 1S3CA 1ACVA 1Z6NA 4LMVA 4LLRA 1F3BA 4XS4A 1KBNA 3M8NA 4F9ZA 4EO3A 2VAFA 3LJRA 3RPNA 5DCHA 2J9HA 3IXRA 2A2RA 2NDOA 4Q5QA 1N8JA 1K3YA 4PUAA 5ECLB 5IMFA 3C1RA 2B5EA 1SJ6A 2CAQA 2B6MA 1XWBA 4I8BA 2F8FA 1U88A 3R2QA 1M7TA 2VCTA 1WP0A 3H79A 5G31A 2IMEA 4KSMA 3L9SA 4IQAA 4PQHA 4YAPA 1T3BA 4ZL8A 2XBIA 5H5RA 3DWVA 4N30A 5ELAA 4POMA 3BCIA 14GSA 2C8UA 1OVNA 3D4TA 4NV5A 1VF1A 1OC9B 3UBKA 1SYXA 4IHUA 2L57A 4IJ3A 3ZVJD 2YZHA 2QC7A 4MA9A 4MF6A 2WB9A 2AJQB 2PVOC 3GYKA 3IAM2 4EDYA 1M2AA 1EV4A 1HQOA 2TIRA 2VM1A 4BWQA 5F0GA 1BG5A 2FWFA 1U3IA 4X1UA 3GTUB 3KEBA 5ENUA 3UL3A 1K3OA 3KD0A 2YP6A 4V2MA 2DLXA 5DAKB 1XWCA 4V2LA 4XTSA 2G0FA 4POBA 2V32A 2GLRA 2JSZA 1ERTA 4ZBAA 1AIUA 1RW1A 3D22A 2IIYA 4JE1A 3WYWA 3WD6A 2H1DA 1QQ2A 4LA1A 1GSEA 1TI1A 2GVPA 2TRXA 1XWAA 2HFDA 2RUFA 4G9HA 2BTOT 2X8GA 3G7YA 2WZ9A 1V9WA 1GP1A 3M9KA 3M0FA 4Q5NA 5DDLA 4ZIJA 1WMJA 1U3AA 3O6TA 3LG6A 1SJIA 3TGZA 3RPPA 2HXKA 3UJ1A 2XPDA 2GZPA 2OADA 1OE7A 4KB3A 4O32A 3WT2A 1OKTA 4IVFA 4ISDA 2YJ7A 1TRVA 4FH8A 3EU3A 1VF4A 4IQ1A 3ZYWA 3ZREA 4BA7A 1DE2A 2O89A 1BJXA 4JZQA 1UA5A 5J9CA 1W4VA 3HVXA 1Z7RA 1SD9A 4K1FA 2VL2A 2P5RA 3TUEA 1ZYQB 4EDZA 3F4TA 3ERFA 1R5PA 3VI5A 1PQNA 2GTUA 2LJRA 3C73A 1TI3A 4ZB6A 5AISA 4FYUA 3FR3A 3KP8A 1GWCA 5CRDA 4P3YB 3QFAC 1XW9A 3SBCA 3QAGA 1LBKA 3DEXA 2YCDA 4GSSA 3MDKA 3ZLPA 4MCUA 3P8WA 3HZ4A 5L71A 2F9SA 4PX1A 4EC0A 3HXSA 4KCAA 2ON5A 3UAPA 4ZILA 5G5FA 1XOBA 1GULA 3GX0A 1X9SB 3J7Yk 5H5QA 5ID2A 5ECHB 2LRTA 1XZOA 3IE3A 5FT3A 3KP9A 4J57E 3CRUA 2I3YA 2GT6A 4BPYA 2EIRA 2HYXA 2LJKA 5J41A 3GN3A 1TOFA 2DMMA 3VK9A 1QXHA 3IPZA 3KCMA 3US3A 1S3DA 1SK2A 1NW2A 4TR3A 2D2ZA 1LU4A 2L5OA 4L5OA 1XWGA 4N10A 1GSYA 4NHWA 3APSA 2CT6A 4IKHA 1GSFA 1TP9A 1SD8A 2H19A 2GZYA 1PMTA 2WULA 2EC4A 1LJRA 2NTOA 3GIXA 1GNEA 2FWGA 1QUWA 2OKAA 4MZWA 3FK8A 2OACA 4OO5A 4XS6A 3UARA 4I97A 2HI7A 4KDYA 5ECQB 1YEPA 2ZCTA 2GZZA 2M80A 2B7JA 3FR9A 4FYCA 4MH3A 3H1NA 4AJ6A 4PQIA 2X64A 3M3MA 3EYTA 1ZCPA 2FY6A 5KN2A 1ERVA 4MJCA 4NPBA 2YNXA 3UEMA 2ZNMA 2LEGA 3PINA 2R37A 4POLA 3UIWA 3APQA 5DALA 4HQSA 1J9BA 2O8VB 3BOAA 3L9VA 3TOTA 3F3RA 1GL8A 3IK9A 2ZUPA 2I4AA 2K8SA 2YN1A 4WXTA 4G19A 3ME7A 7GSSA 2DSAA 2IMDA 2REMA 2H75A 4NMUA 3ZL5A 5KEJA 1TRUA 5INYA 4WR5A 1R26A 2KOKA 4ILFA 1GLPA 3GX8A 3FZAA 1X0RA 3FR6A 2VD1A 3TKSE 4E8HA 3CYNA 2H6YA 5GSSA 2VCWA 5AIVA 5ID2B 3HHVA 3QAVA 4LL1B 5D96A 3QMXA 1H75A 3VFIA 3H4KA 1TU8A 1B8XA 2R3XA 3UMAA 4ML1A 3IDVA 3FZ4A 3TKPA 3IOSA 3GUSA 1JZDA 3EMXA 1VF3A 1AQWA 3A2VA 1YF1A 3LFLA 1WIKA 1FVKA 2KUCA 1FO5A 5ELGA 2HZEB 2F8AA 2V2GA 3G7IA 4POKA 1M2BA 3TKSC 1A8YA 3IK7A 1TXXA 1N2AA 1PN9A 3LEFA 2DJ0A 3DMLA 5GAPD 1EEMA 1EZKA 1PGTA 4O7HA 2FA4A 5IM9A 5ECIB 1TK8B 1O7UA 4G2EA 3W6GA 2K9FA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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