The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
56
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sequence length |
246
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structure length |
246
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Chain Sequence |
IIGGEFTTIENQPWFAAIYRRHRGGSVTYVCGGSLISPCWVISATHCFIDYPKKEDYIVYLGRSRLNSNTQGEMKFEVENLILHKDYSADTLAHHNDIALLKIRSKEGRCAQPSRTIQTIALPSMYNDPQFGTSCEITGFGKEQSTDYLYPEQLKMTVVKLISHRECQQPHYYGSEVTTKMLCAADPQWKTDSCQGDSGGPLVCSLQGRMTLTGIVSWGRGCALKDKPGVYTRVSHFLPWIRSHTK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
publication title |
Crystal Structure of the Urokinase
rcsb |
molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
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source organism |
Homo sapiens
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molecule keywords |
Urokinase-type plasminogen activator
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total genus |
56
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structure length |
246
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sequence length |
246
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ec nomenclature |
ec
3.4.21.73: U-plasminogen activator. |
pdb deposition date | 2012-06-28 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
A | PF00089 | Trypsin | Trypsin |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Mainly Beta | Beta Barrel | Thrombin, subunit H | Trypsin-like serine proteases | ||
Mainly Beta | Beta Barrel | Thrombin, subunit H | Trypsin-like serine proteases |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1GHZ A; 1FJS A; 2OQU A; 3LGV A; 1XVO A; 2A45 B; 2CGA A; 1V2M T; 1BHX F; 4CBN A; 2SGP E; 1O3M A; 1P2K A; 1GI8 B; 3A80 A; 3H5C B; 1RJX B; 3D49 H; 1ARB A; 3A83 A; 2ZP0 H; 2SNV A; 2W3I A; 3S69 A; 1C2I A; 1GJ8 B; 1YKT A; 1V2L T; 4M7G A; 1D3D B; 3QO6 A; 2Z3E A; 5TCA A; 1U6Q A; 4J2Y B; 4KEL A; 3UQV A; 1AO5 A; 2VVU A; 3MH5 A; 1HJ9 A; 4E05 H; 4K5Z A; 2Z9I A; 1TX6 A; 1P11 E; 3U8O H; 3PMA B; 4X6N A; 1TX7 A; 3PRO A; 3Q3K A; 3M3T A; 4IN2 A; 1T4V H; 1FUJ A; 1ETR H; 5A8Z A; 1OKX A; 1BTW A; 1O2X A; 1A5G H; 1GHX H; 2F9N A; 1NFY A; 1M9U A; 4XDE A; 1O2N A; 5EOD A; 2GP9 B; 3M37 A; 1SOT A; 2ZDK A; 2ZGX H; 1ZHR A; 3M5M A; 3MYW A; 2CJI A; 1TQ0 B; 1NM6 A; 1OX1 A; 3UWI A; 3RXC A; 3G01 A; 4MPW A; 3FZD A; 3RDZ A; 5DP4 A; 3SU0 A; 2Z9L A; 1V2T T; 4IW4 E; 3SNB A; 4D7G A; 1DE7 H; 1BA8 B; 1UK2 A; 1C9T A; 2QA9 E; 1TOM H; 5DP8 A; 5PTP A; 1O3K A; 5C5N A; 4Y76 A; 2CXV A; 3V12 A; 8KME 2; 1VJ9 U; 4O3T A; 3M7Q A; 2HAL A; 4K1E A; 4ZKN U; 5JBT A; 3RXK A; 4YOI A; 1LVO A; 4X1N U; 1GI1 A; 4CRG A; 3KNX A; 4JZE H; 1AMH A; 2RDL A; 1G3C A; 3SGB E; 1OP8 A; 1GJ7 B; 1O2H A; 5FX6 A; 1XXF A; 3A86 A; 4NA9 H; 4ABJ A; 1ZYO A; 4CRF A; 1MD7 A; 3F9F A; 1Y3Y A; 1XUG A; 1XUI A; 3SUG A; 1MBM A; 2A0Q B; 5E2P A; 2EI8 A; 2VIP A; 1LQD B; 1G2L A; 1W13 U; 1GMC G; 1NRQ H; 1AFE H; 4KKD A; 2BMG B; 4BXW A; 3H7T A; 2QN5 T; 1OS8 A; 4XBD A; 3SUE A; 4Z6A H; 5LPF A; 2GV7 A; 4WH6 A; 3SU5 A; 4WXV A; 1GDQ A; 2VVC A; 5L2Y H; 3DD2 H; 1C5N H; 1C1Q A; 3LGY A; 2WPK S; 2XC5 A; 2ZDV H; 3F1S B; 2VB0 A; 3PO1 C; 3ATI A; 2BDH A; 1GBA A; 4Q80 A; 1DUA A; 2O8T A; 2ODY B; 1V2J T; 2Y7Z A; 1P57 B; 1S6F A; 2ZDM A; 3FP7 E; 1TNH A; 3ZZA A; 3E8L A; 3NXP A; 2HPQ H; 3UTU H; 1Y3X A; 2OC1 A; 2BLW A; 1MKX H; 3W94 A; 4ZAE A; 3PLB A; 4WMD A; 1BT7 A; 2WYG A; 5DP3 A; 1MUE B; 4X1P U; 1A61 H; 5DP5 A; 1O3E A; 1J8A A; 4WMF A; 3ZVC A; 3KQC A; 1AWF H; 1P2Q A; 2THF B; 1ELE E; 1ZRB A; 4K60 A; 2ZU1 A; 4BAO B; 1TOC B; 2RA3 A; 1Z8R A; 1TNJ A; 4KTU A; 4U2W A; 1RGQ A; 1V2P T; 1QGF A; 2ZHF H; 3ATW A; 5TCC A; 1EJA A; 3NUM A; 4GVU A; 4OS4 A; 5FBI A; 2R0L A; 1FAX A; 1O39 A; 2ZDA H; 1GI3 A; 3MO9 A; 3TGK E; 3LH3 A; 3VGC B; 2B8O H; 3MH4 A; 3RXF A; 4A1X A; 1C2K A; 1HBT H; 3T25 A; 2Z7F E; 2DE9 A; 1LKA A; 2A5A A; 1KY9 A; 1NU7 B; 1OWK A; 3BG4 C; 1A5I A; 2WYJ A; 4GHT A; 4TPI Z; 3E1X B; 1VR1 H; 1V2S T; 5BPE A; 1KXD A; 3RXR A; 3RXD A; 1A4W H; 2EST E; 4CRB A; 5HYO A; 2EEK A; 1Z7K A; 1F7Z A; 1FON A; 1RIW C; 4H42 U; 1QA0 A; 2ZCL P; 2XWB I; 4INH A; 1C5R A; 8GCH G; 3LKW A; 2P8O B; 3OU0 A; 2IPH A; 5J4Q A; 1AND A; 4NZL A; 2OC8 A; 3AW0 A; 4AX9 H; 1GJ6 A; 3JZ2 B; 4IC5 A; 4X6M A; 1NC6 A; 1W14 U; 3Q77 A; 4F49 A; 3SN8 A; 1JXP A; 1H4W A; 1RXP A; 3RXI A; 5EXL A; 1DDJ A; 1WOF A; 5HXF A; 2CHA B; 5TJX A; 2GCT B; 2FOF A; 5AFZ H; 2BXT H; 3BTF E; 3UQO A; 2ZU3 A; 1O3C A; 4RKO B; 1C1R A; 1S83 A; 1TFX A; 1V2Q T; 2PUQ H; 3D23 A; 4ABF A; 2ALP A; 1PJP A; 3FVF B; 5E8E H; 4NIX A; 1SGF G; 3M61 U; 1SFI A; 4TWY A; 2P94 A; 1G32 B; 2SGE E; 1GBD A; 5GCH F; 4AGJ A; 1BTH H; 3HK6 B; 4ZMA H; 1YPJ H; 3P8F A; 4B76 A; 2GX4 A; 6EST A; 1Z6E A; 2OTV A; 4J1Y A; 4LK4 A; 4MPV A; 3SU4 A; 1K1L A; 2PW8 H; 2BDB A; 1XVM A; 1TGB A; 3ELA H; 5IYT A; 1A3B H; 5AVD A; 1BRB E; 1MQ5 A; 1Z8I B; 2C8X B; 3GY5 A; 4B75 A; 3UFA A; 1LVY A; 1O3G A; 1RS0 A; 1TAL A; 2VH0 A; 1T8N A; 2BX3 A; 1OWI A; 3U1I B; 1IQI A; 1O2V A; 2ZGC A; 5EOK A; 1O3F A; 2Y82 A; 4U32 A; 3SI3 H; 2GCH G; 1HAV B; 2FMJ A; 4Y7B A; 1B0E A; 4ZXY H; 1G9I E; 2CMY A; 2GDD A; 1FQ3 A; 1GBJ A; 1S6H A; 2QV1 A; 1V2K T; 1C1T A; 1TA6 A; 2OBQ A; 4CRC A; 4INL A; 3V13 A; 1IQM A; 1NFU A; 3P8N A; 4H4F A; 1EAI A; 1SMF E; 1C5V A; 1OP2 A; 1YF4 A; 1CE5 A; 1GJC B; 3SJ9 A; 1C1M A; 1LDT T; 1NU9 A; 2ASU B; 4OS1 A; 5AHG H; 3S7K B; 5EW2 H; 1TRM A; 3ATM A; 2ZNK H; 3SUD A; 2C8W B; 1PPZ A; 2FOA A; 4GCH G; 1EKB B; 4I8G A; 1O2K A; 3OY6 U; 1FDP A; 1JOU B; 1PYT C; 1CT0 E; 1HGT H; 2AMP A; 2FS9 A; 4B74 A; 2D26 C; 1AY6 H; 1DST A; 2GT8 A; 1CHO F; 1ZOM A; 3HPT B; 3RXQ A; 4Y71 A; 3R0F A; 1O31 A; 2JH6 D; 3SND A; 2PV9 B; 3QUM P; 1O32 A; 2BTC E; 2A2X H; 4F4O C; 3L3T A; 1C5O H; 1AKS B; 5LPR A; 1BOQ A; 5AFY H; 3SNC A; 2BD5 A; 1YP9 A; 2CF9 H; 3LGU A; 1QRW A; 6GCH F; 1FN8 A; 1UK4 A; 4Y0Y E; 3RXG A; 4YTA A; 1W2K H; 4CR9 A; 3PYH A; 1CGH A; 1AUJ A; 4RN6 A; 5FX5 A; 1K21 H; 1O3O A; 4WWY A; 4NWK A; 3TIT A; 2VIW A; 3CP7 A; 3K65 B; 2D1J A; 2VH6 A; 2VID A; 2ZWL H; 4D9R A; 2AH4 X; 4ABE A; 3MNB A; 5LH8 A; 1HAZ B; 1T32 A; 1WCZ A; 5T6D A; 1ELA A; 1W0Z U; 1O3J A; 3A84 A; 2ZHE H; 1YPH C; 4BAM B; 1H1B A; 4VGC C; 1GBT A; 3K6Z A; 3BTQ E; 1AZ8 A; 2HNT F; 1PQ5 A; 1PYT D; 4NFE A; 1OYT H; 1VCP A; 4BAK B; 1NO9 H; 1Y3V A; 1QTF A; 2QF0 A; 3VB7 A; 5K7R A; 1SGN E; 1HAV A; 1P04 A; 1FI8 A; 3Q3Y A; 5HMA A; 1SGI B; 1LQE A; 4IC6 A; 1K2I 1; 2PHB A; 3EAJ A; 3VGC C; 1UVT H; 1HIA A; 1VZQ H; 3DA9 B; 4ABH A; 1SQO A; 4AFZ A; 1J9C H; 1XM1 A; 1BTY A; 2OD3 B; 2PKA B; 1QB9 A; 3TNT A; 1FY4 A; 1TMB H; 1TMT H; 2BQW B; 4BNR A; 2ZPS A; 1L2E A; 5F8X A; 3SJK A; 4TPY A; 1QL9 A; 1ANC A; 3OYP A; 1C5X B; 3SUF A; 3P95 A; 1HCG A; 5CE1 A; 3SQH E; 1D4P B; 3MNC A; 3BTD E; 1SGP E; 4DII H; 1UVU H; 2P8O C; 1MZD A; 1QJ7 B; 3GCT F; 1MKW H; 4NCY A; 3P70 B; 1TPA E; 1AKS A; 1Q2W A; 3ZVD A; 3M36 A; 2ZU4 A; 1GG6 B; 3KGP A; 4MPU A; 3UNR A; 2D8W A; 1GI7 B; 3Q3X A; 1DWB H; 3V0X A; 1SLX B; 4YOJ A; 5K0H A; 2FLB H; 1GGD C; 1TGN A; 1K1P A; 3A8C A; 5JB8 S; 2V6N A; 4SGA E; 2CHA C; 4E06 H; 1DM4 B; 3MI4 A; 2GCT C; 3BSQ A; 1NT1 A; 1UTL M; 1EP6 A; 1T8L A; 1UCY H; 1PPE E; 1FPH H; 1H9H E; 4AFU A; 1SLW B; 5A0B A; 4Y10 E; 2PR3 A; 1TON A; 2Q1J A; 1IQE A; 4FUG A; 3EA8 A; 1OWJ A; 2TGP Z; 3F9H A; 4ZKR U; 6LPR A; 1C1V H; 3NZI A; 2XW9 A; 3C1K A; 1CA8 B; 2W7S A; 2BDC A; 1FV9 A; 1DLK B; 3ZZ5 A; 2J2U A; 1N6Y A; 1A46 H; 2ZHW H; 2XCN A; 3SJO A; 1A5H A; 1C1N A; 4JK5 A; 1HAP H; 1GHV H; 1YCP K; 3HGP A; 1GMH G; 1C1U H; 5CMX H; 2CV3 A; 1LHC H; 2PKS B; 2FX6 A; 1K28 D; 3A7Y A; 1LMW B; 3STI A; 2TGA A; 5EG4 A; 2GZ9 A; 2G8T A; 2ZTZ A; 1JWT A; 1GMD G; 4X8V H; 1MTU A; 2QF3 A; 3UR6 A; 3SJ8 A; 1ZMJ A; 5DP6 A; 2A32 A; 1ZZZ A; 1C5U A; 3KID U; 3RC5 A; 2Z3C A; 3SV7 A; 4NFF A; 5LGO A; 1QJ6 B; 1C4V 2; 2ANM H; 2TPI Z; 1FAK H; 3GYL B; 5A2M H; 3VXF H; 3TH3 H; 3LJO A; 4K69 A; 4I31 A; 4WH8 A; 4JYV H; 1F5R A; 2EI7 A; 3ZYE A; 2H9H A; 2ZEB A; 3EQ0 H; 1KLT A; 2ZTY A; 2ZHD A; 2BDA A; 5E2O A; 2A31 A; 1NPM A; 1TNI A; 3TK9 A; 3TJU A; 3TVJ B; 1GBE A; 1S82 A; 1F5K U; 3U1J B; 1DWD H; 3V3M A; 1EPT B; 4ABG A; 1FY3 A; 2W7U A; 3F68 H; 1P3C A; 1SGT A; 2QXH A; 1YM0 A; 3UY9 A; 2GKV E; 2P3U B; 1EZX C; 2W3K A; 2O8M A; 2A1D B; 2ANK H; 1DSU A; 4OS5 A; 2Y5G A; 1N8O B; 2NU2 E; 4ABA A; 1AZZ A; 3DT0 H; 1BMA A; 2BB4 A; 1DX5 M; 1CBW C; 1IOE A; 2FOH A; 5HM9 A; 4A1V A; 3VB5 A; 2OCV B; 3GY7 A; 4B73 A; 3LGW A; 4AFS A; 3ZV9 A; 1THS H; 1ZRK A; 1TWX B; 5EQR A; 2ZC9 H; 2HNT E; 3QGJ A; 3OY5 U; 1ACB E; 5L30 H; 4I8J A; 4X8T H; 2FI5 E; 2PWX A; 3SU1 A; 1EAX A; 1QQU A; 1C5Q A; 4A5T S; 1ANE A; 4A1T A; 1K1N A; 1P03 A; 2QAA A; 4CRD A; 3T27 A; 2FOB A; 1OSS A; 1BCU H; 4JZF H; 3A8A A; 3A87 A; 1KXB A; 2VGC B; 4HGC A; 2ZDN A; 5DK1 A; 5EGM A; 1AVG H; 5E0H A; 5JDU B; 2NWN A; 1HYL A; 4X1R U; 2VWM A; 1G30 B; 2WPI S; 1UTK A; 1SI5 H; 1SHH B; 1CSO E; 1JRS A; 2HOB A; 3KQB A; 2F91 A; 2NU4 E; 3BIU H; 3ZZC A; 1GMC F; 2RA0 A; 2KAI B; 2SGF E; 1RFN A; 2FIR H; 2ZPQ A; 4CRE A; 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1DOJ A; 4FVD A; 1DY8 A; 1C2H A; 3M35 A; 1GI4 A; 1WU1 A; 1AVX A; 1Y5A T; 3CEN A; 1SHY A; 2PGQ B; 2XBV A; 3U69 H; 1P2O A; 3LGT A; 3Q00 A; 1ZGV A; 5C2Z A; 1H9I E; 4CHA B; 3GIS B; 3RXJ A; 1Y5B T; 2H1U A; 2STA E; 2AFQ B; 5F8Z A; 1N6X A; 3AW1 A; 2ZGJ A; 4VGC B; 4X2V A; 1QL7 A; 1H8I H; 4A6L A; 7EST E; 1ELB A; 2AGG X; 4MNY A; 2C93 B; 4LXB H; 4JMY A; 1QRZ A; 1HXF H; 3SJI A; 1GL0 E; 3FP6 E; 4D8N A; 2V0B A; 3MU8 A; 4UDW H; 2PSY A; 1JBU H; 4IN1 A; 2XXL A; 1KDQ B; 2WIN I; 3PMB B; 4OS2 A; 2PKS C; 2KAI A; 1MTS A; 2G4T A; 1TB6 H; 4XSK U; 4EST E; 3UNS A; 2J92 A; 3DFJ A; 4K8B A; 4B2A A; 2AYW A; 9EST A; 1ANB A; 4I33 A; 1B5G H; 1PPH E; 5ETX A; 3RC6 A; 3NK8 A; 5B6O A; 4CBO A; 3QTV H; 1BRC E; 2A4Q A; 2Z3D A; 2G5N A; 4ISI H; 4AZ2 B; 1GJD B; 1TIO A; 5E0J A; 4ABI A; 4DOQ A; 1XUK A; 3E0N B; 2WPH S; 4NZQ A; 3LU9 B; 2WPM S; 1E38 B; 1OYQ A; 1F2S E; 3GY2 A; 3L6P A; 1SQT A; 3P8G A; 2VIO A; 1O5A B; 1SR5 C; 2JKH A; 1BQY A; 3LGI A; 4FUF A; 2P16 A; 4ISH H; 4O3U A; 3ZVA A; 5SGA E; 4DT7 B; 1PPG E; 4NSV A; 2ZQ1 A; 1SVP A; 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