4GXZA

Crystal structure of a periplasmic thioredoxin-like protein from salmonella enterica serovar typhimurium
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
178
structure length
178
Chain Sequence
DQEKQIENLIHAALFNDPASPRIGAKHPKLTLVNFTDYNCPYCKQLDPMLEKIVQKYPDVAVIIKPLPFKGESSVLAARIALTTWREHPQQFLALHEKLMQKRVYHTDDSIKQAQQKAGATPVTLDEKSMETIRTNLQLARLVGVQGTPATIIGDELIPGAVPWDTLEAVVKEKLASA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and functional characterization of ScsC, a periplasmic thioredoxin-like protein from Salmonella enterica serovar Typhimurium
pubmed doi rcsb
molecule tags Isomerase
source organism Salmonella typhimurium
molecule keywords Suppression of copper sensitivity protein
total genus 64
structure length 178
sequence length 178
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2012-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4gxzA00
1MTCA 3FZ9A 3UMAA 5IMAA 2CAIA 2TIRA 4E8EA 2VLUA 2C0DA 2X8GA 2FY6A 3HJPA 2B5XA 4GTUA 1PKWA 1OAZA 2IL3A 4TR3A 1V2AA 1XOAA 2R6KA 3GHAA 4TKYA 1ERVA 2C3NA 3UEMA 1THXA 19GSA 1K3YA 1XVQA 4MH2A 2XPDA 1OE8A 3EINA 3L4NA 3ZVJD 3FR3A 4L0WA 4V2NA 2JSZA 1M99A 2DBCA 2H6ZA 1M2DA 4NAXA 18GSA 2NBSA 4KGIA 5ECSA 1IYIA 2X99A 3H4KA 5F06A 1OVNA 3VI7A 3UOMA 2J23A 2H0HA 4X43A 2VD1A 3ZYWA 4O5RA 4XS6A 3Q18A 1PMTA 3A2VA 3CSIA 5ECIB 2K8SA 1M0UA 1QK8A 4HJMA 4MK3A 4PNFA 3GIXA 1G7OA 2PVOC 4K9ZA 2XBIA 3VWWA 4NPBA 4O92A 1SKRB 3FHKA 4GWRA 3H79A 1GSQA 5IMFA 4XHMA 1O7UA 3KTBA 4MDCA 2AUVA 3VPQA 2H0GA 1FHEA 2V6KA 3F4SA 2IN3A 4MLYA 1SU9A 2WRTA 3EU3A 1V9WA 1FVKA 3APSA 1A2MA 2V32A 2VLTA 2H76A 2P5RA 3QAWA 3G7IA 2FLSA 1XWAA 5JCGA 4Q5NA 5JWRB 2H1DA 2L6CA 4N0VA 4EO3A 2IMDA 4F9ZA 2GQKA 4GCIA 2VL3A 1WOUA 4TVEA 1QXHA 2VOCA 2HZEA 3C1RA 4OO4A 2BJXA 2NPBA 2OBKA 5KN3A 3H93A 5JCWA 3QMXA 4DSSA 3C1SA 2GGTA 2VL2C 3TKSE 5D9WA 1FOVA 2YANA 4IP6A 3U6VA 1F9MA 3ERGA 3FR9A 2WB9A 3GN3A 1WE0A 2PGTA 1RQMA 5LD0A 2CZ3A 1F2EA 4G9HA 3HDCA 3DRNA 2HLSA 5A4WA 2YJHA 5ECLB 3GKXA 1DUGA 4HOJA 2YPMA 2KHPA 2O8VB 4DEJA 5FT3A 1BX9A 1T8EB 1SK2A 5CRWA 4WBJA 4BVYA 3C71A 1PSQA 3FR6A 2LNTA 3GSSA 4L8EA 3A2XA 3M1GA 1QQ2A 1EOHA 1S3AA 6GSVA 2H1GA 2WULA 1THOA 3DMLA 3I6AA 3G7YA 1XOBA 1ST9A 4ZB6A 2C3TA 5J3RA 3TJKA 1YF1A 3HD5A 3LEFA 4ZIJA 5DBQA 1ACVA 3LJRA 3RHBA 2DJ2A 1TK5B 4IQAA 4IW9A 2C0EA 5LCZA 3UBKA 3TGZA 3ERWA 1SKSB 1VF3A 1YZXA 1VF1A 2GTUA 2H71A 2X8CA 3KEBA 4XRAA 3KH9A 2D2ZA 2HRNA 2IMEA 3IAS2 1AQVA 2LS5A 3LFLA 3FZAA 4HU7A 1JZOA 2AHEA 4EKZA 5DCHA 2AJQB 4ZB9A 1HNAA 3GKMA 5JWOB 3FK8A 3GL3A 5J5NA 5D96A 3D5JA 3QAGA 2XC2A 2A2RA 1YJ6A 3IBHA 3NOFA 4ILFA 1TW9A 1MDJA 4IJ3A 3HZ4A 5D9TA 3EU4A 1U3AA 3GYKA 3KP9A 4ISDA 1VF4A 1ZGNA 1XVWA 5FHIA 4K7OA 1SD8A 1M9AA 2M72A 2H6XA 3DEXA 20GSA 5GAPD 3FKFA 5HFIA 3RBTA 4ZILA 1E2YA 4MPGA 3PGTA 3P7XA 4HQZA 4ECCA 4F0CA 3UIWA 12GSA 1X5EA 2R3XA 1ML6A 3FY7A 2JL4A 2NDOA 9GSSA 4XS1A 4MJBA 4TR1B 1SK0A 2GT5A 4ZL9A 4CDOA 1YEXA 1EP8A 3GH9A 1AIUA 3GL5A 4WF5A 2YZUA 4GRFA 3CTGA 4TXVA 4OCEA 4I2TA 3ZFLA 4K7IA 1K3LA 4I5QA 3ZMLA 2CX3A 2HSHA 1O8XA 4K0NA 2C0FA 1GSYA 1AC1A 3BJ5A 2HNLA 5G2ZA 2EC4A 1B8XA 3RPNA 1XPVA 2OE1A 4IP1A 3LORA 1KEBA 3FYGA 2I1UA 2ZNMA 1CQHA 1WMJA 7GSSA 1RW1A 2X8HA 4Q5FA 3PH9A 4BWQA 1S3DA 1ZL9A 4WXTA 2TRXA 1OC9B 4MABA 4N0ZA 4EVMA 1T4YA 4EXJA 5KN0A 3F9UA 3N9JA 2HZFA 6GSUA 1URMA 3EURA 1SK1A 1XIYA 5IO0A 4LL4B 2V1MA 2LNSA 1VF2A 1R26A 2PERA 1HQOA 4FIWA 3HYPA 3F6DA 3FW2A 1NHOA 1V58A 3VWVA 3IC4A 2KP2A 4DSRA 4D73A 3O6TA 4MH3A 3PR8A 2LKUA 4TXOA 1ZMAA 5JCUA 5B8BA 1EZKA 2GS3A 2ALBA 4RUVA 5FWGA 1T1VA 2H1AA 2LQOA 4OCFA 2F51A 3KD0A 3ME7A 3BD2A 4G19A 1T4ZA 2DSAA 1M7TA 1WP0A 3ZL5A 4NMUA 1SYXA 3QD9A 1PN9A 1TOFA 2WJUA 1X5DA 4WR4A 4DSQA 2K8VA 5A4UA 1ABAA 3KIJA 4H86A 5DJMA 4GF0A 1GUHA 1PL1A 5IOXA 1GTIA 4MZCA 1B4QA 4BL7A 1SENA 3GMFA 1QFNA 17GSA 5DALB 5AGYA 2FUG2 2CV4A 3F0IA 5B7CA 3DWVA 4YAPA 5D9VA 5ELAA 3NZNA 5ECNB 4F03A 3A5WA 1FG4A 4N11A 4YH2A 4FO5A 4MCUA 1YY7A 3QR6A 1TRVA 1GRXA 2IMFA 4IKHA 2CVBA 3GRXA 5ECMB 3LYPA 2YWOA 3VPTA 3FRCA 2L57A 1BG5A 2H01A 5HFKA 2LTKA 3IOSA 3CTFA 3M3MA 4JR6A 2H70A 3VK9A 1JZDA 4EF0A 2MBTA 1O73A 1X9WB 3UL3A 1V57A 4RI6A 3HY2A 5H5RA 4N10A 4EL1A 1X0RA 13GSA 4TN8A 1OYJA 4O32A 3A3TA 3LXTA 3TCOA 3HCZA 2H0IA 5E59A 2VIMA 4XS4B 4V2LA 3EYTA 4MJEA 3D6IA 1TU7A 2YV9A 2LJKA 4X1UA 3EVIA 4JE1A 1FW1A 1GLPA 1PL2A 2C80A 1K0DA 1KNGA 3A2WA 2IWTA 1WJKA 5DAKB 4JU5A 5DDLA 2LUSA 3TRXA 2YWMA 1BEDA 1USBA 3RPPA 3BBYA 3WT2A 3P90A 1PKZA 3F3QA 3MWHA 2VLVA 4JEDA 3LWAA 3M9KA 3DXBA 1V98A 4TR4A 4ECJA 1AQXA 2IIYA 2YZHA 1K0CA 3M9JA 4OFMA 1MD3A 1GTBA 2QGVA 2TRCP 4PNGA 1Z6MA 3F8UA 1T00A 3WGDA 2VCTA 3O76A 2DJ1A 2H73A 2K18A 4TW5A 1LU4A 1YQ1A 4PX1A 1PQNA 1XW9A 1DSBA 2I9HA 4MF5A 5HR1A 5HQPA 1TTZA 5CREA 1M2BA 3H8QA 2IFQB 3QDNA 3CSJA 4WF4A 2VM1A 4IVFA 4AF2A 1FB0A 3ZMKA 3EWLA 4GSNA 1G6WA 2N5FA 5HR2A 3BCIA 3CRTA 1M9BA 5HFGA 1KTEA 1ILOA 2NTOA 2R2JA 3LG6A 3U5RE 11GSA 2FWGA 3TJBA 3CRUA 1W89A 3ZVJA 4KCEA 4MF7A 4KDXA 4OFTA 1SJIA 4HZ4A 5D93A 4J57E 4AJ6A 5J9CA 5ECPB 1JZRA 1U3IA 2FA8A 2GSQA 5IMVA 2IJYA 2OACA 5B8AA 4OMVA 1SL1B 4XRDA 5AIXA 5G1LA 3GH6A 1A0FA 2R37A 1OE7A 2V2GA 4WETA 3WYWA 2WS2A 3GKKA 2AV4A 3C7MA 4PQHA 4QQ7A 2CA8A 2VL9A 3VFIA 2H19A 3LGCA 3J7Yk 1XCCA 4KUNA 4L5LA 2WCIA 1I9DA 4YQMA 2M46A 2YCDA 1AW9A 1X5CA 4F2IA 2RM6A 1U87A 2OKAA 1VRSD 2NVLA 4MPFA 4BWSA 4KDUA 1HD2A 6GSSA 1HNBA 3CYNA 1OC8A 1JLWA 1XBSA 3FZ5A 5D73A 4TR1A 1G7EA 5IQYA 2MMNA 4IQ1A 3ZZXA 2RUFA 3L0HA 4F0BA 3IDVA 5IMCA 1EEMA 3OR5A 3LXZA 2K9FA 2DMMA 2VAFA 1TU8A 3N5OA 3DVWA 5ECOB 4POMA 4XCSA 1VGLA 1F3BA 3TJJA 3I43A 2HXKA 1QGVA 2LRCA 1N2AA 1I5GA 3W6GA 3I9V2 1TP9A 2H66A 3G9BA 4IELA 4IBPA 2E7PA 4TOPA 3TKPA 1ZYEA 4OFNA 5CRDA 2JSYA 3KCMA 4HUAA 1OC3A 6GSWA 1J9BA 3F3RA 2KLXA 2WGRA 3GV1A 4FH8A 1B9YC 1EEJA 2B5EA 3EMPA 3LYKA 5GSTA 2EIRA 3UJ1A 1O85A 3GA4A 3VLNA 5IO2A 1K0OA 3DGQA 2GSSA 1WIKA 3WGXA 3GNJA 3HVVA 1HYUA 2RLIA 2F8FA 2HZEB 4POLA 1Y6EA 1A0RP 2E2GA 4DSSB 2CAQA 3KM6A 2LRNA 6GSXA 2HRFA 4RQXA 5ABRA 2J9HA 4Q5RA 4EE0A 4I6XA 1YKCA 2LSTA 2DIYA 2CQ9A 3E3EA 2O85A 2H6YA 4ZBAA 3TKQA 3HKRA 4ZB8A 5GZZB 2LEGA 5C00A 4ZBBA 1XWGA 2DJ3A 2I4AA 1GSFA 5IPGA 2EIQA 4LA1A 1MEKA 4G2EA 2H75A 1LJRA 3L9SA 1GL8A 1EP7A 5D8IA 3EE2A 5INYA 1UVZA 1EWXA 1GTUA 4WEYA 3DD3A 5IMDA 1Z6NA 2FWHA 1K0NA 2OE3A 5DALA 1C72A 2CT6A 3TB2A 4IJIA 4RI7A 1O81A 5AN1A 2ON7A 3C73A 1ZYQB 3HXSA 2L59A 2H74A 2HI7A 3HHVA 5J4UA 2EIOA 5ECKB 2H1BA 1O6JA 1YKAA 2FCHA 4KCAA 5GAND 1ZZYA 5CO3A 4K8MA 4MJCA 2YJ7A 5IM9A 5B6NA 2BMXA 1MD4A 2F9SA 4CHSA 4F82A 4EDYA 1U6TA 4GQFA 5IMZA 4EC0A 2E2MA 1A23A 1ZCPA 2OA7A 4JRRA 4AJ7A 2FGXA 2C4JA 1EGOA 1M2AA 2V41A 2F3MA 3O3TA 5DJLA 3ZREA 2JZTA 1WPIA 3GUSA 2GZYA 3GTUB 1UN2A 4GLTA 2C3QA 3FZ4A 3TUEA 4PUAA 3ME8A 3F6FA 4NV5A 1YEPA 3LSZA 4I2UA 1PGTA 1SJ6A 5EY6A 1H4OA 4QL9A 3IAM2 4NXIA 5A5KA 1A2JA 4KX4A 2ON5A 4KB3A 4ZL8A 1BQ7A 2IPAA 3VWXA 2L4CA 2F8AA 2DIZA 1EV4A 1T3BA 2MMZA 2B1KA 3TRQA 1GNEA 1TRSA 2N5AA 2PUKC 4L5OA 1GSDA 2OADA 3CBUA 3V1WA 2DJKA 5J41A 3ZTLA 2X64A 1J0FA 5E4WA 1DE2A 5ECQB 5AISA 6GSYA 4E8HA 3ZLPA 2WFCA 3UAPA 2C0GA 1UA5A 3APOA 2OJLA 4NHWA 5C04A 3F63A 2RIIA 4ECIA 2B6MA 2PPTA 5ECHB 1BAYA 3ED3A 2LJAA 4PGTA 3DVXA 2CZ2A 2G0FA 2WZ9A 2KP1A 6GSTA 2AYTA 2H72A 3P2AA 2B7JA 4K2DA 4YQVA 2HT9A 2XBQA 3BCKA 4JBBA 5EVOA 5GSSA 3VURA 1WRYA 3MDKA 2AAWA 3IE3A 4KNDA 2PBJA 1PA3A 5ID2B 1NM3A 1J08A 1F37A 4IGJA 4POKA 1TDIA 2DLXA 2QKEA 2LQQA 3LQ7A 5EPFA 1DE1A 4MA9A 3MNGA 3IHQA 4KSMA 1OKTA 5IIZA 2GQMA 2VL2A 3IK7A 5ENUA 5CNWA 4PURA 3DYRA 2P5QA 2C1YA 1ERUA 1SL0B 3Q74A 1IYHA 4WR5A 5DQYA 1YF0A 1XWBA 2O7KA 3I69A 4MMMA 3WD6A 3HVSA 2DJJA 4ML6A 2RUEA 2Z9SA 4TXOB 2PWJA 1F3AA 3Q19A 4KA0A 3PINA 3M8NA 1R5PA 4AGSA 4HDEA 2JADA 2YV7A 1X9SB 3ZFBA 1Z9HA 4ACSA 2MYGA 4KDYA 1GLQA 3IA1A 1NW2A 3IXRA 4EDZA 2PVQA 4PQIA 1JZWA 2LV3A 3KP8A 1XWCA 1TRWA 4V1Ag 1EV9A 5ECRB 5EL8A 1T7PB 1BYEA 3CMIA 2E0QA 2L5LA 4OD7A 2HFDA 2WDUA 4K6XA 2V6OA 2C8UA 3D4TA 3IRAA 3QOUA 3ISOA 2GSRA 3DKSA 4YQUA 2B7KA 3TKSC 2GVPA 1HNCA 3C8EA 1PRXA 3ZRDA 2M80A 4K1FA 3DIEA 5KN2A 4QL7A 4BA7A 1SKWB 4LMVA 1S3CA 3VWUA 4GXZA 5H5QA 5F0GA 2CX4A 4ZXGA 4PQ1A 1XFLA 4NV2A 1ERWA 1GULA 2QC7A 4Z7XA 3GKNA 3HZ8A 3G7JA 1Z7PA 1GUMA 2LJRA 1E6BA 4Q5QA 4TRXA 4HQSA 4ZL7A 4YAVA 1RK4A 2PU9C 3APQA 1PX6A 3L78A 3Q6OA 2DMLA 3JCML 3H1NA 5A4VA 4KH7A 3KTLA 4O7HA 2QSIA 4HJ2A 1G0TA 1N8JA 1A8YA 2YNXA 1AUCA 2REMA 2I3YA 3P8WA 1NSWA 4ZBDA 5CAXA 1TI3A 3ZIVA 2JACA 4ECBA 2ZUPA 1MDKA 2P0GA 3KMNA 4PUFC 2A4VA 2VCZA 5G5EA 5DVBA 2BTOT 1AAZA 1V40A 2L4QA 1Z7RA 1X9MB 2HE3A 4OO5A 2VCVA 2VD0A 2FA4A 5HR0A 4K0GA 4NWYA 1CQGA 1ZOFA 4KSOA 5D9XA 1XXUA 2PN8A 1GH2A 1Q4JA 2MBSA 3R2QA 3TRPA 3F4TA 3D4MA 1H75A 2VCQA 2N5BA 1F6MC 3S9FA 4KE3A 1B9XC 2KOKA 3QCPA 3KMOA 2B1LA 5F05A 3M0FA 4MP4A 1FB6A 3HVXA 2MMAA 1U88A 3FEUA 3VI5A 3J7Yb 4LLRA 3SBCA 2YWIA 1XW5A 14GSA 1WWJA 3QAVA 3KZQA 2FNOA 1EGRA 2FWEA 1YDKA 1KBNA 4GSTA 2LRTA 1ON4A 4GQCA 5COHA 1OC9A 2B5YA 4G10A 1LBKA 2L6DA 3TOTA 2VM2A 4HZ2A 2MZCA 5AIVA 2I81A 1DBYA 4GSSA 3IV4A 4KAEA 4PXOA 2B3SA 4MF6A 3TOUA 2R4VA 1W4VA 3KXOA 2DJ0A 1TK8B 2IMKA 3D0ZA 2RM5A 4J56E 1TXXA 2DC5A 3GTUA 4TR0A 3UVTA 5KN1A 4OWYA 3CXGA 3QFAC 3QFBC 1GTAA 5F07A 2GQLA 1Z5YE 4JR4A 1FVJA 2HYXA 3L9UA 2K6VA 2GZZA 1GNWA 1XW6A 2FWFA 3TDGA 5J9BA 3EMXA 4MJAA 1SJZA 3HJMA 2L5OA 4I8BA 1QMVA 1A2LA 3CSHA 2AB6A 1XZOA 4RQRA 3HJOA 4AJ8A 4J2FA 3IPZA 3IK9A 5DCGA 1K0BA 1GWCA 1TI1A 1B4PA 5KEJA 1GSEA 2GLRA 2PMTA 4L0UA 3RHCA 3BOAA 5LNKe 4IS0A 1A24A 2VCXA 1SYRA 3GFKA 1PX7A 2ZCTA 1GP1A 2GZPA 1R5AA 3KGKA 4HS1A 3TKRA 5IPHA 4IHUA 4K7NA 2CVDA 1B48A 1MDIA 3D22A 1QUWA 4CW9A 5H5SA 5ID2A 22GSA 2H8LA 1TJDA 4HI7A 3UARA 3MAKA 1TK0B 1TKDB 2FD3A 1XWKA 3SWLA 4I97A 4V1Ap 2YWNA 1BJXA 1Q98A 1GSUA 5CRHA 5CRGA 1TRUA 4MZBA 4BPYA 2O89A 2IMIA 1A8LA 3ERFA 4LMWA 1GUKA 1O8WA 3AY8A 1UC7A 4EUYA 3GX8A 1G6YA 1AXDA 4XS4A 1R4WA 4X0XA 3EC3A 2P31A 4ULXA 5CYYA 3L9VA 3WT1A 2OE0A 4WBRD 1FO5A 3F4RA 5DAKA 1Z3EA 3GX0A 5F8BA 4LL1B 3TKSA 3K8NA 4XIHA 1EOGA 1K0AA 3KH7A 4JZQA 3GURA 4N30A 3ZIJA 1K0MA 2GSTA 3UBLA 2CVKA 2GT6A 5IOWA 2YOIA 2HSYA 3W8JA 4DVCA 2VO4A 4P3YB 2XHFA 3RDWA 2VUPA 4NHZA 4BVXA 5CP1A 2YP6A 1FAAA 4KW6A 1AQWA 5DQSA 10GSA 4WKWA 4IN0A 1SD9A 3D21A 2ES7A 2R5GA 3E9JB 5G31A 2O87A 4MZWA 4FYCA 1PD21 1K3OA 3RAZA 2GDRA 2OBIA 3W8SA 5G1KA 5L71A 1JLVA 8GSSA 2G2QA 1Y25A 3QPMA 3KJYA 5B6MA 2IFQA 1NHYA 1SL2B 2MMOA 2JU5A 3UVHA 3GSTA 5JWQB 1GSSA 3IR4A 3E0UA 4FYUA 2KUCA 5ELGA 3NIVA 3ZITA 4ML1A 4V2MA 1OKDA 5G30A 3TJFA 2VCWA 3MSZA 4FYBA 2H30A 4ID0A 16GSA 4XTSA 4HU9A 1ERTA 5HR3A 2FHEA 2YN1A 5G5FA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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