4HJMA

Crystal structure of glutaredoxin 1 from plasmodium falciparum (pfgrx1) solved by s-sad
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
106
structure length
106
Chain Sequence
EAVKKWVNKIIEENIIAVFAKTECPYCIKAISILKGYNLNSHMHVENIEKNPDMANIQAYLKELTGKSSVPRIFINKDVVGGCDDLVKENDEGKLKERLQKLGLVN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Atomic resolution crystal structure of glutaredoxin 1 from Plasmodium falciparum and comparison with other glutaredoxins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutaredoxin
molecule tags Oxidoreductase
source organism Plasmodium falciparum
total genus 36
structure length 106
sequence length 106
ec nomenclature ec 1.20.4.1: Arsenate reductase (glutaredoxin).
pdb deposition date 2012-10-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4hjmA00
5EPFA 3L9SA 2WFCA 3ZZXA 2ON7A 2P5QA 2XHFA 1TJDA 5ID2B 1TTZA 4LL1B 1MDKA 1YZXA 1U3IA 3TRXA 4MDCA 5ELAA 3OR5A 1PQNA 4YQUA 3L9VA 3RPPA 2HZEB 1V57A 4GSTA 2WCIA 4KDXA 2H1AA 4N11A 1V40A 2DMMA 1FB6A 4KSOA 5F05A 2GLRA 2H0GA 3VI7A 5ECLB 2VUPA 1GLPA 1EOGA 3E3EA 2PVQA 4HJMA 3GH9A 3GTUA 3FW2A 1JZOA 4MABA 5IMVA 1O81A 1R26A 2AYTA 2AV4A 4EDZA 3Q6OA 3D4MA 5JWRB 2AAWA 3FYGA 3H93A 3L4NA 3UBLA 2C1YA 2GDRA 1R4WA 4K9ZA 5GSTA 2MYGA 4J57E 1XWAA 3WGEA 1NM3A 1MD4A 5F0GA 3TGZA 2L5OA 3GX8A 1Z9HA 1ON4A 5G31A 2WB9A 1GRXA 2FLSA 3EU3A 1EGOA 1G0TA 4ZXGA 5ECKB 3KTBA 5CO3A 1T8EB 3A2XA 3ZL5A 3JCML 4QQ7A 1BG5A 2HLSA 3FR9A 5IOXA 4IBPA 2GZZA 2IMFA 1E6BA 2HRNA 2CVKA 5D93A 3ZITA 4KH7A 5IPHA 4EF0A 4MF6A 1A0FA 3FZ9A 5DAKB 3FZ5A 3TUEA 1LBKA 1ZCPA 4O5RA 4EO3A 4JBBA 5C04A 1XZOA 3A5WA 1BYEA 2VL2C 1WRYA 4MA9A 4NV5A 3TKQA 1O6JA 1VF1A 4ECBA 3UBKA 4HU7A 4I2TA 2LRTA 5F06A 2GSQA 2OE3A 1GLQA 1AW9A 1GNWA 5KN3A 3M9JA 3NZNA 3H4KA 4MJEA 1M7TA 3VPTA 2C3QA 1ML6A 5IO0A 3UIWA 5ECOB 2LTKA 3QR6A 3BD2A 1R5AA 2LNSA 3WT2A 3WYWA 2AHEA 3F4TA 3M8NA 2E2GA 4EVMA 2MMOA 1XCCA 2GQLA 4JU5A 1AQWA 4X0XA 2FNOA 2GVPA 3UL3A 1TKDB 16GSA 2GT5A 3DMLA 2H0HA 5IPGA 2QGVA 1Z6MA 1OC9A 1QFNA 3L78A 2IMEA 2CX4A 1THXA 5E4WA 4AGSA 3F6FA 4ZL7A 1SJZA 3QOUA 3E9JB 4AJ8A 4OO4A 1JLVA 1HNAA 1HQOA 5CP1A 1OKTA 3KZQA 4GCIA 4JR6A 4FO5A 2TRXA 4GWRA 3BCKA 3WT1A 3ED3A 1XOAA 3DKSA 2ALBA 2YOIA 1SJ6A 1ZL9A 4TKYA 1FG4A 5J9CA 2O8VB 5IQYA 4PX1A 3A3TA 3FR3A 3KMOA 3CTFA 3TRPA 4I97A 2VO4A 3VLNA 2H1GA 3TB2A 1KBNA 1OC3A 5H5RA 3HYPA 4L8EA 3ZMKA 1X5DA 1GSEA 1M9BA 1PSQA 3VWXA 2H76A 4G19A 1HNBA 3HD5A 2OBKA 2R2JA 4GF0A 3P7XA 1V58A 2EIQA 2JL4A 4PUAA 1TRWA 1PRXA 2VLUA 4BA7A 2K6VA 1V98A 3O6TA 4XHMA 4TN8A 3HZ4A 5JCGA 5ENUA 2CX3A 3FKFA 3GRXA 3GKNA 1SYRA 5HFKA 3IE3A 2H6ZA 1Z7PA 5KEJA 3CBUA 1OVNA 1AXDA 3KH9A 3ZIJA 1AUCA 1ILOA 5L71A 3CSJA 2LKUA 2HYXA 1X9WB 3CMIA 4MZWA 2F9SA 5GAND 3EINA 3E0UA 1Y6EA 1WE0A 3P8WA 4F82A 4NHZA 2YWMA 3MDKA 4AJ6A 4EUYA 9GSSA 5D9TA 3HVXA 1RQMA 3GH6A 2XBIA 4ZBAA 4L5OA 2VM2A 1DE2A 1PX7A 1EV9A 2LNTA 2V2GA 1A24A 1C72A 1PMTA 4QL7A 2Z9SA 5EVOA 3GSSA 4Q5FA 1N8JA 4XCSA 5DALA 1W89A 2LSTA 2PPTA 2L6DA 4NXIA 1JFUA 4BPYA 2LJKA 2HXKA 3GNJA 3F6DA 2I1UA 1SD9A 5E59A 3EWLA 4YQMA 2B3SA 4N30A 3CSIA 1S3DA 5HR0A 4DVCA 3QPMA 2HNLA 3GA4A 2GSRA 1JZDA 3ZTLA 5KN0A 2B5YA 3P2AA 1K0BA 1Q4JA 4BVXA 4KCAA 2TIRA 5J3RA 3TKSE 3UMAA 2LEGA 4GXZA 5J5NA 3DD3A 2CAQA 3AY8A 1TP9A 3QFAC 1HNCA 1XVQA 4N10A 5B6NA 5J9BA 4OFTA 3PINA 1VGLA 2H1BA 1WIKA 4ZB9A 3DRNA 1OC8A 1ZOFA 4OCEA 1Y25A 2L5LA 5ECHB 3Q74A 3D0ZA 2F8AA 2TRCP 5FWGA 5CAXA 3LGCA 1JHBA 1WPIA 2YZHA 3ISOA 3QFBC 2A4VA 4MPFA 3I6AA 10GSA 3M9KA 3L0HA 3ME7A 4IHUA 5CRGA 4GRFA 2RUFA 1J08A 2O89A 5HR3A 1J9BA 5H5SA 2B7JA 4WKWA 2IFQA 5IIZA 1F6MC 3IBHA 2V32A 4YQVA 4O7HA 2OJLA 3TOUA 2H1DA 2XPEA 5INYA 1FB0A 3W8SA 4ECJA 4WEYA 2HRFA 1AC1A 1EEJA 5HFIA 3GKKA 4XS4A 12GSA 2H8LA 3PR8A 2X99A 2MBTA 2RM5A 3IAM2 4Q5NA 1FVKA 4HEA2 4NV2A 3LXZA 2V6KA 4KNDA 4Q5QA 3EU4A 5AIXA 3SWLA 2QSIA 2OE0A 4LMWA 2MBSA 2GS3A 3C7MA 5G2ZA 5GSSA 2OA7A 1XW6A 5JWOB 3LWAA 1E2YA 3ZYWA 2VCXA 1GUKA 3GIXA 2LV3A 1AQVA 5ECIB 2YZUA 2QKEA 3W8JA 2NDOA 2A2RA 4KSMA 2BMXA 2N5AA 3IA1A 4HQSA 1B48A 4GQCA 1FVJA 4MF5A 1ERUA 3GYKA 2RUEA 2ZCTA 4IP1A 2YV9A 1PD21 5ECNB 2FA8A 2XBQA 4IJ3A 3KCMA 5ID2A 3ZFBA 4JR4A 1DBYA 2R37A 4XTSA 1PA3A 3F4RA 1NSWA 2I4AA 4TXOA 3K8NA 4OFMA 4WR5A 2FY6A 3F0IA 5GAPD 5IMCA 2X64A 1UA5A 3KP9A 4F0BA 1SD8A 2DC5A 1WMJA 2B7KA 3WD6A 2YANA 2WGRA 2DJ3A 3WGXA 1GULA 3HCZA 3D4TA 2DIZA 4MZBA 3ZVJD 2LQQA 1OE7A 1QXHA 2WJUA 2JADA 2YNXA 1ZYQB 1X5EA 1A8LA 2B6MA 4YH2A 1GTBA 2I9HA 4KW6A 2LS5A 4OMVA 5D96A 2VCWA 4PQ1A 3KIJA 1XVWA 5G30A 1NHYA 2K8VA 4I8BA 3R2QA 1OKDA 4KE3A 2JZTA 4OCFA 4FYUA 5F8BA 1RW1A 2H72A 3J7Yb 1GTAA 3TKPA 2YWIA 1Q98A 1Z5YE 1T3BA 2R5GA 1K3LA 2K18A 2YWOA 3IXRA 3KD0A 3GMFA 5B8AA 4RQXA 2OE1A 3VPQA 1F37A 2PVOC 1SK0A 3EYTA 6GSUA 1SYXA 4ZBDA 4PUFC 3IR4A 1N2AA 1RK4A 3M0FA 2L6CA 5DAKA 2GZYA 4ZL8A 13GSA 1OE8A 1IYIA 2BJXA 2H6YA 6GSWA 2DJ1A 1M9AA 2EIOA 1GP1A 3C8EA 4ECCA 2C0EA 2DJ2A 2P31A 2J23A 2ZUPA 2H19A 3D6IA 2C0DA 2O87A 1GSUA 2NPBA 1TDIA 2DJKA 1GNEA 3TJBA 3IOSA 3F3RA 3Q18A 3G7YA 5HFGA 4HQZA 2IMDA 1GSSA 2V1MA 1F3AA 3HVSA 1UN2A 2YCDA 5A5KA 1OC9B 3G7IA 4TR0A 1JZRA 5CNWA 2B1LA 4GLTA 4OFNA 1H4OA 19GSA 1YKAA 5DJMA 1GH2A 4POKA 5HR1A 2DSAA 2KP1A 5DVBA 2JZSA 3F4SA 6GSYA 3HA9A 1NHOA 5FHIA 1MEKA 5G1LA 2VLTA 4K7IA 4ZBBA 3KM6A 3A2WA 4D73B 2CZ3A 2KLXA 2CQ9A 1PN9A 3UAPA 1UVZA 3VWVA 5DDLA 4KX4A 2F3MA 1XXUA 5DCHA 1WJKA 2V6OA 2KUCA 4IQ1A 4WBRD 4ACSA 1M2DA 3GKXA 4FH8A 1FAAA 3VWUA 4JRRA 3QAWA 3ZMLA 4AF2A 2H30A 1THOA 2VCZA 4ID0A 2FCHA 1I9DA 4ISDA 2MMNA 3CYNA 8GSSA 3GX0A 4FYBA 2RLIA 2PU9C 4CDOA 2WZ9A 5EL8A 3RBTA 4YAVA 4XS6A 4DSRA 2GSTA 2NVLA 1TI3A 3VI5A 1XW9A 4OD7A 1FO5A 3KGKA 5CRHA 2WS2A 1SU9A 5A4UA 1XW5A 3IV4A 2ZNMA 2PWJA 3DXBA 1O8WA 4NHWA 1FW1A 2AB6A 4LMVA 1KNGA 2CAIA 4POBA 1SKWB 3RHBA 2P5RA 2B5XA 3US3A 3ZIVA 1K0DA 1F2EA 2VD0A 4RI6A 2I81A 1EP7A 5D9XA 1S3AA 1SL2B 5D8IA 5A4WA 3I9V2 2H01A 2IJYA 1BEDA 4IGJA 5JWQB 2DMLA 1TK5B 1M0UA 2B1KA 4NPBA 3GL5A 2EC4A 7GSSA 4TOPA 4PNGA 5DJLA 4PQHA 4MP4A 1G7EA 2VOCA 1SJIA 1A0RP 4RI7A 2FWHA 3D21A 3VFIA 2VIMA 1SKRB 2LQOA 1O8XA 4F03A 3HJOA 1AIUA 1CQGA 1QMVA 4Q5RA 3BOAA 4KB3A 1B4QA 4X43A 2JSYA 2C0FA 3FZAA 4F0CA 3BJ5A 3NOFA 2HI7A 5G5FA 1XOBA 4ECIA 5EY6A 1OAZA 4ML1A 4V1Ap 5D9VA 4TVEA 3IK7A 4HUAA 1EGRA 3RDWA 1LJRA 4E8EA 4XS1A 3RHCA 3DVWA 1TW9A 2M80A 2FWFA 4K2DA 3LFLA 3ZREA 2VM1A 4PXOA 4MMMA 4ZL9A 1ACVA 3DEXA 3MNGA 1A23A 1EEMA 3S9FA 3EVIA 2H70A 3GV1A 4X1UA 2J9HA 1T7PB 2HT9A 4GQFA 1R5PA 4L0UA 3HDCA 1TU7A 4MK3A 4O92A 4WF5A 6GSVA 1G6WA 3LYKA 4MJBA 4YAPA 1DE1A 2H66A 3LG6A 3H79A 2FGXA 2NTOA 4BWQA 5ABRA 4BL7A 2IFQB 4KDYA 4EXJA 1TRSA 2FHEA 4IQAA 4JEDA 3FY7A 4Z7XA 3F63A 4TR4A 3GURA 2IMIA 5IMFA 2K8SA 4KDUA 1YDKA 2C0GA 2GQKA 4ML6A 5HR2A 3TRQA 1FHEA 1BAYA 3ME8A 4G2EA 3BBYA 4V1Ag 4K1FA 2HE3A 1HYUA 1GUHA 3APQA 4FIWA 3DIEA 4J2FA 4TR1A 3H8QA 4XIHA 1K3OA 3QAVA 4MF7A 3ERWA 5G1KA 4PQIA 1O85A 4DSSB 4WXTA 4HZ2A 2IPAA 2GSSA 1OYJA 2PN8A 3KXOA 5B7CA 2PGTA 4O32A 1XPVA 3N9JA 3HZ8A 1U87A 1A8YA 5JCWA 3FEUA 2WDUA 2R3XA 2C8UA 3ZVJA 3UOMA 2N5FA 3IPZA 1H75A 2CVBA 4KA0A 2PERA 1HD2A 2RM6A 2HSYA 3TJJA 1EOHA 2NBSA 2V41A 1ERVA 3HJPA 1GWCA 2H6XA 4P3YB 2CZ2A 2MMZA 2F8FA 1SK2A 4K7NA 2X8GA 1WP0A 1S3CA 2DJ0A 1T4ZA 2YV7A 2PUKC 3F3QA 1T00A 1F9MA 2XC2A 3LYPA 2HFDA 3CTGA 2L4QA 1V9WA 2OADA 1SL1B 5ECSA 3ZFLA 17GSA 5IMZA 3CRUA 2FA4A 4TXOB 6GSXA 1SENA 3QMXA 3GTUB 2HZEA 3LQ7A 3UVTA 1KEBA 1XWCA 2VD1A 2R4VA 2VL9A 2OKAA 1PX6A 1I5GA 3TKSC 1QQ2A 4J56E 2FUG2 4WETA 2VCTA 4EE0A 2LUSA 1ERWA 3GSTA 2N5BA 3F9UA 2IMKA 4V2MA 1M99A 4NAXA 3DVXA 2LRNA 4GSSA 3GFKA 2BTOT 2REMA 3KMNA 2GGTA 3LJRA 1BX9A 3O3TA 1O73A 1B8XA 4WBJA 1JZWA 3P90A 1PL1A 3TJGA 4IP6A 11GSA 3WGDA 3HY2A 1SK1A 2DIYA 4IVFA 1VF4A 2IN3A 3PGTA 1T1VA 2B5EA 1WOUA 5KN1A 1GSFA 3EMXA 4HDEA 3G9BA 5CRDA 2JU5A 1EP8A 1X9SB 3KH7A 2H73A 1TU8A 3QCPA 3BCIA 2OACA 1AAZA 2WULA 1GTUA 4PNFA 4K6XA 1U6TA 2VCVA 1W4VA 3CSHA 1XFLA 4RUVA 1EV4A 1TOFA 4IJIA 2WRTA 3IDVA 4POLA 4IELA 3M3MA 2DBCA 2C80A 4POMA 4E8HA 5CYYA 4HI7A 4LA1A 2DJJA 5DQYA 3FHKA 14GSA 4MZCA 3LXTA 1MTCA 1U3AA 2GQMA 5IM9A 4ZB6A 4F2IA 3RAZA 5FT3A 5CRWA 1GSQA 1DUGA 3UARA 1URMA 4ZB8A 2LRCA 4G10A 6GSSA 1ERTA 1ZGNA 5JCUA 5G5EA 2YP6A 1FOVA 2ES7A 2H71A 3ERGA 1Z7RA 1X9MB 1TRUA 2X8CA 5DBQA 3QAGA 3VWWA 4CW9A 2VL3A 1QGVA 3H1NA 1TK8B 3ZLPA 1GSDA 2CV4A 1F3BA 1YF1A 4MH3A 5H5QA 3J7Yk 1XWGA 2MMAA 4IN0A 4TW5A 3HJMA 1UC7A 5J41A 3U6VA 2IWTA 2XPDA 3GUSA 2A2SA 2KHPA 2H75A 4IKHA 3ZRDA 4BVYA 1YEPA 1NW2A 4EKZA 18GSA 1EZKA 1XBSA 5AGYA 1YEXA 4EL1A 1DSBA 4DEJA 3ERFA 3TCOA 4AJ7A 4PGTA 1YY7A 3IK9A 3CXGA 4EDYA 1USBA 2LJAA 5B6MA 5ECRB 1K0NA 1SKSB 3EURA 4FYCA 4MH2A 4V2NA 1PKZA 1TI1A 3DGQA 4D73A 1LU4A 2MZCA 4RQRA 2GTUA 3W6GA 4TRXA 4L0WA 3CRTA 1A2MA 5ECPB 4IW9A 3KP8A 3PH9A 1MDJA 4I2UA 4HZ4A 5J4UA 3HKRA 2L57A 4DSQA 1MD3A 4F9ZA 4KAEA 1XWBA 2VAFA 3IC4A 4LLRA 4NWYA 4JE1A 3IHQA 1TRVA 1B9XC 1XIYA 1WWJA 5C00A 4LL4B 3EE2A 4ULXA 20GSA 4OWYA 1ST9A 4K0NA 1IYHA 3D22A 3G7JA 3APOA 3L9UA 3F8UA 3DWVA 1QUWA 4KUNA 4ILFA 3QDNA 2IL3A 1ZYEA 5D9WA 3GHAA 2E7PA 2D2ZA 3KEBA 3UVHA 4KCEA 4MJAA 3IRAA 3KJYA 3MWHA 4H86A 1R7HA 2DLXA 3C1RA 4CHSA 3UEMA 3MSZA 3HXSA 4WF4A 5IMAA 4HU9A 2I3YA 1VF3A 1GUMA 2JZRA 5LD0A 1K0OA 2GZPA 1MDIA 1A2LA 2CA8A 1V2AA 3FRCA 3TJKA 1PGTA 4BWSA 1X0RA 1YJ6A 5GZZB 3GL3A 3HHVA 2CT6A 2YWNA 2FWGA 4TR3A 4MLYA 1K0CA 2C4JA 3FR6A 3LSZA 5LCZA 4HJ2A 1TXXA 2QC7A 2RIIA 3FZ4A 1K0AA 1K3YA 2YPMA 4V2LA 2AJQB 2IIYA 2VCQA 5DALB 2CVDA 5IO2A 1JLWA 1O7UA 2G2QA 3TKSA 4HS1A 2E2MA 3KTLA 2C3TA 1Z6NA 2PMTA 3TJFA 3TOTA 3VURA 3SBCA 3D5JA 1XWKA 3FK8A 1GTIA 4TXVA 1SL0B 3M1GA 1B4PA 1QK8A 5A4VA 2JSZA 3APSA 1G6YA 4N0ZA 2M72A 1AQXA 1U88A 1VRSD 4WR4A 1TK0B 2X8HA 1X5CA 5HQPA 4ZILA 2KP2A 2C3NA 1A2JA 1T4YA 2YN1A 1YF0A 3I69A 1GSYA 3DYRA 2H0IA 4EC0A 2PBJA 3C71A 5ECMB 2HZFA 3N5OA 4HOJA 3TDGA 1B9YC 2O7KA 3GN3A 5DQSA 4PURA 3V1WA 5CREA 22GSA 2JACA 3C73A 5F07A 4G9HA 4OO5A 2H74A 4MPGA 2AUVA 5IMDA 2LJRA 1M2AA 3LORA 2L59A 2KOKA 1ZZYA 2P0GA 1EWXA 1PL2A 5D73A 2GT6A 4L5LA 3IAS2 2F51A 1KTEA 5AISA 4I6XA 2YJ7A 5LNKe 2K9FA 1Z3EA 2M46A 5AIVA 1PKWA 1BJXA 3HVVA 5COHA 2HSHA 3EC3A 1ZMAA 3RPNA 3MAKA 6GSTA 4XRAA 4XS4B 1YQ1A 1J0FA 2VL2A 5ELGA 4K7OA 3QD9A 4TR1B 1CQHA 3O76A 2FWEA 4KGIA 4ZIJA 4I5QA 5KN2A 3LEFA 4JZQA 4K8MA 3GKMA 1M2BA 3C1SA 1BQ7A 2OBIA 3VK9A 1G7OA 3UJ1A 4DSSA 2ON5A 1GL8A 4IS0A 3A2VA 4XRDA 5AN1A 5B8BA 5IOWA 5ECQB 3EMPA 2L4CA 4N0VA 4MJCA 3TKRA 2FD3A 4MCUA 3NIVA 4GSNA 4NMUA 2G0FA 3Q19A 2YJHA 1VF2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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