4HS1A

High-resolution crystal structure of glutaredoxin like protein nrdh from mycobacterium tuberculosis.
Total Genus 22
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
22
sequence length
84
structure length
84
Chain Sequence
TVTVYTKPACVQCSATSKALDKQGIAYQKVDISLDSEARDYVMALGYLQAPVVVAGNDHWSGFRPDRIKALAGAALTAHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
source organism Mycobacterium tuberculosis
publication title The Crystal Structure of Mycobacterium tuberculosis NrdH at 0.87 A Suggests a Possible Mode of Its Activity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutaredoxin NrdH, putative
total genus 22
structure length 84
sequence length 84
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4hs1A00
3KH9A 3MWHA 1CQGA 4GQFA 1BEDA 1R5PA 3EU4A 6GSXA 4DSRA 1EP8A 3HVSA 3ZVJA 1S3DA 1X5DA 3HXSA 3IRAA 1K0NA 1AAZA 4EE0A 5EVOA 3LG6A 3GA4A 1HQOA 1OC9A 2JL4A 1VGLA 2BJXA 4KX4A 2YWIA 3TKPA 4GTUA 4PNFA 1MDKA 2V2GA 3GKXA 2N5BA 2FD3A 2O85A 3EC3A 2VM1A 3IE3A 2I81A 1B4PA 4JBBA 3IXRA 2A2RA 1TRSA 1T4ZA 5JCWA 4OO5A 4PNGA 1UA5A 1BAYA 2K8SA 1VF2A 1SD8A 1THOA 2FWEA 2PMTA 1EP7A 4IW9A 4IHUA 4KNDA 3M9KA 2IJYA 3LORA 4HQZA 4LMVA 1GTUA 2VCZA 1HD2A 3BD2A 2IMKA 4G10A 1EZKA 4PX1A 2CZ3A 1B8XA 2B3SA 1TI3A 1OC3A 3LGCA 2MYGA 1VF3A 3L0HA 4GXZA 1M9BA 4TXOB 2DMLA 6GSWA 1ERVA 1XIYA 2WS2A 4ZB9A 2PVOC 22GSA 4XS6A 1BX9A 3EE2A 4K0NA 2H75A 5J5NA 4WR5A 1A2JA 1SJIA 3U5RE 3OR5A 2XPDA 4EUYA 3LJRA 1JZWA 2KHPA 1W4VA 3Q6OA 1PL2A 4FYCA 5J9CA 1OC8A 3VWUA 4V2NA 4OO4A 2LJKA 5DBQA 4N10A 4O5RA 2L57A 2YZUA 4EDZA 1UVZA 5ECLB 1SL1B 3HYPA 1O6JA 2JSZA 3CSHA 1AC1A 4L8EA 4FIWA 4K1FA 2H6YA 1HNBA 3KTLA 2HYXA 3SBCA 2RIIA 2MZCA 2RLIA 1TK8B 2CA8A 2WCIA 2CAQA 2GSRA 5G30A 3PR8A 3D5JA 2A4VA 5GAND 4YAVA 1XW5A 4HU9A 5FHIA 4CHSA 4K2DA 3IK9A 2CVBA 2WFCA 4E8EA 1WPIA 4Q5QA 2KP1A 1DBYA 5GSSA 5B6MA 3GKNA 4OD7A 3PINA 3P8WA 4L0UA 2BTOT 4IELA 3ERFA 2DMMA 1F3BA 2VCXA 1X9SB 5ECKB 5CYYA 2E2GA 3G7JA 3QFAC 5HR3A 4J2FA 5EY6A 4E8HA 3KZQA 3I6AA 2IFQA 3D4MA 5IQYA 2XPEA 3UMAA 1HNAA 3FYGA 1C72A 3HJOA 4TW5A 1J0FA 1Z9HA 3KH7A 5A4WA 5F05A 2FHEA 4IJIA 5IMFA 4I2UA 3RDWA 3ERWA 3QD9A 2HRNA 4NMUA 2V6KA 5G2ZA 2K18A 1DUGA 4ILFA 1XWCA 5KN1A 3RHCA 1F37A 1ST9A 3GIXA 3VWXA 1OKTA 1U88A 3ZZXA 5ECHB 1FB6A 3FEUA 5C00A 4IQAA 5DQSA 1M9AA 3WD6A 4MZBA 2VCQA 2CVDA 4J56E 3CRTA 5IPHA 1VF4A 2QGVA 2H74A 2JZSA 2H1AA 1ZOFA 2VL2C 3QDNA 4MH2A 2P5RA 2H76A 5A4VA 1T7PB 2LKUA 3L9SA 3QAGA 4NXIA 2PU9C 2X8GA 1T8EB 2DSAA 2OADA 1SYRA 2BMXA 4J57E 1X0RA 2WRTA 1Z7RA 1MTCA 4WETA 1LBKA 4TKYA 5A4UA 1M0UA 1FO5A 3RBTA 1SJZA 4ECJA 2B5EA 1U3AA 2VD1A 1EV9A 1WMJA 4Q5NA 18GSA 2G0FA 3NIVA 4RUVA 1EOHA 1M2BA 1M7TA 1DSBA 1E2YA 2X8HA 1GLPA 2H1DA 3HDCA 4POKA 1OYJA 3CSJA 3IOSA 4GQCA 4N11A 2GZYA 1Z5YE 2GQKA 5JCUA 5ELAA 4ZBAA 1PX6A 1WJKA 4K7IA 2OKAA 1GH2A 3RHBA 4KDXA 3VPQA 3EINA 2YP6A 4F82A 1Q98A 3C71A 4K6XA 6GSYA 3F4SA 3VPTA 5IMVA 3DEXA 2ES7A 3A2XA 3A3TA 1GUKA 1Q4JA 4RQXA 2HZFA 2L4QA 2HNLA 1GULA 1XWAA 5JWRB 3QPMA 2FWGA 4EXJA 4L5LA 4XS4B 4MABA 1SK1A 3KTBA 3ZMKA 2ALBA 2NBSA 3VWWA 4V2MA 4ISDA 2D2ZA 4IQ1A 1J9BA 2O7KA 1OE8A 1FOVA 3IBHA 4GSTA 4NV5A 1GSSA 4KB3A 4DSQA 4V1Ap 4X43A 1X5CA 5KEJA 5G5EA 1KNGA 3TOUA 4JR6A 1QK8A 4NPBA 1Y25A 1V57A 2EC4A 3GTUB 2H1BA 2E7PA 4BWQA 5D73A 2ON7A 3CTGA 3J7Yk 4ZL7A 3W8JA 2F51A 2PWJA 1JHBA 1SK2A 2F8FA 1XOBA 3V1WA 2AJQB 2OA7A 1YEXA 1ZCPA 2I4AA 1ZL9A 1ZYEA 5IMDA 2F8AA 5FT3A 3DYRA 3E9JB 4PXOA 1EWXA 1AQXA 3G9BA 3QR6A 5HR0A 3O6TA 2C3TA 4PQ1A 3P7XA 2CX3A 3QMXA 5C04A 1PA3A 1PMTA 1TXXA 4HZ4A 4YH2A 4YQMA 4IKHA 5E59A 3F3RA 4OFNA 1A23A 3TRQA 8GSSA 3GHAA 2C1YA 4MP4A 3IHQA 3G7YA 2CAIA 2EIRA 4N30A 1R5AA 4KSMA 4IBPA 1SD9A 4G9HA 2OE3A 5ECMB 4EDYA 4GCIA 4WF5A 4AF2A 1G7EA 1O85A 4DVCA 2YWOA 5DCHA 2HZEA 3KJYA 2WDUA 2R5GA 4NWYA 4JZQA 1ZMAA 1B9XC 1T1VA 4MJEA 1ILOA 3ZFLA 2NVLA 5DALB 2QKEA 2K9FA 4HOJA 1ACVA 4EC0A 2JADA 4BVYA 2GQMA 3CSIA 2IIYA 5CRHA 5ECSA 4TR1B 2JSYA 2LRTA 5AIXA 3TDGA 3VFIA 2GSSA 4HJMA 2KP2A 5B8AA 4O32A 1OVNA 4POMA 2KOKA 1M2AA 2O89A 1ZZYA 1F9MA 2CT6A 2XBQA 3VI5A 3TJJA 1KTEA 2ZCTA 4MLYA 3TB2A 1G6WA 2VL3A 2KUCA 2CX4A 4F9ZA 4TRXA 5ECPB 2L5OA 16GSA 6GSTA 4DSSA 1X9WB 3CBUA 4D73A 1K0CA 1TKDB 1TP9A 3I9V2 1SKRB 1ML6A 1H4OA 1Y6EA 4I6XA 3Q19A 3HJPA 2X99A 3GMFA 1FVKA 3N9JA 19GSA 1NSWA 2M72A 3CYNA 1QMVA 2J23A 2CV4A 3UL3A 1NW2A 1V40A 2H73A 3O3TA 1TW9A 2NDOA 4QL7A 5IO2A 2HI7A 4GRFA 3VWVA 2YWNA 1W89A 3GSTA 2LJRA 4PUFC 2M80A 2YANA 1MD4A 1MDJA 2FWFA 5DJLA 1EEMA 3PH9A 2RUFA 4OFTA 1PRXA 5GZZB 4I2TA 2LQOA 2VL2A 4AJ6A 5J4UA 2O87A 3F6FA 3BOAA 3ZVJD 3M0FA 3DGQA 2CZ2A 1AW9A 3M1GA 3KXOA 3WGXA 4NHWA 1DE2A 4ULXA 1GL8A 2GT5A 1E6BA 1FG4A 5LCZA 1GSUA 4FYUA 1R7HA 5IMZA 3F4TA 3DIEA 3GN3A 2FA4A 2B7KA 1TRVA 2VL9A 1PD21 4CW9A 3WGDA 1HNCA 2R4VA 2YN1A 4ZXGA 1OC9B 5EPFA 3EWLA 4QQ7A 2FGXA 2J9HA 3A5WA 1THXA 2ZNMA 3D0ZA 3HY2A 2X8CA 1PN9A 3H1NA 4EF0A 2EIQA 2B6MA 3LQ7A 1XW9A 3L4NA 4ECBA 2VO4A 2REMA 2YJHA 4HI7A 3LXZA 2DJ0A 2XBIA 3KMOA 1TTZA 3MSZA 4ML6A 1HYUA 3HVVA 1XWGA 3WT2A 1GSQA 1OKDA 4ECCA 1JLWA 1MDIA 2LS5A 4G2EA 3RPNA 2VCTA 6GSUA 4GSSA 1TK0B 1XVWA 4HDEA 3M8NA 4N0ZA 1XWBA 3AY8A 4LLRA 4F03A 5DCGA 1WOUA 2LNTA 3UJ1A 2VAFA 3GX8A 4Z7XA 2H72A 2R3XA 3PGTA 1TOFA 5G5FA 1MD3A 3GV1A 2IN3A 4JR4A 1XWKA 2FA8A 3ZIJA 2GS3A 3TGZA 1A2LA 4MJAA 3I69A 1IYHA 2AB6A 1TDIA 3H79A 5KN2A 3DVXA 4JEDA 1G6YA 1K3LA 1GSDA 3F63A 2TRCP 5HFGA 1SL0B 1QXHA 4O7HA 4XS1A 1K0MA 3GSSA 4HEA2 2N5AA 2RUEA 4Q5RA 4K7OA 4OCEA 10GSA 3UOMA 1A24A 2C8UA 2C0DA 4TOPA 2HE3A 3H93A 4EKZA 2YPMA 2GVPA 3E0UA 3DRNA 4K0GA 4ZIJA 2MMNA 4IGJA 2P5QA 3A2WA 3EMXA 4ZL9A 2PN8A 2WGRA 1GP1A 3UEMA 4WBJA 1PL1A 1K0AA 3IC4A 2H71A 3GUSA 2X64A 3P2AA 3EVIA 4L5OA 5D9VA 4PQIA 1FB0A 1WWJA 4BVXA 3CTFA 3I43A 2GDRA 4RI6A 5J9BA 3LWAA 3BJ5A 1AUCA 1VRSD 2VLTA 3IPZA 5INYA 2CVKA 3DKSA 3GYKA 3APOA 3WYWA 2GGTA 2IL3A 4MMMA 2CQ9A 1U87A 4XHMA 2LJAA 5A5KA 1B4QA 2A2SA 4WF4A 4WR4A 1M2DA 1AQVA 1RW1A 2HRFA 2PVQA 2VM2A 4JRRA 2LV3A 5ID2A 3F8UA 2LEGA 3EYTA 5B7CA 1X9MB 3QCPA 4HS1A 1BYEA 1SK0A 1JLVA 2C0EA 3RAZA 4BWSA 4K8MA 1PX7A 3JCML 3UBLA 3FZ9A 5IIZA 2LTKA 1G0TA 1QGVA 3ME7A 2L59A 1OE7A 3TKSC 3L9VA 5G1KA 1LJRA 4LL4B 1SL2B 3APQA 6GSVA 2ZUPA 2YV7A 3KP8A 5KN3A 1GWCA 4YAPA 1YY7A 4EO3A 3HZ4A 1X5EA 12GSA 5H5RA 3NOFA 5IPGA 1RQMA 5ECOB 5F0GA 4RQRA 2PERA 4PUAA 5D9TA 3ERGA 4POBA 4N0VA 4WBRD 2F3MA 5DAKA 1F3AA 4LL1B 5F07A 1A0FA 2OJLA 4F0BA 2GZPA 5B8BA 2L6CA 2GQLA 3UVHA 2JZTA 1GUHA 5CO3A 1TU7A 2PPTA 4GF0A 2R6KA 4IN0A 3C73A 3GRXA 3S9FA 5DVBA 2TRXA 3D22A 1SU9A 2LNSA 3ZYWA 4AGSA 2V41A 5JWOB 1TU8A 2K6VA 2FLSA 2V6OA 3KM6A 4CDOA 1FAAA 2C80A 3IDVA 3TKQA 3ZREA 4IS0A 1XCCA 3GX0A 3W8SA 2HSYA 1EEJA 1PKZA 3ZITA 2IMDA 5HFKA 5HQPA 1G7OA 4FO5A 3U6VA 2HLSA 1XZOA 3NZNA 4OWYA 2H01A 1EV4A 1EOGA 3TJFA 2DIYA 2YWMA 4EVMA 2HFDA 1WRYA 1K0BA 3KEBA 3QAWA 2YOIA 3UARA 4NAXA 1YEPA 1YKCA 3WGEA 2P0GA 1GRXA 4YQUA 1SKWB 2R2JA 3GKKA 3LEFA 3FZ4A 4RI7A 5IO0A 2RM6A 5CRWA 2VIMA 4QL9A 4KH7A 3HZ8A 1T4YA 5CRDA 1XW6A 1UN2A 5H5SA 1BG5A 2VCWA 2IMEA 3LYPA 4PURA 3UIWA 2MBTA 3FHKA 1SENA 4G19A 5HR1A 2DJJA 4EL1A 5L71A 1Z6NA 4HZ2A 2L6DA 3ME8A 1WE0A 4ID0A 1XBSA 5KN0A 4YQVA 4KDUA 1GLQA 4TXOA 2C4JA 2L5LA 2TIRA 2MMOA 4I5QA 1Z3EA 4LA1A 4ZB6A 3CXGA 1WP0A 3BBYA 3CRUA 2HZEB 5ABRA 2FNOA 3DVWA 1KBNA 3ISOA 2FWHA 2M46A 5ECRB 2H30A 4NV2A 2LUSA 3VI7A 5GSTA 4ZBDA 3L78A 4MCUA 4TR4A 2C3NA 3TUEA 2LRNA 4HJ2A 2VOCA 5CAXA 3K8NA 1SYXA 1O8WA 3TCOA 1XXUA 3ZRDA 5HR2A 3RPPA 2P31A 3TKSE 1GNWA 4XRDA 1O8XA 3UBKA 2C0GA 17GSA 2I3YA 5CNWA 1PKWA 3IAS2 2F9SA 2YV9A 3KMNA 1K0OA 5IOWA 2H0HA 3ZTLA 1XOAA 1H75A 1ON4A 4GWRA 4DSSB 5AN1A 3F6DA 4D73B 5IOXA 2HT9A 5DQYA 4HQSA 2H66A 1YQ1A 5H5QA 1GSYA 3R2QA 3ED3A 3G7IA 1VF1A 1LU4A 2IWTA 5D93A 2YZHA 2WZ9A 2H6XA 3P90A 3M9JA 4TVEA 5G31A 2PBJA 3LFLA 1FW1A 1AXDA 4KAEA 2H6ZA 1K3OA 2MMZA 4X1UA 1T00A 3O76A 5ECNB 3GH6A 2L4CA 1EGOA 3HKRA 3VURA 1O73A 5JWQB 5LD0A 4ZL8A 2QSIA 5G1LA 1JZRA 1N8JA 3H8QA 3F3QA 1O7UA 1A0RP 2AAWA 20GSA 3F9UA 5LNKe 5JCGA 2B1KA 4PQHA 2GLRA 3LXTA 4P3YB 2PGTA 4MH3A 4MJBA 4AJ8A 5IMAA 3D6IA 1YZXA 1QQ2A 1FVJA 3TKSA 4F2IA 2K8VA 2H0IA 4BL7A 4KSOA 4BA7A 3GNJA 4WKWA 3FY7A 2MMAA 1T3BA 5AISA 4KGIA 3TRXA 1A2MA 1GTBA 1V2AA 3C7MA 2VUPA 2AYTA 1UC7A 3Q74A 5DDLA 3MAKA 2YCDA 2B5XA 4POLA 1YF0A 2VD0A 2GT6A 2WJUA 2FUG2 3KD0A 1F6MC 3HCZA 3QFBC 2VLVA 2FCHA 1YJ6A 3IR4A 4ZILA 5CP1A 3GL3A 2E2MA 4ML1A 4GLTA 4WEYA 3FK8A 2LQQA 3DMLA 1YKAA 4XRAA 1XVQA 3TRPA 2H70A 3HA9A 1TK5B 2H8LA 2GTUA 1JFUA 1CQHA 1N2AA 4LMWA 1XFLA 2Z9SA 2DJ2A 1K3YA 2LSTA 1NM3A 2HSHA 11GSA 3DWVA 4MF7A 1NHYA 3TJKA 3MNGA 4HUAA 3L9UA 5D9XA 4KUNA 1GUMA 4IP1A 2B5YA 2NPBA 4MZWA 4MDCA 2OBKA 7GSSA 1XPVA 6GSSA 1Z6MA 2RM5A 4BPYA 1QUWA 4WXTA 3BCKA 5ECQB 14GSA 1GTAA 1JZOA 5F8BA 2E0QA 4JE1A 1QFNA 3D4TA 2DBCA 3FRCA 2EIOA 4OFMA 1ERWA 4XS4A 5DJMA 3TOTA 3ZL5A 2YNXA 4ZBBA 4KCEA 2LRCA 4FYBA 1A8LA 2GSTA 3FR3A 1O81A 3EURA 5AGYA 4KA0A 1TRUA 2KLXA 1R26A 4KDYA 5GAPD 2IFQB 1JZDA 4XTSA 9GSSA 2VCVA 3FW2A 5AIVA 2IMIA 4ACSA 2XC2A 2OE1A 4MF6A 5D9WA 3WT1A 3GL5A 4PGTA 2PUKC 4FH8A 1M99A 4MZCA 3GTUA 2C0FA 1Z7PA 5FWGA 4O92A 4KCAA 5J3RA 3ZMLA 2H1GA 3D21A 1GTIA 3DXBA 2DLXA 3F4RA 1WIKA 3SWLA 4I8BA 2H0GA 2HXKA 4ZB8A 2I9HA 2JACA 1TJDA 3MDKA 3N5OA 4TR0A 1MEKA 3FZAA 5ECIB 3TJGA 5CREA 1ERUA 4I97A 3LSZA 3GFKA 2JU5A 2B1LA 3TKRA 3H4KA 4F0CA 1FHEA 1EGRA 1BJXA 5ELGA 1J08A 1TI1A 4IJ3A 2AHEA 2DIZA 3TJBA 4DEJA 2AUVA 4NHZA 3FKFA 1SJ6A 4IP6A 1GNEA 2IMFA 3F0IA 1YF1A 5E4WA 3APSA 1ERTA 3GH9A 3C1SA 4K7NA 4HU7A 1K0DA 1I9DA 4L0WA 3DD3A 4XIHA 4KW6A 2OE0A 2VLUA 1S3AA 4KE3A 4MF5A 1YDKA 4GSNA 4TXVA 3ZIVA 1URMA 5DALA 5COHA 3LYKA 4ECIA 1TRWA 3W6GA 1U3IA 2QC7A 4TR1A 4X0XA 13GSA 3IA1A 2GSQA 1ZYQB 3FZ5A 2B7JA 4K9ZA 3E3EA 5D96A 1AIUA 2OACA 3US3A 2DJ1A 1IYIA 1NHOA 3ZFBA 5EL8A 5ID2B 5ENUA 1KEBA 3Q18A 2I1UA 2DJKA 5IM9A 4TR3A 2N5FA 2MBSA 2WB9A 3UVTA 2DJ3A 3VLNA 1PQNA 2IPAA 2ON5A 3UAPA 2H19A 3IK7A 5HFIA 1GSFA 3QAVA 3HD5A 3KCMA 1B9YC 3KP9A 4MJCA 5F06A 4H86A 4MPFA 2DC5A 1V58A 2GZZA 2R37A 4MA9A 1DE1A 3BCIA 2O8VB 4V1Ag 5IMCA 3IV4A 4MK3A 3GURA 1PGTA 2C3QA 4MPGA 4Q5FA 1OAZA 2V1MA 3KIJA 1V9WA 2G2QA 1B48A 1R4WA 2OBIA 3EMPA 1AQWA 3CMIA 1ABAA 3C1RA 5DAKB 3VK9A 2JZRA 5CRGA 3A2VA 3FR9A 3IAM2 4TN8A 1GSEA 4XCSA 1F2EA 3HJMA 3M3MA 2AV4A 2NTOA 1V98A 4V2LA 1RK4A 2YJ7A 1BQ7A 3EU3A 1PSQA 5B6NA 3FR6A 1SKSB 4AJ7A 1U6TA 3ZLPA 1A8YA 4OCFA 3HVXA 1S3CA 2V32A 2WULA 3QOUA 1USBA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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