4HS1A

High-resolution crystal structure of glutaredoxin like protein nrdh from mycobacterium tuberculosis.
Total Genus 22
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
22
sequence length
84
structure length
84
Chain Sequence
TVTVYTKPACVQCSATSKALDKQGIAYQKVDISLDSEARDYVMALGYLQAPVVVAGNDHWSGFRPDRIKALAGAALTAHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Crystal Structure of Mycobacterium tuberculosis NrdH at 0.87 A Suggests a Possible Mode of Its Activity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutaredoxin NrdH, putative
molecule tags Electron transport
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 22
structure length 84
sequence length 84
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4hs1A00
2IJYA 1T1VA 4K7IA 2I81A 5ECPB 3KZQA 1PD21 1ABAA 3UVTA 2WULA 2JADA 1PRXA 1PKWA 3C71A 3F63A 4RUVA 1W89A 2B7JA 1PQNA 2PU9C 4AF2A 2KHPA 4KSMA 14GSA 1K0AA 4H86A 2AUVA 3BJ5A 5LCZA 4WEYA 2FUG2 5HR3A 2P5QA 3DVWA 1O85A 3IDVA 2FY6A 3WYWA 2OBIA 5IOWA 1B9YC 1XVWA 3ZVJA 4K8MA 2VLTA 3W6GA 3KP9A 1GTUA 1OKTA 4E8EA 5G1LA 4POBA 4X1UA 1TP9A 2C0EA 3LG6A 4EKZA 1SKWB 5A5KA 4JRRA 3Q19A 4ECIA 1GSUA 4G9HA 4KDUA 1HNBA 2VM1A 3CXGA 2YZHA 1EOHA 4XRAA 1OC8A 3L9VA 2YWNA 3KIJA 3TJBA 1OE8A 3EWLA 5CNWA 2WGRA 1A8YA 3DIEA 2HZEA 4NV2A 3QPMA 4GF0A 3VLNA 2L57A 2GSTA 3TGZA 4NMUA 2FWGA 3EMPA 4I2UA 3MAKA 3RHCA 1YF1A 2DJKA 4TXVA 5E4WA 1BG5A 3WT1A 1O8WA 2FNOA 5AISA 5A4UA 2OACA 2ES7A 3TJJA 1TRUA 3HY2A 1TK8B 4ZL8A 2E7PA 1VF4A 1BJXA 2YANA 5IMVA 1XBSA 5DALB 3RDWA 1V40A 5DJLA 2GZZA 3QAGA 3E3EA 3WT2A 1URMA 1TU8A 4BPYA 3GH9A 3VWVA 4ML6A 2N5FA 4IVFA 3PGTA 3FY7A 3APOA 3M9JA 5DDLA 5G30A 1S3CA 1JZRA 3UARA 1MD3A 4AGSA 5DVBA 4ZB6A 3GH6A 5ELAA 4KCAA 1BEDA 1JZOA 2GQKA 2IPAA 3CTFA 1VF2A 4KDXA 5ECQB 4D73A 2H8LA 3DYRA 2R5GA 2IWTA 1GNWA 2CX4A 4MP4A 2H73A 5F07A 3ZIVA 1R5AA 4KB3A 5G5EA 4MZCA 1MTCA 2HT9A 1Z6NA 1R7HA 1TRWA 2J9HA 1B8XA 4TR3A 4OD7A 2PBJA 3LWAA 1XWGA 2PGTA 2F51A 4FH8A 2YWOA 4I5QA 1ZYEA 3ZREA 4BWSA 2WDUA 4WXTA 4NV5A 2VCXA 5GSTA 2EIRA 2GTUA 2VM2A 4KX4A 3DRNA 5IOXA 1QUWA 1USBA 4GLTA 1F3AA 3RAZA 4QQ7A 1V9WA 5IO2A 2K18A 3APSA 2PN8A 4GQCA 4LLRA 3KJYA 4YQVA 1HYUA 6GSVA 2VL9A 3GKKA 18GSA 4L5LA 2CZ3A 3J7Yb 4IP1A 3HXSA 1IYIA 4KNDA 3HDCA 3KCMA 5CRDA 1AW9A 1XWAA 3PH9A 1GUMA 3IXRA 3U6VA 4PXOA 1N2AA 3CSIA 5A4VA 2AAWA 1ZGNA 4MZWA 1I9DA 1LBKA 2GZYA 1YDKA 4F0CA 4MZBA 7GSSA 1T00A 1GUHA 2X99A 1DE1A 2C0DA 1TKDB 2F3MA 3PR8A 2OE1A 2GT6A 4WF5A 5FT3A 1ERWA 3TJGA 3UOMA 5DBQA 3VWUA 1TK0B 5ABRA 2KLXA 4IJ3A 5ECHB 2DBCA 5JWOB 2L6DA 5D9TA 1TRSA 3IV4A 2HRFA 3L4NA 1HD2A 1WJKA 3RHBA 1M2BA 3RBTA 4MCUA 1QMVA 2ON7A 5H5SA 3UJ1A 3ZZXA 1AC1A 4E8HA 1YF0A 1BX9A 3GIXA 1YJ6A 3TRXA 3FR3A 1O81A 2B5EA 5GAND 4BVXA 3HJPA 1DE2A 4EDYA 5GSSA 1OAZA 4WF4A 5EL8A 5KN3A 2LQOA 3HD5A 1OC3A 2DC5A 4Q5NA 1OKDA 2DSAA 3TKSA 2M72A 1TJDA 2DMLA 2N5BA 1X0RA 4MA9A 4X0XA 1VGLA 5IMCA 2AV4A 1E2YA 1O6JA 5JWQB 5LD0A 3GL5A 4ZIJA 3DD3A 2N5AA 1MDKA 3LEFA 4TXOA 1THXA 1LJRA 3LGCA 5KEJA 1DUGA 5IIZA 3UIWA 2YP6A 4OFNA 1JHBA 3M1GA 3ERGA 3Q74A 3C73A 4YAVA 2H6ZA 2MMNA 3E0UA 5JCGA 2REMA 4JR4A 4XS6A 5C00A 4XCSA 2VD1A 3MSZA 1XXUA 5AN1A 3L9UA 3FR6A 1GTBA 1J0FA 5KN1A 4MDCA 4EUYA 2E0QA 2FWHA 2C3TA 2VD0A 3GA4A 5HFKA 2A2RA 4KCEA 4J57E 3CSHA 3SBCA 1U3IA 3WGDA 5B6MA 1SKSB 1F2EA 3DGQA 4MJAA 3QOUA 5CYYA 3TKSE 2IL3A 3TRQA 2P0GA 3NIVA 5B8AA 4OWYA 4G19A 2MZCA 4V1Ap 2ALBA 5DQYA 20GSA 5INYA 4OCFA 3TJFA 1CQGA 3LYKA 1NSWA 4XS4A 1C72A 3H1NA 2E2MA 2HFDA 2A2SA 3F3QA 5ENUA 4QL9A 5D73A 1GUKA 1X9SB 4K0NA 1A24A 4D73B 2LTKA 1VF3A 4KE3A 1XFLA 2DJJA 4DSRA 2M46A 3Q6OA 3HVXA 4MABA 4GRFA 1J9BA 5D96A 2L4QA 3BCIA 1X5EA 2K9FA 3FRCA 2R4VA 3FR9A 1G7EA 1FO5A 5J9CA 1WWJA 2E2GA 2BTOT 1S3DA 1PX6A 2JSYA 1ERVA 1X9WB 3H4KA 1M9AA 4TOPA 2CT6A 3Q18A 2IFQA 1PX7A 2GQLA 5ECMB 1BQ7A 4K7OA 4NWYA 2H0GA 1QGVA 3IC4A 1LU4A 2GT5A 2JZSA 3TOUA 2BMXA 1Z3EA 1M99A 3GN3A 1B4QA 1FB0A 2CX3A 1EGOA 4FYBA 4GWRA 2WZ9A 4PNGA 3KTLA 1BAYA 4KW6A 4AJ7A 2GSRA 3TKQA 1AIUA 1TRVA 3N5OA 3I6AA 2YPMA 1SK0A 4IQ1A 1PSQA 3IRAA 3F4RA 1FAAA 1BYEA 2P31A 2R3XA 3ZITA 2IMFA 3TCOA 22GSA 4MMMA 4HZ2A 2HE3A 5G2ZA 2IMEA 1UVZA 1FG4A 2QKEA 3W8JA 4GXZA 2WCIA 4ZB9A 3IK9A 3GL3A 5DAKB 2V2GA 1T4ZA 2NBSA 4LMVA 3U5RE 1SKRB 5J41A 4I6XA 2JZRA 3A2VA 2VAFA 4KH7A 4MJCA 3W8SA 2DJ3A 1XPVA 3O76A 1QXHA 6GSSA 1K0OA 1UA5A 2EC4A 3CRUA 1O7UA 5IMZA 4OMVA 4L0UA 2HSHA 4HU7A 2AYTA 2HNLA 5DJMA 2C0GA 3EC3A 2LRCA 1G6YA 4XRDA 4JE1A 3ISOA 2FA8A 2QGVA 4V2LA 5LNKe 1QQ2A 1TU7A 1GSDA 2CVDA 1YEXA 5G31A 2H74A 4CHSA 3ZFBA 2D2ZA 1ACVA 3H93A 2KOKA 4TN8A 4GSNA 4Z7XA 1DSBA 2GLRA 3FK8A 4JR6A 4HOJA 2HI7A 5D9XA 3WGXA 1QK8A 3KH7A 1GL8A 2LQQA 2NTOA 4EVMA 1GSYA 1RW1A 2RIIA 4KA0A 3GX0A 4PUFC 4PX1A 2V41A 1Z7PA 1TXXA 3O6TA 2P5RA 4QL7A 3D0ZA 2VUPA 3GKXA 4K1FA 3QFAC 1OE7A 1WIKA 3KEBA 3NZNA 4KAEA 5ECKB 1SJZA 1M2AA 4IQAA 1FB6A 1SJIA 5KN2A 4O92A 4ACSA 10GSA 4TXOB 5G5FA 1JLWA 1DBYA 5ECSA 1EV4A 3F9UA 2X8GA 2B5XA 1SL0B 3VI7A 2GSSA 1XZOA 4LMWA 2FHEA 2JACA 1XOAA 1G7OA 3H8QA 1GULA 2VLUA 2DLXA 1MDJA 1GSFA 3S9FA 3CMIA 3P2AA 1AUCA 1F3BA 2H1BA 11GSA 5IO0A 2H1GA 3QCPA 3MWHA 17GSA 1V57A 3TOTA 3C1RA 2QC7A 2B1KA 1Z5YE 3KXOA 1UN2A 3UBKA 2YV7A 3TDGA 4X43A 2JL4A 4MPGA 2CVKA 3ED3A 1FVKA 1XOBA 4XS4B 2B7KA 2G0FA 2XPEA 5CO3A 2L5OA 1VF1A 3P7XA 3EU4A 1FHEA 4EE0A 1KTEA 2OADA 1U87A 1XW5A 3K8NA 4HJ2A 3LJRA 3WGEA 3IE3A 1WPIA 4F2IA 8GSSA 4JZQA 4BA7A 5D8IA 3L0HA 2H1AA 1PL2A 2KP1A 4ZBDA 3ZIJA 3G7YA 2LUSA 3BCKA 2H30A 5HFIA 3GMFA 3KM6A 5F06A 2H6YA 2LEGA 4O7HA 4HI7A 2HYXA 1OYJA 2CAIA 3KTBA 4BWQA 1JLVA 2IFQB 1MDIA 2LSTA 4IELA 4LL4B 3CSJA 2MBTA 2YWIA 3D4TA 2DJ2A 4K6XA 1EEMA 3RPNA 5J4UA 3DKSA 2OKAA 2C3NA 4KSOA 2I9HA 1YEPA 2WFCA 2LS5A 3GX8A 5DAKA 2VLVA 4WR5A 4P3YB 4HUAA 2TRXA 5IQYA 4PURA 2R6KA 4HU9A 1Q4JA 2FA4A 1SL1B 5IMFA 4NPBA 3G7IA 3GURA 13GSA 3HVSA 4JU5A 5CP1A 1NM3A 3LORA 2LNTA 4V2NA 4OFMA 2K8VA 2LRNA 3HKRA 4ZBBA 3IHQA 4JEDA 5HFGA 1Z6MA 1Z9HA 4N30A 3A2WA 4PQIA 3ZYWA 2ON5A 1ILOA 3C7MA 4MF6A 4GCIA 2C4JA 4DSSA 1YKCA 3TJKA 2H0IA 1PGTA 1TTZA 2VCWA 3ZMLA 5CRHA 1ZCPA 3I9V2 3F0IA 2DJ1A 9GSSA 1A0FA 4YH2A 2AHEA 1A23A 3MNGA 4IP6A 4TW5A 4EXJA 4V2MA 2JSZA 3FZ5A 3F6DA 5HQPA 1EGRA 4ECJA 1NHOA 2YJHA 2LNSA 5ECRB 1Z7RA 5FHIA 2CV4A 2VL2C 4IW9A 4NAXA 4DVCA 1H4OA 3APQA 4IS0A 2NDOA 1XW9A 3IAM2 5HR0A 3FHKA 2H01A 1EP8A 4ID0A 4BVYA 3GRXA 2XBIA 4ULXA 2OBKA 1XWKA 4F9ZA 3FYGA 4XIHA 1X9MB 1A2MA 3GHAA 3TRPA 1B9XC 1F9MA 4MF7A 3BD2A 1K0CA 2JU5A 4ZILA 3IK7A 3TKRA 4Q5QA 5B6NA 2V1MA 3HZ8A 2EIOA 1WOUA 1HNCA 3EU3A 5AGYA 4DEJA 4HJMA 4WR4A 1ML6A 5JWRB 2VCVA 6GSTA 3P8WA 3ERWA 2G2QA 1S3AA 4WETA 1A2LA 1ZL9A 2FLSA 2CZ2A 5ELGA 2XPDA 1SL2B 3BOAA 3C1SA 1EP7A 4MPFA 4I2TA 1Y6EA 4ECCA 4IBPA 5F05A 3TUEA 3D22A 16GSA 2VO4A 4FIWA 1EZKA 5GZZB 2K8SA 1GH2A 4WBRD 5JCUA 5CRWA 1WP0A 5ECIB 2GSQA 4XTSA 1XWCA 3H79A 3GFKA 2IIYA 1SK2A 3IPZA 4ISDA 4LL1B 1UC7A 3J7Yk 4FYCA 2X8HA 1FVJA 1VRSD 1EOGA 1X5CA 3LSZA 2O87A 2O7KA 5HR2A 2O85A 2OA7A 2RM6A 3HVVA 3M9KA 2K6VA 1U88A 4J2FA 1SD9A 2DIZA 3KD0A 2I4AA 3QDNA 1ERTA 1ERUA 3PINA 3VWXA 1WMJA 1SYXA 5EVOA 4YQUA 3LXTA 5F0GA 1G6WA 1SD8A 1XIYA 1TDIA 4Q5FA 2TRCP 2H72A 1JZWA 3VPQA 4TVEA 1GP1A 3QR6A 4POKA 2HXKA 2HSYA 2V6OA 2FWEA 4MK3A 2GQMA 2PPTA 4I97A 1G0TA 1U3AA 3ZRDA 1J08A 2VL3A 4EF0A 3HHVA 4PNFA 4AJ6A 3L78A 2PVOC 4G10A 3IAS2 5G1KA 3IOSA 1YKAA 1O8XA 6GSXA 3UEMA 3JCML 1TI3A 3FZ4A 4AJ8A 1K0MA 4I8BA 3HYPA 4IN0A 2DJ0A 2Z9SA 3CRTA 2LV3A 3HA9A 2LKUA 3FEUA 4O5RA 4DSSB 3EURA 2WB9A 2MBSA 2VCZA 2GZPA 2I3YA 4RQRA 5JCWA 1XVQA 3BBYA 4FO5A 2PERA 3GSSA 5IMAA 5EPFA 2L6CA 4EL1A 2J23A 1IYHA 3N9JA 3ZFLA 5E59A 1GSSA 4PUAA 2WJUA 3GTUA 3D4MA 4MH2A 3ME7A 2B6MA 2PWJA 3CYNA 3KGKA 3IBHA 3NOFA 2YN1A 4WKWA 4GSTA 1MD4A 3HJOA 1W4VA 5J9BA 3SWLA 2L4CA 2YV9A 3TKPA 2ZUPA 2TIRA 2F9SA 4IGJA 2IN3A 3RPPA 4TKYA 5ECLB 1XCCA 2M80A 3L9SA 2LJKA 2R2JA 4HDEA 5D9WA 3D6IA 5EY6A 4IHUA 4ZBAA 2RLIA 1PKZA 3EVIA 2CAQA 2XC2A 2ZNMA 4IKHA 1JZDA 3VWWA 2C3QA 3EE2A 3R2QA 1OC9A 4GSSA 1K0DA 2OE0A 1EV9A 4J56E 4HEA2 2EIQA 1JFUA 4MJEA 2F8AA 5L71A 2X64A 4MJBA 3IA1A 4GTUA 1GTAA 4HQZA 2FCHA 3GUSA 4HQSA 4L0WA 5ECOB 5GAPD 3D5JA 3LFLA 1K3LA 1AAZA 6GSYA 1SJ6A 1F6MC 5ID2A 1TK5B 3QAVA 1R26A 2C0FA 3GNJA 2LJAA 1NHYA 4TR1A 4ZL9A 3V1WA 3UBLA 4N0VA 2GGTA 2XHFA 2WRTA 4TR0A 3DWVA 4PQ1A 4EO3A 1X5DA 3QD9A 2R37A 4V1Ag 2B1LA 3UVHA 3MDKA 3LQ7A 2VCTA 1ZMAA 2OJLA 5H5RA 1T4YA 3FKFA 2VL2A 1T8EB 2IMKA 3UL3A 3DEXA 2C1YA 2H75A 3GKMA 2IMDA 4KDYA 5J5NA 3AY8A 1ST9A 5AIVA 5AIXA 1PA3A 1M2DA 2VCQA 1KBNA 3KMNA 5C04A 2H19A 1MEKA 1SU9A 2YZUA 4XHMA 2ZCTA 1XW6A 2H0HA 5IMDA 1F37A 3HCZA 3IR4A 3CTGA 2HZFA 4YQMA 3ZMKA 2H76A 5COHA 4K0GA 2YOIA 2WS2A 3HJMA 3CBUA 3VI5A 3VK9A 4TR4A 1V58A 2FWFA 5KN0A 3KH9A 1YQ1A 4KUNA 3DMLA 2GS3A 4RI6A 4F03A 1EEJA 5J3RA 1GTIA 5D9VA 1I5GA 4ZL7A 4YAPA 4N10A 2LJRA 5IM9A 4N11A 1K3YA 2H1DA 3F8UA 2C80A 3WD6A 5CRGA 2FD3A 4K7NA 1GLPA 1SYRA 1XWBA 1TI1A 3G7JA 6GSWA 2MMOA 2KP2A 4L5OA 2AJQB 3DVXA 5IPGA 2V32A 3US3A 2BJXA 3OR5A 3A2XA 5H5QA 2B5YA 2RM5A 4EC0A 5HR1A 3F4TA 2O8VB 2YCDA 4K9ZA 3ZLPA 1PN9A 1GSEA 4K2DA 1WRYA 2LRTA 3M3MA 4CDOA 5F8BA 1V98A 1KEBA 1O73A 3O3TA 1GRXA 3UAPA 3KMOA 4MF5A 4KGIA 3VURA 3F4SA 2OE3A 1Q98A 1H75A 4NHZA 4HS1A 5CAXA 1ON4A 3I43A 3FW2A 3DXBA 4G2EA 3ZL5A 1RK4A 1N8JA 4XS1A 5DQSA 1EWXA 2VIMA 4IJIA 1M0UA 1ZOFA 3LXZA 1PMTA 2PMTA 1GSQA 3UMAA 2KUCA 4ZB8A 3GTUB 1GWCA 1AQWA 2FGXA 3M0FA 1A0RP 3FZ9A 2RUFA 3GKNA 2JZTA 3GYKA 1T3BA 2DMMA 1RQMA 1T7PB 2HZEB 4RQXA 3F6FA 2XBQA 3FZAA 1A8LA 4ZXGA 4OO5A 3I69A 5DCHA 3P90A 3EMXA 4PGTA 1E6BA 4FYUA 1R5PA 5IPHA 2RUEA 4EDZA 1PL1A 2GVPA 3M8NA 5DALA 4ECBA 5FWGA 1AQXA 5ECNB 4Q5RA 1AXDA 1B48A 4MH3A 3HZ4A 2NPBA 2QSIA 2VOCA 4ML1A 1M9BA 4O32A 1THOA 3QAWA 1AQVA 2V6KA 3QMXA 4LA1A 3GSTA 2A4VA 1TOFA 3GV1A 2CVBA 3ZTLA 4POLA 3QFBC 4OCEA 2MMAA 2YJ7A 4TRXA 19GSA 2HRNA 2F8FA 1OC9B 5B7CA 5A4WA 2PVQA 3EINA 2NVLA 1ZZYA 4L8EA 1K3OA 1NW2A 2PUKC 2YWMA 1YZXA 5B8BA 2H66A 3KP8A 6GSUA 1OVNA 4PQHA 2MYGA 1K0BA 4DSQA 2H70A 2HLSA 4CW9A 5ID2B 2L5LA 3C8EA 4ILFA 4F82A 1HNAA 2O89A 1CQHA 1U6TA 3G9BA 4BL7A 1R4WA 1QFNA 4GQFA 2X8CA 1V2AA 4JBBA 1TW9A 4TR1B 5CREA 12GSA 1Y25A 1SK1A 1GLQA 3ME8A 3E9JB 3TKSC 1A2JA 4MLYA 3VPTA 3ERFA 1FW1A 4OFTA 4NHWA 4WBJA 4OO4A 2YNXA 1YY7A 3A3TA 1ZYQB 3VFIA 2AB6A 1HQOA 2B3SA 4F0BA 1WE0A 5D93A 5DCGA 1M7TA 2CA8A 1GNEA 2H71A 4N0ZA 3F3RA 1B4PA 3TB2A 2DIYA 1KNGA 1K0NA 2I1UA 3ZVJD 4POMA 1SENA 2H6XA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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