4I2TA

Crystal structure of the oxidized glutaredoxin from chlorella sorokiniana t-89
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
SAAKQLVDSTISGNKVVIFSKTYCPYCVKGKRALEKFLPKSKITAIELDGRNDGAAIQDYLLELTGGRSVPRVFIDGQFIGGGDDTDALARNGKLEVMLRNAGVLLEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Chlorella sorokiniana
publication title Crystal structure and functional analysis of glutaredoxin from Chlorella sorokiniana T-89
rcsb
molecule keywords glutaredoxin
total genus 34
structure length 108
sequence length 108
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4i2tA00
2PN8A 3ZFLA 3D22A 3HJPA 1TK5B 1B9YC 2VUPA 3W8SA 1SJ6A 1VRSD 3GKNA 4DSQA 4GXZA 2EIOA 1NW2A 3GX0A 1LJRA 4KAEA 3LJRA 2FWEA 1GLQA 4LA1A 1OE8A 4LMVA 4HOJA 1KEBA 3DD3A 1WWJA 3HY2A 3C8EA 3Q74A 1R26A 2VAFA 3GV1A 3EC3A 3F4RA 5ECKB 1R7HA 2H70A 2CAQA 4ECIA 5HFGA 4MZCA 2XBQA 3F63A 3FKFA 5DQSA 2VOCA 4IBPA 4HDEA 3DVXA 4OO5A 4PXOA 3FRCA 4ZIJA 2DJKA 2DJ2A 1XIYA 3HKRA 3KD0A 4FYUA 3W6GA 1RQMA 1T1VA 4ECCA 4K7OA 2GSRA 5H5QA 3UMAA 2MYGA 2VCTA 3CSIA 1EV9A 3ZVJD 1IYHA 1YEXA 2MMAA 3GX8A 4GWRA 3CBUA 3K8NA 1XXUA 4BWQA 4OFMA 3FEUA 3NIVA 4KSMA 3GTUA 4WEYA 4F9ZA 4NV5A 6GSWA 4WR4A 1SYXA 5IO0A 5C00A 4KDXA 4ECBA 2GDRA 1ERUA 3TJKA 3LGCA 4PQIA 1PKZA 1GLPA 4G9HA 3NZNA 1Y25A 1XWKA 4MPGA 1OC8A 4K9ZA 1PA3A 3ZREA 2QSIA 2IJYA 4WBJA 2V6KA 4TR1A 3ZMKA 6GSTA 1FOVA 4V1Ag 2IMEA 2LS5A 2VL2A 3F0IA 3VFIA 2GZZA 5DBQA 5KN2A 3UBLA 2RLIA 5HFKA 4N11A 4NHWA 5ELAA 3IAM2 1X9WB 1O7UA 2C3TA 3TKSA 3TJBA 1SKSB 1AW9A 3UL3A 3M3MA 1SL0B 1ABAA 2VM2A 3GNJA 4GCIA 4YAVA 4OO4A 4TN8A 2GGTA 2GQKA 3SWLA 4TR0A 4MK3A 2H66A 2YWMA 2CQ9A 4PGTA 1X9MB 1TRSA 4IQAA 4TR1B 2PVOC 5ID2A 3UVTA 5HFIA 1MDJA 2L57A 4J57E 3TRQA 1Z6MA 5HR2A 3HA9A 3TKPA 1VF4A 1M9BA 4IP1A 3VK9A 2L6DA 5B6NA 1AQVA 3UJ1A 5D96A 1ZZYA 3ZITA 2E0QA 3UBKA 7GSSA 4K8MA 4PUAA 5DCHA 3VLNA 3DXBA 19GSA 2K8VA 1UN2A 4K7NA 1QGVA 1TU8A 3GL3A 5CNWA 4LMWA 4J56E 5A4WA 4MA9A 1VF2A 2XPDA 3LQ7A 1JZOA 3QD9A 5ID2B 4ILFA 2IMFA 2H30A 3LEFA 1YQ1A 3LSZA 5GSSA 2X8GA 1SJIA 4WETA 1JZWA 1TKDB 3I69A 1WOUA 2ZCTA 1O6JA 2H6ZA 4Z7XA 5LCZA 1XZOA 4I6XA 1U88A 2H1AA 3HVXA 2P31A 5ABRA 1GSUA 2H1DA 1JZRA 1A24A 2A2RA 4KNDA 3A2VA 1SL1B 3RBTA 2AHEA 3GFKA 3IBHA 4GQFA 3VI5A 4WKWA 1XVQA 3O3TA 3L9UA 3QPMA 1HNCA 2I4AA 1N8JA 3MDKA 2H01A 5F0GA 3APQA 2VL9A 1TU7A 3N9JA 2VCQA 3KMNA 1GSFA 4N0VA 2GZPA 3RHBA 1V2AA 3GSSA 5B7CA 2X99A 1A2LA 1JZDA 1CQGA 3CYNA 4IGJA 1KNGA 5IPHA 4MPFA 2LEGA 4OFNA 2OE0A 1XWCA 5HR3A 5IQYA 1EP8A 4XS1A 4AJ7A 1GSQA 5KN1A 3MNGA 3FK8A 3ZMLA 2PERA 4NV2A 1G6WA 2LUSA 22GSA 4F2IA 4V2NA 5DCGA 2M46A 3M9KA 4L5LA 1V9WA 4OD7A 2LV3A 2OBKA 4ZBDA 1YF0A 3GIXA 2G2QA 3TKSE 4TKYA 2DJ0A 1FB6A 3TB2A 2B1LA 3CRTA 1X0RA 1WP0A 4JEDA 9GSSA 2L5OA 2Z9SA 1FB0A 4PUFC 5AIXA 2X64A 4GF0A 4NXIA 3UAPA 5DVBA 1VF3A 3D6IA 5IMVA 4L5OA 2QC7A 3FZAA 2CV4A 4ISDA 2FWFA 4JRRA 2MMZA 2RM6A 4KDYA 4TR4A 3U6VA 3C73A 4F82A 3KP8A 5AIVA 5G31A 5KN3A 4XRAA 5D73A 1GULA 1UVZA 2WULA 1YY7A 4MF5A 5JCUA 1A0FA 3P8WA 2PU9C 4ZBAA 3IK7A 4MJBA 1F3AA 2LRTA 1K0AA 1PX7A 1Q4JA 4IP6A 2H19A 4F0BA 4LLRA 3U5RE 2DIYA 3HD5A 2X8CA 2GZYA 2R6KA 3GHAA 5F07A 2NDOA 1TXXA 3H1NA 4POLA 3QFAC 1QFNA 1FAAA 4KH7A 2OKAA 3H8QA 1UA5A 2YN1A 2YZUA 4KCAA 4J2FA 1FG4A 4RQXA 5IOXA 1ERWA 2C3NA 4WBRD 2GSTA 2L59A 1R5AA 4F03A 4WF5A 1IYIA 2O85A 2LRNA 4IW9A 2CX4A 3ZYWA 1QK8A 4ZL9A 1ERVA 3CRUA 5IMZA 5A4UA 1YZXA 2B3SA 2H0IA 5IMFA 2O8VB 1K0DA 5ECOB 3E0UA 2H1GA 3C1RA 3F6FA 1M2AA 2VCVA 1I9DA 1M2DA 5D9WA 1LU4A 3TRPA 1ZOFA 2J9HA 1NHYA 4IJ3A 2YWIA 5CRWA 3EWLA 2JZTA 3RPNA 2N5AA 3HDCA 4K1FA 3CSJA 1K0BA 3WYWA 1ZGNA 3FR3A 3DRNA 3I43A 4FO5A 4ID0A 3KEBA 2JADA 2H71A 1B8XA 2LNTA 1DSBA 1NSWA 2GSQA 4RUVA 3BD2A 4KGIA 1ZCPA 1GUKA 4TR3A 1Z5YE 2YPMA 4Q5FA 1F3BA 1ZL9A 4ML6A 1PKWA 2DBCA 1EEMA 1C72A 3IC4A 1ST9A 3ZTLA 3ZZXA 3IXRA 3QAVA 5G1LA 2G0FA 2AB6A 3GL5A 2HSHA 3TOUA 4YQVA 3FZ4A 3GMFA 4N0ZA 3HXSA 1B4PA 2VCXA 4CHSA 2VCWA 5DJLA 2LRCA 2I9HA 3A5WA 2E7PA 3KXOA 3LXTA 4POKA 1G7EA 3PINA 2E2MA 4YH2A 5F06A 2MMNA 3IE3A 14GSA 2M72A 1ZMAA 5J9CA 2VCZA 1WMJA 3KM6A 1HQOA 1K3OA 2WCIA 5CAXA 2C80A 4HJMA 1F37A 1WRYA 3LYPA 3UARA 4MJEA 2AJQB 1ILOA 2CVKA 4POMA 1K3YA 2R5GA 4LL4B 3WGDA 2VD0A 4YQUA 4BL7A 3RHCA 3GH6A 3HZ4A 4AF2A 1M2BA 2PMTA 2CVBA 1B48A 1YEPA 4EVMA 4ZB6A 3ZLPA 4DEJA 1K0OA 5FWGA 3AY8A 3FY7A 5KEJA 4FYBA 2KUCA 1AQWA 2IMKA 3QR6A 3GTUB 1EOGA 1GP1A 3EE2A 2OJLA 4GSSA 1SD9A 1UC7A 2V6OA 3PGTA 5JCGA 3C7MA 3ED3A 2F8FA 2V41A 3ERWA 1XOAA 2DC5A 1V57A 2FLSA 3UIWA 1AC1A 3LWAA 3LG6A 1SK0A 3VWXA 3LFLA 1Q98A 4EE0A 1V58A 3VI7A 1FO5A 1GTUA 3CMIA 2P5QA 5FHIA 5DALA 4G19A 4G10A 1XWBA 2H0GA 2JZSA 2QKEA 2GQMA 1ACVA 1XPVA 1EGOA 5IIZA 2JZRA 3KH7A 2KP2A 1WPIA 5J41A 5KN0A 3BJ5A 2WS2A 3UOMA 4XHMA 4YQMA 1JFUA 2VIMA 3V1WA 3QOUA 3H93A 1K0MA 20GSA 3F3QA 1S3DA 4F0CA 4EUYA 1Z6NA 2GSSA 3M1GA 2TRCP 1O81A 1EV4A 2REMA 2GT6A 3E3EA 2IWTA 17GSA 4FH8A 5IMCA 6GSXA 4PQHA 3P7XA 2CA8A 5E4WA 5DALB 3VPQA 1PL1A 2IFQA 3EYTA 1K0NA 3TJJA 5B6MA 4O5RA 5CRDA 3ZVJA 3CSHA 6GSVA 4ECJA 1SKRB 2YANA 3APOA 4KUNA 5CO3A 2HRNA 4XS4A 3WT1A 2PBJA 5IMDA 5B8BA 1X5CA 1U6TA 3GH9A 5IMAA 2H74A 2YJ7A 1GSSA 3P90A 3ZIVA 1V98A 1TI1A 1GSYA 5GAND 2WRTA 1USBA 2IFQB 2EIQA 3DWVA 4BA7A 2P0GA 4QQ7A 2BMXA 2H6XA 1VF1A 1M7TA 2C0EA 2J23A 3IDVA 1TK0B 2LTKA 1W4VA 4IELA 2YV9A 2HNLA 4XS4B 4KW6A 1GH2A 2FGXA 4I2TA 4MMMA 2VLUA 2B5EA 2L5LA 5JWOB 4EF0A 5G2ZA 2FCHA 4BWSA 2RUEA 3JCML 4ULXA 1AUCA 3IRAA 3WD6A 4D73A 1TTZA 3EU3A 3PH9A 2F8AA 4JE1A 2NPBA 2V32A 2X8HA 2FY6A 3IPZA 4HEA2 4KSOA 1RW1A 2ON7A 3CTFA 4MP4A 2A2SA 4OFTA 3FZ5A 5D9TA 4CW9A 2RM5A 3BBYA 1YJ6A 4I5QA 2HRFA 1OKDA 3O76A 4IVFA 3C1SA 4K7IA 1SKWB 5CP1A 2MMOA 1J0FA 2JACA 4DSRA 1PGTA 3LORA 5D9VA 3I6AA 1GWCA 2HT9A 6GSYA 3H79A 3F8UA 4D73B 3BOAA 2IPAA 3N5OA 4EC0A 2R37A 2HFDA 4Q5NA 2JL4A 1F2EA 1THXA 2DLXA 2YZHA 1WE0A 5F8BA 3IK9A 3HZ8A 1V40A 3L9SA 4TRXA 3IA1A 3GN3A 3HYPA 1XW6A 3Q18A 4HZ4A 2IIYA 3ZFBA 1GNWA 1FVKA 2H1BA 1B9XC 4MABA 1S3AA 2HYXA 1JHBA 1A2MA 2DMMA 1O85A 5DAKA 5CREA 1Z7PA 1QUWA 2WDUA 4HU7A 3I9V2 3D4TA 1PN9A 4JU5A 2FHEA 4RI6A 3MAKA 1T4ZA 5HQPA 2AYTA 5INYA 4GLTA 5DQYA 2WB9A 5G30A 3FYGA 3F9UA 1SENA 1GSEA 3SBCA 4XS6A 1G6YA 4DSSA 4MCUA 2R3XA 3TOTA 2FWHA 2IN3A 4ZB8A 1U3AA 4X43A 1X9SB 4HS1A 4HZ2A 2HZEA 4TOPA 5GZZB 2HLSA 5AN1A 4ZL7A 2VO4A 1TI3A 4E8EA 1MEKA 3IR4A 2GT5A 1SD8A 4IJIA 1GTBA 4EKZA 5H5SA 1TOFA 5COHA 4AJ8A 5DAKB 4HI7A 2WGRA 3RPPA 2MBTA 2TRXA 3TKQA 2H0HA 16GSA 3IV4A 1Y6EA 2XBIA 2JSZA 4KDUA 3TJFA 1MD3A 4PQ1A 3ZIJA 1AXDA 1BAYA 1FW1A 4OCFA 1EP7A 1LBKA 1EEJA 3EMXA 4DSSB 1OAZA 3TUEA 4ACSA 1ZYQB 3KTLA 4MH3A 4OMVA 2C1YA 4XCSA 1VGLA 4NMUA 1RK4A 3A3TA 2VM1A 5HR1A 1DE1A 3VPTA 3OR5A 1KBNA 3WT2A 2NTOA 2KP1A 4EL1A 3G7YA 1DBYA 2ZUPA 2C3QA 3J7Yb 2AAWA 3IAS2 5J5NA 8GSSA 4MZWA 2CT6A 2XHFA 4MF6A 5J3RA 2ON5A 3C71A 3HVVA 3VWUA 4WF4A 3H4KA 2PUKC 1KTEA 2WFCA 3D4MA 2C0FA 1I5GA 3P2AA 2FD3A 5E59A 3L9VA 1SL2B 3QDNA 3KZQA 1OE7A 1N2AA 4JR4A 1B4QA 2VLVA 2WJUA 4MLYA 4AGSA 1G7OA 4XTSA 1THOA 5ECLB 3LYKA 1GL8A 3BCIA 1TRWA 3QAGA 4ZBBA 1EOHA 2PPTA 1PSQA 4LL1B 3KMOA 3BCKA 3DGQA 5G1KA 2DJJA 1NHOA 3HHVA 1A8LA 5JCWA 1U3IA 1G0TA 3DEXA 2HI7A 3E9JB 3ERGA 5ECQB 2KOKA 3CXGA 4POBA 1WJKA 5ECHB 3VWWA 3S9FA 2L4CA 2LJAA 3GA4A 1XBSA 5GSTA 2V1MA 4IS0A 1QXHA 5EY6A 1XWAA 5ECSA 2FWGA 1MD4A 3HJOA 2DSAA 5FT3A 3DMLA 1W89A 1BX9A 3EURA 2AUVA 1XVWA 3EVIA 1PX6A 1R5PA 4I8BA 5JWRB 4IKHA 2O89A 3QCPA 2L6CA 3KCMA 2GQLA 3G7JA 3IOSA 2OBIA 1QMVA 3PR8A 4QL9A 2QGVA 1HYUA 4FYCA 3UEMA 1OC3A 1QQ2A 3GRXA 2V2GA 2ZNMA 3EMPA 3F6DA 1JLVA 2ES7A 5A4VA 5F05A 4PURA 1H75A 4GSNA 4KE3A 1MDIA 1SU9A 1ZYEA 5GAPD 2H72A 4KX4A 3ME8A 3D0ZA 3NOFA 3WGXA 4IHUA 3KH9A 3HCZA 2WZ9A 2HZFA 3VURA 1T7PB 3ME7A 1AQXA 1XCCA 2RUFA 3EINA 2LJKA 5A5KA 2K9FA 4JR6A 1BYEA 1YKCA 4O7HA 2F9SA 3FZ9A 3HJMA 4PNFA 4ZXGA 5G5EA 5B8AA 2YP6A 2C0DA 1BQ7A 4MH2A 6GSSA 3US3A 3QFBC 1O8WA 1M9AA 1T00A 5D8IA 2YWOA 1T4YA 3A2WA 1J9BA 2LJRA 1CQHA 3TJGA 4G2EA 3D21A 4I97A 3HVSA 4WR5A 4RI7A 5IM9A 2B7KA 4KCEA 2LQQA 4NWYA 2O87A 1SK1A 3WGEA 4K6XA 1T8EB 3KTBA 3KJYA 1M0UA 3KGKA 4K2DA 1EGRA 2FA8A 2K6VA 2HXKA 1JLWA 1PRXA 2IMDA 3F4SA 1GNEA 2F3MA 2YJHA 1X5EA 3GKXA 3R2QA 13GSA 1OKTA 1SJZA 2HSYA 4L0UA 4GRFA 2N5BA 3FR6A 2CVDA 3TKRA 4MJAA 2XC2A 2C0GA 1A0RP 1K3LA 3GSTA 10GSA 3L78A 4MJCA 4I2UA 1TK8B 4WXTA 4X0XA 2CX3A 4PNGA 1ERTA 5IOWA 1MTCA 3O6TA 5ENUA 3ISOA 4BPYA 4HQZA 3KP9A 2YCDA 1WIKA 2IL3A 4BVYA 2BJXA 2FNOA 1XOBA 5ECPB 1PQNA 4OWYA 4BVXA 1GUMA 1SK2A 4MDCA 1TRUA 2JU5A 2OE3A 4FIWA 1URMA 4ZB9A 2PGTA 4EO3A 1ON4A 3QMXA 1R4WA 2VD1A 4NAXA 4GQCA 4TXOA 1NM3A 5CRGA 2R2JA 2LNSA 3GURA 2I81A 2K8SA 1F6MC 1XW5A 2KLXA 3QAWA 1E6BA 4N30A 4L0WA 4XIHA 2DJ3A 5EVOA 2RIIA 2HE3A 1YF1A 1O73A 3FW2A 4N10A 2YWNA 2JSYA 4OCEA 3W8JA 1BJXA 4RQRA 4ZL8A 4JZQA 1PD21 2CZ3A 1EWXA 2K18A 2N5FA 1TW9A 2VL3A 5L71A 1HNAA 4GSTA 4TXOB 1M99A 2TIRA 4K0NA 4JBBA 3M0FA 1AIUA 3GKMA 2R4VA 5ECRB 1AAZA 3FHKA 4KB3A 4PX1A 2H75A 2DIZA 3M8NA 4P3YB 4EXJA 2H73A 2GVPA 3Q19A 3GUSA 5CYYA 3RDWA 1Z9HA 1FHEA 2GS3A 3D5JA 1A8YA 4AJ6A 1U87A 2I1UA 3ERFA 2EIRA 2YNXA 5LD0A 4TVEA 4V2LA 5ELGA 2FA4A 2EC4A 5C04A 3GKKA 4X1UA 4H86A 1J08A 1XWGA 2VL2C 1O8XA 2H76A 5EPFA 12GSA 1S3CA 1Z3EA 1K0CA 2E2GA 3FR9A 18GSA 5H5RA 6GSUA 2ALBA 5IPGA 2NVLA 3TKSC 1TDIA 5ECMB 5JWQB 4DVCA 2PVQA 5DJMA 2B5XA 2OACA 3APSA 4TXVA 2PWJA 3EU4A 1F9MA 4NPBA 4HU9A 2LSTA 5D93A 3ZL5A 4O92A 4ML1A 4EDYA 1YDKA 2M80A 4L8EA 3CTGA 5AISA 5G5FA 1BG5A 5ECNB 5EL8A 3Q6OA 4K0GA 2OADA 2B5YA 1TP9A 1FVJA 3UVHA 2VLTA 3DVWA 4HQSA 3G7IA 2MBSA 1GRXA 2XPEA 4NHZA 4Q5RA 2GLRA 4HJ2A 2C4JA 1HD2A 3M9JA 2CAIA 1A23A 5HR0A 4V2MA 1DE2A 5J4UA 1HNBA 3G9BA 3F4TA 3LXZA 1OC9A 2GTUA 4IQ1A 1EZKA 4MZBA 2LQOA 3TRXA 2B6MA 2MZCA 3L0HA 3GYKA 5CRHA 2YOIA 3A2XA 2F51A 4KA0A 1GTAA 5ECIB 1T3BA 3DIEA 5LNKe 3F3RA 2B1KA 4ZILA 2HZEB 5AGYA 1BEDA 1PL2A 1TRVA 4MF7A 2FUG2 3IHQA 2OA7A 3DYRA 3ZRDA 4GTUA 1E2YA 2OE1A 4XRDA 4HUAA 2D2ZA 4Q5QA 1YKAA 3KIJA 4TW5A 3TDGA 2L4QA 3TGZA 11GSA 2A4VA 1XW9A 2B7JA 1XFLA 2P5RA 2C8UA 1GSDA 1H4OA 4CDOA 3RAZA 4E8HA 2AV4A 3MSZA 1OC9B 4O32A 2O7KA 4EDZA 1GTIA 2H6YA 2CZ2A 2I3YA 3DKSA 4YAPA 2IMIA 2YV7A 1Z7RA 2KHPA 5DDLA 1OYJA 2DJ1A 2H8LA 4IN0A 1A2JA 4QL7A 5D9XA 3VWVA 2LKUA 1X5DA 2NBSA 4V1Ap 5IO2A 2BTOT 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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