4I2UA

Crystal structure of the reduced glutaredoxin from chlorella sorokiniana t-89 in complex with glutathione
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
SAAKQLVDSTISGNKVVIFSKTYCPYCVKGKRALEKFLPKSKITAIELDGRNDGAAIQDYLLELTGGRSVPRVFIDGQFIGGGDDTDALARNGKLEVMLRNAGVLLEHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure and functional analysis of glutaredoxin from Chlorella sorokiniana T-89
rcsb
molecule keywords glutaredoxin
molecule tags Oxidoreductase
source organism Chlorella sorokiniana
total genus 34
structure length 109
sequence length 109
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4i2uA00
3RPPA 2OBKA 1SKWB 2R37A 3GV1A 2FUG2 4ZL7A 3CTFA 17GSA 3FR3A 3GFKA 4EL1A 5DJMA 12GSA 1WPIA 2JADA 2GZYA 2H19A 1EWXA 2IMKA 3FZ9A 2GTUA 4ECBA 2YWMA 4ZB6A 1R5PA 4E8EA 3P8WA 3N5OA 1SL0B 5IM9A 2TRCP 2LRNA 2VL2C 3TRPA 2RUFA 2K9FA 2YZUA 5GAND 1NHOA 1Q4JA 2REMA 4XS4B 1H4OA 4PQIA 4IVFA 1SK2A 1PRXA 3G7YA 1T7PB 5B8BA 2OA7A 1T3BA 4ZB8A 3IHQA 3A3TA 1XCCA 2B6MA 2B5EA 3KM6A 3I43A 2P5RA 2QSIA 1PSQA 4XS6A 4PGTA 2H30A 2LEGA 1EGRA 2AAWA 1GSFA 3L78A 1V58A 2JZTA 1Y6EA 4TR3A 4Q5FA 4BWQA 3MSZA 2H01A 4DSQA 1T00A 3TJBA 4EKZA 1YEPA 2PERA 4BL7A 2PWJA 2VM1A 2LQQA 3QDNA 1G6WA 1KBNA 3HXSA 1B48A 3FZ4A 1EGOA 1GUMA 2KP1A 3A2XA 2R3XA 1GSYA 4RQRA 4OO4A 4I2UA 3KEBA 1ZL9A 4HOJA 3IK9A 2EIRA 1G7EA 5KN0A 4TXOB 4ZILA 3PH9A 3KMOA 4YH2A 3BD2A 4Q5QA 1EV9A 5CRGA 1NM3A 2PVOC 4IW9A 22GSA 3TUEA 3BBYA 2CT6A 2VLVA 3D22A 4TVEA 1U3AA 2QGVA 2LNTA 3ERWA 2FY6A 1GLQA 3IXRA 1XWGA 1ERVA 2O7KA 3C8EA 1HQOA 1K0OA 4XRDA 4I8BA 1PX7A 2R2JA 1RK4A 5HQPA 1B4PA 4LA1A 3SWLA 3QCPA 1THOA 4BWSA 1OC8A 4BA7A 3IA1A 5IMZA 3TJKA 2GZZA 5HR0A 3VI5A 3G9BA 3PGTA 4XIHA 5IO2A 2P5QA 3CYNA 1V40A 1A8LA 2VCTA 3P2AA 3FEUA 1U6TA 4X1UA 4K0NA 3FW2A 2H0IA 2MMOA 1K3YA 5CRDA 4YAVA 1Z6NA 2LNSA 3RHBA 1BYEA 1QFNA 1M2DA 1FAAA 3EC3A 4TRXA 3PR8A 5J41A 5D96A 1HYUA 3TGZA 4K1FA 4KW6A 1V9WA 4ECCA 3LFLA 2VD1A 1S3AA 1ERUA 4JZQA 1T8EB 1GNEA 1Z7RA 5H5QA 4X43A 5JCGA 1PKWA 4EDYA 3M3MA 2GGTA 2G0FA 1XOAA 2VLTA 3PINA 1V98A 2CAQA 1S3DA 1PL1A 2GQKA 4FYCA 2L5LA 2LS5A 2VO4A 1GWCA 2OKAA 3VI7A 4MJAA 3UVHA 2H0HA 3TRQA 2C4JA 5G5FA 4GQFA 4D73A 1F6MC 2F8AA 2MMNA 2HYXA 1XW9A 5G1LA 1XWBA 3HVVA 5DVBA 1QGVA 2O87A 16GSA 5J5NA 4OCFA 1N8JA 1GTBA 4GRFA 1SK1A 2L57A 6GSTA 1Z5YE 1TDIA 3APOA 5ENUA 1ML6A 4KGIA 3UAPA 3P7XA 1TRWA 3CMIA 1K0BA 3ZREA 3EMXA 2C3TA 4WKWA 3WGEA 1AW9A 9GSSA 1HNAA 3FR6A 5JCWA 1X5EA 2L5OA 3RAZA 3EE2A 1TI1A 1TTZA 2VM2A 2TIRA 3LG6A 3LGCA 4O5RA 2YN1A 4ZIJA 1JZOA 1W89A 4IN0A 2R6KA 1G0TA 1A2LA 3DKSA 3GYKA 2VD0A 1SU9A 2E7PA 4HUAA 3CSIA 1VGLA 3IRAA 5HR2A 4IS0A 3TKSE 2B7KA 3DIEA 4F9ZA 3W8SA 2VCQA 3Q74A 1TI3A 3CRUA 3ZFBA 2C1YA 2JSZA 3FYGA 4KDYA 3KTBA 4HZ2A 5AN1A 1BQ7A 2GSRA 2H1GA 1A24A 4HZ4A 2VCXA 4XS4A 1GSUA 1LJRA 3KTLA 5HFGA 5HFKA 2C80A 1QK8A 3ZFLA 3CSJA 1FG4A 2DIZA 4GSTA 1XBSA 1U87A 4F0BA 4CW9A 1O73A 5GSTA 2AB6A 2V1MA 2OE1A 4K8MA 1A8YA 4V1Ag 8GSSA 5J9BA 7GSSA 2F51A 2DJ0A 3QD9A 3M9JA 4GTUA 4WF4A 1AUCA 1GH2A 1UC7A 4LMWA 2X8HA 5AIVA 4ZXGA 4RI7A 2H1BA 2IN3A 2JU5A 2GQLA 3KH7A 2DJ3A 2AUVA 4QL9A 4IBPA 1TP9A 4MPGA 4POLA 4GXZA 4HU9A 3TKPA 5LCZA 3L9SA 2A2RA 3R2QA 1SYXA 3ME8A 4N0ZA 4HDEA 1PKZA 1ZYEA 3C71A 2V2GA 5ECRB 3Q19A 4WBJA 1GSDA 4TR4A 5COHA 5INYA 3TKSC 3UBLA 2DJ2A 1C72A 1DBYA 4FH8A 5C04A 4TXOA 4KSMA 5KN2A 3GN3A 4KH7A 1BG5A 2C0GA 3M8NA 11GSA 3C1RA 2PBJA 5IQYA 2MMAA 2B1KA 2ES7A 1RW1A 5KEJA 2ON5A 1MDKA 2VCWA 2GVPA 3ZVJD 1B9XC 3DGQA 1HD2A 3TJGA 5D8IA 6GSXA 2IJYA 4LL4B 4K6XA 1GULA 5ID2B 4IJ3A 3LYPA 2P0GA 1GP1A 1UA5A 1THXA 1GSEA 2GT6A 3FY7A 2BMXA 4MZBA 4ECIA 4AGSA 3G7JA 1X9WB 3VWXA 2GLRA 4YAPA 3GSSA 1E2YA 3Q6OA 2DJKA 4PUFC 1X5CA 2RM6A 3A5WA 4WEYA 3AY8A 3GTUB 1GUHA 4HJ2A 2V41A 5AISA 3DRNA 4LL1B 5CYYA 1SYRA 5B8AA 1TRSA 1F9MA 1TK0B 1TW9A 4FYUA 1PA3A 1V2AA 4KA0A 3TJFA 3WT1A 4MPFA 2FGXA 1MD4A 2VLUA 3QPMA 1MDIA 1B9YC 1XOBA 1AQWA 2N5AA 1F2EA 2VL3A 1ON4A 2YANA 2N5FA 1ZGNA 4K9ZA 4MK3A 3U6VA 3EWLA 5FT3A 1TU8A 3IDVA 2I3YA 2DSAA 1XW6A 2I1UA 1OE7A 2OE0A 3IC4A 1GTUA 5ECIB 3KGKA 1A0FA 3ZIVA 5DJLA 1VF2A 4MH2A 4GF0A 1XWCA 3D0ZA 1VRSD 1VF1A 2YOIA 5ELGA 1PD21 2A2SA 5F8BA 5DQYA 1U3IA 3WT2A 4L5OA 2WGRA 1X5DA 4OMVA 4EDZA 1XZOA 3HD5A 2PN8A 1O6JA 5FWGA 2H75A 3DXBA 3EU3A 4ULXA 2MBSA 5DDLA 5CNWA 4MJEA 5JWOB 3TDGA 2NDOA 1QXHA 3H1NA 2HI7A 1BX9A 1AQVA 1AXDA 1R5AA 2RUEA 2JACA 4DSSB 2OE3A 3TKQA 1X9SB 2N5BA 5HFIA 1H75A 4DVCA 3D5JA 1USBA 1K0NA 19GSA 1KTEA 1PX6A 5G30A 2JZSA 2IMEA 2B7JA 2VL9A 4MH3A 2RLIA 3F3QA 1O8WA 5IMCA 1BJXA 3LORA 1XXUA 5D9TA 2HRFA 1A0RP 5A4WA 3F8UA 4MLYA 1SJZA 2AYTA 2B3SA 1ST9A 4GSSA 4K2DA 1LU4A 3APQA 4TR0A 5J9CA 5KN1A 2K8SA 2I81A 1XIYA 2H1AA 1K3LA 2L4CA 3UARA 3ZIJA 2YPMA 5LNKe 3ZL5A 2IFQB 3H8QA 4PQHA 4PXOA 4NHZA 4NWYA 4KX4A 2YV7A 5E4WA 1JLVA 1OVNA 4KDUA 3VWUA 4IQAA 2XPEA 4WETA 4TOPA 3S9FA 3TB2A 5IIZA 2VUPA 2X8CA 4QL7A 1M9BA 2K18A 3UMAA 3L9UA 5ECQB 2DMMA 2DC5A 4I6XA 2B5YA 2CZ2A 3QFBC 1XWKA 3J7Yb 4WF5A 4KAEA 4MP4A 2JZRA 4QQ7A 1YY7A 1ABAA 2YCDA 2HLSA 2KUCA 2B1LA 2WS2A 5ECLB 4HS1A 1X9MB 3LXZA 4EXJA 2A4VA 5A4VA 3ISOA 3QFAC 3QAGA 1KNGA 4MZCA 4TKYA 5ECMB 4NMUA 1G6YA 3MWHA 1M99A 1BEDA 18GSA 1W4VA 4AJ8A 3ERFA 3VURA 4YQVA 2KHPA 1ZMAA 2G2QA 2DLXA 2H6ZA 3A2WA 3KP9A 1M0UA 2GDRA 3K8NA 2DMLA 5IO0A 3IK7A 4IHUA 5ID2A 2YJHA 1F3AA 3ERGA 2YWNA 3QR6A 3GNJA 2IMIA 2H74A 4HEA2 2YV9A 4MJCA 4O7HA 3UEMA 1AAZA 5DALB 4NXIA 3V1WA 4OFTA 3BOAA 4F2IA 4WXTA 1HNBA 3SBCA 3ME7A 3GTUA 2YP6A 3US3A 4K7NA 2PPTA 2AHEA 2EIQA 3GIXA 2WDUA 3TCOA 3H93A 4HJMA 3KZQA 1O81A 3HKRA 1FW1A 3VFIA 3DVWA 3GUSA 2HXKA 1T4ZA 10GSA 2HSHA 4ZBDA 1GSSA 2CX3A 4N30A 1O85A 5GSSA 3N9JA 3CSHA 6GSUA 1LBKA 3TKSA 2FD3A 4MF5A 3E3EA 1DE1A 2CVDA 2GSTA 1YDKA 2NBSA 2LKUA 2WCIA 4L0UA 4Z7XA 4XCSA 2F8FA 4OO5A 3TOTA 1KEBA 3Q18A 3DD3A 2L59A 4WBRD 2MYGA 5IOXA 1VF3A 2FWFA 6GSWA 1T1VA 3F4RA 3IOSA 3BCKA 5DCGA 2VAFA 2L6CA 2M72A 3A2VA 4X0XA 4MF6A 4HQSA 4MZWA 1E6BA 4L5LA 3P90A 4JU5A 1J08A 5JCUA 5G1KA 3CRTA 4BVXA 2M80A 4IELA 4LLRA 3UVTA 3WYWA 3GL3A 5H5SA 4CHSA 2H6YA 1PGTA 3HVSA 3VWVA 4FYBA 5LD0A 4PX1A 2FNOA 3HZ8A 4ML1A 1Q98A 4KCAA 1TRVA 2LRTA 1WRYA 3J7Yk 2IPAA 1M9AA 4G10A 1SK0A 1WMJA 3ZZXA 3QAWA 4AJ6A 5J3RA 4DSSA 1QQ2A 5J4UA 2HE3A 4PUAA 1WIKA 3I6AA 4JRRA 1JZRA 1OKDA 3UJ1A 3C1SA 1O8XA 2O89A 2CZ3A 3F63A 3W6GA 4PURA 2LJRA 4MJBA 4WR5A 5FHIA 3GA4A 2E0QA 2LUSA 5KN3A 1SKRB 2NTOA 4JE1A 2C3QA 2OJLA 1GLPA 3M9KA 2LRCA 5E59A 1YKCA 1AQXA 4Q5NA 3L4NA 3C7MA 1K0MA 2WJUA 4IQ1A 1PN9A 2FWGA 4XS1A 4MA9A 5A5KA 2ZNMA 3KCMA 4F0CA 1R7HA 2C0DA 3KP8A 4V1Ap 2FA4A 2IFQA 4JBBA 3GX0A 5D9XA 1JZDA 4J56E 1IYIA 5ELAA 4WR4A 5IMVA 4EVMA 2H6XA 4ECJA 3GHAA 2D2ZA 4POKA 4F82A 2HSYA 1UVZA 4FO5A 2H71A 4K7IA 1OAZA 2B5XA 1MTCA 1SKSB 3MNGA 1K0DA 3KJYA 4I97A 3IR4A 4PNGA 2GSSA 4MCUA 4KDXA 1UN2A 2YNXA 2PU9C 3IPZA 4IGJA 1S3CA 2OBIA 6GSSA 2RM5A 1WJKA 2I9HA 1ACVA 4EC0A 1OC9B 1DSBA 1M7TA 2HFDA 1FB6A 1BAYA 3RHCA 2PGTA 1B4QA 2H8LA 2YZHA 3LYKA 4BVYA 4L0WA 1A23A 1I5GA 1VF4A 3DWVA 5F0GA 3F0IA 3ZMLA 1XWAA 4ML6A 5H5RA 5G2ZA 2FA8A 1XVWA 2KOKA 4AJ7A 2E2MA 5IOWA 2FWEA 2OADA 5CRWA 1K3OA 4O32A 3D6IA 1I9DA 4JR4A 1TJDA 2BTOT 3UIWA 4LMVA 4TR1B 4F03A 3NIVA 1OC3A 3EYTA 3HJPA 5JWRB 2FLSA 4POBA 3LQ7A 5DAKB 5CAXA 3NOFA 3LWAA 1YF1A 2I4AA 3HVXA 2V32A 2E2GA 4FIWA 3U5RE 1X0RA 1Z7PA 4N11A 3FKFA 5AIXA 2C8UA 5DALA 4RQXA 1XVQA 1J0FA 3CBUA 1EEJA 1EP7A 3GH6A 4EO3A 2XBIA 4DSRA 1JFUA 3GMFA 1O7UA 1PQNA 3E0UA 4E8HA 6GSVA 2HNLA 4RUVA 2CQ9A 3BCIA 3ZRDA 5IPGA 3H4KA 1GSQA 3IE3A 3HJMA 5EPFA 5ECOB 4JR6A 1YZXA 5ECPB 4NAXA 2LJAA 1Z6MA 2TRXA 5CREA 5ECHB 1XFLA 4NHWA 3APSA 2AV4A 4YQUA 1TXXA 1PL2A 2LSTA 3QOUA 1T4YA 2NVLA 4OFMA 4G19A 4L8EA 3EVIA 4ZL9A 1YJ6A 3TRXA 5B6NA 4ZBAA 4EUYA 4K0GA 13GSA 3DYRA 5HR1A 3FHKA 2H76A 2RIIA 1NHYA 4K7OA 1SD8A 4XTSA 2IL3A 1EP8A 2AJQB 3MAKA 3F4TA 2GZPA 2JSYA 3F6FA 4J2FA 3HY2A 4V2LA 3VPTA 1FVJA 3NZNA 1GNWA 5G5EA 4XRAA 3HA9A 4O92A 4KE3A 1ZZYA 1XW5A 2OACA 3ZVJA 3I9V2 5F05A 2X64A 1FVKA 5B6MA 4HI7A 5G31A 1IYHA 2J9HA 3F6DA 4G9HA 4YQMA 2CVKA 4GWRA 2YWOA 1WOUA 3ZMKA 1SENA 3L9VA 1A2MA 3WGXA 3JCML 5HR3A 5CP1A 5JWQB 2M46A 5CRHA 3VWWA 1K0AA 1F3BA 3ZLPA 1OKTA 1YEXA 2IMFA 4DEJA 3WGDA 3GRXA 5IPHA 2WULA 4XHMA 3MDKA 2R5GA 2VCVA 1K0CA 3UOMA 2YJ7A 2GQMA 3HDCA 4GQCA 3I69A 1MDJA 2XBQA 3FRCA 2X99A 3UBKA 4V2MA 2DBCA 1V57A 1PMTA 2FHEA 2IWTA 3KH9A 4HQZA 1TU7A 3TOUA 5D9VA 2QC7A 4TN8A 1EOGA 3G7IA 2HZEB 4P3YB 4RI6A 3CTGA 3M0FA 2HT9A 2YWIA 2J23A 1ZOFA 3H79A 3L0HA 4NV5A 2F9SA 4BPYA 2Z9SA 1FHEA 3HYPA 2JL4A 4GCIA 3GH9A 3FK8A 1EV4A 2XPDA 3VPQA 2H1DA 2KLXA 4H86A 3HZ4A 2ALBA 5DQSA 2DJJA 5CO3A 4KSOA 1J9BA 2LV3A 2X8GA 2CVBA 2H70A 1OC9A 1FB0A 2H73A 4I5QA 4EF0A 1YKAA 5DBQA 4ACSA 1XPVA 3GL5A 5IMAA 5DCHA 1F37A 1ILOA 1SD9A 4I2TA 5ABRA 1SL2B 1N2AA 3OR5A 1YF0A 2EIOA 1G7OA 4JEDA 3EINA 2XC2A 1GTAA 4MABA 2H0GA 1NW2A 5ECSA 3LEFA 3F4SA 2O8VB 5D93A 5F07A 2FCHA 3QMXA 2WZ9A 3VK9A 2MZCA 4KUNA 3E9JB 4MDCA 4OCEA 3UL3A 3RBTA 1ERWA 3ZTLA 4TR1A 3DEXA 3TKRA 6GSYA 2LJKA 4ZL8A 2PUKC 3CXGA 2O85A 2PMTA 2C3NA 4ZBBA 2BJXA 1M2AA 2C0FA 5DAKA 2L4QA 4PNFA 1DUGA 4GSNA 5ECKB 2IMDA 2NPBA 2WRTA 1QMVA 4POMA 1WWJA 2WFCA 4TXVA 1RQMA 5EY6A 5L71A 2HZFA 1TRUA 3KIJA 3WD6A 1R26A 2VIMA 4ISDA 1EZKA 2L6DA 4OD7A 3LXTA 2XHFA 5ECNB 2CAIA 4ILFA 3C73A 4KNDA 4IKHA 1DE2A 2V6OA 3KXOA 2P31A 2IIYA 1AIUA 1B8XA 4GLTA 4NPBA 2CA8A 2FWHA 4KCEA 1R4WA 5A4UA 5C00A 1NSWA 4J57E 2WB9A 2F3MA 1GUKA 3D4TA 1WP0A 1Y25A 5AGYA 3GURA 2GT5A 1MEKA 3RPNA 3ED3A 5EVOA 1U88A 3IV4A 1Z3EA 2CX4A 4V2NA 1ZCPA 2GS3A 3BJ5A 4NV2A 3RDWA 5GAPD 3QAVA 1YQ1A 1JHBA 1JZWA 2V6KA 3IBHA 5GZZB 5D9WA 4KB3A 1MD3A 4N10A 3IAM2 3GKNA 1Z9HA 3GSTA 2ZCTA 2LTKA 4Q5RA 4MMMA 4HU7A 20GSA 3LJRA 1FO5A 2VOCA 5D73A 2LQOA 4MF7A 2GSQA 3GKMA 3M1GA 2K8VA 3EURA 3F9UA 1M2BA 1AC1A 2MBTA 1SJ6A 5EL8A 3FZAA 3O76A 3O6TA 1TK5B 1EOHA 3FR9A 2ON7A 4G2EA 1GTIA 3DMLA 1FOVA 2EC4A 2R4VA 3HJOA 3ZYWA 2H66A 1TK8B 1OYJA 3KD0A 4IP6A 1CQGA 2CV4A 2C0EA 3HCZA 1JLWA 4N0VA 2VL2A 1SL1B 1OE8A 1TOFA 3DVXA 4AF2A 2K6VA 3LSZA 4TW5A 3O3TA 3GKXA 3HHVA 2QKEA 1SJIA 4IP1A 2HRNA 3F3RA 2ZUPA 4IJIA 4ZB9A 2DIYA 3ZITA 4EE0A 2PVQA 1GRXA 1EEMA 5B7CA 4D73B 1TKDB 4PQ1A 1WE0A 4CDOA 3GX8A 3IAS2 3W8JA 2KP2A 5F06A 1ERTA 2DJ1A 4OFNA 3D21A 4OWYA 1QUWA 4ID0A 5IMDA 1HNCA 3VLNA 3EU4A 1ZYQB 3D4MA 1A2JA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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