4IN0A

Crystal structure of human splicing factor dim2/txnl4b
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
141
structure length
141
Chain Sequence
SFLLPKLTSKKEVDQAIKSTAEKVLVLRFGRDEDPVCLQLDDILSKTSSDLSKMAAIYLVDVDQTAVYTQYFDISYIPSTVFFFNGQHMKVDYGSPDHTKFVGSFKTKQDFIDLIEVIYRGAMRGKLIVQSPIDPKNIPKY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title High-resolution crystal structure of human Dim2/TXNL4B.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin-like protein 4B
molecule tags Splicing
source organism Homo sapiens
total genus 45
structure length 141
sequence length 141
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02966 DIM1 Mitosis protein DIM1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4in0A00
1FAAA 1TRUA 2JU5A 1S3CA 3J7Yk 2HZFA 1J0FA 1X5DA 2H1DA 3F9UA 1Z9HA 2RM6A 2IJYA 4K8MA 2L6CA 1LU4A 1SENA 2YN1A 1M99A 2IFQA 1PKZA 1R5PA 3SWLA 1ML6A 3WGDA 2R6KA 2V2GA 3Q19A 5CAXA 2R4VA 4OFNA 2IN3A 1MD3A 3TRXA 1A23A 3TRQA 4WEYA 1TI1A 2K8SA 4YAPA 3P90A 4HEA2 4LL1B 2X64A 3MSZA 4CW9A 1WJKA 2H6XA 2WZ9A 5J9BA 1ZMAA 5JWRB 1OC9B 2MMNA 2YWMA 3TJKA 5D8IA 3QD9A 4I2UA 3GA4A 4KDUA 2OACA 3F3QA 7GSSA 2YWIA 3FY7A 2MZCA 5CRDA 4LL4B 1K3YA 4CDOA 5IMZA 2LNSA 3UBLA 3L0HA 2E7PA 3KMOA 4AJ6A 2PN8A 4I2TA 2FUG2 1TTZA 5CNWA 2DC5A 3Q6OA 3ZIJA 1K3LA 2L4CA 1XIYA 2O89A 1EGOA 4IP1A 1MDKA 2BJXA 3GV1A 2PMTA 3HVXA 2H1AA 5ECKB 1X9SB 3V1WA 1V9WA 3ZREA 3TUEA 1NHYA 4HZ2A 1V58A 4PURA 4HQSA 2GSTA 5IO2A 5JCUA 2LV3A 4KGIA 3TKSE 1GUHA 4H86A 3TKSC 5EY6A 2IMFA 5IM9A 1BQ7A 1ERVA 4NV5A 2OA7A 5DBQA 2ON5A 1TI3A 3TCOA 2L6DA 4TXOA 4N11A 1NW2A 4N30A 4LA1A 3KGKA 4BL7A 2C4JA 1MD4A 2VCVA 2KP1A 4L0WA 2B3SA 3GIXA 2GQLA 3UBKA 1TU7A 1WP0A 4EXJA 4ACSA 4KSMA 4MH3A 2VCWA 2EIRA 5A4UA 3KD0A 1FB0A 1DSBA 5KEJA 2CZ3A 3N5OA 1PSQA 2NTOA 2IPAA 1R5AA 3IV4A 4MF5A 3TKQA 4EVMA 1RQMA 1TK5B 1SKWB 2P31A 2VL9A 3FK8A 3D22A 2NVLA 1J9BA 4I97A 2N5BA 1QUWA 3C8EA 3FZAA 3GNJA 5GAND 3VI7A 5J9CA 2OE0A 3VFIA 2VCQA 3EU3A 2XPDA 2VCTA 5J3RA 1FO5A 1GSEA 1HNCA 3DYRA 2X99A 3CRUA 5AN1A 3ME8A 2C0DA 2HZEA 3HDCA 4ZILA 1JZOA 3FZ4A 4G9HA 2LEGA 2VL2C 2CVBA 1TW9A 3MAKA 3DKSA 3LYPA 4OWYA 3TGZA 1V2AA 1GLQA 2VIMA 1QQ2A 1V57A 2WCIA 1HD2A 3N9JA 3HCZA 5IO0A 3CBUA 1BYEA 2K18A 2PVQA 3BCIA 4OO5A 5IOXA 3E3EA 4XRDA 3H1NA 4JEDA 1U6TA 1XWCA 4G10A 1ERUA 1QFNA 4BPYA 1JHBA 2NPBA 4PUFC 2B5XA 5IPHA 1G7EA 2AAWA 1QXHA 3UIWA 3GTUA 4HUAA 3OR5A 1K0DA 3M0FA 4GQCA 4F2IA 1F37A 3QR6A 4XS6A 3BCKA 3HD5A 3HVSA 2IMDA 2KLXA 2KHPA 1J08A 2YV7A 3LXTA 5J5NA 1AUCA 2HSHA 3ZMLA 3WGEA 2IL3A 4GF0A 5G1KA 2LSTA 1XCCA 3W8JA 6GSUA 2HZEB 2A2SA 1THOA 5L71A 1JZRA 3LEFA 1XFLA 1XW5A 1TK8B 3UVHA 5J41A 1KBNA 3HZ4A 2V1MA 2YJHA 4Q5QA 2H74A 2H66A 1G0TA 4OCFA 4ZXGA 2IMEA 2J9HA 3GSTA 3DMLA 4F0BA 1ACVA 10GSA 4EC0A 4MF6A 2CX3A 1XBSA 1EWXA 1MEKA 3G7YA 2DJ0A 3ME7A 5ECLB 3ED3A 3M3MA 2GQKA 1SKSB 1EZKA 3HHVA 3FW2A 3GTUB 3QAWA 2VCXA 4V2MA 3EWLA 3M8NA 1ON4A 4N0VA 3H8QA 5IMAA 1ZL9A 2LJRA 3ISOA 4I8BA 1AQVA 2H76A 2QKEA 1GUMA 4G2EA 3ZFLA 2CQ9A 1Z3EA 4JU5A 4TVEA 3IR4A 1JFUA 2CVKA 1HQOA 2GQMA 5JWOB 4XCSA 2CAIA 4PUAA 1T7PB 3CRTA 4BWQA 1GTAA 4XS4A 3FKFA 1JZDA 1A2JA 3D5JA 1SL0B 4KSOA 3EU4A 5JCWA 4RI7A 1Y25A 2LQOA 2PGTA 4OD7A 4WR4A 2MMZA 12GSA 2M80A 2MMAA 3DXBA 3EYTA 1ZCPA 5DALB 1DBYA 3J7Yb 3LYKA 1TRWA 1M9BA 1YEPA 3IA1A 2N5AA 2J23A 1EOGA 2AUVA 4E8EA 3ZZXA 1FB6A 3CSHA 3QDNA 3TJBA 2F8FA 1ZYEA 4ECBA 1UC7A 4HU7A 2AHEA 6GSWA 1N2AA 1UVZA 4PX1A 2NBSA 3ZRDA 3GKXA 1X9WB 1M2BA 2REMA 2F9SA 3TJGA 1WPIA 3DIEA 4EDYA 2I4AA 5GSTA 2HXKA 1PGTA 2DMLA 3C1SA 3LJRA 1NHOA 1N8JA 5E59A 4HS1A 5HR1A 3HJMA 2MBSA 3O76A 1ST9A 2LQQA 2B1LA 1B4PA 3KXOA 5G31A 5ECRB 2LRNA 5ID2A 2DSAA 5G30A 3GMFA 2XBIA 1FVJA 4QL7A 2VM2A 3GH6A 1QK8A 1XVQA 3F0IA 2EC4A 4GCIA 3JCML 5FT3A 2DJ2A 1GSDA 2H01A 3F4RA 3A2XA 5D73A 1YZXA 4YQUA 5CREA 2WULA 5F07A 2H71A 2C0EA 1PMTA 2CZ2A 4GSNA 4MF7A 3EE2A 3NIVA 1U3AA 3H79A 1YF0A 3D0ZA 2AYTA 3GFKA 1BAYA 2XPEA 3NZNA 2P5RA 3FR6A 3L9UA 4MABA 2B5YA 3RHCA 1GULA 1O81A 1U87A 3GH9A 3FZ9A 4ZB6A 1WE0A 3FZ5A 1BJXA 5A4WA 1I9DA 3KP8A 3ZITA 3DVXA 4EUYA 1EV9A 5ECQB 1XPVA 2LRTA 4XRAA 3RPPA 1S3AA 5D9XA 5FWGA 4JZQA 4K0NA 2DJKA 1GSYA 5JWQB 4ZL8A 3C73A 2OE3A 1A2MA 1UA5A 4ILFA 4LMVA 5IMFA 2LJAA 1FVKA 3HYPA 3TKSA 2HRFA 3F8UA 3CMIA 2YP6A 1XWBA 4TR4A 1GNWA 1O73A 3WYWA 4ZBDA 4IJIA 2QGVA 3A3TA 1A0FA 4KW6A 5DCGA 4GXZA 2TIRA 2FD3A 3KTBA 1G7OA 5EVOA 1KNGA 2DBCA 3M9KA 1GNEA 4BA7A 5ECSA 3QFAC 1EOHA 4HJMA 3ZVJD 4X0XA 5KN3A 3TKPA 1AQXA 1IYHA 3RDWA 2JACA 3U5RE 4EF0A 1O8WA 2LUSA 1XWKA 4IN0A 4MJEA 2H0IA 2Z9SA 1TP9A 2I1UA 1K0MA 2N5FA 3KEBA 4YH2A 4MPGA 4L0UA 4ZL7A 5CRWA 2IWTA 3PR8A 1ZGNA 2HI7A 3TOTA 2WB9A 1M2DA 3TJFA 4TRXA 1GSSA 1T4YA 2IFQB 3GL5A 3GSSA 5ECNB 5H5QA 1EGRA 1PKWA 3F4SA 1YEXA 2ZNMA 3TOUA 1B48A 1O8XA 3KP9A 2GTUA 2XHFA 2VD0A 2LNTA 2VLUA 2X8CA 5INYA 2C8UA 13GSA 5ELAA 2FWFA 3ZVJA 3MNGA 3PGTA 3Q18A 2NDOA 2H1BA 4D73A 2B7KA 4IBPA 2WJUA 4YQMA 2KP2A 2FHEA 5COHA 2H1GA 2ON7A 3AY8A 3KM6A 3HKRA 3VLNA 2YOIA 5IOWA 4HI7A 3FEUA 3E0UA 4CHSA 3RAZA 2QSIA 3F6DA 4NAXA 3W6GA 2WS2A 3G7IA 4Z7XA 1TDIA 1OE7A 1XOBA 1QMVA 4POKA 2E2MA 2R37A 2VLTA 4FYBA 4AJ7A 3LQ7A 2R5GA 1F2EA 4NXIA 3GKMA 4ECCA 3IAM2 2I81A 3P8WA 1XZOA 4FYCA 4K7IA 2L4QA 4J57E 1K0OA 4LMWA 3L9VA 4HQZA 3EMPA 4ML1A 4D73B 5DCHA 2LTKA 4WBRD 4KH7A 2BTOT 1FOVA 4TXOB 4POLA 2PUKC 3KTLA 3S9FA 2FNOA 4OCEA 4LLRA 2GSRA 3DD3A 1SK2A 4ML6A 4MDCA 4MPFA 2H6ZA 6GSVA 2GZZA 1K0BA 3G7JA 1B9XC 3LG6A 2JSZA 1M7TA 4NHWA 2R2JA 2GSSA 1SL2B 5DJMA 2DIZA 4EO3A 2CAQA 1TRSA 1U3IA 3CYNA 1X5CA 1Z5YE 2I9HA 2G2QA 2FWHA 3APOA 3IXRA 4OFMA 5KN1A 4IJ3A 2CA8A 2JZRA 5HQPA 1I5GA 3KCMA 3EURA 4K2DA 3GX8A 4DSSA 2C80A 2HE3A 3WD6A 4FYUA 2X8HA 3GKNA 1TJDA 2DJJA 5AIVA 3WT2A 3LSZA 2HNLA 1GRXA 2XC2A 1DUGA 2PERA 1F9MA 9GSSA 2YWNA 1H4OA 5KN2A 4MLYA 1HNBA 4NHZA 4JR6A 5ECHB 3VPTA 3IC4A 4QQ7A 1XW9A 3QAGA 3GRXA 5DQYA 1URMA 5C04A 3F6FA 1T8EB 2KUCA 16GSA 2TRXA 2OADA 1RK4A 1JLVA 1CQGA 5LCZA 3I6AA 5IQYA 4XHMA 5B7CA 5JCGA 1X0RA 5DVBA 4ZB9A 1GLPA 4NV2A 3VWWA 1K3OA 4DVCA 3IE3A 4BWSA 6GSTA 4RQRA 3IOSA 1W89A 4MZCA 1ERTA 4P3YB 4PQIA 2H70A 2PVOC 1OAZA 3UEMA 1IYIA 2HLSA 4MCUA 4ID0A 2BMXA 2GGTA 4MMMA 4AJ8A 4JRRA 1UN2A 1YDKA 4YQVA 3GX0A 1SYRA 2RUEA 4EDZA 1XOAA 2RIIA 5HR3A 1DE1A 1EEMA 3P2AA 4TR1A 3VK9A 1SK0A 2GLRA 4IS0A 1YY7A 5CRGA 1V40A 3GKKA 2LRCA 4OO4A 3UJ1A 4O5RA 3WT1A 1OE8A 3RPNA 2WGRA 2WFCA 4Q5FA 3DRNA 1Z7PA 2YPMA 5ECIB 3ZYWA 2RUFA 4KA0A 1BG5A 5IMCA 2V41A 3KH7A 1SL1B 2E2GA 1CQHA 4KX4A 5D93A 4WXTA 5AISA 3I43A 2YJ7A 5F05A 14GSA 2VM1A 5DQSA 5D96A 2GSQA 1YF1A 4X43A 4XTSA 22GSA 3CSIA 3CTFA 4IQAA 4ZL9A 2F51A 3A2WA 4FO5A 2R3XA 2JZTA 5F8BA 4L8EA 4K0GA 2VL3A 3SBCA 1X9MB 1MDIA 1XW6A 2DJ1A 4IQ1A 2ALBA 4NPBA 4I6XA 5CRHA 4BVXA 4PGTA 3C7MA 4OFTA 1TKDB 1B8XA 2L59A 2ZUPA 4XS4B 1R7HA 1F3AA 3I9V2 5IPGA 1OKTA 1WMJA 3D21A 2PBJA 4DSRA 17GSA 2GT5A 4EKZA 2YV9A 5KN0A 1DE2A 1Q98A 2B7JA 5CP1A 3K8NA 5IIZA 3C71A 1AIUA 1AXDA 2CT6A 2FY6A 2AB6A 2I3YA 2C3QA 2C1YA 4MP4A 2H19A 4HU9A 1GSUA 1PQNA 1FW1A 4GWRA 3HJOA 5HFGA 1EEJA 1O7UA 3DGQA 4N0ZA 1THXA 4NMUA 1HNAA 1EV4A 4MK3A 5B8AA 1S3DA 4POMA 3KMNA 4TKYA 2DMMA 1OKDA 2RM5A 4WF4A 8GSSA 4GSTA 1SK1A 1VF4A 1KEBA 3FHKA 1SKRB 4XS1A 3D6IA 5HR2A 3PINA 2LJKA 2V6KA 4TR3A 2JSYA 3QPMA 3C1RA 4MJBA 1XVWA 4KCEA 5ID2B 3IAS2 4PNGA 2ES7A 1G6YA 3P7XA 5H5RA 3M9JA 2HSYA 3DVWA 1OC3A 2IMKA 4TXVA 4GLTA 2C0GA 3QFBC 1AC1A 1USBA 2FGXA 5FHIA 2VCZA 3ZMKA 2JZSA 4X1UA 4O7HA 4V2LA 5G5FA 4IP6A 1G6WA 4ULXA 2OE1A 2HYXA 2C3NA 4K7NA 3LORA 5F06A 2H73A 2OBIA 2YNXA 4IKHA 1E2YA 1A8LA 4JR4A 1Z7RA 3KZQA 3RBTA 3HXSA 1OC8A 4G19A 4E8HA 1SJIA 2AJQB 1T4ZA 4PNFA 1VF2A 4I5QA 4KUNA 3ZLPA 2OKAA 3EC3A 1TOFA 3HVVA 2KOKA 1XWGA 4QL9A 2PU9C 1PA3A 1A0RP 3GL3A 4MJAA 2HFDA 3L9SA 4BVYA 2JADA 4V1Ap 3M1GA 2P0GA 1EP7A 3RHBA 3CSJA 2IMIA 4JE1A 6GSSA 3APSA 3VPQA 6GSYA 2B6MA 1FHEA 4ECIA 3FYGA 1NM3A 3KJYA 4K9ZA 1VF1A 1Z6NA 4J2FA 4KDXA 1SYXA 4L5OA 2GS3A 2PWJA 4ISDA 4Q5RA 5H5SA 4DEJA 1ZOFA 1F3BA 1T3BA 3QCPA 3LXZA 3BD2A 2K9FA 1T1VA 1ZYQB 2EIQA 2VL2A 4N10A 5A5KA 1K0CA 3GN3A 3US3A 4MZBA 4FH8A 1SU9A 1M9AA 4POBA 5GAPD 4K1FA 2F3MA 4F82A 3BOAA 4EL1A 4MZWA 1YKCA 2DIYA 2OJLA 3IHQA 1O6JA 3TRPA 6GSXA 3HA9A 2H72A 3TB2A 1SJ6A 1K0NA 5HFKA 1O85A 3H93A 4K7OA 2MMOA 1HYUA 5G5EA 1PL1A 2JL4A 3O3TA 2K6VA 1TU8A 3MWHA 3EINA 5AIXA 4HZ4A 1XWAA 3IBHA 1C72A 2L5OA 1X5EA 3HY2A 4IELA 1ZZYA 1W4VA 2M72A 1AW9A 2CV4A 4OMVA 2H0GA 5D9VA 1GTUA 2L57A 3UARA 3NOFA 2H75A 5ECMB 3ERFA 1GH2A 5ECPB 1Q4JA 2FA8A 1E6BA 20GSA 2MYGA 2VLVA 4F0CA 5HR0A 19GSA 4F03A 1YKAA 2CVDA 3I69A 3UOMA 1XXUA 3LGCA 3UVTA 4DSQA 2OBKA 2E0QA 1GUKA 2GVPA 5AGYA 3FRCA 2B5EA 4RQXA 1GL8A 1WWJA 3DWVA 3A5WA 2YANA 11GSA 3U6VA 2O87A 5IMDA 2O85A 1BX9A 1R4WA 1JLWA 1GTBA 3FR9A 3DEXA 3TJJA 2F8AA 3E9JB 2G0FA 5J4UA 2WRTA 2XBQA 2QC7A 1OVNA 1VF3A 1M2AA 2VO4A 4NWYA 3Q74A 3WGXA 2X8GA 3EVIA 4KDYA 2O8VB 2M46A 3GYKA 4WBJA 5GSSA 2DLXA 5G1LA 3A2VA 3ZFBA 1BEDA 5ENUA 4ECJA 2O7KA 3UL3A 4KB3A 1NSWA 4HJ2A 4RI6A 4TR0A 3R2QA 4PQ1A 4IVFA 1WIKA 5D9WA 3IK7A 3IRAA 3ZIVA 3GHAA 2V6OA 1GP1A 2GZYA 2VOCA 3D4TA 4RUVA 3UMAA 4YAVA 2DJ3A 3IDVA 1OYJA 5G2ZA 5EPFA 2L5LA 2FLSA 4F9ZA 1A8YA 1V98A 1WRYA 3KH9A 4AGSA 2FCHA 3TDGA 3VURA 2GZPA 4ZIJA 4GTUA 5DJLA 1A2LA 1PX7A 4DSSB 2VUPA 4AF2A 1A24A 4ZB8A 2VAFA 3CTGA 2CX4A 1T00A 5EL8A 5A4VA 18GSA 5DAKA 1GWCA 3QMXA 5DALA 4MJCA 3IK9A 4Q5NA 3G9BA 1F6MC 3GUSA 1LJRA 1U88A 1PL2A 4XIHA 4JBBA 1B9YC 3PH9A 2EIOA 3LWAA 2V32A 4WF5A 4HDEA 5LD0A 2K8VA 4V1Ag 3ERGA 3BJ5A 1ILOA 1AAZA 1ERWA 1GTIA 4L5LA 1YQ1A 4KCAA 2H30A 2C3TA 3EMXA 4MH2A 2P5QA 5GZZB 3ERWA 1RW1A 4O92A 3LFLA 5ECOB 1EP8A 2H0HA 1LBKA 2FA4A 2HRNA 4ZBAA 2H8LA 3ZTLA 4WETA 2C0FA 4GRFA 1SJZA 3O6TA 3UAPA 5HFIA 5DAKB 2H6YA 3W8SA 1MDJA 3QAVA 4TR1B 3HZ8A 1GSQA 4IGJA 1PRXA 5B8BA 5IMVA 5B6NA 2HT9A 5CO3A 2RLIA 3F3RA 3D4MA 4TW5A 5C00A 4ZBBA 5ABRA 4MA9A 4K6XA 3TKRA 3F4TA 4KE3A 4TOPA 1VGLA 1AQWA 2YZUA 4J56E 2MBTA 3APQA 5F0GA 1WOUA 3BBYA 1K0AA 2YCDA 4EE0A 1GSFA 5LNKe 4GSSA 4WKWA 2PPTA 3KIJA 2LKUA 1SD8A 3VWXA 4V2NA 5D9TA 4PQHA 1R26A 2IIYA 3IPZA 1SD9A 1ABAA 3CXGA 1TRVA 2GT6A 1PN9A 2GDRA 1M0UA 3FR3A 5DDLA 5B6MA 4WR5A 4HOJA 1B4QA 5ELGA 4GQFA 2A2RA 3L4NA 2FWGA 1H75A 1PX6A 4FIWA 3MDKA 3HJPA 1KTEA 3GURA 2FWEA 2YZHA 1YJ6A 1TXXA 4KNDA 4TN8A 3L78A 2AV4A 1MTCA 4IHUA 5CYYA 1FG4A 1Y6EA 3F63A 2VD1A 1OC9A 3H4KA 1JZWA 3VWUA 4IW9A 2LS5A 2YWOA 1QGVA 2ZCTA 1PD21 3VWVA 2A4VA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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