4IP6A

C-terminal domain of the thiol:disulfide interchange protein dsbd, q488a mutant
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
HLNFTQIKTVDELNQALVEAKGKPVMLDLYADWCVACKEFEKYTFSDPQVQKALADTVLLAANVTANDAQDVALLKHLNVLGLPTILFFDGQGQEHPQARVTGFMDAETFSAHLRDRQPGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title An Extended Active-site Motif Controls the Reactivity of the Thioredoxin Fold.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein DsbD
molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
total genus 42
structure length 121
sequence length 121
ec nomenclature ec 1.8.1.8: Protein-disulfide reductase.
pdb deposition date 2013-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13899 Thioredoxin_7 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ip6A00
4KH7A 2FCHA 10GSA 3FZAA 3ZMKA 4GTUA 2I9HA 1XWKA 5INYA 2B1LA 3FRCA 2VD0A 3VI7A 2GDRA 1M9BA 2HE3A 5JCWA 2HXKA 5D9XA 4OO5A 1U6TA 2G0FA 5JWQB 4TXVA 1O7UA 1QXHA 4EE0A 4F9ZA 2LQQA 1MDJA 3H4KA 2YWNA 5DJMA 3F3QA 4L5OA 1XBSA 2C0GA 2L4QA 5G5FA 1GH2A 3E9JB 2DJ1A 4ZBAA 4OFNA 2VLUA 1FVKA 4XRAA 3TJGA 1ZZYA 2O87A 3I43A 3PR8A 2X8HA 2D2ZA 3HHVA 2VIMA 1SL0B 4OFTA 3HCZA 4MZWA 1NM3A 4NWYA 4JEDA 1X5DA 4MK3A 1J0FA 1R5PA 2LRTA 4X1UA 1V2AA 4L0UA 1GUHA 2C4JA 3Q18A 3QPMA 2OBKA 4ECBA 2YJ7A 2RM5A 4Q5NA 5ID2A 4JBBA 3A2VA 3APOA 4I6XA 3AY8A 4O32A 3RHCA 3F9UA 1T8EB 3TRPA 5EVOA 4F2IA 5IMCA 3UBKA 1X9SB 1HNCA 2WFCA 3TCOA 1MEKA 1M2DA 3UARA 1Z6MA 1EEMA 4KCEA 1GNEA 1QGVA 2YCDA 1HNAA 1XW6A 3ZVJD 4OWYA 2E7PA 2FA8A 1R4WA 5IOWA 1I5GA 1OE8A 2H76A 3UIWA 5AISA 4FH8A 2R5GA 1Y25A 4L0WA 5DDLA 4POMA 1TTZA 2LKUA 1XXUA 4AGSA 4MDCA 2FGXA 12GSA 4FYCA 5KN0A 3F0IA 1W89A 5ECNB 3CTFA 4K8MA 4JE1A 1FW1A 5D8IA 2DMMA 2OE1A 4KNDA 1YEXA 2P5QA 3GSSA 1R5AA 1O8WA 2F8AA 2YPMA 3ME7A 4MZCA 4NV2A 4BWQA 5ECHB 4ZL9A 3GMFA 2FD3A 2MMAA 4XHMA 1ERTA 3UVTA 1DSBA 5LNKe 1B9YC 3MNGA 4KDYA 2VL2A 4TR1A 3UVHA 4E8EA 3LFLA 5ECLB 2FA4A 4EO3A 4PGTA 2GQKA 4GWRA 4Q5QA 5AIXA 4DSSA 5CYYA 4LL1B 3KTBA 5F06A 3BBYA 4JZQA 3P90A 4Q5FA 4WEYA 3UJ1A 2MBTA 3HVXA 1GRXA 3V1WA 1TK8B 3VWVA 1TRWA 4N10A 4NHWA 5D96A 4QL7A 3I9V2 4KUNA 5JCUA 1JHBA 2YANA 3IHQA 1RW1A 3J7Yk 1PA3A 3VPTA 1VF1A 3BCIA 2FUG2 3F4SA 2K18A 4OFMA 2VCZA 1XWGA 3E3EA 3LXTA 3HYPA 4MZBA 1SD9A 4ZB9A 4WXTA 3U6VA 3Q19A 1I9DA 1AC1A 1FHEA 2VAFA 4KDUA 2RIIA 5J9BA 5F8BA 2VL2C 3TDGA 4ILFA 3DVXA 3H8QA 4HQSA 3A2WA 1TI3A 4HZ2A 2DBCA 1XWAA 2PUKC 1GSFA 5G1KA 3IAM2 2CQ9A 5EL8A 4QL9A 6GSUA 4MA9A 4PQHA 3WGXA 1Z9HA 2H6ZA 1PSQA 5B7CA 4XTSA 1V58A 1K0OA 1DBYA 1M7TA 1F6MC 3ZL5A 2WJUA 3MDKA 2VCQA 4ZILA 3TUEA 1OVNA 2VLVA 2F9SA 1EEJA 3KTLA 3ZFBA 1M2AA 1WE0A 3L9VA 2XPEA 2E0QA 5D9VA 2EIQA 2RUEA 4CDOA 2MZCA 1O73A 1J08A 4O7HA 4ZL8A 1XPVA 3H1NA 3IAS2 3FEUA 3HJOA 2H6YA 1JFUA 3CSJA 4MH2A 3I69A 3TKRA 2XBQA 3EU4A 4YQUA 5KEJA 4MPGA 1JZDA 1T3BA 4HJ2A 5F05A 2GS3A 2C8UA 1URMA 3C1RA 3MWHA 4IJIA 1AAZA 4K1FA 4BVYA 1SYRA 3A2XA 4F0CA 4HU7A 1Z6NA 3QD9A 2KLXA 4PQ1A 1EGOA 3ME8A 3FK8A 1EZKA 4V2LA 2VLTA 3APSA 4WR5A 3GN3A 2F8FA 3GA4A 2HYXA 4KAEA 5H5SA 3GL3A 1A2LA 3LSZA 2L5OA 1R26A 3JCML 4O92A 3LXZA 4ML1A 3GSTA 1AIUA 5G31A 5D9TA 3D0ZA 5B8BA 3M3MA 2WB9A 4D73B 4EUYA 1GTIA 2MBSA 3GNJA 4MLYA 5KN1A 6GSWA 4EC0A 2B7KA 1IYIA 4YH2A 1N2AA 2QSIA 2WULA 5KN3A 3QR6A 5J5NA 2FY6A 5H5QA 4NV5A 3G9BA 3IXRA 4TOPA 4POLA 5ELAA 2H8LA 1MDIA 2CX3A 5HFGA 3EE2A 5ECIB 2WZ9A 1SJ6A 1VF3A 3GX0A 1X5CA 3CSIA 5CO3A 1LU4A 2B6MA 4PUFC 4IJ3A 1AQVA 3M9JA 1VGLA 4EXJA 3GTUA 5A5KA 2OJLA 4HQZA 2LJKA 2WS2A 2VCTA 2H01A 1X9WB 3W8SA 2JZSA 2KOKA 4V1Ap 3CRUA 1PKWA 2MYGA 3ISOA 3EYTA 3FR3A 3ZMLA 4K7NA 1B4PA 3Q6OA 2DSAA 5F0GA 1TU7A 2ES7A 1BQ7A 2O7KA 4GRFA 2YZUA 2WRTA 3N5OA 2A4VA 3HKRA 3D4MA 5L71A 5AGYA 3R2QA 5A4UA 4FIWA 5CRHA 2ZCTA 3FZ4A 1THOA 1O81A 4XS4A 3HZ8A 1SJZA 2NBSA 1XVQA 3TB2A 3P2AA 3GX8A 4YAVA 5ELGA 3RHBA 1SL2B 2CV4A 4TKYA 2PGTA 4HI7A 5HR3A 1XFLA 3LORA 4POBA 2LRCA 3QMXA 3BOAA 4WKWA 13GSA 1A8YA 4KSMA 3HVVA 1M9AA 2WCIA 3U5RE 4TRXA 1GSQA 2CZ3A 3HDCA 1ERUA 3HXSA 5DALA 3KP9A 4ACSA 1T4YA 2CVDA 2AJQB 5ID2B 1V57A 1T1VA 2R4VA 1TP9A 3APQA 4EF0A 2GSQA 1G6YA 2H75A 2VOCA 1MD4A 4KB3A 4JRRA 3RDWA 1B8XA 4X43A 5HR2A 2DC5A 2QC7A 3TJFA 2ZNMA 1DUGA 1H75A 3QDNA 2YOIA 1GSEA 1OC9A 1K0AA 3CTGA 2H74A 1ST9A 1WWJA 2VL9A 3S9FA 2FNOA 3WGEA 2PVQA 5DQSA 3A3TA 2I1UA 1SL1B 5AN1A 2IMIA 1YKAA 2VM1A 1YF0A 2CX4A 1DE1A 1SENA 2TRXA 2FWHA 1WRYA 3GYKA 1Q4JA 2ON7A 3PH9A 4OCEA 3ZYWA 1PD21 3F4TA 4XRDA 3D5JA 5JWOB 2F3MA 3L0HA 2V2GA 3KH9A 1MDKA 2YWMA 2DJJA 4IBPA 4I2TA 1SU9A 5ECMB 2YJHA 1RQMA 2LQOA 2N5BA 2MMOA 1OC8A 3G7IA 3KMOA 2JADA 4K2DA 5J3RA 1M0UA 2A2SA 4IVFA 1JLWA 1ZGNA 1XZOA 1TDIA 4TR1B 1H4OA 2FWEA 3UMAA 2LNSA 5G5EA 4PQIA 1BYEA 4V2MA 5GZZB 1Q98A 4GQCA 5JWRB 3ZRDA 1PX7A 1T7PB 5G2ZA 4LMWA 2PPTA 5IPHA 4DSSB 4KE3A 3VK9A 1HD2A 3ERGA 4IHUA 1U3IA 4BPYA 1KBNA 4N0ZA 2XHFA 2GQMA 3RPPA 3TKSE 2XBIA 3KXOA 4HZ4A 1YJ6A 3D6IA 2CVBA 4XCSA 1Z7PA 4H86A 4EVMA 2RLIA 1PL2A 2R37A 3QAVA 5H5RA 2V1MA 1AQXA 1A0RP 1JLVA 2H30A 2YZHA 1FG4A 1Z7RA 1EWXA 3ZVJA 9GSSA 3VWUA 4ECJA 3DYRA 4HOJA 4OO4A 3HJMA 1SKSB 1PL1A 4K9ZA 2H19A 2NVLA 3L9SA 3RPNA 1JZRA 1GSDA 1BJXA 1R7HA 3HZ4A 4BVXA 4MJAA 4AJ6A 3LEFA 3F6FA 1K3LA 14GSA 5IOXA 2IPAA 2EIOA 4JR4A 3A5WA 1A24A 1O85A 1UN2A 2JZRA 2K8SA 3E0UA 4EDYA 2HRFA 1Z5YE 1QMVA 3GH9A 3DGQA 2HNLA 1UVZA 1GNWA 5ECPB 4NPBA 4HJMA 2C1YA 1TRUA 3ED3A 1DE2A 3W8JA 1TXXA 4GSSA 4OCFA 4ECCA 2R3XA 1EV4A 2PMTA 3GURA 4N11A 4Q5RA 4WBRD 1GLQA 5B6MA 1A2JA 20GSA 3VURA 4GXZA 2GLRA 4K7OA 3UBLA 4IP6A 4EKZA 3FR6A 3LYPA 1GTBA 5E4WA 1PRXA 5CNWA 3C73A 1LJRA 1SKRB 1VF4A 5HFKA 2GT6A 2VCWA 5DAKA 3QFBC 3M9KA 2IIYA 2HT9A 3HY2A 1A2MA 2I4AA 4RQRA 1XIYA 5IMAA 2RUFA 4PXOA 6GSYA 3F3RA 3US3A 3WGDA 4HDEA 2IN3A 2X99A 4J57E 4BA7A 2IMFA 1XWCA 4TN8A 3IRAA 5D73A 4KA0A 2HI7A 2OKAA 3J7Yb 4K7IA 1BAYA 1XW5A 5A4VA 4ZIJA 3DMLA 1SK2A 4KDXA 2HLSA 5DJLA 4NMUA 4K6XA 1E2YA 3VWXA 4XS6A 2XPDA 1C72A 4WF5A 3IK9A 4HS1A 2WDUA 2IL3A 2YWIA 3G7JA 2VCVA 5IO2A 1G7EA 1AQWA 1PMTA 3O6TA 1UA5A 2DIYA 3CBUA 5A4WA 5EY6A 4KCAA 4JU5A 1FB0A 4TW5A 4X0XA 3GFKA 2P0GA 2GZZA 3GIXA 3FW2A 2LJAA 3F8UA 2C80A 4WBJA 4POKA 4PUAA 3GTUB 2C3NA 1ZOFA 3IC4A 2V6OA 3EWLA 2GVPA 2VCXA 3ERFA 4F0BA 1IYHA 2B5EA 4RI7A 2QGVA 1T4ZA 2CVKA 2CZ2A 4F82A 2YP6A 4G19A 3TKQA 4K0GA 5DCGA 4OD7A 1FOVA 1K0MA 4IP1A 3EU3A 5FWGA 1SK1A 4ZL7A 3LWAA 2E2GA 1K3OA 3LJRA 3TKSA 4PURA 3NZNA 4EDZA 1YY7A 2GQLA 2P31A 2YN1A 5KN2A 1ZYEA 3MSZA 3VLNA 4JR6A 2AYTA 3KGKA 1OAZA 4XS4B 4DVCA 5D93A 2HRNA 5DBQA 1VRSD 3KD0A 4CHSA 1FVJA 3DKSA 3HA9A 1A0FA 4MMMA 1E6BA 2DIZA 3FYGA 4GSNA 4AJ7A 5HR0A 3LYKA 5GSSA 5ECRB 2YNXA 4IW9A 1YEPA 2GSSA 3EINA 3IDVA 2X64A 2K8VA 2RM6A 1U3AA 16GSA 5DVBA 5IMVA 1OKDA 3KH7A 5DALB 1MD3A 3FR9A 5J41A 5B6NA 4XS1A 5G30A 2O85A 1JZOA 1N8JA 4KW6A 2LTKA 3EMXA 2GTUA 4BL7A 2B7JA 2AUVA 5ECSA 3G7YA 3TJBA 3IE3A 2OA7A 1KTEA 3L4NA 4TR4A 5HFIA 1OC9B 17GSA 4LMVA 1V9WA 4TXOA 2CA8A 3KCMA 1M2BA 5ECQB 4J56E 2IMEA 3ZIVA 1K0NA 4GF0A 5IQYA 3VI5A 2M46A 1EOHA 3DIEA 3HD5A 2HFDA 4PNFA 4ZXGA 3FZ5A 2OE0A 3WT1A 5EPFA 4L5LA 1YZXA 3TJJA 1SK0A 3RAZA 4DEJA 3KEBA 3GHAA 1TOFA 1HYUA 3BD2A 3D4TA 2FWFA 4ZB8A 5C00A 3TGZA 4IS0A 3TOTA 2JACA 1CQHA 5IMFA 5ECKB 3TRXA 2VO4A 5C04A 1TW9A 1AW9A 1BEDA 5DCHA 4I2UA 2VM2A 3VWWA 5CAXA 1CQGA 2DJ3A 1G6WA 1S3AA 2MMZA 2BTOT 1NHYA 2GT5A 2H71A 2DJ0A 3K8NA 3DD3A 3EURA 3GRXA 1PGTA 2GZYA 1J9BA 3GV1A 1ILOA 3M0FA 1FO5A 4WR4A 2REMA 4OMVA 2BJXA 7GSSA 5LCZA 1HNBA 1SYXA 5ABRA 1ZMAA 2OACA 3O76A 3CYNA 4LA1A 2H73A 3DXBA 3PINA 4E8HA 2CAIA 5D9WA 4ID0A 4TR0A 19GSA 5CP1A 4YQVA 5LD0A 2IFQA 1TRVA 1WP0A 2AB6A 1QUWA 1YKCA 2GSTA 4MF5A 2DMLA 2H72A 4LLRA 1F3AA 2FLSA 1GUMA 2VD1A 2E2MA 2LSTA 2EC4A 4MPFA 11GSA 1U88A 1FAAA 2F51A 2V41A 4G2EA 3UOMA 1UC7A 1ABAA 1XVWA 4I5QA 4FYBA 2B5YA 2H70A 3W6GA 2MMNA 2AAWA 2X8GA 2H1GA 1GSYA 1YF1A 1WOUA 2B5XA 1PN9A 4MF6A 5J9CA 18GSA 1V40A 6GSXA 1TKDB 2JZTA 1USBA 2J9HA 2DLXA 1GULA 2OE3A 1W4VA 2GGTA 3LQ7A 3PGTA 3GH6A 1WJKA 3ZREA 2PN8A 2X8CA 5GAND 4DSRA 3ZFLA 4MJBA 1ON4A 2DJKA 5IIZA 2PBJA 3D22A 1K3YA 3UAPA 2C0DA 4IQAA 4ML6A 1NHOA 4CW9A 3H93A 6GSTA 1AXDA 4YQMA 1S3DA 2N5AA 1M99A 2G2QA 8GSSA 3QCPA 5HR1A 2K9FA 4BWSA 2PU9C 4NXIA 3VPQA 4ECIA 22GSA 1WMJA 3QAGA 2AHEA 4GSTA 1X0RA 1ML6A 1MTCA 3P8WA 1JZWA 2HSYA 4GCIA 1O8XA 3TJKA 1F9MA 2JU5A 3QAWA 2LS5A 1YQ1A 4IN0A 4IKHA 3FY7A 3GKMA 2C3TA 4TVEA 2L6DA 2YWOA 2IMDA 4I8BA 1TJDA 1FB6A 5DAKB 5GAPD 2B3SA 1WPIA 3KIJA 4NAXA 2EIRA 2CT6A 5ENUA 2L5LA 2PVOC 1Y6EA 4KX4A 4FYUA 4J2FA 4GQFA 1TK0B 2HZEB 3RBTA 2DJ2A 1B9XC 3IBHA 3MAKA 2CAQA 2HSHA 4MCUA 3BJ5A 3ZZXA 2A2RA 1SJIA 4RQXA 2ON5A 5IO0A 4TR3A 2H6XA 4ZBBA 5GSTA 2B1KA 2WGRA 4RUVA 1G7OA 3IA1A 1THXA 5COHA 3LG6A 2M80A 5CREA 1GSUA 3CXGA 4HEA2 2H0HA 2O8VB 4GLTA 4WF4A 1ZCPA 5AIVA 1GLPA 2KUCA 3QOUA 2P5RA 3BCKA 4MABA 1Z3EA 4L8EA 5F07A 2IJYA 4G10A 1GTUA 3DVWA 2BMXA 3ZIJA 5FT3A 1F2EA 5JCGA 2LNTA 3GKKA 1EP7A 2KHPA 4N0VA 1EP8A 1TK5B 4MJEA 1T00A 3OR5A 3GKXA 1K0DA 2N5FA 5J4UA 5G1LA 1TU8A 1KNGA 1NW2A 2HZEA 2I81A 5E59A 3UL3A 4IQ1A 4KGIA 4QQ7A 3ZLPA 3IK7A 4MH3A 2M72A 3UEMA 2K6VA 2TRCP 3C7MA 1S3CA 1VF2A 3WD6A 1K0CA 3H79A 1B48A 1BX9A 3GL5A 2H0GA 2YV9A 3CMIA 4ZB6A 3IR4A 4O5RA 4ISDA 2L59A 2LJRA 3FZ9A 2V6KA 2OADA 3D21A 5FHIA 2KP1A 2VL3A 1OE7A 2O89A 3DEXA 3CSHA 4ZBDA 2JSZA 1TI1A 3SWLA 1AUCA 4FO5A 5CRDA 2Z9SA 1ERWA 1ACVA 2R6KA 5ECOB 2L6CA 1NSWA 2R2JA 1F3BA 2H1AA 1KEBA 2J23A 2V32A 5IM9A 1K0BA 4PX1A 3CRTA 1GUKA 3TOUA 2H1DA 4N30A 3QFAC 1OKTA 3KJYA 1QFNA 3M8NA 2ZUPA 3NIVA 4F03A 3I6AA 4IGJA 2TIRA 2QKEA 1XOAA 2NPBA 2NDOA 3Q74A 3DRNA 2AV4A 5CRWA 6GSSA 1XW9A 2L4CA 3TKPA 1EGRA 3LGCA 2FWGA 3KP8A 3ZTLA 2NTOA 2C3QA 4G9HA 2LRNA 3C71A 1SD8A 3WT2A 1RK4A 3F63A 2HZFA 2IMKA 3GKNA 5HQPA 1SKWB 4AF2A 1QQ2A 2PERA 1GSSA 2IWTA 2LV3A 6GSVA 5IMZA 3ERWA 1OYJA 4PNGA 4ULXA 3FKFA 3KZQA 2C0FA 1ZL9A 2GSRA 4MF7A 1PKZA 4TXOB 2L57A 1U87A 2VUPA 4K0NA 1V98A 3EC3A 4MJCA 4NHZA 1QK8A 2H66A 2JL4A 3IOSA 3EVIA 3O3TA 1TRSA 4AJ8A 5IPGA 5CRGA 4HUAA 1XCCA 3SBCA 3F4RA 3NOFA 4P3YB 1GP1A 4IELA 2XC2A 2H0IA 4V1Ag 2KP2A 3DWVA 4Z7XA 4HU9A 3IV4A 1O6JA 3L9UA 1GWCA 4V2NA 4WETA 1EOGA 3IPZA 3L78A 1EV9A 3N9JA 4LL4B 3TRQA 1PQNA 1HQOA 4EL1A 1GTAA 4MP4A 1ERVA 1B4QA 1PX6A 3VFIA 2YV7A 1A8LA 3FHKA 3ZITA 3KM6A 3TKSC 3M1GA 4D73A 2GZPA 2OBIA 3KMNA 1X9MB 3GUSA 3EMPA 3C8EA 1XOBA 1G0TA 2I3YA 2FHEA 5IMDA 5DQYA 2JSYA 1WIKA 3WYWA 1BG5A 5B8AA 4I97A 4KSOA 1ZYQB 2PWJA 4DSQA 1F37A 3C1SA 3F6DA 2LEGA 2LUSA 2H1BA 1YDKA 1X5EA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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