4JE1A

Crystal structure of thiol peroxidase from burkholderia cenocepacia j2315
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
174
structure length
174
Chain Sequence
AHHHHHHMSKVTLGGNPIDLAGTFPAVGAQAADFKLVGKDLADLSLASFAGKRKVLNIVPSLDTPTCATSTRKFNEAASSLDNTVVIVVSADLPFAATRFCTTEGLANVVTASTFRTGRAFANAYGVDVTSGPLNGLTARAVVVLDAQDKVIHAELVGEIKDEPNYDAALAALK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of thiol peroxidase from BURKHOLDERIA CENOCEPACIA J2315
rcsb
molecule keywords Probable thiol peroxidase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Burkholderia cenocepacia
total genus 53
structure length 174
sequence length 174
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.-:
pdb deposition date 2013-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4je1A00
1G7EA 1ILOA 3BCKA 1I5GA 4Z7XA 4N0VA 4OCEA 3VWVA 2LRCA 5KN0A 2VL2C 1Y6EA 1A8YA 3UEMA 2F8AA 1JZOA 3LYPA 2P5QA 3GSTA 2VL9A 2YJ7A 4I2UA 1KNGA 3ZYWA 5D73A 1IYHA 2HRNA 2I4AA 2WFCA 1PX6A 2AUVA 3APOA 4Q5FA 3GV1A 5GZZB 5D9WA 1EWXA 1TU8A 4MZWA 3QFAC 5F07A 2XPDA 1F37A 2DIYA 4JBBA 1G0TA 2GQMA 3MAKA 3HZ4A 1PD21 3LGCA 3M9KA 2GSTA 2L5LA 1AXDA 3EYTA 4J57E 4PUAA 1B48A 4AJ6A 5CRGA 4KSOA 4HI7A 2V41A 4P3YB 5ECMB 1SL1B 4POLA 1YKAA 3R2QA 3F3QA 4ZBBA 2LRNA 1QK8A 2GDRA 3DVXA 1TI3A 5DCGA 2MZCA 3HZ8A 4N30A 3HD5A 1ON4A 4HU9A 2FD3A 3U5RE 2B6MA 3GKNA 1DSBA 2C8UA 4TVEA 4IELA 5FHIA 18GSA 4IN0A 1U87A 5G30A 4HUAA 3IR4A 3WGDA 1O6JA 1F3BA 4TR4A 4KE3A 1TRSA 1E2YA 2PWJA 4HEA2 4BWQA 3F63A 1NSWA 4X1UA 1XOAA 2YWOA 2L6CA 5CAXA 1Y25A 1WWJA 2JSYA 4BVYA 3D22A 2H1BA 3HA9A 2WZ9A 3QMXA 3TDGA 3DIEA 1VF1A 5ECRB 2OACA 1GSDA 4PXOA 4RUVA 2YV9A 5IOWA 3G9BA 4EXJA 1CQHA 3AY8A 4KDYA 4XCSA 2LNSA 2R4VA 11GSA 1S3CA 4KB3A 1ERUA 4PQIA 1EZKA 6GSYA 5KN1A 4BVXA 3DMLA 2YNXA 1U3IA 5IPHA 3DVWA 3TKSC 2YV7A 1R26A 1FB6A 1XWBA 2GGTA 4V2NA 2H72A 3KD0A 1U88A 1K0NA 4FIWA 3LSZA 4OO5A 4IJIA 1EEMA 3M8NA 2F51A 1O8XA 3CTFA 5J5NA 1G6YA 3HVXA 3I43A 4OFTA 4ID0A 5A4UA 2AHEA 1THOA 3RPPA 3M1GA 1GTBA 1MEKA 1S3DA 1K0CA 2X8HA 5CO3A 1TI1A 3CSJA 2LJRA 1EOHA 2DLXA 3WGXA 4NV5A 4K7OA 1M2BA 1Z7RA 1HNBA 2PUKC 1LJRA 5IM9A 5A4VA 1XW5A 1GNWA 3HDCA 2DMMA 4HQSA 3D5JA 1FAAA 1SU9A 3D4TA 1IYIA 4L5OA 4IW9A 1Z3EA 1XIYA 1HNAA 1VRSD 3TKSA 3ZZXA 3HVVA 2CA8A 2CVBA 1BJXA 2IIYA 4QL9A 4MF5A 1AUCA 5GSTA 4MJEA 4ULXA 1N2AA 1FVJA 4IQ1A 4LLRA 1PKWA 1MDJA 1OYJA 5JCWA 2VO4A 3KP9A 1TDIA 5LD0A 1PQNA 1Z6MA 1X5DA 3H1NA 3EINA 2GZYA 1XWGA 1AQWA 1HNCA 5AISA 3LFLA 5G5FA 1T00A 3EVIA 2DJKA 4WBJA 5KN3A 5H5QA 3IBHA 4JU5A 4GQCA 4KX4A 1MD4A 2CZ2A 3APQA 5A5KA 3K8NA 2L4CA 6GSSA 2EC4A 3NZNA 3LG6A 2ZNMA 3WD6A 2EIOA 4EL1A 3CSIA 3F8UA 2WULA 2LRTA 3QPMA 2O7KA 1GSUA 3ZLPA 5AIVA 2LJKA 2FNOA 1PL2A 10GSA 2EIQA 1A0FA 2O8VB 2TRXA 1T8EB 3P7XA 3F6DA 4XS4B 2IL3A 2HSHA 2DSAA 1XWKA 1QXHA 2C0DA 2MBSA 2GT6A 1EGOA 4MLYA 3CRTA 4IBPA 2E2MA 4XTSA 1V9WA 5HFGA 1ERWA 3IDVA 1OKTA 1SK2A 2G2QA 1MTCA 2BMXA 1X0RA 3HJPA 1YZXA 5ECSA 5C04A 2E0QA 4ZBAA 1WIKA 5AIXA 4LMWA 2H0GA 1TOFA 2OKAA 1V2AA 3F9UA 2VCZA 3WYWA 1BX9A 4NPBA 2IMIA 2HZEB 1X9WB 3PR8A 3F0IA 1A24A 1BG5A 3A2VA 5INYA 1GTIA 3VI5A 2OE1A 2CAQA 4PQ1A 2H73A 4D73B 5DALB 1V40A 1KTEA 3GKKA 1SJIA 1WE0A 2DBCA 3H93A 2B5XA 3CMIA 1VF4A 3ME7A 1BYEA 1F9MA 3GMFA 1ABAA 3RBTA 1TK0B 17GSA 2AYTA 4LA1A 4AJ7A 3TRQA 4MPGA 2RLIA 4RI7A 4MH2A 3FZAA 5G2ZA 1N8JA 2K6VA 2VCWA 1GL8A 3US3A 1R7HA 3ZITA 1USBA 1PSQA 3KH7A 6GSXA 5JCUA 1B4PA 1GNEA 4MZBA 4DSQA 5D96A 5IO0A 5IQYA 5HR1A 3ZFBA 3L4NA 3TUEA 1K0BA 4F82A 4DSSB 2AJQB 2YP6A 3PH9A 2V2GA 1TK8B 4HJ2A 1FVKA 2NVLA 5EL8A 2L57A 3O6TA 3QOUA 3I9V2 1PMTA 4POKA 1FB0A 4IP1A 4XRAA 5CREA 2FWHA 2YOIA 1XWCA 1AW9A 1GSEA 4I8BA 1YF0A 1SK1A 4JE1A 4CW9A 3TOTA 4NHWA 2LUSA 2P31A 4YQMA 3CTGA 2PGTA 5IMVA 4MZCA 2HNLA 2GSSA 3MNGA 5DVBA 2WB9A 2H1AA 1QUWA 4LL1B 3GRXA 2Z9SA 2MMAA 3UVTA 2I9HA 2TIRA 4O92A 2I1UA 1DUGA 2B7JA 3L0HA 4PQHA 4DSRA 3HYPA 3CSHA 2A2RA 2RUFA 1K0OA 2A2SA 4BA7A 3KP8A 2H0IA 5LNKe 3QR6A 3CYNA 1XOBA 2H75A 4PURA 1UC7A 2FCHA 4G2EA 4PUFC 3GKXA 4RQRA 2H1DA 4EDYA 3IA1A 1M9BA 3CRUA 5CP1A 4K2DA 4FYBA 1WPIA 3GURA 4YQVA 2PERA 3A2XA 4TXVA 4NAXA 4GLTA 2C3NA 2B5EA 2DJ3A 1R5AA 1TRUA 4MP4A 4ZB6A 1K0DA 2N5FA 5JWRB 2QC7A 3EMXA 2HZEA 13GSA 4HQZA 2B3SA 4JZQA 2KP2A 4D73A 2QKEA 2DC5A 2VLVA 1W4VA 5DALA 1PX7A 5E59A 2LKUA 3FHKA 3UIWA 1B4QA 4JEDA 3ERGA 4EC0A 2CVKA 3KGKA 20GSA 5ECLB 3IOSA 1XW9A 3UBKA 2R5GA 5B8AA 4MJAA 2GSQA 1TRWA 2VM1A 4BL7A 4TR3A 1TXXA 4V1Ag 1UA5A 4GSNA 1TP9A 4HDEA 1GRXA 1A2LA 1YF1A 2H0HA 3IAS2 1DE2A 5J9BA 2DJ1A 2TRCP 1GUKA 4DSSA 2JADA 3DEXA 4AF2A 4XHMA 5GAPD 3QFBC 2XPEA 3C73A 5IIZA 3ZL5A 2CQ9A 2LS5A 1S3AA 3EE2A 3G7JA 2C80A 3M9JA 2DMLA 4FH8A 4OD7A 4POMA 1WRYA 1V57A 2L4QA 2LSTA 5B8BA 3BD2A 1SJZA 2VAFA 5HR3A 3VI7A 3VURA 4CHSA 1FW1A 5F0GA 2IMEA 4MMMA 5DAKB 2M72A 3RHBA 3FYGA 4QQ7A 3GNJA 3I69A 3UMAA 4OFMA 2MMOA 1NW2A 2R3XA 2VCXA 3D6IA 4JR6A 5FWGA 2HRFA 4WF5A 4HS1A 3GX0A 3G7YA 4YAPA 1UN2A 2H19A 2FUG2 2V1MA 1XBSA 2WRTA 3ZFLA 2C3TA 2HXKA 2X99A 3GTUB 3JCML 1GLQA 4OO4A 1M99A 1Q98A 1UVZA 4YAVA 1BEDA 3VPTA 3L78A 1U6TA 4TKYA 3EURA 2H1GA 3IXRA 2VOCA 5DQSA 4ZL7A 2JZRA 1JZDA 2AV4A 14GSA 1ML6A 2WCIA 2HZFA 2FA4A 3DGQA 1DE1A 2YANA 1SD8A 4IQAA 3UJ1A 3EC3A 4MF6A 3SBCA 2A4VA 3KTLA 2FWEA 4GRFA 1KBNA 4EUYA 3ERFA 4K8MA 1TU7A 3IAM2 1ZOFA 4AJ8A 5HFIA 1XCCA 2OE3A 2R2JA 3CXGA 4I97A 1F2EA 2ES7A 1TRVA 2IJYA 4F9ZA 2M80A 3GH6A 3LJRA 5J4UA 4ACSA 3IE3A 5IMCA 3TRPA 2V6KA 2B5YA 2FGXA 4F0CA 1O8WA 3GKMA 2XHFA 4LMVA 1M7TA 3DRNA 4IGJA 2RM6A 3L9VA 4ZB9A 3HHVA 3GN3A 5AN1A 4Q5QA 3LYKA 1U3AA 2IMFA 1QFNA 2VCVA 3QAVA 1AQXA 4GTUA 3F3RA 4O5RA 4EO3A 4GQFA 1XVQA 2PBJA 3QAWA 5J9CA 3KIJA 3FEUA 2PVQA 1J08A 3I6AA 2HFDA 4K9ZA 3APSA 1ZZYA 2K8SA 1OC8A 1YEPA 3FZ9A 3M3MA 4PNFA 3W8SA 2XBIA 3V1WA 2XBQA 1AAZA 2O89A 4Q5NA 1OC9B 1OVNA 4MDCA 1VF3A 3L9SA 1O85A 1RW1A 3U6VA 3N9JA 1PKZA 4KCAA 2LTKA 2YCDA 1ACVA 5B7CA 3TRXA 1SK0A 2MYGA 1FG4A 2D2ZA 1ZL9A 4IVFA 5CYYA 3BBYA 1ZCPA 3UL3A 4KW6A 5DCHA 4XS6A 5C00A 5DAKA 2KP1A 3VFIA 4L5LA 3E3EA 4NXIA 2L59A 1SKWB 2C0EA 3C1RA 3HVSA 3P8WA 1F6MC 2RIIA 1SKRB 4Q5RA 1HD2A 4TOPA 2DJJA 3TOUA 2GQLA 1GLPA 3GTUA 2WS2A 3O3TA 1H75A 3GA4A 1EV9A 3NIVA 2L6DA 3D4MA 1SJ6A 3VLNA 4MPFA 5A4WA 3GX8A 8GSSA 1TK5B 3F4SA 1K0AA 1M2DA 2H6ZA 2O87A 3F4RA 3MSZA 2J9HA 4V1Ap 1GSFA 3UAPA 3VPQA 2REMA 4WR4A 5DBQA 4YQUA 4L0UA 1T4ZA 5DDLA 2YWIA 4GWRA 2YPMA 3LEFA 3FY7A 1O81A 3P90A 3GL3A 2YWNA 2GT5A 4PX1A 5ECIB 2WJUA 1WMJA 1XW6A 5LCZA 3W8JA 1EGRA 4HU7A 2FA8A 1TJDA 1GSSA 1T4YA 4KSMA 2K8VA 3J7Yk 1WJKA 4K0GA 5IMDA 3RHCA 3A5WA 3TJJA 4PGTA 2G0FA 3HKRA 1GSQA 1Z9HA 2VLUA 2HE3A 1Z5YE 5E4WA 5G31A 4GCIA 3FR6A 2CV4A 1SENA 1BAYA 4IHUA 1X5CA 2NPBA 4EVMA 3WGEA 5D93A 1JHBA 1SL0B 2B1LA 2C4JA 5IPGA 4TR0A 2N5AA 5CRDA 1EP7A 5COHA 4MA9A 3ERWA 2LJAA 2HSYA 5IO2A 2KHPA 1EP8A 4GF0A 5J3RA 1O7UA 16GSA 3KH9A 4ZL8A 5EVOA 1JFUA 2E2GA 3LXZA 3PINA 5AGYA 1NHYA 4RI6A 1OC9A 3TGZA 3S9FA 2QGVA 1XZOA 4HJMA 2H6XA 2WDUA 4G9HA 1TTZA 4KGIA 2PN8A 3GSSA 4MH3A 2RM5A 5D9VA 5ABRA 1VGLA 1ZGNA 1ERVA 5F06A 4E8EA 2JZSA 3DXBA 2YN1A 3IPZA 1JZWA 4I5QA 4F2IA 1YY7A 5ID2B 2I3YA 1XXUA 4OWYA 1V98A 4QL7A 2IWTA 3FKFA 5ECPB 3KEBA 4BWSA 3DYRA 2LNTA 1OE7A 1SYXA 4F03A 3UVHA 4KA0A 6GSVA 3ISOA 2E7PA 1FHEA 4NHZA 1RQMA 4TR1B 2N5BA 4JRRA 2DJ0A 4XRDA 1ZMAA 4HOJA 2H71A 3E9JB 5EPFA 4ISDA 1CQGA 3RAZA 1ERTA 3FZ4A 1YDKA 1XVWA 3GYKA 2X8GA 2C3QA 3QDNA 1SL2B 4FYCA 1J9BA 1K0MA 12GSA 3VK9A 2V32A 4F0BA 4KCEA 6GSTA 3M0FA 1PRXA 4TN8A 1XWAA 2NBSA 2GLRA 2YJHA 1GH2A 3IRAA 4IP6A 1WP0A 1GWCA 3UARA 3FW2A 3C8EA 3H4KA 1PGTA 3L9UA 1T1VA 3QAGA 4ECCA 2MBTA 5GSSA 2R6KA 2IN3A 3BJ5A 2JL4A 5J41A 1F3AA 4L0WA 1ST9A 3TB2A 3ED3A 2OADA 19GSA 3FR9A 4YH2A 5ENUA 3W6GA 2KOKA 1X9SB 4ZBDA 4MJBA 2VL2A 4PNGA 1I9DA 3O76A 2F9SA 4HZ4A 4O7HA 2ON7A 4TW5A 3FRCA 3ZTLA 2R37A 2K18A 1OE8A 2F8FA 2JSZA 3VWWA 1G7OA 3HY2A 4ECIA 4GSTA 2O85A 3DD3A 4ZXGA 2IMDA 5CRHA 1AIUA 4N11A 1YJ6A 1PN9A 4ZB8A 1QQ2A 5IOXA 2H30A 1GSYA 5B6MA 2C0FA 3LQ7A 3QD9A 2CX4A 1C72A 3LORA 3Q74A 3N5OA 4CDOA 5ELGA 1LBKA 2OBKA 5IMFA 1SYRA 2JACA 5FT3A 2OE0A 1TKDB 1A2JA 5L71A 4KNDA 2NTOA 3KTBA 2KLXA 4J2FA 2CAIA 5ID2A 1YEXA 2VCTA 5HFKA 2LEGA 5DJLA 2GZZA 3Q18A 2FHEA 5ECNB 2DIZA 1JZRA 4KH7A 1MDKA 4XIHA 3KCMA 1J0FA 3ZMLA 3UOMA 1E6BA 1THXA 4WEYA 1G6WA 1SKSB 4POBA 4TR1A 4N10A 4X0XA 2C1YA 4BPYA 4WKWA 3F6FA 3TJGA 1B8XA 4KUNA 2PMTA 1PA3A 2B7KA 4V2LA 3NOFA 2NDOA 2P5RA 3ZREA 5EY6A 4TXOB 2MMZA 6GSUA 2VLTA 3Q6OA 5G1LA 3RPNA 5JCGA 3TJFA 4O32A 3FR3A 2QSIA 1KEBA 3ZRDA 2I81A 4EF0A 3TKRA 3KMOA 4IJ3A 2VCQA 2J23A 2ON5A 3EU3A 2ZUPA 2M46A 3FZ5A 5KN2A 2VM2A 1FOVA 2FLSA 2H74A 4V2MA 5IMZA 3A3TA 3ZIJA 2GQKA 1URMA 1W89A 2GVPA 3HJOA 1RK4A 1PL1A 4IS0A 2P0GA 7GSSA 2HYXA 2AAWA 1FO5A 4E8HA 2CVDA 1Q4JA 4G19A 1NM3A 4KAEA 2H66A 2MMNA 1EV4A 1AC1A 3C7MA 2H8LA 1EOGA 3LXTA 4MF7A 3UBLA 2GSRA 1ZYEA 1OAZA 1VF2A 4ECJA 2HI7A 2X8CA 2VD0A 3VWUA 3TKSE 2HT9A 4K6XA 3TJBA 3G7IA 1MDIA 4GXZA 3GIXA 2IFQB 2OBIA 2LQQA 3IK7A 9GSSA 2GZPA 2ZCTA 4ZL9A 5JWOB 5ECHB 5CRWA 3IK9A 1Z7PA 2ALBA 2H70A 5F05A 5G5EA 3H79A 4NMUA 5ECOB 3LWAA 4OCFA 2LQOA 1XPVA 2GTUA 4K7NA 3EU4A 1HQOA 5H5SA 3C71A 4FO5A 1NHOA 3BOAA 4EE0A 1GULA 4KDUA 1A0RP 1SD9A 3HCZA 5F8BA 2H6YA 1R5PA 3HXSA 1T3BA 1GTUA 4G10A 4NWYA 1GUHA 4OFNA 2IPAA 5D8IA 1B9XC 1EEJA 1X5EA 3QCPA 2YZUA 4RQXA 4ML1A 1QGVA 4K0NA 2H01A 3KM6A 3DKSA 4XS1A 3C1SA 4I6XA 4EDZA 4OMVA 4WXTA 4FYUA 1DBYA 2C0GA 2PPTA 2FWGA 2L5OA 3SWLA 3VWXA 1JLWA 3EWLA 5H5RA 2BTOT 4WETA 4ZILA 1X9MB 2V6OA 5JWQB 3J7Yb 3HJMA 2B1KA 2GS3A 2JZTA 3F4TA 4DEJA 2RUEA 3FK8A 3GHAA 5IMAA 3GH9A 2FWFA 2X64A 5ELAA 3TKPA 4JR4A 1R4WA 2OA7A 5KEJA 2F3MA 3PGTA 4TXOA 3D21A 4ML6A 1YKCA 5ECKB 2YZHA 3P2AA 1ZYQB 3D0ZA 3KJYA 3WT1A 4HZ2A 1V58A 3BCIA 1Z6NA 2YWMA 4MK3A 3GFKA 1K3LA 3GUSA 4MABA 1JLVA 4H86A 1M0UA 4WBRD 4J56E 3A2WA 1YQ1A 5DQYA 2JU5A 5B6NA 1XFLA 22GSA 3TJKA 3Q19A 4ECBA 1AQVA 1QMVA 1GTAA 4ILFA 1HYUA 4WR5A 1TW9A 5GAND 2K9FA 4I2TA 4WF4A 3ZVJA 5ECQB 2FY6A 1WOUA 1GUMA 4EKZA 3KMNA 5D9XA 4MJCA 4LL4B 4IKHA 2VD1A 3KXOA 4TRXA 1A8LA 2PVOC 2EIRA 1A23A 5HQPA 3GL5A 2OJLA 2LV3A 3WT2A 3KZQA 3TCOA 5D9TA 1B9YC 4N0ZA 1LU4A 6GSWA 2IFQA 3ZMKA 2KUCA 5G1KA 5CNWA 3MWHA 2CZ3A 4X43A 1M9AA 2IMKA 3OR5A 4K7IA 3MDKA 3IV4A 4L8EA 3TKQA 2H76A 4AGSA 4GSSA 3DWVA 1MD3A 4DVCA 2XC2A 2VL3A 2DJ2A 1A2MA 4NV2A 1M2AA 2HLSA 2WGRA 5HR0A 1OC3A 1BQ7A 3EMPA 4K1FA 1GP1A 1O73A 3CBUA 1H4OA 3ZIVA 2PU9C 3H8QA 3IHQA 3ZVJD 4XS4A 3IC4A 4KDXA 1K3OA 2CT6A 3ME8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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