4JE1A

Crystal structure of thiol peroxidase from burkholderia cenocepacia j2315
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
174
structure length
174
Chain Sequence
AHHHHHHMSKVTLGGNPIDLAGTFPAVGAQAADFKLVGKDLADLSLASFAGKRKVLNIVPSLDTPTCATSTRKFNEAASSLDNTVVIVVSADLPFAATRFCTTEGLANVVTASTFRTGRAFANAYGVDVTSGPLNGLTARAVVVLDAQDKVIHAELVGEIKDEPNYDAALAALK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of thiol peroxidase from BURKHOLDERIA CENOCEPACIA J2315
rcsb
molecule keywords Probable thiol peroxidase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Burkholderia cenocepacia
total genus 53
structure length 174
sequence length 174
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.-:
pdb deposition date 2013-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4je1A00
3QAGA 3ZFBA 2TIRA 1K0MA 3FKFA 4EF0A 5ECNB 4N30A 4K2DA 3CRTA 4ML6A 1YDKA 2CZ2A 3RAZA 1DE1A 3LYKA 1GTUA 1PQNA 3VWUA 1NHYA 5HR3A 1I9DA 5JCGA 3VLNA 2RM6A 5IQYA 2CVKA 3IAM2 4O7HA 3BBYA 1PSQA 3BCKA 1U3AA 3Q18A 4WF4A 2KLXA 4Q5FA 3TJBA 1R4WA 4IJ3A 3VK9A 3GV1A 4FH8A 3ZVJD 1DSBA 1M99A 1SYRA 1V9WA 4PUFC 4MLYA 1QQ2A 3HZ8A 2AV4A 2PVQA 4IKHA 2ES7A 4K8MA 4P3YB 2IMFA 2H1GA 2VCXA 2AUVA 2VLUA 5HFKA 3VPQA 2GDRA 1ERUA 2VUPA 2LNSA 2GSQA 4GRFA 2D2ZA 4DSSA 19GSA 4PXOA 2QKEA 4OO5A 1K0BA 3ZRDA 1UN2A 2VIMA 3WD6A 2H6ZA 2H01A 5J5NA 1URMA 5CO3A 4ID0A 1YEXA 2OBIA 2OKAA 4CHSA 4O5RA 1XWAA 2P31A 2B7KA 2C0FA 1JZRA 1WP0A 3KH7A 1FOVA 1GNEA 4KH7A 5FWGA 4F0BA 1MDKA 5ECIB 3LSZA 2MZCA 3QFBC 2IL3A 1HNBA 3GL3A 4QL7A 4YQUA 1PN9A 4J2FA 3FYGA 1GSDA 1GH2A 3IXRA 1B8XA 1AXDA 4MJBA 3HZ4A 2IJYA 2VL9A 3RHBA 2FCHA 4GLTA 3D0ZA 1GSEA 3CTGA 1KTEA 5ELGA 4GQCA 1PL2A 1KNGA 3TRQA 4D73A 1E6BA 2F8FA 4EO3A 3LXZA 4NV2A 3TKQA 2WS2A 1X5EA 4PX1A 2K6VA 4POBA 5ECPB 1BJXA 2CAIA 2E2MA 2J23A 2L5OA 4TXVA 1T7PB 3ME7A 3ZITA 4XS6A 4K0GA 1T3BA 5AIXA 3P7XA 3MDKA 4MA9A 3VWXA 3H4KA 2HE3A 3FEUA 4MJAA 4BWSA 3IK9A 3J7Yk 2V6OA 3IR4A 4QQ7A 4WR4A 4OCEA 1ACVA 4V2MA 3HXSA 2DMLA 3RPNA 4OWYA 3UJ1A 1EP8A 3DYRA 4JEDA 2YWNA 1YF0A 2LQQA 2REMA 4JZQA 3LGCA 3FR6A 4K1FA 2HXKA 2I1UA 2WDUA 1YZXA 3KZQA 2B5XA 2JZTA 2F51A 5KN3A 2BJXA 1BQ7A 1M2AA 3APOA 4RQXA 1F2EA 2GT6A 3GKKA 4ZL7A 3ERWA 3HCZA 1PKZA 3G7YA 1G6WA 1Z6NA 3NZNA 2L4CA 4TR1A 4TN8A 3HHVA 1GTAA 1X9WB 1EGRA 4AJ8A 1AUCA 5D9XA 1QGVA 1EOGA 3LQ7A 5G31A 3L4NA 5F05A 5ECKB 4MMMA 3EMXA 3Q19A 3UMAA 4WBRD 5D8IA 4KDUA 1TDIA 1V98A 5IMVA 5G1LA 1LBKA 4F82A 5F07A 2F9SA 4MPFA 2OADA 3L9UA 1AQWA 2ZNMA 2FWFA 1UVZA 2WB9A 4PQHA 1V40A 1ABAA 2M72A 3QFAC 3VI7A 2DJ3A 3TB2A 4ACSA 1TK0B 4CDOA 1OE7A 2CVBA 2RUFA 3QMXA 4HS1A 4LA1A 4HEA2 3SWLA 1E2YA 5CREA 3VI5A 2F8AA 1F3AA 1G6YA 5DAKA 2WGRA 1Z5YE 1X9SB 4KA0A 2VD0A 2NTOA 3F3RA 5COHA 4ZXGA 3F6FA 3GKXA 2B1KA 5F06A 3W8SA 1K3LA 4XTSA 1EWXA 4HI7A 9GSSA 3WGXA 5A4UA 2CQ9A 1OC3A 1ILOA 2O87A 2HNLA 1CQHA 1TOFA 3O76A 2YJ7A 3F0IA 4WBJA 1X9MB 3M1GA 4Q5QA 1FAAA 3KP8A 1G7OA 2N5FA 1RK4A 1ZMAA 3NOFA 1NW2A 2XBIA 2LNTA 1F6MC 5D93A 1S3AA 2FD3A 2PGTA 5AIVA 3C71A 4BVYA 1HYUA 1XW5A 2LRCA 2OACA 1OC9B 3HJPA 2HRFA 1J9BA 3UBKA 2E2GA 5IO0A 3US3A 4FO5A 3TOUA 4XS4A 4YQVA 3HY2A 5DAKB 4X0XA 2L57A 3P8WA 3J7Yb 5ID2A 4ZL9A 3EINA 4ILFA 4RI7A 1JHBA 4HQZA 1TP9A 3CMIA 3KCMA 3KJYA 4WF5A 5IOXA 3GX0A 3IE3A 4KUNA 3GA4A 3BD2A 2H71A 2R5GA 3TKSC 1LJRA 3EYTA 4AF2A 1Q98A 7GSSA 5GAND 1OYJA 1A24A 3HJMA 3TRXA 2L6CA 1N2AA 4TVEA 2H1BA 3GMFA 4NPBA 4HDEA 1H4OA 3IK7A 1ERVA 3GIXA 20GSA 4G9HA 3SBCA 3BCIA 1GSQA 2YJHA 1EP7A 1W4VA 4ECCA 4Z7XA 4IELA 5ID2B 2MMAA 4HZ2A 4MCUA 4V2NA 1EZKA 4LL1B 4IW9A 1SL1B 2PUKC 1BYEA 2FA4A 5G30A 3ZL5A 4MJEA 2YCDA 2LS5A 4F03A 2OE1A 3Q6OA 5EY6A 2I81A 1SD8A 6GSTA 1KEBA 3IHQA 4K9ZA 3TKSA 3HD5A 2VCZA 1TRVA 2KHPA 1VF4A 1XIYA 2Z9SA 2NBSA 1A8YA 3LXTA 2C80A 2X64A 3HVVA 2HSYA 2DBCA 3ZREA 1PX7A 4YQMA 5DVBA 2MYGA 2H0GA 4EVMA 4IQ1A 1OVNA 4GWRA 5G5EA 6GSWA 2IMKA 2YANA 5AGYA 5E59A 1F9MA 4IS0A 1GSUA 2H0IA 2GZZA 2YNXA 3UARA 1MD3A 4DSQA 4TXOA 1GUMA 1GNWA 2GGTA 3IC4A 5AISA 5IO2A 4K7NA 4BPYA 2GSSA 1XVQA 1IYHA 5GSTA 2H70A 5CRHA 1WIKA 4ZIJA 1X5DA 3FZ4A 5GAPD 3FR3A 4N0ZA 1WMJA 1NHOA 1T8EB 1I5GA 4WXTA 4O92A 1BEDA 14GSA 2J9HA 3GX8A 1ZL9A 4N11A 2GVPA 2JU5A 2WRTA 5EVOA 2FWGA 3DRNA 1B48A 4Q5RA 2LQOA 3CRUA 2A2RA 2LTKA 1V57A 2DSAA 4KCAA 1FVJA 1GUHA 1QFNA 2LSTA 5B8AA 1WJKA 1PGTA 1EOHA 3M9KA 3UEMA 5CRDA 4TXOB 4ZBDA 1XOAA 3W6GA 1SJZA 4ZB8A 1J08A 2IMDA 3FZAA 1IYIA 2F3MA 3A5WA 2HI7A 4L0UA 3GKNA 1Z6MA 3M9JA 5ABRA 3IV4A 5ENUA 1BX9A 2K8SA 1WOUA 2R37A 2HZFA 1EEMA 1RW1A 5B6MA 3QD9A 4KGIA 8GSSA 3CSHA 3UBLA 6GSUA 5HR1A 4MPGA 5E4WA 4I2UA 3FZ9A 4OCFA 5L71A 2GQKA 3ME8A 5C00A 5DDLA 4TR3A 4ML1A 1HQOA 2JSYA 1XWKA 5LNKe 2OE3A 3FR9A 5HR2A 3KM6A 1UC7A 1F37A 2DC5A 2V6KA 5KN1A 1TK8B 2C1YA 22GSA 2VM2A 1HNCA 2O85A 2GSTA 1AIUA 4NXIA 3DIEA 4G10A 1EV9A 2GSRA 5DBQA 1FW1A 1B9XC 1DBYA 3KMOA 2YP6A 3KMNA 1O73A 1XZOA 2LJKA 3CSIA 4MABA 2JZRA 2CX3A 3EURA 2O7KA 1BG5A 1M2DA 2DJ1A 3LWAA 3M8NA 1OC8A 1TTZA 3DD3A 3P2AA 1PMTA 4AGSA 3VWVA 1TK5B 3OR5A 2HSHA 1S3CA 2IMIA 2DJJA 3D5JA 2H8LA 2VCVA 2H6YA 3I69A 1JLWA 2I3YA 2AYTA 3IAS2 1K3YA 1WE0A 4ZBBA 2KP2A 4WKWA 4EUYA 2K9FA 3H8QA 2KUCA 4LL4B 3G7JA 1JZWA 4OFMA 2V1MA 2H75A 3AY8A 3KGKA 4WR5A 3D22A 4IQAA 1K0AA 3C1SA 4L0WA 3KXOA 1UA5A 3LG6A 3LEFA 1OKTA 2H0HA 4O32A 3ZTLA 5C04A 4MZBA 3N9JA 2WULA 1PX6A 3PINA 3H93A 2C4JA 2R2JA 3EU4A 3C1RA 4NWYA 6GSVA 5ECLB 2EIQA 5IMAA 5IIZA 4ECIA 3F4TA 4LMVA 5ECHB 1SKWB 4I8BA 4XRAA 4FIWA 4Q5NA 4K6XA 3WGEA 3DVWA 2ALBA 4AJ7A 2WJUA 3CSJA 2MMOA 3F9UA 1BAYA 3ZLPA 3LFLA 1NM3A 1MD4A 1AQXA 5CRGA 2C0GA 2H76A 5FHIA 5DCHA 4MJCA 4GQFA 1FB0A 1FO5A 2XPEA 1Q4JA 1QK8A 3U6VA 2IIYA 3GH6A 3U5RE 1ZYQB 1SK0A 3VURA 4E8EA 3NIVA 3E3EA 1Z7PA 1QUWA 3UVTA 2KP1A 1A0FA 5J41A 4MF6A 1O6JA 1AC1A 4TKYA 5G1KA 3GYKA 4G2EA 2VM1A 2P5RA 2GS3A 4KE3A 4XIHA 5CAXA 2HLSA 3C73A 4GSTA 5HFGA 3TJGA 1GP1A 5DCGA 2IN3A 4XCSA 2QGVA 4GXZA 2VL3A 2FWEA 3WGDA 4EDYA 1AAZA 3BOAA 2CV4A 4BWQA 2CAQA 2RUEA 3D6IA 4EE0A 3D4MA 5ECQB 1OC9A 3RBTA 2DJ0A 3P90A 5HQPA 5ECMB 1U87A 4LMWA 1N8JA 4ZBAA 1ERTA 3D4TA 4F9ZA 1O7UA 3EMPA 3I43A 2HFDA 2E7PA 3FZ5A 1XXUA 3F4SA 3G7IA 2H72A 2LKUA 5KEJA 1TU7A 4PURA 1FG4A 16GSA 5D9VA 3TCOA 2AAWA 3APQA 1YQ1A 2KOKA 4TR4A 2RIIA 4PNFA 3PH9A 1U3IA 1EV4A 2YWIA 2I9HA 1TKDB 2HRNA 2PU9C 2TRCP 5IMCA 3HDCA 3ZIVA 4K0NA 3GURA 4YAVA 1Y25A 1K0CA 4TOPA 1T1VA 1M2BA 5JWOB 3LYPA 1X0RA 1THOA 1C72A 4HUAA 1M9BA 3TJKA 3DGQA 3F3QA 1A23A 1TW9A 1JFUA 1PKWA 3UOMA 5EPFA 1HNAA 2FUG2 1SL2B 1K3OA 1TU8A 3IDVA 2YN1A 3QR6A 5EL8A 5IMFA 1A8LA 4OFTA 2DLXA 3KEBA 1SKSB 2B7JA 1YEPA 2V32A 4OMVA 4IBPA 4YAPA 3CYNA 2IPAA 3GKMA 2OBKA 4GSNA 2CX4A 3TKSE 3M0FA 3DMLA 4MH2A 1XW6A 2JADA 2H19A 4HQSA 3RHCA 1LU4A 2YWMA 3KTBA 1TJDA 5CNWA 1DE2A 1G7EA 1VF2A 2PVOC 2TRXA 3QAVA 2MMZA 5DJMA 5DJLA 5HFIA 2VAFA 1GLPA 2PMTA 4MH3A 4I6XA 2QSIA 5D9TA 5GSSA 2IFQA 3DWVA 4KSMA 1ON4A 3R2QA 4KDYA 3FW2A 2L5LA 4HU9A 2ON7A 2VCQA 1JZDA 1XWBA 4IP1A 1HD2A 3IPZA 1H75A 2MBSA 4ECJA 3TJJA 5IMZA 5B8BA 2XC2A 1GTBA 1XCCA 3WT1A 3TOTA 1B4QA 1TI1A 3H1NA 4DSRA 2H1DA 4KAEA 2K8VA 1ERWA 1QMVA 2DMMA 2FGXA 2GQLA 1AQVA 5DQYA 4RI6A 3MWHA 4N0VA 2VLVA 3N5OA 4OO4A 4X43A 1TI3A 1WPIA 2ZUPA 2RM5A 2OJLA 5D73A 1A0RP 4BA7A 4DVCA 2IFQB 1SK1A 1R7HA 2E0QA 4F2IA 3DKSA 3A2WA 4IHUA 3ZMLA 4OFNA 3TRPA 1OKDA 3KD0A 2RLIA 5D9WA 5A4VA 5JWRB 1SENA 18GSA 3FK8A 2OA7A 1A2MA 1Z3EA 2WCIA 5A4WA 2XPDA 5J9CA 6GSSA 2R6KA 4PQ1A 2X8HA 2DJ2A 4FYCA 4KB3A 1EGOA 4I5QA 1GUKA 2V2GA 4JR4A 4ECBA 4BVXA 4XS1A 3GN3A 3ZZXA 2L4QA 12GSA 5CP1A 1XWCA 5H5RA 4TR0A 3ERFA 4WETA 3L9SA 2P0GA 3HVXA 3KTLA 3RPPA 4NHWA 3QPMA 1B9YC 1YJ6A 3V1WA 4MP4A 4RQRA 3GSTA 5B6NA 4KNDA 2LEGA 2O89A 2I4AA 4KSOA 3RDWA 1SJ6A 2FY6A 1O85A 4HJ2A 2B5YA 3GNJA 3GL5A 3A2XA 2X8CA 3KP9A 4XRDA 1PA3A 2YZHA 2GLRA 4NHZA 1JLVA 2N5BA 1PD21 5H5SA 2LV3A 2H30A 1SK2A 1WWJA 2VCWA 1SYXA 4CW9A 4NAXA 4DEJA 2LJRA 2AB6A 1K0DA 3DEXA 5IOWA 4V1Ap 2FNOA 3ZFLA 1M0UA 2DIYA 3FRCA 4HU7A 3C8EA 5IPGA 2K18A 1X5CA 5IMDA 3F63A 4K7OA 1R26A 3KIJA 2H66A 3QAWA 2FLSA 4POLA 3F4RA 3TKPA 2C0DA 2A2SA 2CZ3A 1QXHA 1J0FA 1THXA 4L5LA 4PGTA 2FA8A 1U6TA 3IOSA 5D96A 2HYXA 1XVWA 3JCML 2OE0A 2ON5A 4PUAA 2BTOT 1SU9A 1FB6A 4V1Ag 4L5OA 3VPTA 2IWTA 2B6MA 4K7IA 2NVLA 3EE2A 5ECOB 4GTUA 4I97A 4HJMA 2VO4A 1TRUA 4IVFA 1KBNA 4IJIA 4PNGA 3ZYWA 3QOUA 4TRXA 2C8UA 1XOBA 2G2QA 3H79A 2WFCA 3CBUA 3G9BA 1GSFA 3O3TA 4DSSB 3ERGA 1XFLA 2GT5A 1T00A 1SL0B 2H1AA 1Y6EA 2AHEA 3ZMKA 4EL1A 1MDIA 3GUSA 3ED3A 4ZB9A 1ZGNA 2GTUA 5DQSA 3IRAA 1F3BA 2DIZA 2YZUA 3W8JA 4KDXA 1YY7A 1OE8A 1MEKA 1VF1A 4ISDA 1ZYEA 4KX4A 1T4YA 1SD9A 3MAKA 3WT2A 1SKRB 3I9V2 4JRRA 1XWGA 1GL8A 2X8GA 1A2JA 1JZOA 3QDNA 1MTCA 1VGLA 2QC7A 4FYUA 2B3SA 3LORA 3HA9A 1CQGA 5G2ZA 3L78A 5CRWA 5J4UA 4D73B 2PBJA 2FWHA 1Z7RA 2JZSA 1ST9A 2YV9A 3EVIA 1FHEA 2EIOA 1Z9HA 3MNGA 4JU5A 2NDOA 2C3QA 1M9AA 2C0EA 3EWLA 4IP6A 5KN0A 3M3MA 4MZWA 2H6XA 4GF0A 4MDCA 2NPBA 3L0HA 1S3DA 1ZOFA 2HZEA 3GRXA 1MDJA 2P5QA 3UVHA 3HVSA 4HOJA 2JACA 2M46A 4N10A 4RUVA 3GSSA 4F0CA 5JWQB 2WZ9A 1V58A 1GTIA 2LUSA 3ZIJA 2C3NA 1ZCPA 5LCZA 4EXJA 1U88A 3PGTA 3GHAA 4HZ4A 1WRYA 3E9JB 3FHKA 6GSXA 4BL7A 3EU3A 4KCEA 5IM9A 2V41A 3TKRA 1A2LA 4FYBA 2VL2C 4ULXA 1AW9A 1K0OA 4IGJA 4TR1B 1GSYA 1B4PA 2CT6A 3GH9A 1O8XA 3WYWA 2HZEB 2EC4A 2L6DA 3K8NA 5IPHA 3TDGA 1OAZA 5FT3A 10GSA 2HT9A 2YOIA 3I6AA 3CTFA 3E0UA 2VLTA 3UL3A 2CA8A 4AJ6A 2IMEA 2PN8A 3MSZA 1SJIA 1G0TA 4LLRA 3ZVJA 4X1UA 3PR8A 1XPVA 5A5KA 4ZILA 3FY7A 2YPMA 3HKRA 1XW9A 3D21A 1XBSA 4TW5A 4GSSA 1ZZYA 2CVDA 2VL2A 2BMXA 4JBBA 5ECRB 1O8WA 1GLQA 4H86A 4QL9A 2GZPA 3HJOA 2H74A 1T4ZA 4MF7A 3Q74A 2G0FA 3KH9A 3HYPA 3S9FA 2MBTA 4MK3A 4GCIA 4ZB6A 4JR6A 4ZL8A 3UAPA 3DXBA 5JCUA 2YWOA 3EC3A 1VRSD 4POMA 3VWWA 3DVXA 1FVKA 1YF1A 5CYYA 2X99A 5H5QA 5J9BA 4POKA 2XHFA 2O8VB 6GSYA 2VD1A 1V2AA 2JL4A 1M7TA 1TRWA 5AN1A 2DJKA 4JE1A 2M80A 4L8EA 3UIWA 2VCTA 2AJQB 4XS4B 4J57E 3VFIA 1R5AA 2LJAA 3F6DA 2XBQA 5ELAA 3A3TA 2LRTA 1EEJA 4I2TA 5GZZB 1ML6A 3TGZA 4G19A 4E8HA 3TJFA 17GSA 4IN0A 3TUEA 3A2VA 3GTUA 2PPTA 1TRSA 1GSSA 4J56E 2ZCTA 3ISOA 1GULA 1RQMA 5G5FA 2EIRA 13GSA 2GZYA 4V2LA 4OD7A 3QCPA 5F0GA 5KN2A 4WEYA 4KW6A 1VF3A 2L59A 1GWCA 2N5AA 3C7MA 5DALA 4YH2A 2MMNA 5ECSA 2H73A 2JSZA 1K0NA 1TXXA 3APSA 3F8UA 2PWJA 5B7CA 2VOCA 5F8BA 2YV7A 4XHMA 2FHEA 2A4VA 4MF5A 1GRXA 4EKZA 4EDZA 2PERA 2B5EA 1USBA 1W89A 3BJ5A 5J3RA 2C3TA 3IBHA 4EC0A 1PL1A 1R5PA 2LRNA 2GQMA 5HR0A 3GTUB 3GFKA 4MZCA 2R3XA 1O81A 3IA1A 3LJRA 4PQIA 5LD0A 1DUGA 1NSWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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