4JRRA

Crystal structure of disulfide bond oxidoreductase dsba1 from legionella pneumophila
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
188
structure length
188
Chain Sequence
GSHMQFIEGKDYQTVASAQLSTNKDKTPLITEFFSYGCPWCYKIDAPLNDWATRMGKGAHLERVPVVFKPNWDLYAKAYYTAKTLAMSDKMNPILFKAIQEDKNPLATKQSMVDFFVAHGVDREIAKSAFENSPTIDMRVNSGMSLMAHYQINAVPAFVVNNKYKTDLQMAGSEERLFEILNYLVRKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of disulfide bond oxidoreductase DsbA1 from Legionella pneumophila
rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Legionella pneumophila subsp. pneumophila
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein DsbA
total genus 65
structure length 188
sequence length 188
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4jrrA00
2F8AA 2F8FA 6GSSA 4WBRD 3K8NA 4RI6A 2LRNA 1F3AA 5DJLA 4TR4A 2VLTA 2PVQA 1EV9A 1SJZA 4V2MA 2H01A 2E2GA 2YPMA 1XBSA 5KN1A 4N0VA 1GSEA 4RQXA 3I43A 1XWKA 3CRUA 2YOIA 1NSWA 5EL8A 4KH7A 1KTEA 3TJGA 3TRXA 5GSSA 3HHVA 1AQXA 3QMXA 3VWUA 3G7IA 4KAEA 2O8VB 4F2IA 2EC4A 2LUSA 4ZL8A 3W8SA 2N5FA 1FVKA 3ZLPA 1FB0A 2RUEA 3J7Yk 2KP2A 4PQHA 1XWAA 5CNWA 1F2EA 5F06A 4WF5A 4DSRA 4XTSA 3EE2A 2C3NA 1VF1A 3P8WA 4V1Ap 2O85A 2PMTA 4ILFA 1LU4A 5IO2A 5CRWA 3TDGA 4IP1A 2JZTA 3L9UA 3W8JA 2VL2A 2LS5A 4F03A 1YF1A 2OBIA 3L9VA 5IIZA 1I9DA 1T8EB 3IBHA 3NZNA 2ES7A 1QFNA 3GV1A 3DVWA 4HQSA 4O92A 3O6TA 5IMCA 1TJDA 3HDCA 5CRHA 4GWRA 1M7TA 4K0NA 3MAKA 2QKEA 5CAXA 2GDRA 3MWHA 3ISOA 3M9KA 3C1RA 2C3QA 1U3IA 2FUG2 1BEDA 3H79A 2B5YA 2PVOC 1V2AA 3I69A 5IM9A 1TDIA 3GKKA 4EL1A 4EKZA 5B6MA 7GSSA 1CQGA 3GYKA 5ID2B 2YJ7A 1LJRA 2LJKA 4F82A 5ABRA 2C1YA 1SJ6A 2HE3A 3HVXA 3O76A 4NV5A 1ZL9A 5F07A 4KDUA 2JZSA 1OC8A 3TJKA 3GFKA 3CSJA 2IIYA 1TU8A 3EYTA 16GSA 3F4RA 5IPGA 3IAM2 4ZB8A 3GKMA 2M80A 2CZ3A 2MZCA 4TR3A 1G0TA 4JRRA 5H5QA 3G9BA 3A5WA 4NXIA 3I9V2 2HSHA 2YWMA 5EPFA 4E8EA 4MDCA 3F3QA 1M0UA 4LLRA 2DMMA 2HT9A 1O7UA 5AISA 1OKDA 1R5AA 5J41A 3KMOA 2MYGA 3D6IA 1PSQA 4KDXA 1N8JA 1RK4A 2VM2A 2GLRA 4I97A 2ZNMA 1QQ2A 1THXA 4OFMA 1QK8A 1GL8A 2WULA 5ECLB 5C00A 1NW2A 4ZB6A 2R6KA 1BJXA 1KBNA 4ECBA 5ENUA 2WGRA 4KW6A 2B5EA 4MZBA 1FW1A 2VLVA 2RIIA 4POLA 2V32A 1HYUA 2B3SA 4H86A 1TU7A 4NHZA 1QMVA 3D4MA 3HJOA 1T4YA 2DJ1A 1FO5A 13GSA 2C0EA 4MH2A 3DVXA 4IVFA 4HEA2 3CTFA 1OE7A 1OC3A 5HR3A 3LYPA 1OE8A 2K9FA 2F3MA 5LCZA 4JEDA 4KA0A 3DXBA 1M99A 2Z9SA 4YQVA 5ECSA 1XIYA 4WR5A 2XPDA 2FA4A 4IN0A 4KSOA 1PMTA 2AUVA 3FKFA 3VI7A 2NBSA 4L5OA 3A3TA 1MDJA 1SYXA 2VD1A 4GTUA 4EVMA 3DGQA 3KXOA 1FVJA 2P5RA 3W6GA 3TRPA 4F0BA 3HD5A 2X99A 2GQLA 4V2LA 5HR2A 2L5LA 2YWOA 3TRQA 1EGOA 2VM1A 2H66A 3UL3A 4GSTA 1ZCPA 5J9BA 4GLTA 4HI7A 3EWLA 3BJ5A 3VFIA 3KZQA 3LXTA 2NDOA 3H93A 2FGXA 4X0XA 1FB6A 1A2JA 4IELA 2VLUA 3M8NA 4EE0A 3ME8A 4WKWA 1WOUA 3ZFLA 3ZVJD 1GSUA 1SK2A 2DJJA 2IMKA 4XCSA 3UIWA 1E6BA 3NIVA 3FZAA 2VCWA 2QSIA 1AQVA 2HRFA 3LYKA 3RPPA 1WE0A 2B5XA 4OFNA 3HVSA 1J0FA 4GSNA 3IV4A 3LJRA 2LQQA 2BJXA 4KB3A 3EINA 5DAKA 3IRAA 1MD3A 1PX7A 3GH6A 4OCEA 3WGEA 1K3OA 3SWLA 4QL9A 3TJJA 1JZOA 4BA7A 3ZREA 1A0RP 2HZFA 1GUKA 1R26A 3DD3A 2R2JA 4DSSB 1SL0B 3BCIA 1I5GA 1TRWA 3HYPA 2L6DA 4BVYA 1BYEA 4IW9A 3C73A 1SL1B 1RQMA 2G2QA 3LG6A 3M1GA 3GTUB 5CRDA 1XOAA 4KCEA 1AW9A 4MJBA 1IYHA 1K3YA 3CBUA 1H75A 3F6DA 4BL7A 4OFTA 1XPVA 4I2UA 1AXDA 3KTLA 4HUAA 1GSFA 2VO4A 3LXZA 4KE3A 1VF3A 2B7KA 1WMJA 4N10A 2CA8A 5C04A 1OC9B 4PGTA 1M9BA 4I2TA 2HZEB 5LNKe 1B4PA 3TJFA 5ECOB 3DEXA 2K8VA 3U6VA 4PQIA 1A8LA 2GGTA 1ERWA 2EIOA 4HQZA 4D73B 4K8MA 5D9WA 3HJPA 4POMA 4TKYA 4ZXGA 3VK9A 4WETA 1GTBA 2PWJA 4PUFC 2XHFA 2LJRA 1TXXA 2O89A 3HCZA 3A2VA 3KEBA 2WZ9A 1WWJA 1JHBA 3KD0A 3ZVJA 1XZOA 2X64A 2IJYA 3AY8A 2GSQA 1F9MA 5CP1A 4LA1A 2JZRA 1V40A 3FK8A 3FY7A 1B9XC 5F05A 2JACA 2R4VA 3LQ7A 3ZMLA 1XXUA 4OO4A 2VCXA 2NVLA 3APSA 1TTZA 4G9HA 2OKAA 4ISDA 2PBJA 2J23A 4ZL7A 4WR4A 5A5KA 4OO5A 1AQWA 3HJMA 1YZXA 3J7Yb 1EOGA 4TR0A 2A2SA 4TOPA 1V98A 1EP8A 20GSA 4XS6A 5F8BA 2H6XA 2OBKA 3E3EA 3KTBA 5J4UA 2RM5A 2FWHA 2OE0A 2FA8A 2GSSA 2WJUA 1TKDB 2IL3A 4TXOB 3FRCA 5B6NA 4I5QA 3D21A 2DJ2A 2EIQA 5ECMB 3ZL5A 3ZMKA 3C1SA 1XFLA 3TB2A 1SENA 1J9BA 2DLXA 2OADA 3CSIA 5CYYA 1MEKA 2FWEA 5AN1A 3CYNA 2FWGA 1H4OA 4E8HA 1SU9A 4K2DA 5ECPB 1K0NA 1PL2A 2GZYA 1SKRB 3HA9A 2YCDA 4ULXA 6GSXA 1TW9A 2V2GA 3GIXA 1YY7A 4AJ7A 2OJLA 2I81A 1FG4A 4AGSA 5B8BA 3IPZA 4MJAA 2ALBA 3GHAA 3QCPA 3H8QA 1PA3A 4XRDA 5J3RA 2KHPA 3L78A 3WGXA 2PU9C 3DKSA 1QGVA 4TN8A 5JWQB 4TR1B 4JR4A 3QD9A 4OCFA 4PUAA 2YV7A 2JU5A 3GN3A 4MK3A 1DSBA 2HSYA 2CV4A 3GTUA 3PINA 1M9AA 2RM6A 2C8UA 2JL4A 4MPFA 1MDKA 4J56E 3UEMA 2BMXA 2R5GA 3F0IA 3F9UA 1A24A 1U6TA 3EMXA 3UAPA 3GL5A 4BWSA 2DC5A 5EY6A 4GXZA 3FZ9A 2LJAA 2P5QA 1OC9A 4EDYA 3EU3A 5DJMA 1EV4A 2HZEA 2JSZA 3IK9A 3GA4A 3SBCA 1PQNA 1S3CA 2L59A 4EXJA 4ML6A 1Y25A 2K6VA 6GSYA 4ECCA 1F3BA 3M3MA 5B8AA 2ON5A 3VWWA 1TI3A 5JWOB 1OYJA 3O3TA 1VGLA 3RHBA 2HLSA 4FYUA 4JR6A 3DWVA 5D93A 1BG5A 3UBKA 5DALB 4PNGA 2FY6A 1XVWA 5G5FA 5ECQB 5DQYA 2R37A 2PUKC 3P2AA 4WEYA 3TKSE 3A2XA 4TXVA 1Z9HA 1FHEA 2H0IA 5GZZB 1ZOFA 2FHEA 6GSVA 3EVIA 3MSZA 2H74A 4F9ZA 2DIZA 1GWCA 6GSUA 5FHIA 1YQ1A 2AAWA 3GKXA 4MJEA 1CQHA 2GS3A 3VWVA 2ZCTA 3P90A 2H30A 4K7NA 2HNLA 3VWXA 3QFBC 1X9MB 2FCHA 5AIVA 4QL7A 4KSMA 3Q74A 1SK0A 1HD2A 3A2WA 1MTCA 12GSA 1UA5A 2VCVA 3HVVA 5ECHB 1HNCA 2XC2A 2IFQB 2R3XA 3L0HA 2D2ZA 1TK0B 5IMZA 4OD7A 1T4ZA 4MZWA 4RI7A 4CHSA 4GQFA 4YQUA 1TRUA 2AHEA 1YEPA 5HFGA 1GTIA 18GSA 4HJMA 3G7YA 5INYA 2IMFA 4TXOA 2M46A 4HZ4A 5J9CA 5ELAA 1B48A 1F6MC 3CXGA 3LFLA 2E7PA 1WJKA 1XOBA 4G10A 1DE1A 1HNAA 2H76A 4JE1A 1WRYA 5B7CA 2KUCA 3TUEA 5IOXA 5ECIB 1SKSB 4IGJA 1THOA 5F0GA 1G7OA 1YKCA 2YV9A 1YF0A 4ZILA 3TJBA 4ZIJA 2P0GA 2RUFA 3EMPA 2VL3A 4L5LA 1O6JA 2YANA 2L6CA 1BQ7A 1X9SB 2CVKA 1BX9A 1U3AA 3ZITA 3TKRA 3ERFA 3KP9A 2CZ2A 3DIEA 3M0FA 3NOFA 4PNFA 2GSRA 2AJQB 2L5OA 3U5RE 4FO5A 3QOUA 2ON7A 1PGTA 3UVTA 3IR4A 3RPNA 5KN2A 4G2EA 4DVCA 4TR1A 2OE3A 1A8YA 2L4QA 3RBTA 3HKRA 1SD9A 1A23A 2VCZA 5ECNB 4EF0A 5AIXA 3S9FA 2OA7A 4GF0A 3E0UA 3KIJA 4BWQA 1PN9A 4KCAA 4NPBA 1PKZA 2MMZA 2YN1A 2L4CA 4NMUA 5IMFA 3H4KA 1OVNA 1PX6A 1M2BA 3RHCA 4MZCA 2AYTA 4IHUA 1ERTA 5H5SA 3HZ4A 1MDIA 3N5OA 4ZB9A 4MP4A 4GSSA 2YWNA 4OMVA 5ID2A 2TRXA 4ZL9A 4IQAA 2VCQA 4IKHA 1EEMA 3D22A 5KN3A 3TKPA 3LORA 3D5JA 4ZBAA 4FYCA 3PR8A 3ZIVA 5DQSA 1TK8B 4TRXA 1ML6A 2H1AA 1W89A 3QFAC 2ZUPA 3ED3A 1A2MA 5DCGA 4WF4A 2C4JA 1ZYEA 3DRNA 1XWCA 1Z3EA 5ECRB 5HQPA 1TI1A 2YZHA 2LQOA 1URMA 4KX4A 2OACA 4POBA 2B1KA 1XW9A 3UOMA 1T1VA 4MF5A 5A4VA 1GSDA 2H0GA 3IK7A 2RLIA 1GUMA 5EVOA 2X8HA 2DJ3A 4MF6A 4XS1A 2XPEA 3GMFA 2H1DA 3QAWA 1HNBA 2F51A 5A4WA 1G7EA 4HJ2A 4O7HA 1NHYA 5J5NA 1Z6NA 1O73A 4X43A 1ERVA 1QUWA 1S3AA 5ELGA 3ZFBA 1Z7RA 2VCTA 4K0GA 2BTOT 3F6FA 1GP1A 1J08A 1Z7PA 4YAPA 2DIYA 2J9HA 4GQCA 2PERA 5DVBA 4WXTA 2H75A 1PRXA 5D9VA 1G6WA 1ERUA 2CQ9A 2LTKA 3F4SA 3TKSA 3UJ1A 3KCMA 5G5EA 1AC1A 2O7KA 4Z7XA 1YKAA 5JCUA 2K18A 4I6XA 3F4TA 5AGYA 3GRXA 2JSYA 2H0HA 1GLPA 2VD0A 3KGKA 1BAYA 4K1FA 8GSSA 1HQOA 4LL4B 1Q4JA 3FYGA 1XCCA 4HU7A 3Q19A 3HXSA 2L57A 1ON4A 2P31A 3RDWA 4QQ7A 1AIUA 4MCUA 2X8GA 3CTGA 3KP8A 2MMNA 3JCML 1SL2B 1WIKA 4LL1B 3FR6A 1JZWA 4I8BA 2H6ZA 2WDUA 1ZYQB 4WBJA 1JLWA 2CAQA 4EC0A 1O8XA 2LSTA 3APOA 3FR3A 1M2AA 3APQA 3EURA 1GH2A 1T3BA 1ZZYA 2LRTA 2I9HA 1B4QA 1PL1A 3IXRA 4CDOA 1K0CA 4V1Ag 3IAS2 2CX4A 2FWFA 2FD3A 1TRSA 3WD6A 2N5BA 2OE1A 1TOFA 3R2QA 1X5EA 2LNTA 1R7HA 2HXKA 2H72A 3TKQA 2PGTA 2F9SA 3C71A 2IMEA 2CVBA 2H73A 3FHKA 3GNJA 4DEJA 4JBBA 5A4UA 3RAZA 1EEJA 3HZ8A 1EWXA 3D0ZA 4MPGA 1EZKA 4ZBBA 3GURA 4XRAA 2REMA 14GSA 2EIRA 2KP1A 5GSTA 2V6KA 4YH2A 1X5CA 10GSA 5D9TA 4Q5QA 5IPHA 1XWBA 4DSSA 4FIWA 1B9YC 1O85A 3PH9A 4PXOA 4G19A 2VAFA 5GAND 3LSZA 3QAGA 1TK5B 2TRCP 3TCOA 2WCIA 1V57A 4MABA 2QC7A 3KH9A 4L0UA 5LD0A 2CVDA 3UMAA 2MMAA 1K0OA 1GULA 22GSA 4AF2A 2CAIA 1SYRA 2GVPA 4ECIA 3GSTA 3ERGA 1OAZA 1TRVA 2PN8A 2A4VA 2V6OA 4FH8A 3CRTA 1X0RA 4Q5FA 1K0DA 3BD2A 3UARA 1Z6MA 5DAKB 1A0FA 4IJ3A 1QXHA 1ST9A 4HS1A 5IQYA 4KUNA 2K8SA 1JLVA 3VLNA 2E0QA 4XHMA 1XW5A 4ID0A 2WS2A 2YNXA 1YEXA 1V58A 3N9JA 5G1LA 1JFUA 3ZZXA 3TOTA 1DE2A 3VPTA 4NHWA 4D73A 3PGTA 2LV3A 5GAPD 1DUGA 4YQMA 1ABAA 4XS4B 5D9XA 1GLQA 2IMDA 1GSQA 3GH9A 2GT6A 4L0WA 4TVEA 4KGIA 2YZUA 4PURA 1EGRA 4N30A 2GSTA 4IBPA 9GSSA 3Q18A 2TIRA 1N2AA 5HR1A 5G31A 4BPYA 2LKUA 1ILOA 1PKWA 2H70A 2H8LA 4MH3A 1W4VA 3KMNA 5G30A 1E2YA 3C7MA 2VUPA 4O5RA 2IMIA 2C80A 1UVZA 4NAXA 2PPTA 4AJ6A 3MDKA 5HFKA 1XVQA 5IMDA 1SKWB 4X1UA 1R4WA 2WRTA 4POKA 1YJ6A 2IN3A 2FLSA 3FR9A 2V41A 4KNDA 5HFIA 2N5AA 3BBYA 1S3DA 4TW5A 1WP0A 3WGDA 3LWAA 4J2FA 1SJIA 3ZIJA 3ZYWA 1R5PA 2X8CA 4OWYA 4BVXA 4RQRA 3QAVA 1IYIA 4KDYA 2A2RA 1FOVA 1K3LA 1JZDA 5IO0A 4EUYA 4XIHA 4J57E 5FWGA 1GTUA 2VOCA 2GTUA 5H5RA 5D73A 4MMMA 2H19A 5DCHA 3IHQA 5COHA 2I3YA 3E9JB 2GZZA 1XW6A 2XBIA 3UBLA 1C72A 2AB6A 2DJ0A 2VL9A 1U88A 3KM6A 1XWGA 3IE3A 3GKNA 2GQMA 1GUHA 3FW2A 2NTOA 4PX1A 1M2DA 1U87A 1GTAA 3OR5A 3QPMA 4RUVA 3BCKA 5L71A 4PQ1A 2DMLA 1K0AA 3IOSA 1K0MA 1YDKA 2H6YA 3KJYA 1ZMAA 3QDNA 2C0FA 4Q5RA 3TOUA 1NM3A 2IPAA 1NHOA 3MNGA 5IMAA 3TKSC 5IMVA 4AJ8A 3F3RA 1RW1A 5E4WA 2YJHA 2FNOA 1Y6EA 1WPIA 1LBKA 1Z5YE 4GCIA 4CW9A 3DMLA 4ZBDA 5HR0A 5JCGA 1F37A 2KOKA 1OKTA 3WT1A 5E59A 2WFCA 2VIMA 5D96A 3ERWA 2B6MA 4IS0A 3CMIA 1T00A 4EDZA 3WYWA 1Q98A 2KLXA 3FEUA 4IP6A 3GX0A 1FAAA 1V9WA 3V1WA 3VPQA 3I6AA 2CX3A 2NPBA 1GSSA 5DDLA 3M9JA 5G2ZA 3L4NA 3LGCA 11GSA 1UN2A 2DJKA 2XBQA 2JADA 1VF4A 4NWYA 4DSQA 4JU5A 4FYBA 17GSA 2C0GA 2G0FA 2LEGA 1KNGA 3QR6A 4K9ZA 3D4TA 2DBCA 4GRFA 2MMOA 1UC7A 3F63A 3IDVA 3GL3A 5JCWA 1VF2A 1SK1A 3ZTLA 3BOAA 5KN0A 5JWRB 3UVHA 1X5DA 3EU4A 4MF7A 2GZPA 5G1KA 1KEBA 2LRCA 5DALA 4XS4A 3ZRDA 4K7OA 2QGVA 3L9SA 5CRGA 3FZ5A 4LMWA 3ME7A 1SD8A 4O32A 6GSWA 3GSSA 4NV2A 4ACSA 2HRNA 1MD4A 2MBTA 1X9WB 3LEFA 3IC4A 3DYRA 3GUSA 1GSYA 3GX8A 2IWTA 3TGZA 1GRXA 2CT6A 2M72A 4IQ1A 5ECKB 4N0ZA 4MLYA 4EO3A 1AAZA 2B1LA 4P3YB 3P7XA 2YWIA 2MBSA 5IOWA 1ACVA 4V2NA 1PD21 2GQKA 2HI7A 3IA1A 1A2LA 1AUCA 5DBQA 2WB9A 4K6XA 2GT5A 1EP7A 1VRSD 2VL2C 3CSHA 6GSTA 2HYXA 5FT3A 4HZ2A 1K0BA 2H71A 4F0CA 2IFQA 4ML1A 2I1UA 3KH7A 3VI5A 2LNSA 4ECJA 2H1BA 4Q5NA 4HDEA 3HY2A 4HOJA 1B8XA 4YAVA 3VURA 2AV4A 4MA9A 2I4AA 3C8EA 2DSAA 2HFDA 3WT2A 4IJIA 4N11A 1GNWA 2H1GA 2B7JA 4L8EA 2C3TA 4K7IA 1TP9A 1GNEA 3US3A 3H1NA 1G6YA 5CREA 2V1MA 1O8WA 1EOHA 2YP6A 1USBA 4JZQA 3FZ4A 19GSA 4HU9A 3F8UA 3EC3A 2E2MA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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