The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
62
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sequence length |
254
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structure length |
254
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Chain Sequence |
IVGGKVCPKGECPWQVLLLVNGAQLCGGTLINTIWVVSAAHCFDKIKNWRNLIAVLGEHDLSEHDGDEQSRRVAQVIIPSTYVPGTTNHDIALLRLHQPVVLTDHVVPLCLPERTFSERTLAFVRFSLVSGWGQLLDRGATALELMVLNVPRLMTQDCLQQSRKVGDSPNITEYMFCAGYSDGSKDSCKGDSGGPHATHYRGTWYLTGIVSWGQGCATVGHFGVYTRVSQYIEWLQKLMRSEPRPGVLLRAPFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
publication title |
Discovery of nonbenzamidine factor VIIa inhibitors using a biaryl acid scaffold.
pubmed doi rcsb |
molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
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source organism |
Homo sapiens
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molecule keywords |
Factor VIIa (Heavy Chain)
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total genus |
62
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structure length |
254
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sequence length |
254
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ec nomenclature |
ec
3.4.21.21: Coagulation factor VIIa. |
pdb deposition date | 2013-04-02 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
H | PF00089 | Trypsin | Trypsin |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Mainly Beta | Beta Barrel | Thrombin, subunit H | Trypsin-like serine proteases | ||
Mainly Beta | Beta Barrel | Thrombin, subunit H | Trypsin-like serine proteases |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1MKW H; 3S0N A; 3PM3 A; 2P95 A; 1GBK A; 1O0D H; 3QUM P; 3PLK A; 2JH6 D; 3E0N B; 4E06 H; 2EC9 H; 1NM6 A; 3SW2 B; 1K1M A; 4AG1 A; 1THR H; 1W11 U; 2OQ5 A; 4LK4 A; 2TGD A; 4X8V H; 1RTK A; 2QXI A; 1T7C A; 2EEK A; 1WU1 A; 3GY6 A; 3MU4 A; 4IN2 A; 4DY7 B; 4CRD A; 1SGF G; 1W0Z U; 3BIU H; 1K1J A; 4B74 A; 5I46 H; 1E0F D; 3RXA A; 4SGB E; 3RMO H; 3TH2 H; 3SI4 H; 1IQN A; 3TK9 A; 1QB6 A; 2P8O C; 5F6M A; 3PMJ A; 1O3P B; 1MTW A; 3LGI A; 3U1I B; 3BG4 B; 1HAV B; 3WY8 A; 1TBR H; 1ZPC A; 2VVU A; 2RA3 A; 4ZKS U; 2SGF E; 3LGV A; 4I8G A; 3LH1 A; 3KL6 A; 3A85 A; 1EKB B; 1EXF A; 1GI4 A; 1WAY B; 1EJN A; 1OXG A; 4Y8Y A; 1QHR B; 5C1U A; 1OWI A; 3KQB A; 1AE8 H; 4DW2 U; 3SUE A; 2OC1 A; 1MAX A; 2FTM A; 2H9H A; 3IWM A; 3SO3 A; 1RS0 A; 1SGI B; 3SU5 A; 1LHC H; 1D3Q B; 1PPB H; 3GDU A; 1O3G A; 4CHA B; 2G5V A; 3RXM A; 1UJ1 A; 3RXT A; 4Y6D A; 4XFQ A; 5GCH G; 3IIT A; 3QGN B; 1C2G A; 5GCH F; 1TNG A; 3NWU A; 2PUX B; 3ZVB A; 1XUI A; 2H6M A; 1V2N T; 1QB1 A; 1V2Q T; 2AFQ B; 3SV7 A; 1FAX A; 1MU6 B; 3BTH E; 4DVA U; 1ELT A; 1GI7 B; 4MPV A; 2HRV A; 3QK1 A; 2FI4 E; 3A8A A; 1O5G H; 1QA7 A; 1C5V A; 1T32 A; 4X1S U; 1HAO H; 2R2M B; 5F03 A; 3RXB A; 1SG8 B; 1K1N A; 2HNT C; 2RA0 A; 3RMM H; 1V3X A; 1DSU A; 3RMN H; 4WMD A; 3GY5 A; 2ZGH A; 2RDL A; 4X1R U; 4AYV B; 1QA0 A; 3S9A A; 3VXE H; 1YLC A; 3T62 A; 1AGJ A; 1QL7 A; 2ANK H; 3TJV A; 2PV9 B; 3UR6 A; 3ODD A; 1UTM A; 5HYO A; 3F9E A; 1P09 A; 1DM4 B; 3M61 U; 2D8W A; 2R0K A; 6CHA B; 3FP7 E; 2BY7 X; 3V0X A; 1GI3 A; 2H1U A; 4KTS A; 3RM2 H; 1P9U A; 4BXW A; 1P2M A; 1QRW A; 2C3S A; 1S82 A; 1JWT A; 2XBY A; 2YNB A; 4UDW H; 2VH6 A; 3QZR A; 1LVO A; 1G37 A; 1IOE A; 3LON A; 1O32 A; 1E38 B; 2A31 A; 2AMP A; 1Y3X A; 5FCK A; 4X1N U; 1PPF E; 1NPM A; 5EXL A; 1RTL A; 4AFQ A; 2R2W U; 5FX5 A; 1UO6 A; 2VJ1 A; 1BMN H; 4ABE A; 1YPL H; 1SGT A; 2FOG A; 3RXP A; 4ZHA A; 3CS7 A; 1F0R A; 1BRA A; 3A7X A; 5I25 A; 1BBR E; 1QBN A; 5DP6 A; 5LPF A; 1C5O H; 3SU4 A; 1GBL A; 2FXR A; 1NRN H; 4FU7 A; 5EGM A; 4FUB A; 3FAO A; 2ZHF H; 3TU7 H; 1TBZ H; 3NCL A; 1LMW B; 3OU0 A; 1MBM A; 4B2C A; 1CO7 E; 2VIV A; 1OS8 A; 3ZV8 A; 2OCV B; 1KDQ B; 1KTT B; 5E0H A; 3Q77 A; 4KKD A; 1WYK A; 1GJ7 B; 2GCT C; 2TGA A; 5HM2 A; 5BPE A; 1YPH E; 2BY9 X; 4GSO A; 1Y3U A; 2BY8 X; 3RXL A; 2J2U A; 1G3C A; 2XBX A; 1LPG B; 3C1K A; 4R0I A; 2BDB A; 1QJ1 B; 4ZKN U; 4X6P A; 1OP8 A; 4NFE A; 1AB9 B; 2VWM A; 3GCO A; 2BY6 X; 3UUZ A; 4INH A; 5FPS A; 3Q3K A; 2BX3 A; 1SMF E; 4XBC A; 3HK3 B; 4FUI A; 1ELG A; 2G81 E; 1F0S A; 2XTT B; 3MH4 A; 4MVN A; 3A89 A; 1PPH E; 3R0F A; 2ZHD A; 3AW0 A; 3GY8 A; 3HK6 B; 2QC2 A; 1YPK H; 3UTU H; 3FFG A; 2JH5 D; 1K1P A; 3TK5 A; 4E7N A; 4SGA E; 1UTQ A; 2FOM B; 1A0J A; 1EJA A; 3ATI A; 4Z6A H; 1B0F A; 4YT6 H; 2PKS C; 4BNR A; 1Z7K A; 1C5Z B; 2W5E A; 3MO3 A; 1ESB A; 2RCE A; 2ZPS A; 1O2T A; 1O35 A; 1SFI A; 1ZSL A; 1AND A; 4K60 A; 3EYD A; 5K0H A; 2CHA C; 3QX5 H; 2Y82 A; 4X6M A; 4JYV H; 1O2K A; 1A5I A; 9EST A; 4KTC A; 1SLV B; 2Z3D A; 2ZFT A; 3M7Q A; 4Y79 A; 3UWJ H; 3V7T A; 3ZZ6 A; 2R9P A; 2FIR H; 5F8T A; 2VWL A; 2P3U B; 1PPE E; 4DIH H; 1O36 A; 2F9N A; 2HPQ H; 4U01 A; 4YTA A; 1UTL M; 2ZZU H; 3MWI U; 1S6F A; 2EST E; 4XE4 A; 1O3I A; 1C5Q A; 4IC6 A; 4JK5 A; 1KXD A; 3B9F H; 3KQE A; 3SGA E; 3EQ0 H; 2ZDA H; 3MU5 A; 1YPJ H; 3F1S B; 2ANW A; 1GI5 A; 2ZNK H; 4Y76 A; 4JZD H; 2C90 B; 2J9N A; 1BHX F; 2SGD E; 5C1X A; 3ZVA A; 3FP6 E; 3GCT G; 4B71 A; 1O2M A; 3GCT F; 3LKW A; 4THN H; 1GHY H; 3VB4 A; 3S69 A; 4IS5 A; 3PLP A; 1J16 A; 1GCD A; 1C5P A; 1O2Q A; 4RN6 A; 1NU9 A; 2A2Q H; 4UEH H; 1RJX B; 4JMY A; 1JIM A; 3BTE E; 1LVY A; 2BLQ A; 2F9V A; 2ZG0 H; 5GWZ A; 1BTU A; 3ZZB A; 1TYN A; 2VIP A; 4FU9 A; 1NS3 A; 2A5I A; 1TRM A; 1JXP A; 2GZ8 A; 3SHC H; 1AUJ A; 1V2T T; 1UK2 A; 5E0G A; 1O2V A; 1ZTL A; 2LPR A; 1WOF A; 1FLE E; 5F8X A; 3A87 A; 1KIG H; 4ISH H; 2VIW A; 3SHA H; 1QGF A; 3STJ A; 3ZV9 A; 5DP9 A; 1YPH C; 1GDN A; 4ZAE A; 2AEI H; 3SV9 A; 3RXU A; 4AN7 A; 4ZHL U; 1O3D A; 2BVS H; 1N1L A; 2CN0 H; 1EZU C; 5JYI A; 4NFF A; 1O3M A; 1QIX B; 3NXP A; 3P70 B; 1K21 H; 1OP0 A; 3RXO A; 3DHK H; 3SV2 H; 4ZKO U; 1GL1 A; 5A0C A; 3NUM A; 1DWB H; 2QCY A; 1DIC A; 1FJS A; 3RXD A; 1H8D H; 3MU8 A; 4UFD H; 2ZFP H; 4AZ2 B; 1GDU A; 2UWL A; 2B8O H; 1MTS A; 1BCU H; 2ZHW H; 3A81 A; 2GV6 A; 1F7Z A; 1RRK A; 3LPR A; 4ABB A; 3TJN A; 2YNA A; 4YOI A; 3SU2 A; 2FMJ A; 2ZU5 A; 1PPZ A; 3F9F A; 2V6N A; 4E7R G; 1GDQ A; 2J95 A; 1BRC E; 1V2M T; 1QUR H; 5AFY H; 1GG6 B; 1NRP H; 2OD3 B; 1Q31 A; 1DOJ A; 1C2H A; 1C5U A; 1O3F A; 1FIW A; 1C5L H; 4ABH A; 2NU4 E; 3K6Z A; 1G2M A; 1GPZ A; 2Y5F A; 2WYG A; 1TBQ H; 2CV3 A; 4RKJ B; 2O8W A; 2A5K A; 1J17 T; 4J1Y A; 3FAN A; 1MBQ A; 3E91 A; 3VGC C; 3S7K B; 2OP9 A; 5BRR E; 1TAB E; 3PB1 E; 5AF9 H; 1C5Y B; 2FI3 E; 2H5C A; 3Q3Y A; 1G32 B; 1SGD E; 1MQ5 A; 1TNL A; 1YKT A; 5L2Z H; 1WCZ A; 1ABI H; 4I8H A; 4DJZ B; 2UUY A; 1ZR0 A; 8KME 2; 1O2L A; 1XUJ A; 3GY7 A; 1KY9 A; 3SQE E; 2G5N A; 1OKX A; 2TPI Z; 2ZFQ H; 3IG6 B; 3QDZ B; 1XX9 A; 5L6N H; 1DFP A; 1GI0 A; 1AVX A; 1KDQ A; 4MNY A; 1S85 A; 4VGC C; 2ZP0 H; 1LHD H; 3RXJ A; 2WPK S; 1OYQ A; 2VGC C; 4O3U A; 1L1N A; 9LPR A; 4NZQ A; 3PRO A; 1LDT T; 5HGG A; 3SU3 A; 4GHT A; 4BTI B; 2O8U A; 3SNC A; 1HDT H; 3Q00 A; 4TWW A; 1HIA A; 2BVR H; 3LOX A; 5L30 H; 4FXG H; 5EXN A; 2JH0 D; 2FEQ H; 3A8B A; 3I78 A; 5T3H A; 1MAY A; 1C4Y 2; 2BQ7 B; 3RXR A; 1ZGI A; 4ZUH A; 1ELF A; 5A8Y A; 1QY6 A; 4LXB H; 1D3D B; 3C27 B; 3ZZD A; 4LZ1 H; 4MDS A; 1MH0 A; 3ATW A; 1S0R A; 1QBO A; 1GMC G; 3VPK A; 1GMC F; 4Q7Z A; 1PQ5 A; 1GHA G; 1LHF H; 1SPJ A; 2PW8 H; 3P8G A; 2BYA X; 1GHA F; 1HV7 A; 3QO6 A; 1YC0 A; 2GDD A; 5DP4 A; 3SGB E; 1AFE H; 1J14 A; 1FXY A; 1SVP A; 1HXE H; 4B75 A; 1MQ6 A; 2WYJ A; 4H6T A; 2AYW A; 2GZ7 A; 4JYT A; 5FCR A; 3ZVD A; 2BD2 A; 1CT4 E; 1AQ7 A; 1YCP K; 2HOB A; 4D9R A; 1CA0 C; 2UUK B; 2HGT H; 3GY4 A; 3BEI B; 2AH4 X; 2I6Q A; 3BIV H; 4IC5 A; 4A1X A; 2FOH A; 1YPE H; 5DKM A; 1L4Z A; 2BX4 A; 2CMY A; 1IQG A; 1C1V H; 3T27 A; 1QTF A; 2PWX A; 1FN8 A; 1SQT A; 2BD5 A; 1GBA A; 3MU0 A; 2GMT B; 3FP8 E; 2NU0 E; 1H9I E; 4ISI H; 1ABJ H; 2AMQ A; 1MD8 A; 2Y6T A; 3ATK A; 1LQD B; 5EG4 A; 4CRA A; 3RXE A; 1O2U A; 2AER H; 3LU9 B; 4Y7A A; 1UHB B; 2FOF A; 4TY6 A; 4DUR A; 1MUE B; 1Q2W A; 2A1D B; 1V2V T; 1W14 U; 2BLO A; 4WY3 A; 3MHW U; 3GDS A; 1JRS A; 1EP6 A; 4DII H; 4Y0Y E; 1A3E H; 2BDC A; 2ALV A; 5IYT A; 1TX7 A; 1FY3 A; 1O38 A; 3RC6 A; 3SQH E; 2Z3C A; 2PUQ H; 1OSS A; 1M9U A; 1V2P T; 2JET C; 5K7R A; 2VB0 A; 4MPX A; 2FP7 B; 2PKA B; 4D9Q A; 3OY6 U; 1VCP A; 4FVB A; 2A4G A; 2DUC A; 1AFQ C; 1KXE A; 1AE5 A; 1TB6 H; 2ANY A; 4O3T A; 1QQU A; 1GBH A; 3SI3 H; 2AIP A; 1EAI A; 5JDU B; 1W8B H; 3K9X B; 1DWD H; 1O3K A; 1VIT G; 5CHA B; 1VIT F; 2ZA5 A; 4QT8 C; 1BRU P; 1GBE A; 1T31 A; 4FUC A; 1EZQ A; 4B1T A; 3RXV A; 1BTZ A; 3RLY H; 1RXP A; 2FX4 A; 3SZN A; 2GVF A; 1XVM A; 4MLF B; 3DA9 B; 1F2S E; 2BB4 A; 4BXS A; 7EST E; 2AGG X; 1IQF A; 1QCP A; 2GGV B; 4U30 A; 1V2U T; 1XUF A; 3HKJ B; 4FUJ A; 1ANC A; 1QNJ A; 5SGA E; 1BMM H; 2WUB A; 1JMO H; 1UVT H; 2C8Z B; 8EST E; 4CBO A; 3TGK E; 2ZFS A; 2ZPR A; 1QL8 A; 4BAO B; 4HGC A; 1H9H E; 4PRO A; 1GJA B; 1CGH A; 1FON A; 1PQ7 A; 4K1E A; 2VVC A; 4I31 A; 5DJ7 A; 1LCY A; 5ETX A; 1ELC A; 1GGD C; 6EST A; 3U1J B; 3RC5 A; 1D9I A; 1C5M D; 4BAH B; 3CP7 A; 5JBA S; 4B2A A; 1SSX A; 2NU2 E; 2WV5 A; 2A4O A; 2GX4 A; 1AI8 H; 4U2W A; 1ZTJ A; 3ATM A; 1ANB A; 6GCH G; 6GCH F; 2BD3 A; 2BZ6 H; 1ZJK A; 1C1O A; 3F9G A; 5JB8 S; 2ZC9 H; 1FAK H; 1DWE H; 1F0T A; 1TNI A; 1C1N A; 1A1R A; 1W12 U; 1QRX A; 2HAL A; 1BTX A; 2FZZ A; 2UUJ B; 1EX3 A; 1AD8 H; 1Z8R A; 1ZYO A; 4OS1 A; 1AVG H; 4KGA A; 1DAN H; 3RML H; 4AOR A; 5G4B A; 1BDA A; 2FPZ A; 3SNA A; 2STB E; 1PFX C; 3BTT E; 1C2F A; 2VWN A; 1IHS H; 4OS2 A; 2A45 B; 4O03 A; 2OC7 A; 1ELD E; 5DP8 A; 5J4S A; 4WH6 A; 3JZ2 B; 3Q3X A; 3ZZ3 A; 1KTS B; 3TVJ B; 2AS9 A; 1GJD B; 1PQA A; 2KAI B; 3PWC A; 1QL9 A; 1KLT A; 4A6L A; 2ZDL A; 3LC3 A; 1MTN C; 3A82 A; 5JPM H; 5A0B A; 2SGA A; 5DP7 A; 3S9C A; 2XCF A; 4Y71 A; 3UQV A; 4ASH A; 1L1J A; 2QXG A; 4FUE A; 1ZMJ A; 4CRE A; 2ZFR H; 3ZYD A; 2XYA A; 2BXU H; 2Y7X A; 1AKS A; 1O33 A; 3A86 A; 2O8L A; 2QY0 B; 1UTK A; 1IQI A; 2ZDV H; 3DFJ A; 5L2Y H; 2VWO A; 2XXL A; 5LH8 A; 2P3T B; 1O5D H; 3SU6 A; 1TMU H; 3B23 B; 5LPE A; 7KME H; 1QJ7 B; 4JK6 A; 1Y5A T; 2XWB I; 5DP3 A; 1NFY A; 2WUC A; 3LJJ A; 2A4Q A; 1AWF H; 1BB0 B; 1LHE H; 3RC4 A; 2QAA A; 1UVO A; 2XW9 A; 5DK1 A; 1S5S A; 1ZSJ A; 2ZDN A; 3ZZC A; 1V6D A; 4NIX A; 1TGB A; 5PTP A; 1O2Z A; 2QIQ A; 1YLD A; 1WTG H; 1EOJ A; 1DT2 A; 1ID5 H; 4WF8 A; 5T6F A; 1YPG H; 2PTN A; 1JOU B; 4FUD A; 1VR1 H; 1FNI A; 1UCY K; 2FM2 A; 3QLP H; 1GJ5 H; 2XBV A; 3BTD E; 3ITI A; 2GKV E; 4Q80 A; 3VEQ B; 1NZQ H; 4NCY A; 1ZGV A; 1T8O A; 2WPI S; 2FOE A; 3HGN A; 3U8R H; 3PLB A; 4X8S H; 2F3C E; 1FPH H; 1SGP E; 1TGT A; 1E35 B; 4WXI A; 3SUD A; 1AZ8 A; 1WQS A; 3F9H A; 1F5K U; 3RUO A; 4X8U H; 1TNK A; 4YT7 H; 4YOJ A; 1AO5 A; 2IJO B; 1C4U 2; 1O2P A; 2XC4 A; 5C67 A; 6CHA C; 3RU4 T; 1ETT H; 2DE8 A; 1P03 A; 3MNX A; 4ABF A; 1V2L T; 5A8X A; 3UY9 A; 4ABI A; 3BEU A; 3D65 E; 3ZYE A; 2Z6B D; 1GJ4 H; 1QFK H; 1IQM A; 4ZKR U; 3LDX H; 3MFJ A; 5DO4 H; 1V2R T; 1BTP A; 1FY4 A; 1F92 A; 2OLG A; 2WPL S; 2QV1 A; 1K2I 1; 5EPY A; 1TAL A; 1BQY A; 5CMX H; 1ZHM A; 1OOK B; 1ZSK A; 3ZZ5 A; 1WSS H; 1ZRK A; 4IBL H; 5LGO A; 3GYM A; 1BTY A; 2GV7 A; 4A7I B; 1WUN H; 4EST E; 1BJV A; 1S0Q A; 2ZDK A; 4ZMA H; 4GAW A; 1DVA H; 2F9O A; 1UHB A; 2BVX H; 2Y80 A; 3GIS B; 2ZHQ H; 3UQO A; 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