4K6XA

Crystal structure of disulfide oxidoreductase from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
199
structure length
199
Chain Sequence
PGDAVRVTSSKLVTQPGTSNPKAVVSFYEDFLCPACGIFERGFGPTVSKLVDIGAVAADYTMVAILDSASNQHYSSRAAAAAYCVADESIEAFRRFHAALFSKDIQPAELGKDFPDNARLIELAREAGVVGKVPDCINSGKYIEKVDGLAAAVNVHATPTVRVNGTEYEWSTPAALVAKIKEIVGDVPGIDSAAATATS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Rv2969c, essential for optimal growth in Mycobacterium tuberculosis, is a DsbA-like enzyme that interacts with VKOR-derived peptides and has atypical features of DsbA-like disulfide oxidases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Disulfide oxidoreductase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 64
structure length 199
sequence length 199
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-04-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13462 Thioredoxin_4 Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4k6xA00
4ML1A 5JWOB 2CQ9A 3RHCA 5CO3A 2LV3A 5IOXA 1XWKA 1QK8A 2B5XA 3IA1A 4GRFA 5CP1A 2HSHA 4X1UA 1BG5A 2YP6A 2C80A 4WR4A 3A5WA 3H93A 4K8MA 1Y25A 1U87A 4ZB6A 1YF1A 4POLA 2VM1A 3VLNA 2I9HA 2TRCP 3F6DA 4ECIA 2FD3A 4N10A 1Z9HA 11GSA 3IR4A 4JE1A 4EE0A 4ILFA 3F3QA 1FW1A 3GX8A 1Z3EA 3QAGA 2REMA 4I2TA 2PVOC 1PA3A 4ZB8A 4K7OA 3CSJA 1X9SB 3RPNA 5IPHA 5DVBA 1V2AA 3KXOA 2R3XA 3GURA 2LRTA 4PURA 17GSA 1S3AA 5DAKA 4XIHA 3CSHA 1YZXA 4HU7A 4KDUA 1TW9A 1XXUA 4ZBAA 1ABAA 4JEDA 5JCGA 3GSTA 2DJ3A 1VGLA 4NHZA 3F9UA 1MDJA 1SK1A 2X8HA 2AV4A 1MD3A 5H5SA 2LJAA 1RW1A 3QOUA 4GXZA 1I9DA 5D8IA 2K8SA 4Q5QA 1PX7A 5C00A 5GAPD 3DXBA 1LBKA 3WD6A 1DSBA 4IS0A 1F9MA 4GLTA 1GSDA 3FK8A 1ERWA 4TOPA 3O76A 3GMFA 1ERVA 2R4VA 3DGQA 4K7IA 5F05A 5EY6A 2WCIA 2LSTA 3EU3A 1R7HA 1Z7RA 2TIRA 2BJXA 4TW5A 3DWVA 2M72A 1GSFA 5F07A 6GSYA 2GSSA 3JCML 2MMNA 5F06A 5J41A 1XW9A 1F6MC 5B6NA 5HFKA 1N8JA 1M9AA 2XBIA 4O5RA 4I5QA 2A2RA 3TUEA 3ISOA 5FT3A 3GHAA 1T7PB 2XHFA 3ZZXA 2X99A 3QAVA 4YAVA 2O85A 4OFNA 2DJ2A 4AJ6A 2LTKA 1OKDA 1PSQA 1SL1B 5KN1A 1GTAA 1AAZA 20GSA 2VCQA 1VF2A 3EURA 5CAXA 1FOVA 3E0UA 2LS5A 1U88A 1CQHA 4FYUA 2GGTA 3R2QA 3J7Yb 4IN0A 3FW2A 1GUHA 1GP1A 4BPYA 3KTLA 3HCZA 1K0MA 1GRXA 1B9YC 3LWAA 3FY7A 4CW9A 5DCHA 3WGEA 4EXJA 1M99A 2IL3A 4F0CA 2DJ1A 4LLRA 2CAIA 1ZGNA 1E6BA 1H4OA 1XZOA 3F4TA 4FIWA 1PX6A 2HZEB 5A4VA 2RUFA 1TOFA 4ML6A 1EGRA 1SL2B 2X8GA 4PGTA 4V1Ap 2R5GA 2WJUA 4EDYA 3GSSA 4NAXA 1JZDA 3LEFA 4RQXA 1X9WB 5CREA 3F8UA 2OJLA 2L57A 3ZTLA 1XOAA 2H6ZA 4KCEA 1FVKA 5AIXA 2HI7A 3LFLA 3I6AA 1UN2A 3M3MA 3MSZA 1XVQA 1B8XA 1HD2A 1AC1A 3M0FA 2I4AA 3MNGA 3GKXA 5CYYA 3UAPA 3FYGA 3E3EA 5DAKB 4AF2A 5B8AA 3I9V2 2YANA 4J56E 3IOSA 3F3RA 1J9BA 2C3QA 1TJDA 6GSXA 3C1RA 2FHEA 1EP7A 3CMIA 1RQMA 3BOAA 2H74A 1KTEA 3MWHA 1C72A 3TCOA 3HY2A 4V2LA 3FZ5A 5AISA 2G2QA 3ZIVA 1QGVA 3TKSE 4WF4A 2QSIA 1A23A 2IPAA 2C3TA 2FUG2 2JZTA 1JFUA 4BWSA 1ACVA 3WT2A 2HRNA 3GX0A 2GT5A 4G9HA 4H86A 3TOUA 2L4QA 4MMMA 2K18A 4IHUA 1EOGA 3GA4A 1V98A 5AGYA 3C73A 4N30A 3HKRA 4Q5NA 2YN1A 5F8BA 4I8BA 1GSUA 1XWBA 1O85A 5GSSA 4XS4A 2HT9A 4ZBBA 5J4UA 2P0GA 5IO0A 3VWXA 2PN8A 1Z7PA 1WIKA 4CHSA 2F3MA 1T4YA 1GSQA 1TK5B 2HRFA 2RM5A 4KE3A 5ECRB 1ILOA 12GSA 1PKZA 1SKWB 1DBYA 2VO4A 2IMIA 2ON7A 3VWVA 4ZILA 2IMFA 2VLTA 1OC8A 1OC3A 2FGXA 3H4KA 4EL1A 2JACA 4E8EA 1VF4A 2C0DA 1TI3A 1NM3A 1R4WA 1LJRA 1EWXA 4KSOA 4N0VA 2AJQB 1SJIA 3Q74A 5B8BA 5D9VA 2CX3A 4J57E 3HDCA 4OD7A 2H0IA 3PH9A 2AYTA 3RAZA 2B5EA 3BD2A 3Q18A 1IYIA 4ID0A 3IDVA 1HNBA 5KN3A 2JZSA 2KP2A 3IAS2 1G6YA 4EDZA 5LCZA 3TKPA 1ZYEA 2WRTA 5FWGA 2H19A 1TTZA 2GQLA 4IQ1A 4MABA 3ME8A 2IMDA 1BAYA 4LL4B 3F0IA 1BQ7A 1JLVA 2HLSA 4MH3A 5G1LA 3DVWA 1SYXA 2VL2A 1PRXA 5ID2B 4IP1A 4NMUA 1V57A 4D73B 4QL7A 1B48A 3M9KA 5LD0A 2ZNMA 2MZCA 4K1FA 1YF0A 3HYPA 4MH2A 3QR6A 1GUKA 4KNDA 5IMCA 1ERTA 2FWGA 4KX4A 3HVSA 2E0QA 1JZRA 4XCSA 4FYCA 3BJ5A 3KD0A 5IMFA 3GKMA 2N5FA 2ES7A 2LRCA 5GAND 2O8VB 1VRSD 5GZZB 4I97A 1XFLA 3OR5A 1N2AA 4YH2A 6GSUA 1MTCA 3GNJA 5KN2A 1GSYA 4OFTA 2XC2A 4RQRA 2YWMA 5CRWA 4MCUA 3TJKA 1M9BA 1TXXA 3EINA 2HNLA 3D21A 3FR3A 5CRHA 1TP9A 1WWJA 3KZQA 3UBKA 4NHWA 3ZITA 1FB0A 3LXTA 4MJCA 3G7JA 3G7YA 5G2ZA 5INYA 2HFDA 2HXKA 5AN1A 5IMZA 2DIZA 4EUYA 1VF3A 4HS1A 1URMA 2H70A 5G30A 1JLWA 2R37A 2EIOA 5ECQB 2V41A 1FG4A 2H75A 2WS2A 1OC9B 1ST9A 1A2MA 2E2GA 3FZ9A 2C1YA 3L4NA 2EIQA 1V9WA 1ON4A 2LRNA 2PBJA 4MF6A 3IRAA 1DE2A 2L6CA 3NIVA 4I6XA 3TJGA 4DSSB 1SJ6A 1GNEA 5CNWA 3SBCA 2GZYA 3NOFA 3ZMLA 1A2LA 5J5NA 4P3YB 2L5LA 1W4VA 3IXRA 3S9FA 3FRCA 2PMTA 2GT6A 4OFMA 3W8SA 6GSTA 4QQ7A 3AY8A 3KH9A 1M2DA 3DRNA 10GSA 1QMVA 2H0HA 4LL1B 3F4RA 5D93A 2WZ9A 1XW6A 1WOUA 2VL2C 3UMAA 3SWLA 2N5AA 2IIYA 3LGCA 4HJ2A 4ZL7A 2YJ7A 4POMA 3FZ4A 1TRSA 2LEGA 3W6GA 1ZZYA 1GLPA 2X8CA 1K3YA 2NDOA 2H76A 3HA9A 3KGKA 4NV5A 1A0RP 3H8QA 4HQZA 4Z7XA 2AB6A 4MJBA 1SKRB 3VURA 5ECKB 1Q4JA 2VCWA 2VM2A 3FR9A 3GYKA 3CXGA 1A8YA 2JSZA 1BJXA 2GZZA 3ZVJD 3TJBA 3GTUB 2PPTA 1EEMA 5G5EA 2OE0A 4RUVA 1Z6MA 4ZL8A 1XPVA 2H0GA 2M80A 2PU9C 1GL8A 3TDGA 3ZLPA 4TR4A 4JRRA 1YKAA 2OKAA 1XVWA 3LSZA 5J9BA 1F2EA 5DCGA 5DALA 1WP0A 4TVEA 3W8JA 1O7UA 3VI5A 2FNOA 1AIUA 4WETA 4AGSA 2PGTA 3DIEA 2CV4A 3GIXA 3VPQA 2DBCA 1PL2A 2V2GA 1R26A 1QUWA 2WGRA 4ECJA 4MF7A 3D22A 1MDKA 3IK7A 4PQ1A 2ZCTA 2OADA 5EVOA 4XS1A 1NSWA 1OKTA 3FKFA 2IFQB 2XBQA 4ZBDA 3A2XA 3HJPA 2O89A 3GH6A 4TR1B 5ECMB 4PX1A 1F37A 4HJMA 5HFIA 1WMJA 4KW6A 1GTBA 2IMKA 1PD21 3A3TA 4TXOA 2MBSA 5HR0A 3IK9A 2GQKA 2M46A 2MBTA 1H75A 5ELGA 4OMVA 2H1GA 4BA7A 1K0DA 2DLXA 4J2FA 3FZAA 5CRGA 4ECBA 3US3A 4GCIA 3KEBA 4XS6A 4KA0A 1EV9A 2AUVA 1YY7A 4LA1A 3CRTA 1GULA 5IQYA 1G6WA 1GTIA 1J0FA 2IWTA 5IIZA 2KLXA 4GSSA 5IPGA 2G0FA 2OE3A 1GLQA 3VI7A 1DE1A 2GVPA 1T00A 4IJIA 3GL3A 4O32A 4ULXA 2LJKA 3KIJA 3CBUA 3WYWA 1K3LA 1X5EA 4KUNA 2YWNA 1SKSB 1A24A 1V40A 1TRUA 4V1Ag 2YZUA 1YEXA 2IJYA 5D73A 4F03A 4L8EA 2XPDA 5ECPB 5AIVA 5J9CA 1USBA 3GH9A 1TRVA 2CA8A 5B6MA 3G7IA 4JZQA 2MYGA 1MDIA 2VD0A 1X0RA 2CVDA 2L59A 2EIRA 4DVCA 4MA9A 1FAAA 3HXSA 3UIWA 4PNGA 1FO5A 1YDKA 2WB9A 1HYUA 3E9JB 2YWOA 2YOIA 3TKSA 3D4TA 3FEUA 3HZ8A 3GRXA 1T4ZA 4QL9A 2B1LA 4KCAA 1XBSA 5JCWA 1X9MB 1ERUA 3F6FA 4G2EA 3DVXA 4KH7A 3A2WA 4MDCA 1K0NA 5IMVA 2V1MA 4KDXA 3LQ7A 1J08A 5HR1A 3TB2A 2C4JA 1XWGA 19GSA 2B6MA 2H1BA 3IAM2 3KM6A 2ON5A 3RBTA 5J3RA 3O3TA 2O7KA 5FHIA 4AJ7A 2AHEA 3ZVJA 2GDRA 1NHYA 4WXTA 2YV9A 2CVKA 2H6XA 4WBRD 3GL5A 4WKWA 4PQIA 4F0BA 3HZ4A 3LYKA 4L5LA 2QGVA 2VL3A 3EE2A 4K0GA 3TKRA 2K9FA 4MPGA 5DQYA 2VCTA 5JWRB 1KEBA 3BCIA 3CTGA 4GQFA 3ZREA 3N9JA 5HQPA 3HVXA 4MZWA 1YEPA 1AQWA 2NBSA 3DYRA 3EC3A 2H1DA 3ERGA 1QQ2A 2FLSA 3ERWA 3UOMA 5A4UA 4WEYA 4TXOB 3TRXA 2HE3A 5D96A 2C0FA 2GSRA 2NPBA 5EL8A 4IW9A 4DEJA 1Z5YE 3HJOA 1TK8B 4PUFC 5DJMA 2KHPA 1TU8A 1RK4A 3IHQA 5B7CA 5EPFA 4EO3A 4ECCA 2KP1A 1UVZA 3HJMA 1B4PA 4EF0A 2WFCA 2GTUA 4KSMA 3EWLA 2YV7A 2WDUA 1SL0B 3PR8A 1B9XC 5DDLA 2J23A 2MMAA 4L0UA 1X5DA 4HZ4A 4EKZA 2XPEA 2JADA 1ZMAA 2FWEA 1T3BA 2X64A 3QAWA 4WR5A 1R5AA 4XRAA 5H5QA 1O73A 3FHKA 1XWAA 3APOA 3TKSC 2O87A 3KP9A 1G7EA 2NTOA 1U6TA 2CAQA 4K9ZA 3WGXA 3M8NA 4OCEA 4E8HA 4OCFA 3ERFA 3QD9A 1T1VA 3L9UA 4K0NA 4ZIJA 1M2BA 2FCHA 2JU5A 1FHEA 2YWIA 3HD5A 3UARA 2P5QA 3RPPA 3IV4A 3M9JA 3PINA 1SK0A 1AXDA 5D9XA 3LXZA 2FA4A 1THOA 4MJEA 5D9WA 4N0ZA 2GSTA 1QFNA 4F9ZA 5GSTA 5ABRA 4IJ3A 2BMXA 4HZ2A 4V2MA 3H79A 1DUGA 2I81A 2H73A 3L9VA 1T8EB 4L5OA 1GWCA 3VWUA 1ZOFA 4POKA 1Z6NA 4Q5RA 2VL9A 2LUSA 4OWYA 2N5BA 2JZRA 2H30A 1BX9A 2VCVA 4ZB9A 2C0GA 4JR6A 4IVFA 8GSSA 4MF5A 1WPIA 5DBQA 4BVXA 4XS4B 3TOTA 3QFBC 4CDOA 1S3DA 2LNTA 5COHA 3VPTA 3C7MA 3KCMA 4IGJA 2H66A 1EP8A 2C0EA 2L4CA 2IN3A 3V1WA 3DEXA 3IE3A 2VOCA 4HI7A 2AAWA 4PNFA 3ZIJA 3RHBA 2HZEA 2DC5A 1Q98A 1K0AA 3UL3A 22GSA 2H71A 2EC4A 1K0CA 4JBBA 1NHOA 1KBNA 3C1SA 2V32A 3NZNA 3U5RE 3TGZA 2OACA 4BWQA 3ZFBA 2VIMA 1SK2A 4HDEA 3QDNA 13GSA 3P90A 5A5KA 2RM6A 1HNAA 2DJJA 1TDIA 2R2JA 3QMXA 1MD4A 2LQOA 4PQHA 1EGOA 1G0TA 3ZRDA 2F8AA 2K6VA 1WRYA 2E2MA 1QXHA 2VAFA 1AQXA 5F0GA 1SENA 1TRWA 1XOBA 2LJRA 1EZKA 5C04A 4JR4A 1TK0B 1THXA 3CYNA 18GSA 1V58A 5JCUA 2YJHA 2RUEA 4MP4A 1AQVA 1U3IA 3VK9A 5ECHB 3F63A 1SU9A 3LYPA 2RIIA 3I43A 2CX4A 5ELAA 4AJ8A 3L9SA 2H01A 4WBJA 3O6TA 2PUKC 4NPBA 4YQVA 1M0UA 1ZYQB 4PXOA 1WE0A 4G10A 7GSSA 2GQMA 3GKNA 5G5FA 4MZBA 4OO4A 1GTUA 3MDKA 1E2YA 4KAEA 2B5YA 2DMMA 4GQCA 3UJ1A 2DMLA 1GNWA 4O7HA 3IC4A 4POBA 5ECNB 3UVTA 1K0OA 5IOWA 16GSA 3TKQA 1O8XA 4HUAA 3Q6OA 3J7Yk 1PGTA 5KN0A 2A4VA 3U6VA 2QKEA 3CRUA 1SJZA 3TJJA 5ECIB 3EMPA 2OBIA 3QFAC 2L6DA 4LMVA 4G19A 4EC0A 3PGTA 5E59A 1YKCA 3ZFLA 5LNKe 3VWWA 3DKSA 3P8WA 2K8VA 1O6JA 2VLVA 2V6OA 5HR2A 1R5PA 1CQGA 2QC7A 1LU4A 1GUMA 1FB6A 1PMTA 5HR3A 3EMXA 3ZL5A 3KJYA 1M7TA 4KDYA 1TKDB 1OYJA 2B1KA 4HQSA 3L0HA 1TU7A 4ISDA 2YPMA 3LG6A 4FO5A 4Q5FA 2TRXA 4TR3A 3GKKA 3D5JA 3F4SA 2JL4A 4WF5A 1EOHA 1OE8A 1S3CA 2LNSA 2C3NA 3P7XA 2DSAA 4ZL9A 1M2AA 4YQUA 4MPFA 4GF0A 4L0WA 3M1GA 2DIYA 2P5RA 5IM9A 4IP6A 3KMOA 3LORA 1XWCA 3DD3A 2B7JA 2CZ3A 2PVQA 5KEJA 1UA5A 1FVJA 2FY6A 3ZYWA 2L5OA 2Z9SA 3KH7A 3I69A 1TI1A 4DSRA 2B3SA 2HYXA 2CZ2A 4IQAA 1KNGA 5D9TA 2YCDA 3GUSA 3L78A 4RI7A 4I2UA 6GSSA 4GSNA 5ECOB 4DSQA 1GSEA 3A2VA 5ID2A 2H1AA 4D73A 2GS3A 4K7NA 2OBKA 3LJRA 2H72A 1JHBA 4MLYA 2CT6A 3DMLA 2GZPA 3UBLA 4NV2A 2VCZA 5H5RA 3P2AA 2GLRA 4MK3A 4HEA2 3EYTA 3APSA 2MMZA 3D0ZA 5CRDA 2VD1A 1K3OA 1NW2A 1F3AA 5L71A 3H1NA 4KB3A 5ECLB 2RLIA 3TRQA 2LKUA 4IELA 4XHMA 1HNCA 2R6KA 1O8WA 1YQ1A 3D6IA 1EV4A 4OO5A 4FYBA 4TXVA 5DALB 4F82A 4BVYA 5IMDA 2V6KA 1I5GA 2DJKA 2E7PA 5G1KA 1OE7A 1GSSA 1U3AA 3TRPA 4GTUA 1O81A 1JZOA 5IO2A 2B7KA 5E4WA 3RDWA 5JWQB 2GSQA 4TR0A 4BL7A 4N11A 4XTSA 4XRDA 2YNXA 1WJKA 2YZHA 1PL1A 1UC7A 3HHVA 1A0FA 1EEJA 2D2ZA 3UEMA 2FWHA 1YJ6A 4V2NA 1OC9A 2C8UA 1SYRA 1OAZA 1B4QA 1A8LA 3N5OA 1GH2A 3GV1A 2VUPA 1ZCPA 1G7OA 2KUCA 3BCKA 4F2IA 3C8EA 4MZCA 3K8NA 5DJLA 2PWJA 5IMAA 3D4MA 1OVNA 3G9BA 4DSSA 3MAKA 5DQSA 3ZMKA 3HVVA 9GSSA 1XW5A 3EVIA 2IMEA 4ACSA 4MJAA 3TJFA 2LQQA 1IYHA 1A2JA 4IBPA 2HZFA 3KMNA 1JZWA 4IKHA 3WGDA 4FH8A 3IPZA 1XIYA 1HQOA 2F51A 4TKYA 2I3YA 3CTFA 1PQNA 4KGIA 2KOKA 1XCCA 6GSVA 1X5CA 14GSA 1Y6EA 5HFGA 2VLUA 3KP8A 1F3BA 2J9HA 4PUAA 4HU9A 2BTOT 2ALBA 3GTUA 3QPMA 2F9SA 2CVBA 2PERA 1SD9A 1W89A 4TRXA 2DJ0A 1PKWA 4LMWA 1AW9A 4GWRA 2I1UA 1BEDA 3KTBA 4JU5A 2WULA 2MMOA 2ZUPA 2HSYA 3Q19A 4O92A 5ENUA 3FR6A 5G31A 1ML6A 4NWYA 2A2SA 2P31A 3APQA 4K6XA 2F8FA 2NVLA 6GSWA 4YAPA 2JSYA 2OA7A 4RI6A 1ZL9A 4HOJA 4ZXGA 1AUCA 2OE1A 4YQMA 2H8LA 2IFQA 4X0XA 4K2DA 3QCPA 4X43A 4TR1A 4GSTA 2H6YA 5ECSA 3ED3A 1VF1A 4EVMA 1SD8A 3WT1A 2VCXA 3BBYA 3ME7A 3GFKA 3CSIA 4NXIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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