4K6XA

Crystal structure of disulfide oxidoreductase from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
199
structure length
199
Chain Sequence
PGDAVRVTSSKLVTQPGTSNPKAVVSFYEDFLCPACGIFERGFGPTVSKLVDIGAVAADYTMVAILDSASNQHYSSRAAAAAYCVADESIEAFRRFHAALFSKDIQPAELGKDFPDNARLIELAREAGVVGKVPDCINSGKYIEKVDGLAAAVNVHATPTVRVNGTEYEWSTPAALVAKIKEIVGDVPGIDSAAATATS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Rv2969c, essential for optimal growth in Mycobacterium tuberculosis, is a DsbA-like enzyme that interacts with VKOR-derived peptides and has atypical features of DsbA-like disulfide oxidases.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule keywords Disulfide oxidoreductase
total genus 64
structure length 199
sequence length 199
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-04-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13462 Thioredoxin_4 Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4k6xA00
4YH2A 4K7IA 1SJ6A 3LFLA 16GSA 3LXTA 1N2AA 1PA3A 2DC5A 4KE3A 3U6VA 1BYEA 2VCWA 4HQZA 2H72A 1E2YA 2VUPA 2B5XA 2GSQA 2H01A 3VWXA 1TXXA 2LUSA 2CAIA 3GA4A 2B3SA 1YEPA 2MMOA 11GSA 3ME8A 2O8VB 4NWYA 1QK8A 3H8QA 5B8BA 3ZFBA 5IMCA 1OC3A 2QGVA 3TOUA 3RHBA 5L71A 1SKSB 3KIJA 2X8CA 3N5OA 2JADA 4PUAA 4NMUA 1H4OA 1GSYA 2REMA 2VD1A 3O76A 2JSYA 2FWHA 4TR0A 1T00A 3ZYWA 4L5LA 1SL2B 3KGKA 1OC8A 4POMA 1WOUA 1SK2A 4PNGA 1J0FA 3KH7A 3MWHA 4KB3A 2VL3A 3FZ9A 3WGEA 5EY6A 3IK7A 5J41A 2L5OA 1T4ZA 1FB0A 1ZYQB 1F6MC 2BMXA 3VK9A 1WMJA 1K0MA 3IE3A 3IBHA 6GSWA 3BCIA 2OBKA 3KTLA 4O5RA 3M1GA 2LSTA 3L4NA 5ELAA 1LU4A 1XVWA 6GSVA 2BTOT 4MJEA 5IMDA 2H1DA 3F4RA 3DYRA 4KA0A 2O87A 1EOHA 2MZCA 4PURA 2IIYA 3I43A 2R2JA 4LLRA 3IHQA 1XWBA 4J57E 4OCFA 3VWWA 2A4VA 2HE3A 4MH2A 2DJJA 2DJ0A 4GRFA 1T7PB 1Y6EA 4JBBA 5H5QA 2HRFA 4GQCA 3DVWA 3EU3A 2R4VA 3GKXA 4I97A 3D22A 1TDIA 1W4VA 4X0XA 3UOMA 1KBNA 1WIKA 2IWTA 4NPBA 2RLIA 3EURA 4XRAA 3DXBA 2C8UA 2C4JA 4DVCA 1UC7A 5CNWA 2H0HA 3L0HA 1SKWB 4TR1A 3C7MA 3KMOA 4IN0A 1A0FA 5F8BA 2FY6A 4TXVA 2P5QA 3M9KA 1VF4A 2HSHA 3KEBA 4ZL7A 5F07A 2RUFA 3DVXA 5G30A 4FH8A 4MPGA 2DBCA 7GSSA 5G1LA 4MDCA 5A4VA 2AYTA 1M2DA 3W6GA 1N8JA 1Q98A 4KSMA 2E2GA 1QFNA 3QD9A 2B7JA 4I5QA 5G31A 1YDKA 2RM5A 2VL9A 4GWRA 2EIQA 3PH9A 4MJCA 2O7KA 5DCHA 12GSA 1PSQA 3QAWA 5CP1A 2G0FA 4L0UA 1V9WA 3EU4A 3KXOA 1XWKA 4EO3A 2P31A 3G7YA 5ELGA 1XFLA 1DUGA 3D6IA 5DDLA 1GLQA 2DJ1A 2MBTA 4PNFA 4POKA 5ABRA 3CXGA 4IP1A 3HXSA 5D9WA 1KNGA 2GQMA 2C0EA 3RAZA 4G19A 2LKUA 2YV9A 4K8MA 4KW6A 1LJRA 5DJLA 4QL7A 4K7NA 3F63A 4IJIA 2K9FA 4AF2A 3FR3A 1IYHA 4AGSA 2GZYA 2WZ9A 1TK0B 3D0ZA 1HNAA 2PPTA 2OE0A 5COHA 3TB2A 2LNTA 3BJ5A 4DSSA 2B1KA 5INYA 2OJLA 4NXIA 1O85A 2R6KA 4BWQA 2PVQA 1T1VA 2GQKA 3HVVA 4G2EA 2F8FA 3GH6A 4PQIA 3D4TA 2C0FA 2OE1A 1ILOA 4TR1B 3V1WA 5HFIA 5F05A 2WULA 5HQPA 4E8HA 1GTUA 2H71A 4OMVA 4RQRA 2FGXA 4XS4B 4MABA 5G5FA 4V1Ag 2YWNA 3EMPA 3ZVJD 3M8NA 2PU9C 1FAAA 2PMTA 1X9MB 2GLRA 2QSIA 5KN0A 1XWCA 2HFDA 3CSHA 4ML1A 3FZ4A 3TKSA 3OR5A 1JZDA 2WGRA 3F8UA 4OO4A 5HFKA 1QGVA 1SKRB 2H6ZA 4P3YB 1M99A 4Z7XA 1U3AA 4ECBA 3APOA 3CSIA 3MSZA 3APSA 1MTCA 3ZREA 1AC1A 4WEYA 3GX0A 4I2TA 5ECOB 4Q5FA 2LJAA 2B6MA 1ERWA 5FHIA 3TGZA 3AY8A 5LNKe 1BX9A 13GSA 3QMXA 4BPYA 1MDKA 2YV7A 3FRCA 4BVXA 1G6YA 14GSA 1NHYA 5E59A 4K6XA 3UL3A 4XIHA 1YF1A 1XVQA 3EYTA 1JLVA 1BG5A 2R3XA 10GSA 3TJFA 3KMNA 1TU7A 4V2LA 1GULA 1SK1A 20GSA 1QUWA 2E0QA 2X8HA 3DIEA 1AXDA 3IA1A 1SL1B 2DJKA 1JHBA 3IPZA 4DSSB 3CMIA 1SYRA 3QDNA 4WETA 1FB6A 3IAS2 1S3AA 4D73A 3ZZXA 4MJBA 1THOA 2YWIA 3C1SA 3RBTA 3L78A 3F6FA 3ME7A 1XW6A 4POBA 2FA4A 2GDRA 2H1AA 2DIYA 3C71A 5H5RA 3MDKA 4MLYA 1XPVA 2KHPA 1K0NA 4IW9A 4RI7A 3UEMA 2MMAA 2NDOA 2YZHA 3FW2A 3ERGA 3HA9A 2I81A 1J9BA 1KTEA 1U3IA 4HJMA 4IP6A 3DWVA 3BCKA 5D9TA 1X5DA 2FHEA 4YAVA 1V40A 3EE2A 4ULXA 3PR8A 1JZRA 2IJYA 1EP7A 2CVDA 3ERWA 2IPAA 2XPDA 3EINA 5D9VA 4E8EA 5IPHA 4I2UA 2B5YA 1EEJA 3KD0A 3UVTA 2IN3A 3JCML 4IS0A 1X9WB 5J9BA 3KZQA 2H1BA 4ZBDA 1JZOA 5ECRB 3L9UA 6GSYA 5DQYA 4F2IA 4ECCA 3CRUA 2WCIA 4XHMA 1XZOA 1UN2A 4OCEA 2IMFA 3GRXA 2YWOA 1TKDB 5GAND 5J4UA 2X8GA 1GUHA 5ECIB 3VLNA 4MZWA 4EDZA 2VCQA 3Q74A 2GS3A 3UAPA 2GTUA 4PX1A 2WDUA 3WD6A 1VGLA 4N10A 5IMFA 1BEDA 2FCHA 3EMXA 1EV4A 3UMAA 5KN2A 4JU5A 3LJRA 2LRNA 4D73B 1GP1A 3J7Yk 3ISOA 5FT3A 3BOAA 2L59A 1GSDA 4KH7A 4ZBAA 1V58A 4BL7A 3ZRDA 3HYPA 3GL5A 1R26A 3GMFA 4PQ1A 1O73A 1SL0B 3LEFA 2VO4A 2VLTA 2CX4A 5JCUA 4WF4A 3WGDA 3VURA 1VF3A 1X5EA 4EE0A 2GT5A 4DEJA 4GSNA 1JZWA 4X43A 4ISDA 1DE2A 5EPFA 1T4YA 2I9HA 4XCSA 4J2FA 1ZOFA 2B1LA 5HR2A 4HS1A 3FR9A 2JZRA 2XPEA 3GHAA 4HUAA 5CRHA 2HNLA 1E6BA 2HZEA 5CRDA 3GSSA 1FHEA 1OKDA 1EGOA 4ECIA 4HU9A 2CAQA 1M2AA 2OADA 4KGIA 3FK8A 3GNJA 3LSZA 1GSSA 5JCGA 1PX7A 3O3TA 3HVXA 3GKMA 3P90A 2L4QA 3A2WA 3ZFLA 1SJIA 3H1NA 1GTBA 1DSBA 3QR6A 2HZFA 2JACA 3E9JB 2VL2A 3CYNA 5J5NA 5GAPD 4BVYA 4H86A 4GSTA 4KDYA 5JCWA 4K7OA 4FO5A 5AISA 1KEBA 4XS6A 1S3CA 5FWGA 2H30A 2V41A 4L8EA 2K18A 2O85A 1B48A 3C1RA 1T8EB 2F51A 1YEXA 1BQ7A 5A5KA 1FG4A 1XCCA 3VWUA 3ZIVA 1O8WA 1PRXA 2DSAA 2FUG2 17GSA 1R5PA 5HFGA 3QOUA 4AJ6A 4XRDA 1A2JA 1Z3EA 2XC2A 1ERVA 3A3TA 2BJXA 4QQ7A 3TOTA 4TKYA 1B9XC 3LQ7A 1YJ6A 2Z9SA 2ON5A 5IQYA 2LQOA 3QFBC 2XHFA 3FY7A 4FIWA 4OWYA 1EGRA 4IJ3A 2DJ3A 1I9DA 4Q5NA 3L9SA 2K6VA 2VAFA 2HZEB 1XOBA 5JWRB 4TXOA 4GSSA 3KM6A 2PUKC 2CX3A 4OFNA 4YAPA 2PN8A 4KNDA 4F03A 2R5GA 3QAGA 2YP6A 2VLUA 2XBIA 1NM3A 2WRTA 2H19A 2VD0A 4HZ2A 4ACSA 1ZYEA 2FA8A 2J23A 3F9UA 1AAZA 1YF0A 2C3TA 4IHUA 2FWFA 5IOXA 1MDJA 4MF6A 1QQ2A 1TTZA 5B6NA 3PGTA 1GRXA 2PVOC 2ZNMA 3TUEA 1S3DA 4N0ZA 3WYWA 1B4PA 2GSTA 3GIXA 2DJ2A 1XWAA 3J7Yb 3GYKA 5DQSA 2ON7A 2I4AA 1HNBA 2IMDA 3TJKA 1U87A 2YN1A 1GUMA 2FD3A 3ZIJA 3LG6A 5H5SA 3HZ8A 1A0RP 3CRTA 1TK8B 1GSEA 5G2ZA 4CHSA 2C1YA 1ERTA 1TW9A 4MPFA 4NV2A 3TJGA 4FYBA 3LYPA 4EL1A 1HNCA 3NOFA 2JL4A 2H76A 3WGXA 1ML6A 3MAKA 1GLPA 2K8SA 4LMWA 3I69A 3IAM2 4TRXA 3P7XA 1I5GA 1WE0A 1X0RA 5C04A 1EP8A 2D2ZA 2DIZA 2IMKA 3UIWA 5ECSA 2H66A 3DGQA 3RPPA 1CQHA 1F2EA 1Z6NA 2QC7A 3U5RE 4KUNA 3GV1A 1Y25A 3SBCA 5KEJA 1J08A 4RI6A 2FWGA 2HLSA 5IO2A 5B6MA 4XS1A 4MP4A 1U88A 3GX8A 3I9V2 1AUCA 1HD2A 3PINA 3TRQA 1VF2A 3P2AA 5LD0A 5EL8A 4XTSA 4FYUA 3TKPA 1PQNA 4HJ2A 1V57A 2WS2A 1XW9A 1SENA 2WB9A 4V2MA 5DALA 5KN3A 5CRWA 3VPTA 2F9SA 5E4WA 4K1FA 4TVEA 2LEGA 3ZTLA 1DBYA 1K0BA 3FEUA 4PXOA 1TP9A 4N30A 3P8WA 1K0OA 5F06A 4GLTA 2LJRA 3LORA 2V1MA 5B7CA 4ZL9A 3APQA 1F37A 5ID2A 1M9AA 1EOGA 2B7KA 5CAXA 1BAYA 3UJ1A 1O8XA 3Q18A 2H70A 3ZITA 2L6DA 4WF5A 1OC9A 2GZZA 5AN1A 3TRXA 2GSSA 2LV3A 1K3OA 1M2BA 2LQQA 4L5OA 2NPBA 4TN8A 2AUVA 2YOIA 4EC0A 1QMVA 2KP2A 4HU7A 2FNOA 4V1Ap 2G2QA 2H6YA 3M3MA 3S9FA 3TDGA 3DEXA 5CYYA 1A8LA 4NAXA 3A2XA 3FZAA 1O6JA 3D21A 1JFUA 2EIRA 4MMMA 2KP1A 4ECJA 4JZQA 3FKFA 5DCGA 4MF5A 1MD4A 3EWLA 3KCMA 5ECPB 3ZMLA 2GT6A 3US3A 1OVNA 2N5FA 1PL1A 4TR3A 2V6KA 4ZBBA 4L0WA 2LRTA 5GZZB 3K8NA 2YANA 1YQ1A 5DALB 5DVBA 4O32A 2OACA 3C8EA 3QFAC 3HD5A 1V2AA 2IFQA 2X99A 22GSA 1B9YC 5DJMA 2VCTA 4LA1A 1WJKA 4MH3A 4IVFA 4AJ8A 4RQXA 1XBSA 3DD3A 2GQLA 1TRSA 1CQGA 2VOCA 3R2QA 1U6TA 3D5JA 5ID2B 5IPGA 2CVBA 1TU8A 1OAZA 3WT1A 1RQMA 1SD8A 2L57A 4WR5A 4JR6A 1LBKA 4F82A 1G6WA 4Q5RA 1OC9B 5D8IA 4YQVA 3CTGA 3BBYA 3IV4A 4GQFA 1OYJA 3GFKA 3VFIA 2DLXA 2RUEA 2GZPA 4OFMA 1TI3A 3UARA 1NHOA 4KX4A 4MCUA 5IMZA 1AQVA 3EC3A 4NHZA 4LMVA 4CW9A 2CVKA 2AHEA 2OBIA 3DKSA 5HR0A 3TJBA 1O7UA 2MYGA 3QAVA 1PN9A 1NSWA 1GUKA 1ZL9A 2VIMA 4ZB6A 5G1KA 2TIRA 1K0CA 1UA5A 1H75A 3M9JA 4RUVA 3KJYA 1F3BA 5IM9A 2JSZA 2OE3A 3VI7A 1MEKA 5ECQB 4MZCA 4Q5QA 3EVIA 2HXKA 2H75A 2WJUA 2RM6A 4PQHA 2LS5A 2VCXA 2M80A 3MNGA 1G7EA 2YJ7A 4HQSA 4MZBA 1Z5YE 2HSYA 5EVOA 4LL4B 2YZUA 6GSUA 4EF0A 2C0DA 2EIOA 2H0GA 3BD2A 3IDVA 3ZLPA 1GH2A 3C73A 3Q19A 3E3EA 4KAEA 2IFQB 2GGTA 3GN3A 4OFTA 2L6CA 2YWMA 3TJJA 3KP9A 1G7OA 2N5AA 1TOFA 1XW5A 1M0UA 4KCAA 3W8JA 5D96A 1MD3A 1K0AA 5HR1A 1A2MA 3TCOA 5JWOB 2ZCTA 3GH9A 2XBQA 2N5BA 4ZB9A 2YNXA 2LJKA 1THXA 1GSQA 1T3BA 3HCZA 3UVHA 1Z6MA 3TRPA 4ZB8A 5IO0A 1M9BA 4ILFA 3F4SA 2H74A 4HEA2 4GCIA 4ZILA 2YCDA 4OO5A 3TKSE 4EVMA 2C3QA 2A2RA 2NVLA 2B5EA 1SD9A 2M72A 4K2DA 3IRAA 3KH9A 2V2GA 2K8VA 2F3MA 5GSTA 5ECKB 1PL2A 1ZZYA 2MMNA 2H6XA 3VI5A 3TKSC 2E2MA 4F0CA 2C0GA 3A2VA 3WT2A 2YPMA 4ZL8A 5IMAA 2H8LA 1EV9A 6GSTA 1TJDA 2TRXA 3Q6OA 5JWQB 5B8AA 1A8YA 5F0GA 2LTKA 4QL9A 1OE7A 8GSSA 1A24A 2CZ2A 1XOAA 2FWEA 2P0GA 2P5RA 1HYUA 2KOKA 2C80A 4PUFC 2V32A 4GTUA 3W8SA 1R4WA 5ECHB 2GVPA 3L9VA 3VWVA 2H1GA 1X9SB 3ZL5A 2VM1A 3LGCA 1PD21 5C00A 1WWJA 1B4QA 3VPQA 4GF0A 1AW9A 5AIVA 3UBKA 4O7HA 1QXHA 4MJAA 5IOWA 3NZNA 1GNWA 3E0UA 2PGTA 1WP0A 3HZ4A 4XS4A 2WFCA 3RDWA 4N11A 4EKZA 4WBJA 1F3AA 1TRUA 2JU5A 4KSOA 3F3QA 4TOPA 1RK4A 2DMMA 4F0BA 1OKTA 1VRSD 2HRNA 3ERFA 2CV4A 2MMZA 2VM2A 2VLVA 4NHWA 5DAKA 1W89A 1GL8A 2PWJA 1ON4A 4TW5A 1DE1A 1VF1A 1ST9A 3KP8A 2O89A 4BA7A 2IMIA 5CREA 3RHCA 6GSXA 3IXRA 2KLXA 1ZMAA 3CBUA 1FVKA 4KCEA 4HZ4A 1Z9HA 2HYXA 2CT6A 1IYIA 1OE8A 3DRNA 3GTUA 4IGJA 1R7HA 2E7PA 3QPMA 3HDCA 3LYKA 3H93A 4N0VA 1GWCA 2JZSA 2ZUPA 1BJXA 1PMTA 4PGTA 4G9HA 1USBA 4K0NA 3GKNA 4KDXA 1A23A 5ENUA 3H4KA 2ES7A 4CDOA 3GL3A 2EC4A 2H73A 5ECNB 5G5EA 3ED3A 1GNEA 3FR6A 1ABAA 3DMLA 4JRRA 4TXOB 4IELA 2AJQB 1PKWA 2AAWA 2V6OA 3HHVA 1PKZA 3N9JA 3HJMA 3A5WA 4IBPA 4HDEA 1PX6A 3HJOA 3HY2A 3FYGA 4WR4A 1AIUA 4DSRA 4ID0A 4EDYA 19GSA 4O92A 2I1UA 4AJ7A 5DBQA 3NIVA 1AQWA 3FZ5A 2LRCA 4FYCA 1Q4JA 1ERUA 1TK5B 1K3LA 5DAKB 4V2NA 1M7TA 5GSSA 1Z7RA 2NTOA 3TKRA 1GTIA 2HT9A 2IMEA 1WRYA 2I3YA 4OD7A 1YZXA 3G7IA 2CQ9A 2HI7A 4G10A 1TI1A 1FW1A 3HKRA 3G9BA 3H79A 2L5LA 5D9XA 1Z7PA 4ZIJA 1JLWA 1EWXA 4HI7A 1ZCPA 1A2LA 3GTUB 1G0TA 2DMLA 2PERA 5IIZA 2F8AA 1ZGNA 1PGTA 1YKCA 4MF7A 3CSJA 5ECMB 1GTAA 2MBSA 4I6XA 1AQXA 1RW1A 1TRWA 1FO5A 4TR4A 2PBJA 3KTBA 3D4MA 3ZVJA 1GSFA 4BWSA 3F4TA 3ZMKA 4MK3A 3GKKA 3IOSA 3LXZA 4K0GA 4ZXGA 3F6DA 3M0FA 3F3RA 4DSQA 3IK9A 4JEDA 1TRVA 2OA7A 3G7JA 4F9ZA 1SK0A 4IKHA 1SJZA 5LCZA 1GSUA 1WPIA 4K9ZA 3GURA 5HR3A 5IMVA 2H0IA 3UBLA 4X1UA 1EEMA 1MDIA 2ALBA 1NW2A 3SWLA 2VL2C 4HOJA 3CTFA 3HJPA 2CZ3A 5KN1A 2M46A 2YJHA 4YQMA 5CRGA 5AGYA 3RPNA 1FOVA 4JE1A 5D73A 2L4CA 1X5CA 2QKEA 2CA8A 1XWGA 2GSRA 1K0DA 5D93A 5ECLB 3LWAA 1XXUA 2FLSA 2TRCP 4MA9A 5J3RA 5A4UA 4WXTA 3I6AA 1YY7A 4EUYA 5A4WA 1SYXA 3GSTA 1C72A 3O6TA 4POLA 2KUCA 3QCPA 2VCZA 4IQ1A 2OKAA 1URMA 9GSSA 2RIIA 4GXZA 3GUSA 4ML6A 6GSSA 2C3NA 4JR4A 5CO3A 1K3YA 5AIXA 18GSA 1ACVA 1B8XA 2NBSA 1EZKA 4IQAA 4NV5A 1FVJA 2VCVA 4EXJA 4J56E 3FHKA 2AV4A 1O81A 4LL1B 2X64A 1HQOA 2R37A 3HVSA 1F9MA 3TKQA 4I8BA 2J9HA 4KDUA 2LNSA 1SU9A 4YQUA 1XIYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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