4KW6 | Genus

Total Genus 52

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	52
sequence length	172
structure length	172
Chain Sequence	HMSKAFIGKPAPDFATKAVFDGDFVDVKLSDYKGKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDRFPEFKNLNVAVLACSTDSVFSHLAWINTPRKHGGLGDMKIPVLADTNHQIAKDYGVLKDDEGIAYRGLFIIDPKGILRQITINDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCP

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Peroxiredoxin-1 from the Human Hookworm Ancylostoma ceylanicum Forms a Stable Oxidized Decamer and Is Covalently Inhibited by Conoidin A. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Peroxiredoxin-1
molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Ancylostoma ceylanicum
total genus	52
structure length	172
sequence length	172
chains with identical sequence	B, C, D, E
ec nomenclature	ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date	2013-05-23

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00578	AhpC-TSA	AhpC/TSA family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4kw6A00

1A24A 4MLYA 2LNSA 4YQVA 2VLVA 5HFGA 5CAXA 2AB6A 3FR3A 4NV2A 1FOVA 2CVBA 2YJHA 5F0GA 5G31A 2P5QA 3J7Yb 4IHUA 3G7IA 4NAXA 5ECPB 2YWIA 3PINA 3I69A 1OKTA 2L5OA 2FWFA 3APSA 5HR1A 4AGSA 3GFKA 3ZITA 2X8HA 4ZL7A 1SK1A 1LBKA 4HJ2A 4G9HA 3TRQA 3EU3A 2PPTA 4OFNA 3UAPA 1QGVA 5DBQA 2LV3A 4DEJA 3CYNA 2FHEA 2GSSA 3QMXA 5DJMA 3C1SA 1TU8A 5D9XA 5KN1A 1SKRB 4V1Ag 4RI6A 1ERWA 3UOMA 2L5LA 1S3AA 5EVOA 1GTBA 5D96A 4HU7A 3FK8A 4N10A 2QC7A 3WGDA 4POMA 2H70A 4WKWA 4O32A 1XPVA 3IV4A 2R3XA 2C80A 4YAPA 2B1KA 4WXTA 5DQYA 4I6XA 2H1AA 3P2AA 3EWLA 4DVCA 1EWXA 2GSTA 1X9SB 2JZTA 2IMFA 5ECIB 3LJRA 3A5WA 2WGRA 1OE8A 4K7NA 2K18A 4GXZA 4MP4A 1DUGA 3TOUA 3CTFA 4MH2A 5B8BA 1ILOA 4PNFA 3D21A 3IK7A 2O7KA 3F3QA 1VF3A 1ST9A 2XBQA 1ZL9A 2LQOA 3F4SA 2AJQB 4ML6A 2YOIA 4MPFA 5G2ZA 1F6MC 1AC1A 5A4UA 4NMUA 3NOFA 3LEFA 3KMOA 4OO5A 1VRSD 2CX4A 1JLWA 2LUSA 3EU4A 5ELAA 2PWJA 4HQSA 3VURA 2OBKA 3F4RA 2H01A 2I3YA 2P5RA 1AXDA 3C71A 5HQPA 4E8HA 5B6MA 1MDJA 2KOKA 4IW9A 1GUKA 4AJ8A 2OKAA 4JE1A 3J7Yk 3FZAA 1ZCPA 3KCMA 1TU7A 3GSSA 2B6MA 1QK8A 3WYWA 1AAZA 4KGIA 1GP1A 4MK3A 1Z5YE 5DQSA 3QD9A 2JSYA 3WGEA 4KB3A 1GNEA 4F2IA 5FT3A 2CVKA 5KN2A 2DIYA 2FWEA 2RIIA 2C4JA 4V2LA 1SJIA 1FB6A 2OBIA 1X0RA 4WEYA 1PN9A 3PGTA 3D6IA 3S9FA 3CSIA 5IMFA 3GL5A 1JZOA 2YANA 3ERWA 4CW9A 1FO5A 1WP0A 2AHEA 4WETA 1K3OA 2XBIA 4ID0A 1G0TA 4MDCA 1U3AA 5COHA 1ZYEA 4Q5NA 2PVQA 3QPMA 4XIHA 5J5NA 3RPPA 2OADA 2WRTA 4WF5A 4ML1A 2DIZA 1G7EA 4ISDA 1M99A 1URMA 3GV1A 3N9JA 16GSA 1Q98A 4GWRA 1VF4A 1XWGA 4O5RA 5IOXA 2N5AA 2NBSA 5GZZB 1GSSA 3LQ7A 1F2EA 1R7HA 3V1WA 3M8NA 3HZ8A 1HNAA 1QXHA 3L9VA 1GSQA 1XOBA 1MDIA 2NPBA 2IMEA 1DBYA 1ZMAA 1NHYA 2VM1A 3IHQA 4MF6A 4K9ZA 1J0FA 3L4NA 3TOTA 2H76A 3EVIA 5F05A 1PMTA 2LSTA 4ECCA 2MBTA 3GX8A 2C8UA 1TTZA 3HYPA 2CVDA 2CZ2A 1X9MB 4K0NA 1W4VA 2LRCA 1NM3A 4K7IA 1XW9A 1YJ6A 2D2ZA 5B7CA 1JFUA 1SYXA 2J9HA 1ON4A 2B5EA 1PX7A 3CSHA 1TK5B 2MYGA 3UVHA 4G19A 1WWJA 4BPYA 2CT6A 4MZBA 1K0BA 3BCKA 1K0AA 4YH2A 3MNGA 2LJAA 2L6DA 1XCCA 2H8LA 2VD1A 4ZIJA 4KUNA 5J41A 1Z7PA 3US3A 4OO4A 1TI1A 2WB9A 4KCAA 2LKUA 4TR4A 5IMDA 1TDIA 1WE0A 1EZKA 2NTOA 2GSRA 1V57A 1RQMA 4EDZA 2CX3A 2ZUPA 4KSOA 2PGTA 1XW6A 2H6YA 2IIYA 5HR3A 4ZBAA 1A2LA 6GSSA 4I97A 1K0OA 3O6TA 2OA7A 2E2MA 2DJ2A 4RQRA 5ECQB 2CA8A 5KEJA 3HVSA 3IK9A 5F06A 1V40A 2CZ3A 4PUFC 2ZNMA 4HZ2A 3DD3A 2J23A 2FA8A 2VM2A 2N5FA 4RUVA 4TR1A 2LNTA 2F51A 2HT9A 5E4WA 5CRWA 2RUFA 3RBTA 3C73A 3KH7A 2FNOA 1ABAA 18GSA 1GNWA 4OD7A 2R6KA 2C1YA 1R4WA 2FD3A 4EC0A 3TGZA 1AQWA 1GULA 3FZ9A 2DMLA 2H30A 3P90A 3BD2A 4HI7A 2QKEA 5DAKB 4KDXA 4WBJA 3U6VA 1XFLA 3VWUA 17GSA 3UVTA 4NHWA 3Q6OA 4D73B 3KTLA 3A2VA 3LG6A 2PBJA 1V2AA 3GSTA 3LFLA 4ECIA 4LL1B 3IA1A 4FIWA 4EL1A 3QDNA 4J56E 2FUG2 2GZPA 5ECMB 1N2AA 5GAND 2HNLA 2P0GA 3DVWA 2O89A 1BJXA 3TCOA 1YKCA 4TR3A 2K8SA 1F3BA 3QAWA 3TKQA 3KEBA 2V32A 3F8UA 1SKSB 1O73A 1SD9A 1GSUA 4GF0A 1Y6EA 3ERFA 1OE7A 2PVOC 2VL9A 1QUWA 4GSNA 1MD4A 2HYXA 3O76A 4F9ZA 3DEXA 4KDYA 4TR0A 1TRUA 3RDWA 3WT1A 5DAKA 3UIWA 2HE3A 7GSSA 5IMCA 2I81A 3RHCA 3DKSA 1GSFA 4HU9A 2K9FA 3HJMA 3Q74A 1PA3A 2B1LA 3RHBA 1ZYQB 3LYKA 1UN2A 4WR4A 3SWLA 2O87A 4KX4A 1TK0B 3ISOA 4FO5A 4PQHA 5HR2A 1V58A 4GQFA 2PERA 3L9UA 4HJMA 3L0HA 1M0UA 4IJ3A 2YCDA 3ZLPA 4HQZA 5ECLB 3QCPA 4PURA 1ZGNA 2EIQA 3UBLA 3BBYA 3GTUB 1A8LA 1UA5A 2C3NA 5D73A 4X1UA 1KTEA 1WOUA 2H71A 3FYGA 2MMZA 3HVVA 5E59A 3VK9A 5IPGA 2M46A 1B4QA 5AIXA 6GSVA 1QFNA 4GQCA 2P31A 3GNJA 4MH3A 2BMXA 1HD2A 3FRCA 4HZ4A 1FW1A 4PXOA 2VLTA 4MMMA 2F3MA 1G7OA 3ZMKA 5A5KA 1GSDA 5AISA 2VCTA 2VCXA 2GDRA 2EC4A 4KH7A 5A4VA 5IO0A 1HNCA 2F9SA 4GSTA 4K1FA 5IMAA 2X64A 4NWYA 4PX1A 3F4TA 4IGJA 4NV5A 2H1DA 1Z3EA 4XRDA 2AUVA 4F82A 4MA9A 3ED3A 4KCEA 4BWQA 3F6FA 2ES7A 1GH2A 3CBUA 1THOA 4ZB6A 3GTUA 3W6GA 1JZDA 2MBSA 4TRXA 1T1VA 6GSXA 4K6XA 4EUYA 1JHBA 4WR5A 1FHEA 2ALBA 3IAS2 1A0FA 3MDKA 3F63A 5HFKA 2LS5A 4L0UA 4XHMA 4Q5RA 3N5OA 2LQQA 1OKDA 1UC7A 4F03A 1V9WA 3TRXA 9GSSA 4EO3A 2F8AA 1SD8A 2OACA 1B9YC 1PQNA 3HHVA 3GL3A 1T4YA 2KP1A 3GKMA 1U3IA 2VCZA 2V6KA 2HZFA 3H79A 1MTCA 5AGYA 1F37A 2V2GA 3CTGA 4EE0A 5HR0A 4TVEA 4DSSB 2YV7A 3A2XA 1CQGA 4PQIA 4KE3A 5G1LA 2EIRA 2RLIA 3CMIA 2GLRA 1E2YA 5CNWA 2ZCTA 1EP8A 1QMVA 4QL7A 2RUEA 2LEGA 1PKZA 2YZHA 1A8YA 4Q5QA 2VOCA 1LU4A 6GSUA 3QFAC 2G2QA 1U6TA 4OFTA 5IOWA 4POKA 2JZSA 1Y25A 2MZCA 3G7YA 3TKSE 1A2MA 5H5QA 1EOGA 1YKAA 2A2SA 3IBHA 4KW6A 4NXIA 5IM9A 4KA0A 2A2RA 1Z6NA 1Z9HA 2VCQA 3BCIA 1VF1A 3BOAA 3D4TA 5F07A 2VL2C 1KNGA 5D9TA 1EOHA 3DVXA 4BWSA 1PL1A 5CRHA 1O81A 3NZNA 1K3YA 6GSWA 2FCHA 4I5QA 2O85A 19GSA 1BX9A 4MCUA 2REMA 1AW9A 1USBA 4K2DA 1O85A 1WIKA 2L6CA 4DSSA 3VI7A 5CRDA 2AYTA 5D8IA 1OC3A 3EYTA 2L4QA 5KN0A 1XW5A 2CAQA 1E6BA 2LTKA 1XWKA 5EPFA 4EKZA 3FZ5A 3TJJA 4AJ7A 3M0FA 4V2NA 1TKDB 1DSBA 2A4VA 5ECSA 2H1GA 4I8BA 2C0FA 1PKWA 2FWGA 4NPBA 3K8NA 3M3MA 2JACA 2H73A 1EP7A 2MMNA 1CQHA 3FKFA 3GIXA 3EMXA 1MDKA 4WBRD 4HS1A 2IMDA 3WD6A 2GQLA 4IBPA 3CRUA 3W8SA 5IPHA 2KUCA 5D9WA 1MD3A 4WF4A 3M1GA 4TKYA 4TR1B 2VLUA 3L9SA 3GURA 3VPTA 1J9BA 2X99A 2O8VB 1SK2A 1Q4JA 3VWWA 3Q19A 3APQA 2F8FA 1KBNA 2VUPA 4HEA2 5HFIA 2K8VA 2H0GA 2H0HA 1TOFA 1ML6A 5IMZA 4N0ZA 3QOUA 3ZVJA 3ZMLA 2I1UA 4MF5A 2RM6A 5ECRB 4AF2A 1ERUA 2DJ1A 1C72A 4HOJA 1YEXA 2XPEA 3TKSA 3P7XA 3TKRA 3TRPA 1PD21 1B4PA 4POBA 2JZRA 3UBKA 3KTBA 4MJBA 2M72A 4EVMA 3CXGA 4IJIA 3D0ZA 4KNDA 2YWMA 2LRNA 1T3BA 3F0IA 22GSA 3TB2A 4JZQA 1ZOFA 3ME8A 4J57E 1YF0A 3U5RE 4ZL9A 3G7JA 4XS1A 4PQ1A 1YQ1A 1VF2A 3KJYA 1PX6A 2FY6A 3DIEA 3WGXA 1XOAA 4GTUA 4QQ7A 2XPDA 5CREA 1ERVA 3MWHA 3IAM2 2E2GA 2WZ9A 1AIUA 4NHZA 1FG4A 2JL4A 2JSZA 5JCGA 3HD5A 1YEPA 2V41A 3ZIJA 2V1MA 3M9KA 4TXVA 5DCGA 3TJBA 1YZXA 1ACVA 4MABA 2I4AA 1SKWB 5FHIA 1TW9A 5ID2A 3GUSA 1YY7A 1T7PB 3D22A 4ZXGA 1VGLA 2XHFA 2WS2A 4IQAA 4ECBA 3DMLA 4FYUA 2EIOA 4IN0A 3UARA 5B8AA 1X5CA 2E7PA 3GX0A 3I9V2 4IKHA 2C0GA 3ZZXA 4F0CA 4EXJA 2PMTA 4FYBA 1HQOA 3HJOA 4LLRA 2FA4A 2FLSA 3FR6A 1THXA 4XRAA 3KP9A 4N30A 2YWOA 2CQ9A 3HY2A 2H0IA 3DXBA 4MF7A 3EC3A 3O3TA 5B6NA 2OE1A 2YWNA 1A0RP 1TRVA 4K7OA 1O7UA 2X8GA 1F9MA 2C3QA 3TJGA 5A4WA 3ZVJD 3IRAA 3H8QA 2IMKA 3LGCA 2GQKA 1TXXA 4YQUA 4YQMA 4ZL8A 5GAPD 5LD0A 5D93A 4FH8A 1GLQA 2OJLA 20GSA 1GL8A 4L5OA 1WRYA 1BQ7A 4J2FA 4LMVA 3C8EA 3IR4A 4G2EA 4Q5FA 2GZZA 2IL3A 4IP6A 3M9JA 1TP9A 5J4UA 2DC5A 3ZYWA 5GSSA 5AIVA 2H75A 3KIJA 5J9BA 4ZILA 3IXRA 2GQMA 4MPGA 4GCIA 3KXOA 4OFMA 2H6XA 2B7JA 1O8XA 1XVWA 1SL2B 3EINA 2PN8A 1YF1A 4FYCA 5J3RA 2KLXA 2MMAA 2DJJA 3LXZA 3AY8A 4KSMA 3CSJA 1T00A 1TJDA 2WULA 3E3EA 4BL7A 1LJRA 2HI7A 5G5EA 3UJ1A 4ZB8A 5GSTA 5ELGA 4PUAA 3ZL5A 1NHOA 3D4MA 2LJKA 4DSQA 3PR8A 1F3AA 2VL2A 3HCZA 1SENA 4LA1A 2KP2A 2L59A 2R37A 2H1BA 1HYUA 4JR6A 4TN8A 1H75A 3VLNA 5H5RA 1U87A 4DSRA 1M2AA 1PRXA 3IDVA 1UVZA 3MAKA 1K0NA 1A23A 4XS4A 6GSYA 2H66A 3KD0A 4LL4B 4JU5A 2BTOT 3G9BA 5L71A 3PH9A 2GT5A 3HDCA 2ON5A 3IOSA 2TRCP 3GH9A 3APOA 2R4VA 3FR9A 3GKKA 4P3YB 4O7HA 2HRFA 1K0DA 2HSHA 3DWVA 4GSSA 3QAVA 3LXTA 2PUKC 4BVYA 4F0BA 4HUAA 5CP1A 4JEDA 4X43A 5AN1A 4LMWA 3HKRA 13GSA 5ECNB 3GN3A 2YN1A 3ZRDA 4JR4A 4JBBA 6GSTA 2HSYA 2IJYA 3VWVA 3UEMA 2WJUA 1M9AA 1ZZYA 5LNKe 3H93A 1A2JA 1T8EB 3ZIVA 1X9WB 2DJKA 1KEBA 5ECKB 2GS3A 2QSIA 2JU5A 2YNXA 3KMNA 2FWHA 3IPZA 2RM5A 1OYJA 2FGXA 3VPQA 2LJRA 1TI3A 5G5FA 4MZCA 4N0VA 3SBCA 1GUMA 11GSA 2CAIA 2QGVA 5FWGA 1JZRA 2LRTA 4L5LA 1RW1A 5IO2A 1GUHA 1W89A 3NIVA 2L57A 3CRTA 5G1KA 5DDLA 2L4CA 2B7KA 5INYA 3EMPA 2KHPA 1WPIA 3ZREA 1BEDA 1XIYA 1I5GA 4MJCA 3E9JB 1EV4A 1N8JA 4OMVA 3GKNA 1SJZA 4V2MA 1O8WA 1SJ6A 2R2JA 4G10A 3ZFBA 1EGRA 1K3LA 5JCUA 1FVKA 1NW2A 2TIRA 1JLVA 3UMAA 3DRNA 2X8CA 1JZWA 5D9VA 1PSQA 2ON7A 4GRFA 4KDUA 4OCFA 2WDUA 4RQXA 2I9HA 2DJ3A 4OWYA 1AUCA 4ZBBA 2DMMA 3A2WA 4ILFA 2YPMA 2B3SA 2GZYA 5G30A 2OE0A 3A3TA 1FB0A 2IWTA 3HA9A 1FVJA 5EY6A 3MSZA 1B8XA 3FW2A 3LYPA 1HNBA 5JWQB 3WT2A 10GSA 2DBCA 1PGTA 3C7MA 4MZWA 3EURA 1IYHA 4I2TA 1YDKA 5J9CA 2NDOA 2V6OA 5ECHB 1ERTA 4XCSA 1GTAA 1GSEA 1B9XC 1R26A 2HFDA 1TRWA 5JCWA 1XWBA 3RPNA 1WJKA 1IYIA 3FEUA 2DSAA 2AAWA 2PU9C 2GGTA 2C0DA 3TJFA 4K8MA 4QL9A 3HXSA 3F6DA 5F8BA 4TOPA 2VD0A 3GH6A 8GSSA 12GSA 4ZBDA 1SYRA 3W8JA 2C0EA 4IELA 3VWXA 1AQVA 1BYEA 1OC9B 3ZTLA 1QQ2A 3KP8A 4O92A 1GRXA 1GSYA 1M2DA 1G6YA 1U88A 3TUEA 3HJPA 3GA4A 3IC4A 1NSWA 1XWAA 4ULXA 3ME7A 1GLPA 3FZ4A 1DE2A 3OR5A 2XC2A 4EF0A 3TKPA 4TW5A 5DALB 2GT6A 4XS6A 4BVXA 1OAZA 3DGQA 2E0QA 3F9UA 5H5SA 5C00A 4ACSA 4GLTA 3FHKA 4H86A 2WFCA 4BA7A 4OCEA 1Z6MA 3ZFLA 4CDOA 5ID2B 2VIMA 3Q18A 3FY7A 1SL0B 4L0WA 3GYKA 5CO3A 2MMOA 2CV4A 1OC9A 2H72A 3IE3A 1SL1B 1X5DA 2VL3A 4XTSA 1TRSA 2JADA 2NVLA 3BJ5A 5IQYA 14GSA 1J08A 1PL2A 3JCML 5ABRA 2YJ7A 3GKXA 1M2BA 3GMFA 3KGKA 3I43A 4CHSA 2HZEB 3LSZA 1DE1A 1S3CA 2IPAA 4L8EA 5DALA 4MJEA 3DYRA 2GSQA 2R5GA 2IN3A 4EDYA 1MEKA 4RI7A 3D5JA 3P8WA 3VI5A 5CYYA 3QFBC 5JWRB 1GTIA 4N11A 4AJ6A 5EL8A 1FAAA 3GRXA 1X5EA 2GTUA 1XZOA 4HDEA 1M7TA 2WCIA 1SU9A 2B5YA 1I9DA 4TXOB 3QAGA 1EGOA 3I6AA 3E0UA 2BJXA 2N5BA 3C1RA 5DJLA 3VFIA 4K0GA 2HLSA 1XBSA 2K6VA 4PGTA 5LCZA 1BG5A 4JRRA 2H19A 2H6ZA 1EEMA 4POLA 1K0MA 2TRXA 1XWCA 1M9BA 1EEJA 1BAYA 3QR6A 1Z7RA 2HXKA 3H4KA 3RAZA 2HZEA 4IP1A 4X0XA 5CRGA 3L78A 4MJAA 1V98A 4I2UA 2VCVA 2IMIA 2IFQB 1OVNA 1GTUA 2C3TA 3HVXA 4IQ1A 3KM6A 1B48A 2M80A 3LWAA 4E8EA 4IS0A 4TXOA 2YV9A 2AV4A 2VO4A 5DVBA 4ECJA 4XS4B 4V1Ap 2GVPA 1R5AA 3EE2A 5ECOB 5IIZA 3H1NA 2OE3A 5DCHA 3UL3A 2HRNA 1K0CA 1T4ZA 3KZQA 3TJKA 5JWOB 4D73A 1S3DA 1WMJA 4KAEA 3TDGA 2DLXA 1EV9A 5C04A 2B5XA 1XVQA 4YAVA 2H74A 5KN3A 2YZUA 3ERGA 3KH9A 2Z9SA 3R2QA 1OC8A 4ZB9A 2DJ0A 3TKSC 3GHAA 2VCWA 1H4OA 1SK0A 3LORA 5IMVA 4IVFA 2YP6A 2G0FA 4Z7XA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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