4MCUA

Crystal structure of disulfide oxidoreductase from klebsiella pneumoniae in reduced state
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
188
structure length
188
Chain Sequence
NAQITDGKQYITLDKPIAGEPQVLEFFSFYCPHCYQFEEVLHVSDNVRQKLPEGTKMTKYHVEFLGPLGKDLTQAWAVAIALGVEDKITAPMFEAVQKTQTVQSVADIRKVFVDAGVKGEDYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADLQLQGVPAMYVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVAQYADTVKQLVEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Comparative Sequence, Structure and Redox Analyses of Klebsiella pneumoniae DsbA Show That Anti-Virulence Target DsbA Enzymes Fall into Distinct Classes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Klebsiella pneumoniae
total genus 58
structure length 188
sequence length 188
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4mcuA00
1XWCA 3FRCA 3KP9A 4NPBA 2V2GA 3CXGA 2X64A 2C0DA 4K2DA 2REMA 2HSHA 1T00A 5G1KA 1MTCA 3L78A 4HEA2 4MPGA 3RBTA 3NIVA 1ZOFA 3FHKA 1O85A 1A8YA 1TK5B 1PN9A 3W6GA 2IMIA 2LRCA 1G7OA 6GSWA 2F3MA 4DSQA 2WZ9A 3IOSA 1JHBA 2L59A 1VF4A 3ZRDA 4PQ1A 1OYJA 1OE7A 1A0RP 5DCHA 1XWGA 1FW1A 3LGCA 1WPIA 4KNDA 2LNTA 3TOUA 3MWHA 5L71A 2MYGA 3GKKA 4IP1A 3H93A 16GSA 4ZL8A 5GZZB 4QQ7A 2O87A 2I9HA 1YQ1A 2NVLA 1TTZA 2C4JA 3QR6A 3DYRA 2X8GA 2I4AA 1OKDA 1H4OA 5KN3A 4XS1A 3MDKA 3APOA 4XRDA 5HQPA 2G0FA 3GRXA 1SKRB 1B9YC 2MBSA 4EL1A 1EV9A 1TK0B 2GZZA 1NSWA 1FHEA 4FH8A 1JZWA 1FB0A 4J56E 1BJXA 3ME8A 5CP1A 1CQHA 1TJDA 3TKRA 3DRNA 2DSAA 1JZRA 1DUGA 2H0IA 2YV7A 3H1NA 1CQGA 4PNFA 3P2AA 2K8VA 4K9ZA 2YZHA 2LRTA 2IPAA 5J41A 1F9MA 3ZLPA 5CNWA 2WCIA 4TR4A 2JSYA 2KP2A 4ZB9A 4TW5A 4EC0A 2DC5A 1GSSA 1XXUA 1ZZYA 4K6XA 3VWUA 1XWKA 3SWLA 2VCXA 2I81A 4E8EA 1ERVA 2B1KA 3FR9A 3ZYWA 2IMFA 2VL2A 2HFDA 5D73A 2H1GA 3TDGA 4POMA 3I9V2 2JU5A 2RM5A 3WGXA 2CVDA 2B5XA 2JADA 4EDZA 1C72A 1TI3A 3QAVA 1T3BA 1T7PB 2GQMA 1RQMA 3CTGA 3FZAA 3LXTA 3KMOA 3NOFA 2CVBA 2BTOT 3GH6A 1XVWA 3QAWA 1U87A 5CO3A 2CX3A 3RDWA 3FR6A 5EVOA 3AY8A 2H70A 5F07A 3ERFA 3NZNA 4KH7A 1TRSA 4ZL7A 5IM9A 5KN2A 5AGYA 2H1BA 2VAFA 3G7YA 5DALA 5DBQA 4EUYA 5IIZA 3GTUB 3JCML 3VI7A 1FVKA 1TRUA 1J0FA 1HQOA 1S3CA 7GSSA 4WXTA 1SENA 4TKYA 1X5CA 1YEXA 20GSA 3N5OA 4WBRD 1U3IA 1A2LA 1MDKA 1NM3A 4YAVA 5AISA 3PR8A 5CRDA 5CRHA 1QQ2A 1ERTA 1RW1A 2E2GA 1GULA 5E59A 4NXIA 3QFAC 4HZ2A 3BBYA 5DQSA 4K7IA 2PN8A 2IWTA 1M0UA 3GKMA 3DEXA 3IV4A 3IA1A 4XRAA 1Y6EA 1WJKA 3KH9A 5D96A 4H86A 3Q19A 3IRAA 3VLNA 2VM1A 1JZOA 2N5AA 3A3TA 3GIXA 4GCIA 1SK2A 4HQZA 3WT1A 2H6XA 5FHIA 5HR0A 2OKAA 2YWIA 2HNLA 1SKSB 2PUKC 2P5RA 4IP6A 2FA4A 5LNKe 1B48A 3J7Yb 1EGOA 2L6DA 1OC8A 3HKRA 4F9ZA 4AF2A 1GLQA 2CT6A 5AN1A 1UC7A 3C1RA 3BJ5A 5AIXA 1AAZA 4GTUA 1RK4A 5GSTA 5B6NA 5DAKB 1MDIA 22GSA 3EINA 3UJ1A 1YKAA 4GF0A 5HR1A 3D21A 4RQRA 1PQNA 4IQAA 3F3QA 4IHUA 3TRPA 1XW9A 1K0DA 3UVTA 3F6FA 1R5AA 1HD2A 1A23A 2H72A 3BCKA 1WP0A 3KTLA 2K9FA 2GSQA 2YP6A 1XWAA 3GKXA 1K0NA 1ZYQB 2LS5A 1EGRA 3DGQA 2ES7A 3FZ9A 10GSA 1AUCA 1USBA 5LD0A 1EZKA 3QDNA 3QAGA 3FYGA 5F0GA 14GSA 2OJLA 4ILFA 1QXHA 1O73A 4GRFA 3WD6A 4TRXA 1GUKA 3H4KA 4JEDA 3KJYA 1ST9A 2J23A 3GMFA 4MPFA 3TRQA 1UA5A 5FT3A 1H75A 2JZTA 1MEKA 1OC9A 1QGVA 3HDCA 1PA3A 1N8JA 3KIJA 3EE2A 5B8BA 4CHSA 4OWYA 4TR0A 4DSRA 3HYPA 5CRGA 3ME7A 4L8EA 3L4NA 2ON5A 4N10A 2X8CA 3TKSA 3DVXA 4YH2A 1BX9A 2R37A 5J3RA 3E0UA 4TOPA 5IMFA 1N2AA 1OC3A 4PUFC 3TJFA 1TKDB 2EIOA 4ZBDA 4HZ4A 1ILOA 4MJAA 3GSTA 1I9DA 5IMVA 4FYBA 2DBCA 5IPGA 3APSA 4WF5A 3VWVA 1K3YA 2H0HA 2B5EA 5DDLA 5ECSA 4QL7A 1FO5A 5DCGA 1S3AA 3O76A 3L0HA 2DJJA 5CRWA 4YQUA 1PRXA 2PPTA 2LTKA 3F63A 4IELA 2GQKA 2R4VA 1ERWA 5A5KA 5ID2A 4J2FA 5JWRB 3C71A 3D4MA 2WULA 3MSZA 1ZL9A 5GAPD 5JWQB 1XW5A 2VD0A 3ED3A 3GKNA 4RUVA 2DJKA 4MP4A 3GYKA 4EO3A 4MZCA 2HT9A 5D9WA 3N9JA 1YF1A 2YZUA 3LJRA 2WGRA 1YF0A 1JLVA 1Z6MA 4X0XA 2HI7A 1XCCA 4LMVA 1G6YA 2VCWA 3L9SA 2YCDA 1K0AA 2PBJA 5D8IA 3HD5A 2VUPA 3HJOA 4ECJA 3ERGA 3US3A 2DMLA 2P31A 2RIIA 3RHCA 1GNEA 3TKPA 6GSSA 2EIRA 4I5QA 2YJ7A 1PKWA 4FYCA 2GSSA 1UVZA 4MH3A 2FGXA 2C3TA 2VLUA 4L0UA 5CYYA 1TU8A 3MNGA 5F06A 1K3LA 1XPVA 4MK3A 2HZFA 4N0VA 4KCEA 2VCZA 4CDOA 2FA8A 4BVXA 5B7CA 3APQA 2HZEA 3LSZA 3CBUA 4ZXGA 1SL2B 1THOA 5DQYA 2O85A 1XZOA 4KSOA 1T1VA 3FR3A 3VWXA 2D2ZA 5IMCA 2XC2A 4MDCA 4ML1A 4XS4A 1ZCPA 2LQQA 2IMKA 1DSBA 1DE2A 2FWEA 3ZFLA 4ISDA 5ECRB 2GT5A 4OD7A 1SD9A 4JR6A 4WEYA 2K8SA 5IO0A 3HJPA 1Q4JA 5ABRA 4TXVA 5LCZA 2EC4A 4GQFA 4BA7A 2L5LA 5EL8A 1IYHA 3CSJA 2LJRA 3HVVA 1Z7PA 2GGTA 19GSA 2I1UA 4HUAA 1U3AA 3ZMKA 2PWJA 2O7KA 2CVKA 1J08A 1ML6A 2LJAA 2VCVA 3F8UA 1F3AA 5IMDA 2HZEB 1OKTA 1WOUA 4DVCA 2HRNA 1MD3A 1M2DA 3M9JA 1SJ6A 3RAZA 4IW9A 1ZGNA 4XCSA 4JRRA 4XS4B 2O8VB 2QSIA 2TIRA 2MMZA 1YEPA 2V1MA 1SK0A 2V41A 1XBSA 2C80A 5B8AA 4I2UA 2VCQA 4AJ6A 5D9TA 6GSUA 4EVMA 1Z5YE 5IPHA 2FNOA 2IN3A 3EC3A 1GH2A 3KH7A 1E6BA 4DEJA 3LQ7A 5IQYA 2A4VA 2JZRA 2F51A 1TK8B 3LFLA 3LG6A 1SKWB 1EEMA 2RUEA 6GSXA 1TDIA 3VFIA 4V1Ag 2YNXA 2GSRA 3GV1A 4O7HA 4HJ2A 2TRXA 1X9MB 4V2NA 5FWGA 1GSFA 4O5RA 3ZVJA 1EWXA 3FKFA 3TRXA 1E2YA 3H79A 3TKQA 2LNSA 1FVJA 3TKSE 3KXOA 1F2EA 3VI5A 4G10A 1A8LA 4PQHA 4WKWA 5J9BA 2FWHA 1S3DA 4KAEA 3FZ5A 3U6VA 2VLTA 1O7UA 4EXJA 1WE0A 2E2MA 2E0QA 3HVXA 2JL4A 2M80A 4OCEA 2HE3A 4LA1A 4O32A 4XS6A 4MZBA 4LL1B 2KOKA 1O8XA 3C7MA 3BCIA 3VURA 1GTIA 3I43A 3M8NA 2KP1A 3GX0A 1PGTA 4TXOA 5CREA 1O6JA 1XVQA 2YOIA 1AC1A 4F82A 1R26A 3WT2A 4F0CA 1YDKA 5F05A 2VL9A 3PH9A 1R5PA 4MF7A 3EURA 2L4CA 2GT6A 3F4SA 3P7XA 5KN1A 1Y25A 1OE8A 4MABA 1R4WA 1MDJA 3SBCA 5J5NA 3G7IA 2FCHA 3UBLA 2G2QA 1SYXA 3ZZXA 3GFKA 4FIWA 1OVNA 3G7JA 5EY6A 3A2XA 1WIKA 1WWJA 3KCMA 1QK8A 3ZIJA 3F4TA 4G9HA 4OMVA 3KTBA 1FOVA 3QD9A 3QCPA 2VOCA 4MMMA 1PX6A 1VRSD 6GSYA 3CRTA 3HZ4A 4AJ7A 3LORA 5DALB 3VPTA 2AAWA 2WDUA 4K0NA 4KUNA 2LSTA 1QUWA 3F4RA 3DVWA 2GZPA 2DIZA 1M7TA 3GX8A 1R7HA 3L9VA 2VD1A 3DD3A 4XHMA 3DKSA 1VF2A 2ZCTA 5IMAA 3UMAA 3PINA 1GTBA 3KP8A 4I8BA 4P3YB 4GXZA 1F6MC 1TOFA 5F8BA 3TOTA 3CMIA 2VCTA 2MBTA 3MAKA 5DJLA 1X5DA 1EV4A 2R2JA 2YWNA 2H71A 2C1YA 3CTFA 4L5OA 2PVQA 3QFBC 2VLVA 4F2IA 4HQSA 2RUFA 5JCGA 4OFTA 4NAXA 3EU4A 2A2SA 5ECLB 4BVYA 3GNJA 1AXDA 2H8LA 4N0ZA 3EYTA 1URMA 4OO5A 4E8HA 4V1Ap 2KHPA 2WJUA 3IK9A 2H0GA 2XPDA 5A4UA 1ABAA 4IQ1A 2LRNA 1EP8A 3M1GA 4ZBAA 4DSSA 2KUCA 2AYTA 4GQCA 2LUSA 1YY7A 1BEDA 2FHEA 4IN0A 1AQWA 5H5SA 3D0ZA 3TJGA 1V9WA 2CAIA 1U6TA 3HJMA 4PGTA 1EEJA 3UBKA 2HYXA 2C8UA 2JZSA 1YZXA 5DJMA 2IJYA 5IOXA 5G5EA 1TI1A 3ISOA 1TXXA 1JZDA 2ALBA 3FZ4A 2F8AA 1EP7A 4X43A 4MCUA 2YV9A 3D22A 3E3EA 4K7OA 4KDXA 2L4QA 4NHWA 1M9BA 4HU7A 3P8WA 4MH2A 4N11A 2CA8A 3M0FA 4MJCA 1KNGA 1GUMA 2H76A 2MZCA 4I97A 3KM6A 2OE3A 4POBA 4ID0A 4FO5A 1PMTA 1LBKA 1XW6A 4AGSA 3K8NA 3F6DA 4KA0A 2CV4A 4PQIA 2L6CA 1XOBA 1GNWA 4G2EA 2A2RA 2H1AA 2ZNMA 2F9SA 4TR3A 3ZVJD 3TB2A 2B6MA 3C8EA 1A0FA 2VO4A 1OC9B 1K0OA 2DJ0A 1WRYA 4LLRA 1YJ6A 1G0TA 1K0MA 4KDYA 3W8SA 4BWQA 4X1UA 4TN8A 3M9KA 5ECMB 1A2JA 1JFUA 2CAQA 4AJ8A 13GSA 3CYNA 3LWAA 4OCFA 3O3TA 5IMZA 3OR5A 2V6OA 1QMVA 4JU5A 5ECPB 1KBNA 1VF1A 1GSEA 3ZFBA 4JE1A 1UN2A 8GSSA 2IFQA 4BPYA 3TJJA 1M9AA 3GHAA 2FWGA 4QL9A 1PKZA 2GVPA 1V58A 1GL8A 1SJIA 1VF3A 1GWCA 3HHVA 2B5YA 5ECNB 4KE3A 4Q5FA 4Q5NA 4MLYA 2MMOA 5C00A 2VL3A 2I3YA 1XFLA 4ML6A 4WR4A 4KGIA 2EIQA 3A2WA 1F37A 3LYPA 3DIEA 3IAM2 1T4YA 2M46A 5ID2B 4J57E 2FWFA 3TGZA 4YAPA 3V1WA 2BMXA 5A4VA 1M2BA 1Q98A 3GSSA 5AIVA 1M2AA 3J7Yk 2H66A 2VM2A 2GSTA 4KDUA 3KZQA 2WS2A 4IKHA 5JCUA 4LMWA 4POLA 2X99A 2YANA 1TU7A 2JACA 1GSUA 3IPZA 3GL3A 4OO4A 4PNGA 2IFQB 3HY2A 3WYWA 1GRXA 2FLSA 1A2MA 4TR1A 2YWOA 1GSQA 5D9XA 4L0WA 4EKZA 1DE1A 3QOUA 3GL5A 5HFIA 3D5JA 2NDOA 2AB6A 2IL3A 3M3MA 1HNCA 5J9CA 1T8EB 2B7JA 1FB6A 3CSIA 5CAXA 3FY7A 4BWSA 2IIYA 3EVIA 3IC4A 4MF6A 2C0GA 1GUHA 3GURA 4GSSA 2JSZA 1GTAA 1W4VA 5G30A 3PGTA 1Z7RA 1XIYA 3QPMA 3GN3A 2AHEA 3ZMLA 3IDVA 4ECBA 2HRFA 3IXRA 1QFNA 2LQOA 1FAAA 1WMJA 2DJ3A 1Z3EA 4FYUA 3HVSA 3LEFA 1A24A 1V57A 4XTSA 2QC7A 3O6TA 1B4QA 5EPFA 4TR1B 4ZB8A 3VWWA 5B6MA 2B7KA 3IBHA 1SU9A 2TRCP 5A4WA 4V2LA 6GSVA 2LV3A 2OE1A 1TW9A 3WGEA 3P90A 3EU3A 2WFCA 2YPMA 1PL1A 2OADA 4OFMA 3F9UA 5ENUA 5G5FA 2HSYA 3VK9A 3BOAA 4LL4B 2DMMA 18GSA 2L5OA 1VGLA 1PX7A 1V40A 4ZILA 2O89A 4ZIJA 2N5FA 3TKSC 4EF0A 9GSSA 2WB9A 2RLIA 1AQXA 4D73A 3Q74A 2M72A 5H5QA 5H5RA 2XPEA 4G19A 1NW2A 2H30A 1BG5A 2RM6A 4JBBA 4HI7A 2NBSA 1PSQA 3HXSA 2F8FA 5D9VA 4KCAA 5HFGA 4K1FA 3GTUA 1M99A 3F3RA 5ECIB 1K0BA 2YN1A 3DWVA 4ECIA 3TCOA 2X8HA 2GLRA 4BL7A 1NHYA 3KEBA 2XBIA 2OBIA 3DXBA 3TUEA 2DJ2A 5ELAA 1HNBA 4Z7XA 3BD2A 2H75A 5ECQB 2LJKA 1GSDA 5HR3A 1O8WA 1YKCA 5E4WA 3FW2A 4NMUA 5C04A 1GSYA 1Z6NA 4K8MA 4HJMA 2R5GA 3KMNA 1AIUA 5HFKA 2Z9SA 3UVHA 3UARA 3KGKA 1U88A 4I2TA 4D73B 2H19A 3E9JB 3LYKA 1PD21 1ACVA 3ERWA 1ERUA 3WGDA 2NPBA 3A5WA 2PMTA 4MZWA 2B1LA 3L9UA 1SJZA 3Q18A 2AV4A 3RHBA 4HDEA 4KB3A 4KW6A 3D6IA 3ZL5A 1ZYEA 5KEJA 5HR2A 3D4TA 2BJXA 1T4ZA 3QMXA 2V32A 2MMAA 1KTEA 4IS0A 3UIWA 3FEUA 2WRTA 4O92A 2H6YA 5DAKA 4WR5A 2VIMA 4ZBBA 1G7EA 5ECHB 17GSA 2ON7A 4NHZA 1X5EA 2PGTA 1W89A 4TXOB 1TRWA 4Q5RA 1FG4A 1LU4A 4KX4A 4HS1A 4MJBA 2YWMA 3CRUA 1NHOA 3VPQA 2DJ1A 2AJQB 3HZ8A 1KEBA 3R2QA 3GH9A 4NV5A 3IE3A 1SL1B 3F0IA 2DLXA 4OFNA 1X9SB 1ZMAA 3A2VA 1ON4A 4IBPA 4EDYA 1BAYA 2N5BA 4HOJA 4JR4A 4ZB6A 1Z9HA 2CQ9A 1GLPA 2QGVA 4HU9A 3W8JA 2E7PA 1THXA 2XBQA 2P5QA 5G31A 4GSNA 2R3XA 4RI7A 2OE0A 2FY6A 5G2ZA 5JCWA 3IK7A 2ZUPA 3EMPA 4K7NA 3UAPA 3IHQA 4F0BA 2OACA 5GAND 2OA7A 2QKEA 3FK8A 4POKA 1B4PA 4PXOA 1DBYA 6GSTA 4ULXA 4ECCA 4NWYA 5JWOB 1B9XC 1TRVA 3DMLA 3ZREA 2FUG2 1X0RA 3I6AA 1X9WB 3RPPA 2V6KA 2L57A 2YJHA 4ACSA 2CX4A 3ZIVA 4KSMA 3S9FA 5ELGA 3LXZA 1LJRA 3Q6OA 4PX1A 5ECKB 3ZITA 2H1DA 5D93A 2GTUA 4V2MA 4MF5A 3KD0A 5COHA 2KLXA 5GSSA 2VL2C 2C0FA 4MA9A 1AW9A 1SK1A 3UOMA 2K18A 2PU9C 4WF4A 4PURA 4GWRA 3CSHA 4JZQA 3RPNA 3GUSA 4I6XA 3H8QA 4RI6A 4ZL9A 1EOGA 3UL3A 2DIYA 2MMNA 4YQVA 3TJKA 2HXKA 2IMDA 1K0CA 1O81A 11GSA 2C3NA 4DSSB 1HNAA 2LKUA 2C0EA 1B8XA 3HCZA 1OAZA 1V98A 5KN0A 2PVOC 1MD4A 2GDRA 3EWLA 3U5RE 4F03A 2B3SA 4N30A 2H6ZA 4RQXA 3I69A 4CW9A 3C73A 1GP1A 4IVFA 4MJEA 2CZ3A 3ZTLA 3IR4A 4Q5QA 1F3BA 2AUVA 2H74A 4IGJA 4WETA 2H73A 2HLSA 4IJIA 1G6WA 1BQ7A 1EOHA 1SYRA 2R6KA 3HA9A 12GSA 3GA4A 3EMXA 1XOAA 1TP9A 2CZ2A 1K3OA 2IMEA 4NV2A 1V2AA 4EE0A 2C3QA 5INYA 2XHFA 5G1LA 4WBJA 5IO2A 1I5GA 3IAS2 2K6VA 4GSTA 1SL0B 2GQLA 1SD8A 2NTOA 5IOWA 2P0GA 2OBKA 1PL2A 4K0GA 1IYIA 3C1SA 1BYEA 5DVBA 1AQVA 2GS3A 4TVEA 2H01A 1XWBA 1HYUA 3UEMA 3TJBA 2PERA 1J9BA 1GTUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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