4MH2A

Crystal strucutre of bovine mitochondrial peroxiredoxin iii
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
165
structure length
165
Chain Sequence
APAVTQHAPYFKGTAVVSGEFKEISLDDFKGKYLVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDKASEFHDVNCEVVAVSVDSHFSHLAWINTPRKNGGLGHMNIALLSDLTKQISRDYGVLLEGPGLALRGLFIIDPNGVIKHLSVNDLPVGRSVEETLRLVKAFQFVEAHG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Improved Catenated Structures of Bovine Peroxiredoxin III F190L Reveal Details of Ring-Ring Interactions and a Novel Conformational State.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial
molecule tags Oxidoreductase
source organism Bos taurus
total genus 57
structure length 165
sequence length 165
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2013-08-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4mh2A00
3ME8A 2DMLA 3W6GA 4GCIA 1H4OA 4MCUA 3KMNA 1EP7A 5JCUA 4MPFA 4F9ZA 2XBQA 5ECQB 1OAZA 2K6VA 1T00A 2YZUA 1U3IA 5J9BA 4DVCA 2X8CA 1F9MA 5G30A 3O76A 1I9DA 2CV4A 3MSZA 1QQ2A 4KDXA 3CTGA 2FNOA 2L4CA 3G7JA 1TXXA 3LFLA 1BYEA 4I6XA 3UARA 1HD2A 2X8HA 4GRFA 3EWLA 1E6BA 1HYUA 1BEDA 3K8NA 5D73A 5ID2A 1AW9A 1JZRA 1CQHA 3H79A 2L4QA 2H6XA 1YF1A 2YWOA 1VF1A 2PWJA 2DLXA 1X5EA 4FYCA 4TXOB 5DCHA 2BMXA 1SD9A 4IKHA 5ENUA 3TRPA 1A0FA 1QMVA 2XPDA 4OCEA 3MNGA 1Z7PA 3L0HA 1GWCA 2F51A 2VM2A 3SBCA 1BJXA 4X0XA 5GZZB 3IBHA 2HT9A 3FZ5A 1KEBA 4TR1A 3GURA 2B5XA 4HQZA 2BJXA 4WETA 1G6YA 3RHCA 5G31A 1VGLA 4N10A 2IMDA 2A2SA 1T1VA 4RUVA 2G0FA 4O92A 4PURA 3ZLPA 3HZ8A 1NW2A 1K0MA 2CX3A 4HEA2 2AV4A 4HQSA 1U3AA 4JRRA 5IO2A 1XCCA 3ISOA 2H74A 4G9HA 3HZ4A 2LTKA 5DDLA 1OKDA 2F8FA 2HZFA 2JSZA 2LQQA 2MMAA 5G5EA 4RI6A 4IP6A 4KNDA 4NHZA 2YPMA 1GLPA 1USBA 1UVZA 4I97A 5IO0A 2B6MA 2MMOA 3FR9A 3F4RA 1F3AA 2LRCA 3GL3A 2L6DA 1ZMAA 4EDZA 2LS5A 1OC3A 5COHA 4TN8A 4ZXGA 1X0RA 4K7OA 1F2EA 5H5SA 2N5AA 5D9WA 1A2MA 3C73A 3RPPA 1A24A 3F9UA 3GN3A 3DXBA 4WBJA 3GIXA 1X5CA 20GSA 1YKAA 4MA9A 2R4VA 3F0IA 1BX9A 1YF0A 2VCZA 1K0DA 2H71A 1ON4A 3PH9A 1X5DA 4FYUA 1G0TA 3JCML 3VLNA 5F05A 4TR3A 3VWXA 4MH3A 1VF4A 5F0GA 1SD8A 4J57E 1NHYA 4MH2A 3US3A 5CAXA 3RAZA 4FO5A 1O6JA 6GSXA 3UL3A 6GSTA 5ECMB 4GTUA 4V1Ag 5IMAA 1B4PA 5ECPB 5DQSA 3GH6A 3ZIVA 5AGYA 1EWXA 3ZREA 1SL0B 2VD0A 2NVLA 2R6KA 2PVOC 5CNWA 4KDUA 3FEUA 4HJMA 4XIHA 4RI7A 3WGEA 2YNXA 2CA8A 4QQ7A 4QL9A 3Q6OA 4J56E 3WT2A 4L5OA 3LEFA 4MF6A 4NV2A 4IELA 3F6DA 3F8UA 2NDOA 3M3MA 1A23A 1QGVA 1TRUA 3QCPA 4OFNA 1GTAA 1W4VA 4IJIA 3CMIA 3P7XA 2XC2A 2C0FA 2IMKA 3O6TA 1TKDB 4ZBAA 3UJ1A 2XBIA 1PD21 3DRNA 4GWRA 1ZGNA 1B9XC 2CT6A 5E59A 1J9BA 4I5QA 1WIKA 2CZ2A 4TXOA 1H75A 4IBPA 4ACSA 2OACA 5A4UA 5F8BA 3KCMA 3TJKA 5KN1A 4ZBDA 2FD3A 1C72A 4NV5A 3FZ4A 1T3BA 5B6NA 5IM9A 4EC0A 2HSYA 3VI5A 1G7EA 4KCEA 4POBA 2GTUA 4GLTA 2OE3A 2P5QA 5J5NA 4K2DA 3EMXA 2NPBA 1K3LA 1OC9A 3GYKA 5J3RA 3HA9A 2VLVA 3HDCA 5ECSA 2X99A 1FB6A 4HS1A 4FH8A 4D73B 1GULA 5HR2A 4FIWA 3BJ5A 4MZBA 2F3MA 3H8QA 1ZCPA 2HSHA 4L0WA 5F06A 1K3OA 2YJHA 1AC1A 4GQCA 2AJQB 1BAYA 4ZBBA 4WR4A 2DJJA 3KMOA 3ERGA 1Q4JA 4EKZA 1Z6MA 4YQUA 4K6XA 3LXTA 4TR1B 3AY8A 3L4NA 2MBSA 1XZOA 3TB2A 3GSSA 3F4TA 4K0NA 3D22A 3ZVJA 1SYRA 10GSA 2H1BA 4TXVA 2A4VA 3L9UA 2K8VA 5CRWA 4MF7A 5DJMA 4POMA 2L6CA 3GTUA 4H86A 4EL1A 4BPYA 4JE1A 1BG5A 4PXOA 5CYYA 2MMNA 2D2ZA 3TJGA 1TU7A 4BVXA 2H1AA 4NAXA 5HR1A 1SKWB 1OVNA 1XWCA 1DE2A 3R2QA 4O32A 5DBQA 2B3SA 3I6AA 3KTBA 5F07A 3TDGA 1R5PA 2K9FA 4RQRA 1V9WA 1XFLA 3RHBA 4E8EA 2PMTA 4TOPA 3TRXA 1WWJA 1JLWA 5D9VA 3HY2A 2E7PA 3TKSE 3QPMA 1XW6A 5EVOA 5ECKB 3KTLA 4PQ1A 4PGTA 1YY7A 1XBSA 3FZAA 2GQMA 4G19A 1VF2A 3P2AA 2WDUA 4XRDA 1ERVA 1URMA 3TOTA 2O7KA 1FVKA 1THOA 2FWGA 2IFQA 4HOJA 3DKSA 4KUNA 5IPGA 1S3AA 4QL7A 4IVFA 3KIJA 2AHEA 5DALB 3ZMLA 4ZIJA 3KXOA 5H5QA 1M0UA 2FWHA 2NTOA 4OFMA 4ZB9A 2EIOA 4EO3A 2E0QA 2TRCP 2IIYA 5G1LA 4K7IA 1ZOFA 1RK4A 2E2MA 1F6MC 3TKSA 1GUKA 4WEYA 1KBNA 4O7HA 3ZTLA 3DMLA 3VFIA 1ST9A 2F9SA 3S9FA 2HE3A 3TUEA 3I43A 2OJLA 4V1Ap 2DJKA 5D96A 1QK8A 2YWMA 4ILFA 4MJAA 6GSUA 1K0NA 1B48A 2MBTA 1EGRA 2CVBA 3CRUA 1UC7A 1O73A 2GT5A 5IMFA 3P90A 4IW9A 5B7CA 2CAQA 5JWOB 1YKCA 3GNJA 2PBJA 2LQOA 3CXGA 5KEJA 2GSQA 3E3EA 4IQ1A 1T4ZA 1TJDA 1BQ7A 3DEXA 2WRTA 1TK0B 1SENA 5D9XA 2C0DA 5ECIB 1EZKA 2B1LA 1PSQA 2L59A 1YEPA 2LRNA 2ON5A 2VCVA 2VL9A 4LL4B 2IPAA 2LNTA 6GSYA 4G2EA 3L78A 3CSIA 3HCZA 4MLYA 2GS3A 1XVWA 2IMFA 5FT3A 2H75A 4D73A 2GZZA 4MZWA 3PGTA 4PQIA 3QAGA 3HVXA 1PN9A 2AYTA 2H0GA 5EL8A 2ZUPA 2YN1A 2YV7A 2MZCA 4K1FA 1WRYA 5AISA 4WR5A 2PERA 2H73A 1W89A 1FHEA 4V2NA 1QUWA 3HHVA 3IAS2 3IOSA 2CZ3A 1WMJA 2C3QA 1G6WA 1PGTA 1OC9B 1EP8A 3RDWA 3SWLA 4POKA 2VL2A 9GSSA 4WBRD 2C8UA 5FHIA 1NHOA 1AAZA 4MMMA 1TU8A 3GX0A 4HZ2A 2IN3A 3HJOA 4JZQA 3A2WA 3GA4A 1XIYA 2H19A 3UVTA 1JLVA 1XVQA 4F0BA 3DGQA 3HVSA 3QAWA 1XOAA 3NOFA 1XWGA 1HNBA 4HU9A 1UN2A 3DIEA 1EOHA 3DVWA 4HZ4A 4Q5FA 1U87A 2JACA 2C80A 1M2AA 2IJYA 2V2GA 1MTCA 3KP8A 3TOUA 3GTUB 3IAM2 2FGXA 3LJRA 4CDOA 3FR3A 4MZCA 5ABRA 1TTZA 3P8WA 3FRCA 2GSSA 2VOCA 1K0BA 2ZCTA 1ML6A 1PL1A 3DYRA 4HDEA 3G9BA 5GSTA 1KNGA 1GSUA 3GRXA 1X9MB 3N9JA 1FO5A 1PRXA 3BD2A 5B8AA 5KN2A 5ECRB 5D8IA 2IL3A 3IPZA 2J9HA 5DALA 1SL1B 2HZEA 6GSVA 2OBKA 3IHQA 2WCIA 1J0FA 1U88A 2O85A 3TGZA 3IK7A 1PKZA 5ECNB 4YAVA 1V2AA 3WGXA 4GSTA 3EMPA 1AIUA 1EV4A 3GHAA 3EU4A 2YV9A 4MJCA 3MAKA 1TK5B 2YANA 5HQPA 4IN0A 3H93A 4YQVA 1O8XA 2KHPA 2WJUA 19GSA 5B6MA 2IFQB 1N8JA 2GVPA 3APOA 1I5GA 1TOFA 4F03A 3FZ9A 3KD0A 4BWQA 5J41A 3VI7A 4WF5A 2F8AA 3E0UA 2VO4A 1XW9A 1Z3EA 1HNAA 3F3RA 1DE1A 1GTIA 2IMEA 3HYPA 4K9ZA 1WE0A 5EY6A 1R4WA 2M72A 1O81A 4MP4A 3ZVJD 3BBYA 3D21A 2V6KA 1UA5A 1VRSD 4ZB6A 2G2QA 1QXHA 4DSRA 2FWEA 3LWAA 2GZPA 2QC7A 1MDJA 1SL2B 1MD4A 5IOXA 2VIMA 2RUFA 5KN0A 4AGSA 2XPEA 2LJRA 2H70A 1SYXA 4XS4A 5IMVA 1ERUA 5CREA 4WXTA 5C00A 6GSWA 2ZNMA 4AJ6A 3EE2A 3VURA 1GTUA 2H6YA 3KGKA 3L9SA 5G5FA 3NZNA 4K0GA 2YWIA 2OA7A 3CYNA 2CX4A 4F2IA 3ZIJA 1OE7A 4GQFA 5HR0A 5DQYA 3HD5A 2LNSA 1TRVA 3F3QA 1SK0A 4OWYA 4XHMA 17GSA 3J7Yk 5ELGA 1M2BA 4KE3A 2E2GA 4L5LA 2DIYA 4ID0A 2FA8A 4DSSA 1T4YA 1N2AA 1AQXA 3QR6A 2PU9C 4MDCA 2DC5A 1TW9A 3GH9A 3W8SA 3KH9A 3DD3A 5JWRB 1TRWA 2FCHA 1B9YC 1X9SB 13GSA 5DVBA 2VCQA 8GSSA 4XS6A 3LG6A 3TKQA 4HJ2A 2VM1A 4EUYA 1SK2A 2N5BA 4KB3A 2V6OA 4N11A 3ZRDA 3UVHA 3CRTA 5C04A 2LRTA 1AUCA 2FY6A 3APQA 12GSA 5IMZA 1M7TA 5IOWA 1T8EB 2LJAA 1IYHA 1XW5A 4G10A 4OO5A 1FOVA 1EV9A 2VUPA 2HLSA 2J23A 2R2JA 2KP2A 2OBIA 2KOKA 2AUVA 4KH7A 3F4SA 3KJYA 1K0OA 1R26A 3U6VA 1A2LA 5A4VA 4FYBA 3M1GA 2GQLA 4F0CA 1O85A 2YJ7A 5ELAA 4PX1A 1E2YA 3M9JA 3U5RE 3Q74A 4O5RA 4TW5A 1GSSA 22GSA 5LD0A 1WP0A 2OE0A 1K0AA 5HFGA 4ISDA 1A2JA 2JL4A 1PA3A 3A3TA 4KX4A 3ERWA 1DUGA 4TRXA 3GFKA 3V1WA 5AIVA 1HQOA 3D5JA 4ZB8A 1GH2A 3F63A 4MABA 3IE3A 2P31A 5L71A 4NPBA 7GSSA 1THXA 5ECOB 4TVEA 4YH2A 2H0IA 2C0GA 3G7YA 2YWNA 4Z7XA 3E9JB 2VCTA 2JSYA 4ECJA 2VLUA 3GSTA 2CVDA 4EDYA 2GLRA 2HZEB 2C3NA 5DCGA 4LMVA 4ECBA 5B8BA 2EC4A 3H4KA 1OC8A 1GSYA 4P3YB 4XCSA 2R3XA 1TK8B 5E4WA 3QFAC 1FG4A 3M9KA 3LQ7A 1GLQA 3C7MA 4NXIA 3ZZXA 1NM3A 1Z7RA 2HFDA 1EGOA 1Z5YE 3TJJA 2HXKA 4NWYA 1ILOA 1Z9HA 2VL3A 4OCFA 3GKKA 1MD3A 1PKWA 4KCAA 1SKRB 3DVXA 4AJ7A 4I2TA 2RLIA 5LCZA 1GL8A 4JU5A 3J7Yb 4LA1A 1YQ1A 1SJZA 5CRDA 2K8SA 1A8LA 3TKRA 2JZSA 3WT1A 4RQXA 4ZL7A 4E8HA 5JWQB 4TKYA 1NSWA 4ML1A 1O7UA 1GTBA 3HJMA 3HKRA 3ZMKA 4KSMA 4WF4A 5G1KA 2HRNA 3WYWA 3KH7A 4ULXA 2YOIA 3QOUA 4IP1A 2AAWA 4Q5QA 1PL2A 2C3TA 1F3BA 2VLTA 4I8BA 1EEMA 11GSA 1K3YA 3IK9A 2I4AA 3TJBA 4XS4B 2IMIA 1GP1A 1JHBA 3RPNA 1K0CA 4NHWA 1LU4A 2MYGA 3EU3A 2C1YA 4ZL8A 2KUCA 3FR6A 4L0UA 3UEMA 4ECIA 1GRXA 1T7PB 1R7HA 2DJ2A 5DAKA 2P5RA 1S3DA 2MMZA 5D9TA 3TJFA 4IJ3A 1V40A 2YCDA 1KTEA 3O3TA 5GSSA 2QSIA 3GMFA 4JEDA 1V58A 5FWGA 1B8XA 3LORA 3GV1A 1TDIA 1VF3A 2LUSA 5CO3A 4ZL9A 2GGTA 2JZTA 5ECHB 3BOAA 3APSA 1SK1A 2WZ9A 2VAFA 2I3YA 2EIRA 4KA0A 3EINA 2IWTA 4DSSB 3ED3A 2VCWA 1R5AA 3A2VA 2GSTA 4GSSA 3C8EA 1FVJA 1MDKA 3CBUA 4JBBA 5AIXA 2DSAA 3ZFBA 3ERFA 3UMAA 4IHUA 4PNGA 1RQMA 2GZYA 3GKMA 5CP1A 5D93A 1ERTA 1J08A 1PX6A 2FA4A 3D6IA 1LJRA 2AB6A 4I2UA 5J9CA 2OE1A 1Y25A 2L5LA 1ZL9A 2ALBA 2RM6A 3I69A 3VWWA 1JZOA 3C71A 2HRFA 2FUG2 2L57A 1YDKA 2LV3A 5IQYA 16GSA 3VK9A 3GKNA 1S3CA 2WB9A 1DBYA 1B4QA 1V57A 3Q19A 4HI7A 2PUKC 4NMUA 5IPHA 3A2XA 2LSTA 2X64A 4LL1B 3LGCA 1XWBA 2X8GA 4PUFC 2ON7A 3TRQA 4MK3A 4YAPA 2R37A 3QDNA 1OYJA 2LKUA 2GSRA 2RIIA 2TRXA 1WOUA 3CSJA 1G7OA 1FW1A 3M8NA 2KLXA 4MPGA 2DIZA 2PGTA 1TI1A 2H76A 2L5OA 4MF5A 3UOMA 1ZZYA 2H72A 3QMXA 3VWVA 3KM6A 1IYIA 1GNEA 1GSEA 3FYGA 3GKXA 4F82A 1SJIA 1HNCA 4X43A 1V98A 3EURA 1Y6EA 2FHEA 4PUAA 4TR4A 4WKWA 5H5RA 2JADA 5DJLA 1DSBA 2OADA 2HYXA 3FW2A 3HJPA 3D0ZA 3F6FA 1MEKA 4XTSA 1EEJA 1TRSA 4MJEA 4CHSA 1A0RP 2H1DA 5JCGA 2H6ZA 3BCKA 4V2MA 3D4MA 3IC4A 1Q98A 4CW9A 3PINA 3TCOA 2TIRA 5GAPD 3WD6A 4Q5NA 1M2DA 1XWAA 3OR5A 4PQHA 1AQWA 5CRGA 1SU9A 2O87A 5EPFA 1JFUA 18GSA 3PR8A 2I1UA 2O89A 4BL7A 2YZHA 4BVYA 14GSA 1A8YA 1JZDA 3QAVA 3I9V2 1ABAA 1OKTA 3N5OA 2REMA 2B7JA 2XHFA 2B1KA 3IDVA 4GF0A 5IMDA 3G7IA 3ZFLA 1O8WA 1FAAA 5IIZA 1Z6NA 3UBKA 3CTFA 4BWSA 4KGIA 3GL5A 2GDRA 4JR6A 2FLSA 2GT6A 1M9BA 1GSQA 4EE0A 1ERWA 4GSNA 4IGJA 2P0GA 4N0ZA 4AF2A 1GSDA 1GSFA 3FK8A 3IRAA 2R5GA 3KP9A 1TP9A 3D4TA 2CQ9A 1WPIA 1JZWA 4XRAA 3TKPA 3BCIA 2EIQA 5A5KA 3UBLA 3UAPA 1XXUA 1M9AA 1LBKA 1YZXA 2RM5A 3LXZA 4Q5RA 2QGVA 2M46A 2RUEA 2M80A 4KW6A 1MDIA 2WULA 1FB0A 2DJ0A 1PMTA 1GUMA 2PVQA 4GXZA 2H30A 2K18A 2VCXA 4OD7A 4ZILA 2V41A 4LMWA 5J4UA 3Q18A 4K8MA 2QKEA 5ID2B 1XWKA 2VD1A 3C1RA 5DAKB 1SKSB 4KDYA 2A2RA 4BA7A 2LEGA 5AN1A 1ZYEA 1TI3A 2DBCA 5A4WA 1ACVA 2I81A 1CQGA 1M99A 4N0VA 4IS0A 1XOBA 1EOGA 1RW1A 4EXJA 4L8EA 2ES7A 2NBSA 5GAND 3FY7A 2KP1A 2BTOT 1AQVA 4KSOA 3IV4A 2H0HA 3FHKA 2JU5A 2PN8A 1GUHA 3LYPA 1XPVA 3TKSC 2WGRA 1GNWA 2C4JA 1PX7A 3QFBC 5JCWA 5KN3A 4JR4A 5HR3A 3MDKA 4OFTA 3FKFA 4V2LA 3VPQA 3RBTA 3LYKA 3KEBA 2O8VB 4DEJA 2CAIA 3WGDA 3HVVA 1SJ6A 3ZITA 2I9HA 3M0FA 1ZYQB 3GUSA 2OKAA 4IQAA 2WS2A 1QFNA 3CSHA 3EC3A 3ZL5A 2B7KA 2HI7A 3NIVA 3MWHA 4POLA 2N5FA 4LLRA 2JZRA 4XS1A 3KZQA 5INYA 2H66A 4MJBA 4EF0A 5G2ZA 3QD9A 1YJ6A 3ME7A 4HUAA 2HNLA 2GQKA 2H01A 2C0EA 4YQMA 1OE8A 1AXDA 3W8JA 1F37A 2PPTA 3L9VA 2Z9SA 4DSQA 2B5YA 4PNFA 3EYTA 4EVMA 4ECCA 5LNKe 3DWVA 4KAEA 5HFIA 2V32A 2WFCA 3A5WA 3EVIA 2DMMA 4HU7A 1WJKA 1X9WB 6GSSA 3VPTA 3HXSA 2LJKA 4AJ8A 4K7NA 2V1MA 3LSZA 3IXRA 3GX8A 4J2FA 2H1GA 2DJ3A 3C1SA 4OMVA 1YEXA 1U6TA 5ECLB 5IMCA 2B5EA 2VL2C 3UIWA 3VWUA 4X1UA 2H8LA 4TR0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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