4MH3A

Crystal strucutre of bovine mitochondrial peroxiredoxin iii
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
166
structure length
166
Chain Sequence
APAVTQHAPYFKGTAVVSGEFKEISLDDFKGKYLVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDKASEFHDVNCEVVAVSVDSHFSHLAWINTPRKNGGLGHMNIALLSDLTKQISRDYGVLLEGPGLALRGLFIIDPNGVIKHLSVNDLPVGRSVEETLRLVKAFQFVEAHGE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Improved Catenated Structures of Bovine Peroxiredoxin III F190L Reveal Details of Ring-Ring Interactions and a Novel Conformational State.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial
molecule tags Oxidoreductase
source organism Bos taurus
total genus 52
structure length 166
sequence length 166
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2013-08-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4mh3A00
3CMIA 1USBA 3GSSA 2WJUA 1T3BA 3TJGA 2CAQA 1MDJA 4MF6A 4TXVA 2H30A 2JU5A 3GX8A 3GYKA 3GL3A 2L6DA 3APOA 2HZEA 3L78A 2DSAA 5EL8A 1EV4A 3M1GA 3ME7A 3TGZA 5HFIA 2FHEA 5D8IA 1LBKA 5CAXA 1XWCA 1OYJA 3TJKA 2FY6A 3F6DA 1I5GA 2R4VA 3ZYWA 4IQ1A 3DVWA 1KBNA 2H76A 2H0IA 3KMNA 1KNGA 4OD7A 4KH7A 1G7OA 5DAKB 6GSUA 4MZBA 2CAIA 2EIQA 4PX1A 1ABAA 4ECBA 3WD6A 19GSA 2HE3A 2LRNA 1GSEA 1BG5A 3UAPA 16GSA 3H93A 4ZBBA 2MYGA 3KCMA 3CSJA 2H74A 1YJ6A 2PMTA 3VWWA 4BWSA 3ZFBA 2LNSA 3G7IA 4F82A 4EXJA 3F9UA 5CRDA 1MEKA 3WGXA 4GQFA 1X9WB 4GTUA 3ZIJA 5ECRB 2M72A 4DSSB 4TR4A 5DJMA 2XC2A 1TXXA 1YF0A 4N10A 1Z6NA 4ISDA 1Z5YE 4CW9A 1ERWA 3IXRA 4P3YB 9GSSA 4DSQA 3FW2A 4HZ2A 1GLPA 3EMPA 1GNEA 5IMDA 1A0FA 1OKTA 4AF2A 4D73A 5INYA 3M8NA 2L6CA 1SYRA 1B4QA 1LU4A 1THXA 2X8CA 4NHZA 3LGCA 1K0NA 2H71A 2FWGA 20GSA 3HA9A 4K8MA 4Q5RA 4FYUA 1XWKA 1PN9A 2YV7A 5ELAA 2C3QA 1HD2A 3GURA 4ILFA 4GQCA 5E59A 1MDKA 1K3LA 1ZCPA 4HDEA 2CVDA 3RHCA 2JADA 5L71A 1V57A 2IMDA 2R5GA 4PQ1A 4GF0A 1TRVA 4EDYA 4YAVA 2FWFA 2LEGA 3HXSA 3SWLA 1V9WA 1R5PA 3GMFA 3UMAA 1SD9A 4MJBA 1GULA 5KEJA 3D5JA 2GZPA 3FYGA 4EKZA 1GUMA 1SKSB 2PBJA 3VI7A 1GTIA 3FZ4A 5CREA 2H8LA 2REMA 4K6XA 1FVKA 5D73A 1TU7A 1BJXA 1O8WA 2H70A 2RM6A 5H5RA 2WDUA 5G5EA 4LL4B 1AQVA 1H75A 2O7KA 1PGTA 2G2QA 2WRTA 5IMFA 3EE2A 2NBSA 2V1MA 1RW1A 3QPMA 1XXUA 5KN1A 3LEFA 2R6KA 4WEYA 3EU4A 1DE2A 2V6KA 2XBQA 1M9AA 5F05A 2VLUA 3EYTA 5IMAA 17GSA 2XBIA 4EF0A 2B1LA 3P8WA 2NVLA 4MH3A 3C71A 2AHEA 1SK1A 2ZCTA 3OR5A 2LNTA 2C3TA 5DVBA 3TRXA 2OE1A 3RPNA 3ISOA 1A23A 3TKSE 4OWYA 2MBSA 2CX3A 3M0FA 4K7OA 2VOCA 2GQLA 2YWNA 4EVMA 4ECCA 4PNGA 4H86A 3EU3A 1XW5A 3BCKA 2IMEA 4MJEA 3VFIA 1FOVA 4FYCA 2ON5A 2F3MA 2MMZA 1BAYA 2VCXA 4G2EA 1YY7A 4LLRA 2HT9A 2H19A 1EP8A 3KH7A 2DMLA 4ZL9A 2O87A 1ZL9A 22GSA 1HNCA 2H01A 2E0QA 2IL3A 3DGQA 5JWQB 2OKAA 5D9VA 3ZLPA 3GH9A 1R5AA 4I2UA 3ZMKA 3AY8A 4NAXA 2VD1A 2RM5A 2GGTA 3ZFLA 3Q19A 3D0ZA 4AJ6A 4HZ4A 2VCQA 3W8SA 1QQ2A 4XRAA 4O5RA 3FY7A 1EZKA 2O89A 2YPMA 1HNBA 5IOXA 1ZMAA 3F4TA 4K7NA 5J3RA 1GSFA 2FGXA 3GNJA 2VL2C 2C0DA 2H66A 3C7MA 4IS0A 2YJHA 2YOIA 4X1UA 3LYPA 3L4NA 4E8EA 3RDWA 1GSSA 5EPFA 3JCML 3KP8A 2L4CA 5B6MA 4I5QA 2C80A 3N5OA 1HYUA 4AGSA 2B7JA 2B3SA 3HJMA 2FD3A 2CT6A 2LUSA 1SJ6A 4MDCA 2I4AA 4TN8A 1WWJA 3H79A 3EWLA 4X0XA 4MH2A 5F07A 4K2DA 1X5DA 4L0UA 1SK0A 3QMXA 2H75A 1UC7A 3P7XA 5IOWA 5DCHA 2MBTA 3A2XA 5ECLB 1URMA 3EINA 2HRFA 3EMXA 1EEMA 3UIWA 2P31A 3MNGA 5FT3A 3WGEA 5IMCA 4Q5NA 4WKWA 3TKQA 2PUKC 2LS5A 3C73A 2GSQA 4HOJA 2DC5A 3DEXA 3RBTA 5HFKA 1O81A 4X43A 4K7IA 2OACA 3R2QA 1XW6A 1XVWA 4OO5A 1XCCA 2AAWA 4GRFA 1SJZA 5C04A 2EIRA 1O85A 1HNAA 2IFQB 4NV5A 4OFMA 4XHMA 2C3NA 1XWAA 3TJBA 2LTKA 4RI7A 1ZOFA 3HCZA 4ZXGA 5CRWA 2GSRA 5B7CA 1E2YA 1B4PA 2X64A 1EV9A 2G0FA 4HQSA 2GZZA 1TKDB 3V1WA 2OJLA 3BJ5A 3CBUA 5JCWA 5IO2A 1EEJA 2LQQA 4I2TA 2VLVA 4TR0A 3L9VA 4MABA 2CA8A 2VM1A 3BOAA 2LJAA 2K18A 5D96A 3HVXA 2KUCA 3IA1A 4ULXA 4ZB8A 1G6WA 3F3RA 2A2RA 2CV4A 2YANA 6GSTA 1DBYA 1ST9A 2QC7A 4KSOA 4O7HA 3W8JA 4IP1A 1YEPA 1XWGA 5D9WA 3GUSA 4MF5A 1LJRA 1C72A 2PGTA 4EE0A 3WYWA 3BBYA 5IMVA 4FO5A 5EY6A 1GTUA 2O85A 3I9V2 3CTFA 3F6FA 2CVKA 2D2ZA 1EGOA 1B8XA 5A4UA 1EWXA 4PURA 4G10A 3D4TA 4ZB6A 5JWRB 1UN2A 1NM3A 4J2FA 4DEJA 1ML6A 1WP0A 3GKNA 2HXKA 4IELA 3VURA 4ECJA 1K3OA 1XFLA 5CYYA 5JCGA 3ZMLA 1EOHA 1OE7A 3IR4A 5ECKB 1XPVA 4Q5QA 3A2WA 1AW9A 2H72A 5ENUA 2FA8A 5EVOA 1F37A 2GS3A 4QQ7A 4K9ZA 3LXZA 3MDKA 2HSYA 4I6XA 4ZIJA 2YCDA 4O32A 4EL1A 4V2LA 5GAND 3HJPA 4NHWA 4ZB9A 2F8FA 2H73A 5E4WA 4BL7A 3E3EA 1PX6A 3GKMA 4XIHA 1ILOA 1JZDA 4LA1A 3HVSA 1SL2B 1AXDA 2VL2A 2LQOA 1Z7PA 4TOPA 3G7YA 1CQHA 3IC4A 3L0HA 3CSIA 4MLYA 3HZ8A 3CYNA 2MMAA 4MPGA 4POBA 4XS4A 2B5XA 2YN1A 5GZZB 4KDYA 3LQ7A 3UL3A 5IPGA 3BCIA 3QFAC 2E2GA 3GRXA 2OA7A 1GUKA 4BPYA 4HU9A 5GSTA 1PKZA 2C4JA 3GKXA 6GSVA 4BWQA 3F8UA 1G0TA 14GSA 3M3MA 1TK0B 1PL1A 5J9CA 2HZEB 3HYPA 1XZOA 4YAPA 2V41A 2RIIA 3IPZA 3KM6A 3U6VA 4I97A 1GWCA 4GWRA 2H1DA 1BQ7A 4MZCA 1X5CA 3F0IA 1FHEA 2LSTA 1K0DA 5DALA 3GFKA 3D4MA 2L5LA 4QL7A 1FB0A 1VGLA 4FYBA 4HS1A 2DLXA 1MD4A 4NPBA 1F3AA 5ECQB 1GTAA 1PKWA 2OBIA 1WE0A 1T4ZA 1K0MA 1ERUA 2I81A 3IHQA 3KMOA 3Q18A 4DVCA 2NTOA 2JSYA 5G1LA 1O8XA 3F63A 5ECHB 4XCSA 2AB6A 2VIMA 4IN0A 3M9JA 4POLA 5B8BA 3FKFA 5IMZA 3FR9A 2IMFA 3TKRA 2YP6A 2JZRA 1XWBA 1XW9A 4MCUA 3LG6A 2I9HA 1S3DA 3I69A 3SBCA 1T7PB 4V2MA 2K9FA 1A2MA 1X9SB 4IKHA 5A5KA 4PQHA 4XRDA 2X99A 4XS4B 1M2BA 4YQMA 5AN1A 1JZRA 2PERA 5J9BA 4D73B 1OC9A 3MWHA 4WR4A 5KN2A 2BJXA 3HJOA 2FA4A 1JFUA 3H8QA 3US3A 2ALBA 3ME8A 1A2LA 2J9HA 4TR1A 2JZTA 4TR3A 5ECPB 3RAZA 4LMWA 2DMMA 3ZREA 3GV1A 5AIVA 1Q4JA 2FWEA 2R2JA 2VL9A 2HFDA 2XPEA 3HY2A 3ERWA 4GLTA 2HYXA 1QXHA 4KAEA 2H0HA 2GQKA 3HHVA 2HI7A 1R26A 4PNFA 5C00A 3G9BA 5DALB 5CO3A 1U3AA 4QL9A 2GSTA 4YQUA 2B1KA 5A4WA 4KE3A 5KN3A 2C0FA 2YWOA 3F4SA 1BX9A 4MA9A 3GIXA 1F3BA 4ZL8A 1M0UA 3TB2A 1ERVA 2JL4A 1QGVA 4ML6A 2IMIA 1QMVA 1V2AA 1QFNA 3FEUA 1NHYA 4YH2A 1O73A 2EIOA 4EC0A 2KP1A 2N5AA 1V58A 3GA4A 1XOAA 3C8EA 3GTUA 1W89A 2AJQB 5LD0A 3VI5A 1TI1A 4I8BA 2H6YA 2F51A 2J23A 3VPQA 4OCEA 2DJ0A 1KTEA 1TRUA 3D6IA 3ERGA 4WF4A 1X5EA 5ECSA 4LMVA 5IPHA 4GSNA 2QGVA 6GSYA 2VD0A 2PN8A 3W6GA 3TRPA 4JRRA 1F2EA 2IJYA 4IW9A 1FW1A 5D9TA 3UEMA 2V2GA 4IJ3A 2GT6A 2V32A 1OC9B 5DBQA 3TDGA 4IBPA 4JBBA 2PVQA 1OC8A 4HUAA 2L57A 1UA5A 4HI7A 2R3XA 1O6JA 2MMNA 4NMUA 4TVEA 4PGTA 1VF3A 4G9HA 4TR1B 6GSSA 1TK8B 4KW6A 11GSA 1YF1A 4NV2A 2ZNMA 1AQXA 5HFGA 5A4VA 3DRNA 3QAWA 18GSA 1PL2A 2GSSA 2ES7A 2WFCA 3TCOA 1V98A 1PD21 5G5FA 1VF4A 1PSQA 2VO4A 5AIXA 4EUYA 2I3YA 5B8AA 3Q74A 3DYRA 4HQZA 2VLTA 4CHSA 2BMXA 3GL5A 2B5YA 1SK2A 3LYKA 1AUCA 5LNKe 1E6BA 2GTUA 3APSA 3QDNA 1PRXA 1YDKA 3GTUB 3HD5A 2LKUA 2VCWA 3TKSC 1O7UA 3HVVA 5HR1A 1SKRB 1XOBA 2GT5A 4TKYA 4XS6A 4OCFA 2A4VA 2HZFA 3KZQA 2OBKA 1M99A 1T8EB 4IP6A 1WMJA 1T4YA 2YZUA 1OKDA 2K8VA 1G6YA 2RUFA 4KB3A 1A0RP 5CRHA 1ERTA 3KH9A 4L8EA 4ID0A 4ML1A 2VCTA 1QK8A 5HR0A 1ZZYA 1NW2A 4IQAA 1A8LA 1GUHA 1VF1A 1B9XC 3IAM2 3I6AA 1WRYA 4OFNA 2WGRA 3DVXA 1H4OA 2YNXA 2B5EA 3L9UA 1QUWA 1OC3A 1WJKA 4MJAA 3DMLA 3K8NA 2DJKA 3QOUA 4XTSA 8GSSA 3IK9A 4V1Ag 2P5QA 1M9BA 1S3CA 1MTCA 1R7HA 1SL1B 1A2JA 5ABRA 5DJLA 4FIWA 1GRXA 4IHUA 2VAFA 5DDLA 4RQXA 4IGJA 4HJMA 2AYTA 2C0GA 4KSMA 3O76A 4BVXA 1GH2A 3CRUA 3KTBA 2HSHA 2GQMA 1Z6MA 4KX4A 1U88A 2QKEA 2N5BA 3H4KA 2KOKA 4L0WA 3WGDA 1N2AA 4DSRA 3PINA 2VCZA 4JR6A 1J9BA 4AJ7A 3TJJA 3IRAA 1DE1A 2YV9A 5F06A 1GLQA 4JU5A 3UOMA 2IN3A 4TRXA 2WZ9A 3IAS2 2LJKA 1SU9A 3E9JB 2LRTA 4MJCA 3GHAA 5IIZA 1PMTA 2X8HA 2N5FA 5HQPA 3KGKA 4HU7A 5F8BA 1F6MC 1V40A 4N30A 3ZITA 4O92A 4ECIA 2HRNA 3LJRA 1GSDA 1SKWB 3O3TA 3APQA 4F2IA 3BD2A 2DJ3A 2LV3A 2WB9A 1RQMA 3A3TA 3FZAA 3VWXA 2DIYA 1SJIA 3IOSA 4K0NA 4NWYA 5G30A 1GSQA 3VPTA 4MMMA 2H6XA 4GCIA 1THOA 1BEDA 4PUAA 4IVFA 1SENA 5AISA 3TJFA 4L5OA 2O8VB 1J0FA 1B9YC 3HDCA 2XPDA 2VUPA 3TOUA 2IIYA 2K8SA 1YKAA 5FHIA 1GSUA 2M80A 3J7Yk 4E8HA 1VRSD 2H1BA 2M46A 3CSHA 3ZVJD 1SD8A 3UVTA 4TXOA 3L9SA 2C1YA 5H5SA 1Q98A 4F0CA 2VCVA 1Z9HA 1SL0B 3IDVA 3WT2A 1A8YA 1GSYA 2ON7A 3LORA 2R37A 2GDRA 2HNLA 3ZTLA 1K0AA 2RUEA 3N9JA 5AGYA 3VK9A 6GSWA 5F0GA 3UBLA 4OFTA 4ZL7A 3VWVA 3UBKA 1Z3EA 5D93A 3EC3A 1ON4A 2DJ1A 3C1RA 1K3YA 3O6TA 1Y25A 2A2SA 1TW9A 3DWVA 1ACVA 3C1SA 2P5RA 4AJ8A 1PA3A 2QSIA 1JHBA 1XIYA 4GSTA 2YWMA 5CRGA 1WPIA 3QFBC 1WOUA 2LJRA 3IK7A 3S9FA 1OE8A 1TRWA 2EC4A 3ZVJA 1FAAA 3MAKA 2XHFA 2AUVA 1NSWA 3FRCA 3FHKA 3TKSA 5DQSA 3G7JA 1XBSA 2K6VA 1F9MA 4N0ZA 4EO3A 3GX0A 4EDZA 2DJJA 3F4RA 3KTLA 4MZWA 10GSA 2ZUPA 1GP1A 2WS2A 2LRCA 3DKSA 1AC1A 4ZILA 4HJ2A 3LWAA 2H1AA 1ZGNA 2H1GA 1FB6A 4IJIA 1MDIA 1OVNA 1JZOA 2I1UA 3UARA 3CRTA 1T00A 1M7TA 2FWHA 4OMVA 1EP7A 2YWIA 4WBJA 1A24A 1EGRA 3UJ1A 5D9XA 5COHA 2BTOT 2GZYA 1JZWA 1AQWA 1IYHA 4JE1A 3EURA 3E0UA 1U87A 2DIZA 4N0VA 5JWOB 2F9SA 4TXOB 3A5WA 2OE3A 3TKPA 2FNOA 1Y6EA 5G1KA 3TRQA 2IWTA 4Q5FA 3TUEA 4F9ZA 2B7KA 1X0RA 3NZNA 3WT1A 4YQVA 4HEA2 1T1VA 2FLSA 2GLRA 4KCEA 3H1NA 3KP9A 1DUGA 2H0GA 4G19A 4JEDA 3TOTA 4XS1A 1EOGA 5HR3A 3LSZA 5ECIB 3UVHA 2TRXA 2TRCP 1IYIA 3QAGA 3U5RE 4CDOA 3D22A 2MMOA 4WETA 5H5QA 1SYXA 2CZ2A 1B48A 2MZCA 1X9MB 5JCUA 3ZRDA 1Z7RA 1TU8A 3GSTA 3Q6OA 4Z7XA 1AAZA 1TJDA 1VF2A 3M9KA 4POMA 2FCHA 13GSA 3IBHA 2VL3A 2JSZA 1TTZA 3KIJA 2B6MA 2H6ZA 1TDIA 4JR4A 4K0GA 4GXZA 3ERFA 2F8AA 1M2DA 4V1Ap 2P0GA 3GN3A 2IFQA 4N11A 1FG4A 4WXTA 3P90A 3LFLA 2L5OA 1TI3A 1ZYQB 2L4QA 1U3IA 1KEBA 3FZ5A 2PWJA 2CZ3A 1W4VA 1TRSA 2AV4A 2JZSA 5IO0A 2TIRA 3PR8A 4KDXA 4ZBDA 4POKA 1HQOA 2KHPA 1ZYEA 1K0BA 3CXGA 2OE0A 1CQGA 1FO5A 3FK8A 3FR3A 2NDOA 4BA7A 3KEBA 3VLNA 4F0BA 1FVJA 4MPFA 3I43A 5G2ZA 4BVYA 2X8GA 3NOFA 4GSSA 3P2AA 3HZ4A 2RLIA 5J41A 1NHOA 4KCAA 2FUG2 3DIEA 3QD9A 4WF5A 4PUFC 3ZL5A 3QR6A 4ACSA 2IMKA 5ECMB 1UVZA 3GH6A 5B6NA 1J08A 3KD0A 5ID2A 3EVIA 4WBRD 4KA0A 4KNDA 4WR5A 1RK4A 3LXTA 2Z9SA 1M2AA 2PVOC 4KGIA 4KUNA 4MP4A 4TW5A 6GSXA 5ECNB 2KLXA 2WULA 4J57E 4NXIA 5CP1A 1JLVA 1JLWA 1BYEA 3CTGA 3RHBA 4ZBAA 5LCZA 5IM9A 2E2MA 1AIUA 3KJYA 3ZIVA 4PQIA 4LL1B 2WCIA 1I9DA 4KDUA 1XVQA 7GSSA 5FWGA 5G31A 2YZHA 5DCGA 2HLSA 1WIKA 2PPTA 2C0EA 2L59A 3PGTA 1S3AA 1TP9A 2DBCA 3NIVA 2KP2A 2JACA 2NPBA 2PU9C 5IQYA 4JZQA 2CQ9A 1N8JA 3HKRA 3IE3A 3DD3A 3GKKA 1GNWA 2C8UA 5CNWA 5DAKA 3F3QA 1YKCA 2V6OA 1GTBA 1U6TA 3FR6A 1TK5B 4RQRA 3IV4A 1GL8A 1DSBA 2E7PA 2GVPA 2IPAA 4PXOA 3A2VA 5J4UA 1YQ1A 12GSA 4OO4A 5GAPD 3ZZXA 2CVBA 2OADA 1MD3A 3KXOA 3FZ9A 5DQYA 4V2NA 3ED3A 2VM2A 1K0CA 4L5LA 4MK3A 4RUVA 1G7EA 4DSSA 4J56E 3QAVA 4K1FA 1OAZA 3DXBA 3D21A 4F03A 5GSSA 5KN0A 1YZXA 3MSZA 1YEXA 5ID2B 1PX7A 3RPPA 1K0OA 3PH9A 5HR2A 2DJ2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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