4MJBA

Synechocystis sp. pcc 6803 glutaredoxin a-a79s
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
99
structure length
99
Chain Sequence
MRGSHHHHHHGSAVSAKIEIYTWSTCPFCMRALALLKRKGVEFQEYCIDGDNEAREAMAARANGKRSLPQIFIDDQHIGGCDDIYALDGSGKLDPLLHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Utility of Synechocystis sp. PCC 6803 glutaredoxin A as a platform to study high-resolution mutagenesis of proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Probable glutaredoxin ssr2061
molecule tags Electron transport
source organism Synechocystis sp.
total genus 30
structure length 99
sequence length 99
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4mjbA01
4TRXA 5DDLA 2XBQA 4CDOA 4N30A 1YF0A 2H76A 2YNXA 2VIMA 1A8LA 4NV2A 3G7JA 2C0FA 1PSQA 4L0WA 3CXGA 3BD2A 3ZMLA 5G31A 2O87A 1U3IA 7GSSA 5D9TA 2LKUA 2RM5A 2D2ZA 2JACA 4NWYA 1RQMA 2M72A 2KLXA 1XWBA 3E9JB 3LEFA 4HU7A 3ZFLA 3Q74A 4LA1A 1K0AA 1VF1A 2P31A 2RUEA 3GFKA 5KN3A 4FYUA 1ACVA 4ZBAA 2MZCA 1ABAA 2VCQA 3D4TA 4G10A 3QFBC 1Z9HA 1GLQA 2FUG2 4FYBA 1PX7A 4TR0A 4TR3A 3GN3A 2AYTA 2H1DA 3KD0A 2YV9A 2EC4A 1U6TA 2HSYA 4KDYA 4K7NA 4POMA 1WJKA 3KZQA 4F0CA 4HOJA 2OJLA 5FT3A 4ZXGA 3TGZA 2RUFA 2KOKA 3A3TA 4MJAA 4XS1A 2R4VA 3HVSA 5LD0A 4KNDA 4AJ8A 1GLPA 2TIRA 1XWKA 4LMVA 3IE3A 3DVXA 1OYJA 1G0TA 3A2VA 4YQUA 4HJMA 2OBKA 1R7HA 1Q4JA 1WWJA 2GDRA 2LSTA 1XVQA 3RPNA 2YOIA 5A4UA 4PQIA 3DYRA 1X9WB 2VLVA 1OC3A 4V1Ap 2GVPA 3LGCA 1GSFA 1YZXA 2GQMA 1M99A 3MNGA 4EVMA 1B9XC 1TDIA 5C04A 1OE7A 4ECIA 2IL3A 3F3RA 1EWXA 1F2EA 3W6GA 1XCCA 1TP9A 3F4RA 2H72A 1OKTA 4ISDA 5JWQB 2FY6A 2PPTA 3EC3A 1GSUA 1HNBA 2L59A 3ZREA 1B4QA 3GIXA 1MDKA 3DXBA 3ZFBA 1NSWA 3ZRDA 2OE1A 3OR5A 1O81A 4MA9A 2LS5A 2NVLA 2DJ0A 3F6DA 1A0RP 3F63A 3APQA 1R26A 4TXOB 2I9HA 4EE0A 3ZTLA 4L5OA 4RQXA 4K8MA 5G5EA 1RK4A 1A8YA 2DJKA 1B48A 3H1NA 2F3MA 4EF0A 4OFNA 5IMCA 3L0HA 5B6NA 4I6XA 3O6TA 2V41A 3GX8A 2E0QA 1XZOA 2VCZA 2GQLA 3SBCA 5DQSA 2V32A 2H1BA 2C3TA 3ZIJA 1K3YA 1G7OA 4V1Ag 2B3SA 2TRXA 1EOHA 1R4WA 3LYKA 4WBJA 3MWHA 5CRDA 1YEXA 3TKPA 2IMDA 2F8FA 3U6VA 1EV4A 4L5LA 1F6MC 2DMLA 1GNEA 1Z7PA 1LU4A 5JCGA 5IMDA 2HE3A 2B6MA 1AC1A 1SD9A 1YEPA 3LG6A 4LLRA 5FWGA 1ZYQB 2H1GA 4GCIA 2H6ZA 2JADA 4DSQA 5J9CA 4HJ2A 3WT2A 1SL2B 3APOA 3ERGA 3FW2A 1S3AA 5G2ZA 3GKMA 4GQCA 5DCHA 1EGOA 1OC8A 3VWXA 3APSA 2CVKA 4BWSA 3ERWA 3NIVA 4PX1A 1SYRA 3I9V2 2V6OA 4WBRD 1GSDA 2GZPA 1PMTA 2JZTA 2V1MA 3VPTA 3W8SA 4NHWA 1GUHA 1JZDA 3GH6A 3RHCA 4I2TA 3LQ7A 3ME8A 1SKSB 3KP9A 3D6IA 2GT5A 4ECJA 2EIRA 1S3CA 2RM6A 2L6CA 3DWVA 2GT6A 4TW5A 2YV7A 2R2JA 2VL3A 2I81A 1M2DA 3IPZA 3LYPA 5ECRB 4IQAA 2JL4A 3NOFA 1XOAA 4BWQA 2I1UA 5INYA 2YWMA 3UBKA 2FWFA 5CREA 2N5BA 3VLNA 4IJIA 3FK8A 3I69A 4EC0A 4POBA 2XPDA 1Z5YE 1J9BA 2LJAA 4K7IA 4GSTA 4ZL7A 1RW1A 1GSSA 4Q5NA 3IV4A 5IO0A 1XW6A 1A24A 4IGJA 4ZL8A 1V98A 4MMMA 1B8XA 1XFLA 3EMPA 5F06A 5KEJA 1Q98A 2C3QA 3R2QA 4ACSA 2YN1A 4J57E 5HR3A 3GSTA 1WMJA 3TKSE 3H79A 3I6AA 4PUFC 14GSA 4IP1A 2MMNA 6GSVA 5A5KA 2C8UA 3LJRA 1DUGA 3WGEA 4MABA 2H8LA 4OMVA 1PD21 4BL7A 3QDNA 4WR5A 1MTCA 5E4WA 2K8SA 3KTBA 3TKSC 2LRTA 4MH3A 1KTEA 2H1AA 4JR4A 1OKDA 4FYCA 3P90A 1FOVA 4FH8A 1JZRA 2R3XA 3EWLA 1IYHA 17GSA 2CVDA 3QD9A 1DE1A 1BYEA 1J0FA 5A4WA 1UVZA 1M7TA 3TKQA 1A0FA 1GTBA 2GSSA 2IFQA 3UEMA 5HFGA 1T1VA 3HZ4A 3RAZA 3FZAA 1I5GA 1UC7A 4ECBA 1X5CA 5EY6A 1EP8A 4QL7A 3TDGA 4BA7A 3CMIA 2YWNA 5IPGA 2X8HA 1KBNA 1SK2A 2JSYA 2YWIA 3UAPA 1ZMAA 3U5RE 3H8QA 4QQ7A 3UBLA 1AQVA 3TOTA 4MLYA 5IM9A 3ZVJA 1WE0A 3L9SA 2YWOA 5DALB 4CW9A 5GSTA 3RPPA 2B5XA 1XWAA 3JCML 1E2YA 3TOUA 3IA1A 2GQKA 2GSRA 2F8AA 1SENA 2F51A 4MF7A 13GSA 3GH9A 3HXSA 5AGYA 1W89A 3M8NA 1FG4A 2P5RA 2PVQA 3EU4A 4HQZA 2B5YA 2AAWA 3KP8A 5DBQA 1QMVA 1M9AA 1AQXA 4MP4A 1AUCA 4KGIA 4DVCA 1OAZA 3KJYA 4MZBA 1JZWA 4RI7A 2IPAA 5DJMA 4WETA 2H19A 2VCVA 4ZBBA 2VL2A 2IIYA 3FRCA 2VLTA 2LRCA 2ON5A 4PNFA 2CT6A 4GQFA 2O7KA 3N5OA 2JZRA 4KDXA 6GSYA 5CRGA 4F0BA 3H93A 2XBIA 3FZ9A 2HLSA 4L0UA 4KSOA 1B4PA 4TR1A 4WF5A 1MDJA 3L4NA 4I8BA 3KIJA 1PA3A 1PL2A 2L5OA 2XHFA 5HFKA 2LJRA 1SJIA 1BG5A 3TJBA 1FHEA 3NZNA 3F6FA 1QGVA 4N10A 3QPMA 1SL0B 4HZ4A 4BVXA 1XWCA 2V2GA 3J7Yk 3WD6A 4JBBA 2MMAA 2CX3A 4E8HA 3HKRA 1VF3A 1QQ2A 1NW2A 3VPQA 2QSIA 2A4VA 2KUCA 3S9FA 2VM2A 5DCGA 1PKZA 4XCSA 3TJFA 2LTKA 2VM1A 2WFCA 3TJKA 2ZUPA 5KN0A 20GSA 2C0EA 1ZOFA 2L4QA 1HNAA 3GHAA 5KN2A 1XBSA 2Z9SA 1GWCA 4ZB6A 5HR0A 3TKRA 4GF0A 4KA0A 2K9FA 2WRTA 4GSNA 4NHZA 5ABRA 1F9MA 3M0FA 4I2UA 4LMWA 3GNJA 2LJKA 2FD3A 3GYKA 5D9XA 2LQQA 2J23A 3EE2A 5IOWA 1N8JA 2H6XA 5IMAA 2GZYA 3PR8A 3C7MA 1PRXA 3HJPA 2H0HA 4ML1A 3E0UA 5D8IA 5ELGA 3QAWA 2OE0A 2F9SA 4IELA 2CQ9A 4MJCA 4N0ZA 2PU9C 1F3AA 1GP1A 1T4YA 2C0GA 4WXTA 4POLA 5IPHA 1TJDA 1TRVA 5ID2A 4BVYA 4O32A 3DMLA 2IMFA 1U88A 3EMXA 4GSSA 2WCIA 5LCZA 1TK8B 1X9SB 2PUKC 4NV5A 1O6JA 1CQGA 3HY2A 5F07A 1SK0A 1SJZA 2ON7A 3BBYA 2LNSA 4IS0A 1ILOA 6GSUA 3WYWA 2OACA 3ME7A 3G7IA 1A2JA 1FAAA 1MD3A 4KB3A 3HA9A 2AHEA 3A2XA 2PN8A 2CA8A 5G1KA 2R6KA 1SJ6A 2ALBA 3CTFA 6GSTA 4IVFA 2A2RA 2IWTA 1TOFA 2N5AA 2C1YA 2O8VB 1T00A 1T7PB 1DSBA 1TI3A 2GSQA 1K0CA 4IW9A 3VI5A 4O7HA 3FYGA 3HDCA 1F3BA 1OVNA 3P2AA 1AIUA 1OE8A 1H4OA 1TRWA 1K3OA 3GURA 1ZZYA 2WJUA 9GSSA 3LWAA 5CRHA 1O85A 5DAKA 4HQSA 3HJOA 3RBTA 4X0XA 4G9HA 1NHOA 1U87A 1G6WA 5IIZA 2H71A 1GTAA 4J56E 2MMZA 3UIWA 1O8WA 2PVOC 5F05A 3QFAC 3IRAA 3D22A 2FLSA 3LFLA 4JZQA 1K0DA 2L5LA 4Q5QA 2WDUA 1GNWA 2CX4A 4NMUA 5CRWA 3J7Yb 3ZL5A 3GRXA 2G2QA 3CRUA 5CNWA 3HHVA 4PURA 2OE3A 3ED3A 5AIXA 3C1SA 5F8BA 5A4VA 4EL1A 4CHSA 1TK5B 4KSMA 1TRUA 2X8GA 2HZEA 4DEJA 4MJEA 3P8WA 3F3QA 1VF2A 2H0GA 3ZZXA 1G7EA 1YDKA 1N2AA 4NPBA 1DE2A 2WZ9A 2KP2A 1NHYA 3HZ8A 4BPYA 3F9UA 4MPFA 5AISA 5D93A 3IDVA 3D0ZA 1K0NA 5DAKB 4NAXA 3O76A 3IXRA 1GULA 2TRCP 1ZYEA 5ECSA 1UN2A 1B9YC 2QKEA 3L78A 3FZ4A 3L9VA 3H4KA 4G19A 4O92A 2FWHA 2H01A 2VD0A 3BOAA 1F37A 2DJ2A 3VWUA 3ZLPA 1K0MA 1W4VA 3PINA 4JU5A 3UL3A 5DJLA 3D5JA 1AXDA 2L57A 5GSSA 1ON4A 5EPFA 3DIEA 3UVHA 1PX6A 3EYTA 1TU7A 1X5DA 3ZYWA 2HZEB 3IC4A 1V57A 4OO4A 2CZ3A 3A2WA 1WP0A 1LBKA 1M0UA 5ECHB 4TVEA 4MCUA 2M46A 6GSWA 1YKCA 2PMTA 4MF6A 2MBSA 5ECLB 1GSQA 4TR4A 1Y25A 1O8XA 3QOUA 2C80A 4MF5A 4RQRA 4HI7A 3AY8A 2PBJA 3RDWA 1AW9A 1XOBA 1USBA 1ZGNA 4EO3A 4RI6A 2HXKA 1EOGA 1QK8A 2GLRA 3GV1A 4J2FA 2IMEA 4Q5RA 1MDIA 2PWJA 1SK1A 3C8EA 2HRNA 1HNCA 1ST9A 3C71A 1FO5A 3FR9A 3VK9A 4OCEA 1K0BA 2P0GA 1U3AA 4PUAA 1K0OA 4PGTA 3M9JA 5IMZA 10GSA 3KMOA 4D73A 2FWGA 3EINA 1Z6MA 1JZOA 5COHA 4DSSA 4E8EA 3FR3A 3VFIA 4ZBDA 1S3DA 5C00A 4PNGA 1PKWA 5JCWA 3Q19A 1JLVA 3LORA 1V40A 3FY7A 5J9BA 5ECPB 4LL1B 3DKSA 4ECCA 1QUWA 1WIKA 2IMIA 1PN9A 1GH2A 4XS4A 4GRFA 2C3NA 5EVOA 3FZ5A 5D96A 1YQ1A 1O73A 2YCDA 3GKXA 4F9ZA 1BAYA 6GSSA 4YAVA 3GKNA 4WKWA 2CAQA 5GAND 4OO5A 3Q6OA 2H74A 3VI7A 1HD2A 2WS2A 4K0NA 3TKSA 2AB6A 2YJHA 3CSHA 5DVBA 3KTLA 2M80A 1YKAA 1XVWA 2YJ7A 5D9WA 1X0RA 2KHPA 1QXHA 2G0FA 3DGQA 2HFDA 3IOSA 2I3YA 5JWRB 2LUSA 3KH7A 2K8VA 4IBPA 4EUYA 5B7CA 2RIIA 2B7JA 2IFQB 1FVKA 5DQYA 3ZMKA 1GTIA 3IHQA 4N11A 2FCHA 2J9HA 4TKYA 1UA5A 1E6BA 2DIZA 4X1UA 16GSA 2PERA 1VRSD 4IKHA 1V2AA 4JR6A 3ZVJD 4V2NA 2DJ1A 5AIVA 4GWRA 2ES7A 3L9UA 2LV3A 1TXXA 5B6MA 3TRQA 5JCUA 1TW9A 5J3RA 1ZCPA 1J08A 2X99A 4I5QA 2QC7A 6GSXA 4K6XA 2YZHA 3ERFA 3HJMA 3GL3A 2X64A 5EL8A 1OC9A 4MJBA 3TJJA 1GTUA 2FNOA 1XW9A 1ERUA 2GS3A 2H0IA 1TRSA 2DIYA 2IN3A 1GSEA 2WULA 2H6YA 2DMMA 3F8UA 3TJGA 4JRRA 3GMFA 5IO2A 3IK7A 2AV4A 4MZWA 4PXOA 2EIQA 1R5PA 2E2MA 3QAVA 1Y6EA 4EXJA 3GUSA 5B8BA 3WGDA 3WGXA 4LL4B 1LJRA 3SWLA 2V6KA 3IBHA 3UMAA 4K0GA 5H5QA 2H30A 5H5SA 1XWGA 2L6DA 2CZ2A 4HEA2 1H75A 2HRFA 1GRXA 3FEUA 4K2DA 3E3EA 3BJ5A 2HNLA 3C73A 4PQ1A 3TCOA 4XRDA 2CV4A 4TR1B 4HZ2A 3ZITA 4GXZA 4IQ1A 2O89A 5FHIA 1XW5A 4G2EA 3LXTA 3EU3A 5GZZB 1ERVA 4TXVA 4YQVA 2VL9A 2BTOT 4K1FA 4TXOA 2ZNMA 3QR6A 4WF4A 1WOUA 2REMA 2FA8A 4WR4A 4X43A 2R37A 4K7OA 3HYPA 3G9BA 3G7YA 1TK0B 5CAXA 3EVIA 4AF2A 1OC9B 2DJ3A 4EDZA 1FVJA 2R5GA 4XHMA 3N9JA 2DSAA 2VO4A 3TRXA 3PGTA 3QMXA 3FKFA 5D9VA 5L71A 3M1GA 2I4AA 4K9ZA 2VLUA 2VD1A 2A2SA 3IK9A 2K6VA 4JEDA 3IR4A 4HDEA 4HU9A 2ZCTA 2LRNA 2DC5A 1PQNA 5HQPA 1THOA 4F03A 1EEMA 3IAM2 2YP6A 4MDCA 5HR2A 4N0VA 1C72A 5CYYA 1GUKA 3KMNA 2GZZA 5HFIA 4AJ6A 5CO3A 2WB9A 2FWEA 4ZB8A 4DSRA 5LNKe 1G6YA 3CTGA 3GTUA 1BEDA 2YPMA 1URMA 3UVTA 2B5EA 1PGTA 2AUVA 2EIOA 2FGXA 1WPIA 1JHBA 1M9BA 2DJJA 2GTUA 2E7PA 2C4JA 1JLWA 3RHBA 1M2BA 2H70A 1EP7A 1EEJA 2CAIA 2VCWA 4XTSA 3HCZA 2VAFA 1IYIA 3BCIA 1ERTA 1XIYA 3GSSA 1TKDB 3IAS2 1SU9A 5ECKB 2PGTA 2BMXA 5ID2B 3PH9A 2X8CA 2LQOA 2IJYA 5H5RA 1HQOA 4KX4A 3V1WA 5F0GA 1NM3A 4GTUA 3MSZA 1K3LA 2K18A 2BJXA 2H66A 3DVWA 4KCAA 4MZCA 4V2LA 4WEYA 4HUAA 4F82A 5G5FA 1A23A 4ID0A 1KEBA 1PL1A 4O5RA 4YQMA 3ISOA 1V58A 1YY7A 3F4TA 4KAEA 2P5QA 11GSA 1WRYA 3MDKA 1VF4A 8GSSA 3GTUB 4FIWA 1T3BA 5J4UA 3LSZA 5ECIB 1SKRB 1CQHA 1GL8A 1MD4A 4AJ7A 3TRPA 1KNGA 2HI7A 3M9KA 2YANA 1BX9A 2B7KA 2E2GA 4XRAA 1YJ6A 2WGRA 4GLTA 4OFTA 5G30A 1V9WA 1AQWA 2JU5A 2GSTA 1EV9A 3TUEA 1BJXA 1GSYA 2HSHA 4OD7A 3UARA 1X9MB 4ZL9A 3GKKA 2LNTA 3CRTA 5ECMB 22GSA 3GA4A 4QL9A 3F4SA 3D21A 4IP6A 3EURA 5ENUA 1SL1B 1Z7RA 3QCPA 2B1LA 2FA4A 5IOXA 3UJ1A 18GSA 4YH2A 4IHUA 2NDOA 1SYXA 2H73A 4KDUA 1T4ZA 4TOPA 4IN0A 4ZB9A 3F0IA 2VCTA 1A2LA 1JFUA 3K8NA 3C1RA 4KH7A 3US3A 5J41A 3TB2A 3HD5A 1Z6NA 2DBCA 3VWVA 3ZIVA 2LEGA 3UOMA 4TN8A 4ML6A 4HS1A 4P3YB 2MYGA 2N5FA 1ML6A 1O7UA 4KW6A 12GSA 3A5WA 3HVXA 5ECOB 2NPBA 5DALA 1FB6A 3D4MA 1THXA 4MH2A 4I97A 4POKA 2XPEA 1M2AA 3CSIA 1TI1A 2DLXA 1EZKA 1Z3EA 3VWWA 1FB0A 1I9DA 4IJ3A 3KCMA 3MAKA 3Q18A 2KP1A 3W8JA 3KGKA 1VGLA 2NTOA 5ECQB 4YAPA 2IMKA 2MBTA 2NBSA 5GAPD 2C0DA 2B1KA 3KM6A 1GUMA 4OCFA 5D73A 5HR1A 1DBYA 1XXUA 1ZL9A 2VUPA 2OADA 2VL2C 1QFNA 3DD3A 3P7XA 4ILFA 4PQHA 2MMOA 3CYNA 4ZIJA 2L4CA 3KXOA 4KE3A 4Q5FA 2CVBA 3CSJA 1X5EA 2O85A 2OKAA 5ELAA 2OBIA 2HZFA 5IMVA 5ECNB 4MPGA 5G1LA 1EGRA 4EKZA 2OA7A 4V2MA 4EDYA 1A2MA 4RUVA 3DRNA 5CP1A 5AN1A 4H86A 3GX0A 5E59A 3WT1A 3HVVA 5JWOB 1R5AA 3BCKA 3I43A 19GSA 1TTZA 4KUNA 4F2IA 2YZUA 1TU8A 3LXZA 5IQYA 2JZSA 4MK3A 1XPVA 4OFMA 2GGTA 5B8AA 4ZILA 1AAZA 3CBUA 3KEBA 3O3TA 1BQ7A 1MEKA 2RLIA 4XS6A 3GL5A 3FR6A 2VCXA 3DEXA 4Z7XA 4NXIA 2AJQB 1HYUA 2HYXA 2FHEA 1T8EB 1SKWB 2XC2A 4D73B 4JE1A 5IMFA 1ERWA 4AGSA 4DSSB 2HT9A 2VOCA 4FO5A 1SD8A 3FHKA 5KN1A 4ULXA 1FW1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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