4MJCA

Synechocystis sp. pcc 6803 glutaredoxin a - p84r
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
99
structure length
99
Chain Sequence
MRGSHHHHHHGSAVSAKIEIYTWSTCPFCMRALALLKRKGVEFQEYCIDGDNEAREAMAARANGKRSLPQIFIDDQHIGGCDDIYALDGAGKLDRLLHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Utility of Synechocystis sp. PCC 6803 glutaredoxin A as a platform to study high-resolution mutagenesis of proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Probable glutaredoxin ssr2061
molecule tags Electron transport
source organism Synechocystis sp.
total genus 30
structure length 99
sequence length 99
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4mjcA01
2H72A 5DCGA 2R5GA 14GSA 5B7CA 2HSYA 5CYYA 3C73A 6GSVA 2AJQB 3TKPA 2VAFA 2CAQA 3A2XA 3QAVA 2F8AA 4MP4A 5CRDA 4MH2A 5ID2A 3FR3A 1U3IA 3GHAA 4OFMA 4WETA 4HUAA 3N5OA 5D9XA 1XWBA 5JWQB 1XWAA 1TK8B 2EIRA 2C1YA 2OADA 4HI7A 1PKZA 1GSQA 2CQ9A 1H75A 1PGTA 2XBIA 3M3MA 2HZEB 4X43A 1ZMAA 5DVBA 5B6MA 1G6WA 1TK0B 5HFKA 1C72A 1GTBA 2WRTA 3FK8A 4HOJA 3PH9A 3FR9A 4ULXA 5CRGA 4ZL9A 4KAEA 3H8QA 4MPGA 2CVKA 1PKWA 2DJKA 4PNFA 2OACA 1O8WA 2BMXA 3UL3A 3LORA 4HJMA 2VO4A 4BVYA 3O3TA 3KEBA 3QPMA 1B8XA 4HZ4A 2VLUA 2VLVA 3EYTA 4RQXA 2QSIA 1BJXA 4PQHA 2YV7A 1PX6A 2DJ2A 5DALA 1U3AA 3IOSA 4TR1A 3HA9A 1VF4A 1SYRA 3ZIVA 2H1BA 5F8BA 2H1DA 2C0GA 2J23A 4ZILA 4KSOA 3WGEA 1DUGA 5G5FA 1G7EA 2XC2A 2HXKA 2BJXA 4EUYA 4ECCA 4POMA 2HE3A 3GH9A 5KN0A 1A2MA 1N8JA 2VD0A 1V9WA 1UVZA 2HYXA 3GFKA 3A2VA 1SU9A 2KUCA 2LV3A 3ZITA 3APSA 2H70A 3KJYA 2FA4A 3QFAC 3HZ8A 2HFDA 3TJKA 9GSSA 3RHBA 1X0RA 3QMXA 2E0QA 1EEJA 3BCIA 2CT6A 3F8UA 3HJMA 1FVKA 1Z9HA 2YPMA 4GSSA 4JR4A 2N5BA 4AF2A 2LJRA 4OO5A 4HJ2A 5D73A 11GSA 3ZRDA 5A5KA 12GSA 2R37A 19GSA 2I3YA 4O7HA 3EWLA 4HU9A 2C3TA 1SJ6A 3ZL5A 3HVVA 1I5GA 4PXOA 3HVXA 4YAVA 3L9VA 4IN0A 5GZZB 2XBQA 3WT1A 4K1FA 3EMPA 1GTIA 1V98A 1EWXA 2JZTA 4GWRA 2GSSA 5ECIB 5IOXA 3W6GA 2H66A 1PL1A 2JSYA 3GSTA 1T4ZA 5EVOA 3LJRA 4FH8A 2R3XA 4EO3A 5LNKe 1HNAA 4ZB8A 1B9YC 1TU8A 3W8SA 3TRXA 3C8EA 4TXOA 3DVWA 2IJYA 4F82A 1GL8A 1FB0A 4WF5A 3PGTA 2VIMA 4XRDA 2NBSA 2ES7A 2R4VA 1OAZA 1HNCA 5ECRB 4XRAA 5DDLA 3L0HA 4LLRA 3PINA 5B6NA 4XHMA 4FO5A 3F6DA 5F05A 2A4VA 2C3QA 2I81A 3GH6A 4MJEA 4KGIA 1K0NA 1DE1A 2Z9SA 4ZB9A 4IQ1A 2XPDA 1FB6A 3KIJA 1M9BA 2B3SA 5H5SA 3ZTLA 2H0GA 17GSA 4NPBA 5DQYA 3CMIA 2FLSA 1BEDA 4JU5A 5DJMA 3D6IA 2ZNMA 1FVJA 3TKSE 4PX1A 4K7OA 4DVCA 3WT2A 4EVMA 4NV2A 3C1RA 4WEYA 2P5RA 1K0BA 5IPGA 4L0UA 1J08A 1Y6EA 2VOCA 2K8SA 1FW1A 1SJZA 1IYHA 2FUG2 3GL3A 5JCUA 4NAXA 3US3A 2FCHA 3GKNA 3LQ7A 3F63A 2L6CA 4K0GA 1JFUA 3UOMA 2K6VA 2DMMA 4MMMA 3VWWA 5HQPA 2H6ZA 3D0ZA 1A2LA 3UARA 3QD9A 3CTGA 1SKRB 1OC9B 1XCCA 2YANA 3LSZA 1XVQA 2CA8A 1QXHA 1S3CA 2WDUA 2VCQA 1FHEA 5ECOB 4QL9A 2DMLA 5D8IA 4KW6A 4L8EA 3WGDA 3I9V2 3WGXA 2I4AA 4PUAA 4IBPA 3GKMA 1SKSB 3I43A 4K2DA 3DYRA 4PUFC 3NOFA 3PR8A 2GQKA 4PQ1A 2H01A 1X9WB 3M1GA 2L5OA 1HQOA 1HNBA 3H79A 5B8AA 4GQFA 1SK2A 3L78A 3QAGA 2RM6A 2LS5A 4RUVA 2IMEA 5KN1A 1K0DA 3VPTA 2H8LA 3FY7A 3IK7A 1I9DA 1WRYA 1F37A 2JACA 4DSSA 5J41A 3EE2A 5KN3A 2LNTA 6GSSA 3KH7A 6GSYA 2VLTA 3ZFLA 4I2UA 1EV4A 1RK4A 4OFTA 4XS6A 2L6DA 1QGVA 4KDUA 4Q5FA 5ABRA 3TJBA 1R4WA 1FAAA 2GZYA 2RLIA 1TOFA 2MBSA 3LXTA 3KP9A 2WZ9A 4MA9A 5ECNB 1F6MC 2YJ7A 3EU4A 1YEPA 4CHSA 1TI3A 5G31A 1M7TA 2JL4A 2TRCP 4IHUA 4KSMA 3LYKA 5AGYA 2IPAA 4ECIA 2ZUPA 2D2ZA 3TJFA 1XWCA 3LWAA 1RW1A 3FKFA 4IQAA 4RI7A 3QFBC 2DJ1A 2VM2A 4AJ7A 1ERVA 5A4WA 3EC3A 2LRTA 1MEKA 4AJ8A 2AUVA 4EL1A 3CSIA 1PA3A 1URMA 1XOAA 2JADA 1EOGA 4LL4B 3ERFA 3TB2A 1B9XC 1BYEA 2WFCA 5H5RA 6GSXA 3GL5A 4DSRA 5ECMB 2L4QA 1YJ6A 2HT9A 4KNDA 3FZ4A 3TJGA 3HJOA 5CAXA 3GN3A 3KTLA 2AAWA 2L59A 2NDOA 1GP1A 3TGZA 1XOBA 3IXRA 5ID2B 1WIKA 4Z7XA 1EZKA 1SD8A 5E59A 4MABA 2BTOT 3OR5A 2H6YA 6GSTA 1QK8A 1GNEA 1ACVA 5IMDA 2C0FA 6GSUA 2OE3A 1X5EA 4KDXA 3GIXA 2OE1A 1HD2A 1TKDB 2G2QA 2AYTA 5IO0A 5IMCA 3F3QA 2V2GA 4AGSA 4NMUA 2CAIA 2E2MA 4Q5NA 2C0DA 3QR6A 3J7Yk 4L0WA 4V1Ag 5KEJA 1YF0A 3CRUA 3HKRA 4MCUA 1ZCPA 4J57E 5G30A 1A2JA 1DSBA 8GSSA 2GS3A 1U87A 2NTOA 3L9SA 1T8EB 3BBYA 4MLYA 2OKAA 3F4TA 2L57A 4CW9A 2QGVA 2P5QA 2F8FA 1OC3A 5DALB 2MYGA 4TR1B 2AB6A 3SBCA 1K3YA 4HU7A 5D96A 2GLRA 4Q5RA 1UN2A 5GSSA 5G2ZA 1ZGNA 3HJPA 1ZOFA 1JLVA 2H75A 1RQMA 4FYCA 1MD4A 3QCPA 2PVQA 2B7JA 2RIIA 4WKWA 1T3BA 5F07A 2L5LA 1OE7A 3P7XA 4KE3A 4X0XA 5HR3A 1N2AA 1PQNA 1BX9A 1K3OA 4GQCA 2FHEA 4OCEA 3CBUA 1AC1A 1T1VA 5IMZA 4WR4A 5E4WA 1TTZA 1K0MA 4MF7A 3MSZA 3GKXA 2CZ3A 3HYPA 3LYPA 1EP7A 1GUHA 3DXBA 2F3MA 5CREA 4JEDA 1M0UA 3HCZA 2IMIA 1CQGA 1Z6NA 3Q18A 1QMVA 1ZL9A 2J9HA 3TKRA 1LU4A 3S9FA 4WBRD 3TUEA 1XWGA 4N0VA 4AJ6A 5ECQB 3GX0A 1TRWA 3HDCA 5KN2A 1JHBA 3U5RE 2V1MA 4D73A 4MK3A 3HY2A 3E0UA 3UBLA 3SWLA 3CRTA 3TRQA 3GURA 2JZSA 1XW9A 1TU7A 1O7UA 2RUEA 3L9UA 1ZYQB 1DBYA 3UVHA 1O85A 5IQYA 3BD2A 1V57A 2OE0A 3BCKA 1TRSA 2KLXA 2CVBA 5D9VA 1SL1B 2C80A 3ME8A 3UJ1A 3RAZA 3QAWA 2M46A 5IMVA 1JZRA 2KP1A 5FT3A 3CSJA 3G9BA 1K3LA 1AQVA 3O76A 1ON4A 2NVLA 2V32A 2PN8A 5IMFA 2GQLA 3A2WA 4QL7A 4NWYA 3GTUA 2DIZA 5EY6A 4TXOB 3E9JB 4JE1A 2K9FA 1GLQA 3TDGA 3MAKA 4MDCA 3C71A 3LFLA 3P2AA 5ECLB 2YWNA 3L4NA 1BAYA 5JWOB 4DSQA 1Z7RA 5J5NA 5EL8A 2QKEA 4PQIA 3LGCA 4YH2A 1SKWB 1XFLA 3DD3A 4IJIA 2H76A 5F0GA 3IDVA 2A2RA 2YN1A 4XCSA 3IE3A 3LXZA 4EDYA 2GZPA 1XW5A 1GSEA 3A3TA 16GSA 4IJ3A 2MMOA 1OKDA 5FHIA 3TOUA 4E8HA 1V58A 1Z7PA 1MDJA 4I97A 1M2AA 3VWVA 4O5RA 3EURA 1TRVA 2C8UA 2E2GA 5CO3A 4PURA 3CSHA 4O32A 1TP9A 1USBA 1M2BA 2HRFA 3KTBA 4K7NA 3G7YA 3UBKA 3FZ9A 3TJJA 5ECKB 2YWMA 1GSUA 2YOIA 4I5QA 4L5LA 2O7KA 3KM6A 4KH7A 4EF0A 3Q6OA 1YKCA 2MMNA 2MBTA 1GTUA 2O8VB 2IIYA 4KDYA 2KOKA 2H74A 2PWJA 1K0OA 2CV4A 5JWRB 2FWHA 2HSHA 3Q74A 3RDWA 5CP1A 4MJCA 3RBTA 1B4QA 4BVXA 2HZFA 4X1UA 1ST9A 4IW9A 1PN9A 3H4KA 3TOTA 2LQQA 4V2NA 3IRAA 3VWUA 2WB9A 1ZYEA 4JZQA 2VM1A 2AV4A 4NHZA 4BWQA 2FWGA 1Q98A 5INYA 1FOVA 4G10A 3IK9A 2JU5A 2FA8A 5ELGA 4POBA 2PERA 4HZ2A 5F06A 1ML6A 1E6BA 3EVIA 4HEA2 3A5WA 2VCWA 3DVXA 10GSA 3VFIA 3EMXA 1WE0A 5HR1A 1WOUA 1A23A 1J0FA 2B5EA 4K8MA 4IP1A 1THXA 1SL2B 1T00A 2DJ0A 1O73A 5ECPB 3I69A 2GSRA 2WULA 1PD21 2A2SA 1GULA 2H73A 3HVSA 4TR0A 3FZAA 5C04A 4DSSB 2L4CA 4MZCA 2REMA 2TIRA 1PRXA 4NXIA 1W89A 3GUSA 5EPFA 4XS4B 4F03A 5COHA 2GZZA 3MNGA 2FGXA 2DJJA 1UC7A 4JRRA 2H0IA 1MD3A 1NSWA 2EC4A 1ABAA 3UMAA 2GVPA 1JZWA 4ACSA 3KMNA 3HZ4A 1M9AA 4ECJA 5IOWA 1F2EA 1GUMA 2TRXA 1R7HA 3QOUA 1NHYA 1O6JA 1PL2A 2VCTA 4XS4A 3DRNA 2YCDA 3E3EA 1XXUA 2PVOC 2YZHA 3M9JA 4N11A 5DAKB 2NPBA 2OBIA 4MH3A 2G0FA 1YF1A 5DJLA 2B5YA 2F51A 4GCIA 1ILOA 4O92A 4N30A 3DEXA 4XS1A 5B8BA 3GSSA 1DE2A 4G9HA 3P8WA 2VCVA 2IN3A 1EEMA 1GNWA 1JLWA 1X5CA 1GSFA 2VD1A 2YJHA 4P3YB 2DJ3A 5DAKA 2CZ2A 1EGOA 1WPIA 1YKAA 2VUPA 1OVNA 2IMFA 3NIVA 3AY8A 4BWSA 2R2JA 1MDIA 5AIXA 3APOA 2GQMA 4LL1B 1OC8A 5IMAA 3H1NA 1JZOA 4RI6A 3KMOA 1EGRA 5FWGA 2PMTA 3LG6A 2FD3A 2OJLA 4TW5A 3WD6A 5CNWA 1FO5A 1GRXA 2KP2A 3DIEA 4YAPA 2IMKA 5HR2A 2DLXA 3C7MA 2PPTA 2LRCA 1OYJA 20GSA 1YDKA 2LSTA 3N9JA 3G7JA 4LMVA 2HNLA 2ALBA 5D9WA 2IWTA 1O81A 2N5FA 1SJIA 2B5XA 4MZWA 2HLSA 2LRNA 5G5EA 2YWIA 5JCWA 2YNXA 5AIVA 3RPPA 1BQ7A 2MMZA 4TOPA 4JBBA 3APQA 2FWEA 3KH9A 3KCMA 2V6KA 2XHFA 1T7PB 2VL2A 5CRWA 1ERUA 2GT5A 4MF5A 2KHPA 1XBSA 4BL7A 4WR5A 5ENUA 3F6FA 4EDZA 1XPVA 3F4RA 3F4SA 1ERWA 2LEGA 1XW6A 1EOHA 3ISOA 1E2YA 1B48A 2MMAA 1EP8A 4OFNA 5JCGA 4GSNA 2LTKA 3ERWA 2HI7A 1PSQA 2X64A 4K7IA 4G2EA 1VRSD 4ZL8A 4TXVA 2X8CA 3EINA 3IC4A 4LMWA 3R2QA 4TR3A 1UA5A 4KCAA 2H0HA 13GSA 4FYUA 3KD0A 1TW9A 5J4UA 1A8LA 1WWJA 4I6XA 2P0GA 4GLTA 2GGTA 3IA1A 2OA7A 1OE8A 2RUFA 1K0CA 2HZEA 4WBJA 1GSSA 1TXXA 3M9KA 5LD0A 2GTUA 3MWHA 3ME7A 1A0FA 1AIUA 4TRXA 4GXZA 3ZIJA 4D73B 1A24A 2PUKC 4XIHA 3ZYWA 1M99A 3Q19A 2CX4A 4L5OA 3GNJA 1WP0A 2ON5A 2YZUA 3TKQA 1W4VA 4CDOA 3KXOA 1WMJA 5G1KA 4MF6A 5GAND 4POKA 4KB3A 1VF2A 1XVWA 4V2LA 1B4PA 1WJKA 2FNOA 4JR6A 4TN8A 3LEFA 4KCEA 1A8YA 3TKSA 2LUSA 2VL9A 3NZNA 1EV9A 1TJDA 2LNSA 2PU9C 2HRNA 4FYBA 2H71A 1GSYA 2OBKA 1SENA 3WYWA 2I1UA 5G1LA 2CX3A 4KUNA 1SK1A 1AAZA 3GTUB 3IHQA 2LJKA 4ZBBA 2E7PA 5AISA 4H86A 3H93A 4F2IA 4E8EA 4TKYA 2X8HA 3VWXA 2ZCTA 3GA4A 2DBCA 3FZ5A 3DMLA 2N5AA 3CYNA 3VURA 5HFIA 3RPNA 3ZREA 4HDEA 4OCFA 3J7Yb 7GSSA 4YQMA 1U88A 1V2AA 3KZQA 2PBJA 4MJAA 1LBKA 2H1AA 1AQWA 3BOAA 4ZIJA 4RQRA 3ZLPA 1ERTA 2O85A 5ECSA 2EIOA 5HFGA 3ZMKA 3I6AA 2DSAA 2VCZA 2YWOA 3FRCA 1FG4A 2F9SA 4G19A 1BG5A 3U6VA 2RM5A 3DWVA 5C00A 1U6TA 3VI5A 4K6XA 3F9UA 3ZVJD 5IPHA 3IR4A 2H6XA 2LQOA 2B1LA 1SK0A 1Z6MA 4WXTA 1XIYA 4BA7A 2O87A 4K9ZA 3JCML 3KP8A 4FIWA 4F9ZA 2H1GA 2LKUA 4F0CA 3UIWA 4ID0A 4NHWA 4IKHA 1KNGA 4ZBAA 1GUKA 3IAS2 1S3DA 1XWKA 1THOA 1AQXA 4GTUA 4TR4A 4OD7A 5ELAA 2VCXA 1MTCA 2V41A 2ON7A 1NW2A 2C4JA 3D5JA 4YQVA 1VGLA 4ISDA 2EIQA 5ECHB 1KTEA 2YP6A 3M0FA 1H4OA 3UVTA 2GSTA 4HS1A 5J9CA 2JZRA 3HXSA 1CQHA 1GH2A 1PMTA 3ZVJA 3CXGA 3P90A 3D22A 3FYGA 1A0RP 2GT6A 1SD9A 2O89A 4GSTA 4I2TA 2B1KA 5DBQA 1J9BA 2V6OA 1VF1A 2C3NA 2I9HA 4OWYA 4EC0A 2WGRA 1XZOA 2IL3A 1QUWA 4MJBA 1TI1A 4IVFA 2JSZA 1AW9A 3K8NA 4IP6A 4N0ZA 1F3AA 4PGTA 5D9TA 1V40A 6GSWA 3UAPA 4EXJA 5LCZA 5L71A 4V2MA 1R5AA 2VL3A 3C1SA 3GYKA 3ED3A 3D21A 4EKZA 4KA0A 2YV9A 18GSA 4LA1A 2PGTA 2XPEA 3VI7A 1TRUA 3VLNA 2AHEA 4QQ7A 3BJ5A 22GSA 4ECBA 1Y25A 1YEXA 2VL2C 3O6TA 3GKKA 1G0TA 1MDKA 2H30A 2IMDA 3HD5A 5D93A 1OKTA 4ZL7A 1S3AA 1X5DA 3V1WA 4BPYA 1G6YA 3FW2A 2FWFA 1T4YA 1Z5YE 3G7IA 1LJRA 5DCHA 5H5QA 1O8XA 2X99A 2DIYA 4ILFA 5J9BA 1F3BA 1HYUA 3FR6A 2LJAA 1G7OA 4I8BA 2B6MA 4POLA 2GDRA 2WJUA 1TK5B 1GWCA 2MZCA 3DGQA 4ZXGA 2M72A 4ZB6A 4DEJA 1R26A 1NM3A 1M2DA 1OC9A 2P31A 2K8VA 2CVDA 3VK9A 1AUCA 3IPZA 3ZMLA 3TCOA 3GX8A 3QDNA 5IO2A 3D4TA 3ERGA 3MDKA 4J56E 2H19A 1KBNA 3M8NA 1Z3EA 3KGKA 1IYIA 4IELA 2IFQB 3DKSA 4OMVA 1SYXA 3IBHA 3UEMA 1X9MB 4WF4A 4HQSA 2K18A 3RHCA 4MZBA 1ZZYA 2X8GA 3F3RA 3IAM2 3FHKA 1K0AA 4OO4A 4K0NA 1Q4JA 3GV1A 4MPFA 5AN1A 4HQZA 4IGJA 5IIZA 3TRPA 2FY6A 4IS0A 5GSTA 3TKSC 2IFQA 1YQ1A 3ZFBA 1GTAA 2WS2A 5A4UA 1GLPA 3CTFA 4Q5QA 2GSQA 5GAPD 2WCIA 4V1Ap 5J3RA 1YZXA 3VPQA 4YQUA 5HR0A 4PNGA 1R5PA 3ZZXA 3FEUA 4GF0A 1JZDA 1KEBA 3D4MA 2R6KA 3GRXA 3IV4A 4NV5A 1TDIA 4TVEA 4ML6A 4ML1A 1QQ2A 1AXDA 5CRHA 5A4VA 1SL0B 1F9MA 1QFNA 4EE0A 4J2FA 1NHOA 3HHVA 4ZBDA 1GSDA 2M80A 1YY7A 2B7KA 4N10A 4XTSA 1X9SB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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