4MLYA

Disulfide isomerase from multidrug resistance inca/c related integrative and conjugative elements in oxidized state (p21 space group)
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
202
structure length
196
Chain Sequence
AKIEDIVELPIKGVRAVQSDGQIMFLSENGRFVISGQIYDLWSKKPLNTMSQMRDVAERIHFKSMGMDVDTLNTVSMGRGDKEVVVFVDPRCAVCHQLMGDAKSLVDDYTFKFIVIPALGAESNRLAKNLYCAKDKTHALDALMNNTLGSLPSGQYDQTLLTAHFIGIEGVPFVVAPDGRVSKGRPKNLKSWLESA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Multidrug Resistance IncA/C Transferable Plasmid Encodes a Novel Domain-swapped Dimeric Protein-disulfide Isomerase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DsbP
molecule tags Isomerase
source organism Proteus mirabilis
total genus 54
structure length 196
sequence length 202
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2013-09-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10411 DsbC_N Disulfide bond isomerase protein N-terminus
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4mlyA02
4JZQA 3HJOA 1XWBA 3FHKA 2FA8A 3C73A 2O85A 2KLXA 4KSMA 5CRDA 2VAFA 5HR3A 4FYCA 5DQSA 3J7Yk 3UJ1A 1EWXA 1F9MA 5G5FA 5GSTA 2R2JA 5ELAA 1DE2A 3ZFLA 2FLSA 3J7Yb 5D9TA 3RPNA 2KP1A 1AQWA 2M46A 2DJ1A 2HZEB 2VLVA 3QAWA 3E0UA 5J4UA 2HI7A 3HY2A 4I5QA 4XCSA 5DAKA 5DVBA 3L78A 2V41A 1M9AA 4H86A 1IYIA 3N5OA 1SK1A 4F82A 1U3IA 5ECLB 2P0GA 2RM5A 4K9ZA 2B6MA 2K18A 4N0VA 2YZHA 4POLA 2YWIA 19GSA 4XS4A 1OKTA 4EE0A 4MMMA 5FWGA 4QL9A 2L6CA 2R5GA 4TXOA 3KP8A 1KTEA 6GSXA 3W6GA 3TDGA 1SK2A 5H5RA 1PKWA 5CRGA 2DIZA 2FY6A 1F6MC 2WULA 3CTFA 5EVOA 3VI5A 2L5LA 3TKSE 4XHMA 2O89A 1JHBA 4WBRD 5EL8A 3QD9A 1O73A 2N5FA 3A2VA 4MCUA 2BMXA 1Q98A 1F3BA 1Z7PA 2D2ZA 2CVDA 5A4WA 3KGKA 4ZB9A 2GTUA 5DCHA 2CQ9A 1TKDB 2H73A 5F8BA 5J3RA 1XCCA 1ABAA 1XBSA 1O8WA 4GSSA 1G6YA 5D8IA 1WOUA 2AHEA 4ZXGA 3IAM2 1U6TA 1SJZA 2GZPA 4HU9A 3GKKA 1CQGA 2ZCTA 4BVXA 3IOSA 1U87A 3CRUA 1V9WA 1H75A 4J2FA 2NBSA 1ZCPA 4PURA 2CV4A 1PX6A 3ZMKA 1NW2A 1LBKA 3AY8A 3HVVA 1JZOA 3IK9A 1YJ6A 1QXHA 3GHAA 2VCTA 4NHZA 2B7JA 3UAPA 2XPDA 4EUYA 4I2TA 1GTIA 5J9BA 2GLRA 1ST9A 4MLYA 2B3SA 5ECIB 4ZL7A 3P90A 2C3TA 3TJFA 3M9JA 8GSSA 1G7OA 4MF5A 5HFKA 3A5WA 5B8BA 3APOA 1AC1A 3M1GA 4I8BA 1T4ZA 4JBBA 3G7YA 4KE3A 1A23A 3DKSA 3E9JB 2MBTA 5C00A 2C3QA 2MZCA 5IMFA 2NVLA 1A0FA 4K8MA 3TJGA 3ME8A 5E59A 3FRCA 4CDOA 3APQA 1NHOA 4EVMA 3G9BA 3ZIVA 2GSSA 3GX0A 2ZNMA 3FKFA 4GXZA 3W8SA 3LEFA 3KMNA 3TRQA 4KUNA 1NM3A 3EMPA 2DC5A 3VLNA 2LJKA 5ECHB 4ZILA 1HNBA 3DVXA 3L0HA 1GLQA 2GQKA 2R3XA 4D73B 1GH2A 3BD2A 4G2EA 2DMLA 2H72A 3LXZA 3FZ4A 3F4RA 2GSQA 3K8NA 2MMZA 4XRAA 4IGJA 2LRCA 2I4AA 1GNEA 4ECBA 2HZEA 4HZ2A 1SYRA 3MWHA 4Q5NA 3I9V2 2IMEA 4OMVA 3UBLA 2C4JA 3A3TA 5HR2A 1GSYA 2LRTA 1WE0A 2PBJA 3CMIA 1GNWA 5G30A 3LFLA 5IPHA 4CHSA 3TUEA 4GLTA 3ISOA 3VWVA 3ZLPA 5F07A 4KX4A 4NXIA 4KW6A 2MYGA 2I9HA 2X99A 2OBIA 4KGIA 1ERTA 1T8EB 3LGCA 1R26A 1NHYA 2CZ2A 1O85A 4E8EA 4ML1A 1JLVA 1T1VA 4RI6A 1ACVA 3IK7A 2V6KA 1EGRA 2R37A 3ZVJD 2WB9A 1XW6A 2FCHA 3EINA 4L5LA 1PQNA 1ZYEA 1SK0A 4DVCA 3QOUA 5IMZA 4N30A 4TXVA 4TOPA 2Z9SA 5CP1A 4YQUA 1TRVA 3F8UA 3CYNA 4YAPA 4AJ7A 3QAVA 4TVEA 3ERGA 1K0OA 2MMOA 3IBHA 5DJMA 1FO5A 4YAVA 2P5RA 4TW5A 2QKEA 3Q19A 1BG5A 3UIWA 5CNWA 1GP1A 3GSTA 1X9MB 2RM6A 2VCZA 1PMTA 2H75A 4AGSA 4LL4B 3Q74A 4XS1A 3WD6A 1OAZA 4JR6A 4X1UA 1VRSD 1TK0B 2VD0A 3D4MA 4GSTA 1BX9A 2C3NA 4MJAA 3V1WA 2JADA 4HQSA 1YF0A 1TRSA 2EIRA 4XTSA 5JCWA 3GRXA 1FW1A 3LORA 3WT2A 2CVKA 3BBYA 4MPFA 2VUPA 2E7PA 5IO0A 3F6DA 3ERFA 2L59A 4IJ3A 4WR4A 4IW9A 3M0FA 2M72A 4X43A 4FH8A 1WWJA 3GUSA 1EEMA 3C1SA 1J0FA 3TRXA 3WT1A 1K3YA 1PX7A 2VM1A 5B7CA 2IFQB 1OC9B 3L9SA 2JZTA 3ERWA 3FR9A 2WZ9A 3FR6A 1M9BA 5DJLA 3LG6A 1A2MA 3CSIA 3I69A 5B6MA 5ECPB 5IMVA 5ABRA 5AN1A 2H8LA 2JZRA 5ECKB 3GV1A 1N8JA 1XIYA 9GSSA 2VCWA 2XBQA 3OR5A 3TJJA 3APSA 3QMXA 2GS3A 4KDUA 5DALB 2LNTA 2FA4A 1A2LA 4O32A 4D73A 1K0NA 2V6OA 3CSJA 2F8AA 5F0GA 5ECMB 2OJLA 1BAYA 1HYUA 2X8CA 1DBYA 2L4CA 2YN1A 1UVZA 5HQPA 3U6VA 2IWTA 1M2BA 3UOMA 2CAIA 3VWWA 3DWVA 1SD9A 3HVXA 2OA7A 1M99A 2IMDA 5KN3A 3HA9A 1YKAA 2B5YA 2O87A 1UA5A 2NDOA 2IL3A 3IHQA 4IHUA 1YEPA 3F0IA 3GN3A 3QFBC 3QPMA 4TR4A 4PUFC 1XWAA 3UMAA 2B7KA 1R5AA 2C0EA 1TXXA 2CX4A 1GTUA 3VWUA 3KH9A 1I9DA 4FYBA 2H1DA 4JU5A 1SJ6A 4FYUA 3TKQA 1B9YC 4L0UA 2YOIA 1MD4A 4I6XA 2C8UA 2X64A 4EL1A 3D6IA 1X0RA 1OKDA 3GMFA 4ZBAA 5HFIA 1ZYQB 3KM6A 2L5OA 3FZAA 2IN3A 4NAXA 3IR4A 1AIUA 4HZ4A 3F6FA 3O3TA 1EGOA 3UVTA 3F4SA 3C8EA 2M80A 6GSSA 3NIVA 3L9VA 2VO4A 4GWRA 1GSDA 4OFNA 3D4TA 2YV9A 1A2JA 2LQQA 2F9SA 2HRNA 2H01A 2LKUA 4V2LA 2VIMA 2LJAA 1FHEA 1MEKA 1QK8A 2K8SA 3LSZA 1U3AA 3CXGA 4L5OA 3TOTA 4K0NA 3GURA 3IRAA 1XWKA 2CAQA 1TRWA 5KN0A 4BL7A 1GULA 2JL4A 3LYKA 3GH9A 2PVOC 2H76A 2YPMA 2AV4A 1QMVA 4RI7A 2VL3A 1PN9A 4K7NA 2VM2A 3GYKA 2I81A 4ISDA 2JSZA 1A8YA 3KXOA 2OKAA 1TJDA 2KOKA 1GSEA 3H93A 2KP2A 4KNDA 1K0MA 2GT6A 5B6NA 1F3AA 3GL3A 5B8AA 2LNSA 1XOAA 4IKHA 4IBPA 1SKWB 4QQ7A 3MSZA 2LUSA 1U88A 1Q4JA 2VL2A 1T4YA 2JU5A 2C1YA 4GCIA 3QDNA 4ECJA 3EU3A 3US3A 4WF5A 4YQMA 4QL7A 3IXRA 4MJBA 4YH2A 2HYXA 2B1KA 1K3LA 1OC9A 3EWLA 4OCFA 1LJRA 5CRHA 4BWSA 4IN0A 4Z7XA 2V2GA 3EC3A 5ENUA 1PD21 2HLSA 3CRTA 2NPBA 3KEBA 4PX1A 5ID2B 1WPIA 1EV9A 1OC3A 2DMMA 3GA4A 3VWXA 5DALA 4DSSA 3GTUB 5LNKe 1EP7A 3KH7A 3ZL5A 1T00A 1QFNA 4JEDA 2AB6A 4BPYA 4HDEA 1J9BA 2B5XA 1EOGA 5AIXA 4IELA 4ZL8A 3DMLA 2DJKA 3EMXA 3IPZA 5HR0A 1GSFA 3LXTA 2GSTA 1GUHA 5D93A 4GQFA 3BCKA 4ACSA 1T3BA 2LJRA 3FY7A 5CREA 2F8FA 1GWCA 1TDIA 3VFIA 2HSYA 1TI1A 5D73A 3FW2A 3TKSA 2ON7A 3I43A 2PGTA 2HXKA 5A4UA 4Q5FA 3IE3A 1THXA 1B4PA 5H5QA 4O5RA 2RIIA 3VPTA 4TR1B 2L6DA 5LCZA 2A2RA 2LSTA 4ECIA 3MAKA 1S3DA 4KH7A 3C1RA 5FT3A 3TKPA 1JZDA 2H66A 2PPTA 3FR3A 2YWMA 2HRFA 2CT6A 2K9FA 3UVHA 2YZUA 2GT5A 1QUWA 3VK9A 3HVSA 1UC7A 1GL8A 1VF1A 1Z3EA 1B9XC 3HD5A 1ZMAA 1PL2A 4DEJA 5F05A 2HNLA 4J56E 3PGTA 2WJUA 1BEDA 1Y6EA 1AQXA 3F63A 3UARA 1SENA 1SKSB 4G19A 2N5AA 2B5EA 4O7HA 2TIRA 3TJKA 2XHFA 2C0FA 1JFUA 4KDXA 2OACA 18GSA 3IA1A 3KIJA 20GSA 4WF4A 4NWYA 3RBTA 5DQYA 6GSVA 2GZYA 5JCUA 1TOFA 2I1UA 1XVWA 1XWCA 2H6XA 3HJPA 1K3OA 4X0XA 3QFAC 1V40A 2GQLA 5J41A 1KNGA 4KSOA 2FD3A 2CZ3A 1ZOFA 4RUVA 5AGYA 2X8GA 3H4KA 5IPGA 2HZFA 4K6XA 3HYPA 2F3MA 2VLTA 5AISA 4K2DA 2VL9A 2NTOA 1JLWA 5JWRB 1SL2B 4ZB6A 1OC8A 5JWQB 1TTZA 4N10A 1PA3A 4EKZA 4POKA 5ECSA 2V1MA 2WFCA 2OBKA 3I6AA 5GSSA 3A2WA 4ZBDA 1EOHA 2AUVA 1SU9A 1X5DA 5G1LA 1ZGNA 1FG4A 2X8HA 4ZIJA 1VF4A 1Z6NA 2JSYA 1K0AA 1R4WA 2FWGA 5J5NA 1EEJA 3VPQA 1PGTA 3RAZA 1B4QA 1LU4A 1MDJA 3L4NA 2HSHA 2RUEA 4MK3A 4G9HA 3P2AA 2H6ZA 2WDUA 3GTUA 4K7IA 4LA1A 3DIEA 1RK4A 4EC0A 3DD3A 1PSQA 4TR3A 1XW9A 4MZCA 1DSBA 2OE0A 2H1BA 4ZBBA 3CBUA 2VL2C 2G2QA 1K0DA 2LRNA 3GKMA 4P3YB 4NV2A 4EO3A 1ON4A 3ZFBA 4HI7A 5DBQA 2OE3A 4K1FA 4HS1A 1MDIA 3GL5A 5IO2A 1SYXA 5GAND 3M3MA 1XWGA 1W4VA 2EIQA 4V1Ap 4BWQA 2H0HA 5ECQB 3D5JA 3MNGA 3UEMA 17GSA 4PQHA 2KUCA 2L4QA 3EVIA 4DSQA 1MD3A 2EIOA 5INYA 2H0GA 4NPBA 3ZYWA 4OFTA 3S9FA 2KHPA 5A5KA 5CO3A 3EU4A 5IMDA 4Q5RA 2A4VA 4MABA 2CA8A 4HOJA 3BOAA 3P8WA 3Q6OA 1ZL9A 5ECRB 1M0UA 1FB6A 3F9UA 3GIXA 1KEBA 4ECCA 4J57E 4F9ZA 3SWLA 1E6BA 2PUKC 2K6VA 1AQVA 4GF0A 1ERVA 1SKRB 2B1LA 3BCIA 4EXJA 4IP1A 1O6JA 3NOFA 1SL1B 2GVPA 3GKXA 2VLUA 1A0RP 2TRCP 4PQ1A 3MDKA 1B8XA 3QAGA 1W89A 3DRNA 1SJIA 2FWFA 3JCML 3HZ8A 2RUFA 3DXBA 1EZKA 3WYWA 3C71A 3ZREA 5IMCA 1UN2A 4NV5A 16GSA 2DJ0A 4N11A 3FK8A 1THOA 1O8XA 4MJCA 4BVYA 4V2MA 3DEXA 1BJXA 3UL3A 3IC4A 5JWOB 4HU7A 5G31A 5KN1A 2H1AA 1F37A 2GDRA 3GKNA 2H71A 4OCEA 2YWOA 4KB3A 1GSQA 3D0ZA 1N2AA 3TRPA 5AIVA 4TKYA 3ZIJA 1YKCA 12GSA 3O76A 3Q18A 5IQYA 1TK8B 3ZMLA 3U5RE 1AW9A 2LTKA 4F0BA 1FOVA 2LQOA 2QSIA 4IQ1A 2H19A 2HE3A 1EV4A 4G10A 2R6KA 2H1GA 2YWNA 2VD1A 3WGXA 4ZL9A 3SBCA 2MMAA 3WGEA 2WGRA 5GZZB 4PNFA 1OE8A 1M7TA 4WKWA 1AXDA 1EP8A 1GUKA 1PL1A 1YF1A 3RPPA 1VF2A 2PERA 3KJYA 5KN2A 1JZRA 5JCGA 1HNAA 3DYRA 4ILFA 1QQ2A 3QCPA 1I5GA 3GX8A 2C0GA 2J23A 5D96A 4MPGA 1T7PB 3EYTA 4GTUA 2VOCA 3HKRA 4L0WA 2J9HA 3LQ7A 11GSA 5G2ZA 5ECOB 1O7UA 2V32A 4HQZA 2QC7A 4I2UA 1RW1A 2PMTA 3DVWA 1V57A 2XBIA 3M9KA 2GSRA 2RLIA 2IPAA 2N5BA 1S3CA 5ECNB 2VCXA 2MMNA 4JR4A 4O92A 2G0FA 4PXOA 5COHA 4L8EA 4CW9A 3EE2A 2JACA 2XPEA 5IOWA 2IMFA 5L71A 5IOXA 1Z7RA 2VCVA 4POBA 1MTCA 3D22A 1IYHA 2AJQB 4IVFA 2YJHA 2IIYA 3E3EA 5HFGA 1X5CA 2IFQA 2GZZA 3G7JA 3W8JA 5KEJA 3PH9A 1URMA 1M2AA 2QGVA 3ZZXA 5H5SA 1DE1A 1XFLA 4ULXA 1WP0A 1YZXA 1X9WB 4DSRA 4TR0A 2GGTA 1Y25A 1E2YA 1TRUA 3VI7A 2PWJA 2H70A 1TW9A 2FNOA 1A24A 1KBNA 2YNXA 4ZB8A 3BJ5A 1XW5A 2TRXA 3ED3A 4FO5A 1K0BA 3TGZA 1GRXA 1SD8A 2H0IA 3CTGA 5DCGA 3KTLA 3EURA 3DGQA 3HJMA 3GSSA 4WETA 3PR8A 5G1KA 2DLXA 3F3QA 2FWEA 4GSNA 1OE7A 3RDWA 3GNJA 3PINA 3HHVA 4POMA 1NSWA 3RHBA 6GSWA 4KCEA 7GSSA 5D9WA 5D9XA 1RQMA 6GSUA 1G7EA 2EC4A 1TK5B 1V58A 1DUGA 1QGVA 2DBCA 2DIYA 4V2NA 2K8VA 3CSHA 2O8VB 5ELGA 1B48A 3FZ9A 4RQRA 2GQMA 3O6TA 1YY7A 2P31A 4LMVA 1OVNA 3FYGA 3TJBA 4PQIA 2I3YA 2YV7A 2YJ7A 4HUAA 2ES7A 6GSYA 2LEGA 1BYEA 4MH2A 4OWYA 4F0CA 5CRWA 3LWAA 4HJ2A 1HQOA 4N0ZA 5CAXA 3HCZA 2YP6A 3D21A 1OYJA 4YQVA 3ZVJA 2WS2A 1ERWA 3TB2A 3L9UA 2HFDA 4AJ8A 3H1NA 5E4WA 13GSA 1PKZA 4WBJA 4PNGA 5IM9A 1H4OA 5FHIA 5J9CA 2C80A 1HNCA 1G6WA 3H8QA 6GSTA 2H74A 2JZSA 1PRXA 2BTOT 3G7IA 2E2GA 2PVQA 2FHEA 2H30A 2XC2A 3GFKA 1BQ7A 2DJ3A 5DDLA 1CQHA 2CX3A 2IMKA 5F06A 4OFMA 1S3AA 2LS5A 3KD0A 1GUMA 2L57A 3FZ5A 4XRDA 1R7HA 1ML6A 3N9JA 4WEYA 5EY6A 4E8HA 3IV4A 4OD7A 4XIHA 3QR6A 2IMIA 4XS6A 1O81A 3GH6A 5LD0A 4KA0A 4MH3A 2ALBA 3ZRDA 1YDKA 3HXSA 4AJ6A 1XXUA 1XPVA 2OE1A 5IIZA 5DAKB 2LV3A 1GLPA 1Z5YE 2E0QA 4MF6A 2E2MA 3FEUA 4XS4B 1FB0A 1G0TA 4LLRA 2ON5A 1YQ1A 4LMWA 4IS0A 1J08A 1V98A 4TXOB 5D9VA 2ZUPA 4LL1B 3IAS2 4FIWA 3KP9A 5GAPD 4KAEA 3TOUA 4TN8A 3NZNA 2HT9A 1XZOA 1GTAA 4ID0A 1XVQA 1VF3A 2C0DA 2VCQA 1R5PA 2IJYA 4F03A 5ID2A 4PGTA 3H79A 3ZITA 4F2IA 5EPFA 4EF0A 1FVJA 2AAWA 4EDYA 3WGDA 1WJKA 1K0CA 3TCOA 1HD2A 4NHWA 4MJEA 3ZTLA 1USBA 1F2EA 2FWHA 1TU7A 2DSAA 4GQCA 4K7OA 5IMAA 4IQAA 1A8LA 4JE1A 1WRYA 3F4TA 4HEA2 1X5EA 2O7KA 3R2QA 5HR1A 3UBKA 4IJIA 4NMUA 10GSA 1VGLA 3HDCA 3KCMA 1AAZA 3TKRA 4HJMA 3ME7A 1SL0B 4KDYA 1V2AA 2PN8A 2H6YA 4IP6A 1ILOA 4RQXA 4MF7A 1YEXA 3IDVA 4MA9A 1AUCA 1TP9A 4OO4A 1TU8A 3HZ4A 4MZWA 4TR1A 1WMJA 4WR5A 3M8NA 1WIKA 2MBSA 1X9SB 1TI3A 1ZZYA 3KMOA 4OO5A 2A2SA 2F51A 5A4VA 2YANA 4JRRA 4ML6A 3LYPA 4AF2A 2DJJA 3RHCA 1GSSA 4DSSB 1GSUA 14GSA 2REMA 1Z6MA 2AYTA 3P7XA 4MP4A 4MZBA 4Q5QA 1GTBA 4K0GA 4TRXA 2PU9C 1M2DA 1MDKA 2YCDA 2FGXA 3LJRA 2WRTA 1C72A 1XOBA 2P5QA 4KCAA 2DJ2A 5G5EA 1Z9HA 3TKSC 4V1Ag 5CYYA 3C7MA 2FUG2 2OADA 2R4VA 4EDZA 1ERUA 3F3RA 22GSA 2WCIA 1FAAA 2CVBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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