4MZCA

Atomic resolution structure of pfgrx1
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
106
structure length
105
Chain Sequence
EAVKKWVNKIIEENIIAVFAKTECPYCIKAISILKGYNLNSHMHVENIENPDMANIQAYLKELTGKSSVPRIFINKDVVGGCDDLVKENDEGKLKERLQKLGLVN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Atomic resolution crystal structure of glutaredoxin 1 from Plasmodium falciparum and comparison with other glutaredoxins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutaredoxin
molecule tags Oxidoreductase
source organism Plasmodium falciparum
total genus 37
structure length 105
sequence length 106
ec nomenclature ec 1.20.4.1: Arsenate reductase (glutaredoxin).
pdb deposition date 2013-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4mzcA00
2WB9A 4GQFA 2HLSA 2H66A 2VL2A 4NHWA 4XCSA 1BJXA 3NZNA 3M8NA 3TOUA 1SD8A 2FWHA 2HYXA 3F9UA 1AXDA 2IFQB 3CSJA 2C4JA 3ZFLA 1JZDA 3ERWA 2JZSA 3CSIA 1O81A 5GAPD 2AAWA 1UA5A 3TJGA 1LBKA 2C3NA 4MPFA 1M7TA 4IN0A 4IW9A 2C80A 1GSYA 2AYTA 5EPFA 3M9JA 5J9CA 5KN2A 3J7Yb 3APSA 1HNAA 5B6NA 2L57A 6GSVA 2VD1A 5G30A 5IMAA 2N5BA 4K9ZA 2ES7A 3ZFBA 2GVPA 3HD5A 3VWXA 3GKKA 5J3RA 4I2UA 3WT2A 3EMXA 4YQUA 1WJKA 1OE8A 4EL1A 3LQ7A 3DGQA 3RBTA 5G1LA 1A2MA 3IAS2 1SKWB 3DRNA 5DJLA 1HYUA 3I9V2 5LNKe 1V2AA 1OAZA 1GSSA 1GP1A 4EDZA 4MA9A 4YAVA 5IOWA 2LQOA 4JRRA 3LXTA 2WRTA 3RPPA 4PX1A 4MF5A 3KXOA 3TJBA 3TOTA 3FR3A 1SK2A 3W8SA 2H6YA 2CZ2A 1J08A 1J0FA 4IHUA 1JZRA 1Z5YE 4XS6A 1FW1A 4HU9A 1DBYA 1K0BA 2XBIA 1BG5A 1XOAA 2H6XA 4ZL7A 4G9HA 1VF1A 1ZOFA 1O85A 2I1UA 1EOGA 2TRXA 2PVQA 3VWUA 1B9XC 3ZITA 3DKSA 5EY6A 5GAND 4HQZA 4PUAA 4F9ZA 1LU4A 1EV4A 4EF0A 5IO0A 4XRAA 1TOFA 4K7NA 3BCKA 3KMOA 5ECSA 4GLTA 1G6YA 3HVVA 1JZOA 3O76A 4BWQA 2GTUA 4D73A 3D4MA 4FYCA 1E6BA 3F0IA 1F6MC 2GSTA 3TB2A 1YEXA 2XPEA 2H19A 2K6VA 1K0OA 3F6DA 1QXHA 2DJ1A 2R4VA 2RUEA 2OBKA 4ILFA 2MMZA 1TJDA 1K3OA 3GKXA 2FWEA 3LORA 1C72A 3W8JA 5D9XA 4FYUA 2LV3A 1BX9A 3VPTA 1SJZA 1Z6MA 4KH7A 3CXGA 2GSQA 3F6FA 4JR4A 5KN1A 4FYBA 4IVFA 2C3QA 2HRNA 1SYRA 1KBNA 3TKSC 3HZ8A 5ECNB 2FCHA 2V1MA 3MDKA 1FOVA 1O7UA 2L5OA 1A8YA 1GTBA 4MZBA 2QKEA 4HI7A 2V6OA 12GSA 3I69A 2MYGA 4K6XA 1K0NA 2GZPA 3GMFA 1UC7A 2VCTA 3FEUA 1EEJA 2MMAA 4WF4A 5D9VA 4KE3A 5ECPB 2AB6A 3KD0A 1TU7A 1QGVA 3P8WA 3GX8A 4IGJA 1PN9A 1GLPA 3DVXA 1T8EB 3GKNA 2VOCA 3L9VA 1V57A 3RAZA 2PU9C 2DSAA 2QC7A 3GFKA 2VL9A 3APOA 4ECCA 4DEJA 4GSSA 3VI7A 3VWVA 3EC3A 2X64A 5IQYA 2B3SA 4Z7XA 4OCFA 2RUFA 4JR6A 3FKFA 4HJMA 4HS1A 3DEXA 3ZYWA 4TR1A 4MH3A 1RQMA 4MK3A 5IPHA 3FR9A 3DIEA 1TKDB 2EIRA 3KIJA 2CVBA 4TVEA 4KW6A 1A23A 4TN8A 2P0GA 3D0ZA 4PUFC 4XS1A 1NHOA 3GTUA 1ZYQB 1EGOA 3ZTLA 1TDIA 2YV7A 4GCIA 4IJ3A 3L0HA 4ZB8A 2LNSA 2IMKA 2JACA 1XWBA 3QD9A 4LL1B 5G2ZA 2GDRA 1V9WA 2YANA 4HU7A 3G7JA 3UOMA 3I43A 4TRXA 2K18A 2V32A 2R5GA 3ME7A 4NXIA 5FT3A 3FHKA 4EDYA 4KSMA 3W6GA 3M9KA 1TRWA 1QMVA 3DXBA 4MZWA 1F2EA 3F63A 1AQVA 5GZZB 3C71A 4YQVA 2GQLA 1KNGA 4IP1A 3PH9A 1XBSA 4TR3A 4PNFA 9GSSA 2WJUA 2RM6A 4GXZA 2I3YA 22GSA 4JBBA 4WXTA 5CRGA 4Q5FA 3FZAA 11GSA 1M2DA 2H72A 1EOHA 3HJPA 2PUKC 5J4UA 4WETA 1ERUA 1M2AA 6GSWA 3UL3A 2X8CA 3GHAA 3F8UA 4D73B 4GWRA 5G1KA 4WKWA 4V2MA 1ERWA 3O6TA 1SKRB 4LMVA 4BL7A 1B9YC 1T4YA 4GTUA 3IHQA 2K8SA 1XVQA 3C7MA 3FZ4A 2M72A 5H5QA 2KOKA 4KCEA 3L4NA 3D6IA 5JWQB 1PD21 2R3XA 4XIHA 2HZFA 3HCZA 1X9WB 1USBA 1SKSB 2HRFA 3P2AA 1GWCA 3D5JA 4IELA 1GSEA 5AIXA 5DCHA 3LFLA 3N5OA 2B7JA 1BEDA 1WOUA 2B1LA 4GQCA 5KN0A 1F37A 4ZBDA 2IJYA 1PKWA 3H8QA 2WDUA 2G2QA 4EXJA 1ILOA 2O89A 2YZHA 4HQSA 4N0VA 2I81A 4XS4B 1Z3EA 3IDVA 3HY2A 3IE3A 2F9SA 3EMPA 4J2FA 4AJ8A 2FGXA 1GUKA 5DBQA 2V2GA 4OD7A 1KEBA 1XW9A 4JU5A 2L6DA 5C00A 4EUYA 2P5QA 3ISOA 1Y6EA 2C0EA 1R4WA 2DIYA 2WS2A 2JZTA 2CVDA 2BJXA 1URMA 2CAIA 4L5OA 1ZCPA 2JZRA 1LJRA 3H93A 2J9HA 3UIWA 5COHA 2CAQA 2L6CA 4OFMA 2OE1A 4E8EA 3FRCA 4HDEA 3HVXA 2LRNA 3GKMA 4DSRA 4PQIA 1YKAA 10GSA 3K8NA 5ID2A 1AQXA 2VCQA 5GSTA 3TCOA 4TR1B 3KCMA 4ULXA 2AJQB 2C0FA 3HVSA 5JWOB 2DJ3A 2H74A 1VRSD 2N5AA 5HFIA 1SU9A 2GT6A 2VL3A 3GTUB 2B1KA 3GV1A 3V1WA 2F3MA 4RI7A 1M9BA 1XFLA 1WIKA 3EYTA 3HJMA 5F8BA 2AUVA 3L9SA 3CRUA 4NWYA 4L8EA 4FO5A 2H75A 5AIVA 1GSQA 1G7OA 3F4TA 3TRQA 1GSDA 3IA1A 5CREA 1SD9A 2YNXA 2C0GA 3ZVJA 4H86A 2LJAA 4ISDA 2ON5A 2CVKA 1TP9A 3CTGA 2RLIA 1K0CA 3LJRA 16GSA 1ZZYA 2VLVA 2EIOA 3BBYA 2YWIA 5ECQB 3GSTA 5D96A 2HSYA 3G9BA 3P7XA 1RW1A 2J23A 4RQXA 4ECBA 3SBCA 3Q18A 1OC8A 5DVBA 3UEMA 2V6KA 2H01A 2C0DA 3GL3A 4GSTA 1XXUA 3EWLA 2PERA 5B7CA 2YWMA 3BJ5A 1WWJA 3IPZA 2IMFA 3WGXA 1TXXA 3LEFA 1NW2A 1GTUA 1TRUA 3Q19A 8GSSA 1JHBA 3U5RE 4TOPA 1VGLA 3HDCA 4DSQA 1DUGA 1A0FA 2WCIA 2IMEA 3HKRA 2LRTA 4WF5A 3VK9A 2YCDA 2E2MA 2FHEA 4AGSA 1PL1A 5CRHA 3GX0A 4RI6A 1NSWA 3KP8A 3PR8A 4K0GA 3TKQA 2HFDA 1EZKA 1I9DA 1IYIA 2MBTA 3UBKA 3CYNA 2L59A 4G2EA 5GSSA 2DJJA 1ZYEA 2ON7A 2ZCTA 5ECOB 4YH2A 3GL5A 4MMMA 1KTEA 3ZIJA 3A2XA 5D93A 3GNJA 3IAM2 5LCZA 3UARA 1TI3A 19GSA 4K0NA 3TKPA 3BCIA 2ALBA 2PN8A 5AN1A 3DMLA 1PSQA 2R37A 3KH7A 4ZBAA 3ERFA 1CQHA 2GLRA 4X1UA 4QL9A 3TGZA 3DD3A 1B48A 2DIZA 3FW2A 1S3CA 4MJAA 4KX4A 3QMXA 1TU8A 3WGEA 4PXOA 4AF2A 4BVXA 5INYA 4L5LA 1T4ZA 1V40A 4EO3A 3TUEA 1CQGA 4KCAA 2C3TA 5F0GA 4PNGA 4IQAA 4XS4A 2L4CA 5A4UA 1K0MA 3MWHA 5H5SA 2GSSA 4PGTA 3M0FA 2DMLA 5ID2B 5F07A 2LJKA 1YZXA 4KAEA 1ST9A 1FAAA 5D9TA 4KDUA 3AY8A 1YKCA 3ZVJD 2VO4A 4MF6A 1Z7RA 4Q5QA 5CRDA 4XRDA 3UJ1A 2JU5A 4BPYA 4PURA 4V1Ap 3JCML 4L0WA 2GZYA 1GUMA 3IBHA 2H8LA 4WBRD 1U3AA 2EIQA 1F3BA 2QSIA 1JLWA 2MMNA 3H1NA 1SL0B 3APQA 1K0AA 3F3RA 3ZMKA 2HSHA 3ZRDA 5E59A 2B5YA 1XOBA 2GQMA 4GSNA 3C73A 2IIYA 3N9JA 1EGRA 1JFUA 2KUCA 1A2LA 1W4VA 5CP1A 2X8GA 3E9JB 5A5KA 2VCVA 4G10A 2L5LA 2H30A 5KN3A 4CDOA 1WE0A 1NM3A 2H6ZA 4QL7A 2OADA 1SENA 2IPAA 3PGTA 3RDWA 1A8LA 1PA3A 4IS0A 5IMCA 3TJFA 17GSA 2PVOC 4K2DA 1K3YA 5ECRB 4JZQA 3E3EA 3HJOA 1B4QA 2GT5A 1OC3A 2B7KA 2I4AA 4FH8A 3GA4A 1B8XA 1XW5A 3ZIVA 2H1DA 2PGTA 1PKZA 1XPVA 2OBIA 1OVNA 4ZB9A 1Q4JA 6GSTA 4ZB6A 5LD0A 3ED3A 4ACSA 1MD3A 4MF7A 1HNBA 2KHPA 3O3TA 1V58A 2FUG2 2YWOA 3NIVA 4BA7A 2LS5A 3KMNA 1GRXA 4OFNA 4ZIJA 3D21A 3ERGA 1MD4A 1A24A 5DJMA 5CO3A 5D9WA 3DVWA 5ECMB 5AISA 3KH9A 5CRWA 2A2RA 1VF3A 2IL3A 5DALA 4ZL9A 3LXZA 3QFBC 1VF2A 1ZGNA 3GRXA 3FYGA 2LSTA 3F4RA 2H73A 3QPMA 4I2TA 2HNLA 1FHEA 2OA7A 4MJCA 4K1FA 4WBJA 3Q6OA 3IK7A 1JLVA 2R2JA 2HT9A 2MMOA 2V41A 4O5RA 3LSZA 4KB3A 1RK4A 3KTLA 3QFAC 1SJ6A 1GSFA 5HR0A 4POLA 2M46A 3IRAA 1J9BA 3M1GA 1EP7A 1HQOA 2DJ2A 2VLUA 3GH6A 4MCUA 1GTAA 2BTOT 4G19A 4MJBA 4KUNA 5D73A 1GSUA 3VPQA 4OO4A 3PINA 2ZNMA 4DVCA 3GUSA 4AJ6A 2KP2A 2O8VB 4KDXA 4OCEA 4MPGA 4NV5A 4E8HA 5J41A 2IMIA 2DLXA 1M99A 2OKAA 3CMIA 3CRTA 1AQWA 4J57E 2R6KA 2N5FA 2XHFA 1YDKA 1GNEA 4MP4A 1Z9HA 2LRCA 5JCUA 1WRYA 2FD3A 5ECHB 4DSSA 5ELGA 3FZ5A 4K7OA 5CAXA 2F8FA 5B8BA 1GULA 3C8EA 1ACVA 1YQ1A 1TW9A 1O73A 1YEPA 3IV4A 2MBSA 1X5DA 3FK8A 5EVOA 2VM2A 4PQ1A 1SYXA 4N11A 4I5QA 2RIIA 3Q74A 4HUAA 2VL2C 3FY7A 5KEJA 3ME8A 2FA4A 2X99A 1FG4A 4LMWA 5A4VA 1VF4A 2O7KA 2YWNA 5A4WA 2HZEA 4MJEA 1OKDA 2H0HA 2K8VA 5C04A 1G0TA 2JSZA 1YY7A 2XC2A 2VCZA 5DQSA 2FNOA 5H5RA 2H76A 1FVJA 3LYKA 5G5FA 1XWKA 3WYWA 1M0UA 1WP0A 2PPTA 3A2VA 1XWAA 1O8XA 3C1SA 3HZ4A 4NPBA 2NPBA 2O85A 1DE2A 3KEBA 4TR0A 1AUCA 1GL8A 1ML6A 3TRPA 1WPIA 5DAKA 3L78A 2NBSA 2KLXA 1O8WA 1PGTA 2YJHA 4WEYA 3VWWA 3GIXA 2VIMA 4I6XA 1MDIA 5JWRB 4F2IA 2F8AA 2H1GA 3LYPA 2GS3A 1EWXA 5AGYA 5F05A 1Q98A 2BMXA 4YAPA 1MEKA 5FWGA 1Y25A 2B6MA 1TK5B 1FB0A 2DJ0A 4JE1A 1PX7A 2E2GA 4POBA 3UMAA 3KJYA 4I8BA 3QCPA 1U3IA 2LKUA 3G7IA 1MDJA 3OR5A 3VLNA 5HR1A 1S3DA 1WMJA 3KP9A 20GSA 4KNDA 1TK8B 4IKHA 3F4SA 5DALB 3A3TA 3QOUA 4ECIA 1NHYA 2YV9A 3LWAA 1HNCA 5B6MA 1GLQA 2E0QA 2OE0A 2YJ7A 4EE0A 5B8AA 3D22A 4O92A 1I5GA 1GTIA 1UVZA 1E2YA 3IK9A 1EEMA 4OFTA 2CX3A 1TTZA 1H75A 4KA0A 1SK1A 4HEA2 1PQNA 3IC4A 3UBLA 5CNWA 3VURA 5JCGA 1X5CA 2REMA 3MSZA 1YF0A 14GSA 3U6VA 5IMDA 1DSBA 1QK8A 1THXA 1TRVA 1FO5A 5E4WA 2GGTA 2HE3A 1U6TA 3VFIA 1X9SB 3ZZXA 1T7PB 4WR5A 5ECIB 2VM1A 2AHEA 1XWCA 2WULA 4F0BA 5IIZA 1MDKA 4POKA 1ABAA 2AV4A 2CX4A 3F3QA 1FB6A 1R26A 1YJ6A 1H4OA 1ON4A 2RM5A 4V1Ag 1BYEA 4O7HA 2LTKA 4PQHA 1MTCA 4QQ7A 4IQ1A 4DSSB 3L9UA 1F9MA 1UN2A 4KSOA 1M9AA 3RHBA 2WZ9A 4IJIA 4CHSA 2VLTA 4P3YB 18GSA 1THOA 2FWGA 4TXVA 3QAWA 1JZWA 2PWJA 3EURA 3ZREA 3J7Yk 1GNWA 4N30A 1R5AA 4J56E 1X0RA 2HZEB 2CA8A 5JCWA 2I9HA 3KZQA 1A0RP 4F03A 3IR4A 3DYRA 1R5PA 3GURA 2CV4A 4KDYA 4TXOA 1EP8A 1BAYA 1AW9A 5EL8A 5FHIA 1ERTA 1EV9A 1T1VA 1V98A 5DCGA 5IMZA 3US3A 2WGRA 1A2JA 4V2LA 4MDCA 4TKYA 2LNTA 2YZUA 2DMMA 4GF0A 3D4TA 4BVYA 4WR4A 3TKSE 4HJ2A 3MNGA 3HYPA 4HZ2A 2TIRA 4JEDA 3FZ9A 5DAKB 2H71A 3WT1A 4L0UA 3G7YA 3QAVA 3TRXA 4EC0A 2OACA 4I97A 2VAFA 4HZ4A 5L71A 2VCXA 3M3MA 4V2NA 2FWFA 1XW6A 2YPMA 5IOXA 1AAZA 4N0ZA 3HHVA 3EINA 3ZL5A 1QUWA 2JSYA 2LEGA 2A2SA 3CBUA 4N10A 2YN1A 4XHMA 2C8UA 3DWVA 7GSSA 2DC5A 3A2WA 2P5RA 2FY6A 2PMTA 2IMDA 2E7PA 1TI1A 1GH2A 3HXSA 4NAXA 3TKSA 2CQ9A 4O32A 1XIYA 6GSUA 2CZ3A 3UAPA 2YP6A 2VCWA 3TJJA 2IWTA 2GSRA 4EKZA 4XTSA 3GN3A 3E0UA 3KTBA 2O87A 2G0FA 3EU4A 2FA8A 1X9MB 4ZL8A 3EU3A 4FIWA 1OC9A 1Z6NA 3GSSA 1B4PA 2XPDA 3H4KA 2JL4A 4TW5A 4X43A 2IFQA 1SL1B 4NV2A 4ZBBA 2DBCA 5HR3A 3CSHA 4MZCA 2OJLA 5ECKB 1ERVA 4ID0A 3I6AA 3HA9A 1U87A 5ECLB 2YOIA 1K0DA 1U88A 1FVKA 3ZMLA 5CYYA 1ZMAA 2ZUPA 1G6WA 3IXRA 4ECJA 5IO2A 4NHZA 1XVWA 2C1YA 2K9FA 5G5EA 3QR6A 4OMVA 3UVHA 3GH9A 1R7HA 2HI7A 5IPGA 1QQ2A 2HXKA 1SK0A 2X8HA 1PL2A 3WD6A 1AC1A 1K3LA 4NMUA 3A5WA 1M2BA 1QFNA 2B5EA 1IYHA 2A4VA 5HQPA 3NOFA 4ZXGA 4X0XA 5J9BA 3QDNA 2CT6A 4OO5A 4RUVA 2H70A 3KM6A 1YF1A 6GSSA 3LG6A 5IM9A 2NVLA 3BOAA 2NDOA 1OYJA 2F51A 2LUSA 3CTFA 4TR4A 4YQMA 1AIUA 2FLSA 2B5XA 2LQQA 3IOSA 1TRSA 3WGDA 2Z9SA 4Q5RA 1GUHA 2DJKA 5ABRA 4MLYA 5G31A 2TRCP 3UVTA 1OKTA 4BWSA 4LA1A 4GRFA 4F0CA 2H0GA 6GSYA 2L4QA 1O6JA 2IN3A 4K8MA 2GQKA 5HFKA 4TXOB 2OE3A 2WFCA 2P31A 4OWYA 1TK0B 1BQ7A 1DE1A 4F82A 3BD2A 1S3AA 1T3BA 4KGIA 1F3AA 13GSA 4MABA 3TDGA 5ELAA 4LLRA 1XWGA 3EVIA 2PBJA 5HR2A 5DDLA 1PMTA 1OE7A 3FR6A 2H0IA 5J5NA 4LL4B 3VI5A 1SL2B 5D8IA 3H79A 1N2AA 3ZLPA 1SJIA 4POMA 3GYKA 2KP1A 3TJKA 3QAGA 4HOJA 1Z7PA 2JADA 2QGVA 1XCCA 5HFGA 3MAKA 3R2QA 1X5EA 4ML1A 3S9FA 3SWLA 5DQYA 2NTOA 2VUPA 5F06A 4CW9A 5IMVA 4ZILA 2XBQA 3RHCA 1W89A 2M80A 1N8JA 2GZZA 6GSXA 3KGKA 5ENUA 1PRXA 2H1AA 2D2ZA 3C1RA 4MH2A 4K7IA 2EC4A 2LJRA 3LGCA 3P90A 4AJ7A 4IBPA 1PX6A 4Q5NA 1XZOA 4ML6A 5IMFA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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