4N0ZA

Crystal structure of cisplatin bound to a plasmodium falciparum glutaredoxin 1 (pfgrx1)
Total Genus 37

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
SEAVKKWVNKIIEENIIAVFAKTECPYCIKAISILKGYNLNSHMHVENIEKNPDMANIQAYLKELTGKSSVPRIFINKDVVGGCDDLVKENDEGKLKERLQKLGLVN

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
AH1 (6-18)AH3 (58-70)S3 (77-80)3H1 (45-47)TIV3 (74-77)EMPTYTVIII1 (19-22)S1 (21-25)TIV1 (26-29)S4 (83-86)AH2 (30-42)AH4 (88-97)S2 (48-52)TI1 (52-55)TIV2 (53-56)AH5 (99-107)TIV4 (79-82)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Plasmodium falciparum
publication title Interaction of Cisplatin with plasmodium falciparum Glutaredoxin 1
rcsb
molecule keywords Glutaredoxin
total genus 37
structure length 107
sequence length 107
ec nomenclature ec 1.20.4.1: Arsenate reductase (glutaredoxin).
pdb deposition date 2013-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4n0zA00
2J9HA 4D73B 5ECHB 2DJ2A 4L8EA 1TTZA 4FH8A 4IN0A 4WEYA 5JWOB 2FD3A 1PN9A 1T8EB 4V2NA 4LMVA 3KP9A 3GFKA 5B8BA 4K2DA 2HZFA 4IVFA 2GTUA 1F6MC 1R5PA 3CRUA 3EC3A 4MCUA 2C3TA 5H5QA 2JU5A 4K7OA 3BBYA 4ULXA 1K0MA 1ST9A 1ZCPA 2ZUPA 1Z6NA 3WD6A 5CAXA 3E9JB 3MAKA 3SWLA 4KA0A 1G6YA 4FO5A 2YWIA 1PQNA 3ZYWA 2C3QA 3EU4A 1H75A 2H0IA 2C8UA 4ML1A 4I6XA 4KSOA 5IO2A 5IMFA 2GDRA 4GCIA 4PXOA 4ID0A 3FHKA 1DE1A 1ZOFA 4J2FA 1MDIA 2B1LA 4F0BA 4WXTA 3GHAA 1AW9A 1EV4A 2WJUA 5EVOA 1GNEA 2OBIA 2K8VA 3IDVA 2GSTA 3M1GA 2Z9SA 1A8LA 2AHEA 5ELAA 1ILOA 2K8SA 2BJXA 5B6NA 2B5YA 1KNGA 3P8WA 1M7TA 1PL2A 2LV3A 4HU9A 3EYTA 4LL4B 1MDKA 1AQXA 1K0CA 3IV4A 4K0NA 2P5RA 1ZZYA 2H1GA 4POMA 2C4JA 2LJKA 2LQQA 5DALB 3A5WA 4HZ4A 3H79A 4WF5A 3GMFA 1MEKA 4IGJA 5H5RA 5IQYA 1R5AA 1IYIA 1M2AA 2PN8A 2LNSA 3FYGA 2H8LA 3RDWA 3FR9A 3UMAA 5FHIA 5DJMA 3IC4A 1YY7A 2EIQA 2JZRA 3DGQA 2O85A 2FNOA 4WETA 3W8JA 5JWQB 1VRSD 1F3BA 2IMEA 1E6BA 2FA4A 1G6WA 1GP1A 3H4KA 3QMXA 4DSRA 3ED3A 2WRTA 3NOFA 4NV2A 2LRNA 2LNTA 5KEJA 2B5EA 3JCML 2MMOA 1S3CA 2YZHA 2X8GA 1DBYA 2VOCA 3DRNA 4OD7A 2IMDA 4WR5A 4AF2A 3TRQA 2H71A 3NIVA 2PBJA 2H19A 4OMVA 1F9MA 2GZYA 6GSSA 1XWKA 2QC7A 4XRAA 1CQGA 2P0GA 5IMDA 2GGTA 5GSSA 4ECBA 5HR0A 4NV5A 2R5GA 3F4TA 1EEMA 4GWRA 4XTSA 4YQUA 3TJKA 3TRXA 3F4SA 2AJQB 4MJAA 3GURA 1DSBA 2MMNA 2RM5A 1ZL9A 2ON7A 5F07A 5EY6A 1OC3A 2FA8A 2GT6A 3FRCA 2ES7A 1GL8A 1UA5A 3HJOA 4X0XA 2GSQA 3LORA 4MZCA 2C0EA 3TKQA 1XOAA 2BTOT 4DEJA 3VK9A 3GL5A 2IPAA 1B4QA 3EMXA 3IOSA 2GSRA 1TJDA 5G5FA 4KW6A 3UL3A 3CYNA 2ZNMA 3P2AA 1Y25A 3CMIA 3CSJA 4JR4A 4TXVA 4POBA 2O7KA 1XCCA 3G7IA 4PUAA 4XS4A 3BJ5A 1O8XA 4O92A 2I1UA 1VF3A 4YH2A 3FEUA 2YJ7A 1YEPA 4PGTA 3UVHA 5AGYA 3ME8A 1THOA 3GA4A 3KH7A 1OE7A 2KUCA 1YF0A 3QCPA 1OVNA 2NDOA 1U6TA 2JSZA 3PR8A 2C0FA 2VL3A 4EO3A 3FZ5A 4GRFA 3EWLA 3IBHA 1GTBA 3ZFBA 2H1AA 5F05A 3VI7A 2VLUA 2JADA 3WGEA 1NM3A 1MD3A 5G1KA 1TRSA 4Z7XA 2M72A 1SKSB 5D93A 4EDZA 4LLRA 3E0UA 4ZB8A 2R37A 1G0TA 4I8BA 2ON5A 1T7PB 3H8QA 2FWHA 1XFLA 3CTFA 2V41A 2QKEA 4ZBDA 3BCIA 2E2GA 3WGXA 1SL2B 1ZMAA 4HJ2A 1T1VA 2CZ2A 4TR1A 3VI5A 1BYEA 4QL9A 1MTCA 14GSA 1V57A 1AC1A 1WPIA 3ZRDA 4ECJA 1EOHA 5IO0A 3ZLPA 2MBSA 2MMZA 1SD9A 5F0GA 4ECCA 4FIWA 2OJLA 1X9MB 2E2MA 3TKPA 2DJ1A 3GSTA 3TGZA 2AUVA 4DSSA 4OWYA 4XS4B 1ERWA 2RM6A 3N9JA 3VURA 5D73A 1B9XC 3CSIA 4TR4A 3LG6A 2VUPA 3FR3A 1C72A 4E8HA 2X8CA 2E7PA 1J08A 3VWXA 3GUSA 2I3YA 2LKUA 16GSA 1EGRA 1V98A 4MMMA 3EE2A 1ZYQB 4Q5NA 2KLXA 2NVLA 4XRDA 3TKSA 1IYHA 1OYJA 5B8AA 1TP9A 3CBUA 2H1DA 7GSSA 1SJIA 2OE1A 1FW1A 6GSWA 3RAZA 4MLYA 3P7XA 5DAKB 2LJRA 3GTUA 5F06A 4KDXA 3GSSA 2VL9A 3QD9A 3UBLA 1SK2A 2RLIA 1HYUA 3GRXA 4D73A 3KTBA 3O6TA 4LA1A 1O6JA 3RHCA 2CT6A 3KH9A 2I81A 4NAXA 2C3NA 4KCAA 4K7IA 4TXOB 3GKKA 3M9JA 4OCFA 4TR1B 2YJHA 2AV4A 1WMJA 3C73A 2WCIA 4EXJA 2VLVA 1PMTA 3WYWA 1LJRA 4ILFA 4MP4A 2LRTA 2GS3A 2CAIA 3VLNA 10GSA 1O73A 2DIYA 5D96A 1GSEA 2DSAA 1XW6A 5J41A 4IQAA 2PWJA 2H66A 2YN1A 2GZZA 2VCQA 2N5FA 3D21A 1MD4A 3C71A 1E2YA 3SBCA 2VL2A 3DMLA 3EURA 2O89A 5INYA 4O7HA 1TRVA 2CZ3A 1ERTA 3ZMLA 3EVIA 2G2QA 4MF7A 2PVQA 1X5EA 2NPBA 2A2SA 9GSSA 3M8NA 2YV7A 4IBPA 3BCKA 1V2AA 5ABRA 4K9ZA 1QQ2A 1F37A 4RUVA 1R4WA 3PGTA 4I2TA 3KIJA 3PH9A 4WKWA 3KMOA 4PNFA 2KOKA 3KZQA 2VCZA 2IN3A 2K6VA 2GQKA 3MNGA 5ECLB 4MZBA 3I6AA 4N30A 1OC9A 3IAM2 3HD5A 3VPQA 2B5XA 3ERGA 1A23A 4RI7A 1TOFA 1B8XA 1AQWA 1PKWA 4TR3A 4L5OA 3Q6OA 2C80A 5DALA 3G7JA 1AUCA 4TW5A 3GX0A 3TKSC 4XS6A 1QMVA 4HQZA 3M0FA 5GAND 4N11A 3WT2A 2CQ9A 2WGRA 2H72A 1GH2A 3DVXA 1EZKA 3QPMA 3ZFLA 3G9BA 1PSQA 4YAPA 5A4WA 2CVKA 3HVSA 2FHEA 1HNAA 4YQVA 4AJ7A 5G5EA 3QDNA 1S3DA 5D9XA 2HSYA 4BA7A 4MH3A 1SYRA 2L6CA 3TJGA 1HNBA 2JACA 5IMAA 1SL0B 3O76A 2D2ZA 2DIZA 1A2MA 1ML6A 3HXSA 1N2AA 3H93A 5KN0A 4HQSA 1GSUA 4X43A 2VAFA 2L4QA 5CP1A 3DD3A 2V6KA 3CXGA 2J23A 1HNCA 4FYUA 5C04A 17GSA 3KEBA 4V1Ag 3ZIVA 5G31A 2DBCA 4L0UA 1PX6A 3F6FA 1OC9B 4NWYA 3PINA 4GSTA 2TRCP 4HZ2A 3CRTA 4O32A 1K0NA 4PQHA 1ERUA 1AQVA 3UVTA 2CVBA 2VL2C 3DVWA 5A5KA 4NXIA 5EPFA 3ERWA 1I5GA 3DWVA 3TOUA 4DSQA 2F3MA 3VFIA 3A3TA 4K7NA 3DKSA 4EVMA 4TR0A 3UOMA 2YWMA 2H6YA 3U6VA 1V9WA 3CSHA 1BEDA 1UN2A 3TJFA 2XPEA 1QXHA 4MPGA 4QL7A 5DJLA 2P5QA 1K3YA 5EL8A 1TW9A 4HI7A 1HQOA 5HFKA 1R7HA 1B48A 5ECPB 3KXOA 1TI3A 3UAPA 4ISDA 4N0ZA 2L5LA 1FB0A 5JCWA 1J9BA 1XXUA 2OA7A 2M46A 2XBIA 5GZZB 5DCHA 2FWEA 2IL3A 3HVXA 2LSTA 2ALBA 1JHBA 4AGSA 2WDUA 1PKZA 2WFCA 4K0GA 2FWGA 3H1NA 3LYKA 4PX1A 2OACA 1U87A 1UC7A 2CAQA 2V32A 3HY2A 2XC2A 3IRAA 2NBSA 4GSNA 1QUWA 2LUSA 4ZB6A 4PNGA 1SU9A 2KHPA 3GH6A 5CYYA 1GUHA 1YJ6A 2REMA 3Q18A 2X99A 1NHOA 2R6KA 4OFTA 3ERFA 5CRWA 3UJ1A 4KSMA 3ZVJD 1O81A 2EIRA 2YP6A 2HE3A 2XBQA 2IJYA 4TKYA 3QOUA 2OBKA 2VM2A 4WR4A 2DC5A 1K0OA 2M80A 4IS0A 1ERVA 2L59A 6GSYA 5C00A 2L5OA 3TOTA 1SL1B 1W89A 2GQLA 5ECIB 2OE3A 4OCEA 3KMNA 4MJCA 3TKSE 3LEFA 2HYXA 2HI7A 1FO5A 1GSQA 2VCWA 1GSFA 4KUNA 3V1WA 1XW9A 1XPVA 3I43A 2YV9A 3IHQA 5LCZA 1EWXA 2B1KA 3VWUA 1GTAA 2PUKC 4EC0A 4OO4A 2YZUA 2LQOA 4Q5QA 5CO3A 1Z5YE 1XW5A 5IIZA 1R26A 4CHSA 5DVBA 2KP2A 2C1YA 4TN8A 3J7Yk 3ZREA 2VM1A 2LTKA 5DAKA 5ECMB 4ECIA 3C8EA 5ID2B 3TDGA 4WBRD 4I2UA 4XS1A 5DBQA 4F0CA 1PX7A 3HZ4A 1X5CA 1RW1A 3IE3A 5IOXA 1FHEA 1T4YA 4L0WA 3A2WA 1FAAA 4TXOA 5COHA 5J9BA 1M2DA 1A8YA 4J57E 4MPFA 2YPMA 5DQYA 1K0BA 5ECSA 2X8HA 1XZOA 4F2IA 1TK5B 3MDKA 3IA1A 1AXDA 5E59A 1QGVA 4MDCA 1GLQA 1ZYEA 5AISA 1JLWA 1X9WB 3GYKA 5D9TA 4OFNA 4ZBBA 3RPNA 4TVEA 4HJMA 1SYXA 3L9SA 1A2JA 4JR6A 2ZCTA 2V1MA 3C1SA 4IW9A 22GSA 2WB9A 5JCGA 1A2LA 4OO5A 4XIHA 1NSWA 3IK7A 1Q4JA 4ZXGA 4BPYA 2HT9A 5GSTA 2WS2A 3KCMA 1FOVA 1VF2A 4Q5RA 1PRXA 4JZQA 4K8MA 3UBKA 1JFUA 4YAVA 3IPZA 2YNXA 4G19A 1YF1A 1O7UA 3ZTLA 4KAEA 1M9AA 1TU8A 2H30A 1JLVA 4I5QA 1EOGA 1OAZA 3D0ZA 4IJ3A 4K6XA 4HUAA 5B7CA 1ON4A 3Q19A 4KCEA 5HFGA 1GTIA 2R3XA 1U88A 3UIWA 3LFLA 1A0FA 1YEXA 1X5DA 1QK8A 2A2RA 1SD8A 2IIYA 2C0GA 3IXRA 1YKCA 3DYRA 3F3QA 5D9WA 1Z7PA 3LGCA 5IOWA 3LYPA 1YQ1A 3F6DA 4CW9A 1TRWA 3BD2A 3WGDA 4F82A 1M99A 4POLA 2DMLA 4QQ7A 4MF5A 1Z3EA 3KP8A 4TRXA 4EF0A 5CNWA 4WF4A 1GLPA 4MF6A 5IMCA 2HZEB 2H0GA 1W4VA 2FUG2 3FKFA 1WIKA 3L0HA 3LWAA 2FY6A 2RUEA 5ECKB 1SK0A 1YKAA 3O3TA 1X9SB 5ECNB 6GSXA 4TOPA 2HRFA 4BWQA 5ECOB 2K18A 5CRHA 1NHYA 4RQRA 4IHUA 2GSSA 4V2MA 1WP0A 2IFQA 3MSZA 4PURA 1OC8A 2YWNA 4MK3A 5KN1A 5LNKe 3D5JA 1GULA 1AAZA 2CVDA 2P31A 13GSA 1VF4A 3U5RE 4GSSA 3ZZXA 1JZOA 4IP1A 1JZRA 4GQFA 3GH9A 2MBTA 5KN2A 4N10A 1Z9HA 3DXBA 2VIMA 4IP6A 5G2ZA 3EMPA 6GSUA 1GSDA 3ZITA 2B6MA 2O87A 1BJXA 2TIRA 2JZSA 1SJ6A 3EU3A 1XVQA 2OKAA 1OE8A 5A4VA 3W6GA 1TXXA 20GSA 3HDCA 1XWAA 2L4CA 2PMTA 3IR4A 1XOBA 1F3AA 2IMKA 4X1UA 3TB2A 2QSIA 4EKZA 2I9HA 4HOJA 4XCSA 4GXZA 1YDKA 5J3RA 4WBJA 1NW2A 4F9ZA 1ZGNA 3FK8A 11GSA 2XPDA 2JSYA 1LU4A 3QAGA 1KTEA 1WWJA 1K0DA 4F03A 1LBKA 2IFQB 3VWVA 2XHFA 5L71A 2DJJA 3LQ7A 1EV9A 1TK0B 1VGLA 4BL7A 2VD1A 2H0HA 2B3SA 4NHZA 3GKXA 3APOA 3KD0A 1EP8A 1I9DA 1G7OA 5HFIA 4ML6A 2H76A 3P90A 4IQ1A 2R2JA 3D22A 4JEDA 1PA3A 3L9VA 1WJKA 2PERA 1PD21 1GUMA 3F8UA 3GV1A 1TK8B 2IWTA 4MJBA 3TUEA 3FY7A 1FG4A 1KEBA 1QFNA 2A4VA 1GTUA 4JU5A 4H86A 2KP1A 2AB6A 2DMMA 2YANA 1THXA 4EE0A 3GKNA 2CX4A 2H01A 1BG5A 4IELA 4JBBA 2VO4A 2DJ0A 5HR1A 4BVXA 1SK1A 1H4OA 3WT1A 4IKHA 5FT3A 1WOUA 5J9CA 1ABAA 2L57A 3US3A 1EEJA 3TJJA 3D6IA 3IK9A 1JZDA 3HJMA 3KM6A 2N5AA 3RBTA 5GAPD 5FWGA 2B7JA 2H6ZA 3FZ9A 3HCZA 1EGOA 1ACVA 2FGXA 4MABA 3MWHA 2HLSA 3K8NA 1Z7RA 3D4MA 3R2QA 5ELGA 2HFDA 3ZMKA 1XWBA 5HR2A 2AYTA 2B7KA 2JZTA 4PQ1A 1UVZA 4MJEA 5AIXA 1TRUA 3A2XA 5A4UA 3APQA 4P3YB 2GVPA 2VCTA 4FYBA 1BQ7A 1GRXA 1O8WA 2L6DA 2PVOC 3VWWA 1O85A 3F3RA 2IMFA 5ID2A 1PL1A 5IPHA 1B9YC 2IMIA 3QFBC 1A0RP 3VPTA 1XVWA 5JCUA 1M9BA 3RHBA 2GT5A 3GNJA 1WE0A 4V1Ap 3TJBA 1TI1A 3N5OA 5ENUA 4AJ8A 1MDJA 1G7EA 4ZB9A 3GL3A 4NPBA 5E4WA 2G0FA 1K0AA 2H1BA 3M9KA 2TRXA 3HYPA 3F4RA 3GIXA 4JRRA 1XWCA 2OE0A 1M2BA 2WZ9A 4G10A 4KB3A 3LXTA 5HQPA 2MZCA 1HD2A 2YWOA 2RUFA 4ZL8A 12GSA 2DLXA 1F2EA 1PGTA 3KTLA 1GUKA 1BAYA 3TCOA 1DE2A 3L78A 3TKRA 2CV4A 2HRNA 4KX4A 3DIEA 3Q74A 1FVJA 1DUGA 2N5BA 3APSA 19GSA 3G7YA 3E3EA 2R4VA 2JL4A 2LS5A 4RI6A 1XIYA 2GQMA 1S3AA 1K3OA 2LEGA 4GTUA 2FLSA 5CRDA 5AN1A 3UARA 5DCGA 4K1FA 4HU7A 2EC4A 3UEMA 2BMXA 2AAWA 2V2GA 2LJAA 3QR6A 4PQIA 2VCVA 2VCXA 4HEA2 4GQCA 4FYCA 2VD0A 3QFAC 2GZPA 5CREA 1V58A 1FVKA 4KH7A 1BX9A 3I9V2 4I97A 1TU7A 1GSSA 3LSZA 1EP7A 2HXKA 3LXZA 3KJYA 3NZNA 4NMUA 2O8VB 3W8SA 1RQMA 2MMAA 1GNWA 3C1RA 5G1LA 3ISOA 2H74A 5D9VA 1M0UA 4KDYA 2X64A 1OKTA 4G9HA 4Q5FA 5F8BA 5DDLA 1URMA 1TDIA 5IPGA 3HVVA 1RK4A 5B6MA 5ECRB 5HR3A 4BWSA 2NTOA 2PPTA 3AY8A 2H70A 5DQSA 3ZVJA 3IAS2 3LJRA 2HZEA 3HHVA 4EL1A 2H75A 2E0QA 1V40A 4MZWA 2F8AA 4PUFC 3EINA 5IMVA 4EUYA 2PU9C 4KDUA 1T00A 2OADA 2K9FA 4GF0A 4ZL7A 3J7Yb 2WULA 1T4ZA 18GSA 4HS1A 3C7MA 4XHMA 2F9SA 4ZILA 3ZIJA 2C0DA 1J0FA 3OR5A 1JZWA 4RQXA 3A2VA 2PGTA 4ZL9A 3HZ8A 1U3AA 2QGVA 4G2EA 3GN3A 2H73A 1XWGA 5G30A 1X0RA 3GKMA 1WRYA 2I4AA 1OKDA 3L4NA 4J56E 2MYGA 2FCHA 4O5RA 1Y6EA 4KGIA 5H5SA 4DVCA 1KBNA 2V6OA 2LRCA 3BOAA 3L9UA 2VLTA 3KGKA 3HA9A 4OFMA 5AIVA 1GSYA 1XBSA 3FR6A 5IMZA 1T3BA 5JWRB 5CRGA 1Z6MA 4MH2A 4POKA 4BVYA 6GSTA 3I69A 2HNLA 2CX3A 1GWCA 1SENA 3CTGA 1TKDB 1AIUA 2F8FA 1VF1A 4KE3A 5IM9A 3RPPA 3QAWA 4V2LA 3TRPA 1A24A 1N8JA 3M3MA 4LMWA 2RIIA 2YCDA 4GLTA 1B4PA 3HKRA 1SKRB 4ACSA 4MA9A 3DEXA 2FWFA 4DSSB 4LL1B 3F0IA 3F9UA 3FW2A 4HDEA 2HSHA 4CDOA 5KN3A 2GLRA 3GX8A 3ME7A 5D8IA 1Q98A 2YOIA 8GSSA 4NHWA 5J4UA 4AJ6A 5J5NA 1CQHA 1FB6A 4ZBAA 2EIOA 4IJIA 1SKWB 1K3LA 3FZ4A 3F63A 3QAVA 1SJZA 3S9FA 4YQMA 2DJ3A 2CA8A 3FZAA 4JE1A 2F51A 4ZIJA 2H6XA 4N0VA 1U3IA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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