4N30A

Crystal structure of pseudomonas aeruginosa dsba2
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
182
structure length
182
Chain Sequence
KGLPANHSLYGDAKARWTINEYADLECPFCKVYTPRLKRWVDSHPDVNLVWRHLPLQMHGEAARHQARLVECAGIQGGAKAFWSAIDAIFAQSAGNGGGLPGGTLDFPELDQARLEKCAKDNELIDSDIKLDIDIARSKGITATPTLVIRDNQTGRSVKLEGMADETTLLSAIDWLAKDLLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Dissecting the machinery that introduces disulfide bonds in Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Protein disulfide isomerase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 71
structure length 182
sequence length 182
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13462 Thioredoxin_4 Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4n30A00
5KN2A 1A24A 3RHBA 4CDOA 5DCHA 4OFNA 1SL1B 3TJJA 4N0VA 3C8EA 2C8UA 4X1UA 5CRHA 3F9UA 3GFKA 3ZFLA 4O32A 2H1DA 1GTIA 4ZIJA 5D8IA 1BYEA 1GLQA 4G10A 2F9SA 2YN1A 1FVJA 1K0NA 4FIWA 5CYYA 3BCKA 3IR4A 2FNOA 2J23A 1X9SB 2C3NA 3GKNA 4RI6A 1U3AA 3F3RA 3U6VA 2JACA 2ES7A 2V6KA 1XWGA 1S3CA 1GRXA 4MH2A 1IYIA 1O85A 5A4UA 5G5FA 2REMA 3TRPA 3TRQA 1Y25A 2EIQA 2R3XA 4TR1B 5H5SA 5JWOB 9GSSA 4KX4A 3EE2A 4NV2A 5ELAA 3QMXA 5D9WA 1OAZA 1TU8A 12GSA 1XWKA 4TXOB 5GZZB 1OC8A 3F63A 4I97A 2CAIA 2VCZA 4L8EA 2V41A 2H01A 3US3A 1JFUA 2YV7A 5C00A 3G7IA 4V2LA 3TJKA 2PERA 4RI7A 2LEGA 3KM6A 1K0BA 1R4WA 2OACA 3DXBA 5KN3A 2V1MA 1V2AA 3FY7A 2RLIA 1U3IA 2M72A 4PNGA 2L4CA 5ECQB 3Q74A 6GSSA 2V6OA 3HZ4A 1JHBA 2IMFA 1WMJA 1PX7A 1F3BA 2KUCA 5HR1A 22GSA 4OWYA 1TXXA 2GQMA 4HI7A 2AJQB 4KDXA 2HFDA 2TIRA 2G0FA 2IMEA 3HA9A 2YV9A 6GSUA 2YANA 5ELGA 4IBPA 1B8XA 3U5RE 5HFGA 2L6DA 3KZQA 2MZCA 3OR5A 3TDGA 1SK0A 3IA1A 4KAEA 4NPBA 1FG4A 1EWXA 1XXUA 2HZFA 4HJ2A 3DD3A 2E2GA 2IFQA 1CQHA 1GULA 4L0UA 5IPHA 7GSSA 3ZMLA 2VL2A 2VIMA 2I1UA 1JZDA 3Q19A 1GP1A 3VWXA 1SL0B 2P5QA 2VL9A 2WB9A 3VLNA 1SJZA 3DWVA 1EGOA 2QC7A 4J56E 1X5CA 3D22A 4OCFA 5CO3A 3A2XA 3WT2A 1XWAA 4CW9A 2IPAA 5DCGA 3KP8A 4K0GA 2H1AA 3CMIA 3J7Yb 2GQKA 1SK2A 1O81A 1H75A 4XS6A 3WD6A 4N30A 1PD21 1ABAA 19GSA 4JEDA 5D96A 3QDNA 3BBYA 3ERFA 3G7YA 4IN0A 3P2AA 2GT5A 4EXJA 2CV4A 2FWEA 3GKXA 3MNGA 1XVQA 5ECHB 3O6TA 2IJYA 3L9VA 1PA3A 5ECNB 3EYTA 1XOAA 2DJ1A 2XPDA 1V57A 1FB6A 3E0UA 4NXIA 4ZBBA 4MK3A 4D73B 3HD5A 1SKSB 2LQOA 4MLYA 1ZCPA 1YKCA 2FWFA 2JZTA 3TCOA 3TGZA 3E3EA 5IMVA 3GV1A 2PBJA 1BEDA 3I69A 3QFAC 2VCXA 3FR6A 4HJMA 4IW9A 3D0ZA 1ACVA 4JBBA 1E2YA 5B7CA 4K1FA 1XZOA 2JL4A 3IXRA 2AB6A 1F2EA 3ZYWA 5ECMB 3WGXA 3UOMA 2MBSA 2PN8A 1GWCA 4OMVA 4TW5A 1ZOFA 2GS3A 4KSOA 2GSTA 1A8YA 1W89A 4MPGA 3UL3A 3C7MA 3HVXA 3HKRA 3VFIA 2H72A 1YQ1A 4HZ4A 1UA5A 3ZZXA 2N5FA 1X9WB 4PUAA 4QL7A 1XIYA 4E8EA 2GZPA 2A2SA 4MJAA 4I6XA 4X43A 1X5EA 3KGKA 2LQQA 5F05A 2KHPA 4DSSA 3FK8A 5J9CA 2H30A 1TRVA 2Z9SA 1G7EA 2VCTA 3L9SA 4FYBA 2YJHA 1FW1A 2A4VA 1RW1A 1UVZA 5IMCA 2H6YA 2FWGA 1B4PA 1ST9A 4TXVA 3APOA 3GL3A 2C3QA 2DIZA 4GLTA 1EOHA 1GLPA 3BJ5A 20GSA 1V40A 1TRSA 3FR3A 4GSSA 2E0QA 4TRXA 2CT6A 3S9FA 1TW9A 4PURA 4WBRD 3P7XA 4MF5A 4OD7A 3EURA 3BD2A 3LQ7A 1K0DA 4ZB8A 3UVHA 4EO3A 2YNXA 4Z7XA 4PX1A 5ABRA 1RQMA 2HRFA 1BJXA 5E59A 2L5OA 1VGLA 1J0FA 1PRXA 4F9ZA 4DVCA 3VPTA 4KDYA 1R5AA 3IOSA 1EV9A 5JWQB 4K8MA 3KIJA 1TRWA 2PU9C 1GNWA 5G5EA 3M1GA 1OKTA 4IQ1A 3VK9A 2I9HA 2FCHA 2O8VB 4O5RA 4YAPA 3O76A 2IFQB 1WE0A 1NHYA 2VUPA 3TKSE 2VM2A 2AAWA 5IMAA 4KGIA 4KSMA 3TOTA 1K0MA 2P5RA 2PMTA 3CXGA 2PUKC 4PGTA 2NTOA 1AQXA 3KXOA 1RK4A 4K0NA 2YJ7A 1U88A 3M8NA 1A2JA 3UJ1A 3F3QA 3HY2A 2YZHA 2R4VA 2XBQA 5ENUA 3PINA 1VF4A 1UC7A 2B1KA 4Q5RA 2H6XA 2DJ0A 5G30A 1DE2A 3VI7A 5INYA 3KMOA 4G2EA 2FHEA 2GZZA 1NSWA 4XIHA 2LSTA 2LRCA 5FT3A 4K7OA 3GRXA 4JR4A 1GSYA 3D6IA 4ECCA 1A2MA 2H0HA 2DJ3A 3KP9A 2DC5A 3TKSA 3VI5A 4E8HA 4EE0A 1VF3A 1PKZA 3GL5A 2DLXA 1FOVA 3WYWA 3PR8A 2KP1A 4POMA 3GTUA 5G1LA 1AC1A 2IIYA 2LNSA 2OJLA 1FB0A 5JCUA 6GSXA 2TRCP 4HQSA 3H8QA 6GSWA 2CVDA 2L57A 4LMVA 4MF6A 3W8SA 4J2FA 3DYRA 1BG5A 2B5XA 2O85A 3VWWA 2R37A 1J08A 3GN3A 3L4NA 1A23A 2MBTA 4MZWA 5D9XA 4IKHA 1AIUA 1WRYA 3KJYA 4NHWA 2FD3A 4F0CA 4ID0A 3E9JB 4IS0A 2VLUA 1SENA 3C1SA 2F3MA 2MMZA 2RUFA 3QCPA 1G6YA 3UVTA 4KNDA 4WEYA 1A2LA 2YWMA 2OE0A 4NHZA 1TI1A 3ME8A 1J9BA 3DVWA 3G7JA 3GIXA 5H5RA 5HFKA 5KN0A 4DSSB 1F3AA 1SD9A 1VF2A 4G19A 2I4AA 4HUAA 2VOCA 5COHA 2OE1A 5G1KA 3LG6A 3FR9A 1CQGA 2OA7A 4MMMA 3C73A 2D2ZA 2MYGA 4ACSA 1PMTA 4Q5NA 3IPZA 3HHVA 1ML6A 1ZGNA 4L5OA 3LSZA 5HR2A 3GH6A 1IYHA 1LJRA 3CBUA 3NOFA 4I2TA 5DVBA 4ULXA 1V9WA 1TRUA 3M9JA 1I5GA 2L59A 2H1BA 5F8BA 2O7KA 2GTUA 4CHSA 1WIKA 5CP1A 5J41A 2LTKA 2C1YA 2HNLA 1ZMAA 3ZREA 3DGQA 1FVKA 3IBHA 4TR4A 2C0FA 3EU3A 2N5AA 4OO5A 3H1NA 3TOUA 2YP6A 2LJAA 2YCDA 3F4RA 2WDUA 1PX6A 5DAKA 3ISOA 2IL3A 4L5LA 2CVKA 5ECSA 5AN1A 5DJLA 3GMFA 1ERUA 2VD1A 3IK7A 1XOBA 4KH7A 3LXTA 3AY8A 2DIYA 2FGXA 1WP0A 2H74A 2AUVA 3LYKA 1M2BA 4IP1A 1GTUA 1DSBA 2X8GA 5A5KA 2IWTA 4AF2A 2OBIA 5J4UA 2GSQA 2LRNA 3FEUA 4HOJA 1PL2A 2ON5A 4IJIA 1HQOA 3ZFBA 3J7Yk 1B4QA 4G9HA 4BA7A 3F4SA 2HZEA 2XBIA 4HDEA 17GSA 3KEBA 2GDRA 3ERGA 4BWQA 3L0HA 2VCWA 5GSSA 4ECBA 3L78A 4YAVA 1QK8A 5ECPB 3QR6A 4K7IA 3Q18A 1TJDA 2HSHA 18GSA 1ZYQB 3KMNA 1QUWA 3UMAA 4RQRA 5CAXA 4YQUA 4V2NA 1B9XC 4AJ8A 1HNAA 3QAVA 1TU7A 4ZBDA 3GTUB 5A4WA 4V2MA 1YZXA 1Z3EA 5B6NA 1WWJA 4K6XA 1U6TA 1EOGA 2LNTA 1GL8A 4POBA 4HU7A 1OC9A 1SKWB 2DMMA 2LJRA 2EIOA 1MTCA 3CSJA 2VL3A 2C4JA 1YJ6A 2PPTA 2M46A 10GSA 1JZRA 4MJEA 1M99A 5DQYA 1GSEA 4AGSA 4QQ7A 4BVYA 1M2AA 1O8WA 1GUKA 1KEBA 4IQAA 5IPGA 1Q4JA 3H93A 5AIVA 2H73A 2GLRA 5DDLA 16GSA 4ZB6A 1M9BA 3I9V2 3HJMA 4IVFA 1SU9A 4FYCA 5CRDA 1U87A 1AAZA 4NAXA 2ZUPA 1SYRA 3F6FA 2VCVA 3WGDA 1UN2A 1SK1A 4WBJA 2TRXA 5L71A 4WR4A 2HI7A 1FHEA 3G9BA 2B7KA 2XPEA 2LKUA 5J5NA 1Q98A 1B48A 2R6KA 2C3TA 2V32A 4TKYA 4TVEA 4ILFA 5E4WA 4MZCA 4WKWA 4POLA 2CX4A 3EU4A 5HR0A 3ZL5A 2CA8A 2VLVA 1K3LA 3WT1A 3APSA 1QXHA 1T4ZA 1Z9HA 3HVVA 3GUSA 4BPYA 1AW9A 1YF0A 3LGCA 2WS2A 3VWUA 1K0AA 3TKPA 3D4TA 3DEXA 5DQSA 2ZCTA 2C0DA 2K9FA 3CTGA 5IOXA 5IMFA 3EVIA 1S3AA 4TR3A 1TK0B 5AIXA 1XW5A 4IELA 3UBKA 3FKFA 4O7HA 4RUVA 2DMLA 1TI3A 5HQPA 2FWHA 3UARA 2YOIA 8GSSA 5GAPD 3GURA 2X99A 4AJ7A 1O73A 3IE3A 2KOKA 4WF4A 2LV3A 3P90A 2L6CA 5F06A 2H66A 1TK8B 1T3BA 3HJOA 1FAAA 2R2JA 1ON4A 1YKAA 4YQVA 4GF0A 4XS1A 4LL1B 4IGJA 1QGVA 4BVXA 2I81A 2YWIA 3LFLA 3RDWA 2VAFA 5GSTA 5DAKB 1A0RP 4TOPA 3H4KA 3EMPA 2I3YA 1OC3A 3LJRA 2HXKA 3ZIJA 4K7NA 4XS4A 1EP7A 3NZNA 5ECIB 2GGTA 2B3SA 3RPPA 1ERTA 5KN1A 3HZ8A 2H8LA 2FA8A 4KCEA 4K2DA 4BL7A 5DALA 4F2IA 2JZRA 2H70A 3M0FA 3RBTA 4YQMA 13GSA 2JZSA 5EY6A 3W6GA 2HZEB 2BTOT 4MJBA 3GH9A 3D21A 4HZ2A 3GHAA 1DBYA 1F9MA 2DJKA 1Z7PA 3UIWA 3M9KA 3ZTLA 3FW2A 2B6MA 5IO2A 3QOUA 4ZILA 2PWJA 4KB3A 1SYXA 3TB2A 1GTBA 2IMKA 1Z6NA 3GX8A 3HDCA 3GKKA 2QKEA 3V1WA 3QD9A 4MDCA 3GA4A 3EC3A 2CVBA 2AYTA 4J57E 2MMNA 3FYGA 1A8LA 2KLXA 4RQXA 6GSVA 3LWAA 4N10A 4EF0A 11GSA 5A4VA 4BWSA 1OC9B 3TRXA 4LMWA 1GSDA 2H75A 3IAS2 4Q5QA 2WZ9A 4MCUA 2J9HA 2CX3A 2O89A 3O3TA 4EVMA 5ECOB 1AUCA 2PVQA 2GSRA 2QGVA 2F8FA 2WRTA 2VD0A 1MD3A 1O7UA 3IDVA 2F51A 1R26A 4EL1A 2HT9A 2R5GA 4O92A 1FO5A 3HJPA 5FHIA 3GKMA 1N2AA 2P31A 5LCZA 1LU4A 3I6AA 2NBSA 1NHOA 4KCAA 4OO4A 2HYXA 4AJ6A 3KTLA 4ML1A 1DUGA 1JZOA 5DBQA 2K6VA 2AV4A 4JRRA 1THOA 1H4OA 4GWRA 1XWBA 1VF1A 3UBLA 2H19A 3ED3A 1HD2A 2E2MA 2DSAA 1EZKA 3UEMA 4GXZA 2OBKA 2VCQA 2CZ3A 2LRTA 4OFTA 4MABA 2K18A 3RPNA 5LD0A 5H5QA 3C1RA 4EDZA 1DE1A 1GUHA 3M3MA 3ZLPA 2FLSA 3FZ9A 1GSQA 2AHEA 2RM6A 2GSSA 3CTFA 1QFNA 4YH2A 1PQNA 3I43A 2VLTA 4LA1A 2WGRA 1X5DA 5C04A 3ERWA 3HCZA 3FRCA 1HNCA 4OCEA 4K9ZA 4ML6A 3MSZA 5KEJA 2E7PA 1XWCA 3FZ4A 3ZVJA 4HU9A 3QAGA 3ZVJD 2XHFA 4PQHA 2B7JA 5IMDA 4XCSA 2HSYA 2OE3A 2O87A 4GRFA 4MZBA 5ECKB 3RAZA 3GX0A 1GTAA 1EGRA 4XHMA 4L0WA 1AXDA 2BMXA 1XW9A 3KH9A 2JSZA 2VL2C 1WOUA 2WULA 1GSFA 2LS5A 2X8CA 4F03A 4F82A 1GSSA 2WCIA 5CRGA 1Z5YE 4JR6A 1SD8A 4XTSA 1Y6EA 3WGEA 1M2DA 4ZB9A 3TJGA 5CREA 4EUYA 5J3RA 1XCCA 4XS4B 1V98A 1OVNA 4H86A 3P8WA 4EDYA 1XPVA 1M9AA 4ZL9A 5HR3A 2YZUA 1MDKA 3DKSA 5DALB 2PVOC 1K0CA 3TJFA 3CYNA 1JLVA 1G0TA 3ZMKA 3APQA 3JCML 3Q6OA 4KE3A 1JLWA 3W8JA 2HLSA 5B6MA 3RHCA 2NPBA 4JE1A 3VWVA 1XW6A 3HYPA 1SJIA 3SBCA 3L9UA 2C0GA 3KCMA 6GSTA 4Q5FA 2H76A 2QSIA 1SKRB 2V2GA 1XFLA 2NVLA 1A0FA 3IAM2 2MMOA 4GSNA 1K0OA 3DVXA 3GYKA 5EL8A 5IOWA 4KUNA 2CZ2A 5ID2A 2VM1A 4NMUA 1W4VA 1ZYEA 4FYUA 1I9DA 4KA0A 2NDOA 1ILOA 1T00A 4GTUA 4GQFA 2C0EA 1TK5B 4GSTA 3F4TA 1YDKA 1ZL9A 2YPMA 2IN3A 4EKZA 4V1Ap 4WF5A 1VRSD 2HRNA 2P0GA 2DJJA 2B5YA 1TTZA 3C71A 1ZZYA 5D9VA 4POKA 2HE3A 1USBA 1PGTA 4IP6A 1OE7A 1MDJA 4F0BA 1F37A 4KDUA 5IO0A 2OADA 5AGYA 3DMLA 2F8AA 4QL9A 1E6BA 4ZBAA 1PSQA 5FWGA 3EWLA 1N8JA 3PGTA 4NV5A 2H0IA 5J9BA 1YEPA 1NW2A 3IHQA 2N5BA 3TKRA 1BQ7A 2G2QA 1GNEA 3CSIA 4PQ1A 4DSRA 1QMVA 2LJKA 1XBSA 1K3YA 4LLRA 5ECLB 2LUSA 4JU5A 1F6MC 4IJ3A 3A2WA 1TDIA 2GT6A 2WFCA 1T8EB 4MF7A 4I8BA 3ZITA 1YY7A 1QQ2A 3D5JA 3QPMA 3K8NA 2VO4A 1MD4A 1GSUA 3MDKA 3MAKA 3FZAA 3TJBA 1B9YC 2ZNMA 4N11A 3CRUA 3HXSA 2X8HA 4TR0A 4GCIA 2YWOA 3ZRDA 4HS1A 3EMXA 4PXOA 3ME7A 5F0GA 2FA4A 3UAPA 3HVSA 3F8UA 3VURA 1Z7RA 4HQZA 5DJMA 14GSA 1K3OA 2MMAA 1SL2B 5CNWA 1AQVA 2GVPA 3GSSA 5JCGA 3N9JA 2IMDA 2H6ZA 5JCWA 4IHUA 4ECJA 1X9MB 4WR5A 1LBKA 4P3YB 4GQCA 2H71A 4TR1A 2WJUA 2B5EA 1G6WA 2ALBA 3LEFA 2B1LA 1R5PA 3CRTA 3LYPA 1YEXA 2ON7A 2YWNA 2DJ2A 4WETA 2EIRA 4TXOA 3A2VA 1TOFA 4DSQA 4FO5A 1URMA 3CSHA 5EPFA 2K8VA 1KNGA 4ZL7A 3KH7A 3A5WA 3IK9A 3QFBC 2GZYA 1T4YA 3A3TA 1BAYA 1R7HA 4JZQA 2BJXA 5CRWA 1EEJA 4HEA2 1TKDB 1X0RA 4TN8A 4ZXGA 1O6JA 3TKSC 1OE8A 2KP2A 3IV4A 4X0XA 3IRAA 4MJCA 3F0IA 5D93A 4I2UA 4WXTA 1KBNA 1V58A 3H79A 4V1Ag 4MPFA 4MH3A 4DEJA 4EC0A 2DBCA 1THXA 3N5OA 1MDIA 2GQLA 5G31A 2L5LA 1EV4A 1TP9A 3QAWA 1GUMA 1ERWA 1M7TA 2CQ9A 3BOAA 3LORA 5ID2B 4KW6A 1OYJA 5IIZA 1G7OA 4PUFC 3NIVA 5JWRB 4MP4A 1JZWA 3GNJA 5LNKe 1WJKA 1O8XA 4MA9A 2RM5A 3SWLA 2RIIA 2C80A 4NWYA 1EEMA 3R2QA 4XRDA 1NM3A 1HYUA 2FUG2 1Z6MA 4I5QA 3IC4A 1PL1A 1S3DA 5GAND 1HNBA 1ERVA 1AQWA 4XRAA 5B8BA 1SJ6A 4N0ZA 2JADA 1BX9A 2JU5A 4OFMA 3DIEA 5D73A 2IMIA 1MEKA 1M0UA 2M80A 2H0GA 4ZL8A 1WPIA 3PH9A 3VPQA 3MWHA 2K8SA 2RUEA 2X64A 3KTBA 5EVOA 1EP8A 5HFIA 1PKWA 3DRNA 1KTEA 5IM9A 3ZIVA 3F6DA 5ECRB 5IMZA 1PN9A 2H1GA 1T7PB 3BCIA 5AISA 4LL4B 5D9TA 2CAQA 4ECIA 1GH2A 1YF1A 3EINA 1OKDA 3D4MA 4PQIA 3FHKA 2JSYA 1XVWA 6GSYA 1C72A 2XC2A 5F07A 2OKAA 2EC4A 2FY6A 3LXZA 4FH8A 5G2ZA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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