4O32A

Structure of a malarial protein
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
89
structure length
89
Chain Sequence
NTVIVLYFFAKWCQACTMQSTEMDKLQKYYGKRIYLLKVDLDKNESLARKFSVKSLPTIILLKNKTMLARKDHFVSSNDLIALIKKHLV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Plasmodium falciparum
publication title Crystal structure and solution characterization of the thioredoxin-2 from Plasmodium falciparum, a constituent of an essential parasitic protein export complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
total genus 29
structure length 89
sequence length 89
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4o32A00
1DE2A 2B6MA 4IKHA 4EDZA 1SJIA 1TI3A 5COHA 1VF3A 2TRCP 1Z6MA 4ZXGA 2BTOT 2FA4A 5ID2A 4MLYA 1T8EB 4MK3A 3D0ZA 2K9FA 1SJ6A 2L4QA 2FGXA 4KE3A 1GTIA 1EEJA 1V40A 2YZHA 1SU9A 3TGZA 5IMZA 2OKAA 1PD21 2VL3A 1HNAA 5DAKA 4OCFA 6GSTA 4F2IA 3BOAA 2OBIA 1QQ2A 1V57A 1GNEA 1NHOA 1THXA 2H1DA 4NHWA 17GSA 2RLIA 4FYUA 5DCGA 4TOPA 4ISDA 2CT6A 1UC7A 4Z7XA 1KEBA 5DVBA 2LUSA 2IFQB 1ZYQB 2YOIA 1T7PB 1EGRA 5GSTA 1TW9A 5ELAA 4TR3A 4O7HA 2LV3A 1QK8A 8GSSA 4POMA 3FR6A 4ID0A 3HYPA 4FH8A 4NMUA 1PMTA 1A2MA 1TTZA 4N11A 5ECLB 1B48A 4GQCA 2HSHA 2L59A 4LMVA 1F6MC 2FWHA 2YPMA 4TW5A 1T1VA 1GTBA 4OO5A 3R2QA 5HR3A 4K7NA 5AN1A 2PGTA 3J7Yk 2QSIA 2O87A 2HLSA 2NTOA 3P7XA 5J3RA 2PWJA 2ZNMA 5CYYA 3ERWA 1ST9A 3LWAA 3VWVA 5G5EA 1AW9A 1YZXA 3QAGA 4F0CA 1CQHA 2V32A 3UOMA 4KUNA 2WRTA 3VI7A 2NBSA 2YCDA 1YEPA 3C1RA 4WBRD 1PL1A 1EP7A 1NSWA 4FYCA 5FHIA 4MJEA 4GWRA 1GUHA 3H93A 2RIIA 5B8AA 3HVXA 3HD5A 4KDYA 3WD6A 3D4MA 5GSSA 1TK8B 2X64A 2IMKA 5G1KA 12GSA 1XFLA 5DJMA 4J56E 4DEJA 3O3TA 3CRUA 1MDJA 1RW1A 2YJHA 1O81A 4YQUA 3APOA 4ECIA 3MAKA 3IV4A 2GLRA 5A4VA 1GSDA 3QAWA 4K0GA 3CYNA 3ZZXA 3CXGA 2HRFA 4OFMA 2HE3A 2F9SA 2C0FA 2IWTA 2YN1A 4ECBA 3RDWA 2WCIA 3TRPA 1O6JA 3G7JA 2X8GA 3CTGA 1S3CA 4E8HA 3GURA 5INYA 1OKTA 5CRHA 1VF4A 1KTEA 1GSFA 5C04A 4V2NA 2CVKA 2VIMA 4WR4A 4L0UA 4TKYA 3QFBC 1K0CA 1Z7RA 4BA7A 4HS1A 2R37A 5AGYA 2DBCA 1ZMAA 2IMDA 4KAEA 5DQYA 5DJLA 2E2GA 1GSYA 4D73A 2AYTA 1PX6A 4LA1A 5KN0A 1X9MB 3C8EA 2H0IA 4NAXA 2C1YA 3F3RA 1JFUA 4GSSA 2CX3A 1HYUA 1Z5YE 2DIZA 3N5OA 2P31A 1XZOA 1M7TA 1PKZA 4I2UA 3LSZA 1HD2A 3LXTA 2FY6A 2KHPA 2YV9A 1JLWA 1ILOA 3DIEA 5IIZA 4BWSA 4OFNA 6GSSA 2GTUA 4O32A 1EP8A 2OACA 2XPEA 2VCTA 3A2XA 4AJ7A 2H76A 2L6DA 2H75A 4LMWA 4GLTA 4YAPA 3ZREA 1DBYA 4NXIA 2RM5A 2AAWA 2IIYA 1ZYEA 2KP1A 1XW5A 4WKWA 3TDGA 6GSUA 5HFGA 4YQMA 2TIRA 13GSA 3IR4A 2HXKA 1EEMA 1X5DA 2IMFA 2DJ3A 2DJ2A 1JZOA 5G30A 2O8VB 1Q4JA 2F8AA 3KZQA 3GTUB 4EXJA 2NVLA 1HQOA 3N9JA 1K0BA 2V2GA 4IJ3A 2OE1A 3QOUA 3BCIA 4K2DA 2K8SA 3GH9A 2QGVA 4KH7A 3GTUA 3MNGA 5D8IA 1PA3A 4DVCA 4WXTA 3DGQA 5ECRB 1UVZA 1AQXA 1OAZA 1AQVA 2A4VA 3UBKA 3GSSA 1G7EA 3KMNA 4JEDA 1TRWA 1E6BA 2LNSA 3VWXA 1XOAA 3VLNA 1ERWA 4TRXA 3DRNA 5J41A 3Q74A 4IP6A 1GRXA 1TXXA 4AJ8A 3DVXA 1YY7A 1PGTA 3DMLA 2P5RA 4IJIA 4LLRA 5CAXA 1AXDA 3ZYWA 3DXBA 2B1KA 2J23A 3FK8A 1OC9A 1PL2A 4V2LA 4AJ6A 2OBKA 3LFLA 4JR6A 4TN8A 1WJKA 4HJ2A 3JCML 1BJXA 4K7IA 4XS1A 2CAQA 4XS6A 1G6WA 1J0FA 3ZLPA 2VOCA 3UJ1A 2RM6A 3PGTA 5D9WA 4QQ7A 5IMCA 1WOUA 4QL7A 5J5NA 4O92A 2DMMA 3ME7A 5CREA 5H5QA 4BPYA 1U87A 4KA0A 5EVOA 2IMIA 2HT9A 2H01A 2FNOA 6GSYA 2GZPA 3EMPA 4N0ZA 3GH6A 2PUKC 1M9BA 5CRGA 2H6ZA 1Z9HA 3FR3A 3ZIJA 2LEGA 1ZOFA 5CO3A 1VGLA 5GZZB 2LQQA 3CBUA 3TJBA 3VWWA 1PN9A 5FT3A 20GSA 2HZEB 2CV4A 2QC7A 2FD3A 2YWOA 3KH7A 3TJFA 2WJUA 2MZCA 5EL8A 4NWYA 1I5GA 2H71A 3J7Yb 3W8JA 4MZWA 2V1MA 1RK4A 3HJOA 1A0FA 3US3A 3KTBA 3A5WA 1O73A 2B3SA 3D21A 3KJYA 3NZNA 1DUGA 1ERVA 1JLVA 4MDCA 4OFTA 2TRXA 3UIWA 1M99A 2E0QA 5ECHB 1FHEA 2AB6A 3S9FA 1LU4A 2IN3A 1Y6EA 4JRRA 2LKUA 1J9BA 2PU9C 1XVWA 3TJGA 4Q5QA 2C0EA 1Z6NA 3FEUA 2DC5A 5D96A 2BJXA 4TR1B 5EPFA 3UMAA 3ZRDA 3TRQA 3IPZA 4MZCA 3F9UA 4EVMA 3LQ7A 1M9AA 5ID2B 2DJKA 1OC8A 4TR1A 5G5FA 4G10A 4N0VA 2XBQA 4KB3A 1HNCA 3IK9A 4ZILA 1GSUA 3VPTA 1PKWA 4G2EA 1DSBA 1QMVA 4WF5A 1K3YA 3KMOA 5G1LA 2AV4A 1FVKA 3RPPA 2HYXA 1XIYA 4XRDA 5DAKB 11GSA 4HU7A 3WYWA 4IS0A 1U3AA 2V6KA 4ZB8A 4ACSA 5CRDA 2F8FA 5HQPA 1TRUA 5IOXA 2H70A 2ZUPA 3TJJA 1KBNA 1BG5A 3GSTA 4FIWA 4H86A 1TK5B 5IO0A 3QPMA 3QAVA 4GXZA 5L71A 4MJAA 1FG4A 4HI7A 4L8EA 1TU8A 4Q5RA 2I3YA 4CHSA 1MDKA 4I6XA 1MEKA 2REMA 1R26A 2OE0A 5JWQB 4NPBA 3ZITA 3ZMLA 4PUAA 5JCGA 3ZIVA 3K8NA 1SL2B 4POBA 1WWJA 2WB9A 4V1Ag 1QXHA 2DMLA 2EIQA 3CSJA 3ERGA 3HA9A 3KXOA 3FZ4A 5HR2A 2JZRA 3TRXA 2IL3A 2N5AA 3E3EA 1R5PA 2GT5A 2KOKA 2WFCA 3SWLA 2PVQA 2E7PA 1XW9A 4HEA2 16GSA 2CVBA 4IGJA 4GF0A 2WS2A 1EGOA 3RAZA 3QCPA 4MH2A 3IHQA 2VLVA 1EOHA 19GSA 5CRWA 4YAVA 1GSSA 1XWGA 1OKDA 1B9XC 1TU7A 1AC1A 2MMAA 4OWYA 2H1AA 2R4VA 5IMAA 2GQKA 3CMIA 3KCMA 3GX8A 2YV7A 2HRNA 2X8CA 3BBYA 3EE2A 4P3YB 2LS5A 1HNBA 1YQ1A 1PRXA 2C0DA 3UAPA 1CQGA 5DDLA 1S3AA 5D9TA 4MP4A 1JZWA 1MD4A 4FYBA 3G9BA 1SK2A 5ABRA 2O89A 2K18A 3D6IA 3C71A 2H6YA 1XBSA 2GDRA 3UL3A 1OVNA 1OE7A 4OCEA 1SKWB 3M3MA 3HCZA 3EVIA 2KUCA 3WGXA 3A2VA 1W4VA 4JE1A 3DVWA 3VURA 4K1FA 2N5BA 5DCHA 5ECIB 2GQLA 3L9VA 2PN8A 2DJ1A 3LORA 1GULA 2H1BA 4MF6A 1U88A 2F51A 2FLSA 3FKFA 2O7KA 1AQWA 3RHBA 3ZMKA 2YZUA 1M2BA 2WZ9A 3TKPA 3ZVJD 2OE3A 3O76A 2C80A 1T3BA 5KN3A 1E2YA 4GCIA 5B8BA 3IDVA 2M80A 2R2JA 1GNWA 4MPFA 3C73A 4D73B 2XC2A 1ERTA 2JL4A 3W8SA 1AUCA 2YNXA 2YWNA 5DALA 1GUMA 3GNJA 2AUVA 1GWCA 4OO4A 3QR6A 1GTUA 2M46A 3C7MA 3VFIA 3TKRA 3HJPA 2NDOA 4TXOA 3F6FA 3TOUA 5B7CA 1QUWA 4EDYA 1SL1B 3KGKA 3NOFA 2GSRA 3FZ5A 3IRAA 2JZSA 1K0MA 1QFNA 1WMJA 4IW9A 1XWAA 1VF1A 4ECJA 3FR9A 2YP6A 2FHEA 3QFAC 4F03A 1NM3A 4KCAA 3F63A 1BX9A 2H74A 2CA8A 3RHCA 1B8XA 2MBSA 3KTLA 2AJQB 3EC3A 2AHEA 5CNWA 4ML1A 4MZBA 3C1SA 2HSYA 1PSQA 4J2FA 5H5SA 2JU5A 3LG6A 1G0TA 3FW2A 1O8WA 3ZL5A 5ECQB 3ZFLA 2DJ0A 4MABA 3GX0A 4F9ZA 6GSVA 3KEBA 3HKRA 3DKSA 4Q5NA 4HU9A 2GGTA 2FWFA 2VM1A 4LL1B 3EMXA 4ZL9A 4PUFC 5AISA 4PGTA 1WE0A 1T00A 4PQ1A 2IMEA 1EV4A 3EYTA 2HI7A 1N2AA 5C00A 1H4OA 3W6GA 1TI1A 1IYIA 4ZB6A 1WP0A 4EO3A 2LJAA 4XHMA 3BJ5A 3FY7A 1GLPA 1TK0B 1S3DA 3F4RA 1SYXA 1BAYA 3KD0A 3I9V2 4GTUA 2K8VA 1TP9A 4WR5A 3QMXA 2LRNA 3LGCA 4HZ2A 2VO4A 5J9CA 2BMXA 5JCUA 1NHYA 2ES7A 2OADA 4L5OA 2CQ9A 3SBCA 1AIUA 4DSRA 2G0FA 2R6KA 2RUFA 3UARA 1YDKA 1OC9B 2X99A 3LJRA 3GL5A 2Z9SA 4POKA 2OJLA 3FHKA 5A4UA 5HFKA 1K0DA 2RUEA 3ZTLA 3ZVJA 5ECPB 1B9YC 1SD8A 2PERA 2K6VA 3A2WA 4POLA 3GFKA 3PR8A 5F06A 2MMNA 4AF2A 4BVXA 2ON5A 14GSA 1F3BA 2FWEA 4F82A 4RUVA 3RPNA 4TXVA 5E4WA 2PVOC 3EU3A 2WULA 3EWLA 1X5EA 2G2QA 1PQNA 4PQIA 3GKNA 4MF7A 2LSTA 2VM2A 4JR4A 4L5LA 2VD1A 2GS3A 3P2AA 4BVYA 5D93A 1W89A 2VLUA 2VCWA 5LD0A 1ABAA 4WF4A 2GSTA 4XIHA 4ULXA 4K8MA 2N5FA 2I81A 2M72A 1FAAA 1F3AA 1SK1A 4IQAA 2PMTA 1SKRB 3UEMA 1YKCA 1ML6A 2YWIA 2VUPA 2FWGA 1GP1A 3V1WA 3DEXA 2VL9A 2VLTA 3CSIA 3KM6A 3APQA 4EC0A 1FO5A 3M9JA 3D22A 5A4WA 5IO2A 4J57E 3HZ4A 3WGDA 4CDOA 3E0UA 3HVSA 2IJYA 1XXUA 3BD2A 4HZ4A 1Y25A 2VL2C 2VCXA 4Q5FA 2R5GA 4IP1A 5DQSA 6GSWA 4KDUA 1JZDA 3L9SA 3TKSC 2XPDA 1K0AA 2GVPA 2WDUA 3EURA 4XCSA 2CX4A 1T4YA 1YEXA 4HQZA 4CW9A 1J08A 3GL3A 1JHBA 1XWCA 1X9SB 1THOA 2LRCA 4EUYA 3GIXA 4ZB9A 1F9MA 4PXOA 1XWKA 1YJ6A 2B1LA 4DSQA 1OYJA 3P90A 3G7YA 4IBPA 1A2JA 5D73A 4XS4B 3TJKA 2YWMA 2H30A 4TVEA 3F6DA 1FW1A 1GTAA 1EOGA 3AY8A 2CVDA 2WGRA 3TOTA 1ACVA 5F05A 5ECMB 3CSHA 5IPGA 1Z3EA 3WT2A 4KGIA 3CTFA 5IPHA 4XS4A 22GSA 2JADA 2VCQA 1XOBA 4EE0A 5B6MA 7GSSA 2NPBA 3GMFA 3HXSA 2I9HA 1SD9A 1VF2A 2H8LA 5CP1A 1GUKA 5IMDA 1TRSA 4F0BA 3KP8A 1PX7A 2LNTA 1N8JA 1GSEA 5ECOB 1F2EA 5KEJA 4I8BA 5F8BA 1UN2A 4X0XA 2LJRA 1TDIA 4ZBAA 2H19A 4X43A 3LXZA 3LEFA 4GSTA 3F4SA 1AAZA 5AIVA 3IC4A 3F3QA 1TKDB 2GZYA 3A3TA 4MA9A 4JU5A 4MMMA 5IQYA 1V2AA 1K3OA 1BQ7A 1OE8A 2DJJA 2IFQA 1O8XA 1LBKA 1A8LA 3IK7A 4I2TA 1DE1A 1GL8A 2XHFA 4EF0A 2H73A 5E59A 1TJDA 1JZRA 5ENUA 1WPIA 2HZFA 1Q98A 2MMZA 4WEYA 4PURA 4JBBA 1EWXA 2L5OA 3MDKA 1A24A 2JACA 3M1GA 3MWHA 1M2DA 4KDXA 4GQFA 5HFIA 1FVJA 5G2ZA 4BWQA 3LYPA 1X5CA 1WRYA 2MBTA 3U5RE 1EV9A 5ECSA 2X8HA 3IBHA 1YF0A 2B5YA 4RQXA 3FZAA 1A0RP 2EIRA 4PNFA 5LNKe 3FYGA 3H4KA 1K3LA 3L4NA 3ME8A 1U3IA 4X1UA 3DWVA 4GSNA 1ZCPA 2LTKA 3VPQA 2A2SA 2P5QA 2R3XA 2EIOA 1YKAA 4N30A 4HJMA 1FB6A 2VCVA 3KIJA 2L6CA 4HUAA 3M0FA 2HNLA 4IVFA 3IA1A 1IYHA 3IXRA 4ML6A 1NW2A 3WT1A 3WGEA 4K9ZA 1M0UA 1SK0A 3L78A 1R7HA 1WIKA 4DSSB 2D2ZA 3QD9A 5FWGA 3I43A 1SYRA 4KCEA 2LQOA 2FCHA 1O7UA 2F3MA 2FUG2 5D9VA 2V6OA 5F07A 4E8EA 2CAIA 4DSSA 5DALB 5KN1A 3UVHA 4HOJA 5LCZA 4N10A 4I97A 3HZ8A 4TR4A 4TXOB 1XW6A 1GSQA 3GKMA 3GN3A 6GSXA 3F4TA 3VWUA 1A23A 2LRTA 4KSOA 4XTSA 1YF1A 3H1NA 4G19A 2C3NA 5GAPD 5IOWA 4G9HA 4MJBA 3RBTA 2XBIA 4RI6A 1O85A 4ECCA 1MTCA 2GSSA 3GV1A 3D4TA 2MMOA 5ECNB 4NV2A 2C8UA 1SL0B 1ERUA 2L5LA 3P8WA 2DLXA 1GLQA 2KP2A 4LL4B 5D9XA 1USBA 5IMFA 1FOVA 4K6XA 2HFDA 10GSA 2YJ7A 1R5AA 1EZKA 2VL2A 5DBQA 3TUEA 2VCZA 5B6NA 1V9WA 3GYKA 3PH9A 4HQSA 5J4UA 3MSZA 2VD0A 3GKXA 3TKSA 2J9HA 1G6YA 3TCOA 2PPTA 4MPGA 3NIVA 2EC4A 1B4QA 5JCWA 3LYKA 2JSZA 3E9JB 3M9KA 2C3QA 4PQHA 1SENA 1XPVA 3D5JA 3IAS2 1V98A 3DYRA 4ZBBA 4BL7A 2ZCTA 3HY2A 2O85A 3ERFA 2B7KA 4HDEA 1A8YA 4L0WA 1X9WB 3Q19A 4O5RA 1TOFA 4ZBDA 3EU4A 4ZL8A 1ZGNA 1Z7PA 2V41A 3I6AA 3VI5A 3H8QA 3DD3A 3I69A 2JSYA 2JZTA 2PBJA 2H72A 2A2RA 1RQMA 1ZL9A 4IELA 2IPAA 3GKKA 3H79A 3ZFBA 2CZ3A 4KX4A 2OA7A 4IQ1A 4AGSA 4EL1A 3UVTA 1XWBA 1T4ZA 5A5KA 2I4AA 4RI7A 2VAFA 3APSA 3F0IA 4MCUA 1TRVA 2C0GA 18GSA 1MDIA 4MH3A 3GA4A 2C4JA 1UA5A 1ON4A 2L4CA 1R4WA 3EINA 1BEDA 1SKSB 1K0NA 1F37A 1SJZA 3CRTA 5EY6A 3PINA 4PX1A 2P0GA 1K0OA 2DIYA 4ZIJA 1G7OA 4RQRA 3HJMA 1C72A 1XVQA 3F8UA 2CZ2A 3IOSA 4OMVA 2DSAA 2B5XA 2GZZA 5IMVA 3GHAA 4QL9A 2KLXA 9GSSA 1URMA 4IN0A 5HR0A 4JZQA 5HR1A 3GUSA 3FRCA 3L9UA 2ALBA 5AIXA 3M8NA 4K7OA 4FO5A 4MF5A 1ZZYA 2C3TA 1LJRA 4V1Ap 4EKZA 4KW6A 3U6VA 5KN2A 2L57A 3HDCA 2LJKA 1X0RA 3HVVA 3HHVA 2H66A 4KNDA 3UBLA 3QDNA 1I9DA 3O6TA 5H5RA 2B7JA 1QGVA 3TKQA 2ON7A 2H0HA 4I5QA 4WETA 1A2LA 1BYEA 3TB2A 2H1GA 4IHUA 2GT6A 2QKEA 1FB0A 2B5EA 3GRXA 3KH9A 4YH2A 4GRFA 3FZ9A 4TR0A 5J9BA 2GQMA 4PNGA 1V58A 1B4PA 1GH2A 5ELGA 2MYGA 3Q6OA 1M2AA 1OC3A 3BCKA 4OD7A 4WBJA 3ISOA 4MJCA 4ILFA 1XCCA 4YQVA 2FA8A 2HZEA 2E2MA 2GSQA 1H75A 3IE3A 2H6XA 4K0NA 4XRAA 5JWRB 5F0GA 2YANA 3TKSE 4ZL7A 1MD3A 4NV5A 3ED3A 3IAM2 3L0HA 5ECKB 2H0GA 1KNGA 3OR5A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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