4O5RA

Crystal structure of alkylhydroperoxide reductase subunit c from e. coli
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
167
structure length
167
Chain Sequence
MSLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEITEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYAVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVASHPGEVCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure, mechanism and ensemble formation of the alkylhydroperoxide reductase subunits AhpC and AhpF from Escherichia coli
pubmed doi rcsb
molecule keywords AhpC component, subunit of alkylhydroperoxide reductase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
total genus 45
structure length 167
sequence length 167
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2013-12-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4o5rA00
1GH2A 1MDIA 2LKUA 3TCOA 1X5DA 1CQHA 4X43A 4LMVA 3IBHA 1V2AA 4JR4A 5HQPA 1K3OA 3NOFA 3KGKA 4PX1A 1YDKA 1A2LA 2IMDA 1B9XC 1VF3A 2YWNA 2GDRA 1T4YA 3APQA 2GT6A 4IKHA 3LQ7A 1SL1B 4GCIA 3KJYA 5G30A 3QOUA 4L8EA 4Q5NA 2DJ1A 1OC8A 4DVCA 2LV3A 1O85A 1ZYQB 3NIVA 2LQOA 2V41A 3U6VA 2WCIA 4I6XA 2VIMA 1ZYEA 1U6TA 3C71A 5FWGA 2VLTA 1HYUA 2C0FA 2GQMA 2VAFA 1KTEA 2E0QA 3ZLPA 2LUSA 3QFBC 4NXIA 5DQSA 4K2DA 2WDUA 3G7IA 1FO5A 4XTSA 1XZOA 1R4WA 5A5KA 1A8LA 4FO5A 2XC2A 4ACSA 4MZWA 4MJBA 4KUNA 4BVYA 3E3EA 4MZCA 3GX8A 1PL2A 3TB2A 4OFTA 3TGZA 2JADA 2GZPA 1GNEA 2R2JA 3E9JB 5F07A 4MJCA 1AUCA 5GAND 4BWQA 2MZCA 1AIUA 1YEXA 3P7XA 2E7PA 2B6MA 3F3RA 4GSNA 1U3IA 4HI7A 2C80A 3LJRA 2R5GA 5CAXA 2A2RA 4RQRA 1NSWA 2YOIA 3EMPA 1XFLA 5DCGA 3GKKA 3HVSA 4MK3A 2YV9A 5ECLB 3ZIVA 2JSYA 3FZ4A 3IR4A 6GSVA 2I4AA 3L4NA 1JHBA 3QCPA 2DJJA 3ZZXA 1GTAA 1V40A 1N8JA 3RHCA 3A2XA 1PN9A 3TKQA 4TR0A 19GSA 4POLA 1A0FA 1SJIA 4IQAA 2V2GA 1ERVA 1XVQA 1TXXA 2ALBA 2BJXA 4K0GA 1V98A 4MJAA 3J7Yk 1THXA 2YPMA 4BL7A 3GA4A 1X0RA 2GGTA 5KN0A 5D9VA 1Z5YE 1T7PB 3ZMKA 2AJQB 2JACA 2O7KA 2P5RA 1A2MA 1K0MA 2YCDA 5EPFA 1Z6NA 4TKYA 3F4RA 2G0FA 3FY7A 3UBKA 3GX0A 1EGRA 5DAKB 3UVTA 3M3MA 3PR8A 1XWAA 2GVPA 3C7MA 4ZBDA 2B1LA 1RQMA 2H74A 4GRFA 2L5OA 3N9JA 2O8VB 1SKWB 2MMZA 4I97A 5KN1A 2VL9A 3M9JA 1QK8A 2X64A 4L0WA 3VPTA 4JRRA 2VCZA 1WJKA 3GSSA 4ECIA 5LD0A 5F0GA 1ZZYA 1A2JA 1GP1A 2YJ7A 5AIXA 3D6IA 2V6KA 3TDGA 3APOA 1XVWA 4TRXA 5DAKA 2YWIA 3HA9A 3UAPA 5H5SA 1JLVA 4MA9A 2PERA 3BCKA 5C00A 1M9BA 4NHZA 1EWXA 4JU5A 2YZUA 1GSEA 2F9SA 1SK2A 1PRXA 4KNDA 3QAWA 3M9KA 4E8EA 1RW1A 3FZAA 1DBYA 3PGTA 4TR1B 2H30A 4O7HA 5IPGA 3KD0A 5G1LA 2AV4A 2H1DA 2HRFA 3UBLA 3DMLA 5IMZA 3J7Yb 6GSXA 3CTFA 1Z7PA 2GSSA 3LORA 2R6KA 5HR1A 3A2WA 4WBJA 3TJJA 5DJMA 1NW2A 2F3MA 1K0NA 3HHVA 4OO5A 2IL3A 1E2YA 10GSA 2EIQA 4HS1A 4TR1A 5GZZB 2HNLA 1Q98A 4FIWA 4EKZA 3P90A 1TRWA 2FWHA 3GHAA 1XBSA 2C1YA 1LJRA 2MBSA 1A23A 4N10A 4KSOA 2QSIA 3LWAA 4Q5FA 5IMAA 5D9XA 4XS6A 6GSYA 3KH7A 4NWYA 3IA1A 4QL9A 1OVNA 2C3TA 5B8AA 1S3DA 4LL1B 3L9SA 1TU8A 2TIRA 1MD3A 1SL2B 3KTLA 2HI7A 3GSTA 3KMNA 1UC7A 5D9TA 4IELA 5CRWA 3HY2A 5HR3A 4GLTA 4V2LA 2PWJA 2OKAA 1XCCA 2B5EA 1PKWA 2WGRA 4PURA 1Z7RA 4K7IA 4ZB6A 1EV4A 2ZNMA 2L59A 3ZFLA 3SBCA 2VCWA 4PXOA 2IN3A 2IJYA 2H0GA 1NHOA 1KBNA 1GULA 3ZYWA 4TW5A 2JZSA 2R37A 2HT9A 4LL4B 1X9MB 5GSTA 2WJUA 2CAIA 2YANA 3KH9A 4MZBA 3F6DA 3EYTA 2CT6A 4MF7A 2VCXA 4O92A 3JCML 5JCWA 3TOUA 2RIIA 2X99A 4ZBBA 4DEJA 5AISA 2LQQA 4MF6A 1EGOA 1Q4JA 1M2BA 5ECOB 4ZB9A 1CQGA 1ZOFA 1R5AA 3GV1A 1K3YA 1ZMAA 4GSSA 1JZOA 1QQ2A 4NAXA 4HU7A 1EZKA 4FYCA 2C8UA 3KIJA 2PBJA 3C73A 5DJLA 5G31A 4DSSB 3ERFA 4XIHA 17GSA 3PINA 5FT3A 2D2ZA 4K1FA 3CXGA 3I43A 4KH7A 1PX6A 3GN3A 5F05A 1SYXA 1GRXA 5EL8A 5IMFA 4JZQA 4XRDA 5J9BA 1Z3EA 4MDCA 1J08A 2VCVA 2GZZA 4AJ6A 3EINA 3OR5A 5D96A 4WR5A 2B5YA 4PQIA 4DSSA 4MP4A 2I9HA 4E8HA 4IGJA 2PVOC 5LCZA 3HVXA 2B7JA 1XW6A 2MMNA 1X9SB 3A5WA 3FEUA 4BA7A 5HFIA 3ME7A 3FZ9A 1BEDA 4KSMA 3O76A 4CDOA 3DRNA 4YQVA 2FY6A 3KTBA 1B8XA 3IPZA 2WS2A 1M99A 1QGVA 3F6FA 4MMMA 2I1UA 1GUHA 5IM9A 3GH6A 5G1KA 5J9CA 4J56E 3LFLA 3WD6A 3F0IA 2F51A 2VD1A 1URMA 8GSSA 3GIXA 2VCQA 3NZNA 1SL0B 1K0DA 5DQYA 4K6XA 5D9WA 1U3AA 5DALB 4ML1A 1ZL9A 5ABRA 4PQHA 1EEJA 3HYPA 2OE1A 5HR0A 2GQLA 3FZ5A 1AQVA 1THOA 3WGDA 5ID2B 2VOCA 2DJ2A 5ECRB 1M7TA 3UIWA 1I5GA 4OCFA 1YKCA 3IV4A 3VWWA 4N30A 1WP0A 4MABA 4MH2A 2E2GA 2CQ9A 2CVBA 5FHIA 4TXOB 5F8BA 4HDEA 2CV4A 1K3LA 1M2AA 5DALA 4Z7XA 2LEGA 1BAYA 5CRHA 2IIYA 3VLNA 5ENUA 4YAPA 3DIEA 5ID2A 2JL4A 1AXDA 1IYIA 5IMDA 4OMVA 1EV9A 1BX9A 4NV5A 2NDOA 9GSSA 4GTUA 1SYRA 2A4VA 4K7NA 1G6YA 2WZ9A 1TI3A 1C72A 2XBQA 1YEPA 1O7UA 1B4QA 1OE8A 2L4CA 2HSHA 4TXOA 3ZRDA 1OYJA 1WWJA 3DKSA 3GFKA 1WPIA 4N0ZA 5D8IA 1DUGA 4WXTA 4WBRD 2B3SA 5B6NA 5IOXA 4X0XA 4WF5A 1GSSA 1VF1A 3DWVA 3ZVJA 2ZUPA 1WIKA 3QMXA 4ECJA 3BD2A 5B7CA 3D0ZA 3FRCA 2OA7A 1B48A 2IPAA 2NTOA 1HNAA 1XOAA 5G2ZA 1M9AA 1ERTA 4EL1A 5JCUA 3KZQA 3CBUA 4F82A 2DIYA 1GLPA 3UARA 3FR3A 3H1NA 4ISDA 4OD7A 3EURA 3MNGA 1YQ1A 5COHA 2QC7A 1YF1A 1RK4A 4ULXA 4POKA 3F8UA 1XW5A 2YP6A 2JZTA 4WKWA 1FVKA 3GMFA 1YF0A 4BVXA 3CTGA 3GKNA 1T4ZA 1TK8B 4MH3A 2YWOA 3TJFA 2VL2C 1PL1A 4IP1A 1GSFA 2XHFA 4ZBAA 3ZMLA 3IK7A 2RM6A 3RPPA 1SK0A 3IRAA 4IBPA 4IHUA 2CA8A 1YZXA 3S9FA 3GYKA 4KE3A 1G0TA 4BPYA 4EUYA 1WRYA 5IMCA 4F0BA 3GKXA 3MWHA 2H72A 1USBA 1ST9A 4HUAA 2CZ3A 1YY7A 3UEMA 3LXTA 6GSWA 4FH8A 4LLRA 4YQMA 4N11A 2H1AA 4V2MA 2IMFA 3VI5A 3MAKA 2YJHA 1PSQA 1NHYA 1VGLA 4V1Ap 2YZHA 4EO3A 3HD5A 2HSYA 2H71A 4KB3A 1TK5B 1F2EA 4AJ7A 3KXOA 2DJKA 4MCUA 1J0FA 1VRSD 1F6MC 4EDZA 1F37A 1KEBA 2IFQB 4ILFA 1TRSA 1H75A 1JFUA 1WOUA 5INYA 5IIZA 2ON7A 1DE1A 2A2SA 2VO4A 4KCEA 1X5EA 5ELAA 3FHKA 1U88A 4HZ2A 3FKFA 3RPNA 2VM1A 3WGEA 2FGXA 3DD3A 2VD0A 4ZILA 1OKTA 1O8XA 2AUVA 4ZL8A 2O85A 4HZ4A 2VL2A 4G9HA 5AN1A 2WRTA 1X5CA 2JSZA 12GSA 2E2MA 2IFQA 2VUPA 1DSBA 3GRXA 2WULA 2ES7A 2NBSA 1H4OA 1XWGA 1OE7A 3TRXA 3D22A 1IYHA 1UVZA 2WFCA 3ISOA 5GSSA 3ME8A 2VCTA 3G7YA 1AW9A 2X8GA 2AAWA 4YQUA 2GSTA 4KW6A 4EE0A 4I5QA 5JWQB 3FK8A 4IN0A 2H6ZA 3F4TA 4GXZA 5ECIB 4PQ1A 1ILOA 1MDJA 4AGSA 5IO0A 3ERGA 2JU5A 1HQOA 1O6JA 1ABAA 1OC9B 3Q6OA 1GTBA 4GQCA 2DLXA 4HQZA 4O5RA 4H86A 2FLSA 3DXBA 5L71A 4FYBA 2C4JA 4JR6A 1EP8A 1EEMA 3TOTA 2CX4A 4POMA 4PNFA 1SKRB 5CRGA 4KGIA 3L9VA 5G5FA 2IWTA 2B7KA 4K0NA 4LA1A 4F2IA 1GNWA 2K6VA 1OC3A 1GSYA 3IHQA 3C1SA 4G19A 3TJGA 5IOWA 4ML6A 1XWKA 1OC9A 5DBQA 1M0UA 4TR3A 3CSJA 3HZ4A 2BMXA 3LSZA 3I6AA 3RAZA 1XWBA 1O81A 1PQNA 4I2UA 1FW1A 2PVQA 4K8MA 2VLUA 3BBYA 2NPBA 4TN8A 3BJ5A 3UJ1A 2N5AA 2GLRA 3IC4A 14GSA 3FR6A 2YV7A 2X8CA 3QAVA 3GH9A 2YNXA 1TOFA 4GQFA 1SU9A 2K18A 1S3AA 3IDVA 3RDWA 3TKSA 3CYNA 4KDYA 2V1MA 5HFGA 1G6WA 3TJBA 1ZGNA 2LJAA 3TUEA 2X8HA 2L6DA 4NV2A 3VWXA 3UMAA 4EVMA 1WE0A 2H0IA 2H75A 2RM5A 2DIZA 2H01A 2LRNA 2AHEA 3EU4A 5D73A 4BWSA 2TRXA 2KHPA 1TJDA 3HZ8A 2OACA 4JE1A 1V9WA 5H5QA 2K9FA 2KP1A 2LNSA 1R26A 1V58A 3EVIA 4PUAA 3HDCA 4ECCA 1F3BA 1ON4A 1JZWA 4CHSA 1XW9A 1F9MA 1GL8A 1LU4A 6GSSA 3UL3A 3GL5A 5IQYA 2OBKA 1PGTA 3M1GA 4EDYA 5ECMB 4F03A 2C0EA 2LJKA 5GAPD 5EY6A 5ECPB 5KN2A 1T3BA 2O89A 3HJPA 4GF0A 3O6TA 5A4WA 3CMIA 2PN8A 5B6MA 2FWFA 3RHBA 3HCZA 1JZRA 3H93A 3QAGA 4GSTA 3L0HA 1VF2A 3IE3A 4ID0A 4IJIA 2J9HA 4IVFA 1R7HA 1Z6MA 1A0RP 3KP9A 2EIRA 5HFKA 5J5NA 3Q74A 1MEKA 4P3YB 4D73B 1ERWA 2XPEA 4HEA2 3GUSA 4NHWA 1SK1A 2R3XA 2ZCTA 13GSA 2CAQA 3DVXA 5KEJA 2H0HA 3GL3A 1SKSB 2QGVA 2G2QA 2HRNA 3VWVA 1F3AA 2GZYA 6GSTA 1BG5A 2C3QA 2HE3A 3QD9A 2FHEA 3HXSA 2GQKA 5CRDA 3D5JA 2EC4A 2PU9C 4L0UA 3LEFA 1AC1A 5A4UA 2L4QA 4D73A 3EC3A 4RI6A 3IXRA 5E59A 1TU7A 4ZB8A 1AQXA 5AGYA 2LRCA 3DEXA 4IW9A 2H6XA 3VURA 2OADA 3ERWA 3EE2A 3QDNA 4KCAA 4RI7A 1OKDA 3CSHA 1A24A 7GSSA 4EC0A 1O73A 3TJKA 2K8SA 3PH9A 1A8YA 3E0UA 2V32A 4RQXA 1PD21 5IMVA 4DSQA 2NVLA 2OE0A 3TRPA 1N2AA 3I9V2 5CNWA 5H5RA 3US3A 1GLQA 2JZRA 3LG6A 1M2DA 3HJMA 1Z9HA 1TKDB 3KM6A 2AB6A 2FD3A 2YN1A 4TOPA 4IJ3A 2B1KA 3Q18A 1Y25A 4MPFA 2H1BA 3KMOA 3EMXA 1BYEA 3L78A 4OFNA 2M72A 2AYTA 3KEBA 1KNGA 3H8QA 4NMUA 2M46A 4G2EA 5DCHA 1GSQA 4ZL9A 4J2FA 4JEDA 2VM2A 3IAM2 3VI7A 1OAZA 4TVEA 1GWCA 1W4VA 4L5LA 2PMTA 3KCMA 4F0CA 3ED3A 4G10A 3P8WA 3LGCA 2C0DA 3ZFBA 3TKSE 1XOBA 3O3TA 18GSA 3L9UA 1PA3A 2P5QA 1EOHA 3ZVJD 3C1RA 1WMJA 2CVKA 1JLWA 3WGXA 2IMIA 3VPQA 3H4KA 3WT2A 4IP6A 2HLSA 1B4PA 1T00A 4DSRA 1AQWA 4GWRA 2P0GA 4WR4A 2H70A 1PMTA 4JBBA 4K9ZA 3HKRA 1TK0B 2MMOA 4PUFC 2I3YA 1E6BA 4O32A 3VFIA 4Q5RA 4AF2A 2PUKC 3UVHA 2DSAA 3D21A 2N5FA 1EOGA 5B8BA 5ECSA 2HZEB 2REMA 3HJOA 3KP8A 1I9DA 2LS5A 1V57A 2H76A 3ZIJA 2J23A 4X1UA 4N0VA 2DC5A 4POBA 5DDLA 3VK9A 4WF4A 2C3NA 1G7OA 4KAEA 1J9BA 4ZIJA 2F8AA 2L5LA 2ON5A 1QMVA 2BTOT 4OFMA 2P31A 2KLXA 2H19A 5ECKB 2FA4A 2HZEA 3ZL5A 3QFAC 5IO2A 1BQ7A 1ERUA 4L5OA 2KP2A 4V2NA 5KN3A 3APSA 2KOKA 4YAVA 5G5EA 3DYRA 4PGTA 4OO4A 3WYWA 4MJEA 2K8VA 1GSUA 2PGTA 2GT5A 1S3CA 5JWOB 1XXUA 1QFNA 4XRAA 5J3RA 1K0CA 1TDIA 3Q19A 4OWYA 3LXZA 5CP1A 3ZREA 4RUVA 3W8JA 5CYYA 1FG4A 4IQ1A 4I8BA 5JWRB 1GUKA 3N5OA 4FYUA 4CW9A 2FNOA 4AJ8A 2DBCA 2I81A 3D4MA 4XCSA 4KDUA 4QQ7A 3F4SA 1U87A 3F63A 2FWGA 3UOMA 3DGQA 4XS1A 2CVDA 2DMMA 4KDXA 1O8WA 1PX7A 2XPDA 1GUMA 2N5BA 2R4VA 2KUCA 5D93A 2OJLA 2Z9SA 1HD2A 4WETA 3I69A 2MYGA 2YWMA 1G7EA 1JZDA 2C0GA 3TKSC 3U5RE 3BCIA 5J4UA 2VL3A 3IK9A 2LSTA 3M0FA 4HU9A 4I2TA 3AY8A 4ZL7A 5DVBA 1FOVA 3G9BA 3F3QA 3EU3A 2OBIA 1ACVA 1XPVA 3FW2A 1FB6A 2HFDA 2OE3A 2HYXA 4MF5A 2PPTA 3P2AA 1FB0A 1GSDA 2CZ2A 2VLVA 2H6YA 1EP7A 4EXJA 2FA8A 1VF4A 4MLYA 2MMAA 4KA0A 6GSUA 3R2QA 3DVWA 1PKZA 1TRUA 2IMEA 2HXKA 4IS0A 1K0AA 2V6OA 2O87A 3LYPA 1R5PA 1DE2A 3ZITA 4HJMA 1NM3A 1YKAA 3FR9A 2MBTA 4OCEA 4F9ZA 2QKEA 4XS4B 2WB9A 5CO3A 4ZXGA 2GSQA 1UA5A 1T1VA 2FCHA 1XIYA 3W8SA 1MDKA 4K7OA 1K0OA 1QXHA 5JCGA 2RLIA 2XBIA 5HR2A 2H66A 3ZTLA 1MTCA 20GSA 5EVOA 4ECBA 2L6CA 3WT1A 1ZCPA 1XWCA 2RUEA 3A3TA 3V1WA 5J41A 11GSA 1FAAA 1FVJA 3EWLA 3G7JA 2H73A 3CRUA 5ECQB 5E4WA 2FWEA 1B9YC 4XS4A 3SWLA 4HOJA 5CREA 1SENA 2EIOA 5ELGA 2TRCP 2F8FA 2HZFA 2LNTA 5F06A 1BJXA 3HVVA 1TP9A 3C8EA 5C04A 1K0BA 2GTUA 3RBTA 1T8EB 5LNKe 1Y6EA 2H8LA 4MPGA 2B5XA 1AAZA 1ML6A 4Q5QA 1HNCA 3GTUB 5IPHA 4YH2A 1GTUA 3D4TA 4XHMA 1TW9A 4V1Ag 1HNBA 4WEYA 1MD4A 3W6GA 2M80A 3F9UA 3K8NA 3TRQA 2H1GA 3M8NA 3QPMA 3GNJA 2DMLA 2IMKA 1FHEA 3GURA 2LTKA 3IOSA 2L57A 1TRVA 3CRTA 4HQSA 3TKRA 3MDKA 5A4VA 1SD9A 3LYKA 1SD8A 3CSIA 2CX3A 3VWUA 3GTUA 2FUG2 1YJ6A 4QL7A 3GKMA 1LBKA 4KX4A 2LRTA 3TKPA 1W89A 5ECNB 1UN2A 3MSZA 1TTZA 3QR6A 3FYGA 1QUWA 22GSA 4TXVA 5ECHB 4EF0A 2RUFA 2DJ0A 3H79A 3IAS2 1TI1A 4HJ2A 2LJRA 4J57E 1SJZA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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