4OCFA

Crystal structure of the disulfide oxidoreductase dsba (s30xxc33) active site mutant from proteus mirabilis
Total Genus 62
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
62
sequence length
187
structure length
187
Chain Sequence
ADISEGKQYTNLSKPVAGAPQVVEFFSFYSPHCYQFSEVYKVNSTVEKNVPENTKMARYHVDFLGPLGKEMTRAWAVAIALGVEDQVSPALFKGIQETQSIRSVDDIRTTFINAGVKAEDYDAAINSFVVNSLVSQQQNAVTDFQINGVPAMVIDGKYKMKNDGISAKSPEEYAKAYSDVVNQLLMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the Dithiol Oxidase DsbA Enzyme from Proteus Mirabilis Bound Non-covalently to an Active Site Peptide Ligand.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Proteus mirabilis
total genus 62
structure length 187
sequence length 187
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ocfA00
1OAZA 4IHUA 4TXOB 3RDWA 2H6YA 3BCIA 3ISOA 4H86A 4O5RA 2VD1A 7GSSA 4KSOA 3DIEA 1EWXA 4GQFA 1SD8A 3H93A 4MA9A 2H01A 1MDJA 4K7OA 2PPTA 2AB6A 2HZFA 4I8BA 4HDEA 12GSA 1T8EB 1Z7PA 2C0GA 1HNAA 2CVBA 3QAWA 4IQAA 5G5FA 2NTOA 1EP8A 4MJAA 22GSA 5KN2A 3LFLA 4KCEA 2O8VB 2O89A 1TRWA 5LNKe 1NHYA 5KN3A 1X9MB 2GT5A 2G0FA 2GTUA 2OACA 4ID0A 5HR3A 2GS3A 3KP9A 4ACSA 5IO0A 4JR6A 1T1VA 2JU5A 4DSQA 2N5AA 5JWRB 2HZEB 4I6XA 2E2GA 2N5BA 4OCFA 4ILFA 4MF7A 3C1RA 4F03A 2PVOC 2NPBA 3UVTA 1PKWA 1DBYA 3AY8A 11GSA 3KH7A 4D73A 4N30A 5CRHA 5G1KA 3HVVA 2CVDA 2GZYA 1TI1A 3TKQA 4KE3A 4MABA 4NMUA 1K3LA 2KUCA 1GWCA 1ZZYA 3KXOA 2L5OA 2H71A 1OC9A 2GGTA 1ERTA 3BOAA 1FB6A 5HFGA 4FYBA 4HI7A 2B6MA 2XC2A 1ZL9A 3CTFA 3GIXA 2H19A 3V1WA 1SD9A 2MMZA 2FWEA 1FB0A 4GCIA 1T4YA 2VCQA 3S9FA 2O7KA 1W89A 4WETA 1K0DA 2H74A 4E8HA 3C7MA 2L4CA 1BQ7A 2CX4A 1Z7RA 2NBSA 2V6OA 2LV3A 3M0FA 2PU9C 3D5JA 1V2AA 5LD0A 2OA7A 2YV7A 4MMMA 3IK9A 4EVMA 4EDZA 1VF2A 3RAZA 1TK8B 4V1Ag 4LMVA 1NSWA 4GRFA 1AW9A 1A2LA 3M3MA 5G31A 2H0IA 1XXUA 3D4MA 4GXZA 2K18A 3TRQA 4GSTA 2CQ9A 3CSJA 2YCDA 3ZLPA 4V2MA 5IO2A 3WGXA 1GNEA 1A24A 3O3TA 1UA5A 4IN0A 2H8LA 2GQLA 5ECOB 1R7HA 1SKSB 1T3BA 1USBA 3VPQA 5J3RA 2HLSA 2EC4A 1GLQA 6GSTA 2X8CA 4HOJA 3BBYA 1HD2A 3ERWA 4J56E 5DBQA 16GSA 1YKAA 4ZL9A 1M9AA 4TXVA 1M99A 4DSRA 2G2QA 3TKSA 2VD0A 20GSA 4XS1A 3APSA 3EWLA 1ZGNA 1M0UA 1OYJA 3QCPA 4YQVA 2O85A 2LNSA 1ZYQB 3VLNA 2DJ1A 4K9ZA 2C80A 3N5OA 1O81A 4L5OA 1T00A 1XW9A 1XBSA 2QC7A 1PX7A 4ECCA 1HNBA 3P2AA 5CNWA 5JWQB 1ABAA 1J9BA 4X43A 1U6TA 2IFQB 2B5XA 1EGRA 5DJLA 1DE2A 4MJEA 5JCWA 1K0AA 1A0FA 3DMLA 2JZSA 1TXXA 2VO4A 3GL3A 3RBTA 4BVXA 4OD7A 2OE3A 4HJMA 3LG6A 2HSYA 5F07A 1URMA 1YZXA 1MTCA 4OO5A 1PRXA 1IYHA 4BL7A 1SKWB 2VL2A 1I9DA 3TJFA 5IQYA 1BJXA 2JZRA 4ECJA 3IR4A 4GSNA 1AQXA 2L6DA 3BJ5A 5IMZA 3EE2A 3LXZA 4WKWA 4OFMA 2H73A 5GZZB 3FRCA 5DQSA 4DSSB 1GTUA 4CHSA 1IYIA 2B1KA 2GT6A 3TOUA 2O87A 3HZ8A 5B8AA 5IPHA 2AHEA 3H1NA 2OBIA 4Q5FA 1WP0A 3H79A 2X99A 3L9VA 2PVQA 3HVXA 3PGTA 1XOBA 4HQSA 2GQMA 3QD9A 3G9BA 3Q74A 3QPMA 4ZBBA 5GAND 2H1GA 1BAYA 1EV9A 1GTIA 2BJXA 5F05A 1VF4A 3QDNA 4ECIA 4KNDA 2CVKA 4K7IA 4WR5A 2FWFA 5CAXA 2C0DA 1JFUA 1J0FA 1FOVA 1A2JA 1U3AA 4NXIA 4IVFA 2LS5A 5F8BA 4Q5QA 4HUAA 4LMWA 2IMDA 1R26A 2PMTA 3VPTA 5INYA 1O73A 3D4TA 4G10A 19GSA 1XZOA 3F63A 3WYWA 5HR0A 1GSYA 2FWHA 1F2EA 1ZYEA 2FLSA 3O6TA 3D0ZA 1GL8A 2TIRA 5E59A 5HFIA 4JZQA 1ON4A 3FZAA 3U6VA 2E2MA 2RUFA 5AISA 2BTOT 5KN1A 3C73A 4F9ZA 5EL8A 3FKFA 3UVHA 3IV4A 5GAPD 2HT9A 3BCKA 3D21A 1F3BA 5DAKB 3HKRA 5HR2A 4PNGA 1U3IA 1F3AA 3GYKA 3VWXA 1QUWA 1GH2A 3WT1A 3GSSA 3ZYWA 2RM6A 3VWWA 4YQUA 2LTKA 3A2VA 2XPEA 1RQMA 4L8EA 4K2DA 3TCOA 5CRWA 4ZL7A 2VM2A 2H0HA 2XPDA 2GSRA 3DVWA 3VI7A 4TXOA 3P90A 3MNGA 4FYCA 2YZUA 5G2ZA 4EKZA 4J57E 6GSVA 2J23A 2H0GA 4ML6A 2MYGA 3QOUA 2DJ3A 2ZUPA 3DVXA 2AUVA 2P5RA 1NHOA 4KW6A 2M72A 2JADA 4MJCA 5J9BA 2RM5A 1H75A 4DEJA 3KTBA 1JZRA 3ZVJD 4HEA2 5D96A 2IN3A 5H5RA 1X9SB 3EURA 1C72A 4JE1A 3TDGA 3LEFA 3ERGA 1OC3A 1A0RP 4NHZA 1YDKA 3RPPA 1JZDA 2DLXA 3VWUA 3NZNA 1YKCA 2P31A 3ZITA 4Z7XA 2XBQA 2LSTA 5AN1A 3DGQA 2HZEA 3G7JA 4IQ1A 2GZPA 4KGIA 1XW6A 1Q4JA 2GDRA 3IC4A 4JR4A 3EMXA 3KJYA 2JACA 5COHA 3GURA 2GSQA 3GKXA 4EDYA 4J2FA 4JBBA 18GSA 2R37A 2DC5A 1RK4A 3WGDA 1OE7A 3L0HA 1GRXA 4OCEA 1BG5A 3F4TA 4RQRA 4OO4A 4AGSA 2GSSA 2CAIA 5EPFA 3IHQA 2QKEA 1Z6MA 6GSXA 1U87A 4FYUA 5ELGA 2B5EA 2R2JA 1SK2A 3L9UA 2MMOA 3UIWA 2AJQB 1A23A 3TJGA 1XCCA 1YQ1A 2YV9A 2M80A 1XWGA 3KMOA 13GSA 3A2XA 3FZ5A 1Q98A 4BWSA 3L78A 3TJBA 1Y25A 1GNWA 3CRUA 4PQIA 1Z3EA 4K0NA 3UJ1A 1FAAA 2H66A 3RHBA 6GSYA 5J9CA 1TOFA 2I3YA 5IIZA 1GSDA 4PXOA 1PGTA 2FY6A 3C71A 2LEGA 2V6KA 2KLXA 1AIUA 4L0WA 4NAXA 1KEBA 4O92A 4K7NA 2WB9A 1ZCPA 2VCWA 4V2LA 3WGEA 1S3CA 2R3XA 1EGOA 4XRAA 3EMPA 5ECPB 1E6BA 3APOA 5B6NA 1THXA 1G6WA 4GF0A 1WWJA 2KP1A 2DJ0A 3GTUB 2R5GA 5HR1A 2H1BA 1K0MA 3E3EA 1O7UA 1O8WA 1X5CA 2F51A 4MZCA 1X0RA 1OKDA 2GZZA 3J7Yb 2B7KA 2OE0A 3M9JA 5CRDA 3PINA 4KCAA 2LRCA 3ME7A 5C00A 4JU5A 4MP4A 5JWOB 4GWRA 1XPVA 3G7YA 1MDKA 1M7TA 4NWYA 3QFAC 3UEMA 4AF2A 14GSA 4AJ6A 3ZTLA 2DSAA 2ZNMA 5CP1A 3I6AA 4HU7A 3FZ9A 3GUSA 2OBKA 4EUYA 1TI3A 1XVQA 2P0GA 2K8SA 3HZ4A 2IFQA 5G30A 1EP7A 1XIYA 1WJKA 4EF0A 1E2YA 3PR8A 4POKA 4CDOA 3HA9A 4IP1A 1FO5A 2LJAA 1G6YA 3E0UA 1OKTA 3O76A 1LJRA 2CAQA 4N0ZA 5ENUA 3LORA 2C3QA 3M8NA 4I97A 4O7HA 1ST9A 4G19A 4EC0A 1YF0A 5CO3A 1JZOA 4GLTA 4IBPA 3TKPA 2DMMA 5JCGA 3GFKA 2QGVA 2I1UA 4I2TA 5J4UA 5KEJA 2JSYA 2YWOA 3KD0A 3TGZA 4HZ2A 1BYEA 2FUG2 2H75A 2IMEA 5B7CA 3LWAA 4DSSA 3MSZA 4BVYA 3W6GA 1QFNA 3TOTA 4MZWA 3ZFLA 3ZL5A 1SENA 4RQXA 2L6CA 3ERFA 4D73B 17GSA 4ECBA 3LGCA 2X8GA 2RUEA 1MDIA 2PBJA 4TOPA 2A2RA 2YOIA 2FWGA 4RI6A 1X5DA 3EC3A 3ZIVA 1GLPA 3Q18A 3TKSC 3UMAA 1XW5A 1WE0A 3F3RA 2VCVA 5H5QA 4HZ4A 3KIJA 3L9SA 3HVSA 4K6XA 2AV4A 1H4OA 3IDVA 1A8YA 3UBLA 2NVLA 5JCUA 4KDXA 4ZBAA 1O85A 1K0OA 3HDCA 2VCXA 1YJ6A 5ECLB 2H72A 4NV5A 2AYTA 4HU9A 3ME8A 1G0TA 4MDCA 1PX6A 1SK0A 2LQQA 4YAPA 1O8XA 2HSHA 2IMKA 3HD5A 3FR9A 4LL4B 3ZZXA 4KH7A 2X8HA 5EVOA 1V40A 3FR3A 3F6DA 4PQHA 3SBCA 1SU9A 2VL2C 5DAKA 1WOUA 3FR6A 1G7EA 3FYGA 1GTBA 1SJZA 1BEDA 1OVNA 4MF5A 2F8FA 4MH2A 3ZVJA 1U88A 4E8EA 2L4QA 3VWVA 5EY6A 8GSSA 5E4WA 2VIMA 4KDYA 1K0NA 2VL9A 2EIRA 4KDUA 3KP8A 2L57A 3DEXA 5DQYA 2YP6A 4TVEA 1FW1A 2K9FA 5CRGA 4YH2A 1JLWA 3WT2A 2DIYA 4EL1A 1SK1A 2QSIA 4F2IA 2FA8A 3DRNA 4POMA 1KBNA 1WRYA 2LQOA 2MMAA 1GP1A 5IMAA 4F0CA 1X9WB 1V98A 3CYNA 4MCUA 2PWJA 5ECIB 1B9XC 4G9HA 5ABRA 2LRTA 1GULA 3ZRDA 1XWKA 2VM1A 1NM3A 2ES7A 2GQKA 4TRXA 5G5EA 1DUGA 1JZWA 2H6XA 2C0FA 4QQ7A 3BD2A 3TB2A 3TKRA 2REMA 2H6ZA 3Q6OA 2P5QA 3UL3A 4XIHA 3DD3A 2YPMA 1YY7A 1F9MA 2HE3A 1WMJA 4XHMA 4AJ7A 4P3YB 1ERVA 5ECQB 2CT6A 2CX3A 2IMIA 4IP6A 2WULA 1GSUA 3KMNA 2VL3A 3KM6A 1F6MC 4ZB9A 6GSSA 4ZIJA 2B7JA 2H1DA 2RIIA 1R4WA 3CMIA 4YAVA 3IE3A 4PGTA 2WCIA 1GUMA 3LYPA 1ERWA 4PNFA 2J9HA 3QAGA 3IA1A 1S3AA 2JZTA 5A5KA 1TKDB 5A4VA 4GQCA 1J08A 3HHVA 3NOFA 2MZCA 1VGLA 1EEJA 1A2MA 4N11A 4PURA 4OFTA 1RW1A 1ACVA 2HNLA 4NHWA 4ZB6A 3LSZA 2FA4A 1QMVA 3FK8A 2FHEA 3FW2A 4BA7A 2JL4A 2IIYA 2D2ZA 4MPFA 6GSWA 2C4JA 2H1AA 4WEYA 2CZ3A 1CQGA 1LU4A 4HQZA 2CA8A 3GMFA 1HNCA 2C3TA 2WZ9A 3CBUA 4K8MA 4X0XA 4NPBA 3ZREA 4PX1A 4ZXGA 1TU8A 3KCMA 4CW9A 2YZHA 2E0QA 2F9SA 2DJJA 4MPGA 1B48A 1XWCA 1XOAA 1FG4A 4NV2A 4JRRA 4GTUA 2YWMA 4ZL8A 5ECRB 3NIVA 1OE8A 4K1FA 2YWIA 3GNJA 4HJ2A 4WXTA 3IAS2 2VLTA 2LNTA 3GTUA 5DALB 4MZBA 5ECSA 3E9JB 4XTSA 4L0UA 1AUCA 4BWQA 3DWVA 3MDKA 2HRFA 1EEMA 2YWNA 2TRCP 1SL1B 5C04A 5ECMB 3GRXA 4RI7A 5H5SA 4ISDA 2RLIA 3CRTA 2VLVA 2I4AA 3RHCA 1SL0B 4XS4B 3KH9A 2PERA 1XWAA 3VK9A 3GX0A 1PSQA 3R2QA 1OC8A 2DIZA 9GSSA 4QL7A 1T4ZA 1PQNA 1R5PA 2IJYA 3TRXA 5D73A 5D9XA 5GSSA 3I9V2 3U5RE 1FVKA 3GX8A 5D8IA 5ID2B 3CSIA 2V1MA 1GSFA 1PL2A 3GSTA 1SKRB 3HCZA 2IMFA 3WD6A 5F06A 4PUFC 2EIOA 3OR5A 1SYRA 1QQ2A 1M9BA 3I69A 3HJMA 1B8XA 2C1YA 3VFIA 5A4WA 2I9HA 2XHFA 2JSZA 2LUSA 2HRNA 2K6VA 2FCHA 2K8VA 1Z5YE 1K0CA 1PMTA 3W8JA 1VF1A 1CQHA 2YNXA 2PUKC 4TR1B 3N9JA 2PN8A 3A3TA 4QL9A 1GSQA 4FH8A 2F3MA 2GSTA 2YJ7A 1UC7A 5DVBA 3US3A 4JEDA 4N0VA 1ZOFA 4K0GA 3W8SA 1VRSD 1XFLA 5DCHA 4MF6A 4IGJA 4DVCA 1PN9A 1TDIA 2PGTA 5B8BA 3I43A 2VAFA 2WFCA 5IMCA 4PUAA 1AQWA 1A8LA 1MEKA 1TTZA 2C8UA 4I5QA 4XCSA 4WF5A 4O32A 4F82A 3IXRA 2KHPA 4FO5A 3C8EA 3M9KA 3L4NA 2IL3A 3FEUA 4MLYA 3KEBA 1EZKA 3P8WA 1YEPA 5FHIA 2WDUA 2VUPA 5HFKA 1SJIA 5AIVA 4KA0A 5ECHB 1AXDA 3F9UA 2V41A 1TRVA 2E7PA 2LRNA 5G1LA 4EXJA 5B6MA 1BX9A 3HXSA 2TRXA 1GSSA 5ECNB 1TJDA 4EE0A 2BMXA 3F3QA 3GH9A 3LQ7A 1V57A 3LJRA 3GN3A 2ON5A 1I5GA 3QMXA 2HYXA 1MD4A 2DJ2A 4TKYA 1Z6NA 3M1GA 4TR0A 2M46A 3DXBA 2KOKA 4LA1A 1FVJA 3H4KA 3HYPA 2H70A 3IK7A 4KX4A 1N8JA 4BPYA 3EU3A 2DJKA 1G7OA 2YN1A 4YQMA 5L71A 4ULXA 2NDOA 3UBKA 3F8UA 2OKAA 1SJ6A 2WRTA 2B3SA 3FY7A 1ML6A 4KUNA 5F0GA 1OC9B 4IELA 1JLVA 4L5LA 4Q5NA 1V58A 4V2NA 3TUEA 1YEXA 5A4UA 1HQOA 5IPGA 4N10A 5DDLA 3ED3A 4OFNA 1F37A 4IS0A 1S3DA 3QAVA 1Z9HA 1KTEA 2CV4A 4EO3A 2VCZA 2Z9SA 5D93A 1M2DA 1TK0B 3F6FA 3TRPA 2LJKA 2CZ2A 1B4PA 2FD3A 1ILOA 1THOA 1UVZA 4PQ1A 3G7IA 2F8AA 3GA4A 4TR4A 4MH3A 4MK3A 5D9WA 3CSHA 2V2GA 4OMVA 2H30A 4TW5A 4GSSA 2MBSA 3HY2A 2LKUA 1LBKA 2AAWA 5IOXA 1PKZA 5AGYA 1EOGA 1SYXA 2MMNA 1W4VA 4LL1B 1GUKA 2OJLA 4XRDA 4V1Ap 3LXTA 3IPZA 4AJ8A 2VCTA 1WIKA 3QR6A 1TRUA 2FGXA 5DJMA 2YANA 3ZMKA 1QGVA 3GHAA 3MAKA 3CTGA 1X5EA 4ML1A 5IMVA 4IKHA 3F4RA 3ZIJA 4FIWA 4WR4A 1QXHA 2VLUA 1HYUA 3C1SA 2N5FA 4KAEA 1B4QA 2VOCA 2IWTA 1UN2A 3GKKA 3H8QA 1TRSA 1ERUA 2LJRA 3SWLA 1ZMAA 2GVPA 1TW9A 4X1UA 2X64A 2R4VA 3DYRA 5KN0A 2DMLA 4WF4A 3IOSA 5IM9A 2L5LA 4HS1A 3GL5A 4POBA 2WGRA 3JCML 4Q5RA 3FHKA 2I81A 2OADA 1TK5B 1O6JA 3GKNA 1AC1A 2ON7A 10GSA 2OE1A 3MWHA 1V9WA 1JHBA 3IAM2 1T7PB 2DBCA 3F4SA 3PH9A 5IMFA 2H76A 2HFDA 5DALA 3KZQA 3FZ4A 2XBIA 1KNGA 5J5NA 4IJ3A 1TP9A 3A2WA 5J41A 3TKSE 3EU4A 1XVWA 3F0IA 2A2SA 1K0BA 3UARA 5CREA 3RPNA 1EOHA 1Y6EA 4KB3A 3VURA 3ZMLA 3D6IA 4IW9A 2V32A 1TU7A 4ZBDA 1PL1A 2FNOA 4XS4A 5ELAA 2YJHA 1GTAA 1K3OA 2GLRA 1DSBA 2A4VA 2C3NA 5FT3A 3J7Yk 2MBTA 2HI7A 3GV1A 1FHEA 5ID2A 2IPAA 1M2AA 3K8NA 3APQA 2L59A 1SL2B 1N2AA 4I2UA 3CXGA 3HJOA 5FWGA 3KGKA 2WJUA 5HQPA 5LCZA 3HJPA 4LLRA 3TJKA 4TR3A 5IMDA 1B9YC 1MD3A 3IRAA 3IBHA 4OWYA 1YF1A 5D9TA 5D9VA 1K3YA 6GSUA 4MJBA 1GSEA 2EIQA 2B5YA 2B1LA 1EV4A 3GKMA 2WS2A 3P7XA 4XS6A 1NW2A 4KSMA 4TR1A 2HXKA 4IJIA 3GH6A 3TJJA 3VI5A 4RUVA 3EVIA 1QK8A 5DCGA 5GSTA 5ECKB 1PA3A 1R5AA 5CYYA 4ZILA 3LYKA 3UAPA 3UOMA 3Q19A 4POLA 2R6KA 5AIXA 1M2BA 3D22A 4ZB8A 1AQVA 3QFBC 4TN8A 2ZCTA 4F0BA 4WBJA 3DKSA 2ALBA 1PD21 5IOWA 4G2EA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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