4OD7A

Complex structure of proteus mirablis dsba (c30s) with a non-covalently bound peptide pwatcds
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
187
structure length
187
Chain Sequence
ADISEGKQYTNLSKPVAGAPQVVEFFSFYSPHCYQFSEVYKVNSTVEKNVPENTKMARYHVDFLGPLGKEMTRAWAVAIALGVEDQVSPALFKGIQETQSIRSVDDIRTTFINAGVKAEDYDAAINSFVVNSLVSQQQNAVTDFQINGVPAMVIDGKYKMKNDGISAKSPEEYAKAYSDVVNQLLMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the Dithiol Oxidase DsbA Enzyme from Proteus Mirabilis Bound Non-covalently to an Active Site Peptide Ligand.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein
molecule tags Oxidoreductase/peptide
source organism Proteus mirabilis
total genus 61
structure length 187
sequence length 187
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-01-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4od7A00
3IPZA 3VPTA 5GZZB 2CQ9A 2C3TA 5JWOB 2H66A 1WJKA 2LJRA 1QMVA 4ZB8A 2H0GA 1V57A 4XIHA 4N0VA 5DBQA 3U6VA 4G19A 1PQNA 2H0HA 4K8MA 3IAS2 3EU3A 2J23A 2PGTA 5ECKB 1O73A 2FGXA 4MPFA 1NM3A 4OO4A 2H74A 4OFMA 4XRDA 1M9BA 1ABAA 3GX0A 14GSA 2XPEA 2LJAA 1TRSA 1TTZA 2C8UA 2R37A 2M46A 1JZDA 2OBKA 3H1NA 1QQ2A 5DALB 3GTUA 1DE2A 3LXTA 4JR6A 4TW5A 2C0DA 2PN8A 5HR3A 5ECQB 3M9JA 3TRPA 3VWUA 4JR4A 4V2NA 2HT9A 1YKAA 1ZGNA 1GSEA 3TRQA 2B5XA 4PNGA 2YZUA 5IQYA 4WR4A 3F4SA 3JCML 1FHEA 12GSA 1UN2A 2DJ1A 5ELGA 4E8HA 1VF1A 4XHMA 1FVJA 1T4YA 2L4CA 2VCWA 1VF4A 2DBCA 1QGVA 4GRFA 1GTBA 1GH2A 3TB2A 3VFIA 2XPDA 3IHQA 3KH9A 4OO5A 4TRXA 3TKRA 1X5DA 5CRHA 4GTUA 6GSXA 4AJ6A 1V40A 2HYXA 2LJKA 2OKAA 4POKA 16GSA 1MTCA 5F07A 1OKTA 4TR1A 4KX4A 1ZOFA 3M0FA 3CSHA 3RHBA 2R5GA 2CZ3A 3V1WA 2FWHA 5DQSA 5H5RA 1T8EB 2ON5A 1O85A 3EWLA 2V32A 3TOTA 1WPIA 1N8JA 3FHKA 3GURA 5JWQB 4ZXGA 2VCXA 1XWBA 4X1UA 2MYGA 1ERWA 3F6DA 1G7OA 4MABA 1XW6A 1HYUA 1OC8A 3LXZA 4KE3A 1TU8A 3MSZA 2GDRA 2KLXA 4ECIA 3EC3A 3CBUA 4I5QA 1XWGA 2PU9C 3H93A 3LWAA 4ISDA 3TKPA 1KEBA 2HZFA 3QCPA 1EEJA 2OE0A 4EKZA 1AQWA 2KP1A 1GNWA 1Z6MA 1F2EA 3US3A 5AIXA 1WOUA 2B1LA 3QD9A 5DQYA 4OFTA 1ERUA 3M3MA 3EINA 1RK4A 1BX9A 1O81A 3BOAA 4WEYA 4N10A 2EIOA 4KDUA 3QMXA 1AUCA 3DWVA 3IK7A 4F03A 1AC1A 3HD5A 5GSTA 2KOKA 1ON4A 3F0IA 1VGLA 2NPBA 1SKWB 4BVYA 1V9WA 3GKXA 2JZRA 1S3AA 1F37A 2IFQA 3GH6A 2VL2C 1KTEA 5JCGA 5G1LA 2NDOA 1TI3A 2C3NA 5GAND 2IIYA 4MDCA 5ECIB 3DIEA 4LA1A 2NBSA 1GSDA 3ERWA 2NVLA 3ZZXA 5C04A 1Z6NA 3GHAA 1NHOA 3TUEA 3TJFA 2VUPA 4OMVA 2O89A 4F0BA 4NHWA 3O76A 4FYUA 5DCHA 1TOFA 3LGCA 4ZBAA 3ERFA 3ZFLA 4MF7A 2WRTA 3HZ4A 4IJ3A 4YQVA 2I1UA 1O8WA 4ZL8A 1BAYA 2B7JA 2H71A 2B6MA 1OYJA 4MZCA 1GRXA 4HU7A 4ULXA 5D73A 3HVXA 5ECLB 4KUNA 3EVIA 4EUYA 1PGTA 4WETA 3RPNA 1AQXA 3SBCA 3F8UA 3KXOA 3LG6A 4JZQA 5IIZA 1HD2A 2H1DA 5CO3A 3P90A 5J41A 2FA8A 4TR4A 2QKEA 1TW9A 4ZBDA 2GSQA 1HQOA 4GSSA 1AAZA 3TJJA 3G7IA 1ZCPA 5F0GA 1K0MA 3DVXA 2ZCTA 4XTSA 4K7IA 2CT6A 5D9WA 1S3DA 1FW1A 1NHYA 3EMPA 1SYXA 2EC4A 4WF4A 5IOXA 1GP1A 3BJ5A 1GULA 2ES7A 4ILFA 1GUMA 5IMCA 1PL2A 2GSRA 2DSAA 2RM6A 2JADA 4DVCA 3TKQA 3J7Yk 1JZOA 2LSTA 4HQZA 3F3QA 2OADA 4IP6A 3EURA 2FWFA 5EY6A 4IW9A 3UL3A 5CRGA 4PX1A 1U3AA 2R3XA 3Q74A 4Z7XA 2LEGA 3VLNA 1Z9HA 2WS2A 3VWWA 2DLXA 2V1MA 5AISA 3VI5A 3HJOA 6GSYA 1ACVA 5DDLA 4P3YB 3ZIVA 1OKDA 4TVEA 3GYKA 3KMNA 5JWRB 2YPMA 2H1GA 3FY7A 3H4KA 4EF0A 4EVMA 2PERA 4Q5QA 1MD3A 5CREA 2IN3A 4MZWA 5J9BA 2P5RA 2DC5A 3LYKA 4NV5A 1PA3A 3WGXA 3QAWA 2CV4A 2MMOA 3UAPA 3HZ8A 3TDGA 3D6IA 2ZNMA 2OE1A 17GSA 2IMDA 2B3SA 3ZMKA 1FB6A 6GSUA 3UMAA 3RBTA 3UVTA 1YZXA 3GFKA 2FD3A 3L9UA 1EOHA 3UEMA 5IOWA 3G7JA 4ML6A 1T1VA 1B8XA 1JZWA 1JHBA 2GLRA 1M9AA 4QL7A 3ZRDA 1I9DA 3UOMA 4I97A 4O5RA 3ZITA 3W8JA 4XCSA 5B7CA 3VK9A 1DUGA 3QAVA 1TK5B 3ISOA 4TKYA 4V1Ag 4EXJA 3A2WA 4BL7A 3N5OA 3LYPA 4JE1A 1R26A 1M2AA 5L71A 4IJIA 5D9VA 2CAIA 1X5CA 4HOJA 3KTBA 1EEMA 5CRWA 5DAKA 1ZZYA 5DJLA 3H8QA 5EPFA 3RHCA 1M2BA 5J3RA 4XRAA 5ECPB 1MDIA 1XXUA 3HJPA 1SK0A 3GTUB 2YWMA 3GL3A 4LMWA 2M80A 5EVOA 1Z5YE 2GT6A 3MAKA 4IN0A 1F9MA 2R4VA 6GSWA 3HXSA 1MEKA 4OCEA 2KP2A 1SU9A 2RM5A 3UBKA 3VWVA 2GSSA 1T00A 4LMVA 4TR0A 2C0FA 3VI7A 2H1AA 2VM1A 4XS4A 2VL3A 3Q18A 1EV9A 4E8EA 3QR6A 1Y25A 4BWQA 3N9JA 1N2AA 3Q6OA 4O7HA 1R4WA 2H6XA 2IPAA 3RDWA 2H01A 4HI7A 4MP4A 4K7OA 4PUFC 4L5OA 5G1KA 1PSQA 4KSMA 3DRNA 2JL4A 4TR1B 4K1FA 4OD7A 1LJRA 18GSA 1TK8B 1DBYA 3WT1A 4RUVA 1BYEA 1USBA 2O85A 2QGVA 3GX8A 5HFGA 4DSQA 3CYNA 4EE0A 5B6MA 2FWGA 1YY7A 4IKHA 3MWHA 5G31A 1B9YC 4F82A 4J56E 4K2DA 3AY8A 1WE0A 3FZ5A 3TGZA 5DVBA 4YQUA 11GSA 1YQ1A 3EE2A 1TI1A 2C80A 2O87A 3GIXA 4N30A 5ID2B 1K0AA 1GTAA 2B7KA 3VPQA 2AB6A 1SKRB 4KCEA 1FG4A 1BQ7A 2I3YA 3QDNA 3IOSA 3F63A 2P0GA 1Z7RA 7GSSA 3IDVA 1AIUA 5ENUA 4QL9A 4GLTA 4IVFA 1X5EA 2VAFA 1MDKA 1K0CA 3LJRA 3NOFA 2M72A 2LTKA 3L0HA 4NHZA 2H0IA 1B48A 1FAAA 2L6CA 3DD3A 4YAVA 1RW1A 1SYRA 4POBA 3GKNA 4F9ZA 1R5PA 3FZAA 1TP9A 1EV4A 4KNDA 5KN0A 3ZVJA 3GL5A 2IMIA 4IHUA 5IMFA 1B4QA 2MBSA 2IFQB 1FO5A 1G6YA 4IGJA 1A0FA 4HEA2 4WXTA 1Q4JA 3F4RA 3IV4A 1K3YA 2PBJA 2YV9A 2HXKA 1FB0A 3PINA 5G30A 3KMOA 1U6TA 4MJEA 1OC3A 2YV7A 4ZILA 4XS1A 1NSWA 5ID2A 5GSSA 1R7HA 3BCKA 1NW2A 3IBHA 3CRUA 4KH7A 5LCZA 4MCUA 1EWXA 4F0CA 3KM6A 2YANA 3HJMA 1W89A 4PUAA 2AJQB 2N5AA 3HY2A 2RIIA 3UVHA 3KGKA 3M1GA 2PVOC 4NPBA 5IMDA 2VM2A 3A2XA 2E2GA 2MMNA 4IS0A 4Q5NA 1JFUA 3KH7A 1TRUA 2REMA 4FYBA 2HFDA 1YF0A 4IBPA 4MLYA 4F2IA 5IMVA 2GZYA 2YN1A 4NAXA 1OVNA 4I2UA 4AJ8A 3DKSA 2L5OA 3UARA 5CP1A 5FT3A 3IAM2 3ZLPA 4BPYA 1X9MB 3ZVJD 4MJBA 1T3BA 4POMA 5ECMB 2HSYA 2GQLA 2FA4A 4FYCA 5G5EA 2GQMA 1H4OA 4J2FA 20GSA 4PQIA 4K0NA 2DJ3A 1AQVA 2WB9A 2BJXA 3ED3A 1SJZA 1K0DA 2E7PA 2LQOA 2N5FA 3DGQA 2L4QA 5E59A 1XW9A 2VL2A 4RI6A 2WZ9A 3D5JA 3D21A 2I4AA 4WKWA 4WR5A 3IE3A 5ECHB 4IP1A 2LRTA 5KN1A 2GVPA 3O6TA 2F51A 1TRVA 3WYWA 2CX4A 3KP8A 5IMZA 2LRCA 4PQHA 4MZBA 2LRNA 1M0UA 1ZYEA 3CSIA 3KD0A 1CQGA 2HSHA 2LS5A 4ECJA 2HZEA 4KSOA 4N11A 1K3LA 4H86A 5J4UA 2EIRA 1XIYA 1A23A 3GRXA 2WJUA 5IM9A 2IMKA 2YJHA 3TRXA 2PVQA 4AGSA 2GQKA 1TJDA 2TRXA 3A3TA 3FR6A 4PQ1A 2F8AA 1OE8A 5F8BA 5KN3A 2CX3A 3DMLA 19GSA 4PNFA 2J9HA 2LNTA 1YF1A 2X8GA 2VCZA 1UC7A 1X9SB 2CVKA 2JZSA 3F4TA 3CTFA 2FCHA 5KN2A 3WGEA 2IJYA 1G0TA 4CHSA 1Y6EA 3KTLA 3A5WA 2F9SA 1XW5A 1HNBA 4WF5A 1QFNA 3ZTLA 4ZB6A 5FHIA 4PXOA 1X0RA 1XBSA 1VRSD 1XVQA 3KIJA 1GLQA 4HS1A 1DSBA 3I69A 3P2AA 1E2YA 4IQ1A 1XPVA 2D2ZA 3APSA 5H5SA 5HFIA 1PMTA 4MPGA 5DAKB 1TK0B 4FO5A 5HQPA 2K8SA 4L8EA 3CTGA 1UVZA 2OA7A 3ZL5A 3HA9A 1F3BA 1QUWA 4PURA 1A2LA 2BMXA 4K9ZA 2R6KA 3E0UA 2YNXA 1ST9A 2H73A 4POLA 5E4WA 4DEJA 3J7Yb 1JZRA 2E0QA 2A2SA 2CA8A 4NWYA 3D4MA 2RUFA 1LU4A 4HZ4A 5ECSA 4DSRA 4PGTA 5HFKA 6GSSA 3TJGA 3L4NA 2WFCA 1PRXA 4XS4B 1XWAA 4G2EA 1TRWA 3D22A 10GSA 5HR0A 2B5EA 3LORA 1YDKA 1ZL9A 2AAWA 3GUSA 4NMUA 5B8BA 2V6KA 3CSJA 1U3IA 1SK2A 5EL8A 4HJ2A 1IYIA 1PX6A 4YH2A 5FWGA 2VCVA 1ERVA 4RQXA 1XOBA 4QQ7A 5IPGA 5IO2A 2O8VB 1VF2A 2C3QA 4LL1B 3F9UA 1YJ6A 1OAZA 1A2JA 3HVSA 2KUCA 1F6MC 3FKFA 3GN3A 1PD21 4I2TA 2PMTA 4DSSA 2C0GA 2G0FA 3BBYA 2HE3A 2JSZA 2YJ7A 2K18A 2C1YA 2LUSA 1GNEA 1XWKA 1GSYA 2V41A 3H79A 2FHEA 1SL0B 3FEUA 2MMAA 4LL4B 4TXOA 9GSSA 4OWYA 3M8NA 2X8HA 1QXHA 1J0FA 1K0OA 3L78A 5ECRB 1EP8A 2PWJA 1X9WB 1PL1A 3P7XA 5AGYA 4GCIA 4YAPA 1THXA 1AW9A 4MF6A 1MD4A 1V58A 3DEXA 1XZOA 5D9TA 3W6GA 2AUVA 2QSIA 4KAEA 2NTOA 3GMFA 1TKDB 2DJJA 1XCCA 5JCUA 3TKSE 3QAGA 2IL3A 3WD6A 5A4UA 1T7PB 1SD9A 2GSTA 2VL9A 3PGTA 1XFLA 4OFNA 1W4VA 2FUG2 3TJKA 4FH8A 4O92A 2A2RA 1C72A 4BWSA 3UIWA 3LSZA 5HR1A 5F05A 4MK3A 4X0XA 2YCDA 5GAPD 3VWXA 1GSFA 4MMMA 4JRRA 4WBJA 1OC9A 3FR3A 3IR4A 5AIVA 2Z9SA 3ZFBA 2YZHA 4KDYA 5CYYA 3BCIA 5ELAA 3IC4A 3ZIJA 3S9FA 5G2ZA 2ZUPA 1R5AA 3WGDA 4V1Ap 13GSA 4GSTA 4CW9A 2JSYA 1OE7A 1SL2B 5ECOB 4G10A 3R2QA 2I81A 4ZIJA 2C0EA 22GSA 4ECBA 1WIKA 3CRTA 3TKSC 2XC2A 2K6VA 1GSUA 2WCIA 2H6ZA 5LNKe 2HRFA 2EIQA 5DCGA 3GH9A 4EC0A 1Q98A 1SJ6A 3BD2A 4EL1A 2YP6A 1SL1B 1BEDA 2X99A 2VO4A 3LEFA 1GUHA 4L0UA 2GS3A 3GSTA 1ERTA 3KP9A 3CMIA 2AYTA 4EDYA 2LKUA 1EGRA 2YWNA 1URMA 2CVDA 1A8LA 3KEBA 2CAQA 1SENA 1SD8A 1A2MA 1T4ZA 3TKSA 3SWLA 4KW6A 1J9BA 3O3TA 2JU5A 4ECCA 2ALBA 1ZYQB 2DIZA 1GL8A 4JBBA 6GSVA 5A5KA 3EU4A 5J9CA 3C8EA 3GNJA 3TCOA 5AN1A 5IMAA 3DYRA 3P8WA 2XBIA 1JLWA 4KDXA 5DJMA 3ZYWA 3OR5A 1PX7A 4L5LA 1U87A 2LNSA 3L9VA 4XS6A 4KCAA 5DALA 1S3CA 2WGRA 4FIWA 4TXVA 1XOAA 5CRDA 4WBRD 3QPMA 1ZMAA 2JZTA 4KGIA 4NV2A 2MBTA 4MF5A 2O7KA 1UA5A 2WULA 4HDEA 3F3RA 3GKMA 3C7MA 5D9XA 4ACSA 1O6JA 3HYPA 1I5GA 2GT5A 2RLIA 2YWIA 1FOVA 2E2MA 2P31A 2AV4A 4LLRA 2MZCA 1GLPA 1WP0A 2OACA 4ZBBA 1YEXA 1KNGA 4HUAA 1GUKA 5JCWA 1LBKA 2FWEA 2HZEB 1EGOA 1DE1A 4YQMA 1J08A 1HNCA 2RUEA 4EDZA 3HCZA 4I6XA 4K6XA 4K7NA 2DMLA 3E9JB 1ML6A 3I43A 4HQSA 1TDIA 2IMEA 3ZREA 1Z3EA 5LD0A 3W8SA 4JU5A 3FW2A 1GSQA 2I9HA 1SKSB 1RQMA 5CAXA 3APQA 2H30A 1V98A 2CVBA 5ABRA 2VOCA 4ID0A 3HHVA 3QOUA 2H70A 3KJYA 3NZNA 1YEPA 3LFLA 5J5NA 5ECNB 4TOPA 3PH9A 1GWCA 3RAZA 3C73A 3DXBA 1PKZA 4KB3A 4MJAA 2FY6A 2L57A 2H6YA 4ZL9A 2VLVA 2L59A 2YWOA 3G7YA 2HI7A 2LV3A 4K0GA 1THOA 3VURA 6GSTA 4TN8A 1AXDA 4AF2A 3QFBC 2H1BA 3C1SA 2BTOT 2K8VA 1ILOA 3EYTA 3ERGA 5F06A 1EP7A 3HKRA 1CQHA 3M9KA 3CXGA 1TXXA 2L5LA 1IYHA 2AHEA 1WWJA 2KHPA 4MH2A 1A0RP 2H75A 8GSSA 3TOUA 2DJ0A 4O32A 2QC7A 2V2GA 1SJIA 3GKKA 1XWCA 5C00A 1WMJA 2V6OA 4IELA 1JLVA 1H75A 3IK9A 2ON7A 4EO3A 3D0ZA 4V2LA 3I6AA 3IA1A 2IMFA 3K8NA 2OE3A 3ZMLA 2N5BA 2DIYA 1GSSA 4MH3A 2GGTA 3UJ1A 3ME7A 2H8LA 1SK1A 1HNAA 2MMZA 3HDCA 1M99A 4RI7A 3U5RE 4L0WA 2H76A 2X8CA 2H72A 3C71A 2PPTA 4DSSB 1K3OA 2R2JA 4TR3A 1M2DA 1BJXA 2OBIA 3MNGA 1GTIA 3APOA 3ME8A 2B1KA 1GTUA 1K0NA 4MA9A 4D73B 3RPPA 4J57E 4GQCA 1M7TA 2TIRA 3GA4A 4KA0A 5D8IA 2B5YA 2P5QA 3Q19A 4Q5RA 4RQRA 1A8YA 3FK8A 2HRNA 4TXOB 5IO0A 1U88A 4N0ZA 3TJBA 1KBNA 1V2AA 2C4JA 3KZQA 3E3EA 5G5FA 5B8AA 2JACA 3FR9A 3FRCA 4JEDA 2XHFA 2LQQA 2DMMA 1G6WA 1B4PA 5B6NA 2GTUA 3I9V2 3D4TA 4GQFA 3MDKA 1A24A 2L6DA 3WT2A 3IXRA 4ML1A 3LQ7A 4NXIA 5COHA 2FNOA 3NIVA 4IQAA 1O8XA 4GF0A 2K9FA 1Z7PA 3PR8A 3EMXA 4HJMA 2CZ2A 3FYGA 3UBLA 5D93A 2VCTA 2XBQA 3IRAA 2H19A 1PN9A 2VIMA 1G7EA 5INYA 3GSSA 3A2VA 2OJLA 2HNLA 2A4VA 1OC9B 4CDOA 3C1RA 2WDUA 1XVWA 3HVVA 2VLTA 4BA7A 3G9BA 1F3AA 2VCQA 2DJKA 1PKWA 3GV1A 4D73A 4GWRA 3QFAC 2PUKC 2FLSA 2F3MA 2VD1A 4G9HA 4OCFA 1K0BA 3L9SA 3KCMA 2HLSA 1QK8A 5KEJA 1TU7A 3DVWA 4I8BA 2X64A 4GSNA 2GZZA 5D96A 5A4VA 4X43A 1BG5A 1O7UA 2TRCP 1MDJA 2IWTA 5HR2A 5CNWA 2F8FA 5A4WA 1WRYA 3F6FA 5IPHA 5H5QA 1YKCA 4BVXA 4Q5FA 2VD0A 4AJ7A 2VLUA 2GZPA 3FZ9A 1VF3A 2YOIA 4MJCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite