4OD7A

Complex structure of proteus mirablis dsba (c30s) with a non-covalently bound peptide pwatcds
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
187
structure length
187
Chain Sequence
ADISEGKQYTNLSKPVAGAPQVVEFFSFYSPHCYQFSEVYKVNSTVEKNVPENTKMARYHVDFLGPLGKEMTRAWAVAIALGVEDQVSPALFKGIQETQSIRSVDDIRTTFINAGVKAEDYDAAINSFVVNSLVSQQQNAVTDFQINGVPAMVIDGKYKMKNDGISAKSPEEYAKAYSDVVNQLLMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the Dithiol Oxidase DsbA Enzyme from Proteus Mirabilis Bound Non-covalently to an Active Site Peptide Ligand.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein
molecule tags Oxidoreductase/peptide
source organism Proteus mirabilis
total genus 61
structure length 187
sequence length 187
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-01-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4od7A00
4MCUA 4BVYA 5ECLB 1OVNA 2E2MA 2GZZA 3KTBA 4Q5QA 1A24A 2JSYA 2MZCA 1A8YA 2YCDA 1G6WA 5KN0A 1X5CA 5ELAA 4WR5A 4O5RA 4TRXA 2R2JA 3ZRDA 1FVKA 2GSQA 2RLIA 5D9WA 5ECMB 1MDKA 1EV4A 3RBTA 4OO5A 4ZB8A 1X5DA 5DQSA 3RAZA 4K1FA 2X64A 1FW1A 4OFNA 1RK4A 3WGEA 1AQVA 3APSA 1GSDA 4V1Ag 1W89A 3A2VA 1V9WA 1LJRA 4MP4A 1GUHA 2H0HA 3GL3A 3IC4A 3VI5A 3G7YA 3Q74A 3VPQA 2YV7A 4GSSA 4N0ZA 2VD1A 1H4OA 3E3EA 3L4NA 2VD0A 4TN8A 2AB6A 1OC8A 4OFTA 4TR1B 3HCZA 1BG5A 4Q5NA 5GAPD 1THXA 4ML6A 3LJRA 3W6GA 1GRXA 2CVDA 3EWLA 2JZSA 3RPNA 2DJJA 2XC2A 3O3TA 4ACSA 1GSFA 16GSA 1XWAA 1YKAA 2YN1A 1QMVA 4LL1B 3UVTA 2XHFA 1U88A 4MF6A 2VUPA 4DSSB 2E0QA 3CRUA 3GKXA 4FYBA 5ABRA 2L4QA 3AY8A 5DDLA 2JZTA 1QXHA 3BCKA 3Q6OA 4MPFA 1DE1A 3VWUA 1TTZA 2KHPA 5F05A 4RI6A 2F8FA 3QOUA 1HNCA 4HU7A 4KSMA 1URMA 4I5QA 4PQ1A 2X99A 3EE2A 4H86A 2LSTA 2GQKA 1DBYA 3C1SA 1JZWA 2LRCA 2GS3A 5DALB 4ECIA 5IOWA 1X9MB 3ED3A 1J08A 4K0NA 4G9HA 1SKWB 2QSIA 1HNBA 2O7KA 1BEDA 2TIRA 3FRCA 4IKHA 1G7OA 5LD0A 4GQFA 2RIIA 1USBA 1S3DA 1YF1A 2IIYA 3GURA 1SU9A 4KNDA 5D9XA 5ID2B 5AISA 3ISOA 2V6OA 3N9JA 4ML1A 1B9XC 3ERWA 3K8NA 5J5NA 3GV1A 2C1YA 2I4AA 2PN8A 3D21A 2V6KA 4EVMA 1HQOA 2FWGA 3F8UA 4JU5A 2WDUA 2LRNA 2VCZA 1PQNA 4YQUA 1MTCA 1V58A 1Z9HA 3UMAA 1SJIA 5D9TA 3N5OA 4OCFA 4IQ1A 1EOGA 2HRFA 2K9FA 3HDCA 3ZL5A 1XWGA 3US3A 3MDKA 4MDCA 3MWHA 3QFBC 1ON4A 4G10A 4KAEA 2G0FA 4MA9A 4K8MA 17GSA 2O89A 2H70A 4DSQA 5D9VA 4TW5A 3ZYWA 6GSXA 2NBSA 5L71A 2REMA 3KTLA 4YQMA 1PKZA 5GAND 1VRSD 1AW9A 1SJ6A 3ZIJA 5DVBA 3KCMA 1U87A 4KCEA 1EP8A 3D4MA 2WULA 1GSQA 4K7IA 1XWCA 5ECRB 3IE3A 5G30A 2L57A 3KM6A 4XS6A 2EIRA 4J56E 1DE2A 3WT1A 5CYYA 2R37A 1GULA 1YJ6A 3HD5A 4L0WA 1M7TA 5GZZB 5DAKA 4YAPA 5J9CA 5B8AA 4LL4B 4HDEA 2O87A 5B6MA 3S9FA 5J41A 1FB0A 1Y25A 5G31A 3KH9A 5IOXA 4N30A 2C4JA 2TRCP 4XS4B 1QK8A 4AJ6A 1A0FA 2AHEA 2VAFA 1F3BA 3CMIA 1YQ1A 4IN0A 1TRWA 1XBSA 2CQ9A 3TJKA 2P31A 2H01A 4PNGA 5D8IA 4MJCA 4IBPA 1FOVA 2PMTA 4FYUA 2PBJA 1K0NA 2IJYA 3HYPA 4NMUA 2V2GA 2OADA 1PL2A 5FHIA 1WOUA 3F9UA 3FR9A 3LFLA 5AIXA 2LV3A 4IW9A 5IO0A 2IMKA 1GLQA 4OO4A 1TU7A 3LXTA 3IXRA 2R3XA 1SYXA 1SK1A 1SYRA 2LJKA 1HNAA 4I97A 4ULXA 3KH7A 12GSA 2H8LA 1SD8A 2MYGA 3QAWA 1Z5YE 5J3RA 1GSSA 1LBKA 4WF4A 2ALBA 1OAZA 4IELA 2H72A 5C00A 5ECPB 2VCWA 20GSA 2N5BA 4I2TA 1GTIA 1OC9A 6GSVA 3VWVA 1TK8B 1OE7A 4XIHA 1GTUA 1XVWA 1SK0A 5DBQA 5EVOA 4V2LA 2L4CA 5ECKB 4PUAA 5JCUA 4ID0A 2H1AA 4QL9A 3HVXA 4JR6A 3ZTLA 3M8NA 2L6CA 1TDIA 2ES7A 4BVXA 3UAPA 2P5QA 1YY7A 2H73A 5IMDA 2VL2C 2DJKA 4FYCA 3HZ4A 1GH2A 1M9AA 4WETA 3LXZA 5CREA 2X8HA 1Z7PA 3ZVJD 1ZYQB 2WB9A 2H1BA 2C0DA 4YAVA 3WGXA 2I3YA 4EDYA 1BJXA 2LTKA 2GVPA 2YV9A 2WJUA 3TJBA 1M99A 7GSSA 5ECIB 4KGIA 4I2UA 2CX3A 3EVIA 2VOCA 2F8AA 1ZOFA 1XXUA 4KUNA 3IK7A 2EIQA 2QGVA 3GL5A 3UBLA 5GSSA 4MABA 1S3AA 1UVZA 4K6XA 4X0XA 1XW5A 4EKZA 2A2RA 3EU3A 1GNWA 1UA5A 3FKFA 3DD3A 4XHMA 5KN2A 2H0IA 3M9KA 2AJQB 4NHWA 4PUFC 4P3YB 4YH2A 1NSWA 19GSA 5J4UA 2PERA 3DMLA 1T8EB 1PGTA 3QR6A 2H30A 1K3YA 3QD9A 3ZFLA 3J7Yk 1AQWA 3TRQA 5CRWA 5IO2A 3EMPA 2B7JA 5D96A 5IM9A 1S3CA 1X9WB 5AGYA 1ZGNA 6GSTA 4PX1A 1GP1A 2M80A 2X8CA 2B1KA 4ZL7A 3H1NA 1YEPA 3DKSA 4WKWA 1U3IA 2HZEA 2J23A 5CO3A 4ECJA 3CTGA 4NV2A 2RM6A 5LNKe 1J9BA 1X0RA 3PH9A 5KN1A 4WBRD 1ERVA 1QUWA 1BYEA 4RI7A 3GUSA 2YP6A 4D73B 4MJEA 2IN3A 4JE1A 2BJXA 4GLTA 3APQA 1V40A 4HZ4A 4GF0A 1ZZYA 1XOBA 1AIUA 3IOSA 4POLA 2B6MA 1N8JA 4N11A 2LQQA 4NXIA 3H4KA 3UJ1A 1WRYA 3I43A 2HI7A 4AJ8A 6GSWA 2GDRA 1O81A 3HA9A 3E0UA 2YOIA 3F4SA 2OE1A 1K0OA 4ZXGA 2LUSA 3WGDA 2H1DA 1ZL9A 4OCEA 1T4ZA 3GX0A 1Z6MA 1ERTA 4K7NA 2H19A 3H79A 3P2AA 2A2SA 2OE0A 2Z9SA 1A23A 3FK8A 1FO5A 2IMFA 13GSA 2XPEA 3GA4A 3TKPA 2AYTA 1XZOA 4GCIA 4NV5A 5KEJA 2IL3A 2LQOA 5DCGA 1E2YA 3TKSC 5DCHA 3EC3A 2MBTA 2KP2A 2G2QA 5JCWA 2GTUA 2DMMA 4JR4A 3TOTA 3TB2A 3C1RA 1M2AA 3DVXA 3QPMA 4TXOA 2IFQB 1MDJA 5ECNB 1ZYEA 4WBJA 1TI3A 1JZOA 4IJIA 3KP8A 1YKCA 3UL3A 1RW1A 4F0BA 2YZUA 4E8HA 3DRNA 3F6FA 3FR6A 3LG6A 1XCCA 1AQXA 3ZMLA 2PPTA 5HR0A 1NHYA 2YWMA 2CAQA 2C3QA 3ZITA 6GSYA 1GTBA 3EYTA 4TR0A 2EC4A 1GUKA 2A4VA 4KDUA 3F4TA 3ZZXA 4GWRA 1TP9A 4QQ7A 1Q98A 2HXKA 1DSBA 1EGRA 1K3OA 2J9HA 1TI1A 5G1LA 5J9BA 2LRTA 2DMLA 2MMNA 6GSUA 2VLVA 2TRXA 1PKWA 4HQZA 1E6BA 4KX4A 3UBKA 3GTUB 1QFNA 5AN1A 4IVFA 1ZCPA 1O85A 2GSTA 3PINA 4CW9A 3KZQA 8GSSA 5C04A 3G9BA 3M3MA 5CRHA 3LYKA 3A5WA 2XBIA 2HFDA 2GSSA 3GKMA 3IA1A 5IMAA 3HJPA 2H66A 3D4TA 3RHBA 1GTAA 1R5PA 10GSA 2FA4A 2OE3A 2DIZA 2P5RA 4Q5RA 1YF0A 1XPVA 3KEBA 2PWJA 2HYXA 5HFIA 4HJMA 4V2MA 3PGTA 2WFCA 4EUYA 4ILFA 1ERUA 3DEXA 3TKQA 1PRXA 2DSAA 2C0FA 1FVJA 4ZL8A 4G19A 1SK2A 2HSHA 3GH6A 3W8JA 5H5SA 2WGRA 1V98A 1JHBA 1JZDA 4TXVA 1PA3A 4MJAA 2PVQA 4L0UA 3F4RA 3GYKA 2JL4A 4ECBA 2CAIA 4F03A 4F82A 2HSYA 1ABAA 5DJMA 3FZAA 4KB3A 4MLYA 3MAKA 4N0VA 1QQ2A 4J2FA 1K0CA 1KEBA 1PMTA 2R5GA 2FUG2 3QAVA 4K0GA 2AUVA 2X8GA 3UEMA 5A4VA 2WS2A 2IWTA 3DVWA 5DJLA 2B3SA 2QKEA 4O7HA 1U3AA 1FHEA 1WPIA 4HI7A 5D73A 3BJ5A 2F3MA 2VCTA 1O8XA 4X1UA 3VFIA 1GLPA 4HQSA 4CDOA 2DJ3A 4EL1A 1PX6A 2YWIA 1ILOA 2OJLA 3HJOA 4GTUA 4LMVA 2BTOT 2L5OA 5IPGA 4TR1A 2VCXA 2OKAA 3TKRA 1I5GA 4ECCA 4GSNA 1O73A 2HLSA 1THOA 4ZB6A 1TK5B 3IR4A 1TU8A 5AIVA 2IMIA 1T1VA 2E2GA 3RPPA 3FY7A 4JZQA 2CT6A 2YWNA 3Q19A 3UOMA 4MPGA 4TKYA 3A2XA 3EINA 4MJBA 3TCOA 1F37A 2B7KA 3NOFA 1BX9A 1G6YA 4EXJA 4MK3A 1FAAA 3L0HA 2L59A 1AAZA 2C3NA 3ZLPA 4DSSA 2M72A 1W4VA 2O8VB 3D22A 5B8BA 2YANA 3V1WA 3GFKA 2CV4A 4WF5A 4WEYA 1XIYA 3FZ5A 4FH8A 4TOPA 3CXGA 2KLXA 1N2AA 2V1MA 3HKRA 2KUCA 2GLRA 1Q4JA 3ERFA 3FEUA 1WWJA 3GIXA 4LLRA 2IMDA 4ZB9A 1PSQA 4J57E 2BMXA 3CTFA 2VCVA 3E9JB 4NAXA 3D6IA 5DALA 3TJGA 3G7IA 2FLSA 1KBNA 5JWQB 2ZNMA 3LSZA 4XCSA 2H0GA 3HVSA 4ZBAA 3DIEA 3SBCA 1VF1A 5LCZA 1WMJA 3VK9A 1Z3EA 5INYA 5H5RA 3KMOA 5CRGA 2ZCTA 3ZIVA 4EF0A 4K9ZA 3BOAA 5IMCA 3TJFA 2RM5A 5ID2A 4IP6A 5F0GA 3TUEA 1T3BA 3BD2A 4PQIA 4POMA 3EMXA 4WR4A 1MDIA 3J7Yb 1TJDA 5HR3A 4RUVA 1Z6NA 4PURA 3G7JA 5H5QA 4JRRA 1NW2A 3M0FA 3ZREA 3L9SA 1UN2A 3LEFA 5ECOB 4LA1A 1EEMA 2RUEA 3HXSA 3ME8A 2FNOA 2P0GA 3DXBA 5JWOB 3MNGA 2YNXA 2B5EA 14GSA 2B5XA 5G5EA 1SL1B 1IYHA 2NDOA 4BWQA 4LMWA 4TR4A 3R2QA 4IJ3A 2LEGA 2VM2A 2V32A 2YPMA 5G5FA 18GSA 1TRUA 2JU5A 4X43A 1A2MA 4RQXA 2C0GA 2DJ2A 1K0AA 1TRVA 4DEJA 1OKTA 4ZBDA 3TJJA 1VF2A 4HU9A 2WRTA 5EL8A 1OKDA 1MEKA 1TXXA 4ZL9A 3F6DA 2O85A 2WZ9A 1Z7RA 1EZKA 1R7HA 3QFAC 1XOAA 4EDZA 4Q5FA 3QCPA 1H75A 5JCGA 3HZ8A 3U6VA 2DC5A 4KSOA 4TVEA 2CA8A 5FT3A 2L5LA 4TR3A 5D93A 4EO3A 1WE0A 2D2ZA 1MD3A 1BQ7A 1ML6A 3O6TA 2OA7A 3FZ4A 5E4WA 4AF2A 4MF5A 3LORA 1QGVA 1VF4A 4KCAA 4ZBBA 4AGSA 5IIZA 2CVBA 4XS4A 3C8EA 2FA8A 2MMZA 3F3QA 1SL0B 1FG4A 1K0MA 1C72A 2B5YA 4V2NA 5A5KA 2ON7A 1A2JA 4YQVA 1TKDB 4BPYA 2MBSA 1K3LA 2KOKA 5FWGA 3GMFA 1ERWA 5COHA 3LYPA 4PQHA 4XTSA 4MH3A 2DJ0A 1WJKA 2YJHA 1LU4A 4O92A 4GRFA 1X5EA 3GSTA 3GN3A 2H1GA 2YZHA 1Y6EA 3QAGA 4F9ZA 4CHSA 1GSYA 1OE8A 4GXZA 5IPHA 1KTEA 2R6KA 3GRXA 2VO4A 3CSJA 2H6YA 1SJZA 1DUGA 5HFKA 5GSTA 3D0ZA 4IGJA 4OWYA 1GWCA 2KP1A 5CRDA 3W8SA 3WYWA 2VM1A 3NZNA 2GQLA 3P90A 4KH7A 1EEJA 4EC0A 2FWEA 2LNSA 5CAXA 2K6VA 2NTOA 3HHVA 2RUFA 3KMNA 1PN9A 22GSA 4BA7A 3UVHA 1V57A 5G2ZA 3M9JA 1HYUA 2C80A 4MZBA 1K0DA 1YEXA 2GT6A 5A4UA 2H76A 4AJ7A 2DLXA 3GX8A 3KP9A 5DAKB 5ECSA 1O6JA 2HE3A 2K8SA 2OACA 3DYRA 4I6XA 2I9HA 3FR3A 1YZXA 1AC1A 2IMEA 3U5RE 4POKA 5F06A 1CQHA 2PU9C 2R4VA 1TRSA 4L5OA 4DSRA 5IQYA 2LJAA 3GHAA 1M0UA 2H74A 3F63A 2H6ZA 4MZCA 1AUCA 1TK0B 4HEA2 3EU4A 1O7UA 2C3TA 3APOA 4ZILA 2VLTA 2FWHA 4IHUA 2HZFA 1PD21 3BCIA 4K7OA 3QMXA 4V1Ap 1EP7A 1VGLA 3TOUA 3IRAA 4L8EA 1T7PB 2GSRA 9GSSA 5ENUA 2QC7A 4BWSA 2CX4A 3FZ9A 6GSSA 2V41A 1M2BA 4XRDA 4GSTA 2N5AA 3ERGA 3P7XA 1B8XA 2JSZA 1R26A 4KDYA 4Z7XA 1GNEA 3O76A 4I8BA 2NVLA 3L9UA 1NHOA 2VCQA 2HNLA 2CVKA 3FHKA 1FB6A 1OYJA 1SKSB 3ZMKA 1YDKA 1AXDA 4MF7A 1I9DA 2XBQA 3CYNA 5F07A 2ZUPA 3CSHA 4DVCA 1SENA 5ELGA 1OC9B 1TOFA 1CQGA 1F9MA 4ZIJA 2GZYA 3FW2A 1U6TA 2WCIA 1HD2A 2VL2A 1K0BA 1TW9A 2E7PA 2L6DA 4E8EA 1X9SB 3IV4A 4OD7A 1PX7A 1R4WA 5IMFA 3EURA 1OC3A 4HS1A 4D73A 2B1LA 4GQCA 1XW6A 2YWOA 4XS1A 3KD0A 4OMVA 1A0RP 1WIKA 2LS5A 5HR2A 1XWKA 3KIJA 3H93A 5JWRB 3IBHA 1XFLA 3VWXA 3OR5A 3GH9A 3ME7A 1JZRA 1PL1A 1O8WA 4PXOA 4F2IA 5IMZA 3TKSE 2FCHA 3WD6A 3D5JA 1G0TA 3RHCA 2FY6A 4JEDA 1R5AA 5HR1A 2C8UA 4O32A 2VLUA 1UC7A 1V2AA 3I69A 3ZFBA 3SWLA 3TRXA 2PVOC 3LWAA 2EIOA 2I81A 4QL7A 1XVQA 1SL2B 3F3RA 1GSEA 3GKKA 1XW9A 2N5FA 1ST9A 1KNGA 4HZ2A 1EOHA 2LKUA 4K2DA 1B9YC 4NWYA 5B6NA 4F0CA 3M1GA 1JLWA 2HT9A 1XWBA 5HQPA 3LQ7A 1F2EA 3DGQA 5F8BA 2M46A 3NIVA 4HJ2A 3UARA 2IFQA 3TGZA 4KDXA 4XRAA 1BAYA 3VLNA 4KA0A 3P8WA 4NHZA 3H8QA 4KE3A 4HOJA 4PNFA 3QDNA 3I6AA 3RDWA 4HUAA 1GSUA 2NPBA 2HZEB 1SKRB 3A3TA 2HRNA 3Q18A 1B4PA 1RQMA 3KJYA 3GSSA 1J0FA 11GSA 3VPTA 1ZMAA 3UIWA 2PUKC 4PGTA 5EY6A 2LJRA 1M9BA 4FIWA 2I1UA 3VWWA 5HFGA 3HY2A 5ECQB 2AAWA 2OBIA 2DBCA 1B48A 3L9VA 1GL8A 2DJ1A 3JCML 2FGXA 2JADA 2CZ3A 4RQRA 3PR8A 4N10A 2PGTA 3F0IA 5DQYA 3DWVA 2VIMA 3KXOA 3GTUA 3CRTA 5KN3A 1F6MC 2FD3A 3CSIA 1EV9A 3IK9A 3TKSA 4WXTA 1M2DA 1NM3A 2VL3A 3TRPA 2F51A 1EGOA 3HVVA 2H71A 5ECHB 1SD9A 3I9V2 1EWXA 2F9SA 3ZVJA 2DIYA 5CNWA 1IYIA 3C73A 3CBUA 3GNJA 3A2WA 3TDGA 1A8LA 3WT2A 5B7CA 1GUMA 5CP1A 2C0EA 3BBYA 4L5LA 1WP0A 4KW6A 2MMOA 5E59A 3IAM2 1T4YA 5EPFA 4TXOB 4NPBA 2OBKA 3IDVA 2JACA 4BL7A 2IPAA 4G2EA 4OFMA 2H6XA 1JLVA 3L78A 5G1KA 3VI7A 1ACVA 3C7MA 4JBBA 2AV4A 2K18A 4EE0A 3IAS2 2MMAA 2ON5A 3GKNA 5IMVA 3MSZA 2CZ2A 2GZPA 2FHEA 2GT5A 2H75A 4IP1A 3LGCA 4MZWA 4ISDA 1F3AA 1JFUA 1A2LA 3FYGA 1MD4A 4IQAA 3KGKA 4MMMA 3IHQA 2LNTA 2JZRA 3C71A 4MH2A 4POBA 2GQMA 1B4QA 1VF3A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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