4QL7A

Crystal structure of c-terminus truncated alkylhydroperoxide reductase subunit c (ahpc1-172) from e. coli
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
166
structure length
166
Chain Sequence
MSLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEITEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYAVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVASHPGEVC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Key roles of the Escherichia coli AhpC C-terminus in assembly and catalysis of alkylhydroperoxide reductase, an enzyme essential for the alleviation of oxidative stress
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
molecule keywords Alkylhydroperoxide Reductase subunit C
total genus 44
structure length 166
sequence length 166
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2014-06-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ql7A00
4KDUA 5J4UA 3ZITA 1BQ7A 1YF1A 1R26A 1ON4A 1NHYA 2R2JA 3G7JA 4F82A 4EF0A 4RI7A 3HJOA 4AJ7A 2MMZA 5ECOB 2XHFA 3QD9A 2AB6A 4JBBA 5LD0A 4LL4B 1JLVA 4NV2A 1T1VA 2TRCP 4J2FA 5DALA 4PUFC 1GTAA 1BEDA 2NVLA 1TJDA 5JCUA 4PQHA 1SYXA 5D8IA 2VLVA 3CRTA 1A2LA 3UVHA 3IAS2 4N10A 2HLSA 5C00A 1S3CA 2FA4A 2IMEA 5ELGA 4YQMA 1VGLA 5J9CA 2B3SA 2IJYA 4GTUA 1SD9A 1A8LA 3C1SA 3GMFA 2FWFA 3CMIA 2XPEA 4OWYA 5J9BA 1Z7PA 1MTCA 2BMXA 3QCPA 1URMA 4KW6A 4V1Ap 3APSA 1EOGA 2ZUPA 1SKSB 1TK8B 4EO3A 4ZXGA 1XPVA 2VL9A 2RUEA 5AGYA 1PA3A 4GLTA 3UIWA 1GRXA 2HNLA 1F6MC 2VLTA 5B7CA 1VF1A 4EXJA 3DVWA 5B8BA 3QDNA 2WDUA 2YZHA 1A23A 2YZUA 1OVNA 5HFGA 5H5RA 5COHA 22GSA 2V41A 3HXSA 1GSFA 2WCIA 2E2GA 1MD4A 4ZBDA 3QAGA 4Q5NA 5CRWA 3IR4A 3ZZXA 3HZ8A 2GT6A 3ME8A 4PNFA 2B1KA 4ACSA 2C3QA 4MPGA 2H66A 1YKCA 3KTLA 5IMCA 1ZYEA 2DJKA 1WJKA 3HD5A 1ST9A 1THXA 2O85A 5JWRB 2H70A 4GQFA 4KSMA 3WT2A 1B4QA 1GTIA 3L9SA 3D4TA 3LORA 5A4WA 3UJ1A 4DSSA 4K8MA 3KGKA 3VPQA 4ULXA 3UBLA 3ZRDA 2LJAA 2MMNA 4ZBAA 2FD3A 1X0RA 2K18A 3ZFLA 3TKSA 1A24A 3GH9A 2H73A 3DYRA 5DAKA 3ISOA 4WBRD 4XRDA 5ECMB 2FWHA 3C71A 3U6VA 2IPAA 2OADA 2NBSA 1FHEA 3EU4A 5DJLA 1E6BA 3TJJA 1O81A 2CQ9A 2ALBA 3Q18A 3IBHA 5IMFA 3LWAA 1PMTA 1MDIA 5GZZB 4J56E 8GSSA 2C3NA 2GZZA 3D4MA 4WF5A 3ZIJA 4PUAA 2JL4A 2DMLA 3KIJA 2IFQA 2CAIA 1DUGA 5D9WA 2MMOA 2GQMA 1SKRB 4DVCA 4GQCA 2FCHA 3H8QA 1XIYA 1SL0B 5IOWA 2VL2A 1RW1A 1YZXA 2HRFA 4ZBBA 3D6IA 1VF2A 4NHZA 5IPGA 1W89A 4IELA 1PN9A 4DSSB 3DEXA 3DD3A 3QFBC 1VF4A 1HNBA 4OCEA 4EKZA 2FY6A 3R2QA 4HZ2A 2AYTA 1TTZA 2PWJA 5DAKB 3BCKA 3ZTLA 12GSA 2K6VA 5B8AA 2LUSA 4G10A 5ECHB 3HJPA 4D73A 4GSSA 1FVKA 5EVOA 1FW1A 1M2BA 1B4PA 1OKDA 1MDKA 5C04A 1XBSA 2OBIA 5KN0A 2GSQA 2MBTA 2CX4A 4FYBA 5CRGA 1JZWA 3GKNA 1GLQA 4G19A 1JHBA 1KTEA 3TB2A 2L4QA 3TJKA 2MMAA 3A2XA 4KUNA 2HZEA 2NPBA 5D9XA 4RQXA 3DRNA 5D9VA 4BA7A 2F3MA 2N5BA 1GUHA 4IP1A 2CV4A 3APOA 2EC4A 2WB9A 3P8WA 1HQOA 4EVMA 1G7EA 3IK9A 2F9SA 2VCWA 1HNAA 1K3YA 5IO2A 2JZTA 2PN8A 5FT3A 5IQYA 5IMVA 3UOMA 2DIYA 1AIUA 3TJGA 4X1UA 2FNOA 4FYCA 5A5KA 1NSWA 5GAPD 1SL1B 1M7TA 2V1MA 1TRVA 2DMMA 1EWXA 3W8JA 1BYEA 5DDLA 4TRXA 5J3RA 2BTOT 1FVJA 3GV1A 4POKA 2L6CA 1RQMA 2L4CA 4WF4A 4CDOA 4EDZA 1PRXA 3UAPA 2I3YA 1GTUA 2L5OA 1FG4A 1Y6EA 4MJCA 1ILOA 4WR5A 3EVIA 1SD8A 1DSBA 1XVWA 1AC1A 4WEYA 4OCFA 2TRXA 4MF7A 2HT9A 1K0DA 4GSNA 2YV9A 2C0EA 2MYGA 5F06A 3IXRA 2N5FA 1EP8A 3HKRA 1DBYA 3KTBA 3H79A 1IYIA 2RLIA 5HFKA 4ZL8A 2AUVA 4GSTA 2IN3A 4EDYA 1GNEA 4F03A 5ENUA 1XW9A 1T4YA 4KAEA 4X43A 1GUKA 1Z6NA 3HCZA 3FKFA 2GLRA 4F9ZA 1ZYQB 3FR3A 11GSA 2E2MA 1TRUA 3EWLA 3CTGA 4NXIA 3HYPA 3FR6A 2LEGA 3F6FA 1OC3A 2I4AA 3A2VA 2LRTA 2KLXA 3FEUA 2H6ZA 2LTKA 2QSIA 4KCAA 4N11A 3GNJA 4I97A 3QR6A 1JZOA 3RBTA 4MA9A 1O8WA 4RUVA 4K7NA 4QL7A 3EC3A 4TOPA 1R7HA 2FHEA 2JSZA 1SJZA 4K0NA 5HQPA 2VCXA 1ERWA 1GSSA 1J0FA 2C1YA 2I9HA 3TRXA 4ECJA 4KDXA 4PQIA 1M0UA 4KA0A 2TIRA 5D73A 4IQ1A 2LJRA 1R5PA 2PUKC 2XBIA 2FWGA 2CAQA 1OKTA 3GX8A 4YQVA 1R4WA 1UA5A 3JCML 1YF0A 2H76A 2F8AA 4V2MA 2FA8A 2I81A 5FHIA 4I8BA 1N8JA 4TVEA 4YQUA 1HD2A 3GX0A 3FYGA 1TRSA 5CYYA 2LQOA 3W6GA 3Q6OA 5EY6A 4ZB9A 1TKDB 1ZL9A 5ECSA 2CZ3A 4KGIA 4JE1A 3KP9A 3C7MA 5GSTA 2H1DA 4E8HA 2KP2A 5CO3A 5ECRB 2EIQA 2DJ2A 1T7PB 4V2LA 3D22A 3O3TA 1A8YA 1Z9HA 2H30A 1GSUA 1PSQA 4LMVA 2V6KA 3F3QA 2R4VA 1TK5B 3I43A 3L9UA 4L0UA 1BG5A 1OYJA 5DCHA 2D2ZA 3RPNA 1NHOA 3IAM2 4WETA 4MABA 4MH2A 3LYPA 3I6AA 3GFKA 1SENA 4TR3A 1S3DA 1X5EA 3FY7A 3UBKA 3E0UA 1EGOA 4OD7A 2H72A 1ZCPA 3TKPA 3N9JA 2GSSA 2O87A 2H0IA 4JZQA 5G5FA 2EIOA 3FZAA 4MH3A 4ECIA 4LL1B 4ECCA 2HZFA 1AQWA 2PVQA 1M2DA 3W8SA 3CSJA 4KB3A 3EMXA 10GSA 2B5YA 1AUCA 2HI7A 2YWIA 5HR0A 1TU8A 2R6KA 1SK2A 4ZB6A 1NW2A 2X8GA 2VO4A 3GUSA 1K0NA 2WFCA 2GT5A 3FHKA 1QMVA 1Z7RA 1X9SB 3UVTA 1UC7A 2V32A 3Q74A 3RHBA 2DJ0A 3L4NA 4MF6A 3FZ4A 1SJIA 1JLWA 3KMOA 1TU7A 2VCZA 1EEMA 4N0ZA 2HSHA 2YN1A 3LSZA 4DSQA 3TKSC 2QGVA 4TXVA 2REMA 2GQLA 1YQ1A 4ECBA 2O8VB 1PD21 3VI5A 1M2AA 3VURA 2K8SA 1AAZA 2GSRA 4NHWA 1EV9A 3IDVA 1Q4JA 2J23A 2VLUA 2EIRA 3MAKA 4TKYA 2P5QA 3H1NA 2M80A 4YAVA 2X8CA 3FZ5A 1WPIA 4O7HA 2R5GA 3F6DA 3MWHA 1AQVA 2VD1A 2YJHA 1RK4A 3UMAA 1NM3A 6GSSA 5KN1A 2PERA 2IMIA 4TXOB 3EYTA 1XXUA 1K0BA 1AXDA 4L5LA 3G7YA 1CQHA 4JEDA 2GGTA 2GS3A 5G31A 3ZVJA 5E59A 2M72A 5IMAA 1ZMAA 3IE3A 5B6NA 5B6MA 17GSA 3FRCA 5ECIB 4XS6A 1O85A 2GVPA 2WRTA 1MDJA 3F63A 4OFTA 2AJQB 2GZPA 5ID2B 4NWYA 1OC8A 2GQKA 3GSSA 4BVXA 1CQGA 3ED3A 4XS4A 2H0HA 1K0OA 1F37A 3VI7A 3EINA 5ECNB 1IYHA 2WS2A 1GSDA 2H8LA 4V2NA 2LRCA 1M9BA 1GWCA 3PR8A 1G7OA 4TR1B 3CTFA 3CSHA 3WT1A 4Q5QA 3H93A 5ABRA 1YDKA 1OAZA 3RPPA 1JZRA 5ECLB 5HFIA 1QXHA 2LKUA 3CXGA 1TDIA 4V1Ag 1EP7A 2RUFA 2WGRA 2IMFA 4FIWA 2PGTA 2A2RA 1X5CA 3A5WA 3O6TA 1ABAA 3ERWA 3DKSA 5D9TA 5E4WA 1MEKA 2R37A 2C0DA 3UEMA 4OMVA 1V2AA 2NDOA 1N2AA 5CNWA 1B48A 1LBKA 2JU5A 1M99A 1H4OA 5AIVA 3IV4A 5D93A 4XS4B 3D5JA 1XWBA 4BWQA 2CVKA 3KXOA 4K1FA 1SKWB 4JR6A 4FH8A 6GSTA 4NV5A 1FO5A 4L0WA 5DJMA 4DEJA 2B6MA 2WULA 2VAFA 2AV4A 3LG6A 6GSUA 2F51A 4CHSA 4HI7A 3TJBA 4IVFA 3TGZA 4MZWA 3DXBA 1BJXA 1WE0A 5DQSA 3QAWA 4HU7A 4WKWA 3NIVA 4IS0A 3J7Yk 1PKWA 7GSSA 1PL1A 3QPMA 5KN3A 4IN0A 1BX9A 5IPHA 2YWNA 4O5RA 3E9JB 1BAYA 3WGXA 1AW9A 1WRYA 1VRSD 4HEA2 2YV7A 4HOJA 5G5EA 3BBYA 2OE3A 2VL3A 1OC9B 5G30A 4EC0A 3EURA 3VWVA 1U88A 5IOXA 3TDGA 5JCGA 3GIXA 2M46A 4JR4A 3IHQA 1GSQA 3GH6A 4ISDA 3ERFA 3BD2A 3TRQA 3RHCA 5ECKB 4HJ2A 3DIEA 4F0BA 3F4RA 4NAXA 1K3LA 2FWEA 2LNSA 2L59A 1X9WB 4N30A 2C4JA 2VM2A 2HE3A 3DVXA 3CYNA 5IO0A 3I9V2 5AIXA 1V58A 3J7Yb 3ZMKA 1SL2B 3TKSE 5GAND 5ELAA 3BCIA 5F05A 5IMZA 3G7IA 3FR9A 5CRHA 4PQ1A 5IMDA 1PKZA 6GSVA 2VCVA 2ES7A 1HNCA 4GRFA 1PGTA 4ZL7A 3RDWA 2JACA 5EPFA 4YAPA 5KEJA 2VM1A 2X64A 2OJLA 4K2DA 3F3RA 1PX7A 4OFMA 2PPTA 3TKRA 1J9BA 2PMTA 5F8BA 3FZ9A 3S9FA 4OO5A 4WR4A 1UN2A 3KCMA 1XWAA 4ML1A 4BL7A 4MPFA 1F9MA 2Z9SA 18GSA 3GRXA 3LXZA 3C73A 1VF3A 2GSTA 3LJRA 3ZMLA 2XPDA 1O7UA 3ZIVA 1B9YC 3G9BA 3M0FA 5ECQB 2LQQA 3VWWA 2B5EA 4ID0A 1SYRA 1B9XC 4DSRA 4F2IA 4Z7XA 1V40A 1GTBA 1GUMA 1W4VA 2ON5A 3HA9A 5H5SA 4MCUA 1G6WA 4POBA 2CT6A 14GSA 2HYXA 1U87A 3EE2A 2J9HA 3DWVA 2H75A 4PURA 4I5QA 2KHPA 4EE0A 3LEFA 2BJXA 3IK7A 4I6XA 1YJ6A 4BWSA 4EUYA 5EL8A 1Q98A 2KP1A 4Q5FA 1ZGNA 1TW9A 3KP8A 6GSXA 9GSSA 3GKXA 1QFNA 4AJ8A 2OKAA 4MZCA 1UVZA 4LMWA 2V6OA 4MLYA 3A2WA 4IHUA 3PINA 2IMKA 4KSOA 5G2ZA 4ZIJA 1C72A 3KM6A 1JFUA 3L78A 5CREA 3M9KA 1DE1A 4GWRA 4IJ3A 1WOUA 3GL5A 2O7KA 1O8XA 1GL8A 5J41A 2AAWA 2DC5A 2C80A 3KMNA 3GSTA 1J08A 2DSAA 3KD0A 3UARA 2P0GA 4HZ4A 2P5RA 1XWGA 4MK3A 2DJJA 3HVVA 2LNTA 4POMA 4Q5RA 3TRPA 4WXTA 1A0RP 3KH9A 3L9VA 5A4UA 2GZYA 3TOTA 1XOBA 2H1GA 3GYKA 3ZREA 4PX1A 1ZZYA 4QQ7A 1K0MA 1G6YA 2KUCA 2C3TA 3LGCA 5LCZA 2HSYA 3MNGA 4PGTA 2PVOC 4XIHA 3GKMA 2N5AA 4XS1A 4YH2A 1V57A 2OA7A 1K0AA 2RM6A 1TOFA 2JZRA 2DIZA 2CVBA 4TXOA 1Z3EA 2LJKA 1KNGA 2HXKA 5F07A 3Q19A 3RAZA 1PX6A 4XRAA 6GSYA 1Y25A 2HFDA 1QQ2A 3HZ4A 4IJIA 1XOAA 2FLSA 1QUWA 5JCWA 1A2JA 3QAVA 4TN8A 2L57A 1FOVA 1WP0A 1ERTA 2YWMA 5CRDA 4KE3A 1GULA 4L5OA 2XC2A 5ID2A 2PBJA 2IMDA 1I9DA 3GKKA 1KEBA 4FO5A 1F3AA 1H75A 2WJUA 3FK8A 4PNGA 5DALB 4AJ6A 3QOUA 1EV4A 5AN1A 1ML6A 3M3MA 3P2AA 3IPZA 3VK9A 3IC4A 3HVXA 4IW9A 4E8EA 2CZ2A 3VPTA 2LV3A 1V9WA 2F8FA 2YJ7A 4KCEA 5L71A 1SK1A 2H1BA 4MJEA 2MBSA 4TR1A 3C1RA 4RI6A 5HR1A 4FYUA 2VL2C 4H86A 3HDCA 3QMXA 3F9UA 2ZNMA 1M9AA 5D96A 1GNWA 2V2GA 1G0TA 1K3OA 5LNKe 3GL3A 5IIZA 4HQZA 3NZNA 13GSA 2X99A 3LYKA 5JWOB 3TJFA 1YKAA 3IRAA 4ILFA 3KEBA 4EL1A 2JADA 2YP6A 4N0VA 1EGRA 1K0CA 4MZBA 3KZQA 3GA4A 4MDCA 3GHAA 1B8XA 3BOAA 1FB0A 1XWCA 3M9JA 1SU9A 1HYUA 1T00A 3TKQA 3HHVA 3PGTA 4MJAA 3NOFA 1EZKA 1GSEA 3MSZA 4KNDA 1TI1A 2DJ1A 3CSIA 2VOCA 4X0XA 2VD0A 3P90A 1SK0A 1YY7A 4NMUA 2YPMA 4L8EA 1O73A 1XW6A 5FWGA 5CAXA 4TW5A 2QC7A 6GSWA 3WGDA 1JZDA 5H5QA 4ZL9A 2K8VA 3ME7A 1QK8A 4ML6A 4P3YB 1SJ6A 5DVBA 1TXXA 2B1LA 4IKHA 2L6DA 3HVSA 2R3XA 1Z5YE 1OC9A 1O6JA 4JU5A 2KOKA 2LRNA 3U5RE 1T4ZA 3GURA 4IP6A 2IWTA 4MJBA 3EU3A 2VUPA 4MMMA 3N5OA 4CW9A 4GCIA 2JZSA 3H4KA 3D21A 3E3EA 3P7XA 1KBNA 5JWQB 19GSA 4G2EA 2NTOA 2H1AA 1R5AA 5G1LA 1GLPA 2YOIA 3EMPA 2YWOA 2IFQB 4K7IA 4POLA 1XVQA 2VCTA 1F3BA 1WWJA 2O89A 1U3IA 3ERGA 3APQA 4PXOA 2GDRA 1WIKA 3VLNA 3GN3A 4KDYA 1EOHA 1ERUA 4NPBA 1FB6A 4HJMA 4IGJA 2ZCTA 3SBCA 2OE1A 3L0HA 1TRWA 4GXZA 3ZVJD 2B7JA 3F0IA 1ZOFA 2G0FA 3C8EA 2C8UA 4HS1A 2LSTA 1FAAA 2DJ3A 2X8HA 5IM9A 1T3BA 4XCSA 3PH9A 1WMJA 4TR0A 1TI3A 1YEPA 3AY8A 5HR3A 5DCGA 5HR2A 3DGQA 3ZFBA 4I2TA 2H01A 2H19A 3VFIA 4TR4A 2XBQA 2DLXA 4D73B 3I69A 2A2SA 2RIIA 2H6YA 2RM5A 1X5DA 2C0FA 3TUEA 1ERVA 5AISA 3OR5A 2AHEA 2FGXA 2OE0A 3K8NA 4ZB8A 3LQ7A 3D0ZA 3GTUA 2DBCA 3A3TA 3US3A 1S3AA 3M1GA 1A2MA 2E0QA 1AQXA 4KH7A 4O92A 2WZ9A 4XHMA 4WBJA 2OACA 3F4SA 4K9ZA 4BVYA 4K6XA 1MD3A 3QFAC 4K7OA 2H0GA 1XWKA 5DBQA 2HZEB 4OFNA 4HUAA 4KX4A 3ZL5A 1DE2A 4O32A 3LXTA 3WD6A 2QKEA 1THOA 4HU9A 3DMLA 2YCDA 3HY2A 5ECPB 2CA8A 1XFLA 1ACVA 3UL3A 3TOUA 1GP1A 2H71A 1XCCA 16GSA 1X9MB 1YEXA 2L5LA 3ZLPA 2H74A 4MF5A 3WGEA 4LA1A 2HRNA 2E7PA 2C0GA 4J57E 4HDEA 3F8UA 3FW2A 2GTUA 2G2QA 1U6TA 1PL2A 1Z6MA 3TCOA 5A4VA 5DQYA 4QL9A 1GH2A 4XTSA 3GTUB 2YANA 1I5GA 1LJRA 5CP1A 4F0CA 5J5NA 4IQAA 1TP9A 4JRRA 2OBKA 5G1KA 4I2UA 4BPYA 1OE7A 3ZYWA 2K9FA 3MDKA 2IL3A 4AGSA 5GSSA 2I1UA 1F2EA 2VCQA 2ON7A 3V1WA 4GF0A 1EEJA 1A0FA 1XZOA 1QGVA 3SWLA 4IBPA 3WYWA 4G9HA 3IA1A 3O76A 2CX3A 5KN2A 4K0GA 1T8EB 3LFLA 3M8NA 1USBA 1TK0B 1LU4A 2B7KA 2IIYA 4LLRA 3CBUA 1U3AA 4AF2A 2VIMA 1XW5A 1GSYA 2JSYA 2P31A 3VWUA 3IOSA 2A4VA 2YNXA 3CRUA 2B5XA 3HJMA 3F4TA 3BJ5A 3KH7A 3VWXA 5F0GA 4RQRA 4MP4A 1E2YA 1PQNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite