4RQRA

Crystal structure of human glutaredoxin with mesna
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
GTAQEFVNCKIQPGKVVVFIKPTCPYCRRAQEILSQLPIKQGLLEFVDITATNHTNEIQDYLQQLTGARTVPRVFIGKDCIGGCSDLVSLQQSGELLTRLKQIGALQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Cysteine Specific Targeting of the Functionally Distinct Peroxiredoxin and Glutaredoxin Proteins by the Investigational Disulfide BNP7787.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutaredoxin-1
molecule tags Electron transport
source organism Homo sapiens
total genus 37
structure length 107
sequence length 107
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-11-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4rqrA00
1MDIA 3LJRA 5DQYA 1VGLA 2DIYA 3ISOA 2ALBA 5A4UA 2LV3A 4WKWA 3GH9A 3GFKA 4EL1A 1BX9A 2REMA 2C8UA 4KH7A 2K9FA 3FR3A 3Q74A 2WDUA 4Q5QA 5A4VA 4XS1A 2FWFA 1ABAA 3PH9A 1TRVA 2FWEA 4IP1A 1WRYA 1TU7A 1JFUA 3QR6A 4JE1A 2XPEA 2B3SA 2J9HA 4KDYA 1FVJA 1LJRA 2XC2A 1VF1A 5ID2A 4IVFA 2ON5A 4MF5A 2YNXA 3FZ9A 1FVKA 2WULA 5CNWA 3A3TA 2GQMA 4YAPA 2TIRA 4ZL7A 2ZNMA 1FG4A 1ON4A 2VUPA 2QSIA 2YJHA 4DEJA 1AAZA 2FA4A 2QKEA 5ECQB 4EXJA 3F6FA 5IMVA 4LLRA 5D9XA 4JR6A 1K0OA 3RBTA 2JZRA 5DDLA 2V1MA 2LNSA 3ZVJA 3H93A 3L9SA 3J7Yk 2MMZA 3KTBA 1AQVA 2YANA 1KEBA 1GP1A 4TR3A 1CQGA 2GGTA 1GWCA 3D0ZA 2V2GA 3L0HA 4IKHA 3KZQA 1O7UA 4NV5A 3TKRA 1HNBA 3GIXA 5AIVA 2JU5A 2NVLA 1C72A 5JWRB 4K7IA 2AV4A 1OC9B 1PL2A 1XW6A 1U88A 2FCHA 4AF2A 4OFNA 4IQ1A 3UL3A 4CW9A 2MYGA 3MWHA 1GRXA 3U6VA 1UA5A 2IWTA 1T7PB 1FAAA 5J9CA 3LG6A 5HFIA 1V40A 4ACSA 1M2BA 5E4WA 3TOUA 3P7XA 3IRAA 3TKSA 3OR5A 1GNWA 1GTIA 2H74A 1HD2A 1KBNA 4X1UA 1XZOA 2KUCA 4Z7XA 1ZYQB 2CZ3A 1T00A 2MBSA 5IPHA 9GSSA 4H86A 2JSZA 1OC9A 2I4AA 1OKDA 4BPYA 4K1FA 1V58A 5CO3A 1X5EA 2RM5A 2OE0A 3BCKA 3DRNA 2F9SA 2JADA 1AXDA 1ZGNA 3ZFBA 1SJIA 2N5FA 2OE1A 4KAEA 1OC3A 1X9SB 1SL0B 5IMFA 4ZIJA 5ECRB 2HSHA 2HSYA 2R4VA 2H0IA 2H75A 3NOFA 5DCGA 5GZZB 3IK7A 1I5GA 1M0UA 3ERFA 1V57A 5LNKe 2FHEA 1A2MA 2RUEA 5L71A 2H30A 2LJKA 3ZRDA 3KEBA 2I1UA 2GZPA 5A4WA 2NPBA 2LNTA 3ZFLA 2B1LA 5F06A 1SD8A 2P0GA 1PL1A 1SD9A 3ZITA 3W8SA 2L4QA 1TU8A 2H6ZA 1B9XC 1Z6MA 3F4SA 3Q18A 3H1NA 5B6NA 3W8JA 3QAVA 1KTEA 3F4TA 5CRDA 5G1LA 2FUG2 4MP4A 5ECNB 3KCMA 1GNEA 1BYEA 2H73A 4TRXA 4XS4B 4PUAA 3HD5A 1F6MC 4IJ3A 3TJBA 1FB6A 3TJFA 1EOHA 4BA7A 1XCCA 4KUNA 5DJLA 1B8XA 3D4TA 4WEYA 1FB0A 2PGTA 1TRSA 4MZBA 1Z6NA 4MZCA 5IQYA 3TGZA 4WF5A 3VWXA 3EINA 3TUEA 2H1DA 3FKFA 1AQWA 4I6XA 5IMCA 1MD4A 2VCWA 1G0TA 4ZXGA 4K7OA 4MLYA 5D9VA 1UVZA 2WGRA 1S3CA 4KCEA 4XS4A 1PMTA 3TRQA 2CT6A 1MTCA 2VOCA 4LMWA 2B5XA 3L9VA 3EE2A 2OADA 4FO5A 2H76A 1E6BA 2I81A 2PWJA 3DXBA 5EVOA 4F9ZA 3MSZA 5H5SA 3RPPA 1SL1B 5IMZA 5LD0A 2TRXA 1USBA 1XBSA 4NMUA 2H19A 4HS1A 3A2WA 5D9WA 1B4PA 4XRAA 2IMFA 3G7YA 3CXGA 4TVEA 1HNCA 3ZREA 2H70A 3VWVA 3TRPA 3L78A 4AJ7A 2LJRA 1WWJA 4GSSA 5F0GA 3VI5A 3IDVA 2HNLA 3ZL5A 3ERGA 2HYXA 3F0IA 2PMTA 1VF4A 3WGXA 4HOJA 4X0XA 16GSA 3M1GA 3TKQA 4JRRA 2OACA 4LL1B 1W89A 1B4QA 4K0NA 3TJGA 3CSHA 4XCSA 2E0QA 4MZWA 4EUYA 2VD0A 3IA1A 2VLTA 3CYNA 1G7OA 3BD2A 5GSSA 3JCML 5HQPA 2N5AA 2C0DA 4IQAA 3HZ4A 3O76A 1V98A 1XPVA 1XWBA 2IMIA 1EWXA 2FLSA 1GL8A 3VFIA 4I2UA 2H8LA 4EKZA 3GL3A 4BVYA 2OA7A 1SU9A 1SJZA 1EV4A 4MH3A 4KGIA 1OVNA 1GSUA 5G5EA 1MEKA 3FHKA 5G31A 3HDCA 8GSSA 3M9KA 1A2JA 1Z3EA 1GUKA 1GSQA 3IBHA 3TJKA 5H5RA 1TK0B 2DSAA 5CYYA 3KTLA 2B7KA 2CZ2A 1EZKA 3FK8A 4GCIA 1QMVA 4RQXA 4N0ZA 3DMLA 3M0FA 1SENA 3GKXA 1NHYA 2YV7A 5J41A 3DKSA 4I8BA 14GSA 4NHWA 4WR5A 2X8GA 4WF4A 1N8JA 2M46A 1G6WA 3UJ1A 1O85A 3GTUB 1A0RP 3GKMA 5A5KA 3Q6OA 1EP7A 4EE0A 6GSUA 4AGSA 5J3RA 3KJYA 3BOAA 1A24A 2CVBA 4N10A 2VCVA 3PR8A 2V41A 1JZWA 1ZMAA 2GT5A 2IJYA 3GKNA 4PQHA 4PQ1A 1YKAA 2OE3A 4Q5NA 5IOXA 1AW9A 1XWGA 3EU3A 4FIWA 1XW9A 1ERVA 4TXOB 3GUSA 4OCEA 3GTUA 4HQSA 2WB9A 4X43A 3F9UA 2NDOA 3A2XA 3GA4A 4G9HA 4ULXA 1ACVA 3APOA 1Y25A 4KCAA 3DWVA 2YOIA 3VLNA 4V1Ag 5GAPD 1AQXA 5HFGA 4HEA2 1TXXA 2HRNA 2LRNA 3GN3A 3F4RA 2M72A 3UVHA 1TK5B 4Q5FA 4POLA 4BVXA 2H66A 3J7Yb 4TXOA 1GSDA 2LUSA 3SWLA 1NHOA 1BAYA 2F3MA 2H1GA 5D73A 5D8IA 4GF0A 4XHMA 5ECKB 5G1KA 1R26A 1XW5A 3KP9A 3UVTA 1TJDA 1A2LA 4KSMA 5DQSA 4N0VA 2VIMA 2I9HA 6GSYA 3F3QA 4LA1A 2C80A 1ZCPA 1WPIA 3HA9A 2N5BA 3D21A 2EIRA 1EOGA 1PX6A 3BBYA 5IM9A 3QPMA 4KDXA 2Z9SA 3I6AA 1SJ6A 2H1BA 4XIHA 4YQUA 3UMAA 2C0GA 3IHQA 2WCIA 3FZ5A 3V1WA 2CV4A 1XWCA 4ML1A 5KN3A 5IO2A 1GTBA 4IN0A 2LQQA 2K6VA 5IO0A 6GSVA 4JU5A 4KB3A 1KNGA 3TKSE 4XRDA 3D5JA 4PUFC 1ST9A 2CVKA 1THXA 4HI7A 2RLIA 4L8EA 4IW9A 1GUMA 1TI1A 1IYHA 3MNGA 4IS0A 2HFDA 2GT6A 4K8MA 3GX0A 2GSRA 2LSTA 5B6MA 4E8HA 1UN2A 5AGYA 2X64A 2JSYA 2VAFA 2HXKA 1F3AA 1Z7PA 3KXOA 1SKSB 3SBCA 4ID0A 1JLWA 1B9YC 2HZEB 1K3YA 2L4CA 2ZCTA 3O6TA 1Y6EA 4MCUA 4HU7A 3KD0A 3H4KA 3IR4A 3FR9A 2O8VB 2GDRA 2KHPA 4HJ2A 2IMDA 4L0UA 6GSTA 4WBJA 5CRWA 1R5AA 3A2VA 13GSA 3GHAA 4ZL9A 2PBJA 1GH2A 4PURA 1YF1A 1TI3A 3KGKA 4PX1A 4GTUA 3A5WA 2EIOA 1TDIA 1QQ2A 4KE3A 2VL2C 3VURA 1QFNA 3ZMLA 1EEMA 3FZ4A 1X5CA 2HZEA 4MJAA 1GLPA 2GQKA 3M9JA 4EDZA 3QOUA 3C73A 2HZFA 4TN8A 4LL4B 3EU4A 2EC4A 2GZZA 1ERTA 3I9V2 3US3A 4K2DA 2CX4A 4N30A 2DIZA 3C7MA 3C1SA 2LEGA 2P5QA 3HJOA 2FA8A 2GLRA 2YV9A 2LS5A 5ECPB 2VLVA 4MJEA 3H8QA 3TDGA 4OWYA 4MH2A 4TR1A 2R37A 4POMA 1SYRA 2DJ0A 4I97A 4DSQA 4JBBA 3UARA 4XS6A 5C00A 3L4NA 1K0BA 2RIIA 3GURA 1GSFA 1BJXA 1DE2A 1YKCA 2LTKA 3ZZXA 1K3LA 3KH7A 1ERWA 4HU9A 4TOPA 4MMMA 1NW2A 1TTZA 1RQMA 1Q4JA 5C04A 5ECOB 4CDOA 3EURA 1ERUA 2DJ2A 1U87A 3APSA 3HVVA 2OJLA 3E3EA 2X99A 4IGJA 2A2SA 4N11A 1SK2A 2C1YA 1FOVA 4NPBA 4CHSA 4F03A 2K18A 5ECHB 2B5YA 1GUHA 4F2IA 2TRCP 5AISA 3C8EA 1U6TA 20GSA 1VF2A 1J9BA 3W6GA 2O7KA 3LFLA 1GSYA 2B6MA 3S9FA 3N5OA 1T1VA 2PU9C 2CAQA 4F0CA 2BJXA 2G2QA 1M99A 3D22A 3P8WA 2VCTA 4L0WA 3VPQA 1SKRB 4WBRD 2XBQA 2RM6A 2DC5A 1ZL9A 1K0NA 18GSA 5B8BA 2CAIA 2HI7A 4EF0A 4WETA 5DCHA 3E0UA 3TCOA 4PQIA 2E2MA 3C71A 2C4JA 4POKA 4E8EA 3ERWA 3DEXA 1DSBA 1W4VA 1N2AA 4K7NA 4ECJA 3R2QA 12GSA 4ZBDA 5F05A 4NHZA 3CRUA 1T3BA 1NM3A 1G7EA 4IP6A 1RK4A 2JACA 2IMEA 3NZNA 1WJKA 3EC3A 1XOAA 3G9BA 1TOFA 4D73B 4Q5RA 5CP1A 4WXTA 2HRFA 2HT9A 5IOWA 5D96A 3M3MA 5ELGA 5DJMA 2EIQA 3EWLA 1MDKA 2YN1A 4RUVA 4MDCA 3GKKA 3VI7A 1PQNA 2VCZA 5COHA 1GSSA 1SL2B 3TJJA 5CAXA 4TW5A 5JCWA 3QDNA 2E7PA 3CMIA 3MAKA 4AJ6A 4OMVA 2FWGA 4K9ZA 3GX8A 5CREA 5IMAA 2CA8A 3QFBC 1V2AA 3VK9A 2A4VA 4G2EA 3VWUA 1R4WA 1DUGA 3RHBA 1TRWA 2B5EA 1R7HA 3RDWA 1K0AA 6GSXA 1GLQA 1M9BA 3IK9A 1U3IA 1PN9A 3BCIA 2G0FA 4F82A 4P3YB 4D73A 3ED3A 4J57E 2MMOA 1PSQA 1YY7A 5ENUA 1JZRA 2YWNA 1J0FA 2CX3A 4LMVA 2GS3A 3AY8A 1ZOFA 1SKWB 1F9MA 3HZ8A 2L6DA 5DBQA 2XBIA 4PNFA 3L9UA 1GTAA 4EDYA 1TRUA 3NIVA 4HDEA 4HZ2A 2H6XA 3IOSA 2VL3A 2VL2A 5AN1A 3KH9A 3GSTA 3HJMA 1U3AA 2RUFA 1MD3A 1VF3A 3TB2A 3ZTLA 1JZOA 5KEJA 2NBSA 1SK0A 5DALA 3F8UA 2M80A 3KM6A 5DVBA 4OO5A 4GLTA 5F07A 3IV4A 4ZBAA 5G5FA 1M2DA 4OFTA 3FYGA 1EEJA 1OE7A 1WIKA 4MJCA 1E2YA 4JR4A 3P90A 1YF0A 4RQRA 3WD6A 4BWQA 5G2ZA 4KSOA 3HCZA 4MPGA 2O85A 3WYWA 4ZL8A 1OAZA 2AJQB 1FW1A 1EGRA 1H75A 3ZVJD 5AIXA 2YWOA 3HHVA 3QAWA 4MA9A 2C3QA 3N9JA 5ECLB 2XHFA 5CRGA 2QGVA 3KMOA 2FGXA 2J23A 1B48A 2DMMA 1EP8A 2LJAA 4FYCA 2LQOA 3GMFA 4PXOA 1BEDA 4FYBA 2X8CA 4OO4A 5H5QA 1YQ1A 2IFQB 2BMXA 2WS2A 2K8VA 3TOTA 4O5RA 3GH6A 2JL4A 4YQVA 4ECIA 2MBTA 3FR6A 3QCPA 4L5OA 5ECIB 1S3AA 4GRFA 1XOBA 2D2ZA 1QGVA 4IBPA 1K0DA 5KN0A 3RAZA 2H0GA 4BL7A 5D9TA 4G19A 2VCQA 1GULA 1RW1A 5JWQB 2KP2A 2R3XA 1XWKA 4J2FA 3ME8A 1OKTA 2ON7A 2H0HA 3CBUA 5B7CA 1OC8A 1DE1A 1JZDA 2FD3A 2IFQA 3G7IA 1R5PA 1XVQA 6GSSA 2I3YA 1SYXA 2O87A 1XIYA 1PKWA 5D93A 2DJKA 2WZ9A 4OFMA 1O81A 4NWYA 3HYPA 4MPFA 3I69A 3WGEA 2KLXA 1TK8B 5EY6A 5HR1A 3GV1A 2OKAA 1JHBA 2QC7A 3IC4A 4GSTA 4ZB8A 1SK1A 4V2LA 2F51A 1AC1A 3UBKA 4ISDA 5ECMB 5FHIA 2DMLA 3VPTA 5ABRA 2E2GA 2O89A 5J4UA 1S3DA 3F3RA 4ML6A 2VCXA 2YZHA 3ZIVA 4GXZA 4TKYA 3RHCA 2H6YA 5INYA 5KN1A 4YAVA 1HNAA 1VRSD 2YJ7A 3FZAA 1T4ZA 3HVSA 3H79A 4ZBBA 2HLSA 5GSTA 1K0MA 1EV9A 4TR0A 3K8NA 4NXIA 4V2MA 4KNDA 4KA0A 3HJPA 1F37A 1LBKA 4KDUA 1ZZYA 2IL3A 2PUKC 1O8XA 5G30A 4JEDA 2ZUPA 3Q19A 4EVMA 2PVOC 2DJ1A 2DLXA 1M2AA 3KMNA 4ZB6A 1WMJA 3HVXA 3WGDA 1BQ7A 19GSA 2DJ3A 3F63A 3LQ7A 2R6KA 5JWOB 1O73A 3LXTA 1O8WA 3UIWA 3QD9A 1AUCA 4TR1B 4F0BA 1TKDB 1G6YA 3GL5A 5GAND 1YJ6A 4OCFA 5HR2A 4KX4A 3I43A 1ILOA 2L5OA 3D6IA 3LYKA 1URMA 3QMXA 1J08A 2WRTA 1Z5YE 5JCGA 4ECCA 1X0RA 2K8SA 2V6KA 2PVQA 1IYIA 4V2NA 2LRTA 5IMDA 2NTOA 4HQZA 4JZQA 4POBA 4XTSA 5E59A 5DAKB 2JZSA 4EO3A 1QXHA 4AJ8A 1Q98A 4G10A 2VLUA 3F6DA 1QK8A 2DBCA 3MDKA 1WE0A 1X9WB 3TKPA 1XVWA 2C3NA 1PKZA 3ZLPA 2H72A 3GSSA 4PGTA 1A8LA 1HYUA 5IIZA 4HUAA 5KN2A 3G7JA 3CSJA 3LSZA 1GSEA 5J5NA 1PD21 1PA3A 1CQHA 1PX7A 4IJIA 5ELAA 2OBIA 3U5RE 2GZYA 2MZCA 4MF7A 3WT2A 2B7JA 3DGQA 5DAKA 1NSWA 4EC0A 5FT3A 4ZB9A 3UBLA 1HQOA 3GYKA 4RI7A 3LWAA 3PINA 3DD3A 3BJ5A 3HY2A 5HR3A 1FO5A 2MMNA 1AIUA 2MMAA 1O6JA 3QAGA 3LORA 3IAM2 4FH8A 5JCUA 3CSIA 4IELA 3APQA 3CRTA 4ECBA 4V1Ap 4MJBA 4FYUA 4I5QA 4YQMA 4L5LA 2XPDA 2AYTA 4HJMA 2VL9A 2VD1A 1V9WA 4GWRA 1M9AA 3D4MA 2WFCA 2IMKA 3UEMA 1A23A 4O32A 3PGTA 2PERA 2H01A 2IPAA 1EGOA 2GVPA 4KW6A 3FEUA 2P5RA 3QFAC 1UC7A 2FWHA 3IAS2 2GSTA 3DYRA 1Z9HA 1M7TA 2GSQA 2OBKA 4QL7A 2AUVA 3HKRA 2L57A 4GQFA 3LGCA 2AHEA 1A0FA 2LRCA 2C0EA 2C0FA 1XFLA 1GTUA 3DIEA 4NAXA 3FW2A 1K3OA 1WOUA 4TR4A 5J9BA 3FY7A 1I9DA 3IPZA 1A8YA 2CQ9A 3LYPA 1JLVA 3EMXA 2X8HA 2L5LA 22GSA 3HXSA 3ZYWA 1YZXA 2A2RA 4MF6A 1BG5A 2PPTA 3IE3A 5EL8A 1XWAA 3RPNA 3C1RA 1ZYEA 5DALB 4IHUA 1X5DA 4DSSB 11GSA 4BWSA 5F8BA 2AAWA 3IXRA 3WT1A 1TP9A 1K0CA 3ZIJA 2HE3A 2YCDA 4MK3A 2R2JA 4ZILA 2V6OA 3UOMA 2YWIA 3E9JB 3VWWA 3TKSC 1WP0A 2DJJA 2F8FA 3KP8A 6GSWA 2GTUA 2KP1A 2H71A 2B1KA 4PNGA 4O7HA 3EYTA 2H1AA 1YEPA 2IN3A 2JZTA 2L59A 1FHEA 2GSSA 4O92A 5EPFA 10GSA 3UAPA 3CTGA 5HR0A 2FNOA 4GSNA 2AB6A 4DSSA 3CTFA 2FY6A 1LU4A 2WJUA 4K0GA 1PGTA 2V32A 3GNJA 2PN8A 1F2EA 1OE8A 2YWMA 1QUWA 3KIJA 5HFKA 3M8NA 3EVIA 4J56E 1T4YA 1PRXA 2BTOT 1OYJA 2YP6A 1T8EB 1X9MB 2VM1A 2YPMA 4HZ4A 4RI6A 4DVCA 17GSA 4OD7A 3LXZA 3DVXA 2C3TA 4ILFA 5ECSA 2P31A 3ME7A 5IPGA 4TXVA 1THOA 4QL9A 3P2AA 4YH2A 3O3TA 1H4OA 4MABA 4GQCA 4K6XA 1DBYA 5FWGA 2L6CA 2KOKA 3TRXA 2IIYA 1TW9A 1MDJA 1XXUA 1F3BA 4WR4A 5CRHA 3EMPA 2ES7A 2YZUA 1ML6A 3DVWA 2R5GA 3FRCA 5B8AA 2VO4A 1YDKA 2F8AA 4I2TA 3LEFA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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