4TR3A

Mouse iodothyronine deiodinase 3 catalytic core, semet-labeled active site mutant secys->cys
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
188
structure length
188
Chain Sequence
GIDPFTGQKLDFFKQAHEGGPAPNSEVVRPDGFQSQRILDYAQGTRPLVLNFGSCTCPPFMARMSAFQRLVTKYQRDVDFLIIYIEEAHPSDGWVTTDSPYVIPQHRSLEDRVSAARVLQQGAPGCALVLDTMANSSSSAYGAYFERLYVIQSGTIMYQGGRGPDGYQVSELRTWLERYDEQLHGTRP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of mammalian selenocysteine-dependent iodothyronine deiodinase suggests a peroxiredoxin-like catalytic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Type III iodothyronine deiodinase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mus musculus
total genus 53
structure length 188
sequence length 188
ec nomenclature ec 1.21.99.3: Thyroxine 5-deiodinase.
pdb deposition date 2014-06-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4tr3A00
5DAKB 1AXDA 5ECRB 1ZMAA 2R37A 1B48A 1HNAA 1DSBA 1WOUA 2P31A 1I5GA 1YEXA 2CZ3A 1SENA 2OBKA 4K9ZA 3IDVA 4XHMA 2MYGA 1M7TA 2L6CA 1KBNA 4RI7A 3DWVA 2CX4A 2VCVA 3GRXA 3GUSA 4YQVA 1YY7A 2H6YA 3HCZA 1PA3A 2R3XA 2F8AA 2YWIA 1GLQA 1K0BA 1A8LA 1ZYEA 2ALBA 2C4JA 4KH7A 1GNEA 3TRQA 4EUYA 4DEJA 3FZ5A 1PKWA 4K6XA 4OCFA 2QGVA 5B8AA 1R5AA 4MZBA 1OKTA 2IMEA 1WPIA 1XBSA 3IE3A 3IA1A 4GLTA 12GSA 1G7OA 1K0CA 1R5PA 4TW5A 1TP9A 1ON4A 2QKEA 5G2ZA 1EP8A 5CNWA 1SK1A 3KP8A 2M72A 4IW9A 3WYWA 1THOA 1FAAA 1OC8A 2H8LA 4X43A 7GSSA 4ZB8A 2B1KA 2C0GA 1H4OA 3GHAA 4PX1A 3TRPA 4CHSA 1THXA 1WIKA 3F63A 3VLNA 3TOUA 2O87A 2E2GA 1Z7RA 4MJCA 1OYJA 4GTUA 2H74A 3DEXA 1QXHA 4YQMA 2DSAA 3I9V2 2FGXA 2DJ0A 2J23A 1JZDA 1EGRA 3TJGA 2NVLA 3H93A 5ECIB 1YQ1A 2WRTA 2LRNA 2OBIA 2FWEA 4BVYA 2GDRA 1AQWA 2WULA 3KCMA 3F4TA 2QC7A 4NPBA 1O8XA 2L6DA 3GL5A 3NOFA 4G2EA 4POBA 2RM5A 1U87A 1A23A 2F51A 2AYTA 1SKSB 2RLIA 2GT6A 1GSDA 1EGOA 4I2TA 3TKSC 3LFLA 3H4KA 1K3YA 3PR8A 2ON7A 3E3EA 4HUAA 1XVWA 5HFKA 1ST9A 2HZEB 2KUCA 3ERFA 2L4QA 5DJMA 2CVDA 5ENUA 1RK4A 2KLXA 1C72A 1M0UA 1V58A 4MH3A 3GIXA 1BAYA 2C1YA 2K8VA 1FVKA 2RM6A 3MNGA 4KUNA 5E59A 2FY6A 1HNBA 2GZYA 1PN9A 4F9ZA 1B8XA 3K8NA 2H6ZA 5ELGA 4FO5A 2B3SA 1J0FA 3RHBA 2C0FA 4LLRA 5DALA 4MF6A 2LTKA 2O8VB 2VCWA 3HJPA 2VL3A 2YWNA 2I1UA 5F0GA 2MMNA 4TRXA 3PINA 1RW1A 5D9TA 1A0RP 1URMA 1EV4A 1PSQA 2A4VA 3EURA 5F07A 4V1Ap 3SWLA 1TI3A 1V2AA 3V1WA 2XHFA 1T7PB 1XW5A 2C0EA 2R2JA 2FWGA 5D93A 1PQNA 4L8EA 4MZCA 3LYPA 5F05A 3FK8A 4GQFA 5DJLA 5HFIA 3GH9A 3KTLA 3LG6A 1K0NA 4Q5NA 2EIQA 3FKFA 3GURA 4ML1A 2YJ7A 4ZB9A 4ECCA 4WR4A 2H73A 3HHVA 1XOBA 1YDKA 4IQ1A 3APOA 3VPTA 9GSSA 5DCHA 2WS2A 1PX6A 2VCQA 3CTGA 3HZ8A 3C73A 1ACVA 2DJ3A 1E2YA 1F9MA 2FWFA 3QMXA 3CXGA 2MMAA 5H5SA 2H0HA 1YF1A 3ERGA 5ELAA 3WT1A 3KD0A 3WD6A 4NXIA 3ZVJA 2G2QA 2DJKA 3QCPA 2VCZA 4YQUA 13GSA 5KN1A 2YN1A 2JU5A 3C1SA 2PPTA 1Z5YE 3ERWA 3BOAA 4I2UA 4XS1A 2H1AA 1XFLA 1W89A 4EO3A 1GSEA 1WRYA 3OR5A 1Q98A 4OO5A 3EVIA 3ZMLA 4EDZA 1EP7A 5AIVA 2B5XA 3GTUA 5G5FA 4NMUA 2F9SA 2LQQA 1BYEA 2GS3A 2ES7A 5B6MA 4DVCA 1NHOA 1BX9A 3FZ4A 3JCML 4MA9A 3UL3A 2VLTA 3ZYWA 5IO0A 4MMMA 2YV9A 2CAQA 4MPGA 1O6JA 4ZL8A 5IMZA 2HT9A 3G9BA 1I9DA 4KCAA 1SYRA 4L0WA 4TXOA 4ECIA 1ZYQB 3IC4A 4GSTA 1GSQA 4Z7XA 5DQSA 1X5DA 4X1UA 1AQXA 3TJFA 4XS6A 4WBJA 4HJMA 4OO4A 1HNCA 4F03A 5COHA 2YJHA 5CRWA 2DJ2A 3HA9A 1Y25A 2DJ1A 1PD21 2PBJA 2OA7A 3VFIA 2R4VA 2P5QA 3VWVA 5KN2A 3W6GA 3DKSA 2LKUA 4J57E 4ZB6A 3SBCA 3LQ7A 2VCTA 3D5JA 2CX3A 3TJBA 1XCCA 1EEJA 4DSSA 5JWQB 1M9AA 5LD0A 5ID2A 3ZVJD 2GQMA 3CRUA 2YCDA 4QQ7A 2H0IA 1S3DA 4HDEA 1G6WA 2N5FA 2P5RA 3G7IA 4KNDA 2IFQA 3N9JA 4AJ6A 1K0DA 2H6XA 2H30A 3F8UA 1O73A 1XIYA 1MDJA 4PXOA 5ECPB 1CQGA 1BG5A 3CBUA 3ED3A 4PGTA 3BCIA 1T4ZA 3GKKA 1AW9A 1QQ2A 5FWGA 1GL8A 3L9UA 2B7KA 5J9CA 3P8WA 2Z9SA 5B7CA 1JHBA 1GSFA 4TR1B 4FIWA 1FOVA 1KEBA 2A2RA 2IMDA 3RPNA 2VM1A 2FWHA 1ERWA 2GSQA 3UJ1A 5AISA 4I5QA 4HQZA 1F3AA 3F9UA 1SK0A 2YNXA 1OVNA 2CT6A 3E0UA 4G10A 3KH7A 3GA4A 3M3MA 3TUEA 3EU4A 4IKHA 2V32A 2E7PA 6GSYA 1U88A 1GP1A 2I4AA 1AUCA 1TJDA 4J2FA 2G0FA 4K0GA 1ZOFA 4PQIA 1EOHA 2VIMA 2XPEA 3O6TA 3HD5A 1M99A 1GLPA 3FEUA 1K0AA 4KAEA 2HNLA 1R4WA 2HI7A 4V2NA 2IMKA 3FY7A 1SD8A 4O7HA 2C3NA 3ZMKA 3VPQA 5IMDA 3IV4A 2X8HA 1NSWA 4HQSA 3ZIVA 3LXZA 1TXXA 5FHIA 2B5YA 4KDYA 3A2WA 2PWJA 3QAWA 2F3MA 1MEKA 4NV5A 3UAPA 3IOSA 3TKRA 3E9JB 2GT5A 2PUKC 11GSA 2CV4A 4K8MA 1SKWB 4DSQA 3KEBA 2IWTA 3UARA 2L5OA 1TRWA 3HDCA 3TKPA 4IJIA 2LS5A 2XC2A 4IJ3A 4ZBDA 2LV3A 4OMVA 2X8CA 3H1NA 5IMCA 1GULA 3L9VA 2V6OA 3L0HA 5J9BA 5ECHB 3A3TA 3F3QA 3Q6OA 5HFGA 19GSA 2EC4A 1A2JA 4P3YB 2JACA 3EINA 3H8QA 3A2VA 5EVOA 4I97A 3FHKA 2REMA 3L4NA 2HZFA 1TOFA 2LJAA 4GQCA 4QL9A 5GAPD 1ERUA 2I9HA 5AGYA 4IELA 2LSTA 4FYBA 3QR6A 4ML6A 1RQMA 1MD4A 1X5EA 1Q4JA 3TDGA 4BWSA 3KMNA 2HSYA 4PNGA 2JADA 1PX7A 3ISOA 2PMTA 4KSOA 3ZIJA 1GUKA 1TK0B 1MDIA 4BA7A 3HVSA 1F6MC 2YPMA 2NPBA 2L5LA 4KX4A 1N8JA 1QGVA 3WGEA 3C7MA 5C04A 1EEMA 5D8IA 1V98A 5GSTA 4XTSA 1G0TA 1TU8A 3Q18A 2B7JA 5F06A 3QDNA 2YZHA 4TOPA 2M46A 2MMZA 4IN0A 2FA8A 2IIYA 1R26A 2MMOA 2H71A 1QUWA 3IPZA 2OACA 3I69A 5A4WA 22GSA 1F37A 2YV7A 1V57A 5EPFA 4KCEA 4JRRA 3APQA 3KJYA 4MJEA 4AJ7A 2H72A 1FVJA 1OE7A 2VOCA 4KGIA 4MABA 3DD3A 2B1LA 1OE8A 4NHWA 3C71A 4LL1B 3GN3A 3UMAA 1WP0A 1TI1A 1DE1A 5DQYA 1SYXA 3KP9A 2IPAA 2TIRA 3A2XA 20GSA 2TRXA 3ME7A 1AC1A 3UBKA 4HJ2A 3HKRA 5EL8A 4KB3A 1GWCA 3F6FA 3IK9A 1B4QA 4LA1A 4AJ8A 1JLVA 4YAPA 1OAZA 1AIUA 2VCXA 1T4YA 4ECBA 1B9XC 5CRHA 1SL1B 2OE1A 3GV1A 4OFNA 5ECSA 3MAKA 2BJXA 3QAVA 4TR4A 6GSSA 1F2EA 3GH6A 2K8SA 3L9SA 4PQ1A 2PN8A 1OC9A 3IR4A 2R6KA 4IVFA 5CYYA 1S3AA 3IHQA 4GRFA 1TK5B 2H1BA 5ECNB 3C8EA 2C80A 3FR6A 3F3RA 1V9WA 5DALB 1J9BA 3DVWA 2DIYA 1S3CA 4ZIJA 4L5LA 2H1DA 2YWOA 3R2QA 3BJ5A 3C1RA 3GL3A 2IJYA 2K18A 2OJLA 2J9HA 4JE1A 1XWGA 4I8BA 1X9MB 5JCGA 3P2AA 3LGCA 3KZQA 2ZCTA 3KGKA 2C0DA 1XVQA 1T1VA 4WEYA 3EC3A 5IOWA 4BL7A 1U6TA 4FH8A 4IGJA 4Q5QA 4HZ4A 4ZBAA 6GSXA 2GLRA 4EE0A 3G7YA 3M8NA 5D96A 4EVMA 1ZGNA 4YH2A 2AHEA 4JU5A 5C00A 4GXZA 4K7OA 4OWYA 6GSWA 3MWHA 3EMPA 2AUVA 3P7XA 3TKQA 4KA0A 3S9FA 2KOKA 2WDUA 5B8BA 2PVOC 3DGQA 4TR0A 3EE2A 2CZ2A 1F3BA 2GTUA 3U6VA 3Q74A 3GSTA 3QAGA 2WFCA 2HE3A 4HU7A 1GTBA 3KXOA 4D73A 4IBPA 1M2DA 1UA5A 2ON5A 1NHYA 2L59A 1A8YA 1ERTA 3ZLPA 4POLA 5CRGA 2FA4A 3KH9A 2LRTA 5B6NA 1VRSD 2VD1A 3FZ9A 4N0VA 5J3RA 3EYTA 3GKMA 4IHUA 2P0GA 5JCUA 2AV4A 3EU3A 4KSMA 2KP2A 5HR3A 4JR4A 4LMWA 1G7EA 3HVVA 5HQPA 3GTUB 4V1Ag 5JWOB 1Z6NA 4ZBBA 2OE0A 1EV9A 2B5EA 2BMXA 3HYPA 5JWRB 3BCKA 5H5QA 4FYCA 4CDOA 1DBYA 4GSNA 5IPHA 1YKCA 4PNFA 4OCEA 4BWQA 1YF0A 2CVKA 2AJQB 3HVXA 2H01A 5IMAA 2I81A 4TXOB 3F6DA 4NAXA 3D0ZA 3UVTA 4XIHA 2I3YA 1OC3A 2CAIA 2FUG2 4PUFC 3CSHA 3LXTA 2VD0A 5HR2A 2TRCP 1DUGA 3PH9A 3ME8A 1FG4A 2VO4A 1BQ7A 3GX8A 4BPYA 5F8BA 4GSSA 1BEDA 1O81A 1XPVA 4WBRD 4N30A 2LQOA 2NDOA 1ILOA 1EZKA 4HS1A 1CQHA 3DVXA 3FR9A 2HLSA 2GZPA 1LU4A 5IO2A 3M0FA 5IM9A 3VI5A 5CRDA 3CMIA 1HQOA 5GZZB 1MD3A 3AY8A 3IAS2 2HSHA 4DSSB 4O5RA 1EWXA 4ZL7A 5ID2B 4OD7A 2V6KA 3LJRA 3WT2A 1M9BA 1VF3A 2GQKA 3NIVA 2DC5A 2H75A 10GSA 4POMA 1ERVA 2VM2A 3EMXA 2IFQB 2FHEA 2H76A 3VWUA 4MF7A 5A5KA 17GSA 1TU7A 3A5WA 5DCGA 1TW9A 1SJZA 1WMJA 2MBTA 1B9YC 4XS4A 1QMVA 5IQYA 4ZILA 1A24A 1NW2A 3GNJA 1QFNA 1SL2B 1GH2A 5H5RA 3US3A 5A4UA 1PL2A 2OE3A 2DJJA 4TR3A 3TOTA 6GSUA 2H1GA 5ECLB 5DAKA 2CA8A 2N5AA 4TXVA 2GGTA 1YKAA 3W8JA 3IXRA 4HEA2 6GSTA 4H86A 3UVHA 4MK3A 1XXUA 4WKWA 4RUVA 3L78A 1Z7PA 1QK8A 4XRAA 1WE0A 1PKZA 2PERA 1MTCA 2AAWA 1FB6A 1YJ6A 2LUSA 3M9JA 1M2BA 4K7NA 3HY2A 3DYRA 1SKRB 3ZZXA 4GCIA 4BVXA 4ID0A 4JEDA 2MBSA 1TRSA 2QSIA 4L5OA 4WF5A 2YWMA 4EC0A 3ZREA 6GSVA 4JR6A 1X9WB 3RBTA 3J7Yk 2GQLA 3CSJA 4K7IA 1M2AA 3O76A 3HJOA 4K0NA 3FRCA 1PRXA 1GSSA 1JFUA 1O85A 1UVZA 3CRTA 1GNWA 2V2GA 3GYKA 3CYNA 5ECKB 4TKYA 4POKA 1GRXA 2A2SA 2IMIA 1N2AA 2ZNMA 1GSYA 1TKDB 4AGSA 1XWKA 1K3LA 3KIJA 1J08A 5IMFA 4MPFA 5AN1A 1IYHA 4NWYA 2L57A 1VF4A 4I6XA 3GSSA 4JBBA 16GSA 4TN8A 2X99A 2RIIA 1G6YA 1K3OA 1X5CA 3GKXA 1TK8B 1HYUA 4QL7A 2C3TA 2WZ9A 2O89A 3NZNA 1AAZA 3KM6A 5KEJA 4N10A 2AB6A 3TJJA 4DSRA 3Q19A 1YZXA 3RHCA 2DMMA 2PGTA 4XRDA 4NHZA 3QFAC 3GMFA 5ECQB 3KTBA 4YAVA 2GSRA 5ECMB 1YEPA 1GTUA 4V2MA 3GFKA 5GSSA 3HXSA 4F82A 1Z6MA 4LMVA 2RUFA 1GTAA 1R7HA 3TRXA 4AF2A 5LCZA 2JZRA 1T3BA 4WETA 2OKAA 4NV2A 4EKZA 2HZEA 4IP1A 2H66A 2H70A 2XPDA 2KHPA 2IN3A 2VLVA 3QPMA 1PMTA 2JSZA 2XBQA 1FW1A 3FYGA 4EDYA 1B4PA 5J5NA 2WB9A 1VGLA 4K1FA 3D21A 4KDXA 3TKSA 2WGRA 3UOMA 2L4CA 3HJMA 2CVBA 4JZQA 1XW9A 3VWXA 3QOUA 2HRNA 5ABRA 3GKNA 1U3AA 4IS0A 1XWAA 2EIOA 2O85A 1V40A 2R5GA 3PGTA 2C3QA 1T00A 4Q5FA 4G9HA 3VURA 3VI7A 3I6AA 4ULXA 1JZWA 3D6IA 1WJKA 5AIXA 2O7KA 4HZ2A 2B6MA 2JZSA 2VL2A 1Y6EA 2FNOA 2HRFA 2DBCA 2LJRA 4IP6A 5KN3A 1EOGA 4MDCA 1MDKA 1ML6A 1U3IA 5D9VA 4N11A 5G31A 2VL2C 5IMVA 3BBYA 3ZL5A 4RI6A 4PQHA 3QFBC 5IIZA 4L0UA 1NM3A 4N0ZA 3ZITA 2BTOT 5HR0A 2H0GA 2GVPA 3CTFA 4CW9A 5J4UA 4IQAA 3UBLA 1T8EB 8GSSA 4F2IA 1FHEA 3IAM2 1A2MA 1BJXA 3J7Yb 4EXJA 1FO5A 1OC9B 3DIEA 2M80A 3QD9A 1TDIA 3F0IA 4RQXA 5L71A 4HI7A 1SD9A 4RQRA 4TVEA 3MSZA 4GWRA 3IK7A 2GSTA 2PU9C 4MCUA 1ZCPA 1SK2A 4OFTA 5JCWA 1ZL9A 2FCHA 4MZWA 3D4MA 1LBKA 4E8HA 3FZAA 3TJKA 3M9KA 2YOIA 1W4VA 4GF0A 4MJAA 3IRAA 5D9XA 4EF0A 4WR5A 4ILFA 3N5OA 1XOAA 2JZTA 4EL1A 5KN0A 2DMLA 1DE2A 1E6BA 1XWBA 4XCSA 3RDWA 3LWAA 2DLXA 3FR3A 2FLSA 14GSA 3H79A 2VLUA 5IOXA 2LEGA 4K2DA 2V41A 2PVQA 3IBHA 2JSYA 3WGDA 2HXKA 1SL0B 2WCIA 5CREA 2X8GA 1OKDA 5EY6A 3M1GA 2KP1A 3ZRDA 2C8UA 1SU9A 2E0QA 2OADA 1PL1A 1XW6A 3CSIA 5D9WA 3UEMA 1O7UA 2VL9A 4KDUA 4D73B 2V1MA 1KNGA 4ECJA 1SJIA 18GSA 3U5RE 3I43A 5E4WA 3MDKA 3TB2A 1VF2A 1SJ6A 3F4RA 1Z9HA 3TCOA 5HR1A 2NTOA 4G19A 1H75A 2N5BA 4MLYA 1A0FA 4ISDA 2XBIA 2ZUPA 2LRCA 3TGZA 5ECOB 5G1KA 2X64A 1UN2A 1X9SB 5CP1A 4O92A 3TKSE 4E8EA 5FT3A 2LJKA 3GX0A 3KMOA 3EWLA 1A2LA 2VUPA 3APSA 1ZZYA 2D2ZA 5G1LA 2YZUA 1ABAA 1VF1A 5DBQA 5CAXA 4WXTA 4F0BA 2GSSA 1XWCA 2NBSA 3BD2A 3VWWA 4WF4A 2YP6A 2H19A 1TTZA 4ACSA 3ZFLA 2K9FA 1GUHA 1UC7A 4KW6A 1GTIA 4Q5RA 5D73A 5G30A 3UIWA 4V2LA 2EIRA 4TR1A 1X0RA 1LJRA 2CQ9A 5A4VA 1PGTA 5INYA 2GZZA 5IPGA 3W8SA 3VK9A 1AQVA 3ZTLA 4ZL9A 2K6VA 4OFMA 3RPPA 3WGXA 3O3TA 3DXBA 4FYUA 1JLWA 3FW2A 4J56E 2JL4A 4HU9A 2LNSA 5G5EA 4X0XA 1HD2A 3LSZA 3F4SA 2IL3A 4O32A 5J41A 3DMLA 2HFDA 4LL4B 1GSUA 2E2MA 1TRUA 1KTEA 4MJBA 1JZRA 2F8FA 2FD3A 1WWJA 2YANA 1Z3EA 1JZOA 5LNKe 1USBA 4HOJA 2HYXA 3LYKA 3D22A 2VAFA 1XZOA 4PURA 5GAND 5DVBA 2MZCA 4MF5A 3DRNA 2WJUA 2DIZA 1K0OA 3ZFBA 1O8WA 1TRVA 1IYIA 1FB0A 3HZ4A 4PUAA 4XS4B 2IMFA 3P90A 2RUEA 5CO3A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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