4TR3A

Mouse iodothyronine deiodinase 3 catalytic core, semet-labeled active site mutant secys->cys
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
188
structure length
188
Chain Sequence
GIDPFTGQKLDFFKQAHEGGPAPNSEVVRPDGFQSQRILDYAQGTRPLVLNFGSCTCPPFMARMSAFQRLVTKYQRDVDFLIIYIEEAHPSDGWVTTDSPYVIPQHRSLEDRVSAARVLQQGAPGCALVLDTMANSSSSAYGAYFERLYVIQSGTIMYQGGRGPDGYQVSELRTWLERYDEQLHGTRP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of mammalian selenocysteine-dependent iodothyronine deiodinase suggests a peroxiredoxin-like catalytic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Type III iodothyronine deiodinase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mus musculus
total genus 53
structure length 188
sequence length 188
ec nomenclature ec 1.21.99.3: Thyroxine 5-deiodinase.
pdb deposition date 2014-06-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4tr3A00
3GKXA 3APOA 2O87A 1DBYA 1MDIA 3L78A 5J3RA 1A0FA 2LTKA 4TR4A 4XTSA 1F3BA 3GHAA 1R4WA 5F0GA 2DMLA 1OKDA 5GZZB 4QL9A 1GSYA 2GVPA 4N0ZA 3WT2A 1XWCA 4EF0A 3M3MA 1XZOA 2RUFA 4XS4B 2N5BA 2VD0A 2P5QA 2B1KA 3HA9A 2FWEA 3F8UA 4FIWA 2K6VA 4MJEA 2LRNA 5ID2A 3KCMA 1THOA 4GQCA 1FVJA 2VL9A 5DALA 3ZITA 3KJYA 5ECPB 2LUSA 3FR3A 4RI6A 6GSYA 4OWYA 4EKZA 4F2IA 1ERWA 2DJJA 1X9WB 2KOKA 1FAAA 1HNAA 2JZTA 3QAVA 1GLQA 3BCKA 4KDYA 3TJKA 3HXSA 1Q98A 1XWGA 1SL0B 1JZOA 2OE0A 4MZBA 4IQAA 4O5RA 6GSUA 1Z5YE 3V1WA 2HE3A 5F06A 1FHEA 2GQMA 4POLA 4WR4A 1BYEA 3FKFA 2DJ2A 3D22A 1TK0B 2FD3A 3Q18A 4I5QA 1W4VA 5D8IA 1K0CA 5HFGA 2YN1A 4HI7A 3HKRA 2VLVA 5DJMA 1H4OA 1HQOA 5ECHB 5JWQB 3ZZXA 1XOAA 5JCUA 4ZB8A 2L5LA 3CTGA 3PGTA 2WS2A 3HJPA 2HSYA 4MZCA 3TRXA 1Y25A 4TR1B 5A4VA 7GSSA 1XW6A 3ZIVA 1JZRA 4MF6A 3F4SA 1ZGNA 5C04A 4KA0A 5HR0A 1ZMAA 2IPAA 2V41A 1XVQA 2L6CA 1HNCA 2HT9A 2V2GA 1EEMA 4WBRD 4EC0A 2VM1A 3ZVJD 4D73A 4HQSA 4Q5FA 3HJMA 4KCEA 2P0GA 1MDJA 1BG5A 3H8QA 1HNBA 5LD0A 2IFQA 1UC7A 1T3BA 4MF5A 4NWYA 1XCCA 4MH2A 3A2WA 4MPFA 1KNGA 2YZUA 3E3EA 2H71A 4V2LA 3C73A 4EO3A 2WRTA 3LGCA 3FZ4A 3GRXA 4DSSB 4FYCA 4N10A 4PGTA 2GS3A 3LFLA 2CX3A 3HJOA 3C8EA 3ZTLA 3US3A 2H8LA 3WYWA 3KH7A 3RPNA 3TDGA 4EL1A 2XBIA 2C0GA 3A2XA 5JCGA 4ZIJA 2X99A 2WULA 4K7IA 2ON7A 4O32A 1AUCA 4IGJA 4MA9A 3S9FA 3FEUA 1Z6MA 2YV9A 3DKSA 5IPGA 4IS0A 2WCIA 4ZXGA 3W6GA 4F82A 4TVEA 3M0FA 1YEXA 1GRXA 2PWJA 4MDCA 2MZCA 2HRFA 2F3MA 2P31A 2YJ7A 3UBKA 3BJ5A 4K6XA 4TN8A 1K3LA 1GNEA 1PQNA 2CA8A 3ZMKA 5LCZA 4ZL7A 1OC3A 1XPVA 3DVWA 1U3AA 1M2DA 1TRVA 2IJYA 5GAPD 1YZXA 2FWHA 5IMVA 3MSZA 3D0ZA 2LJKA 5ECLB 16GSA 4RI7A 2G0FA 4CDOA 4CW9A 6GSTA 4AGSA 1TOFA 1TJDA 1F6MC 2H6XA 2H0GA 2E7PA 3F3QA 2OA7A 4OCFA 5E59A 2CAIA 4MPGA 5HQPA 3FHKA 2F9SA 2HNLA 2H66A 4ZB9A 4WBJA 2H6ZA 2CX4A 3DD3A 3I43A 3ISOA 3H4KA 4NHWA 2EIRA 3JCML 5KN1A 1SJIA 4KUNA 3ZMLA 1BAYA 5CRHA 1GULA 5ENUA 1WWJA 1K0AA 1NHOA 3G7IA 4ECIA 3CXGA 2F51A 5DQYA 3W8SA 4HU9A 3GKMA 3VK9A 1ABAA 3UVHA 4BVXA 1TRUA 3QFBC 4MMMA 2ON5A 2F8AA 1QGVA 2GGTA 4H86A 2FLSA 2H1GA 3GIXA 1GUMA 1GUKA 5E4WA 4TRXA 2BJXA 3A3TA 4IP6A 1Y6EA 4OO5A 1G0TA 2H1AA 4PNFA 3IAM2 5H5SA 5A4UA 3ZLPA 1ST9A 2R5GA 4K8MA 1EV4A 2AUVA 2JU5A 3APQA 4OFTA 2ZNMA 1IYIA 2NBSA 1U88A 1X9MB 1TRWA 2WB9A 5DVBA 5GSSA 2CAQA 1WRYA 2DC5A 5G2ZA 5A5KA 3GUSA 1GSDA 1THXA 4F0BA 2VCQA 1R5PA 1TI1A 1EP7A 4IN0A 2M80A 1VRSD 2LSTA 3N5OA 3HYPA 4KSMA 1C72A 5L71A 1BJXA 2WZ9A 2GT6A 4F0CA 4I2UA 4LMVA 4Q5RA 3CYNA 1NM3A 2OADA 1FB6A 5HFIA 1J08A 1A8LA 1PGTA 2DJ1A 4ZL9A 1V58A 2C80A 3N9JA 4WKWA 2GZYA 1ERVA 2VCTA 5ECQB 3ZREA 5G30A 3RHBA 2JZSA 9GSSA 1I9DA 5DCHA 1E6BA 1OAZA 1WP0A 1FO5A 3I9V2 1F3AA 1GUHA 2O8VB 5DJLA 2DJKA 2KHPA 1PA3A 1KTEA 2YANA 5IMCA 4J56E 4RQXA 3GURA 4V1Ag 4KNDA 3C1RA 4DEJA 5HR3A 1HYUA 4BL7A 4TR0A 5H5RA 3FY7A 2CV4A 14GSA 4JRRA 3HCZA 3GV1A 1Z6NA 4ZBBA 4BVYA 1GTUA 4IVFA 3TJGA 3ME7A 1O7UA 1SK1A 2LQOA 2WFCA 1Z9HA 1R5AA 5D9VA 4G10A 4KDXA 3LG6A 2YJHA 3ZVJA 5AISA 4RUVA 3QAGA 1QMVA 4G19A 2JZRA 1JZDA 2RLIA 1Z7RA 2C3TA 1T7PB 3RAZA 2DJ0A 2CVDA 4ZB6A 3PH9A 4NV5A 3VFIA 5IO0A 2MYGA 4X0XA 3GSTA 4KB3A 2HZEB 5IMFA 3HVVA 2V1MA 4LLRA 4L5LA 1OC9A 3GL3A 1G7OA 2FWGA 4ECJA 2XC2A 5ECNB 1AXDA 4TW5A 1NW2A 3J7Yk 2H70A 5CYYA 3L0HA 2PGTA 2VCXA 2K8SA 1GWCA 1A8YA 4HDEA 3L9VA 3ME8A 3K8NA 3PR8A 3D21A 3SBCA 4WETA 1XXUA 4HUAA 1GTIA 2KLXA 2PERA 1A23A 4DSRA 3U5RE 3HZ4A 22GSA 2GLRA 1PMTA 4MJCA 2N5FA 5KEJA 1M9BA 3VWWA 2XHFA 4V1Ap 13GSA 4V2MA 1QXHA 3RBTA 3LQ7A 1ZL9A 2IMDA 2OE1A 1K3OA 1QQ2A 3GTUA 4N11A 4DSQA 1AAZA 4J57E 3EU4A 1T8EB 4IQ1A 1U3IA 1G6WA 5JWOB 4GXZA 3QPMA 3VWXA 2V6OA 3TRPA 4BWQA 4NAXA 3UVTA 4V2NA 1AQWA 2H74A 1AC1A 2OACA 1JHBA 3FZAA 1GTBA 5CRGA 3TRQA 2LJAA 5ECMB 4HZ2A 2MMNA 1X5DA 4RQRA 1F37A 2LKUA 3GKKA 6GSSA 5JWRB 1F2EA 1O8WA 1NSWA 4X43A 2PU9C 3MWHA 1JFUA 2VD1A 5DQSA 4BWSA 3VURA 2XBQA 1HD2A 1IYHA 4TOPA 4XS4A 1LJRA 2AYTA 2ZUPA 1AQXA 4ILFA 1UA5A 2FUG2 2WGRA 4PQ1A 5CREA 2IWTA 3H93A 1XOBA 2C8UA 2GTUA 3GX8A 4BPYA 3QD9A 5ECOB 5J41A 2YWOA 3GSSA 2HI7A 3QDNA 4TXOB 1F9MA 5JCWA 1GP1A 3CSHA 4PUFC 3KP8A 3KZQA 3BCIA 2VM2A 4KE3A 1CQGA 2CVBA 4ZILA 2TIRA 3F63A 5EPFA 1SD9A 2R4VA 3KMNA 5B6NA 1YEPA 4XS1A 4AF2A 4OFNA 3ERFA 1GSSA 2LNTA 5HR2A 4ML1A 1UN2A 5DBQA 3HVSA 1ERTA 4FO5A 4TXVA 4MJBA 2IMFA 3APSA 1WMJA 3FYGA 2OBKA 4GF0A 2K9FA 2YNXA 3TGZA 1A24A 4IJIA 2GDRA 5D93A 2BMXA 3VI7A 3F3RA 2Z9SA 4KSOA 4POMA 3IE3A 4AJ6A 5IPHA 1R26A 1OC8A 2FHEA 2L59A 3IC4A 3KIJA 1TK5B 2ES7A 4L5OA 1XIYA 2PUKC 1LU4A 4EVMA 1ZZYA 4K0NA 1GLPA 4EUYA 5G5FA 4OMVA 4MK3A 4I6XA 3GH6A 2R2JA 3IRAA 3KXOA 2GQLA 3ZFBA 2AJQB 5EL8A 1TI3A 1E2YA 3VWUA 3P7XA 4TR1A 4PURA 1M9AA 4GQFA 1V2AA 4GSNA 4OD7A 2X64A 4IBPA 3IDVA 2DBCA 1V40A 1M99A 5J9CA 2A2RA 3LWAA 3KGKA 2YCDA 3EMPA 2NPBA 2AV4A 3IXRA 3HZ8A 2H19A 3LXTA 4GCIA 4HEA2 2AB6A 1XWKA 4OFMA 1PL1A 2I1UA 1A2MA 2YV7A 1BEDA 4ZBAA 1B4QA 2J9HA 4JR6A 1VF3A 1ACVA 2REMA 3EMXA 5AGYA 4HU7A 1ML6A 1O81A 2EC4A 1T4ZA 3CSJA 1B9XC 3QMXA 4PUAA 5J5NA 5AN1A 3IPZA 3M9JA 5HFKA 1O8XA 3EURA 1Z7PA 4DSSA 1XWBA 1A0RP 4PQHA 1YF1A 2FY6A 3L4NA 4O92A 3TOUA 4XCSA 2GT5A 5EY6A 3DYRA 5D96A 4WEYA 1SKSB 5B7CA 5J9BA 1PX6A 3LEFA 5GAND 1K0BA 1YDKA 3E0UA 1SYRA 2GZPA 3GFKA 1GNWA 2YWIA 2CVKA 2PN8A 2L5OA 3D5JA 1EZKA 3EWLA 5ECRB 2M72A 1PKZA 3IV4A 1M2AA 1YQ1A 1B48A 2N5AA 17GSA 2A2SA 3LJRA 3UOMA 2LV3A 2OBIA 3TKSC 3ZYWA 3Q6OA 2JADA 5F07A 4ULXA 4I8BA 1PSQA 3L9SA 1BX9A 3TKRA 2PVOC 1RK4A 4E8EA 3WD6A 3KH9A 3TJFA 4NHZA 3TUEA 2HFDA 4KDUA 3KMOA 5D73A 5KN0A 3GMFA 2R6KA 4WF4A 4GSSA 2H6YA 2YWNA 3TKSA 3DRNA 2GSTA 2E2MA 2DJ3A 2X8CA 1EV9A 1YKCA 4I2TA 2NTOA 2VCZA 1RW1A 1PL2A 4YH2A 2VCWA 2CZ2A 4LL1B 2D2ZA 3FR9A 3CTFA 1QK8A 2VCVA 3M8NA 2AHEA 3AY8A 5LNKe 1OE7A 2NDOA 4QQ7A 1EGOA 2PBJA 2R37A 1GSEA 4LMWA 2VUPA 3PINA 3KP9A 4TR3A 3IAS2 5ELAA 2YP6A 2GQKA 3H1NA 1T00A 3HVXA 4MP4A 1ZCPA 3J7Yb 1YKAA 4PX1A 2EIQA 3D4MA 2FA8A 4JEDA 5AIVA 3DGQA 3G7YA 3IBHA 1K0DA 3F4TA 3NZNA 4AJ7A 2JSZA 2RM6A 2OE3A 1A2LA 1TU8A 4POKA 5IMZA 1UVZA 1ILOA 5GSTA 1MDKA 5G1KA 1EEJA 3D4TA 5CRWA 2IN3A 2E0QA 1H75A 1S3AA 1O73A 1URMA 3L9UA 2V32A 3HY2A 1JLVA 5DAKB 1X5CA 3QCPA 4N30A 2R3XA 1O6JA 3U6VA 4G2EA 1DUGA 2GSQA 3NIVA 2O85A 3DWVA 4FH8A 5ECIB 2L57A 4XHMA 1SKWB 4ACSA 3QAWA 4LL4B 6GSXA 1U6TA 1T4YA 2MBTA 2ZCTA 4J2FA 1VGLA 1PN9A 2F8FA 5G1LA 2HLSA 4GRFA 4FYUA 3WGXA 2MMAA 3O76A 2H75A 1SL1B 4XRDA 3HHVA 3SWLA 3ED3A 4Z7XA 4ISDA 3DVXA 1FG4A 3ERGA 2QSIA 5ID2B 20GSA 5DALB 3LORA 3EE2A 1JZWA 1QUWA 3TKPA 6GSVA 4ZL8A 2EIOA 4KX4A 1XFLA 4GWRA 1YY7A 3RHCA 2AAWA 1EOHA 5B8AA 4AJ8A 1M0UA 1GL8A 2DIZA 3LXZA 1WOUA 1TKDB 5IQYA 4HZ4A 2VOCA 1ON4A 1OYJA 5IIZA 2B6MA 3Q74A 1TK8B 1SYXA 1USBA 3D6IA 3KM6A 4K9ZA 4KCAA 3M9KA 1M2BA 3CRUA 2I3YA 4HS1A 1RQMA 3C1SA 1NHYA 2DLXA 5CRDA 1K0OA 3HD5A 3O3TA 2LS5A 1DE1A 2X8HA 19GSA 5IOWA 1MTCA 1PX7A 1TTZA 3UIWA 2OJLA 2G2QA 3IR4A 1WPIA 2FWFA 4MJAA 4ECBA 3EINA 1KEBA 1SK0A 1XWAA 1EGRA 3ZIJA 4O7HA 1KBNA 5A4WA 2X8GA 3CMIA 3ZFLA 3F4RA 4ECCA 2VL3A 4IELA 5HR1A 5B6MA 4K2DA 2HZEA 11GSA 3TB2A 2JSYA 2MMZA 4N0VA 4K7NA 3ZL5A 1SJ6A 4ML6A 4KGIA 1EOGA 1K0MA 3F0IA 3R2QA 1TW9A 2TRCP 3FR6A 3UEMA 2BTOT 1ZYQB 2XPEA 5FT3A 4YQMA 4D73B 2VAFA 1BQ7A 1VF2A 4F03A 3QFAC 3FRCA 3UMAA 4MF7A 2LNSA 5D9TA 5G31A 2H01A 2IFQB 3HDCA 4QL7A 5ABRA 2IIYA 2FGXA 2B5EA 4HJMA 3TOTA 4OO4A 2RIIA 5IM9A 1SK2A 2VO4A 5KN2A 3GX0A 3RPPA 1N2AA 18GSA 3WGDA 4EXJA 4TKYA 2LJRA 4WR5A 1X5EA 3IHQA 2GZZA 2VLTA 4EDYA 8GSSA 4JZQA 1WE0A 2H30A 2HXKA 4K7OA 4GSTA 1SJZA 1FVKA 3TJBA 3CBUA 2YPMA 4YQVA 1DSBA 3IK7A 1K3YA 2ALBA 3G9BA 2FCHA 2WJUA 2B1LA 3TJJA 5IO2A 4JU5A 5D9XA 1PD21 4GTUA 3I6AA 3KTBA 2GSSA 5G5EA 4MLYA 2KP2A 4I97A 4EDZA 3LSZA 2CQ9A 3UBLA 1W89A 2OKAA 2IMKA 2L4QA 5DCGA 2IMIA 3GNJA 3UL3A 2HSHA 1MD4A 1JLWA 2B3SA 4PQIA 1TRSA 4HOJA 1YF0A 5IMDA 5CO3A 4TXOA 3M1GA 2HZFA 3F6DA 2PMTA 4POBA 4HQZA 3UARA 5DDLA 4E8HA 3WGEA 2CT6A 3P2AA 4G9HA 2LRTA 1Z3EA 1EWXA 1V9WA 3DIEA 3I69A 2J23A 4K1FA 2GSRA 2C1YA 6GSWA 1AW9A 4KW6A 1AQVA 5INYA 1WJKA 3CRTA 3FZ5A 4ZBDA 5H5QA 2VLUA 12GSA 1ZYEA 3ERWA 1XVWA 1V57A 4GLTA 3NOFA 5FHIA 5COHA 4IP1A 2C0EA 5CP1A 1SKRB 4FYBA 2L4CA 5F05A 1J9BA 1GH2A 2YOIA 5J4UA 2K18A 3FW2A 5CNWA 3VPTA 3KTLA 1GTAA 4MCUA 1N8JA 4KAEA 1YJ6A 2HRNA 4Q5NA 4NXIA 1XW9A 3DEXA 3KD0A 3GH9A 2A4VA 2E2GA 2P5RA 1XW5A 2NVLA 2O89A 3Q19A 3O6TA 4Q5QA 1T1VA 2LQQA 1J0FA 5ECKB 2H72A 2B5XA 5KN3A 1CQHA 3GN3A 1O85A 3KEBA 5AIXA 1G7EA 4YAPA 2C3NA 3RDWA 3VLNA 10GSA 5IMAA 1S3DA 1ZOFA 3IOSA 1R7HA 4WXTA 2HYXA 5ELGA 3GL5A 2DIYA 1FOVA 2VIMA 2PPTA 2B5YA 1FB0A 3UAPA 3GA4A 4YAVA 2YZHA 4L0UA 2C0DA 1TP9A 4PNGA 2H76A 3BOAA 5FWGA 1EP8A 2RUEA 3FK8A 2L6DA 3BD2A 2C3QA 5B8BA 2YWMA 1B4PA 2DMMA 2LEGA 3IA1A 4ID0A 2O7KA 3FZ9A 1TXXA 1SL2B 1SD8A 1K0NA 4NMUA 4EE0A 1G6YA 1B9YC 3LYKA 2MMOA 1A2JA 3TKQA 1GSUA 3VWVA 4MZWA 2H1DA 3BBYA 4IKHA 1VF4A 2MBSA 2H0HA 5EVOA 4YQUA 2VL2C 1SENA 2K8VA 1X9SB 3QOUA 3EU3A 4P3YB 3VPQA 2PVQA 2I81A 1VF1A 3F9UA 2QKEA 3QR6A 3MNGA 2M46A 3A5WA 1PKWA 1Q4JA 3EYTA 4MH3A 3OR5A 4JR4A 3VI5A 3EVIA 2QGVA 2VL2A 3UJ1A 1AIUA 2LRCA 4NV2A 3G7JA 2B7JA 1TU7A 1SU9A 2H73A 2JACA 3MAKA 4JE1A 4BA7A 4OCEA 1X0RA 1ERUA 2V6KA 2WDUA 4IJ3A 1DE2A 3GYKA 4MABA 1OKTA 2TRXA 5ECSA 1XBSA 5D9WA 1OC9B 1QFNA 2QC7A 1GSQA 1MEKA 2H0IA 4JBBA 3IK9A 3F6FA 3MDKA 3E9JB 4KH7A 1FW1A 3W8JA 1V98A 5C00A 4X1UA 1PRXA 4F9ZA 1I5GA 3C7MA 4NPBA 2XPDA 5IOXA 1LBKA 2B7KA 4XS6A 4IW9A 4XRAA 2CZ3A 4HJ2A 2I9HA 1WIKA 2FNOA 3A2VA 3EC3A 3WT1A 3C71A 4PXOA 1OVNA 2H1BA 2KP1A 2IMEA 1U87A 4L8EA 4DVCA 1TDIA 4IHUA 5CAXA 4XIHA 3ZRDA 2FA4A 2DSAA 1S3CA 3GTUB 3LYPA 4K0GA 4CHSA 3GKNA 2I4AA 1M7TA 5DAKA 2IL3A 2KUCA 5F8BA 3TKSE 4LA1A 1B8XA 1OE8A 3H79A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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