4TXVA

Crystal structure of the mixed disulfide intermediate between thioredoxin-like tlpas(c110s) and subunit ii of cytochrome c oxidase coxbpd (c233s)
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
175
structure length
175
Chain Sequence
GDPACRAAVATAQKIAPLAHGEVAALTMASAPLKLPDLAFEDADGKPKKLSDFRGKTLLVNLWATWCVPSRKEMPALDELQGKLSGPNFEVVAINIDTRDPEKPKTFLKEANLTRLGYFNDQKAKVFQDLKAIGRALGMPTSVLVDPQGCEIATIAGPAEWASEDALKLIRAATG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title How Periplasmic Thioredoxin TlpA Reduces Bacterial Copper Chaperone ScoI and Cytochrome Oxidase Subunit II (CoxB) Prior to Metallation.
pubmed doi rcsb
molecule tags Protein binding
source organism Bradyrhizobium diazoefficiens
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein TlpA
total genus 46
structure length 175
sequence length 175
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4txvA00
4IQAA 2JU5A 4TXVA 1VF3A 3IRAA 1HNBA 3TCOA 4NHWA 4ZB9A 5HFKA 3WYWA 4CHSA 1U3IA 2C0EA 2DJKA 2FUG2 1TK0B 2R4VA 1PL2A 3RHCA 2REMA 3FR3A 5DJMA 3LYKA 1ML6A 1WRYA 3GUSA 3C1SA 1SYRA 3UVTA 4X0XA 2G0FA 1GSUA 2NVLA 1EZKA 3H79A 4PQIA 1F37A 1XIYA 2HFDA 5LD0A 3ZTLA 1EGOA 2KOKA 1ZL9A 4HU9A 3VURA 2LQQA 1XW5A 3VWXA 5D9WA 2CAIA 2EIQA 4HUAA 4POLA 4MMMA 5IMZA 3WT2A 1EGRA 3F8UA 2DIZA 4GQCA 1U88A 1GH2A 1H75A 3D22A 2H70A 3TKRA 1GRXA 3H8QA 3TGZA 3MNGA 4N10A 1YDKA 5JWQB 4I5QA 4RQRA 1GSSA 3SWLA 3CBUA 2XHFA 3I69A 5AIXA 2XBQA 3VI5A 3F4SA 4ECIA 2I1UA 3KP8A 3WGDA 1Z6NA 2LSTA 1PSQA 5JWRB 1SJZA 3QAVA 1R26A 3F3RA 2YWNA 4PUFC 2BJXA 3P8WA 4OFNA 5ECMB 4XTSA 2L4CA 4XIHA 3LSZA 3LEFA 1BJXA 1G6WA 4ZL9A 4AJ6A 3F63A 2B5YA 1VRSD 3VWWA 4MF6A 5J41A 1XBSA 2GDRA 4GXZA 3KMOA 1B4QA 4BL7A 2DMMA 4HJ2A 3RBTA 5F8BA 3GSSA 2WDUA 1TOFA 5IO0A 1X5CA 4NWYA 4KE3A 5CNWA 1THOA 2KP2A 4V1Ag 3VPQA 3LGCA 5AIVA 4L5OA 1XWAA 1B48A 4IQ1A 2YZUA 2ES7A 1XWCA 1TRVA 3GKKA 1TU7A 3GN3A 1WE0A 4IELA 5INYA 1SJIA 1WJKA 4OFTA 1TU8A 4EC0A 3US3A 5ABRA 2C8UA 3TRQA 1Z3EA 4ZB6A 3GH6A 3FR9A 5CRHA 4PGTA 2AUVA 1TDIA 4Z7XA 3DWVA 3TJKA 3HZ8A 2H6XA 5DDLA 1R5AA 4NPBA 3BCIA 4ML1A 2AJQB 3QFBC 2OBIA 3Q18A 4MH3A 3KTBA 4GF0A 5HFGA 2GSQA 1TJDA 3A2WA 1CQGA 2VD1A 4FYUA 4HOJA 2DMLA 4LMWA 5FWGA 1GNWA 4LL1B 5IO2A 3EINA 1TTZA 2B3SA 2J9HA 2C80A 4OO4A 2E0QA 5JCWA 3UBKA 4KDYA 3ZMKA 3KMNA 2CVBA 3ERFA 2PERA 3EMPA 4MCUA 1U3AA 4FO5A 2L57A 1TXXA 3HJOA 1M0UA 1A0FA 2R6KA 3KEBA 2C1YA 1FB6A 3ZVJD 4K0GA 3DIEA 4MJAA 3ZFLA 1PKZA 5EL8A 3APQA 1B9XC 4HU7A 5ELAA 1MD4A 5KN1A 1AIUA 1K0CA 2DBCA 3BBYA 3HVSA 4D73B 5ECSA 3D4MA 2KHPA 2RM5A 3L9SA 3DD3A 3R2QA 4J56E 2EC4A 2L4QA 2K8SA 2L59A 5J9CA 1DE1A 1U6TA 3FEUA 4TVEA 2LJAA 4HS1A 4ECJA 5LNKe 1XOBA 2V32A 4IW9A 4HZ2A 1SU9A 3QPMA 4BA7A 2H1GA 4MJEA 2E2GA 2O89A 3VLNA 4L0UA 2FGXA 2PVQA 3E3EA 1Z7RA 3UJ1A 5DQYA 3GKXA 1XFLA 4XS1A 3IOSA 5L71A 1YQ1A 4OMVA 1B4PA 4PNGA 3IE3A 5DCGA 3ED3A 3K8NA 2P31A 5D9XA 4Q5NA 3HY2A 2H0IA 3HKRA 2JSZA 2NDOA 4POKA 1V40A 1T4YA 2VCZA 2CT6A 1EP7A 5COHA 1THXA 1OC8A 3EC3A 1EOGA 2LNSA 4MA9A 3LORA 3UMAA 1GP1A 3IDVA 4K7NA 1EEJA 2NPBA 3HZ4A 1BX9A 4IGJA 4V2MA 4D73A 3HA9A 3M9JA 2CV4A 4JEDA 2DJJA 5G5FA 1XXUA 5HQPA 4MDCA 2H19A 1PN9A 4RI7A 5DJLA 4JZQA 4MF7A 2OA7A 1A2LA 4POBA 5IMDA 3PGTA 2CZ2A 1GSFA 1SL0B 1R4WA 2PPTA 4EE0A 4GQFA 2I9HA 4ILFA 3G9BA 3VPTA 4MF5A 4Q5RA 4OO5A 2FCHA 2J23A 2B5XA 3L78A 5IPHA 1UA5A 2XPDA 2IFQB 16GSA 1TRWA 3IAS2 1FG4A 3FYGA 1PD21 1AW9A 4JRRA 1HNAA 3BD2A 4ZB8A 1XPVA 4EO3A 1PQNA 3GURA 1OAZA 4GSSA 4MZWA 4MZCA 1F2EA 1WWJA 1ABAA 1Y6EA 2B7KA 3ISOA 5CREA 2C0FA 4ISDA 1GSQA 1MTCA 1WIKA 2NTOA 2GZPA 2LKUA 1EEMA 1GSDA 4EKZA 3EURA 1U87A 4BPYA 1RW1A 2H76A 1EV4A 3V1WA 4K7IA 3BJ5A 3W8JA 4F03A 4ZXGA 2CZ3A 3L0HA 5H5RA 1M9BA 4O5RA 3GTUB 3WGEA 1OKDA 4QL7A 3F9UA 2VL3A 1T1VA 2VAFA 2H74A 5G1KA 2LEGA 2X99A 4TR0A 3ZLPA 2C0GA 3IK9A 2EIRA 2N5BA 4MJBA 4IVFA 1FHEA 4MPGA 3QCPA 3QOUA 1W89A 1VF4A 3DKSA 5G31A 13GSA 4I2TA 4ID0A 3ZITA 2H8LA 1JZOA 1G0TA 2IFQA 2HSHA 2JZTA 2H73A 1HQOA 5IQYA 6GSVA 2LTKA 4KAEA 2TRCP 4XS6A 4RQXA 4MJCA 1GLPA 1S3AA 4OD7A 2B1LA 2FA8A 3GIXA 4KSMA 4HQSA 4TR4A 1PX6A 1M2DA 1ZZYA 2QKEA 4RUVA 3GYKA 2GTUA 4OCEA 1GTIA 3ME8A 4O7HA 4BWQA 3MSZA 5H5QA 2WULA 1K3YA 5KEJA 12GSA 2WJUA 2OJLA 1ERTA 4EL1A 2LRNA 5A4VA 5ECHB 4ZL7A 1ERWA 4MK3A 4GLTA 2WCIA 1GSYA 3GTUA 2HRFA 4G2EA 2GVPA 4IKHA 4K9ZA 2HRNA 3ZVJA 4HDEA 3D0ZA 4X43A 5E4WA 2M72A 2YJ7A 5CYYA 2HE3A 5F0GA 3C73A 2F8FA 2B6MA 3LFLA 2VCTA 2H6ZA 4KSOA 5JCGA 1XW6A 3C7MA 3NZNA 3ZIJA 4NHZA 1ON4A 1A2JA 3UBLA 2H0HA 3FZ5A 3MWHA 1DUGA 3QD9A 2ZNMA 4LMVA 1ZMAA 2YWOA 2X8HA 3U5RE 3FY7A 2O85A 3C8EA 1O85A 5B8AA 5DQSA 1A0RP 3QR6A 3UARA 3EE2A 1C72A 4DSQA 1PA3A 1JHBA 4OFMA 4MP4A 1XOAA 1KNGA 4YAVA 3D21A 1JLWA 2IL3A 2VM2A 1SKRB 3IXRA 4MABA 4BWSA 3ERGA 2LJRA 4FH8A 2PGTA 3P7XA 6GSUA 2V6KA 5CO3A 3C71A 1GTBA 2HSYA 4HZ4A 2HZFA 4KA0A 4N0VA 4E8EA 6GSWA 4RI6A 2DIYA 3FZ9A 1O81A 1W4VA 5B6MA 4NAXA 2F3MA 3N5OA 1DBYA 4IP6A 4TR3A 3LXTA 1JZRA 1ERUA 4F2IA 1DSBA 1B8XA 3TKSE 2YV7A 5EPFA 1GNEA 5C04A 3FZAA 4CDOA 2GZYA 3KXOA 11GSA 1ZGNA 2IMIA 4OCFA 22GSA 5F05A 4E8HA 3HJPA 5HR3A 17GSA 2V1MA 4GWRA 4TW5A 1TK5B 3DYRA 1HNCA 5ID2B 1K0MA 1SK0A 5G30A 4EUYA 3GKMA 3TUEA 4MH2A 3M1GA 4L0WA 3FW2A 1B9YC 2RIIA 4BVXA 2MZCA 2AB6A 3HCZA 2FY6A 5FT3A 4WR4A 1QUWA 4O32A 4DSSB 1F6MC 1NSWA 5KN0A 1TKDB 4ZL8A 2HXKA 2YPMA 1OC9B 1A8YA 2JZSA 1OYJA 4F82A 1SKWB 3HYPA 5A4UA 2VCXA 3WGXA 1YJ6A 2C4JA 1TK8B 1F9MA 6GSYA 3ZZXA 1HD2A 3GSTA 4KCAA 3KH9A 5GAND 5DBQA 1K0AA 3PR8A 4WKWA 5CRWA 3P90A 5AN1A 3D5JA 1O73A 1QXHA 1FW1A 1X9WB 2LUSA 5GZZB 3L4NA 1K0OA 3TKQA 1V57A 4EDYA 1JFUA 1HYUA 1OKTA 3J7Yk 3UAPA 1V98A 2FWEA 5CRGA 2VD0A 10GSA 2WGRA 2H72A 1YZXA 6GSXA 3C1RA 5ID2A 19GSA 3KCMA 2PBJA 1JZDA 2JZRA 2O7KA 1E2YA 4IN0A 1M7TA 5ECKB 2VCWA 1MDKA 1O6JA 4PNFA 5A4WA 2R3XA 8GSSA 3CXGA 3F0IA 2F8AA 2AHEA 4O92A 2PWJA 2HNLA 4DSSA 4DEJA 3G7YA 3LWAA 5ECNB 2E7PA 1GWCA 2H1DA 4PUAA 1OC9A 3VI7A 1QQ2A 4YQMA 2DLXA 1A2MA 2CA8A 4KCEA 3RDWA 3H93A 4GCIA 5CAXA 3FHKA 5D8IA 1QK8A 3FRCA 3CSIA 2R5GA 2EIOA 2L6CA 1XVWA 1T00A 2K6VA 3IHQA 4PX1A 1A24A 3Q74A 3GHAA 1AUCA 5IMVA 1MDIA 4P3YB 1OVNA 5HR1A 3FK8A 4GTUA 2OACA 2WFCA 2VLUA 2C3QA 1XWKA 3KJYA 5G1LA 2H01A 2L6DA 4I6XA 2B7JA 5B6NA 1I5GA 2QC7A 2GSSA 14GSA 5ECLB 1MD3A 1BYEA 3APOA 2R37A 5H5SA 2YCDA 2PUKC 3HJMA 2IIYA 3CRUA 3TRXA 2I81A 2ALBA 4GRFA 4JU5A 1GSEA 2CAQA 3RPNA 1R7HA 2OBKA 3F6FA 4NXIA 2LRTA 3H4KA 1SD9A 3HD5A 3I43A 3S9FA 1OE7A 3LQ7A 4JR4A 3TDGA 4CW9A 3TJGA 3J7Yb 2F9SA 4IJIA 2GS3A 2FD3A 2O8VB 3UEMA 1TRUA 2XC2A 3M9KA 4V1Ap 5G2ZA 2BTOT 2NBSA 1H4OA 2A2RA 1XZOA 2VL2C 3GX0A 1F3BA 2MBSA 5CRDA 5DAKB 4KNDA 5D9VA 4KGIA 4N0ZA 2V2GA 3F4TA 2GQKA 2H0GA 2JACA 2O87A 5IOWA 1VGLA 1V2AA 4QQ7A 5KN3A 1MEKA 1IYIA 2I3YA 2P5RA 5D9TA 2MMZA 1UC7A 1UVZA 3CMIA 1GLQA 4DSRA 1F3AA 1X0RA 2D2ZA 5ECQB 1NHOA 5HR0A 2JL4A 3QAWA 1J9BA 5B8BA 2CVDA 5DALB 1TI1A 3NIVA 2DJ1A 3IV4A 1G7OA 3EVIA 1QGVA 2IMKA 3TOUA 4TOPA 2YV9A 3W6GA 1URMA 4K7OA 5FHIA 4HI7A 1K3LA 4PURA 4AJ7A 3CSHA 2GGTA 1K3OA 3KP9A 2HLSA 1GL8A 3PH9A 5D73A 2OE1A 2IJYA 1SK2A 3L9UA 1ACVA 1YY7A 3KIJA 1FB0A 5J9BA 1J0FA 4XS4B 3GA4A 4WXTA 3HHVA 3N9JA 2LRCA 1GTAA 2CQ9A 1AAZA 2VL2A 2H1BA 3O76A 2DSAA 2L5OA 3P2AA 2C3NA 1KBNA 4WR5A 3I6AA 4MPFA 3A3TA 5D96A 4LL4B 2YOIA 3QAGA 3KD0A 1TW9A 2YANA 2M46A 1T4ZA 4K0NA 2PMTA 4JE1A 4TR1B 1NM3A 1WP0A 2DJ2A 1ERVA 6GSSA 1SENA 1BG5A 1TRSA 5IIZA 3TKSC 1LJRA 2JADA 3IR4A 3FKFA 1ST9A 1Z9HA 4PQ1A 1BAYA 2L5LA 3TOTA 3TJJA 1QMVA 1EOHA 2VLVA 2ZCTA 5DALA 2PN8A 2ON5A 4YH2A 5EY6A 4YQVA 4FIWA 1CQHA 3QMXA 1Q4JA 3DVXA 1YEXA 2RM6A 1Z6MA 4KX4A 1PGTA 3A5WA 2MMNA 3DXBA 4FYBA 2X8GA 3OR5A 3H1NA 4N11A 4ECCA 5F07A 5ENUA 2P5QA 1SJ6A 1O8XA 3EYTA 1PL1A 3AY8A 2CX3A 3VWUA 1V9WA 5EVOA 4XS4A 2B1KA 4WBJA 3APSA 1OE8A 2LQOA 2Z9SA 3WD6A 3E0UA 2IMFA 2HI7A 1R5PA 2VCVA 4NV2A 1DE2A 2CVKA 5GSTA 3KM6A 2DJ0A 2VO4A 3CSJA 3DMLA 3HVXA 2X64A 5AISA 4IHUA 1ZCPA 4IBPA 3CYNA 1S3CA 20GSA 4F9ZA 2M80A 2H66A 3IPZA 3TB2A 2TIRA 4TR1A 1M2AA 3GL5A 4ML6A 1Q98A 2H75A 2HT9A 3QDNA 2FHEA 3F4RA 3TKSA 1GUKA 4XHMA 1V58A 2GQLA 1PX7A 1IYHA 3RPPA 5E59A 3GRXA 4J2FA 1J08A 3MDKA 2E2MA 4KB3A 4ZBBA 3G7IA 4FYCA 3Q6OA 2IN3A 1VF1A 2KUCA 4G10A 2MMAA 2AYTA 1T3BA 2LS5A 5HR2A 3ZREA 2AV4A 3G7JA 3ERWA 3SBCA 3FZ4A 1ZYQB 5DCHA 3UVHA 3O6TA 1E6BA 2FA4A 3CTFA 4G9HA 3ZIVA 4ZBAA 4TN8A 2ZUPA 2GLRA 3HXSA 1K0DA 1USBA 4POMA 5LCZA 1AC1A 1EP8A 3F6DA 4MZBA 4L8EA 1ZOFA 1TP9A 3HDCA 1LU4A 1TI3A 2QSIA 3UIWA 1XWGA 4WF4A 4N30A 1QFNA 4EDZA 1Z7PA 3BOAA 1MDJA 1KEBA 3IAM2 5CP1A 3DGQA 2GZZA 1GUMA 2XPEA 4F0BA 5ECOB 4WF5A 5JCUA 2K8VA 1G7EA 1I9DA 4Q5FA 3EWLA 1EV9A 2YN1A 1NW2A 2V6OA 2WB9A 1Z5YE 1GULA 2DJ3A 2ON7A 5F06A 4XCSA 1SL2B 4MLYA 3D4TA 2LV3A 3KTLA 1OC3A 4NMUA 3KGKA 18GSA 1S3DA 2P0GA 1XCCA 3M8NA 4HQZA 5IMFA 3ZL5A 4GSNA 3CRTA 1FO5A 2WRTA 4YAPA 3U6VA 1T7PB 5IMCA 1X5DA 1FAAA 4AF2A 3DVWA 1NHYA 4TRXA 2K18A 2K9FA 5KN2A 1YF0A 5AGYA 4EXJA 7GSSA 1YF1A 1X9MB 2YJHA 2YWMA 1VF2A 1LBKA 2H6YA 2X8CA 5ELGA 2FWFA 3ZFBA 3GX8A 4PQHA 1X5EA 1GTUA 4XRDA 4ACSA 1O8WA 3PINA 2G2QA 1FOVA 3IA1A 4IJ3A 1K0BA 9GSSA 3GNJA 4JR6A 4ZILA 2RUEA 2TRXA 2A4VA 1SYXA 2OE3A 1BEDA 3A2XA 1N8JA 4LA1A 2AAWA 1WMJA 3LJRA 3VWVA 4G19A 4I2UA 4PXOA 4BVYA 5D93A 2WS2A 3LG6A 3LXZA 3IBHA 5DVBA 3O3TA 3EU3A 1WOUA 4KW6A 1X9SB 4IS0A 1ILOA 2HYXA 1Y25A 3IC4A 4KUNA 3E9JB 5B7CA 3EU4A 1O7UA 2MMOA 3CTGA 1ZYEA 2OE0A 4KDUA 2IPAA 2YP6A 1YEPA 2H30A 5GSSA 3DRNA 5ECIB 4WETA 3RHBA 3ZRDA 1SKSB 2PVOC 2LJKA 3RAZA 1XW9A 1JLVA 4ZBDA 3A2VA 2VLTA 4WEYA 1EWXA 2H1AA 1JZWA 2VM1A 1SL1B 1A8LA 1M2BA 4KDXA 4EF0A 3BCKA 2GT5A 1XWBA 3HVVA 1GUHA 2QGVA 2F51A 1RQMA 4TXOB 2I4AA 1T8EB 1AQVA 2WZ9A 2VIMA 3WT1A 4K1FA 1M99A 5J4UA 2MYGA 4K2DA 4QL9A 4EVMA 3VFIA 3VK9A 2LNTA 5G5EA 4ZIJA 2FLSA 2IMDA 4YQUA 4DVCA 2KP1A 4ECBA 2HZEB 1YKCA 2N5AA 4WBRD 5ECRB 4HEA2 5IOXA 1WPIA 1UN2A 2RLIA 3TKPA 4NV5A 1PMTA 5IMAA 3KH7A 3L9VA 1A23A 5GAPD 2FNOA 2JSYA 3KZQA 2VUPA 2KLXA 2N5FA 4J57E 2V41A 3GFKA 4TKYA 3F3QA 3MAKA 6GSTA 1SD8A 3LYPA 5C00A 3JCML 3Q19A 3GV1A 3ZYWA 4H86A 1RK4A 4OWYA 4Q5QA 4HJMA 2BMXA 2PU9C 3TJBA 2FWHA 1AQWA 4I8BA 4L5LA 5IM9A 4V2LA 2FWGA 3EMXA 2VL9A 5A5KA 1G6YA 1KTEA 1FVKA 2YZHA 1XVQA 3GL3A 3GKNA 2MBTA 4AGSA 1SK1A 3FR6A 2B5EA 1YKAA 4K6XA 3ZMLA 2XBIA 4K8MA 4TXOA 4AJ8A 4V2NA 2H71A 2DC5A 2VOCA 1K0NA 2C0DA 4I97A 3M0FA 4ULXA 4JBBA 3GH9A 2A2SA 3NOFA 2IMEA 4F0CA 2C3TA 3M3MA 2YWIA 1BQ7A 1FVJA 3W8SA 3TRPA 1N2AA 2RUFA 2GSRA 2YNXA 2HZEA 5DAKA 4XRAA 2GSTA 2CX4A 4IP1A 5HFIA 1AQXA 3UOMA 5IPGA 1PKWA 3I9V2 4X1UA 3DEXA 4LLRA 2OKAA 2IWTA 3D6IA 3ME7A 1M9AA 3GMFA 2VCQA 5JWOB 4KH7A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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