4ULXA

Crystal structure of ancestral thioredoxin, relative to the last common ancestor of the cyanobacterial, deinococcus and thermus groups, lpbca-l89k mutant.
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
SVIEVTDENFEQEVLKSDKPVLVDFWAPWCGPCRMIAPIIEELAKEYEGKVKVVKVNVDENPNTAAQYGIRSIPTLLLFKNGQVVDRKVGAQPKEALKERIDKHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Mutational Studies on Resurrected Ancestral Proteins Reveal Conservation of Site-Specific Amino Acid Preferences Throughout Evolutionary History.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LPBCA-L89K THIOREDOXIN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Synthetic construct
total genus 31
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature ec 4.7.1.4:
pdb deposition date 2014-05-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ulxA00
4ULXA 4POBA 4IVFA 1GRXA 2RUEA 3M0FA 2L4CA 5D93A 3IK7A 2L6DA 1O6JA 3GH9A 3EMXA 3A5WA 3VPQA 1TTZA 1ZZYA 5B6NA 1A23A 3CSIA 2OJLA 1G6WA 1U87A 3HZ8A 4BPYA 2IJYA 4WBRD 3EC3A 3M3MA 3F8UA 5JWQB 1T4ZA 2KP1A 3TGZA 4POKA 3U5RE 4BL7A 1B4PA 3F4TA 3DGQA 1AQVA 4XS1A 4K8MA 2L5LA 2MMOA 4XCSA 4TRXA 1N2AA 3IAS2 1CQHA 1AAZA 1AQWA 4BWSA 2LQQA 1FG4A 1KNGA 1OYJA 5CRGA 1ML6A 1FVKA 3E3EA 5ID2B 3VLNA 4MJCA 2H8LA 5IMVA 4K2DA 1GSEA 1AUCA 2FWGA 2YNXA 4MF5A 2L6CA 1SKWB 2F9SA 2RIIA 1JZOA 4KH7A 1SL2B 1ZGNA 2YANA 5G1LA 3MNGA 2P31A 3H4KA 4HJMA 3H93A 2NDOA 1U3IA 2YP6A 4RUVA 4FYUA 3H8QA 2F51A 2R5GA 3APOA 3ZREA 2A2RA 3IE3A 4LLRA 5J41A 3TJFA 3GN3A 3BOAA 2LUSA 5IO0A 4PGTA 5F0GA 2CA8A 1PMTA 4KAEA 3GL5A 4ML6A 2FLSA 1FB6A 4FO5A 4WXTA 3QFAC 1XOBA 3UMAA 3WGEA 2HT9A 1O73A 1JFUA 5EVOA 3ME7A 3GSSA 1X9WB 5CP1A 5IMCA 5ECSA 1HD2A 2R6KA 3MAKA 3I69A 2YOIA 3MDKA 4WF4A 2A2SA 5IO2A 3CRUA 3S9FA 5HFGA 3GH6A 3KCMA 4KE3A 2QC7A 1USBA 2OE3A 1MDIA 2WS2A 1TJDA 2L4QA 2M46A 2VD1A 4V1Ag 2OBIA 2JSZA 2X8GA 2YZUA 11GSA 3IAM2 4MJBA 4KGIA 3LFLA 2X8HA 3KTLA 4EE0A 2H1GA 1M9AA 4GQFA 1SL1B 3ZITA 2PVOC 4I2TA 1XWGA 4QL7A 4CDOA 2B3SA 3UJ1A 5IQYA 2YWNA 4GRFA 5IOXA 5AIVA 2GGTA 1EP7A 1XVQA 4AF2A 3WGXA 5DALB 5IOWA 4GXZA 2LSTA 5H5SA 2DC5A 4P3YB 3IV4A 2AUVA 5FWGA 16GSA 4QQ7A 2GQMA 2H1BA 5DCHA 2VL2A 4MJAA 1GSYA 5AN1A 1UN2A 10GSA 4MH3A 1THOA 2IN3A 1JLVA 2L57A 2ZNMA 3L9UA 2L59A 5INYA 2WB9A 1BEDA 2EIOA 3CXGA 1PD21 4NHWA 2MMAA 4G9HA 5DAKB 3PR8A 1V9WA 2DJ3A 6GSWA 2LEGA 3C1RA 2LRCA 3KH9A 3RAZA 3W8JA 3TRQA 5CRDA 3LORA 1QXHA 4RI6A 3UVTA 3KIJA 1T4YA 2JSYA 1WOUA 1HNCA 3Q18A 1XW9A 2C0DA 1K0OA 4MMMA 1MEKA 1NHOA 2K8VA 4IJIA 1EGRA 5IMDA 4IELA 4MK3A 4XS4A 1BG5A 4PUAA 4GLTA 3LEFA 1Z3EA 4J57E 1SKSB 2FD3A 4J56E 4K7NA 5ECHB 1TRWA 5J9BA 1SKRB 3FEUA 1ERWA 4KUNA 2V6OA 2FNOA 2WJUA 5CNWA 5HFIA 1SYXA 1PQNA 3C1SA 2VCXA 5LNKe 1PN9A 4HU9A 2VL9A 1TRSA 4IP6A 3D22A 3GX0A 2DJKA 4H86A 3RHCA 1SL0B 4TN8A 4PNGA 2VLUA 3VWXA 5DDLA 3UBLA 4ECJA 2GLRA 1JHBA 1SK2A 3ZMLA 3ZRDA 2TRCP 1TU8A 1ERTA 5D9XA 2N5FA 4ZB8A 3VWUA 2H0HA 2LJRA 1SENA 3TKRA 3MWHA 1V98A 2YV7A 4QL9A 4X0XA 5D9WA 3EU4A 2YN1A 2HE3A 3GL3A 1PX6A 13GSA 1BYEA 1FHEA 4K0NA 1O81A 4OMVA 3UAPA 5IIZA 1K0MA 3CBUA 5HR1A 3QR6A 4K6XA 2C3QA 4DSQA 1UC7A 3P8WA 3DMLA 2GDRA 2K8SA 3N9JA 3GRXA 3ME8A 1HQOA 2LJAA 4K7OA 2CX4A 2ALBA 3TKSA 3LG6A 1G0TA 1F6MC 4JU5A 4ZBBA 2AAWA 1C72A 4HDEA 5G2ZA 4HOJA 1HYUA 1SK0A 5GSTA 4L5LA 4K0GA 3RPNA 4KX4A 2CAQA 2X8CA 6GSUA 4MPFA 4YH2A 1Y6EA 2VCVA 3IC4A 3APQA 3M8NA 3DVXA 3UOMA 3QAGA 2H71A 19GSA 1T3BA 2MZCA 4MZWA 1ZOFA 2MBSA 1G7OA 1B4QA 4TR4A 1GL8A 3G7IA 3D0ZA 1YF1A 3F63A 3M1GA 3ZFLA 5KN0A 7GSSA 4BWQA 1TDIA 3FZAA 2IMDA 4O32A 5E4WA 4ZB9A 4DEJA 1XWBA 2KLXA 4MP4A 1GNWA 3IA1A 2NBSA 3TKSE 2H30A 2QKEA 4TR3A 1GTAA 2VM1A 2WFCA 1BQ7A 3GUSA 2E2MA 3ZMKA 2KUCA 4HUAA 3RBTA 4POLA 1OKDA 4TR0A 4LL1B 4MPGA 3HVVA 3GHAA 1YKCA 3ZLPA 2O7KA 3HA9A 2PERA 4WETA 4F03A 4NAXA 2GQLA 4YQMA 2X99A 4IJ3A 2GSRA 1FW1A 1A8LA 2GQKA 4YQVA 2LRNA 2PVQA 3Q74A 5HR0A 1FOVA 4V1Ap 2QGVA 3APSA 1QFNA 2H1DA 3OR5A 4N10A 4TXOA 3SBCA 2XBIA 1V57A 3KTBA 5EY6A 2JZRA 5D8IA 12GSA 5C04A 4LMVA 1TK5B 4K1FA 1K0CA 4JRRA 3FZ4A 4V2NA 5DJLA 3L9SA 1R5PA 5G5FA 3NZNA 2VCZA 2H6XA 3VI5A 1JZRA 5B6MA 4ZBDA 2LKUA 2GT5A 1W4VA 3PGTA 3DYRA 1MDKA 2HNLA 2H74A 5B7CA 3TOTA 1FVJA 3GV1A 2JADA 3A2WA 2VM2A 4XS4B 1GSFA 4I6XA 5ENUA 3KP9A 1M2DA 5ECNB 4IW9A 4EF0A 4PXOA 5ELAA 4YAPA 1M7TA 4ECIA 1F3AA 2EIQA 3N5OA 1ZYQB 2VIMA 1W89A 5G5EA 1N8JA 1BX9A 2TRXA 3M9JA 4KSOA 5DJMA 1NW2A 2DLXA 2X64A 2GZZA 1B9XC 5DQYA 4L5OA 1LBKA 1YY7A 3ISOA 1XIYA 5DQSA 3IXRA 1B8XA 4EVMA 1A2JA 2LRTA 3UL3A 5G1KA 3FKFA 1XWKA 4D73A 4G2EA 5EPFA 2CVKA 4JBBA 3EWLA 5ECMB 3QAVA 2WULA 2JZTA 1V2AA 3H79A 3ZL5A 2H0IA 2IMEA 4IS0A 5KN1A 3TDGA 3WGDA 1RQMA 4E8EA 3VURA 3F4SA 2EIRA 3LXTA 4IQ1A 1GSDA 1TW9A 2ON7A 1YEXA 1SD9A 4NV5A 2CV4A 4ISDA 3UIWA 2VLVA 1WMJA 1T7PB 1DBYA 3H1NA 2R37A 2ZUPA 4ZILA 4TVEA 1OC8A 3EU3A 2I4AA 2C3NA 3ERGA 5G30A 4EKZA 1M9BA 3SWLA 1T8EB 2B5YA 4JEDA 3IDVA 3D4MA 1K0NA 4IKHA 5J4UA 2I9HA 1VF4A 4Z7XA 4TKYA 3FK8A 5HR2A 4I97A 1XW5A 3C73A 3HHVA 4IHUA 3RPPA 4PUFC 3QD9A 3CMIA 5IMZA 3IOSA 1S3DA 2H73A 1ZL9A 3WT2A 1SD8A 3LJRA 1GTBA 3HD5A 3IPZA 2FA8A 3DKSA 1F2EA 2CZ3A 2J23A 3G7JA 4DSSA 2DSAA 2PGTA 2AJQB 4OFNA 1EOHA 1O85A 2LS5A 4FYBA 1QQ2A 5D96A 1ACVA 5ECPB 3PH9A 2VL3A 4OO5A 4HZ2A 2C8UA 1M2BA 1I5GA 1VF2A 1H4OA 3KD0A 1ON4A 1S3AA 3ZZXA 5ECOB 4GSNA 1GUHA 1TU7A 1NM3A 1A2MA 3QFBC 4RQRA 5EL8A 2JL4A 1ABAA 1VGLA 1IYIA 1O8WA 3FR3A 6GSXA 2OE1A 2LTKA 2O89A 2O85A 1PKWA 1GLPA 1T1VA 1X5EA 3W6GA 3O76A 1V40A 2GS3A 3D4TA 4AGSA 3Q6OA 4ZL7A 4XS6A 3HKRA 3IRAA 3BCKA 1TRVA 1QK8A 2G0FA 4ECCA 3HZ4A 4DSRA 4O7HA 5CRHA 2O8VB 2AYTA 3DRNA 4L8EA 1OC9A 4OCFA 2E2GA 3FW2A 1WP0A 2FWEA 2VCWA 2YWIA 3VI7A 3F3QA 1GH2A 2M72A 5DCGA 4ACSA 1A2LA 4TXOB 2YCDA 1K3LA 4NPBA 1H75A 3KMNA 2AV4A 5FT3A 5F07A 2DMMA 2RM6A 1G7EA 1VF3A 3F0IA 3QDNA 1X5CA 1X0RA 2GSSA 4K7IA 5KN3A 1A24A 3HVSA 3HXSA 1KBNA 2H76A 2EC4A 6GSSA 3F9UA 1AIUA 1OKTA 4GWRA 1QUWA 5F05A 6GSYA 1GNEA 2H6ZA 2MMNA 2G2QA 4V2LA 1M0UA 3CYNA 3P7XA 4PNFA 2VUPA 3TJBA 2B5EA 4NV2A 4GCIA 2IIYA 2RUFA 4GF0A 1TI3A 3QPMA 4ID0A 2P0GA 1Z7PA 2N5AA 4LA1A 4TW5A 4F0CA 1A0RP 1FB0A 3ED3A 1TXXA 4K9ZA 2B7JA 4POMA 1VF1A 2L5OA 2YWMA 4I2UA 2YPMA 4X43A 3O6TA 4TR1A 3LYKA 2HI7A 5GZZB 2PBJA 2DJ1A 5IM9A 1MD4A 2VL2C 6GSVA 3HVXA 2OADA 4HEA2 1OVNA 2HFDA 5DBQA 4D73B 1R5AA 4PQIA 5AIXA 3LXZA 2KHPA 4ZBAA 3HJPA 2FCHA 2XBQA 3A2XA 1SK1A 3GKXA 2XPEA 5LCZA 2BTOT 1ERVA 2H66A 2FY6A 2FHEA 14GSA 4MF6A 5D9TA 1MDJA 3GNJA 4BA7A 1WWJA 4ML1A 1U88A 1YKAA 1R4WA 3TJGA 2KOKA 2F3MA 4HJ2A 2E0QA 1AC1A 3TRPA 3US3A 2CQ9A 5JCGA 4AJ6A 4OFMA 4ZL9A 4MF7A 3UVHA 1FO5A 3QAWA 2OE0A 2LQOA 2B5XA 1TK8B 2K9FA 2H19A 1S3CA 4KCAA 5ELGA 2HSHA 2AB6A 1ZYEA 4KB3A 3G9BA 1EEMA 2LV3A 4TXVA 3TCOA 3ZIJA 1ERUA 3UEMA 2K6VA 1X5DA 1MD3A 1K0AA 4PQ1A 2V2GA 1DE2A 1THXA 2HSYA 4OO4A 2H6YA 2YZHA 3ZIVA 2PUKC 3GYKA 4OWYA 4DSSB 3PINA 2XHFA 1F37A 2NVLA 1WRYA 2C3TA 4MZCA 2I3YA 4KNDA 2K18A 4V2MA 2MMZA 1GTUA 3Q19A 1UA5A 1BAYA 1KTEA 5A5KA 4HU7A 1U3AA 3KXOA 2DBCA 2B1LA 1DE1A 3FZ9A 1PKZA 4X1UA 1LJRA 2NPBA 2C0GA 4YAVA 3VWWA 1XCCA 1JZDA 1V58A 2GSQA 3D6IA 3L78A 1QGVA 2MYGA 1ZMAA 2A4VA 1K3YA 2H0GA 2ZCTA 1EP8A 4F82A 1NSWA 2HZEA 3DEXA 1YDKA 4JR6A 1UVZA 4KCEA 2J9HA 1GLQA 2IL3A 3FRCA 4EC0A 2ON5A 3DIEA 1KEBA 3TUEA 3I43A 3A2VA 3KZQA 4ZL8A 2VCQA 3TKSC 1AW9A 1F3BA 1MTCA 3UARA 1OC9B 4RQXA 1YEPA 4KDYA 1PL2A 3GX8A 2RM5A 4NWYA 1Z6NA 5ECLB 1XFLA 3DVWA 4EO3A 3AY8A 2H75A 3BD2A 2GVPA 1SYRA 1OE7A 1RK4A 1BJXA 4WR5A 4XIHA 3HCZA 2IFQA 2QSIA 1R26A 5D73A 2V32A 3W8SA 4N0ZA 5KEJA 3TRXA 1G6YA 4Q5QA 4HI7A 4WR4A 4J2FA 1I9DA 4IQAA 5AISA 3C71A 5CYYA 2VLTA 3G7YA 3CTGA 4PX1A 6GSTA 1K0DA 5IMAA 5CO3A 2B1KA 3BCIA 2H1AA 4ZXGA 2HLSA 2GZPA 2I1UA 2FA4A 3NIVA 1GWCA 2CVBA 3L4NA 3E9JB 2GTUA 1J08A 3O3TA 3JCML 1FAAA 4NXIA 1T00A 2HRNA 5J9CA 3BJ5A 1EEJA 4DVCA 3C8EA 2FGXA 4N30A 4HQSA 2M80A 3J7Yk 4PURA 1NHYA 3GIXA 3F4RA 1PSQA 1F9MA 2HXKA 3HDCA 2NTOA 4TR1B 4CHSA 3ZVJA 3HJOA 1GSQA 5CRWA 5JWRB 2BJXA 3F6FA 4ZIJA 5ECIB 4KSMA 1GSSA 3D21A 4ECBA 2PWJA 4F9ZA 1CQGA 4Q5RA 2OBKA 1XOAA 2VCTA 3KH7A 2PPTA 3KJYA 3ZYWA 2FWHA 4E8HA 3LSZA 1ILOA 3CSJA 1J0FA 1PL1A 4WEYA 1URMA 2IMKA 2V41A 4OCEA 1O8XA 2JACA 3WYWA 5JCWA 4IN0A 4EDYA 3QCPA 3QMXA 1O7UA 4NHZA 1GSUA 3KM6A 5A4WA 2DJ0A 5AGYA 4EDZA 3LGCA 4L0WA 3IBHA 2HYXA 3L9VA 3QOUA 5CREA 1SU9A 4ZB6A 8GSSA 1YQ1A 2REMA 3K8NA 4GSSA 3RDWA 5H5RA 2V1MA 5CAXA 4YQUA 5GSSA 3ZFBA 1JLWA 3CTFA 4MJEA 3GA4A 3DWVA 4JE1A 5JCUA 3V1WA 5FHIA 4EXJA 2HZFA 4ILFA 4WBJA 2P5RA 1M99A 1SJ6A 1Z7RA 3TKQA 1R7HA 2VO4A 3FY7A 4LMWA 3IK9A 4GSTA 22GSA 2H01A 5J5NA 1X9MB 3VFIA 4Q5FA 5H5QA 1XXUA 3TJKA 3MSZA 2PN8A 2WRTA 5HFKA 3L0HA 2LJKA 4MDCA 17GSA 1TKDB 3GSTA 2C0EA 1XW6A 4XRAA 2CT6A 3GKMA 5KN2A 2CZ2A 2CAIA 1XWCA 2OACA 4F2IA 1WPIA 4IP1A 2YWOA 1SJIA 9GSSA 2PMTA 4I5QA 3GTUA 3EE2A 1J9BA 4AJ7A 3J7Yb 5IPHA 2F8AA 5ECRB 4EUYA 3R2QA 4BVXA 3TOUA 2XC2A 2DJ2A 2AHEA 2B7KA 3NOFA 2KP2A 2HZEB 1YJ6A 1DUGA 1A8YA 1TOFA 1TK0B 3ZTLA 1GP1A 3P90A 1PA3A 5F8BA 4MLYA 3HY2A 3EVIA 1B48A 2DIYA 3CRTA 2GSTA 1YZXA 5IMFA 1AXDA 1WJKA 5ECKB 4XHMA 4GTUA 3GFKA 4JZQA 1SJZA 3KGKA 2IFQB 3C7MA 4FH8A 4MCUA 4HZ4A 4Q5NA 3ZVJD 3E0UA 2WGRA 2V6KA 1Q98A 2VD0A 3EYTA 2I81A 5A4VA 1OC3A 5ABRA 3FZ5A 3KP8A 1HNAA 4FIWA 2IPAA 4O92A 5JWOB 5ID2A 2C80A 2WDUA 1EOGA 1RW1A 3TB2A 1WIKA 4G19A 2MBTA 4KW6A 1GULA 5L71A 5HQPA 1TP9A 1OE8A 5COHA 1XWAA 1WE0A 1YF0A 2PU9C 2C1YA 3IHQA 2TIRA 4G10A 3EINA 3D5JA 4I8BA 3GKKA 4MABA 1OAZA 2YJHA 5DVBA 3VWVA 3P2AA 18GSA 1EV9A 4IBPA 5GAPD 4AJ8A 3WT1A 2F8FA 1GTIA 3EMPA 3HJMA 1XVWA 1HNBA 4HQZA 3KEBA 1B9YC 2JU5A 3F6DA 2LNSA 3DXBA 4KDXA 3LWAA 2CVDA 3VK9A 2E7PA 2FUG2 1Y25A 5ECQB 1Z9HA 2XPDA 2C0FA 1ST9A 1XPVA 1X9SB 1PRXA 3ERFA 3WD6A 4EL1A 2GT6A 4LL4B 4N0VA 4MH2A 3DD3A 5HR3A 2VOCA 1Q4JA 4MA9A 3TJJA 5IPGA 1VRSD 1A0FA 3EURA 5LD0A 3BBYA 3FYGA 3I6AA 3TKPA 4F0BA 4OD7A 2FWFA 3U6VA 5E59A 3UBKA 2IMIA 1EZKA 1AQXA 4KDUA 2H70A 3KMOA 2LNTA 5J3RA 2B6MA 3FR6A 1GUMA 2CX3A 3GURA 3I9V2 1EWXA 2BMXA 2YV9A 2WZ9A 4PQHA 1E2YA 5F06A 5GAND 2H72A 2DMLA 5G31A 4KA0A 4TOPA 4XRDA 2YJ7A 2DJJA 2P5QA 5C00A 1Z5YE 1DSBA 3VPTA 1M2AA 1JZWA 2VAFA 4N11A 4GQCA 20GSA 3F3RA 2Z9SA 1GUKA 4WKWA 2WCIA 3A3TA 5DALA 1PX7A 2GZYA 2IMFA 1TRUA 3HYPA 4HS1A 5B8AA 1ZCPA 3FR9A 3IR4A 2OA7A 2ES7A 2JZSA 4WF5A 1IYHA 1EV4A 4BVYA 4RI7A 3CSHA 5B8BA 2R4VA 1XZOA 2O87A 2R3XA 1XBSA 4OFTA 3LQ7A 1LU4A 3RHBA 1E6BA 5A4UA 1QMVA 4XTSA 3M9KA 1K0BA 5DAKA 5D9VA 1U6TA 4JR4A 2C4JA 2OKAA 4L0UA 4CW9A 2IWTA 1PGTA 3LYPA 3GMFA 2DIZA 2D2ZA 2R2JA 4FYCA 3FHKA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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