4WETA

Crystal structure of e.coli dsba in complex with compound 16
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
187
structure length
187
Chain Sequence
QYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Application of Fragment-Based Screening to the Design of Inhibitors of Escherichia coli DsbA.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
total genus 63
structure length 187
sequence length 187
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.8.4.2: Protein-disulfide reductase (glutathione).
pdb deposition date 2014-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4wetA00
3KP8A 1PGTA 1MD3A 2OE0A 1SKRB 3EC3A 2MBTA 3KP9A 2IIYA 1THXA 2HLSA 3GL5A 2F3MA 3M9KA 2H0HA 4N0VA 2DMLA 2CX4A 3VWXA 1GUKA 1W4VA 5B8BA 5G5EA 1GTUA 4OD7A 4NMUA 1SKWB 3FZAA 3EYTA 2YANA 2H70A 4EXJA 2VOCA 2R4VA 5ECMB 4ZIJA 1K0NA 1FW1A 3DGQA 3CMIA 3RBTA 3TJJA 1QMVA 2GSQA 3QAGA 2M72A 1AQXA 2FCHA 5DALB 5IMDA 5GZZB 3Q74A 2A2SA 5DJMA 2L59A 2FWHA 1TK0B 4K0NA 2F8AA 3H79A 3ZZXA 4O92A 2VCWA 2IFQA 2ES7A 1A0RP 19GSA 3N5OA 4D73B 1B9YC 1BX9A 4IQAA 2WRTA 2YN1A 3TB2A 4ZBBA 1PKZA 3IK9A 4ACSA 4N0ZA 3QCPA 2G2QA 3BOAA 3ZMLA 4KAEA 4G10A 1WRYA 4ID0A 3TJGA 2CV4A 4EDZA 5AIXA 1I5GA 1ZYQB 2HNLA 5J5NA 2P0GA 1TRWA 4F9ZA 2XC2A 2DMMA 2KOKA 4OCEA 3PINA 3TCOA 5F8BA 4NV2A 1H4OA 1KEBA 1M9AA 4AJ6A 4HZ2A 3MNGA 1URMA 1SYRA 1U87A 1PL1A 2H71A 2IN3A 1XPVA 1TDIA 2JL4A 3J7Yk 4Q5QA 1ZYEA 3ZIJA 4NAXA 2C3QA 3KCMA 3GV1A 2PPTA 3ZL5A 12GSA 1XW6A 3IR4A 1BJXA 5CRDA 3VK9A 1I9DA 5CO3A 4TOPA 9GSSA 2H72A 1T4YA 1W89A 3MSZA 4YH2A 1Q4JA 4NHZA 2P5QA 3D6IA 1WPIA 1XVWA 3P2AA 4DEJA 3WGEA 5D96A 2F51A 4ECJA 4KSOA 2MMNA 2O87A 1SENA 3QR6A 2CQ9A 3ZMKA 1ZOFA 1JLWA 2A4VA 2CT6A 2NPBA 2H66A 2IJYA 4LA1A 1JLVA 4TRXA 4GF0A 4IP1A 1RK4A 4IJ3A 3UVHA 2OKAA 3VWWA 1G6YA 5INYA 3O76A 4ZB6A 4L5LA 2CAIA 4K0GA 4V1Ap 2QSIA 2IWTA 1X9MB 2L4CA 4ZXGA 4K1FA 1O8WA 5HFIA 1OC9B 2C80A 3GKXA 1GNEA 4P3YB 2HFDA 6GSWA 4MZWA 1SYXA 2H1GA 5D93A 3H93A 2BTOT 4ECCA 1T3BA 3A2VA 1YF1A 1USBA 3RHBA 1BYEA 2VAFA 4J56E 2YV9A 2H74A 1FOVA 1LU4A 2LRTA 3IOSA 4OFNA 4J2FA 4F2IA 4PQIA 4GRFA 3KTLA 3CTGA 3WD6A 3ZTLA 1K0MA 2H1BA 5IOWA 4EUYA 1K3LA 2FUG2 4MZBA 2DC5A 5HR1A 2LQOA 3IK7A 4BL7A 4X43A 5ECSA 1GSFA 2EC4A 2VCZA 5ENUA 3V1WA 2EIRA 2IMFA 4O5RA 5KEJA 3LXZA 2FA8A 1ERUA 2MBSA 5ECHB 1PX7A 4KW6A 1JZDA 2JSZA 2JSYA 3FYGA 4MA9A 4KCAA 2C0FA 2GTUA 4Q5NA 3MDKA 5G2ZA 3TKRA 2LV3A 2YNXA 4FH8A 3FZ4A 3E3EA 3A2WA 3G7JA 3ZREA 3IC4A 1M2DA 4MJAA 5HFKA 1Y25A 3R2QA 1AC1A 3FHKA 3ME8A 3LGCA 16GSA 1DUGA 1ZL9A 4PXOA 1SL1B 4OCFA 5IM9A 4ULXA 5JWRB 2L6CA 1XZOA 1VF1A 1TXXA 5IMAA 4PUAA 3APQA 2C0EA 3F8UA 4XTSA 2V2GA 3HXSA 1WWJA 2LJRA 2AHEA 1Q98A 2TRXA 3Q19A 4NV5A 1VRSD 2FY6A 18GSA 4JBBA 1AQVA 4OWYA 2I3YA 2P31A 1YF0A 3C1RA 5AGYA 3F6FA 2VL2A 1U88A 4ZILA 3TJBA 2QKEA 3GSSA 1OE7A 4MJCA 1WIKA 2DLXA 2VL2C 3D4TA 2GZYA 3VURA 2R5GA 2VCTA 1U3AA 1DE1A 4ZBAA 3ZVJA 1KNGA 3CSIA 2GSTA 2CX3A 2PVOC 5ABRA 1CQGA 4OO5A 3KGKA 1DBYA 1K0BA 3HJMA 3M8NA 6GSXA 1OC3A 1OC8A 1YEXA 2E2GA 4WBJA 4Q5RA 1B8XA 4MPGA 5J9CA 2VD1A 3LXTA 2V1MA 5G30A 2G0FA 5DJLA 1M9BA 1THOA 3QMXA 4BVXA 3HVXA 2MZCA 6GSUA 4HQZA 3AY8A 1FAAA 3UL3A 3BD2A 3I43A 2CVBA 2AB6A 4HU7A 1XW9A 4F0CA 1B9XC 2DIYA 2OACA 4MK3A 1X5EA 2YJ7A 1ZGNA 3S9FA 3E9JB 1F3AA 4MZCA 2YPMA 3L0HA 1TK5B 3DWVA 7GSSA 4TVEA 5D9VA 3VI5A 4PGTA 3GRXA 5CRHA 2CA8A 4MCUA 5DAKA 2WZ9A 2VIMA 5GAND 2V32A 3NZNA 4IELA 5IMZA 3BBYA 2KUCA 3KM6A 2B1KA 3TOTA 4YQMA 1AQWA 3CYNA 2AV4A 3W8SA 4DSSA 1EZKA 2VCQA 3C8EA 3F63A 3WGXA 4CDOA 1NSWA 5KN2A 2PERA 3GH6A 4LL1B 2YJHA 5ELAA 2B1LA 3HKRA 3FR9A 2PUKC 1K3YA 2H6ZA 2CVKA 4F03A 1R26A 3VWVA 1FG4A 3IAM2 2NVLA 3UIWA 5DCGA 3UEMA 2E7PA 1XWKA 5ECOB 4PURA 1A8LA 2FHEA 3A2XA 3EVIA 1F6MC 5GSSA 4POBA 4CW9A 2KHPA 4HDEA 2V41A 3PR8A 2R2JA 2RUEA 2I1UA 4DSQA 1M2AA 4KGIA 3KZQA 4CHSA 4K2DA 2HRNA 2FLSA 3I9V2 2OBIA 2RLIA 4V2NA 1T00A 2IMKA 1GNWA 2GZPA 2HZEA 3ME7A 3VWUA 1TRUA 1ILOA 1TRVA 5ELGA 2O8VB 3IA1A 2B3SA 1ON4A 1MDJA 2REMA 4ZL7A 3WGDA 1G6WA 2H0GA 20GSA 2HZFA 1HNCA 1O85A 2C3NA 5HR3A 3VPQA 3EMXA 4ZL9A 5JCUA 1XBSA 1WP0A 5IMCA 4EO3A 5LCZA 5AN1A 2N5FA 2B6MA 5D73A 4MABA 4GSNA 4K7IA 2YZUA 1GSUA 2F8FA 4MMMA 2LJKA 3GKNA 3VPTA 3H8QA 2X8CA 2R3XA 1X9SB 2K8SA 4KX4A 2KP2A 1XFLA 2B5XA 1JHBA 3DVWA 1AUCA 2GT5A 5KN1A 2FNOA 4OMVA 1F3BA 5DQSA 3UVTA 4GLTA 3J7Yb 3LSZA 1B4QA 3D22A 3GKMA 1PRXA 3FW2A 2E0QA 4TR4A 2XPDA 2WDUA 2X64A 2B5YA 2WGRA 5AISA 5CRGA 3TKSE 2LNTA 1C72A 1HD2A 3LORA 3UJ1A 5CP1A 3C7MA 4L8EA 2RM6A 3H4KA 4GXZA 1T4ZA 3GNJA 4FYUA 2PVQA 1K0CA 4V2LA 4IP6A 5DALA 3D21A 1AIUA 1GLQA 4V2MA 4XRAA 2R37A 3QPMA 1EOGA 1ZMAA 3BCIA 3APOA 3C1SA 1ERVA 4HI7A 2HE3A 2K18A 2L4QA 4GQCA 1Y6EA 6GSYA 2H8LA 4KSMA 3HDCA 3UAPA 4D73A 4ECBA 2L5LA 3EU3A 2FWFA 4AGSA 1RW1A 3D0ZA 2K6VA 4WXTA 5B8AA 2OJLA 4HJMA 1X5CA 5CNWA 3QOUA 3EINA 4KDYA 5F05A 3G7YA 2RUFA 3CSJA 2CZ3A 4TR1B 2GGTA 4IKHA 4K6XA 3IXRA 4XRDA 4RI7A 3M9JA 4JE1A 5EY6A 3I69A 1O6JA 3GIXA 1V57A 5ECNB 1YJ6A 3HD5A 1FHEA 2GVPA 2IMIA 4WEYA 1F37A 1NHOA 3KJYA 4N30A 3RAZA 4KH7A 1T7PB 4ML1A 1TW9A 2LRNA 4WETA 2XHFA 2MMAA 1PMTA 2PU9C 1GTBA 3NOFA 3US3A 3LEFA 4XS6A 1BQ7A 1XWBA 3KH7A 1OAZA 2VCVA 4FO5A 3L9VA 1GSEA 3GTUB 1X5DA 4POMA 1V9WA 5DQYA 1Z3EA 3CXGA 1JZOA 2HSYA 2PWJA 4QL7A 4POLA 1AW9A 2TIRA 4WR5A 1Z7RA 4YAVA 2MYGA 2DJ0A 3IHQA 5D9XA 2AJQB 3CSHA 2ALBA 1Z6MA 1J08A 4TR3A 4F82A 3FR3A 1XWCA 1SL2B 4JEDA 3DD3A 2JACA 4KE3A 1SK0A 2DJ2A 1Z7PA 3IE3A 3KXOA 1GL8A 2RM5A 4RUVA 5G31A 4HUAA 4YQUA 3U5RE 2B7KA 2GQMA 3RPNA 4FYCA 13GSA 1LJRA 2C4JA 3GYKA 1TI1A 3TRQA 2BMXA 4TW5A 1A24A 1QQ2A 5KN0A 2ON5A 1UN2A 2L57A 2J9HA 3PGTA 4WF5A 5H5SA 1OC9A 4QQ7A 4XS1A 3UARA 4FIWA 4MH3A 3RPPA 4I97A 1MTCA 1QXHA 5CYYA 4RQXA 2GSRA 1MDKA 1ZCPA 1WOUA 1LBKA 1OKTA 5D8IA 5ECKB 5COHA 4Z7XA 3DIEA 3QAWA 4EDYA 1AXDA 4WKWA 1ST9A 1A2JA 1GUMA 3LYPA 3TKSA 1PL2A 1GUHA 1U6TA 2HXKA 1PD21 3ZIVA 1BAYA 4LL4B 5A4WA 2LNSA 3KMNA 5DVBA 5ID2B 2DIZA 2IMEA 2P5RA 4MLYA 3D5JA 4KUNA 1VF3A 4XS4B 4GWRA 3VI7A 5CAXA 5JWOB 1FVKA 4TXOB 1UC7A 1SJIA 2YWMA 2H6XA 3DVXA 4BA7A 2N5BA 3HZ8A 1WMJA 4MH2A 4WF4A 5E59A 1V58A 2B7JA 2I81A 2LRCA 4GSSA 3ZVJD 2GLRA 1ABAA 3F4RA 5EVOA 2O7KA 4KDXA 2HSHA 1QGVA 1XW5A 3SBCA 3EWLA 1G7EA 3GHAA 4MPFA 3O6TA 1FB6A 2HT9A 5J4UA 5ECQB 3IRAA 2NDOA 2KLXA 2VUPA 2WS2A 3OR5A 4MDCA 1EP7A 2GT6A 3UOMA 3HCZA 1OE8A 4HOJA 1A2MA 2FWGA 6GSTA 1HYUA 1TTZA 5EL8A 5J3RA 1ACVA 2IL3A 4OFMA 4OFTA 4GTUA 1PQNA 1XWAA 5G1LA 4ML6A 3CRUA 3TKQA 4PQHA 3EURA 1UVZA 3HA9A 2JZRA 4JR4A 3UBLA 5A4VA 1SK2A 2OBKA 3HJOA 2CVDA 5A5KA 2C3TA 4G9HA 2GZZA 3HY2A 4AJ7A 1PSQA 2C1YA 3FKFA 3F3RA 1SU9A 4N10A 1WJKA 2O89A 3VLNA 4I6XA 4EVMA 1YKAA 3ERFA 1PX6A 1MD4A 1EWXA 4L0WA 1A2LA 4LLRA 3MAKA 3ED3A 3UBKA 3FEUA 1SJ6A 2ON7A 2CAQA 1SKSB 2WULA 4IS0A 4NPBA 1B48A 5LNKe 3I6AA 4POKA 2YV7A 3GFKA 2LEGA 2XBQA 2LTKA 3N9JA 4AF2A 1EGRA 2ZNMA 1ERWA 1XWGA 1O8XA 3IPZA 3IV4A 2KP1A 3KEBA 2VL9A 4XCSA 1B4PA 1GSQA 3C71A 3KIJA 2HYXA 4TN8A 3DYRA 1XIYA 1ML6A 1TOFA 3A5WA 4H86A 1R4WA 4ZBDA 3APSA 4WR4A 5C00A 2EIOA 2X8HA 1YQ1A 5C04A 2GDRA 2H30A 1IYHA 2K9FA 5G5FA 1X9WB 5ECPB 1Z6NA 1DSBA 2AYTA 3LQ7A 4HU9A 3HYPA 3TKPA 2VCXA 3E0UA 4EE0A 1V2AA 1GTAA 2H01A 2EIQA 1G0TA 1H75A 2IFQB 1AAZA 3P7XA 4Q5FA 3KH9A 1GSDA 4KA0A 4YQVA 5ECRB 3L4NA 3KD0A 4KDUA 1XOBA 4JR6A 17GSA 2H76A 4PX1A 1K3OA 4JRRA 5JWQB 1QFNA 1GWCA 1S3DA 4LMVA 2IPAA 2QC7A 3GN3A 3IBHA 1K0DA 4MF7A 5HFGA 8GSSA 4GQFA 2RIIA 2O85A 3EU4A 1J9BA 1OVNA 1SL0B 1SK1A 4LMWA 2AUVA 5IMVA 3HVVA 4BVYA 3RDWA 5HQPA 2X8GA 2PN8A 4IBPA 3QD9A 3H1NA 2ZCTA 5IMFA 1VF4A 3WYWA 4V1Ag 3MWHA 2LJAA 1XOAA 4PNGA 4PQ1A 1TRSA 22GSA 2OA7A 4BWSA 1XXUA 2CZ2A 4RQRA 1TI3A 4O7HA 1IYIA 1SJZA 2JZSA 2OADA 3F4TA 2VM1A 1GSSA 3UMAA 2WB9A 2TRCP 3HZ4A 2LSTA 2VO4A 3FZ5A 4MJBA 4EC0A 3W8JA 2J23A 3M0FA 4QL9A 1NM3A 3QFBC 4MP4A 3WT1A 3ZRDA 1HNAA 1MDIA 2YWNA 3F0IA 4FYBA 4MJEA 3A3TA 1A8YA 3RHCA 3GX8A 3Q18A 2C0DA 3FK8A 2I9HA 1EV4A 1V40A 3P90A 2OE1A 1GULA 1ERTA 4WBRD 2GQLA 4DSRA 4ECIA 3DMLA 5LD0A 4O32A 1N2AA 1SD9A 1T1VA 1M0UA 3ZFLA 3TOUA 4L0UA 1QK8A 6GSVA 3CBUA 11GSA 4KCEA 2LUSA 2VLVA 2HRFA 2YZHA 4BWQA 4N11A 5IIZA 2H6YA 1BG5A 4OO4A 4F0BA 5F0GA 1R7HA 3ISOA 5ECLB 2M80A 2WCIA 2VLUA 2FD3A 1O73A 4TKYA 4TR0A 2YWOA 1M7TA 4EKZA 1GTIA 4NHWA 2V6OA 2VL3A 4HQSA 2PBJA 1GSYA 3EE2A 4E8EA 1S3AA 2K8VA 3LJRA 1Z9HA 4ZL8A 4TR1A 3C73A 2PGTA 5IOXA 5DBQA 1YEPA 1YZXA 2JADA 3IDVA 1PN9A 5B7CA 2M46A 5IPHA 3ERWA 3TDGA 4HZ4A 4JU5A 3D4MA 3M1GA 4I8BA 2LKUA 4IHUA 1R5AA 4AJ8A 5F06A 3U6VA 3TRXA 5L71A 1K0AA 5IQYA 1ZZYA 3EMPA 1YY7A 3QFAC 3L9UA 3P8WA 4KNDA 5GSTA 2NTOA 4HJ2A 1YKCA 6GSSA 2GQKA 2H0IA 3GTUA 3K8NA 1N8JA 1M99A 3L9SA 1JFUA 2JU5A 5HR2A 1KBNA 4BPYA 1BEDA 4RI6A 4DVCA 4X1UA 1XVQA 2F9SA 2YWIA 2R6KA 1U3IA 5JCWA 3TJKA 5DDLA 2YCDA 2HI7A 3LFLA 1J0FA 3SWLA 2MMOA 2A2RA 2DJ1A 5B6MA 3QDNA 3LWAA 1SD8A 5JCGA 1TKDB 2VLTA 2L6DA 4IN0A 5IPGA 3F9UA 3GURA 1K0OA 5CREA 5FWGA 3JCML 4EL1A 1MEKA 4IW9A 5HR0A 5D9WA 3KMOA 4K9ZA 4L5OA 2B5EA 3TKSC 5B6NA 1XCCA 1GRXA 3ZFBA 3F3QA 1EEJA 2FGXA 3WT2A 2DSAA 1A0FA 2H1DA 4MF5A 3W6GA 2L5OA 4PUFC 3BCKA 1NHYA 4IGJA 3TJFA 2C0GA 1EEMA 3CTFA 4EF0A 4X0XA 2DJJA 4K7NA 2E2MA 2YP6A 4TXVA 4HEA2 2C8UA 3GSTA 4PNFA 4G19A 1GLPA 4ISDA 4E8HA 1E2YA 3TUEA 1TP9A 1TK8B 4MF6A 4YAPA 2FWEA 1F9MA 1O81A 1CQHA 4JZQA 3FY7A 2DBCA 3ZLPA 2H19A 5KN3A 3O3TA 2YOIA 2IMDA 5F07A 2X99A 3GA4A 2OE3A 4NXIA 1TU8A 5ID2A 1KTEA 2H75A 4XIHA 4XS4A 3GX0A 1Z5YE 1OYJA 1JZWA 4GSTA 3ERGA 1V98A 4TXOA 3IAS2 1VGLA 2XPEA 2MMZA 5E4WA 1PA3A 3GKKA 4IVFA 5DAKB 1F2EA 2DJKA 1M2BA 4IQ1A 1FB0A 5D9TA 3DEXA 5GAPD 3PH9A 3HVSA 1JZRA 3FZ9A 4ZB9A 1FVJA 3GUSA 1EOHA 3DXBA 3G9BA 1UA5A 3Q6OA 5DCHA 1NW2A 4DSSB 2GSSA 4XHMA 2ZUPA 4I5QA 2AAWA 1OKDA 14GSA 5IO2A 1GH2A 1O7UA 2VD0A 2LS5A 3TRPA 3LG6A 3BJ5A 4HS1A 5J41A 4GCIA 1FO5A 1GP1A 5J9BA 3L78A 3GMFA 1EV9A 1VF2A 10GSA 4ILFA 5FHIA 1WE0A 3TGZA 2D2ZA 5G1KA 2WJUA 1A23A 2N5AA 1HNBA 1QUWA 3F4SA 1E6BA 3FRCA 3NIVA 5ECIB 2V6KA 2XBIA 3F6DA 1R5PA 5CRWA 5EPFA 2BJXA 2H73A 4J57E 2FA4A 4NWYA 3GH9A 4K8MA 1EGOA 2NBSA 3M3MA 4KB3A 4IJIA 2VM2A 3DRNA 5A4UA 3HHVA 5H5QA 2HZEB 1T8EB 3KTBA 2H1AA 5H5RA 3ZITA 3HJPA 1TU7A 5FT3A 5AIVA 3QAVA 4K7OA 4G2EA 4ZB8A 2DJ3A 1X0RA 2Z9SA 2WFCA 1G7OA 1HQOA 3CRTA 1YDKA 2GS3A 1EP8A 2I4AA 2JZTA 5IO0A 1TJDA 3G7IA 2PMTA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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