4WF4A

Crystal structure of e.coli dsba co-crystallised in complex with compound 4
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
188
structure length
188
Chain Sequence
AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Application of Fragment-Based Screening to the Design of Inhibitors of Escherichia coli DsbA.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
total genus 63
structure length 188
sequence length 188
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.8.4.2: Protein-disulfide reductase (glutathione).
pdb deposition date 2014-09-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4wf4A00
3HJOA 1JFUA 3L9UA 1IYHA 1O73A 4MH2A 3UIWA 4K1FA 4LMVA 1GSDA 5COHA 3F3RA 22GSA 19GSA 2LEGA 1PMTA 2CX4A 2X99A 2IFQB 1AUCA 1GTAA 5CRHA 5J3RA 2PMTA 4NXIA 3GKMA 1G6WA 2VL3A 1PX7A 4F2IA 2XPDA 3CBUA 4DVCA 1WRYA 4MZBA 4P3YB 2XBQA 4IP1A 3MDKA 1A8YA 3F3QA 4G2EA 3J7Yk 2CVKA 1AAZA 1TJDA 4Q5FA 3GA4A 2RM5A 2EIOA 4WEYA 3CXGA 3L78A 1LJRA 3W6GA 2H6XA 1R4WA 1XOAA 1U3IA 2GT5A 2O8VB 4KGIA 4EKZA 3G7JA 2RIIA 2YV7A 4KDXA 4GSTA 1I5GA 3G9BA 2XC2A 5ECHB 1M2BA 2PUKC 1UA5A 3EU4A 1GLPA 3UMAA 4FH8A 1F3AA 5DJLA 4I97A 5G31A 2OADA 1AXDA 1VF1A 2H72A 4HJMA 3ZITA 2VCWA 5KN0A 2QSIA 2JACA 5AISA 1SL0B 1YEPA 2OE1A 2GTUA 3F9UA 2GQKA 1XZOA 1F2EA 1TRVA 4FYBA 1THOA 3IK9A 3M0FA 5J5NA 4ML1A 4J2FA 2K18A 16GSA 4TKYA 4KUNA 1FHEA 3VWVA 2TRCP 1NHYA 1WE0A 2VLUA 1J08A 2H0HA 4IHUA 1YF0A 1M99A 1K3LA 4LMWA 4POBA 3PINA 1U87A 2I4AA 3BCKA 4MJEA 5A4VA 4XCSA 1K0BA 4MABA 2B1KA 3DWVA 5B8AA 3I69A 1X5EA 3DYRA 1PN9A 3EC3A 3WT2A 3VI5A 2H30A 2L5OA 3AY8A 1CQHA 1B9YC 2O89A 1G0TA 1ERVA 2GZZA 4I6XA 3WGEA 2H0GA 3TKSC 4KA0A 3DEXA 3QCPA 4G10A 3O76A 4BWSA 4POKA 2IMDA 2H66A 4E8EA 1OKDA 1WOUA 3FZ9A 2WCIA 3DD3A 1ZZYA 1HNBA 2R6KA 3ZFLA 2LRTA 5H5RA 1C72A 1GNEA 1K0OA 3GUSA 5IOWA 2KP1A 4GSSA 4IW9A 3TUEA 3GMFA 2VCTA 2I3YA 1NW2A 4XIHA 3NIVA 2GSQA 4MPFA 4EUYA 4AF2A 1QFNA 1AIUA 2HI7A 3HYPA 2LUSA 2GLRA 5F06A 3HVXA 2F51A 3HVSA 1EP8A 4ZBDA 4N0VA 2VL9A 4MJAA 5DJMA 3ZRDA 4LLRA 2N5BA 1PSQA 1QQ2A 1J9BA 3GTUB 1BX9A 3FY7A 5E4WA 3O3TA 3KXOA 1ON4A 3UL3A 2DJJA 2IMFA 3DRNA 1OC8A 3ERGA 2AB6A 5B8BA 3FW2A 3KD0A 1BEDA 2VAFA 2H1BA 3ZLPA 3QR6A 3LXTA 3TKRA 2A2SA 1GP1A 3FZAA 1DE2A 1Z7RA 5IO0A 2PU9C 4ECJA 1URMA 1GUKA 1NM3A 2H1GA 1V57A 3M9KA 5G1KA 5CREA 2FA8A 3QFAC 2MMNA 2F8FA 2RUFA 2LV3A 2XHFA 1TU8A 3WGXA 3F4RA 1WP0A 2CA8A 1AQVA 1V58A 1SK2A 3DIEA 2HYXA 1YEXA 4NV5A 1XIYA 4BWQA 2FCHA 2PERA 2ZCTA 3GV1A 1TTZA 2QKEA 4NHZA 2OE0A 4JRRA 3A3TA 2FA4A 2MBTA 2V32A 2HT9A 4JE1A 1MD4A 4HEA2 4KNDA 4EDZA 3HJMA 4XHMA 4GRFA 2DJ2A 1WJKA 1M7TA 4MP4A 4KW6A 3EVIA 4KB3A 1TU7A 1Z5YE 1JZDA 5KN3A 3LGCA 4OCFA 3KZQA 5ECNB 4KAEA 4PNFA 2IMIA 4WR4A 2NBSA 4OMVA 7GSSA 3DKSA 1FO5A 3VK9A 2QC7A 3A2WA 4YQMA 5ECMB 1FAAA 5CNWA 3GH6A 3LYKA 1EV9A 1PKWA 2VLTA 3WT1A 2JZTA 1ST9A 5H5SA 3A2XA 4HI7A 3GTUA 1EV4A 3PGTA 3L9SA 3UAPA 2R3XA 2A4VA 1T4YA 1A8LA 1U3AA 1GSQA 4AJ6A 3IAM2 2E2GA 2KUCA 1WIKA 2C4JA 2YP6A 3QAWA 4JU5A 2LKUA 4HOJA 3FZ5A 1H75A 3GKKA 3GX8A 3TRXA 3HKRA 4CDOA 4NPBA 2FWFA 2LSTA 2K8VA 1YKAA 2WJUA 1XXUA 1GSYA 1TI3A 1SJIA 3KMOA 1QXHA 1K0DA 5ELAA 4MJCA 1Z9HA 2RUEA 2VD1A 3MSZA 5DQYA 4ZL8A 3L0HA 1A2MA 3RBTA 2WDUA 3FR3A 1OC3A 2IN3A 2RLIA 2EC4A 5IMDA 4YAVA 4MK3A 1R5AA 1SL1B 1ZYEA 1O7UA 1EEJA 3ERWA 5CRDA 1SJZA 3ED3A 3CTFA 2VO4A 3HVVA 3BCIA 4PQIA 4CHSA 3KEBA 4F0CA 5HR2A 2GSTA 4NAXA 2DIYA 5HFKA 4YH2A 2LRNA 2JZRA 3F4SA 2H6YA 2LRCA 4YQVA 2GDRA 1N8JA 1UN2A 2YZHA 2JADA 1BJXA 3KJYA 5ENUA 2NVLA 3ERFA 4KSOA 3S9FA 4I2TA 4GQCA 4PXOA 3ME7A 1Z3EA 1KNGA 2H6ZA 1YZXA 2FWHA 3M3MA 2EIQA 4GWRA 4Q5QA 2MMZA 2E2MA 2NPBA 4XS4A 1NSWA 1HQOA 1EWXA 2L4CA 4PQHA 3APSA 3TKSA 4OWYA 4K2DA 2X64A 3J7Yb 3MAKA 4QQ7A 2YJHA 4AJ8A 2HNLA 1PGTA 1V2AA 1PKZA 5F05A 1SKRB 4RI6A 3KCMA 5IMZA 1KEBA 1H4OA 1USBA 5IO2A 3UEMA 2L6CA 6GSVA 1B48A 1X5CA 2X8CA 4ECBA 4V2LA 1XWKA 3TJJA 4TXOB 5D9WA 1VF3A 5JWQB 3W8SA 1GUHA 4MLYA 1E2YA 3H93A 5C04A 2C1YA 2Z9SA 1SD9A 4N0ZA 1W4VA 3IE3A 2PWJA 4FYUA 4PGTA 3M1GA 4WBRD 3ISOA 4MMMA 6GSUA 4V2NA 1TK0B 2LS5A 2VUPA 1QK8A 2OACA 3KP9A 2LNSA 5KN2A 4WKWA 3HHVA 2V1MA 1ZCPA 5LNKe 2VL2C 5E59A 4X43A 2BJXA 1SENA 1VRSD 2DIZA 3TDGA 2CZ2A 2HZEB 4TR4A 3KTLA 4MJBA 1XPVA 2C8UA 5ECRB 1MDKA 2I81A 3U6VA 4N10A 1SU9A 2C0DA 12GSA 1TXXA 4MF6A 3ZYWA 4Q5RA 2LQOA 1B8XA 2PVQA 1XW9A 6GSYA 1A0FA 3R2QA 3DMLA 3CSHA 4EL1A 5CYYA 1FVKA 3IR4A 1J0FA 4OFTA 4PUAA 3APOA 4D73B 1XWGA 3RPPA 4LL1B 2I9HA 1YQ1A 1O81A 3CYNA 5AIXA 5DBQA 4JBBA 1V40A 4MF5A 4L8EA 5DCGA 1X0RA 5DQSA 3GL5A 4POLA 4ZBBA 2JZSA 4L5OA 1PD21 1G7OA 3GNJA 3TGZA 4WETA 3DXBA 4TXOA 3GKXA 1A24A 3FKFA 3D6IA 4N30A 4WF4A 1OAZA 2GGTA 4GQFA 2M72A 2YN1A 3F4TA 1O85A 4HZ4A 1JLVA 3O6TA 1F3BA 4ULXA 2FHEA 1ML6A 1PA3A 4IQ1A 1IYIA 3ZZXA 4NHWA 4L0UA 1M2AA 2AHEA 2K9FA 2KLXA 1VGLA 1YY7A 2LJKA 1MDJA 3D4TA 3RPNA 5ECLB 3QAVA 2XBIA 3GIXA 2ZUPA 2CQ9A 2IL3A 1GSSA 3I9V2 2HZEA 4TVEA 2LNTA 4E8HA 3SWLA 3DVXA 1SJ6A 1TP9A 3D21A 1O8XA 4NWYA 2VOCA 2V41A 2QGVA 4I8BA 4MZCA 1ERUA 1T4ZA 3LWAA 4ZL7A 5JCGA 5IMVA 5GZZB 1QMVA 2OBIA 1BG5A 3UJ1A 3GSSA 3NOFA 4MPGA 3RHBA 4O32A 4KH7A 5H5QA 4ML6A 2HLSA 1WPIA 3IAS2 3UVTA 5D93A 5A4WA 1M0UA 1WMJA 3TJBA 2K6VA 2DSAA 4D73A 2AYTA 2B7JA 3HDCA 1TOFA 5GSSA 4KCAA 1GULA 3DVWA 1M9BA 3GFKA 2DMMA 2YWNA 5DALB 4V2MA 1V98A 5ECSA 3TKQA 3EMPA 4G9HA 3BBYA 2YWIA 5G5FA 2I1UA 2O87A 4QL9A 3GL3A 2R2JA 1UVZA 1PX6A 2HSHA 1U88A 3G7YA 2L59A 14GSA 3FK8A 5EPFA 1HNCA 2C0EA 1GH2A 1YJ6A 2B1LA 2MZCA 3DGQA 4GSNA 5IMCA 3UVHA 2R5GA 3E0UA 4MH3A 3TOTA 3ZTLA 1BAYA 1SYXA 4TR0A 4RQRA 2M80A 2VCQA 2X8GA 3HZ8A 2IWTA 3TJKA 1WWJA 4GF0A 3P8WA 5DDLA 5JCUA 4LL4B 2LJRA 2R37A 2YZUA 3TRQA 1TRUA 3IOSA 4AJ7A 2CAQA 3P2AA 18GSA 2B5YA 3FR9A 4IS0A 4HQZA 2H76A 1PL1A 1O6JA 1EOGA 4QL7A 4F82A 1K0AA 1XWAA 4J56E 5IPGA 3C7MA 2R4VA 3F6DA 9GSSA 5CAXA 3KTBA 2N5FA 3HY2A 2YV9A 5A5KA 2C3QA 4OO4A 1XCCA 3LFLA 4HJ2A 2PN8A 4V1Ag 5AGYA 4K7IA 5IPHA 3KGKA 1MEKA 1AW9A 2YPMA 3H8QA 4FO5A 1DE1A 3IHQA 4IELA 2FWGA 2REMA 5ECKB 4JZQA 4OCEA 4GXZA 2KP2A 3IK7A 3CRUA 3TOUA 2FY6A 1X5DA 5JWOB 2K8SA 5ELGA 2LJAA 4XS4B 3LEFA 1PL2A 1TI1A 5IMFA 4IGJA 1HD2A 2WB9A 2CV4A 3GYKA 3N9JA 5J9BA 1MDIA 2DC5A 4KDYA 2HRNA 2H8LA 2LQQA 4YQUA 5J41A 1B4PA 2JSZA 2ZNMA 4G19A 4TOPA 4XRAA 1XBSA 2DJ0A 1SK0A 2VL2A 5DALA 4ZBAA 4ILFA 3K8NA 3D0ZA 4V1Ap 2H74A 1T1VA 4BPYA 3HZ4A 4EE0A 1S3DA 4K7NA 2B7KA 1MD3A 2L4QA 1A23A 4MCUA 2CAIA 4Q5NA 3VI7A 3F63A 4ZIJA 3VFIA 2CZ3A 1G6YA 1ZYQB 2VCXA 2CVBA 1TW9A 2HFDA 3C73A 2WFCA 5D9TA 2JU5A 2G0FA 1QUWA 2V6KA 5J9CA 5J4UA 1A2JA 3IRAA 1XWCA 4HU9A 2GSRA 3RHCA 2ON7A 2F9SA 2J23A 4F9ZA 1JZRA 5INYA 2KOKA 2IMEA 3M8NA 2N5AA 3Q6OA 4O92A 4CW9A 3F8UA 2IMKA 1GWCA 3A5WA 3FHKA 1JZOA 1YF1A 2C0GA 4IP6A 5B7CA 1ERWA 1EEMA 4FYCA 1X9WB 3OR5A 3MWHA 3BOAA 1JLWA 1X9MB 5HFGA 4IQAA 5LCZA 3HXSA 3CTGA 1GSUA 4ZILA 3L9VA 2HE3A 4XS6A 4MZWA 4PURA 1B4QA 1FOVA 2AAWA 3VURA 3ZMLA 3N5OA 2LTKA 3APQA 5DCHA 4ZB6A 2WRTA 3IV4A 2P5RA 5IMAA 1SYRA 2DLXA 2HSYA 3TJGA 4XS1A 4EXJA 3KIJA 5AIVA 1LU4A 1KBNA 3WGDA 3PH9A 4ZB9A 1PRXA 2OA7A 3L4NA 3GKNA 5IQYA 2GS3A 3KM6A 2TRXA 1GSFA 3CSIA 2YCDA 1FW1A 3EINA 3F6FA 1EGOA 1A2LA 4ECCA 4MA9A 3C8EA 3EU3A 2L6DA 2P31A 4L5LA 1EZKA 4BA7A 1JHBA 1T3BA 1EGRA 2VD0A 3WYWA 3VPTA 3C1RA 1AC1A 5D9VA 5D96A 3LJRA 1G7EA 3IA1A 2A2RA 17GSA 1GNWA 5ECQB 3Q74A 3KMNA 5GAPD 1Q98A 3EWLA 1AQWA 4JR6A 1TKDB 3FEUA 2FD3A 2NTOA 5EVOA 1Y6EA 20GSA 5DAKB 4ECIA 3LORA 3QOUA 2AJQB 3I6AA 3H79A 4WBJA 2G2QA 3RAZA 2B5EA 4DSQA 3UOMA 5FWGA 1ABAA 2C0FA 4KX4A 3BD2A 3V1WA 2FNOA 1M9AA 2AV4A 2H75A 3GN3A 3GRXA 4KCEA 2BMXA 3ZL5A 2YWOA 5FHIA 2BTOT 1GTUA 5F8BA 1K3OA 3VWWA 3LXZA 4IBPA 2IPAA 4HUAA 3D5JA 3GURA 1SKWB 3M9JA 4PX1A 1FVJA 1AQXA 4XRDA 2CX3A 1BQ7A 2PBJA 5GSTA 5G30A 3TB2A 2H1AA 2XPEA 4O7HA 3UBKA 2E0QA 4GTUA 3EE2A 2PGTA 4LA1A 4WXTA 1OVNA 4IJIA 1Z6NA 8GSSA 3FR6A 4L0WA 5LD0A 2FLSA 1EP7A 2P0GA 2E7PA 3VPQA 5KEJA 2WGRA 2DJ3A 4TW5A 4RI7A 1TK8B 4HU7A 6GSSA 2MMAA 4H86A 1T8EB 1XFLA 3EYTA 3LSZA 3EMXA 5ECIB 2GZPA 4DSSB 4TR3A 3UARA 2O7KA 4PUFC 4K0NA 5G2ZA 3UBLA 1TDIA 5DAKA 1EOHA 1T00A 2IFQA 3GSTA 3W8JA 3ME8A 1ERTA 4N11A 13GSA 1R5PA 4K7OA 3GH9A 3ZMKA 2YJ7A 3GX0A 1RQMA 1I9DA 6GSXA 5D73A 2ON5A 2L5LA 2FWEA 11GSA 2IIYA 1Z7PA 1TRSA 4K8MA 3MNGA 2H1DA 2OKAA 3U5RE 2DJKA 1ZMAA 1ZGNA 4RQXA 2OBKA 2RM6A 3Q18A 4EDYA 3CSJA 1RW1A 1GLQA 1OC9B 1VF2A 1K0NA 3EURA 5KN1A 2AUVA 2C3TA 1X9SB 3PR8A 2WZ9A 4ID0A 5B6NA 4GLTA 2VCZA 4IN0A 2V6OA 1K3YA 4K9ZA 5D8IA 4F03A 1XW6A 5AN1A 2KHPA 2VIMA 4HDEA 1KTEA 6GSWA 1R7HA 5CO3A 3IXRA 1RK4A 2B3SA 5ECPB 3WD6A 3VWUA 4OO5A 4NV2A 1OKTA 2IJYA 5CRGA 3FYGA 4ACSA 2C80A 3IPZA 4PNGA 1Y25A 2FGXA 2B5XA 2TIRA 5DVBA 3QAGA 3ZREA 1S3AA 4NMUA 4ZXGA 1FG4A 1YKCA 1SL2B 4JEDA 5JWRB 3BJ5A 1MTCA 4K0GA 3ZVJA 5IOXA 1OE8A 3NZNA 4DSSA 3HD5A 2CVDA 5CP1A 3H1NA 1F6MC 4HQSA 1F37A 3KH9A 1OE7A 4BVXA 5G5EA 3I43A 2WS2A 3C71A 4ZB8A 4K6XA 1TK5B 3FRCA 2H01A 2HRFA 2J9HA 2M46A 3QPMA 4TN8A 5D9XA 4POMA 2P5QA 1K0CA 1Z6MA 2YNXA 3LQ7A 3P7XA 1XVQA 5ECOB 2PPTA 2MBSA 1GSEA 2H0IA 1K0MA 2DBCA 1SD8A 1FB6A 4DEJA 3F0IA 5A4UA 1TRWA 4RUVA 4TXVA 1VF4A 2C3NA 1GUMA 5HFIA 2B6MA 3D22A 3HCZA 2GQMA 4J57E 5EL8A 1ACVA 2GSSA 2OJLA 3LG6A 4Z7XA 3GHAA 4IJ3A 4IKHA 1OC9A 4XTSA 1F9MA 2HXKA 1R26A 5B6MA 3CMIA 2VCVA 5IIZA 1W89A 1XOBA 4EF0A 1GTBA 2GQLA 3D4MA 4TR1B 3IDVA 2HZFA 3RDWA 3QMXA 3ZVJD 5EY6A 4I5QA 3VLNA 1V9WA 4DSRA 5F0GA 1XVWA 5IM9A 4FIWA 4GCIA 4X1UA 2GT6A 3QDNA 3TCOA 4OFNA 3TRPA 1QGVA 5GAND 4O5RA 2H19A 4HS1A 3G7IA 1YDKA 1ILOA 3E3EA 2CT6A 6GSTA 3US3A 5HR3A 1BYEA 5ID2B 2L57A 2MMOA 3FZ4A 5ABRA 4BVYA 2VLVA 2O85A 3QD9A 4I2UA 1OYJA 3E9JB 5HQPA 2ES7A 5FT3A 1CQGA 4EVMA 3A2VA 1THXA 3IBHA 3CRTA 4OD7A 4TRXA 3JCML 1E6BA 5F07A 1GL8A 2DMLA 4MF7A 2V2GA 3ZFBA 4AGSA 2FUG2 2JSYA 3H4KA 4ZL9A 1Q4JA 4OFMA 1SKSB 1N2AA 1DSBA 2F8AA 1GTIA 4IVFA 2VM2A 2H70A 5G1LA 1T7PB 2JL4A 1M2DA 4WF5A 3HJPA 2MYGA 1ZL9A 2H73A 1XWBA 5L71A 5HR1A 2ALBA 4MDCA 1HNAA 1U6TA 4EO3A 4PQ1A 2GVPA 2EIRA 4ISDA 1XW5A 4HZ2A 1PQNA 4KE3A 2X8HA 2NDOA 1HYUA 4EC0A 3IC4A 2YANA 1S3CA 1UC7A 4KDUA 3VWXA 3P90A 2F3MA 1B9XC 3TJFA 4TR1A 3KP8A 3Q19A 2YOIA 3TKPA 5JCWA 1DBYA 1LBKA 3QFBC 5C00A 10GSA 2VM1A 4F0BA 4WR5A 1O8WA 3C1SA 3LYPA 1NHOA 3ZIJA 1DUGA 4KSMA 2WULA 2YWMA 1SK1A 2D2ZA 3ZIVA 5HR0A 3TKSE 3KH7A 1GRXA 5ID2A 4BL7A 3HA9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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