4WF5A

Crystal structure of e.coli dsba soaked with compound 4
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
188
structure length
188
Chain Sequence
AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Application of Fragment-Based Screening to the Design of Inhibitors of Escherichia coli DsbA.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
total genus 67
structure length 188
sequence length 188
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.8.4.2: Protein-disulfide reductase (glutathione).
pdb deposition date 2014-09-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4wf5A00
5D8IA 1PN9A 1W4VA 2P31A 4MPFA 3Q18A 1VF4A 2MBTA 2V32A 2YV7A 3AY8A 4TXOA 1ZMAA 2JSYA 1KEBA 3A5WA 2B7KA 4JR4A 12GSA 1HYUA 2V1MA 1TOFA 3TKQA 3ZLPA 2CQ9A 3FY7A 3DXBA 4XS1A 2E2GA 4F9ZA 4MDCA 4NHZA 1F6MC 2X8GA 4IKHA 3HJPA 2PUKC 3D22A 2X8CA 3UMAA 5IQYA 3LXTA 3Q6OA 5AIVA 3LSZA 3F3QA 4LMWA 1JZDA 2O85A 1AC1A 1AQVA 3GA4A 4P3YB 4JEDA 3KCMA 1GSDA 1V57A 4NMUA 1MD3A 1XVWA 4J57E 3C8EA 1PGTA 3R2QA 4G19A 5G5FA 3ZZXA 1B9YC 1SK2A 1OKTA 3US3A 3O76A 3DVXA 2MBSA 3CSJA 3GYKA 2C0EA 1T8EB 3CMIA 3KH7A 4NPBA 1ML6A 2CX4A 5AN1A 3H8QA 3RPPA 4KDXA 1IYHA 3G7JA 2JZRA 3KMNA 4KAEA 3S9FA 2MMAA 2JZSA 3GKXA 2VL2A 5HFKA 1RW1A 1A0RP 1AUCA 4HUAA 3TOUA 5EY6A 4PNGA 2WB9A 3QMXA 2LJAA 1B4QA 3FK8A 1U87A 5IMFA 2VL2C 2FWGA 4DSRA 1XBSA 3P90A 3A2WA 1H75A 3LXZA 1TW9A 1OC9A 3C7MA 3TRPA 1A23A 3PGTA 2XPEA 5ECMB 1WPIA 4X43A 2Z9SA 2VCXA 1MTCA 3L9UA 4PQIA 2VAFA 4TXVA 2PN8A 5D9XA 5EVOA 1FG4A 1YY7A 1ZYEA 2XBQA 4ZILA 2REMA 4TRXA 1HNBA 4O32A 1XW6A 1GRXA 4Z7XA 1GL8A 3WGEA 2PWJA 5ELAA 1GULA 3QAVA 1R5PA 4GTUA 2VM2A 4PGTA 2DLXA 2XPDA 5GSTA 4OFMA 1PRXA 2PGTA 4NV2A 1U3AA 3UBLA 1F3BA 2H75A 2R6KA 1EP8A 1R26A 2QSIA 3HJMA 5DALB 3UL3A 4LL4B 2B1LA 4TKYA 1YEXA 3O6TA 3F6FA 4FH8A 2R5GA 5E59A 2LKUA 1YDKA 2K8SA 1PL1A 3F8UA 4OD7A 4BWSA 2IMEA 4IVFA 2H1DA 2EIOA 3LYKA 4PQ1A 4N11A 2YWIA 4ZBAA 2YP6A 1GH2A 2FWFA 3GSTA 3C73A 4KH7A 1A0FA 3N5OA 1EOGA 1SL0B 2TIRA 3VPTA 2L4CA 2HRFA 2O7KA 17GSA 3F4TA 2M46A 4BWQA 1OE7A 3FHKA 2GT6A 1VF2A 4YAVA 1XW9A 4G9HA 8GSSA 1ZYQB 1FHEA 3HD5A 1WRYA 4JR6A 3UIWA 4I2TA 3H79A 2I4AA 5JWRB 3D4TA 4GRFA 4X1UA 2C4JA 2QGVA 3CXGA 4ZBDA 2A2RA 1IYIA 4LMVA 4BPYA 3IC4A 4HS1A 1TTZA 4RUVA 1PMTA 4QQ7A 3BCIA 2VD0A 1FW1A 1PQNA 3DRNA 3IBHA 2KLXA 4HDEA 3BBYA 3CSIA 1YEPA 1T4YA 3HVSA 1TK8B 2GSSA 3LEFA 3RPNA 1Z7PA 3RHCA 1SKWB 4ISDA 4K8MA 3GIXA 2J23A 2N5FA 3EINA 4I2UA 1EV4A 3TJKA 3UAPA 2JADA 1SJ6A 5G30A 1MDIA 3IA1A 1QK8A 2DJ0A 1JZRA 3IHQA 5HQPA 1YQ1A 1X9SB 3Q74A 5D9VA 2EIRA 2M72A 5C00A 1TU7A 1TRUA 2JSZA 2JL4A 2X99A 4HZ2A 2LV3A 2LQOA 2C80A 4XCSA 5ECIB 3GHAA 4XRDA 3FKFA 1VF1A 4GXZA 3EU3A 1MEKA 1JHBA 5JCGA 1O6JA 1YKAA 3F63A 3BCKA 3DD3A 4DSSB 3QCPA 1LJRA 5CRHA 3FZ5A 4FIWA 1FO5A 1K0DA 5DQYA 1AW9A 4KUNA 4MPGA 1YF0A 4MH2A 3GH6A 3D0ZA 1SYXA 4G10A 2X8HA 3GTUB 2GQMA 3VK9A 5ECRB 1TKDB 2LTKA 2DJ2A 3TKSA 1QUWA 2WRTA 3TDGA 5HR3A 4BVYA 4NXIA 2BTOT 2IN3A 2VOCA 3TKSC 3ZFLA 1TRWA 1SYRA 3KXOA 4I6XA 1ILOA 2QC7A 1G7EA 2JACA 3IAS2 5IOXA 4FO5A 3VLNA 5L71A 5ECOB 2DIYA 4JBBA 4Q5RA 3IK7A 5GAND 2FHEA 2HRNA 4ML1A 5KN1A 2FLSA 2YOIA 2YCDA 3C1RA 2GTUA 3ZMKA 1M2AA 4KDYA 1WP0A 3L78A 2YN1A 3ZITA 1THOA 4FYCA 5ECLB 1M9AA 4PNFA 3QPMA 1M2DA 2CAIA 2GDRA 4ECBA 3IDVA 2I9HA 3TKPA 1SD8A 2AHEA 2QKEA 2HI7A 4E8HA 3W8SA 4L5LA 5KN2A 4POKA 2WDUA 5ECQB 3VI5A 5LNKe 3E0UA 1XCCA 1O7UA 2AAWA 4V1Ap 4POMA 1W89A 1BG5A 4HQZA 5D9WA 3BOAA 2P0GA 3H1NA 5DDLA 4D73A 1HD2A 4EF0A 1X0RA 2GVPA 4K1FA 4HZ4A 4QL7A 5GZZB 4JZQA 1GNEA 1V2AA 1XWKA 2IWTA 5HFGA 5GSSA 3ME8A 5D96A 2WFCA 4XIHA 6GSSA 1N2AA 2NDOA 4TR0A 3E9JB 3KMOA 3KZQA 2B5EA 2YZUA 4ACSA 4D73B 1B4PA 5CAXA 4PX1A 4POLA 4WF4A 3VWUA 3ISOA 1V58A 2VO4A 1S3CA 5B8BA 2FY6A 1V98A 1EEMA 5B8AA 4POBA 4TXOB 4BVXA 4ZXGA 1SKSB 4WBRD 5DAKA 3HZ8A 5J9BA 3D5JA 2MMNA 5IMDA 4N10A 1FVKA 5HFIA 1MDJA 2RUFA 4K7NA 2OBIA 3FYGA 4MLYA 4MK3A 2IFQA 3P2AA 3C71A 4NV5A 3GMFA 1U88A 2F8FA 3RDWA 2I3YA 4MZWA 3DMLA 3TRXA 1EWXA 5DAKB 4ECCA 5DQSA 2BJXA 2C8UA 3I9V2 4CHSA 2R2JA 2DMMA 1K0CA 1T7PB 1XIYA 2L57A 2B6MA 4FYUA 2OE1A 3L9SA 1PL2A 2GZZA 3F4SA 1T1VA 1G6WA 2IFQB 1LBKA 3EE2A 2E2MA 1QMVA 2B1KA 3MNGA 1XOBA 3NIVA 2DBCA 3MWHA 1ERUA 11GSA 3FRCA 2L6CA 1EGRA 2PPTA 1UC7A 3HVVA 3HYPA 5CRGA 4ML6A 4ZB9A 2VL9A 5D93A 4EC0A 4JRRA 3F3RA 4IHUA 4IGJA 3J7Yk 3FR6A 1EP7A 2HXKA 2H6ZA 1HNCA 2AYTA 4GQCA 4TR4A 5EPFA 2H19A 4Q5NA 1K0BA 2AUVA 4TN8A 1PSQA 1O81A 2HZEA 2D2ZA 2EC4A 16GSA 1JZWA 4J56E 4MA9A 2OADA 3GX8A 1A2MA 3M8NA 3FZ9A 2F3MA 4IS0A 1PX6A 1GSEA 2YNXA 4CDOA 2H0HA 3VURA 1EZKA 2HE3A 3A2VA 5CYYA 4ECJA 5B6NA 2FD3A 5AIXA 2C0GA 2OA7A 1FVJA 1OC9B 3V1WA 5DVBA 1ACVA 2OE0A 4GQFA 1UN2A 4O92A 4ZB6A 3TUEA 2GGTA 1PKZA 4MP4A 3TGZA 1YKCA 2IMKA 1USBA 3QAWA 4HI7A 2V6KA 5AGYA 3CYNA 4XS4A 5CREA 3F4RA 5EL8A 3D21A 2GT5A 4WKWA 3JCML 4KSMA 1R4WA 1BEDA 1MDKA 1ZCPA 2V6OA 3VWVA 2CVKA 2RM5A 5INYA 7GSSA 3HCZA 4K7OA 2H0IA 2OBKA 4DVCA 3KTLA 4OO4A 3UEMA 4O7HA 4XS4B 2H71A 1OAZA 2H74A 2C0FA 4GSTA 2EIQA 2H1GA 3DGQA 3CBUA 1TP9A 4ZB8A 1XPVA 5DBQA 2OACA 1EOHA 2VCWA 4K2DA 4EDZA 3QD9A 1E6BA 1PKWA 2RM6A 2LEGA 3TJFA 3EURA 3KM6A 2YJ7A 5IO2A 2FGXA 5CRWA 2I81A 5J3RA 2J9HA 1SK0A 4BL7A 2VLUA 1Z3EA 2ES7A 2LUSA 1EV9A 2YZHA 3ZREA 1B48A 5DCHA 2DJJA 3G7YA 20GSA 9GSSA 3NOFA 5B6MA 2MYGA 1F3AA 2CX3A 4KDUA 3EMPA 1DE1A 3QAGA 3WT1A 1EEJA 3I6AA 5CRDA 4HOJA 4EDYA 4WEYA 3KEBA 3L4NA 2FUG2 3QFAC 1J9BA 4RI7A 3EMXA 2PMTA 4TR3A 2PVQA 2X64A 2PVOC 4Q5QA 2H72A 1SENA 1XXUA 3ED3A 2LNTA 4L0WA 3WGDA 5LCZA 1YJ6A 3ZVJA 4MJEA 2O89A 2H1BA 3KJYA 3M0FA 2H76A 5JCUA 3HVXA 4F82A 3GH9A 4MF7A 2TRCP 3FZAA 2VL3A 1OKDA 1XWCA 1CQGA 5DCGA 2AV4A 4L8EA 2VCZA 1SKRB 22GSA 2H66A 1K0MA 4E8EA 1NHYA 1XWGA 1PA3A 1FB6A 2L4QA 4ZIJA 1XWBA 1O8XA 5KN0A 1M2BA 3O3TA 1TI1A 2WULA 1NM3A 3WYWA 3GN3A 4KA0A 4K0GA 4J2FA 4GSNA 5IIZA 2LSTA 1R7HA 3LGCA 18GSA 4KE3A 2B5XA 3VI7A 1ERVA 3HXSA 1K3OA 3TKSE 3MDKA 2YWMA 4MZBA 2M80A 4V2LA 4F2IA 5F05A 1A2LA 3GUSA 2IIYA 4XS6A 4IJIA 1WWJA 4XRAA 1QGVA 2CVBA 5IOWA 3GFKA 2K18A 1T4ZA 2R3XA 1NSWA 1T00A 5IMCA 2A4VA 3PR8A 1A8YA 3IRAA 4WXTA 5F07A 4I8BA 2WGRA 2DIZA 2L59A 2MMZA 5C04A 3TRQA 1FB0A 19GSA 1G6YA 3L9VA 2KP1A 2K9FA 3GX0A 5CNWA 5ABRA 6GSXA 4WR5A 5J4UA 1X9WB 2AB6A 5ID2A 4DEJA 1WE0A 1J0FA 4MJBA 2GLRA 3RAZA 2YANA 3VFIA 2PERA 2GZYA 3P8WA 2F9SA 3FZ4A 5JWQB 2HZFA 4IQAA 4H86A 1GUKA 4KSOA 3J7Yb 1ZZYA 2NVLA 1Z9HA 5ID2B 2C0DA 2GSQA 4F0BA 3GV1A 5HR2A 1TJDA 1FAAA 1TK0B 2LS5A 4O5RA 4KGIA 6GSTA 2G2QA 4WR4A 1S3AA 3P7XA 3EVIA 4TR1A 6GSVA 3LQ7A 4ZBBA 3LYPA 2BMXA 2DMLA 4I5QA 3IE3A 2RLIA 1X5EA 4RQRA 2N5BA 4HU9A 5IMZA 3RBTA 2HSYA 1RQMA 1QXHA 5G5EA 1B9XC 2GS3A 1G0TA 3M9KA 5H5SA 4PXOA 4MF6A 4XHMA 1ON4A 4V1Ag 2KUCA 1URMA 2LJRA 2RIIA 2WZ9A 3G7IA 3LWAA 4JE1A 6GSUA 1OC3A 2E0QA 1XFLA 4IQ1A 1QQ2A 1NW2A 3ZTLA 3CRTA 2GSRA 2KP2A 2HLSA 3Q19A 1WIKA 2LQQA 3APSA 3LG6A 2R37A 3UVHA 3L0HA 2IMIA 5IPGA 4NHWA 5B7CA 3IAM2 4TOPA 3LORA 5JCWA 4AF2A 4EE0A 3DWVA 2ZNMA 3TJJA 3TKRA 1DE2A 1GSYA 4JU5A 5COHA 4L5OA 2V2GA 4I97A 3WGXA 1TI3A 4GCIA 4EVMA 2H1AA 6GSYA 5HR0A 4ULXA 4K9ZA 1Y25A 3HHVA 1RK4A 4AGSA 13GSA 2WCIA 3A3TA 4HEA2 3F6DA 2VCVA 5J9CA 3IPZA 1M7TA 2DJKA 3I69A 2N5AA 3W8JA 3HDCA 5F8BA 1GWCA 5A4UA 2IJYA 3GL5A 1XOAA 2L5LA 3ZIJA 1WMJA 1GTIA 1O73A 1KNGA 1GSUA 2FWHA 3UOMA 4TW5A 2C1YA 3QDNA 5ENUA 4MF5A 4LA1A 5IM9A 6GSWA 1AIUA 2NBSA 4N0VA 4OFNA 5DJMA 4YH2A 1OYJA 2JU5A 2OE3A 1QFNA 3DYRA 2OKAA 3UVTA 1YZXA 3ZL5A 2VIMA 5IMVA 1GLQA 3HA9A 2L5OA 2XHFA 4IN0A 2CAQA 2HSHA 3F0IA 2FCHA 5A4WA 3FR9A 1THXA 5D73A 1XW5A 1M0UA 1Z7RA 1YF1A 2AJQB 4ILFA 3EC3A 4MABA 5ECHB 1TDIA 2DJ3A 4OMVA 4RI6A 3DVWA 5CP1A 1GUMA 1F9MA 5FWGA 3QFBC 4L0UA 2F8AA 4OO5A 5FT3A 5ECKB 1K0OA 3CSHA 1GTAA 2H6YA 5JWOB 2CZ3A 4MH3A 1JLWA 1A2JA 1TU8A 4ECIA 4IBPA 5CO3A 1Q98A 1VF3A 3KGKA 3TJBA 3IOSA 2HNLA 2NTOA 3GNJA 5J5NA 2LRCA 2RUEA 3M1GA 2WS2A 4ZL7A 1H4OA 4DSQA 1X9MB 2CT6A 1JFUA 1SJIA 4XTSA 2K8VA 1HNAA 2GQKA 5G1LA 2CA8A 5H5RA 3CTFA 3VWXA 2F51A 2FA4A 2HZEB 3APOA 3KP9A 3KH9A 2PBJA 2R4VA 1CQHA 1XZOA 1K3YA 5HR1A 2H73A 2XBIA 1DSBA 3BD2A 1MD4A 2C3TA 2PU9C 1I9DA 1E2YA 1K3LA 1ZL9A 3GSSA 4IW9A 4GF0A 4N30A 3I43A 3SWLA 1EGOA 3C1SA 1O85A 1K0AA 4KNDA 2LRNA 1V40A 4PURA 4HQSA 4QL9A 2ZUPA 3W6GA 2B3SA 2YWNA 3K8NA 5IO0A 5DALA 3HJOA 2CV4A 4KB3A 1SL1B 1VRSD 5F06A 3HZ4A 4KW6A 1ZOFA 2O87A 1J08A 2I1UA 1GSSA 3PH9A 5LD0A 3BJ5A 1Z5YE 2VM1A 2H01A 1X5CA 2GSTA 3NZNA 1GUHA 3N9JA 2DSAA 3MSZA 1AQWA 1HQOA 1ABAA 1AQXA 2JZTA 3IV4A 1X5DA 1A8LA 4MCUA 3D6IA 4ID0A 1BJXA 1SL2B 3VPQA 2CVDA 3IK9A 1K0NA 4GSSA 3ME7A 1AXDA 3VWWA 5DJLA 2WJUA 2L6DA 2ZCTA 2GQLA 4WBJA 2V41A 3PINA 1TRSA 2HFDA 2VCTA 3U5RE 2H6XA 1U3IA 3FW2A 4OCEA 3TJGA 1PD21 1GSQA 4F0CA 3EYTA 1B8XA 2TRXA 3U6VA 4HU7A 2IMFA 3H93A 4IJ3A 3HY2A 4V2NA 1NHOA 5IMAA 2MZCA 1OE8A 2VD1A 3SBCA 4YQUA 3ZYWA 2IPAA 5A4VA 1SJZA 3ZIVA 3EU4A 4TVEA 1LU4A 4KCAA 3HKRA 4KX4A 4WETA 4PQHA 4WF5A 3ZFBA 4EL1A 1F37A 3RHBA 3GKNA 5ECNB 2LNSA 1AAZA 1XWAA 4IP6A 3A2XA 5GAPD 3ZMLA 2A2SA 1DUGA 3KIJA 5ECSA 2VCQA 3ZVJD 3WD6A 2CZ2A 2H8LA 4OFTA 5AISA 4HJMA 3EWLA 4YQMA 2O8VB 1KTEA 1Y6EA 2P5QA 1WJKA 5FHIA 2YPMA 4YQVA 5G1KA 2B5YA 4HJ2A 3TB2A 1KBNA 3GKKA 4LLRA 5ECPB 3CTGA 1T3BA 1TRVA 5A5KA 3DIEA 4EXJA 3IR4A 3TOTA 4K0NA 3KTBA 4EUYA 1V9WA 4NWYA 2FNOA 1M9BA 1BYEA 1OVNA 2DJ1A 2ON7A 3GRXA 5KN3A 2ALBA 1WOUA 3G9BA 1PX7A 3LFLA 4EO3A 1BQ7A 4GLTA 1TXXA 4NAXA 2GZPA 5IPHA 3ERWA 2MMOA 1DBYA 1BX9A 4X0XA 3M9JA 1A24A 1FOVA 4DSSA 3MAKA 3UBKA 1SD9A 2HYXA 3M3MA 1UVZA 4KCEA 4FYBA 2YV9A 3KP8A 2FA8A 3LJRA 2VUPA 1XVQA 2YWOA 3E3EA 3GTUA 2VLTA 1ZGNA 10GSA 3QR6A 4CW9A 1I5GA 3GKMA 1JZOA 1ST9A 1GP1A 1SK1A 3ERFA 1C72A 2FWEA 1R5AA 1ERTA 4K7IA 2G0FA 1OC8A 4ZL9A 4N0ZA 1BAYA 2H0GA 4V2MA 1GLPA 1GTUA 4AJ8A 1GNWA 1N8JA 2VLVA 3D4MA 2DC5A 1F2EA 4G2EA 3UJ1A 2E7PA 1GSFA 4MJCA 3FEUA 1Z6MA 4LL1B 4RQXA 5ELGA 1UA5A 4IELA 2IL3A 1Q4JA 3UARA 2LJKA 3OR5A 1S3DA 4F03A 4PUAA 4YAPA 2K6VA 5E4WA 3CRUA 2P5RA 2HT9A 1JLVA 5D9TA 3WT2A 2YJHA 3DKSA 4EKZA 4ZL8A 3TCOA 3GURA 5F0GA 5G31A 4TR1B 2NPBA 4OWYA 1Z6NA 3IXRA 5G2ZA 4AJ6A 4PUFC 3DEXA 5J41A 1G7OA 1VGLA 14GSA 2C3NA 4OCFA 2XC2A 4MZCA 4K6XA 2H70A 3ERGA 2KHPA 3FR3A 1ERWA 3H4KA 1GTBA 4MMMA 4GWRA 5H5QA 3F9UA 2H30A 3APQA 5KEJA 4Q5FA 4MJAA 2OJLA 3KD0A 1U6TA 1O8WA 2LRTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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