4X1UA

The structure of ahpe from mycobacterium tuberculosis revisited
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
157
structure length
156
Chain Sequence
PRGSHMLNVGATAPDFTLRDQNQQLVTLRGYRGAKNVLLVFFPLAFTGIQGELDQLRDHLPEFENDDSAALAISVGPPPTHKIWATQSGFTFPLLSDFWPHGAVSQAYGVFNEQAGIANRGTFVVDRSGIIRFAEMKQPGEVRDQRLWTDALAALT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Mycobacterium tuberculosis
publication title Revisiting sulfur H-bonds in proteins: The example of peroxiredoxin AhpE.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative peroxiredoxin MT2298
total genus 50
structure length 156
sequence length 157
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2014-11-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4x1uA00
4AGSA 4OD7A 1SYRA 1GSDA 2QKEA 1RQMA 4OFTA 4TXOB 3UVTA 3TDGA 1ML6A 2KLXA 3QAWA 1QFNA 2AUVA 1O6JA 1YEXA 3DKSA 1QUWA 4TRXA 3IK9A 3DVWA 2VAFA 2QSIA 4WR5A 1FG4A 2CVBA 4IJIA 4Q5RA 6GSSA 4KAEA 4WR4A 1A24A 6GSWA 2NDOA 2YNXA 1MDIA 1F3AA 5DVBA 2GTUA 1G6WA 3M9JA 5ECOB 1EEJA 4TVEA 2DMMA 3CRTA 2HNLA 2B7KA 2C0DA 4POBA 1VF1A 2I1UA 4OCFA 4DSSA 2LNTA 2C3NA 4X43A 3VWUA 3GIXA 1I9DA 3VPQA 4I2TA 3N9JA 4IGJA 2AHEA 3E9JB 4PX1A 1ZYEA 4ECCA 1NW2A 2VL3A 5B7CA 4KW6A 3DWVA 3RPPA 3G7JA 3FRCA 2RUEA 1T1VA 1TP9A 2CAIA 2RM5A 3TRPA 2Z9SA 4RI7A 1R26A 3G9BA 2HRFA 5D9XA 1EGOA 1ABAA 1GSUA 1Y6EA 2X8HA 1ON4A 3GKNA 4G19A 4ZB9A 2PPTA 3LXTA 5D9WA 1WPIA 5G5FA 3N5OA 1J08A 5CP1A 3QFBC 4ID0A 1VGLA 4PNFA 4YAPA 4L0UA 1A23A 1XVQA 3EE2A 4EE0A 2DMLA 1Z6NA 3A2XA 1U88A 1YKCA 4ZL7A 3ZLPA 1A2MA 3PR8A 1K0NA 2IPAA 5ECKB 5HQPA 5J4UA 5FT3A 4K7IA 5ENUA 3TB2A 4EL1A 2H1AA 3CTFA 2MMNA 4RQRA 1URMA 3Q74A 1WP0A 3IXRA 5DALA 4JZQA 2YWNA 1W89A 2DIYA 3DIEA 1SKRB 4MZCA 1G6YA 4WEYA 5F8BA 2C0GA 3D6IA 4FYBA 5A4VA 4OFMA 4NPBA 3MNGA 3WGXA 1ZZYA 4DSRA 1QK8A 5G5EA 5ID2B 3I6AA 2JZRA 5KN0A 2XHFA 4IJ3A 1GSEA 4AJ7A 1GULA 4EDYA 4J56E 1TRUA 3AY8A 3EU4A 10GSA 2ALBA 2FWEA 1Q98A 4HOJA 3DD3A 3NZNA 1ERVA 3U5RE 2KUCA 5AN1A 2TRCP 5HR0A 3CSIA 5IM9A 3O3TA 1K0CA 2HZEA 2KP2A 1H4OA 2LJAA 1V40A 3CXGA 2DJ1A 3MDKA 3W8SA 4EO3A 1TKDB 4EC0A 4EF0A 3M9KA 1K0BA 2F9SA 2KOKA 2N5FA 4TN8A 3HVXA 2GZPA 1EGRA 4K8MA 3V1WA 5CYYA 2H71A 2IMIA 3KH7A 3SBCA 1TOFA 4IN0A 1AQVA 5F05A 1KNGA 2ZCTA 3IBHA 3WYWA 4LLRA 3HCZA 3ZIVA 4TXOA 1K0MA 2HE3A 1OC9A 4FYUA 4V1Ag 2RIIA 4TR0A 2VCXA 2CA8A 4HS1A 4ISDA 3ZL5A 1QGVA 1CQHA 1SK1A 3TJBA 2RLIA 2LQQA 5CRGA 3RBTA 2OE3A 3FEUA 4TR3A 1I5GA 2IMEA 2VL2A 1HNAA 1PQNA 3W8JA 2DJJA 4NAXA 1ERWA 3GX8A 5IOXA 2CZ2A 1HNBA 5IPHA 5J3RA 4ZILA 2PERA 5IMFA 3VPTA 4ZL8A 5D93A 1JFUA 5ECLB 1TU7A 3H4KA 1UC7A 4KUNA 1XOBA 1E6BA 3TKPA 1TK8B 2FY6A 2HI7A 1YQ1A 2RM6A 1FB0A 2FA8A 4WF4A 4PQHA 4F0CA 3IRAA 1T8EB 1XPVA 4GTUA 3TUEA 3EMPA 4ZL9A 5KN1A 1X9WB 4K9ZA 1PKWA 3GUSA 1ERUA 4E8EA 2VOCA 3BD2A 3UIWA 3GFKA 1XCCA 3HYPA 5J9CA 1TTZA 1XWCA 5ELGA 2B1KA 4KDUA 1U3AA 2VL2C 4MCUA 2HYXA 3RPNA 4ZBBA 4YAVA 3HXSA 4IQAA 3WGEA 3GKKA 3S9FA 3E3EA 2B3SA 5GAPD 1R5PA 2AJQB 1PMTA 4PGTA 3J7Yk 4GSSA 3UL3A 3A2WA 3GURA 3F63A 4TR1B 2FGXA 4PXOA 3ZFLA 3EVIA 1KTEA 2V32A 2H74A 2XPDA 3GH9A 3HJPA 4YQMA 1YY7A 5G31A 2H8LA 1A0RP 1MEKA 3CSJA 1AUCA 2I81A 1KEBA 1GLPA 2H19A 1ST9A 1N8JA 3UJ1A 2B7JA 1PN9A 1BJXA 2HRNA 4JR4A 5C00A 2CQ9A 3UBKA 2TIRA 1CQGA 4FH8A 2GT6A 1GNWA 3QOUA 1MTCA 18GSA 5KN2A 1ZOFA 4HU7A 5CO3A 3GKMA 3CRUA 1FO5A 2FWHA 2R37A 4ZBAA 3C8EA 2PVQA 2H01A 1DSBA 1TW9A 3O76A 4I6XA 5COHA 6GSUA 2YV9A 1KBNA 1LBKA 2FA4A 2MBTA 2LRTA 3I9V2 3CSHA 2DJKA 2GVPA 3GL3A 4MH3A 1EP7A 2WS2A 5ABRA 1O73A 4GXZA 6GSYA 4V1Ap 5E4WA 5DCHA 3LYPA 3TKQA 3BOAA 3L9VA 3L0HA 3BJ5A 2C8UA 3M8NA 4KDYA 1SKWB 3FK8A 5ECQB 1X5DA 4ZIJA 1TDIA 5DQSA 4N0VA 4PQIA 5J5NA 1FOVA 3VI7A 3UOMA 5L71A 3TOUA 5C04A 3ED3A 4Q5FA 2OA7A 1A8LA 2GZZA 3P8WA 5HFGA 2F3MA 4I97A 4POKA 5IO0A 3P7XA 1X0RA 3HKRA 3IPZA 1WIKA 3ZREA 1HYUA 3LG6A 1JZRA 2FWGA 1GUMA 4KGIA 2B1LA 1OE8A 3HDCA 2D2ZA 5AISA 1PKZA 4XRDA 2GQKA 5DDLA 6GSVA 3HVVA 2B6MA 1BX9A 3GN3A 2GT5A 5GZZB 4BVXA 4G9HA 1THOA 5JCGA 3FZ5A 1Z3EA 2X99A 1AW9A 3UMAA 3CYNA 3KGKA 4RUVA 4AF2A 1XWKA 4HEA2 1B48A 1OE7A 2YANA 1M0UA 1M2BA 2OKAA 4JBBA 4MA9A 5EPFA 5GSTA 5KN3A 5JWQB 3APQA 3PGTA 5JWRB 4K0GA 4YQUA 1NM3A 3F9UA 4L8EA 3D22A 5A5KA 1J9BA 3GL5A 5EL8A 4YH2A 2VCVA 5J9BA 3QPMA 4MH2A 3D4TA 1Z6MA 1HD2A 3OR5A 3A2VA 2YPMA 4QL9A 2PBJA 1GTAA 3D5JA 5CRDA 1FW1A 3L78A 3LJRA 2H6ZA 13GSA 2PN8A 2VCZA 3I69A 3QAGA 1XBSA 4FYCA 2GS3A 1RW1A 4KCEA 1ACVA 2L59A 3ERGA 4DSQA 3EURA 4I2UA 3J7Yb 9GSSA 4NV5A 2WJUA 3WGDA 2V2GA 3UBLA 1SL0B 5IIZA 4OO5A 3BCKA 5HFIA 1OC8A 4BL7A 4BVYA 2DSAA 4EDZA 4HI7A 1FAAA 4TR1A 4AJ8A 1ERTA 1ZCPA 4NHZA 3LYKA 4KB3A 1GUKA 1DE1A 4JE1A 1SENA 4L5LA 5B8AA 5D8IA 4IP1A 2I9HA 1OVNA 4I8BA 4D73B 2C80A 3L9SA 4J2FA 4TR4A 7GSSA 1SD8A 4GSTA 3DYRA 2H6YA 3QDNA 4MMMA 1THXA 1TU8A 1EV4A 1NSWA 4RI6A 2C3TA 2P5QA 3LORA 1EOHA 4XHMA 1HNCA 3EC3A 3C1RA 5AIXA 1Z9HA 4TW5A 3PINA 1TRVA 2OE0A 1NHYA 2R2JA 2YN1A 2EIOA 4O32A 3VWXA 3IA1A 1BEDA 1MD4A 4XS1A 3TRXA 1YJ6A 1GUHA 3DEXA 5LD0A 3FR6A 4JEDA 3E0UA 2LRNA 3FR3A 4KX4A 3VWVA 4NXIA 5HR2A 2EIRA 3C71A 4CW9A 4FO5A 4HDEA 2X8GA 1Y25A 3G7YA 1SK0A 3Q6OA 5LCZA 2YOIA 3CMIA 3TJGA 3TJFA 4QL7A 1XW9A 4TKYA 3F4RA 3F8UA 2P0GA 4F0BA 1GSFA 4WBJA 4YQVA 1MDJA 3TCOA 3G7IA 2GZYA 2H30A 3KM6A 4BPYA 2H6XA 2IFQA 3KCMA 2DBCA 1SU9A 1OYJA 1XW6A 3KP8A 2GSQA 3VI5A 11GSA 2A2RA 2GSRA 3UEMA 2LNSA 5F07A 4OCEA 1QXHA 3ZRDA 3DRNA 2FCHA 3GV1A 1AC1A 5D9TA 1X9MB 3KXOA 2X64A 2CAQA 4OFNA 2MMOA 2IWTA 1SJ6A 5IMDA 4IS0A 5ECPB 3APSA 3JCML 3W6GA 1SL1B 1LU4A 1EZKA 4MPGA 2HSHA 3H8QA 4BWSA 1BAYA 4X0XA 3BCIA 4DVCA 1XFLA 5GSSA 4K0NA 4GCIA 4JRRA 3ZVJD 4IBPA 2YCDA 3ZMKA 1WMJA 2O89A 3F4SA 2DJ3A 4WKWA 2ON5A 4BA7A 3IK7A 3EU3A 5J41A 4LL4B 2O8VB 2HT9A 1XWAA 4XS4B 2JACA 1TK0B 1BG5A 2LEGA 1SYXA 5D9VA 3KMNA 2IMKA 5CRHA 3KZQA 5H5SA 4EXJA 3IAM2 4KE3A 2YWMA 3F0IA 1K0OA 3MSZA 1XIYA 2C0EA 2FUG2 2PU9C 3QD9A 3UAPA 3GNJA 2LV3A 3M0FA 3MWHA 2FD3A 2GLRA 4P3YB 3KH9A 2MZCA 2LKUA 5DJLA 3KP9A 2P5RA 3KIJA 1U6TA 3FZAA 2WGRA 4IQ1A 3LEFA 1TXXA 2M80A 1A0FA 3HVSA 2OBIA 1R7HA 2DJ2A 3D0ZA 2CZ3A 4KDXA 1ILOA 1YEPA 4AJ6A 4DSSB 2B5YA 2K18A 1J0FA 3LQ7A 1F37A 3P90A 4IHUA 2B5EA 2YJ7A 1SK2A 1EP8A 4ACSA 2QC7A 2PMTA 2HZFA 3EMXA 4MF5A 5F06A 2VL9A 5JWOB 2E0QA 4L5OA 5ECRB 1X9SB 3VK9A 5IQYA 2VLUA 4XS6A 3F4TA 1F2EA 3IR4A 1F9MA 1VF2A 1SD9A 2V6OA 2DJ0A 2IMFA 4MJCA 3D4MA 1F3BA 5IMCA 3ZMLA 2O7KA 2M46A 4O7HA 5ID2A 5CAXA 1VF3A 3TGZA 1GLQA 1UA5A 4G10A 4F2IA 1FB6A 1GSQA 2I4AA 2REMA 1U87A 2F51A 1WWJA 4ML1A 4XTSA 5IMAA 1ZMAA 2L6DA 4JR6A 4ILFA 2LJKA 4K2DA 4MK3A 2VO4A 5DALB 1V98A 1K0DA 2C0FA 1OC3A 1SKSB 2EIQA 2ES7A 3O6TA 2JZTA 1XZOA 4KCAA 4PUFC 5GAND 1YZXA 3R2QA 5A4WA 2RUFA 2R6KA 1C72A 4I5QA 2OBKA 3F3QA 4LL1B 4MJAA 16GSA 1EV9A 1O85A 20GSA 3FYGA 1GTIA 3I43A 2GSSA 2XBQA 4N0ZA 2MYGA 2LJRA 2WB9A 1Q4JA 4NHWA 1PL2A 2H0IA 4MJEA 4O5RA 1V58A 2CX4A 2CT6A 4ULXA 3ZVJA 5F0GA 3APOA 1M9BA 4QQ7A 1Z7PA 2AV4A 2GDRA 3P2AA 1GTBA 5DAKB 1EEMA 1SJIA 2CVKA 22GSA 4HZ2A 3HZ4A 1TI3A 1ZL9A 2VLVA 5IOWA 4PQ1A 2R5GA 4BWQA 4N30A 1WJKA 3GH6A 1O81A 1K3YA 2A2SA 2MMAA 3IE3A 3L9UA 5IMZA 2HZEB 5KEJA 1XOAA 1BYEA 3FZ4A 4Z7XA 3ERWA 3GSTA 2JSZA 3GX0A 1FVKA 3H1NA 1AAZA 2IN3A 4XS4A 3TKRA 1U3IA 2E2GA 2GQMA 2LSTA 2YJHA 4GRFA 2MMZA 3GTUB 3ZZXA 2N5AA 1O8WA 1B4PA 3KMOA 4EKZA 2L5LA 3MAKA 2YP6A 1OC9B 1WE0A 1AIUA 8GSSA 1BQ7A 1S3AA 1A2LA 2JU5A 2PVOC 1SL2B 3VWWA 1B9YC 1VF4A 1PSQA 3FY7A 3KD0A 4FIWA 4WXTA 4JU5A 2XBIA 4MF6A 2L4QA 12GSA 5ECMB 5DJMA 1T00A 1R4WA 4K7NA 2L4CA 4CHSA 3QFAC 3HY2A 3U6VA 4ZXGA 4GWRA 4V2LA 4EVMA 1V9WA 1DBYA 2I3YA 3ERFA 3VURA 2VIMA 2NTOA 2J23A 5B6MA 1GH2A 2H66A 5G1KA 4ECBA 5INYA 3HJMA 4GLTA 2CX3A 2H1GA 2H73A 4XCSA 3C7MA 2HLSA 2OJLA 1G7EA 2K8SA 1R5AA 4LMVA 5CNWA 1AQWA 1TK5B 2NPBA 3CTGA 3ISOA 3IOSA 2OADA 2H70A 1QQ2A 2CV4A 3TKSE 1GWCA 3GYKA 1DE2A 3NIVA 2K9FA 2ON7A 2IJYA 5ECSA 1AQXA 1MD3A 3ZYWA 4OMVA 2P31A 2F8AA 1PD21 3DXBA 2M72A 2JZSA 5G1LA 2V41A 3EINA 5DBQA 1GL8A 3PH9A 3LGCA 4X1UA 2IL3A 4RQXA 2NVLA 4MZBA 1JZWA 1ZYQB 2YZUA 4GQCA 1M7TA 1X5EA 2LQOA 3FR9A 4LMWA 3QCPA 2G0FA 1PRXA 1K3LA 1V2AA 2BTOT 1VRSD 4IKHA 2VCWA 5JCUA 4G2EA 2J9HA 3GHAA 2O85A 2VD1A 1T4YA 2HSYA 2X8CA 4Q5QA 3DVXA 1SJZA 5AIVA 4MPFA 2HXKA 3FZ9A 1M9AA 4WETA 2TRXA 3RDWA 4MF7A 4V2MA 1TI1A 1DUGA 1B9XC 4XIHA 3F6FA 5FWGA 1A2JA 2FNOA 3VFIA 3KTBA 3LSZA 1PX6A 2L6CA 2XPEA 4MLYA 4PURA 2VCTA 1LJRA 5DAKA 4ML6A 2FLSA 2YWOA 3GA4A 3FHKA 4K7OA 3FW2A 4KSOA 4ZB6A 3HHVA 4MABA 2DLXA 3LFLA 4Q5NA 1V57A 1IYIA 1S3DA 1YF1A 4F9ZA 1Z7RA 1TRWA 4MJBA 3TJKA 3DMLA 2L5OA 5ECHB 1PX7A 5H5RA 2JL4A 4GQFA 1O7UA 2AYTA 1G7OA 3GSSA 4POLA 1USBA 1AXDA 1A8YA 2FWFA 1ZGNA 1E2YA 2G2QA 1B8XA 1YDKA 17GSA 3GTUA 1K0AA 1JLWA 2CVDA 4HUAA 4MZWA 1M99A 1YF0A 2BMXA 5HR3A 4PUAA 3Q18A 4IP6A 2NBSA 2JSYA 5ECIB 2O87A 4IVFA 1JLVA 5G2ZA 4HQSA 4CDOA 4HZ4A 2DC5A 3WT2A 2VM1A 3A3TA 4E8HA 3KJYA 4POMA 4HU9A 2VM2A 3D21A 2VLTA 3ZIJA 2AAWA 4KNDA 4F82A 2IIYA 1N2AA 4L0WA 1T7PB 2FHEA 6GSTA 4N11A 3F6DA 2H0HA 2F8FA 2VCQA 2H1BA 19GSA 3CBUA 2OACA 3EWLA 3GMFA 3QAVA 5ELAA 1WOUA 2K6VA 4ZB8A 1OKDA 2AB6A 4HJMA 2R4VA 1UN2A 5E59A 4NMUA 3QMXA 1B4QA 1FVJA 3ZFBA 4N10A 3RHCA 3WD6A 1GNEA 1XVWA 5B6NA 4F03A 1Z5YE 2C4JA 4NV2A 5EY6A 5IMVA 4KH7A 1YKAA 3HZ8A 3K8NA 2ZNMA 1EWXA 2E2MA 3ME8A 3WT1A 1T3BA 2WULA 4ECJA 4EUYA 3HD5A 2BJXA 1PL1A 5AGYA 1XWBA 4OO4A 4K1FA 3RAZA 3C1SA 4D73A 2V6KA 5ECNB 1M2DA 3VLNA 1T4ZA 3TRQA 4XRAA 5B8BA 3KTLA 1GSSA 5DQYA 1XW5A 2XC2A 4KA0A 2JADA 2N5BA 2GQLA 3TKSA 1JZDA 3ZITA 2WZ9A 1OKTA 2E7PA 3IAS2 1PA3A 2VUPA 3TOTA 2LUSA 3SWLA 1MDKA 3GRXA 1GRXA 1JZOA 4V2NA 3RHBA 1NHOA 1TJDA 1GTUA 5A4UA 2H76A 2LS5A 1S3CA 4O92A 3KEBA 3UARA 3H93A 4MP4A 3L4NA 3IDVA 4IELA 2KHPA 1JHBA 1FHEA 2R3XA 2LTKA 2WRTA 2YZHA 3NOFA 4TXVA 3M3MA 1OAZA 2KP1A 2GGTA 2C3QA 3Q19A 5DCGA 2PWJA 5D96A 4GF0A 2WDUA 3HA9A 2DIZA 1GP1A 3IV4A 5IO2A 2L57A 2H72A 2H0GA 2PGTA 3TJJA 2K8VA 1X5CA 5H5QA 1RK4A 2GSTA 2IMDA 3TKSC 2H75A 1W4VA 1G0TA 5CREA 3M1GA 2YV7A 14GSA 5FHIA 1F6MC 1GSYA 1H75A 2B5XA 4IW9A 3IHQA 3HJOA 2ZUPA 4K6XA 2A4VA 3ZTLA 3F3RA 4GSNA 4TOPA 4MDCA 4H86A 1K3OA 4ECIA 4PNGA 1TRSA 4WBRD 5CRWA 3DGQA 2MBSA 4LA1A 3EYTA 2HFDA 2C1YA 3LXZA 4OWYA 1O8XA 3A5WA 1XXUA 4J57E 4DEJA 3H79A 2LRCA 3LWAA 1WRYA 4HQZA 5HR1A 2YWIA 2WFCA 1QMVA 5IPGA 3FKFA 2WCIA 1XWGA 2VD0A 2EC4A 4KSMA 4ZBDA 5LNKe 5EVOA 2H1DA 4HJ2A 2PUKC 2V1MA 3IC4A 4NWYA 5JCWA 2IFQB 5HFKA 3US3A 3ME7A 2QGVA 3UVHA 6GSXA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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