4XCSA

Human peroxiredoxin-1 c83s mutant
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
179
structure length
179
Chain Sequence
GSHMSSGNAKIGHPAPNFKATAVMPDGQFKDISLSDYKGKYVVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDRAEEFKKLNCQVIGASVDSHFSHLAWVNTPKKQGGLGPMNIPLVSDPKRTIAQDYGVLKADEGISFRGLFIIDDKGILRQITVNDLPVGRSVDETLRLVQAFQFTDKHGEVCPAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Dimeric Human Peroxiredoxin-1 C83S Mutant
doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-1
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 54
structure length 179
sequence length 179
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2014-12-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4xcsA00
1ILOA 4NV5A 4K8MA 2RM6A 4DVCA 4FH8A 1GSDA 2GZYA 2GSTA 2CZ2A 5DALA 3RHBA 2R4VA 3J7Yb 3N9JA 4DSSB 2H1DA 3G7IA 3LYPA 4ZXGA 2A4VA 3DWVA 6GSXA 2IMDA 3CTFA 5C00A 4EL1A 2IFQB 3VURA 2AB6A 3KGKA 1YEPA 4KCEA 3CBUA 3HZ4A 1PMTA 2B6MA 1TXXA 4F0BA 3M1GA 2IPAA 1EGRA 2ES7A 3O3TA 1TK5B 2MMNA 2H6ZA 5JCUA 4ACSA 3APOA 4KH7A 2YWNA 1X9WB 1BEDA 3D21A 1GTAA 3UMAA 3ZYWA 3GYKA 3F6FA 2F8FA 3J7Yk 5D8IA 4HZ4A 3QCPA 4LMVA 1J0FA 5ECNB 1M0UA 2F8AA 4ZILA 1A2MA 2RUEA 3D4TA 4RQRA 3FHKA 1GSSA 5ECSA 1U88A 2R37A 2WB9A 1N8JA 3QPMA 1ABAA 3LWAA 4NHWA 3UIWA 2DMLA 6GSYA 1GSFA 1PKZA 3UL3A 10GSA 1BAYA 4P3YB 3HKRA 3PR8A 1JZWA 1T8EB 4IJIA 2VIMA 3EU4A 2YJ7A 2EIOA 3FYGA 3H8QA 1B4QA 5FWGA 2HZEB 1M7TA 3HVSA 3I6AA 3TJKA 2ZCTA 2P5RA 1BQ7A 3D5JA 1I5GA 1W89A 1EEMA 1Z6MA 2G0FA 4K7IA 4Q5RA 4MZBA 1OC9A 1HQOA 2IMKA 1QMVA 1RW1A 1HNAA 2LRNA 2GVPA 3DEXA 3MWHA 5AIXA 3RDWA 1FVKA 3A3TA 3WGDA 4MABA 5JWQB 2PU9C 4QL7A 4TR4A 1XPVA 1X9MB 1SL1B 3VWUA 4QQ7A 4OO4A 2K6VA 1WRYA 2RUFA 3C73A 3GX0A 4F82A 22GSA 11GSA 1WE0A 2YN1A 1AC1A 1ML6A 3HZ8A 1A2LA 5DAKB 1DE2A 4CDOA 5DQYA 1R5AA 2C4JA 3TDGA 4KSOA 4Q5NA 2AJQB 3F3QA 4TN8A 2YCDA 1OE7A 2BMXA 5B6NA 5EVOA 2FWFA 3CMIA 2FY6A 2AV4A 2YZUA 4WR4A 4K0GA 4KUNA 3GKNA 5F07A 3TRQA 2VM2A 2H6XA 2E2GA 5GAPD 2H01A 1OAZA 2P31A 5LNKe 3FY7A 4MCUA 4E8EA 2A2SA 1KNGA 4I2TA 4IP6A 2PMTA 4ZBDA 1YZXA 6GSUA 4BL7A 1SKWB 3KJYA 4WR5A 1TK0B 3APQA 2LS5A 1TI3A 1NSWA 2M80A 2X8GA 4Z7XA 4XS6A 4KX4A 1S3AA 1OE8A 2PVQA 4ZB6A 4KCAA 2KHPA 1XWCA 2GDRA 2C3NA 3UBLA 1K0BA 1X5EA 3EVIA 4HU9A 1EP7A 5DJLA 1K3YA 3D6IA 5EPFA 4KDXA 5H5RA 1FAAA 2H1GA 1ERUA 3IA1A 1Y6EA 3E3EA 2OA7A 2HSYA 3H93A 5C04A 1MD4A 1WOUA 3CSIA 4GWRA 1LU4A 1GNEA 2IWTA 3IRAA 5A4WA 3EC3A 4NHZA 1SK0A 2N5AA 4DSSA 3VK9A 3ZVJD 16GSA 2JL4A 4FIWA 1ST9A 3HA9A 1YDKA 2N5FA 1MTCA 4TW5A 2XPDA 1AUCA 2V41A 4K7NA 5IM9A 1YKCA 2HZFA 1F3BA 3ZIJA 2PWJA 1MEKA 4MJEA 3HY2A 4TVEA 4JE1A 4K6XA 4I2UA 2O8VB 2NPBA 4XIHA 1TK8B 1OVNA 1O8XA 3LJRA 1SK2A 4JR6A 1X9SB 4GF0A 1MDJA 1GWCA 1NHOA 2VD0A 3IK9A 5ENUA 1UN2A 1OKDA 2GQKA 2V32A 2HYXA 2L59A 2E2MA 5EL8A 5G31A 5IMVA 4EXJA 2WJUA 2R3XA 2GTUA 3VWVA 2YV9A 3FKFA 4K1FA 1AW9A 1M2BA 4BA7A 3A2VA 4X1UA 5IQYA 1A0FA 4N10A 2PGTA 2IN3A 1UVZA 1TRWA 1JLWA 3FW2A 2LEGA 4HQSA 3HDCA 2HI7A 3TJGA 4GSTA 3HD5A 2NDOA 4O32A 2JSZA 3A5WA 5IOWA 4EO3A 3L4NA 20GSA 2V1MA 3GSSA 1TDIA 4XRAA 5G5FA 1SL0B 2FGXA 1DUGA 4WETA 1A0RP 3ZFBA 4PQIA 4PNGA 3MSZA 1KBNA 1G7OA 2AUVA 4AJ7A 1SJZA 4N0VA 4GQFA 3GMFA 2YV7A 2FWGA 1BJXA 1AAZA 2DJ1A 3QDNA 5F05A 1ZGNA 2JZTA 2OACA 3M8NA 1IYIA 3ZREA 3ZFLA 5J9BA 2C8UA 3HXSA 3DVXA 2GS3A 4V2NA 1SKSB 2JZRA 5DAKA 3QAVA 1TRUA 1XXUA 1MDIA 1MD3A 5HR3A 4E8HA 4IW9A 3TKSC 1KTEA 3W8SA 2AHEA 4BVXA 4MF5A 4ML6A 5EY6A 1XWBA 1XW5A 2LNTA 12GSA 3KTBA 6GSSA 1T4YA 3EINA 3IAS2 1HNBA 1GULA 2H1BA 1AQWA 2KUCA 4MDCA 1O85A 4KA0A 3UARA 4OFMA 3Q74A 2LRCA 1EGOA 4PQ1A 2C0EA 5DBQA 4IHUA 3GRXA 2XHFA 3A2XA 4QL9A 1USBA 2L4QA 2HFDA 3ZIVA 2PPTA 3KIJA 2H19A 1T3BA 2YOIA 1TI1A 4ZL8A 3I43A 3M9JA 4PUAA 3UBKA 2ON5A 2I1UA 1HD2A 3P2AA 5ECMB 2MZCA 4BPYA 1GTIA 2JACA 1A2JA 2VD1A 4I5QA 3GSTA 1MDKA 4G2EA 3HJOA 1EZKA 2DLXA 3KCMA 4K7OA 5DDLA 2CVBA 2GGTA 3UOMA 1AQXA 1U3IA 1LBKA 1K0DA 3GTUB 1T00A 4O7HA 4TKYA 3DMLA 4X0XA 1TP9A 1Z7PA 4GSSA 4GCIA 4HUAA 5D9TA 1O7UA 3GKMA 3WGEA 2VOCA 3M3MA 4MLYA 5A4VA 3F3RA 1B8XA 3S9FA 3KZQA 2RM5A 4IBPA 5G1KA 3CRTA 3F4RA 4NMUA 2DIZA 2H30A 3VPQA 3UVTA 2IL3A 3TKPA 1GL8A 4AJ8A 2CX4A 4F0CA 1YF0A 1ERWA 2HT9A 3D0ZA 1B48A 1JZRA 3AY8A 4ZB8A 3KEBA 3EURA 4MK3A 3NIVA 1SD9A 1JLVA 4MP4A 2R2JA 4LL1B 5IMDA 1N2AA 5CNWA 4JU5A 1PL1A 4TR1B 3K8NA 2F51A 3O6TA 2R5GA 3C8EA 4WKWA 5ECPB 4WF5A 4BVYA 3LORA 1KEBA 3PH9A 1WMJA 4XS4A 2YZHA 2ALBA 3BD2A 3P90A 4YQUA 4X43A 3H1NA 3DXBA 4HQZA 1V98A 3RPPA 1VF3A 2MMZA 4NXIA 5IO2A 1U87A 4IKHA 3LFLA 5ID2B 5DJMA 5GAND 2FLSA 1FHEA 4HJ2A 1G0TA 3FZ5A 5L71A 1ZCPA 1XIYA 2WULA 3IPZA 3KTLA 1S3CA 2FCHA 5IMCA 4AF2A 2O7KA 2DBCA 3CYNA 3CSJA 2HLSA 4D73B 2VAFA 5J3RA 4JBBA 3GIXA 3RAZA 1NW2A 4MH3A 1FW1A 5JCGA 3LXTA 3V1WA 2X8CA 4ZB9A 4ZBBA 3QOUA 1V9WA 4TXVA 4TXOB 4N11A 1PX6A 5ECHB 5LCZA 4IP1A 1CQHA 3ERFA 19GSA 1TRVA 1PQNA 3LSZA 1G7EA 2TIRA 2E7PA 4XRDA 1QXHA 1QUWA 5H5SA 1XVQA 1A8LA 3LGCA 2JZSA 3Q6OA 3APSA 4I8BA 1XWAA 4FYCA 4MPFA 5KN0A 2FUG2 2B5EA 3G7YA 2WFCA 4V1Ap 1AXDA 2HRFA 4RI7A 4JRRA 3GN3A 1GSYA 5KN1A 1A24A 1YQ1A 1PA3A 3VWXA 5KEJA 4F2IA 1BG5A 3FK8A 2LV3A 2VUPA 5HR1A 2H0GA 1BX9A 1TTZA 1TKDB 3E9JB 3ZTLA 1VF2A 1SU9A 3HJMA 2N5BA 1Q98A 2HNLA 1Z3EA 6GSWA 2VL2A 5CYYA 1GNWA 6GSVA 1T7PB 3BCKA 3VFIA 5HFIA 3KH9A 3WT1A 3RPNA 1FVJA 3KH7A 4RQXA 1TRSA 2I4AA 3IR4A 4MJBA 2H6YA 3M0FA 1TOFA 1K3OA 4TR0A 2IMIA 3GTUA 4MF6A 4HI7A 2AYTA 1Z9HA 1LJRA 1X0RA 2OJLA 2OBKA 3U6VA 3UEMA 1R7HA 3GX8A 1FO5A 3US3A 3F8UA 2BJXA 3LXZA 5KN2A 4GXZA 1V2AA 5FT3A 1XZOA 2ON7A 5J41A 1ZL9A 1V58A 3O76A 2L57A 3TGZA 4ISDA 1F2EA 4XCSA 3VLNA 4HU7A 1FB6A 1XOBA 5ECIB 2IFQA 3P8WA 4POBA 4Q5QA 4NPBA 4KB3A 5IMFA 2TRCP 4DSQA 1O81A 3DD3A 5AGYA 1EWXA 4FYBA 5DALB 2KLXA 3EYTA 2QC7A 4OMVA 5FHIA 3ED3A 1EOHA 2DC5A 4TR1A 1B9YC 4TRXA 2AAWA 4OWYA 3KP9A 4EVMA 2YWOA 2CA8A 2YPMA 5CAXA 2JSYA 4YQMA 3C1SA 4KSMA 1ZYQB 1DE1A 2VLTA 3QFBC 1THOA 5D93A 1YEXA 3FEUA 2P5QA 5E59A 4OFTA 4IGJA 1XVWA 5COHA 1SYXA 1M2AA 1SD8A 1JHBA 2H75A 5ID2A 4K9ZA 3IV4A 1E6BA 4J57E 5IMAA 1PL2A 1NM3A 1V57A 3EMPA 3RHCA 1K0MA 2O85A 2B5YA 4OO5A 2LJRA 2HZEA 4GRFA 4F9ZA 4POLA 1XBSA 4IQAA 3Q18A 4NAXA 1A23A 3HVVA 4LLRA 1GP1A 2NBSA 4L8EA 2OE0A 3L9SA 1HYUA 2EIQA 3LEFA 1EEJA 1IYHA 4EDZA 1J08A 2H8LA 1V40A 2L6CA 3ZZXA 2X99A 5IPHA 1DBYA 1OC8A 2VCXA 3PINA 4LMWA 3CRUA 1OYJA 2LJKA 1H4OA 1GH2A 1SL2B 2NVLA 3FR9A 3L78A 1QQ2A 3D4MA 2B7KA 3FR3A 1SENA 1K3LA 3IBHA 1TU7A 4TXOA 1VF1A 2JADA 1GLPA 3ZMLA 2VCTA 3FRCA 4V1Ag 1YY7A 2E0QA 5AN1A 3DYRA 2XBIA 2OADA 1Z6NA 4ZIJA 5CRGA 4CW9A 2X8HA 5IIZA 4L5OA 1OC9B 1TJDA 3KD0A 4ML1A 3JCML 4YQVA 1T4ZA 3EE2A 1XCCA 1GRXA 2CAQA 2MYGA 2G2QA 1HNCA 3NOFA 5HQPA 5ECOB 1PKWA 4KGIA 2O87A 3WD6A 3HJPA 2H71A 1WJKA 2REMA 4DSRA 3MNGA 4JZQA 3QD9A 1R26A 1QFNA 1THXA 1K0CA 5IPGA 3R2QA 1SJIA 3QAWA 2LTKA 4EKZA 3MDKA 1X5DA 2X64A 1NHYA 2B7JA 4K2DA 2HRNA 5DCHA 1RQMA 3TRXA 2PBJA 2DMMA 3QAGA 2H76A 2C0GA 1XW9A 4L0UA 2VLUA 2VLVA 3N5OA 2VO4A 4N0ZA 5E4WA 4MA9A 4ID0A 3KP8A 1QK8A 2K8VA 3TJJA 13GSA 3VPTA 4AJ6A 4ZL9A 2K18A 2YNXA 1SK1A 2MMOA 3EU3A 4HJMA 2PN8A 1PGTA 5IOXA 1A8YA 3FZAA 5GSSA 2OBIA 3DKSA 1WIKA 2GZPA 3GA4A 4ECIA 2DJ3A 1YF1A 4RI6A 1K0OA 2OE3A 5F8BA 2D2ZA 5JWOB 3F63A 3GKXA 2HE3A 5ECQB 5ECRB 1FB0A 3TRPA 2GSQA 2ZNMA 2I81A 5G30A 5ECKB 2V6KA 1I9DA 4GTUA 4ULXA 1F6MC 1Q4JA 1O8WA 3G9BA 5IMZA 2FD3A 5D9WA 2IMFA 1PD21 3IHQA 1GUHA 1URMA 5CRDA 2FHEA 2QSIA 3KMNA 3OR5A 5CRHA 3ZRDA 3WGXA 2GQLA 3TJBA 4AGSA 5CO3A 2XBQA 2XPEA 4IN0A 4ECCA 4Q5FA 2CVDA 5HR0A 2FA4A 1F37A 3E0UA 4PXOA 2C0FA 5CRWA 4XHMA 4HS1A 4V2MA 4GQCA 2FWHA 4WXTA 5JCWA 3P7XA 2K9FA 3ZITA 4N30A 2NTOA 1GSUA 1J9BA 1DSBA 4IS0A 1XWKA 2WS2A 3DIEA 3IK7A 5A4UA 3FR6A 4ECBA 3GL3A 5ELAA 3TKSE 2C0DA 3PGTA 1R5PA 1YKAA 14GSA 1UA5A 2PUKC 4WBJA 3D22A 2GSSA 5B8AA 5DQSA 3W8JA 3SWLA 3CXGA 4O92A 3VI5A 1GTUA 5B6MA 1Z7RA 2WDUA 2GQMA 3NZNA 3L9UA 2K8SA 4H86A 2H70A 2LRTA 2EC4A 2I9HA 3LQ7A 3ZL5A 2I3YA 4IJ3A 1ACVA 2H74A 3L0HA 2DJKA 5GZZB 3RBTA 4OCEA 4MZWA 4PNFA 2WCIA 1SJ6A 2VM1A 3CTGA 3HCZA 1JZDA 1H75A 3H79A 6GSTA 1O73A 4MJCA 2IIYA 3QMXA 3DRNA 4MZCA 4EUYA 5GSTA 1X5CA 3IE3A 3ME7A 1M9BA 3A2WA 2MBSA 3TUEA 1VGLA 1ERVA 2VCWA 1QGVA 1T1VA 4PX1A 5HFKA 17GSA 4KNDA 2RLIA 3HYPA 3GFKA 4IVFA 4G19A 3GL5A 2DJJA 2IMEA 2LNSA 1PN9A 2A2RA 2DIYA 4YAPA 3F6DA 4HZ2A 3BBYA 4IELA 5A5KA 4KDYA 1GUKA 3IXRA 5AISA 3VI7A 1CQGA 3ZLPA 3I69A 3ZMKA 2DJ2A 4ECJA 4LL4B 3FZ9A 3KMOA 4EF0A 4J56E 4PQHA 1M2DA 2FWEA 3UVHA 2ZUPA 2H1AA 1VF4A 1SYRA 1JFUA 1B9XC 2LJAA 5G5EA 5D9VA 2PERA 4EDYA 2F9SA 3QFAC 4MF7A 2LSTA 3F4SA 5F06A 3SBCA 1M99A 1C72A 4G9HA 4BWQA 4WEYA 4WBRD 4LA1A 2LQOA 1PSQA 2GZZA 3IAM2 3BOAA 3ZVJA 1O6JA 1S3DA 1BYEA 2H72A 2VCQA 4L5LA 3IOSA 3MAKA 2OKAA 1F9MA 2CT6A 4TOPA 3BJ5A 3HHVA 5LD0A 3IC4A 2WRTA 4OCFA 2DSAA 2IJYA 4O5RA 1WWJA 4OFNA 4CHSA 2R6KA 2V2GA 2CZ3A 2JU5A 1U3AA 3GUSA 3GURA 4PUFC 1W4VA 2M72A 3F9UA 4K0NA 4I6XA 1SKRB 5IO0A 3G7JA 1FG4A 2FNOA 4F03A 4FO5A 5DVBA 5J4UA 4HDEA 5ABRA 5J9CA 4KDUA 5B7CA 3W6GA 4PURA 3TKSA 9GSSA 3L9VA 2HSHA 3H4KA 2GT6A 1PRXA 1OC3A 4POKA 5AIVA 2J9HA 2C1YA 2GSRA 4XS1A 3DVWA 1YJ6A 1AIUA 1VRSD 2QKEA 3GV1A 2RIIA 1WPIA 1XWGA 1XFLA 4YH2A 4JR4A 2L6DA 4JEDA 5D96A 1R4WA 1K0NA 5D9XA 1WP0A 4KW6A 4I97A 1F3AA 1Z5YE 4FYUA 2YWIA 4J2FA 3UJ1A 3WT2A 2H66A 2V6OA 2OE1A 2TRXA 2H0IA 4ILFA 5INYA 5ELGA 2CVKA 1RK4A 5DCGA 2H0HA 1B4PA 2YANA 3GHAA 4NV2A 3TOUA 3GH6A 3VWWA 2M46A 1AQVA 1ZYEA 3BCIA 2VL2C 4MPGA 4ZL7A 1ON4A 2GLRA 4XS4B 3WYWA 4GLTA 1Y25A 2MMAA 4D73A 2H73A 2CQ9A 4EE0A 8GSSA 2CV4A 2YWMA 5ECLB 2B5XA 3GKKA 4POMA 3CSHA 1TW9A 2CAIA 18GSA 3IDVA 1ZOFA 3KM6A 2Z9SA 4MMMA 2MBTA 1GUMA 3EWLA 3C71A 3KXOA 1U6TA 4BWSA 1PX7A 2VCZA 3EMXA 2L5OA 2C3QA 1G6WA 1E2YA 5D73A 2EIRA 2KP1A 4TR3A 2VL9A 1XW6A 1UC7A 3TJFA 3DGQA 5B8BA 4HEA2 2L5LA 2WZ9A 5H5QA 2LQQA 3ME8A 2YP6A 1ERTA 2O89A 1OKTA 2YJHA 2HXKA 1JZOA 2B3SA 2CX3A 4V2LA 3C7MA 2DJ0A 2P0GA 4YAVA 4IQ1A 3ISOA 4HOJA 1GTBA 2KP2A 4PGTA 3TKQA 2BTOT 2QGVA 5CP1A 4L0WA 3Q19A 3F0IA 3TCOA 1EP8A 4GSNA 5F0GA 4EC0A 2KOKA 3LG6A 2PVOC 5JWRB 4KAEA 7GSSA 1ZZYA 2F3MA 3UAPA 2C3TA 1FOVA 1TU8A 2VCVA 2GT5A 1GSEA 1XOAA 2B1KA 4G10A 5J5NA 3ERWA 5HR2A 3U5RE 1EOGA 2XC2A 3LYKA 2FA8A 1M9AA 2LUSA 2B1LA 4MJAA 1GLQA 4RUVA 1G6YA 1ZMAA 3F4TA 5CREA 5G1LA 3ERGA 3QR6A 3I9V2 5G2ZA 4XTSA 4OD7A 4WF4A 3TKRA 3TB2A 1GSQA 4KE3A 2VL3A 2J23A 3HVXA 3GH9A 3FZ4A 3M9KA 1EV9A 5HFGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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