4XCSA

Human peroxiredoxin-1 c83s mutant
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
179
structure length
179
Chain Sequence
GSHMSSGNAKIGHPAPNFKATAVMPDGQFKDISLSDYKGKYVVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDRAEEFKKLNCQVIGASVDSHFSHLAWVNTPKKQGGLGPMNIPLVSDPKRTIAQDYGVLKADEGISFRGLFIIDDKGILRQITVNDLPVGRSVDETLRLVQAFQFTDKHGEVCPAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Dimeric Human Peroxiredoxin-1 C83S Mutant
doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-1
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 54
structure length 179
sequence length 179
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2014-12-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4xcsA00
2VM1A 4NAXA 4K9ZA 3IK7A 3GL3A 3GN3A 1K3OA 5D9TA 4I5QA 4H86A 4TVEA 2KP1A 3UMAA 3EVIA 3ZMLA 2LQQA 3F3QA 1TRUA 2RIIA 1XBSA 3IPZA 2DLXA 4ML1A 2VM2A 3D5JA 1Q4JA 4MP4A 2EIOA 4CW9A 2K9FA 1X5EA 4ACSA 1TRSA 2I9HA 1Y25A 2RUEA 4ZBBA 2YV7A 5IO2A 2O87A 3TKPA 2IMKA 4XRAA 4POBA 2QGVA 3KMNA 3KTLA 12GSA 3LG6A 3F6FA 2C0DA 2H71A 5G30A 2H8LA 4NV2A 1JFUA 3H1NA 2PUKC 2O89A 4DEJA 4MLYA 1FO5A 4XS4B 4N11A 5F0GA 1X0RA 2OA7A 3MNGA 5CREA 3G7YA 2YZUA 1PL2A 4GSSA 1EOHA 1W4VA 5GSTA 4POKA 4WBRD 2VLVA 2YV9A 2DSAA 2R2JA 2WRTA 1JZRA 1GTBA 2YWOA 4KX4A 2L4QA 1KNGA 2V41A 3EU3A 4AJ8A 2B5YA 1B4QA 1HD2A 2IMEA 4XHMA 1EGOA 1XOAA 1PGTA 2VCTA 4KSMA 3VURA 4IHUA 2H0IA 2WZ9A 4GWRA 2GSQA 4TXOB 4EXJA 4OWYA 5COHA 3VWXA 1XVQA 2O85A 4TKYA 1U3IA 5D9XA 3KH9A 5HR1A 13GSA 4GSTA 2AAWA 3TRQA 4DSSB 1SL1B 2VL3A 17GSA 3Q74A 2AV4A 4O7HA 1ML6A 1M9AA 4HI7A 3E9JB 6GSXA 4G9HA 2EIRA 1ZOFA 3C73A 1RQMA 3GYKA 18GSA 1EOGA 4BPYA 2ON7A 2FA4A 2H72A 4MPFA 3MDKA 4AF2A 2HYXA 2IJYA 4E8EA 1WJKA 3KZQA 4ILFA 4BVXA 2ZUPA 2E7PA 3GNJA 1RK4A 3WT1A 3M3MA 4IQAA 4MJAA 1XIYA 1NHYA 1EZKA 5G1KA 2DJJA 3VWUA 4ZBDA 4G2EA 1Z6NA 1HNCA 1LU4A 4TW5A 3D4TA 2GVPA 3P2AA 1GSEA 3G7IA 2C0FA 3I43A 1MDIA 1FOVA 4KH7A 3WGEA 3H79A 5IMZA 4EDZA 5DALA 5AISA 1FG4A 1HQOA 1R5AA 3TUEA 1B9XC 3HY2A 4NPBA 9GSSA 4MH3A 3CSIA 4EO3A 1BAYA 2AUVA 3TDGA 1R5PA 2GT6A 4KGIA 4O32A 4HDEA 4O92A 1SU9A 4HQSA 1OC8A 3VWWA 2G2QA 2L5OA 4K7OA 1XWAA 4MPGA 5D73A 1TW9A 1SKRB 2V2GA 5LD0A 3DXBA 3TKQA 2XBQA 4OO5A 5J4UA 4F82A 4JRRA 1GNWA 5IMCA 3TKSE 1GTIA 2R6KA 3ZMKA 3L9SA 4EF0A 1GL8A 5IO0A 4TR4A 1OC9A 3P8WA 5KN3A 5G1LA 5JWRB 5GSSA 1GP1A 4ZL8A 1TRVA 1Y6EA 1XWKA 3QAWA 4YH2A 1M2DA 3GX0A 4F0BA 4XRDA 3FY7A 2LEGA 8GSSA 4PX1A 4ML6A 3KP9A 1X9MB 5IPGA 3A2WA 3A2VA 5JWQB 4OD7A 2L5LA 1PMTA 2MMZA 1DSBA 3KP8A 4PGTA 3ZTLA 1Z5YE 3TGZA 1X9WB 4XS6A 1J08A 3KD0A 4PUAA 4AJ6A 5HR3A 2CA8A 4V1Ag 2Z9SA 3VPQA 1B9YC 2MBTA 3C8EA 3E3EA 1XWCA 3MSZA 1G7EA 2X99A 2H6ZA 4K0GA 4NHWA 1XFLA 4GRFA 5CRDA 4XS1A 3WGXA 2GQLA 1WWJA 1ERUA 4AJ7A 5H5QA 2JU5A 3LSZA 3L4NA 1A0FA 1TU7A 2MYGA 1DE2A 2JZSA 2P5QA 5C00A 1YEXA 1MDKA 3GFKA 3GL5A 1WRYA 4MMMA 2NPBA 1PX7A 2RLIA 2H19A 3V1WA 1WPIA 4G10A 4FH8A 1GH2A 1EP8A 1K0OA 3J7Yb 1DBYA 1GUMA 1X5DA 5IIZA 3CXGA 3ERGA 1GUHA 1ZL9A 4N10A 1PRXA 4IP6A 1OKTA 2PPTA 4PXOA 3GA4A 1ZYQB 2AB6A 4GQCA 4WR5A 2WB9A 5DALB 4HOJA 1M7TA 2GLRA 3GUSA 3F9UA 1YEPA 4N0ZA 3I69A 4BL7A 4BVYA 2HZEB 3ZVJD 2WS2A 1ILOA 3GH9A 3SWLA 3Q18A 1M99A 1K0CA 3RBTA 4MCUA 4MDCA 1PX6A 2DJ1A 2VLTA 1WOUA 4J57E 1NW2A 1PD21 4AGSA 1OKDA 2LUSA 4EVMA 2VO4A 2HFDA 2X8HA 2JACA 1RW1A 2ES7A 3ZIJA 4E8HA 3VPTA 4L0WA 3GKKA 5FWGA 1S3CA 1U87A 3TJBA 5G2ZA 2H6YA 2HZFA 3DVXA 1HNAA 1PKZA 3BOAA 4TR1A 5KEJA 2H74A 5JCUA 1TKDB 1OC9B 3IC4A 1GTUA 1K0NA 2H0HA 3GHAA 1S3AA 1GSQA 3O6TA 1BJXA 5A4VA 1JLVA 2B5XA 4KA0A 5ECSA 5IMFA 2HXKA 4YAPA 2R4VA 4GLTA 2I81A 3HDCA 2JADA 3QD9A 3A3TA 4I97A 1B4PA 2CX4A 1VF2A 2FLSA 3M8NA 1IYIA 1A2MA 4YQUA 3RPPA 2CQ9A 2O8VB 1GSFA 2GTUA 5ELAA 16GSA 3VLNA 3QCPA 1VRSD 1OAZA 2DBCA 2IMIA 4ECIA 2EC4A 11GSA 1UA5A 6GSYA 2YJHA 1ERWA 4NHZA 2B1KA 2C4JA 2FUG2 1FB6A 4JR4A 5CYYA 4HJ2A 1C72A 1BEDA 1A23A 4ZILA 2CT6A 2JZTA 4IQ1A 1CQGA 2WCIA 5H5RA 3UVTA 3CMIA 3DKSA 3ZREA 1I5GA 5G5EA 1QXHA 2ZCTA 1MDJA 4WBJA 1O8XA 1O73A 3GURA 2IN3A 2VCXA 2H30A 2G0FA 3L9VA 4HU9A 4KE3A 2LSTA 5J41A 2QC7A 2H1BA 1F6MC 2BTOT 2VD1A 3UARA 4ZIJA 1SENA 5DCGA 2IL3A 5H5SA 4K7IA 3BJ5A 3GX8A 3H8QA 3GKMA 5GZZB 2DJ0A 4K8MA 4PUFC 3PR8A 4TRXA 2PU9C 2JL4A 2DJKA 1W89A 1U6TA 3FR9A 3JCML 1FW1A 1M9BA 3TB2A 2YANA 3K8NA 3QAVA 5D8IA 3LGCA 3WT2A 1A0RP 4ZB8A 2DJ3A 4V2NA 4V2LA 2YN1A 4RQXA 1TU8A 2DIZA 1Z9HA 2ZNMA 1SYXA 2B7KA 3LJRA 3FEUA 1V57A 1GLQA 4IJ3A 3FRCA 1MEKA 4YQMA 1DUGA 14GSA 2LJAA 1F3AA 1MD3A 5DQYA 2VCZA 4KB3A 4ECCA 1V98A 2VLUA 1TDIA 4ZXGA 5B8AA 4TR1B 2PBJA 2DMMA 4KCAA 3MWHA 3QPMA 3O76A 1YKAA 2P0GA 4LLRA 2VCWA 1UC7A 2GSTA 3LEFA 5IMVA 2GSSA 1NM3A 3IDVA 2WGRA 4HJMA 2FHEA 1ZMAA 5ABRA 5FHIA 3HVSA 2LS5A 2VIMA 4WF5A 1AUCA 4PQIA 4MA9A 3EU4A 3HD5A 5IM9A 4KAEA 2JSYA 4OFTA 1FB0A 2IIYA 3GTUB 2VAFA 1BQ7A 3DIEA 4LL4B 2VCVA 2H1DA 5DVBA 4TOPA 1GLPA 1GNEA 5F07A 4IVFA 5EPFA 2FY6A 2PWJA 4F9ZA 3BD2A 5ELGA 1YQ1A 2FWFA 1K0AA 4HS1A 2H6XA 2CVKA 3QR6A 3MAKA 2KHPA 1ABAA 3DWVA 3F6DA 2IMDA 3TKRA 1SK1A 3LQ7A 1AW9A 5G31A 1USBA 3Q19A 1XCCA 1GSYA 5HR2A 4IP1A 2C8UA 3CRTA 2NVLA 3L0HA 1QFNA 1O6JA 1LBKA 2KOKA 3ISOA 1MTCA 22GSA 4J56E 3S9FA 5B7CA 1ERVA 2IWTA 3RPNA 1EEMA 5DJLA 2R37A 3EMXA 1PL1A 2LRCA 2C1YA 2B3SA 3EYTA 4MZBA 4WKWA 5DCHA 1M0UA 3F4SA 3LYKA 5AIVA 4ZB6A 2LKUA 1EGRA 3KIJA 5J9BA 1WMJA 5DJMA 4F0CA 1FVKA 1YKCA 3VK9A 2PVQA 1XOBA 2P5RA 1A2JA 1YZXA 2DIYA 2RUFA 4Q5QA 4LL1B 1SL2B 5ECIB 1PN9A 3GH6A 2HZEA 2C3TA 3R2QA 5AGYA 1SJIA 2LTKA 1GRXA 3G7JA 3D22A 5ECOB 2OE0A 1EWXA 2CV4A 3GMFA 1TK5B 3TJFA 1EEJA 3NOFA 1NHOA 3C7MA 2O7KA 3APQA 2WDUA 1YF0A 1V2AA 1GSSA 3RHCA 2YOIA 4CDOA 3KXOA 1TOFA 2VL2C 1K0MA 1Z7RA 4GF0A 4NXIA 2AYTA 3DEXA 1AXDA 1THXA 3IA1A 3GSSA 2LNSA 6GSWA 3HA9A 3F8UA 1X9SB 2VL2A 2X8GA 4XCSA 4K2DA 1EV4A 3PH9A 3VFIA 3U6VA 3Q6OA 4RI7A 3IK9A 4N30A 4HZ2A 2YNXA 3HZ8A 1XZOA 1T3BA 2LRNA 3TKSC 2M72A 1AQWA 1B48A 1SK2A 4JU5A 3DRNA 4NV5A 2HT9A 1DE1A 3ZIVA 2B1LA 3J7Yk 3TJJA 2K6VA 2GDRA 3UJ1A 1SJZA 1TI1A 4HQZA 1O81A 3KMOA 1BYEA 2H76A 5D9WA 4V2MA 3TKSA 6GSUA 4HUAA 2F8FA 2KUCA 4MJEA 3FR6A 4Q5NA 1XXUA 1K3LA 4TN8A 2NTOA 2YWMA 2H70A 2L4CA 3VI5A 3EWLA 3TJGA 1O7UA 4KSOA 2PMTA 3I6AA 4K7NA 3M1GA 2WFCA 5J9CA 5FT3A 4FO5A 2A2SA 2FA8A 5ENUA 3CRUA 4L8EA 3AY8A 1O85A 2YP6A 4MF5A 5EL8A 4KDUA 1AQXA 4P3YB 4K1FA 1E2YA 3UEMA 4F2IA 4I2TA 4WEYA 2CAQA 4N0VA 5ID2B 1Q98A 5CO3A 5KN0A 1GUKA 3SBCA 1PA3A 4GSNA 3GV1A 4X0XA 1QMVA 2QSIA 2OE3A 4WF4A 1TP9A 2YWNA 1G6YA 3P90A 4MABA 4MF6A 1I9DA 1VGLA 2FD3A 2L57A 4I8BA 4RQRA 1HYUA 4L5LA 4HEA2 3M9JA 2L6DA 3EINA 4NMUA 4TXVA 4EC0A 3FW2A 3CYNA 1M2AA 1OE8A 4D73A 1GTAA 5E4WA 5ECLB 4J2FA 2LRTA 4MJCA 2HLSA 1K3YA 4ULXA 1U88A 2E2MA 5HFIA 2F51A 1ZYEA 1OVNA 3IBHA 2H75A 1KEBA 2YCDA 5B6NA 2DJ2A 1TK8B 1GULA 5AN1A 3ZFBA 1VF1A 4PQHA 1XWBA 2AHEA 1WE0A 2FCHA 2N5BA 1FVJA 4MZCA 2OKAA 3GTUA 5IOXA 4FYCA 3DGQA 1J0FA 2RM5A 5A4UA 3UOMA 3CTGA 5INYA 4WETA 3ED3A 1YJ6A 3D21A 4BA7A 3M0FA 4PQ1A 2H01A 1QK8A 3PGTA 2NBSA 2DMLA 2H73A 4GQFA 2K8VA 1R4WA 2LQOA 4V1Ap 1FHEA 1Z7PA 4L0UA 3IE3A 3LYPA 4BWQA 2MMOA 2HE3A 2GZZA 3DMLA 3ZVJA 1GSDA 2VD0A 3F63A 5EY6A 4IS0A 1TJDA 1T1VA 3FZ5A 3PINA 2L6CA 1E6BA 4Q5FA 3KEBA 3O3TA 1HNBA 3UBLA 2X64A 4I2UA 3N9JA 5F05A 2KLXA 4IGJA 1AQVA 4OFNA 5L71A 5CP1A 2YZHA 1EV9A 2H66A 2PGTA 1A8LA 1U3AA 5D93A 1ST9A 1TK0B 2FWEA 4OCFA 4ISDA 4IBPA 1G0TA 1XWGA 3APSA 3W8JA 5HFGA 4DSQA 2TIRA 1KTEA 4ZL9A 2GQKA 1OE7A 4WXTA 3HJPA 3QDNA 2YWIA 5C04A 1QQ2A 1WP0A 1EP7A 4EUYA 3EC3A 1X5CA 1KBNA 3C71A 3IXRA 4MH2A 2EIQA 2X8CA 3KTBA 5HFKA 3D4MA 1AIUA 3GKNA 1QGVA 3US3A 5A5KA 3D0ZA 3N5OA 4EL1A 3I9V2 4D73B 3FYGA 5B8BA 1LJRA 3C1RA 4QL7A 4PURA 1OYJA 5CNWA 4XIHA 4EKZA 1T4YA 3VWVA 1S3DA 4Q5RA 4IJIA 1SD8A 4ZL7A 5F06A 2GZPA 4G19A 1T8EB 4EE0A 2XBIA 3IR4A 3EE2A 3E0UA 1GWCA 5DQSA 2NDOA 1J9BA 2N5FA 3GRXA 2PERA 1XW6A 2HSHA 4XTSA 3LFLA 2A2RA 1ERTA 1SYRA 2B5EA 2H0GA 4PNGA 1N8JA 2V1MA 4KUNA 2DC5A 3QOUA 3DYRA 4FYBA 3UVHA 5D9VA 4JBBA 1A2LA 5EVOA 1R7HA 2GT5A 2M80A 2FNOA 3LORA 5G5FA 4GTUA 3D6IA 2C0GA 1MD4A 4LA1A 2F8AA 4OMVA 4OO4A 4IN0A 4KDYA 2OADA 2R3XA 4LMVA 6GSSA 4GCIA 4QL9A 2I1UA 2MBSA 5IMDA 4KDXA 2CZ3A 3HKRA 3HYPA 3BCIA 1UN2A 3ZYWA 3QFAC 5B6MA 2CVBA 5JCGA 3IRAA 2V6KA 3W6GA 5D96A 3QAGA 3FHKA 6GSTA 3FR3A 2HI7A 4CHSA 3CBUA 2XHFA 2OBIA 3CSHA 1PSQA 2XPDA 3HVXA 3GSTA 3LXZA 1IYHA 1ZCPA 2CAIA 2YPMA 3FZ9A 3U5RE 4BWSA 2VL9A 3KGKA 5LCZA 1ZZYA 2JZRA 3BCKA 1T7PB 4Z7XA 4JR6A 4HZ4A 2BJXA 5ID2A 2K8SA 5IOWA 2JSZA 3VI7A 3UIWA 2GS3A 1FAAA 1H4OA 4ZBAA 3IHQA 3ME8A 1OC3A 2WJUA 2E2GA 2CX3A 3EURA 1JZOA 2TRXA 2C3NA 1V40A 2OE1A 3WD6A 5ECQB 2J23A 3UAPA 1JHBA 1GSUA 2YJ7A 2ON5A 1K0BA 3IAM2 3L9UA 4K0NA 3FKFA 2MMAA 2PN8A 5A4WA 4ZB9A 2IMFA 1O8WA 5CAXA 3KCMA 3W8SA 1SKWB 1F9MA 4HU7A 4JEDA 2I4AA 5DAKA 4QQ7A 10GSA 3HJMA 5ECNB 1V58A 1Z6MA 2GZYA 2HSYA 5GAPD 1YF1A 2ALBA 2BMXA 5DDLA 2M46A 7GSSA 5IQYA 1XW9A 1WIKA 1A24A 1V9WA 1R26A 2V6OA 3UBKA 1BX9A 3ZITA 2N5AA 5LNKe 2F3MA 2PVOC 3IV4A 3KJYA 1F3BA 1ZGNA 4IELA 2CZ2A 3EMPA 1PKWA 3ERFA 3F3RA 1AAZA 3TOTA 3KM6A 3LXTA 1Z3EA 3CSJA 2A4VA 1SJ6A 1VF3A 4POLA 1AC1A 2E0QA 1G6WA 3QMXA 2J9HA 5HR0A 2FWGA 1TI3A 3DD3A 4IKHA 2C0EA 4MZWA 5J5NA 3F4TA 5ECRB 1XPVA 1T4ZA 4LMWA 4OCEA 3NIVA 2H1AA 6GSVA 4EDYA 2MMNA 2H1GA 4JE1A 3RDWA 2OBKA 2QKEA 4IW9A 3ERWA 3RAZA 4FYUA 2REMA 2GSRA 1T00A 1N2AA 3IOSA 4O5RA 4X1UA 1SKSB 1B8XA 5F8BA 4X43A 2AJQB 1H75A 3TRPA 2TRCP 4RI6A 2K18A 1ON4A 1YDKA 3BBYA 2CVDA 3KH7A 2IFQA 3C1SA 4DSRA 4MK3A 5IMAA 3ME7A 4ID0A 3DVWA 5ECHB 3G9BA 4RUVA 3FZAA 5AIXA 3IAS2 3HXSA 3H93A 3LWAA 3TJKA 4KW6A 3QFBC 1M2BA 2V32A 20GSA 3P7XA 5ECPB 3ZZXA 2HRNA 4NWYA 2I3YA 4L5OA 1SD9A 2LJKA 3F0IA 4KNDA 2LNTA 4ECBA 2P31A 4TR0A 4OFMA 1TRWA 3RHBA 4MF7A 2D2ZA 5KN2A 1ACVA 2C3QA 3APOA 2IPAA 1JZWA 5CRHA 5DAKB 4POMA 2FGXA 3WYWA 1PQNA 1URMA 4PNFA 2VOCA 1QUWA 4ECJA 1TXXA 4YAVA 2XC2A 5GAND 5KN1A 1UVZA 4MJBA 5CRWA 5ECMB 3A5WA 1CQHA 4XS4A 3GIXA 3TOUA 4YQVA 1A8YA 1K0DA 1VF4A 2R5GA 1F2EA 4KCEA 1YY7A 3OR5A 3CTFA 3WGDA 2HRFA 2RM6A 3ZFLA 3L78A 19GSA 3M9KA 1F37A 4F03A 5IPHA 1BG5A 2XPEA 3A2XA 5ECKB 1NSWA 1SL0B 3FZ4A 4TR3A 1SK0A 5E59A 3H4KA 1JZDA 1TTZA 5J3RA 2WULA 4TXOA 1XVWA 2GGTA 2VCQA 3ZL5A 2OJLA 2FWHA 4WR4A 2MZCA 4K6XA 5JWOB 4GXZA 3TRXA 2OACA 2L59A 3HHVA 5CRGA 1THOA 3ZRDA 1G7OA 2LJRA 5DBQA 4FIWA 4DSSA 3GKXA 4JZQA 3ZLPA 2VUPA 2HNLA 1XW5A 3F4RA 3HJOA 2LV3A 3NZNA 2B6MA 2KP2A 5JCWA 4I6XA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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