4XRD | Genus

Total Genus 55

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	55
sequence length	164
structure length	164
Chain Sequence	SLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAHPGEV

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Salmonella typhimurium AhpC T43S mutant rcsb
molecule keywords	Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus	55
structure length	164
sequence length	164
chains with identical sequence	B, C, D, E
ec nomenclature	ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date	2015-01-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00578	AhpC-TSA	AhpC/TSA family
A	PF10417	1-cysPrx_C	C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4xrdA00

1OC8A 4WBRD 1UN2A 2E7PA 4NHZA 1HD2A 4GQFA 1B4QA 2WJUA 2GSTA 2LNSA 4NV5A 2NDOA 2MZCA 4OO5A 2HLSA 3Q18A 4AJ8A 3LG6A 4IN0A 2LRCA 1GNWA 4JE1A 3DWVA 4K1FA 4KNDA 4FH8A 3WGEA 1M99A 4EDZA 2LTKA 3GV1A 3CYNA 2CZ2A 2L57A 3EWLA 1KEBA 3D5JA 1XVWA 2CAIA 6GSVA 3D0ZA 4TN8A 2PUKC 5HR0A 1Y25A 1LJRA 5IO2A 2YV9A 5HFGA 3EE2A 1GLQA 1WPIA 5H5QA 4HS1A 2AYTA 1TK5B 1YY7A 2GT6A 3QFAC 1TOFA 1MTCA 5JWQB 4TKYA 4BWSA 1XW5A 1YEPA 1AIUA 2WRTA 1WP0A 1NW2A 3LYPA 1E6BA 4HU7A 1M0UA 2B1LA 1DE1A 4I5QA 2YWOA 2IMIA 4ID0A 3ISOA 5EVOA 4MPFA 3CMIA 3UAPA 1QFNA 2FNOA 4ZBDA 3I69A 4MDCA 2RM5A 3DGQA 1T8EB 1F6MC 3F8UA 4KB3A 2E0QA 3ZZXA 5DCGA 3GHAA 3PINA 4EKZA 4IQAA 1N2AA 2H0IA 2YJHA 2TRXA 4N11A 5GAPD 4MJBA 3HYPA 5DVBA 2JZTA 4X43A 3GYKA 1O8XA 4XS1A 2CVBA 1XZOA 4J2FA 4F0BA 4ML1A 3APSA 2QKEA 5ECHB 1M2DA 3HA9A 3GURA 4YQVA 6GSTA 2DSAA 2LV3A 2L6CA 2GT5A 4GXZA 1MDJA 3KTBA 2WB9A 2MYGA 2R4VA 1S3DA 3G7YA 2OE3A 1Z6NA 1SKRB 1XWKA 5KN3A 3C8EA 2P5QA 2PU9C 4KCEA 2JU5A 2L5LA 5DALA 2ON7A 4OWYA 3F6FA 2D2ZA 17GSA 1YKCA 1RW1A 2C0FA 2C0DA 3KJYA 1ON4A 1JLWA 1O85A 4HU9A 5DAKA 3EYTA 4NWYA 2V1MA 2A4VA 4POMA 4Q5NA 3DYRA 2C4JA 3RAZA 1Z3EA 5LD0A 3QFBC 1AQXA 1EOHA 5CYYA 1JFUA 5D93A 3BOAA 4BWQA 3HDCA 2KP2A 1WE0A 1B48A 2R5GA 5COHA 4I2UA 3LWAA 3HKRA 5IOXA 3UVTA 5G5FA 1TP9A 3F0IA 1SD9A 1SK2A 3KXOA 3HZ8A 2DJ0A 2H6YA 4GQCA 4KH7A 2VL9A 1ABAA 2H1DA 3ZTLA 3C7MA 1SK0A 4ZBAA 5IM9A 1R7HA 2GZPA 3GMFA 1J0FA 3EMPA 2AHEA 5H5SA 2IFQB 3EU4A 1JHBA 5ID2A 2GSRA 2I4AA 2Z9SA 3HY2A 4RUVA 3L0HA 3APOA 1B9YC 4KA0A 1ST9A 2HZFA 2BTOT 3SWLA 3UIWA 4L0UA 2VCTA 4G9HA 4J57E 2FA8A 1OE8A 4WEYA 4LLRA 3IE3A 1Z9HA 5LNKe 3RPPA 1Z7PA 2L5OA 4KSOA 4IJ3A 2H8LA 1TRUA 4G10A 2GZZA 2IPAA 4GTUA 2CA8A 1NSWA 1GSQA 5F05A 1GNEA 2VD0A 5IQYA 1XPVA 2VCZA 3US3A 3WT1A 4ZL8A 1AQVA 5ELAA 3FY7A 4K0GA 1M2AA 1VF4A 3W8JA 3MWHA 4Z7XA 1BEDA 1K0DA 2YN1A 5A4UA 3L9UA 2HZEB 3CSHA 5HR2A 5G31A 1PL2A 4MPGA 2PVQA 3GH9A 4JR6A 4EUYA 1HYUA 5IMCA 1PA3A 2R6KA 4JRRA 4Q5FA 3PGTA 4ISDA 1R26A 1OC9B 4KX4A 4N10A 1Y6EA 3P8WA 3GKKA 5D9TA 1A8YA 4AF2A 3D22A 2H70A 2O8VB 1UC7A 4KUNA 2LQOA 1PSQA 1XWAA 1G6YA 2PWJA 4IELA 2JSZA 1J08A 1G7OA 3QD9A 1XFLA 3VI7A 4POLA 4PNFA 3FK8A 4TR3A 1B9XC 2JACA 2LJAA 1TKDB 2K9FA 4X1UA 2RUEA 5D9WA 4L5LA 2H1GA 4WKWA 4X0XA 2YP6A 2MMAA 3IAM2 3P7XA 2H71A 1AXDA 4PXOA 4EF0A 1Q4JA 3LSZA 1O7UA 1R5PA 4MJCA 5IIZA 2AAWA 2C3NA 4JBBA 3PH9A 5HFKA 2HSYA 2CZ3A 4POKA 4PUFC 1F9MA 1K0OA 2FWFA 4G19A 3SBCA 3ZVJD 5F0GA 1TI1A 1DBYA 4IBPA 1YEXA 5JCUA 2CQ9A 3RBTA 1OKDA 5CRWA 4KAEA 3UL3A 1XWCA 2OKAA 2KOKA 3CTFA 4EC0A 3MNGA 5ECSA 1GP1A 1ILOA 5GSSA 5G1LA 3P90A 5IMVA 3IK7A 1ZL9A 1GUHA 3GUSA 4IKHA 4LL1B 3LXZA 3TUEA 4GLTA 1SKSB 1ZOFA 5ECLB 3FZ9A 4NMUA 1ZYEA 2K8SA 4K8MA 3IK9A 4L5OA 5L71A 2I3YA 3J7Yk 4AGSA 2DIYA 4HOJA 4KCAA 3MSZA 5D73A 3KMNA 2KLXA 5DQSA 4KW6A 1J9BA 4MJAA 3C1RA 1ML6A 4HQSA 2GTUA 14GSA 4V1Ag 5GAND 1PX6A 4MZBA 1XW9A 2H6ZA 1K0CA 4MZCA 2P31A 5B7CA 4BVYA 1FB6A 5ECNB 2DBCA 3TJGA 10GSA 1FAAA 3FZ4A 5B6NA 5B8AA 2FY6A 4QL9A 5A5KA 2EIQA 3IV4A 1EGRA 2F51A 4DSRA 2QC7A 2CVDA 1TTZA 4NPBA 4GF0A 1XWGA 4ZB8A 1C72A 3TKPA 3A2WA 2ES7A 1I9DA 3LORA 2ZCTA 1A2LA 4P3YB 3BD2A 1YKAA 4NHWA 3FZ5A 5ECPB 3UMAA 4L0WA 3M0FA 1TU7A 5HQPA 1WMJA 4TW5A 4IW9A 3GSSA 5J41A 1BJXA 3O6TA 1SJZA 5IMDA 3M8NA 3VPTA 3BCKA 1ERUA 1R5AA 3LFLA 4IQ1A 5CRHA 5D9XA 3KMOA 4OCEA 3DD3A 3H93A 3EU3A 1GSSA 3RPNA 12GSA 5D9VA 5J9CA 5ECOB 4NAXA 1RK4A 4I97A 2C3QA 2LKUA 4PQHA 2MBSA 2IWTA 4KE3A 1BG5A 2WS2A 5D96A 1KBNA 1M9AA 5A4WA 3UBKA 4FYCA 2MMNA 2XHFA 2JADA 4PUAA 2B5YA 4ULXA 3GA4A 1B8XA 4ZB6A 3FZAA 1XXUA 2V6OA 3GL3A 1GUKA 3L9VA 2O89A 2IFQA 1K3YA 1K0MA 5J4UA 2H19A 3MAKA 3HVSA 4NV2A 2MBTA 1GULA 2X8CA 4EVMA 4BPYA 4GSSA 5KN2A 2YNXA 4ZBBA 1XIYA 4I2TA 1WRYA 20GSA 2J9HA 1XBSA 1USBA 3R2QA 9GSSA 4DSQA 2DJKA 1H75A 2OA7A 4TR1A 1XVQA 5ECIB 4HEA2 4K7OA 4H86A 1F2EA 1V58A 4OO4A 1A2JA 2H0GA 3L78A 1QXHA 2ALBA 4ECIA 3HJOA 4FYBA 4XHMA 2F3MA 3ZREA 3C1SA 1DE2A 1THXA 3F63A 4O92A 3A2XA 3WYWA 2EIOA 4JR4A 2DIZA 4KDUA 4WXTA 1OC3A 2YPMA 2N5BA 4AJ7A 1PQNA 1K3LA 2X64A 3QR6A 2FWHA 3KIJA 4NXIA 1XWBA 3KZQA 1EEJA 1TRVA 1A24A 2P0GA 3Q6OA 5EL8A 5J3RA 3ZMKA 5J9BA 2VLVA 4K0NA 5KN0A 1SYXA 4MF5A 2B5XA 3IC4A 1YZXA 3F3QA 2DMMA 3M3MA 4YAVA 1SL2B 5CREA 4MP4A 3WGDA 4K9ZA 4ILFA 1ZMAA 2MMZA 3FKFA 1PKZA 1Q98A 1MD4A 3BCIA 2NTOA 2C0GA 4V1Ap 4MF7A 3F6DA 2FUG2 3ZMLA 3IDVA 2HFDA 1OKTA 3AY8A 3I9V2 3GSTA 1A0FA 1GSDA 3DVXA 2LJRA 4G2EA 5JWRB 5INYA 2ON5A 2LNTA 1AAZA 5CRGA 1SJ6A 3M9KA 2YCDA 1SU9A 3QAGA 1Z6MA 6GSUA 1ZCPA 1O81A 2FA4A 1TRWA 3ME7A 2OE0A 4WBJA 1A23A 1Z7RA 2JZRA 4GCIA 3FHKA 2V2GA 5ELGA 4JEDA 1OVNA 2VL2C 4OFMA 2GQKA 2CX3A 1A0RP 4BVXA 2IN3A 1PKWA 2HRNA 2XBIA 4TR4A 2FLSA 4V2MA 1G6WA 1ERTA 2XBQA 3S9FA 2LJKA 1GSFA 2OJLA 1FHEA 1S3AA 3P2AA 1PX7A 3U6VA 2HE3A 1TK0B 2JZSA 2I81A 1ERWA 1W4VA 3IHQA 4PURA 1SD8A 5HFIA 2AJQB 1PD21 3ZL5A 3Q74A 4PQ1A 2KHPA 1XOBA 1R4WA 2EC4A 4D73A 4GSTA 3GKXA 1CQGA 1RQMA 5GZZB 5JWOB 3FEUA 2LRTA 3CBUA 5G5EA 11GSA 1WWJA 3UARA 4FYUA 2YOIA 4ZL9A 4DSSA 1PMTA 4MJEA 1M9BA 2FCHA 4YQUA 2FWEA 2GDRA 3F3RA 1A2MA 4OFNA 2P5RA 2VCQA 1VF3A 5F07A 5IPHA 1QMVA 3G9BA 1TXXA 1EV9A 1T1VA 4IJIA 4TRXA 2C8UA 3RHBA 3ZFLA 5B6MA 5IMAA 4CDOA 1AC1A 1O73A 1GWCA 2GVPA 3U5RE 3CXGA 4Q5QA 2DJ3A 4N0ZA 1K0BA 1EEMA 1TK8B 2QGVA 5ECKB 5DJMA 2LUSA 4YQMA 2GZYA 2WDUA 2R3XA 3E0UA 1YF0A 2LRNA 1TI3A 2A2RA 3PR8A 1TW9A 4CHSA 3HJMA 2NPBA 2H6XA 4KGIA 4ZXGA 1QQ2A 1U6TA 3FR9A 3ZYWA 1EOGA 3FYGA 3DEXA 3KH9A 2VLTA 3IPZA 2XPDA 2VLUA 5KN1A 1GTBA 4KSMA 2NVLA 3D21A 1SL1B 3HXSA 1PN9A 3LEFA 4TXVA 2H30A 3K8NA 4J56E 2H75A 2L4CA 4WF4A 1GL8A 8GSSA 4PGTA 4JU5A 1JZOA 5KEJA 1KNGA 1TU8A 3A5WA 2BJXA 5J5NA 2F8FA 4E8EA 3HCZA 4WF5A 2V41A 1PGTA 3CRUA 2RM6A 3VWVA 1VF2A 1GLPA 1MEKA 3ZIVA 1BYEA 2FHEA 4GWRA 2YZHA 3VI5A 3F4TA 2DJ2A 3KD0A 1EGOA 3UOMA 4LMVA 4CW9A 2C3TA 2YJ7A 2GS3A 2I9HA 3QDNA 3HJPA 2PBJA 3TJBA 1OYJA 2M72A 3TJFA 4K7NA 4JZQA 5ABRA 1AW9A 3GTUB 3EC3A 1HNAA 4HI7A 1BQ7A 1N8JA 2K6VA 3JCML 2PMTA 2VO4A 4DVCA 3TKSC 2VL2A 1FVJA 4GSNA 5EY6A 3UBLA 2L59A 2HT9A 5ECMB 1T4ZA 3QCPA 2DMLA 3FR6A 2H1AA 2VM2A 1QK8A 3KH7A 1MD3A 2AV4A 1GTAA 3W8SA 2A2SA 3NZNA 3QPMA 4K6XA 2YANA 2HRFA 1M2BA 2YWNA 1O8WA 3IR4A 1SKWB 1YDKA 4TR0A 4XTSA 2OBIA 1JZRA 5CO3A 3VWUA 1URMA 3Q19A 4EXJA 4RQXA 4XRAA 1T3BA 1X5CA 4HJMA 3I6AA 1GTIA 2CV4A 4MMMA 4O5RA 3RHCA 3KEBA 3TRQA 4E8HA 2IIYA 2O85A 3TDGA 3TOTA 5ECQB 4XS4B 5F8BA 1W89A 1FO5A 1F3BA 1YF1A 1MDIA 4EL1A 4FO5A 4F0CA 4XCSA 5B8BA 2DJJA 3FW2A 3GKMA 5IO0A 4RI6A 5G2ZA 1CQHA 2E2MA 5ENUA 2PN8A 1BAYA 2B3SA 5HR3A 4HUAA 5C04A 5C00A 1UVZA 2GSSA 1SENA 2WGRA 1A8LA 3MDKA 5FHIA 1U87A 1YJ6A 2O87A 2X99A 1TJDA 4OD7A 1DUGA 3CRTA 3I43A 5ECRB 5AIVA 1FVKA 2B6MA 2H76A 3UVHA 2IMKA 3N5OA 1WIKA 2E2GA 4ZILA 4AJ6A 3VWWA 4TXOB 3M1GA 4HDEA 3BBYA 2CX4A 1AQWA 3HZ4A 3TKQA 18GSA 2FWGA 3D4MA 2WULA 1VF1A 2H72A 5IMFA 3F4SA 2VUPA 2OADA 1LU4A 2IMDA 2R2JA 3W6GA 4WR5A 5JCWA 3F9UA 1NHYA 2R37A 2CVKA 2OBKA 2VCWA 2B5EA 1T4YA 3TOUA 4ACSA 1JZWA 5E59A 4XRDA 4PQIA 1JLVA 3LXTA 2AUVA 5AISA 2CAQA 2X8HA 2LEGA 2GQLA 5H5RA 1SL0B 5AGYA 4F9ZA 2B7KA 2H0HA 1KTEA 4MCUA 1GSYA 1K0AA 3IAS2 4F82A 2RIIA 2X8GA 1Z5YE 5IOWA 3D4TA 1EZKA 3DMLA 5DBQA 1M7TA 2HZEA 2ZUPA 3HD5A 3ZFBA 3ED3A 2G2QA 3C73A 3KTLA 3ZITA 1FG4A 1TDIA 3G7JA 5FWGA 3GL5A 3H8QA 5LCZA 3OR5A 2VM1A 3DVWA 3GX8A 3VK9A 4N30A 1V2AA 3HHVA 1OC9A 2XC2A 1XW6A 1FOVA 3TRXA 2VIMA 5DJLA 3WT2A 2VL3A 3KCMA 1ERVA 22GSA 3VPQA 3TKRA 4ZB9A 2HSHA 4ECJA 4LMWA 1IYIA 1X5EA 3UJ1A 7GSSA 4OFTA 4HJ2A 3TKSA 2YWMA 5EPFA 4KDYA 1WOUA 4K7IA 2BMXA 2VCVA 3IBHA 2PGTA 2OE1A 3VFIA 4HZ4A 5G1KA 2F9SA 2RUFA 4LL4B 4QL7A 2DLXA 3HVVA 1T7PB 4HQZA 2RLIA 4F03A 2CT6A 1T00A 3FRCA 5F06A 2PPTA 4BL7A 5A4VA 1I5GA 1BX9A 3QMXA 3IOSA 2K8VA 4RQRA 1V9WA 4PNGA 1S3CA 3APQA 1ZGNA 2YZUA 2LSTA 1OE7A 2NBSA 3ERWA 5GSTA 3F4RA 4WETA 3TKSE 1JZDA 3IXRA 3J7Yb 3TB2A 2V32A 4ML6A 3WGXA 1EWXA 2F8AA 5JCGA 1QUWA 2GSQA 2KUCA 3L9SA 3UEMA 4MF6A 2REMA 4GRFA 4ECCA 2GGTA 2HNLA 4PX1A 3L4NA 4TR1B 3KGKA 2M80A 2VAFA 3KM6A 2JL4A 3H79A 3QAWA 1VGLA 1V98A 3TRPA 1SYRA 2VCXA 5CRDA 2H01A 4IP1A 4MZWA 1UA5A 4MA9A 2LQQA 2OACA 2IMEA 1X9SB 3LYKA 2TIRA 3QAVA 1ACVA 4RI7A 3HVXA 4KDXA 4YAPA 1QGVA 2L6DA 1PRXA 2WFCA 3H1NA 1EP7A 3GN3A 2WCIA 1ZYQB 3GTUA 5CP1A 4EO3A 5DQYA 1F3AA 2EIRA 6GSXA 3FR3A 5DALB 3GFKA 5HR1A 3EINA 1V40A 2HYXA 2FD3A 5DAKB 2K18A 2QSIA 4OMVA 4F2IA 1HQOA 1E2YA 1U88A 1H4OA 3ERFA 4EE0A 4I6XA 3RDWA 1EP8A 1GH2A 2H73A 1F37A 2YV7A 3TJKA 4LA1A 4K2DA 2N5FA 5CAXA 3GH6A 4MK3A 4L8EA 4MH3A 4IHUA 1GSUA 4HZ2A 3E9JB 1WJKA 3DKSA 3ZRDA 2J23A 1O6JA 3VLNA 3CSJA 3ME8A 1ZZYA 4DEJA 2G0FA 3LGCA 1G0TA 3TCOA 1MDKA 1X5DA 3CTGA 2H1BA 4BA7A 4XS4A 3KP9A 3ZVJA 4ZL7A 2AB6A 2HI7A 5ID2B 3DRNA 1THOA 5IMZA 4IS0A 1EV4A 1PL1A 1DSBA 2ZNMA 4Q5RA 1G7EA 4WR4A 6GSYA 4OCFA 4POBA 1NM3A 3H4KA 4MLYA 1K3OA 2MMOA 2VD1A 1YQ1A 2KP1A 4EDYA 6GSSA 4MABA 2O7KA 3D6IA 3EURA 5E4WA 1GTUA 1U3IA 2PERA 3GIXA 2H66A 2GQMA 3KP8A 2WZ9A 13GSA 3O3TA 4XS6A 1LBKA 1FB0A 2H74A 4V2NA 2YWIA 5AN1A 1TRSA 3O76A 4MH2A 3VWXA 3DIEA 1AUCA 3IA1A 2GLRA 2TRCP 2I1UA 4TXOA 4D73B 3IRAA 2C80A 2VOCA 3BJ5A 4V2LA 2M46A 3G7IA 3M9JA 16GSA 3GKNA 3GNJA 1V57A 1X9MB 2DC5A 2N5AA 1U3AA 2LS5A 4DSSB 3V1WA 1SK1A 3NOFA 3NIVA 3N9JA 5FT3A 4XIHA 5CNWA 2JSYA 3QOUA 1X0RA 4IVFA 2IJYA 3A2VA 2FGXA 2IMFA 2C0EA 2L4QA 2XPEA 3VURA 5DDLA 2PVOC 2IL3A 3TGZA 4ECBA 4N0VA 4FIWA 2B1KA 1XCCA 4TVEA 1NHOA 3EVIA 1GSEA 1B4PA 1FW1A 3EMXA 1K0NA 2HXKA 4TOPA 3ZLPA 4O32A 4ZIJA 3CSIA 1SJIA 4IGJA 1HNCA 3C71A 3A3TA 3LQ7A 1HNBA 1X9WB 4O7HA 4YH2A 5DCHA 5G30A 3ZIJA 4I8BA 1IYHA 1OAZA 3TJJA 3ERGA 2V6KA 2DJ1A 2B7JA 4QQ7A 3E3EA 5AIXA 1XOAA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4XRDA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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