4XS4A

Salmonella typhimurium ahpc c165s mutant
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
167
structure length
167
Chain Sequence
SLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAHPGEVSPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Salmonella typhimurium AhpC C165S mutant
rcsb
molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
molecule tags Oxidoreductase
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 57
structure length 167
sequence length 167
chains with identical sequence C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2015-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4xs4A00
3RBTA 1GTAA 4O7HA 1WJKA 3KEBA 4BVXA 2YNXA 4TR1A 3ERGA 2CT6A 5E59A 1PKZA 2QSIA 1I5GA 5AN1A 4JR4A 2B6MA 4GWRA 1Z3EA 1GSUA 4I2TA 4GSTA 1O6JA 3LXZA 2VD0A 3G7YA 2JSZA 5A5KA 1GTBA 5KEJA 2L4CA 5ELAA 1G6WA 2H76A 2O85A 2PMTA 1TOFA 4KCEA 3G9BA 2GS3A 1U87A 1O73A 4HUAA 5ECRB 4IHUA 1C72A 4AJ6A 2OKAA 5JWOB 4ECJA 2XPEA 3ZFLA 1UN2A 2LKUA 2H19A 3HYPA 2VCXA 4V1Ap 1F9MA 4DSQA 1N2AA 3RHBA 3BBYA 2JZSA 4TR3A 2XHFA 1B9YC 4XCSA 4EXJA 3C7MA 3LGCA 4H86A 1GL8A 1SL1B 3L4NA 4IVFA 4ZL8A 1OC9B 1TK0B 3GH6A 3LSZA 3SWLA 1GLPA 3CSHA 1WE0A 4RI7A 1XFLA 5E4WA 19GSA 2WULA 2CAIA 3H1NA 1K0MA 2GGTA 2JZTA 2HT9A 1TRWA 2O89A 2IMDA 3KD0A 1XWKA 1THXA 4F2IA 1GSQA 4OO5A 4ZILA 5LCZA 1EOHA 2G2QA 4TXOB 2HRFA 4BPYA 3DVXA 2GSTA 3IK9A 5KN1A 2DIYA 3LXTA 3Q18A 1ON4A 3DEXA 1T8EB 1SU9A 3KCMA 4OCFA 2R37A 2LQOA 1VF2A 4MH3A 3TJFA 3HY2A 3DRNA 2L5OA 5IMCA 2PWJA 4ECBA 2H30A 3MWHA 4GF0A 4K0NA 3BOAA 5EL8A 1FHEA 3EC3A 4G19A 3TKSA 2EC4A 1YZXA 5GSSA 1HNCA 2IIYA 4PQIA 4MJBA 2YN1A 4JE1A 5J5NA 1FW1A 3F6FA 1SD9A 1J08A 4KUNA 1TXXA 2CV4A 2VL2A 2A2RA 2FHEA 3R2QA 2VM1A 1GSFA 1MDJA 3QPMA 1SK2A 4XTSA 3ME7A 5A4VA 2OA7A 4N10A 4PNGA 3GV1A 4DVCA 4TVEA 2YWIA 3E0UA 2VM2A 2HI7A 5G2ZA 2O7KA 4K9ZA 1SJIA 4MA9A 1EOGA 2YWNA 1K3YA 4BWQA 4ML1A 4L5LA 3MSZA 3FYGA 1SKRB 1KBNA 3UL3A 4G2EA 1TW9A 1HNBA 5HR3A 4KCAA 2WRTA 2YOIA 2AUVA 1AXDA 1K0CA 4XRAA 2H0HA 4GLTA 4XS4B 2GT6A 3KJYA 3RPNA 4F0BA 3TJBA 4OO4A 3GRXA 2IFQB 2IMKA 3EU3A 1XOAA 4IP1A 4EO3A 3IPZA 3HJPA 1S3CA 2E2GA 1MD4A 1R26A 5D9VA 4WR5A 2VIMA 1FVJA 5A4WA 4ECIA 2DMMA 3I6AA 4Q5RA 4XHMA 1SL2B 4XS1A 5ECHB 2R6KA 2DJJA 2FA8A 5D96A 3ISOA 1HD2A 4NMUA 3EMPA 3CRTA 2M46A 3FW2A 5CRWA 3EURA 3HD5A 2H70A 2IMIA 1GP1A 1SK0A 1GLQA 1QQ2A 1J9BA 1ZL9A 1XW6A 4KA0A 3ERWA 5F05A 5DCGA 1MTCA 2P5QA 3TJJA 3C71A 1SYXA 2Z9SA 2O87A 4X43A 1EV9A 1Z6MA 1ZCPA 1CQHA 2FLSA 4YQUA 4MF5A 4WBRD 5KN0A 3VI7A 2VL9A 4RI6A 2NTOA 1I9DA 1TRVA 1X9MB 1QFNA 2LNSA 2V2GA 2MBSA 3ZYWA 4PQHA 1GSEA 4FYBA 4MPGA 2YJHA 4TR4A 1ZGNA 2QC7A 3IXRA 4NWYA 2CQ9A 4POBA 3LYKA 5AIVA 3N9JA 3L0HA 5GAND 2TRCP 3RPPA 3F6DA 1HYUA 5IO0A 1BYEA 4J57E 2VLTA 1AAZA 3VPTA 1KNGA 4ULXA 4XRDA 3HHVA 4KDXA 5H5QA 3GKKA 3DYRA 1V9WA 3J7Yb 1OE7A 1SL0B 3HVSA 1XZOA 4NPBA 1FB6A 2C3NA 5DALB 2E2MA 2DJ3A 5DQSA 3F9UA 5DQYA 4WBJA 3ZTLA 5B8AA 1PX6A 2DMLA 2B5XA 3GTUB 3PINA 3SBCA 13GSA 1E6BA 1VF1A 1KTEA 1XWBA 5CRDA 2K9FA 1OC9A 2V41A 3HXSA 2WZ9A 1R5PA 5G1KA 1Z7RA 2EIQA 2M72A 2ALBA 3CTFA 1JFUA 1Y6EA 1G0TA 3LWAA 1V2AA 4OFMA 2XBIA 4IW9A 4F82A 2E7PA 5HR2A 4V1Ag 1GTIA 4OFNA 3TRXA 4DSRA 22GSA 4MJAA 4EKZA 1F6MC 8GSSA 5ECKB 2VCWA 3LEFA 3ZL5A 3D6IA 3I43A 3LG6A 3KMOA 2K18A 5ENUA 5GAPD 5ID2B 3O76A 3IR4A 1Z7PA 3DKSA 1TDIA 2DJ1A 2HXKA 4L5OA 2LEGA 3GSTA 3F4SA 4YAPA 1AQXA 2GQMA 2FGXA 3IOSA 2B5EA 2OE1A 6GSVA 2J23A 1A2JA 4NHWA 3GYKA 3FEUA 1OKTA 1PRXA 5D73A 4E8EA 2PPTA 3Q6OA 4NXIA 4LMWA 5DCHA 2FWHA 4QL9A 3QOUA 2RUFA 4Z7XA 3HZ8A 1SK1A 2PU9C 1SD8A 3PR8A 3TKPA 1QXHA 4Q5NA 1PGTA 4ZL7A 5KN3A 1QGVA 4Q5QA 1GSYA 1NSWA 1OYJA 3MDKA 3LQ7A 3QD9A 3IHQA 2DJKA 7GSSA 3GFKA 2V6KA 1K3LA 2HLSA 4ZL9A 1WRYA 1TJDA 2WS2A 2JADA 1XXUA 2A2SA 4FYUA 4WR4A 3GNJA 2PUKC 3FK8A 1BJXA 1ABAA 2H0IA 4BVYA 3HVXA 3ERFA 4MK3A 1ERVA 2O8VB 2GSQA 2OBKA 2LV3A 3UVTA 1YKAA 1M2AA 4EVMA 2PN8A 1YKCA 4ZB9A 1TK5B 2LQQA 1T1VA 2KOKA 3M3MA 1ZZYA 1T7PB 5CO3A 4DSSA 3ZITA 3QAGA 3ZREA 2CVBA 2K8VA 3D21A 3IAS2 2X64A 1M0UA 3PH9A 4EL1A 2H1GA 3GMFA 2HRNA 2IFQA 4GSNA 3I69A 4MZWA 1G7EA 1K0NA 5DDLA 2F9SA 3H8QA 3C8EA 2WB9A 3GURA 2X99A 4PUAA 1MD3A 4EDYA 1UC7A 2PBJA 1BG5A 1K0AA 5ABRA 2B3SA 1KEBA 3L9SA 2A4VA 2VLUA 3F63A 4KH7A 1WMJA 1EGRA 4ZB6A 5JCWA 2B1KA 4KSOA 5AIXA 1AIUA 4HU9A 1DBYA 2YPMA 4V2MA 2REMA 4MH2A 4WEYA 2K8SA 1MDIA 3F3RA 3HJMA 1G6YA 3CRUA 4G9HA 1BQ7A 3BD2A 3GH9A 2WJUA 2FNOA 2VOCA 4L0WA 3UARA 3UJ1A 1S3DA 1IYIA 3D22A 2KLXA 3QAWA 2I4AA 1YF1A 1J0FA 4HEA2 2YZHA 4HJMA 5FT3A 1NHYA 5B6MA 3TOTA 1FAAA 3KH7A 3QDNA 1JLVA 2LJAA 1TU7A 2P31A 4D73B 1K0OA 3QCPA 4QQ7A 2N5BA 2KHPA 5H5SA 3ZRDA 4POLA 3KTBA 5DJMA 3FZ4A 2YV9A 1F37A 1RQMA 5EY6A 5G5EA 1V58A 3UEMA 2CX4A 3WGXA 4YQVA 3ZFBA 1HNAA 3LJRA 2C4JA 4J56E 5EPFA 1FB0A 1GULA 5D8IA 2L6CA 5F06A 1AUCA 4PXOA 4QL7A 6GSUA 1UVZA 11GSA 2WGRA 1XW5A 3TJGA 1SJZA 4OCEA 1FVKA 3DIEA 2JSYA 2EIOA 2VCQA 3FR9A 2C8UA 3LORA 3C1SA 2H74A 2DC5A 2ON5A 2JZRA 5FHIA 5B8BA 4PUFC 4JU5A 2MMOA 2CVKA 3CMIA 4XIHA 3VWWA 1K0BA 1O7UA 2H1BA 4O5RA 2GQKA 1ILOA 5IIZA 4GTUA 4N0ZA 3O6TA 2LRTA 2LSTA 3APSA 1GUKA 3TOUA 2MZCA 2D2ZA 2IL3A 4JEDA 5B6NA 4ZBAA 5ECNB 5HR0A 4ZIJA 1K3OA 3QFAC 2IJYA 3GIXA 4PGTA 1YQ1A 2GSRA 4ZB8A 4I8BA 1AQWA 4MF7A 3FRCA 2NDOA 2X8HA 5CRHA 4CHSA 2HZEB 5IM9A 4HJ2A 5IPGA 1THOA 2F8AA 12GSA 2RM6A 4TR1B 4LMVA 3HZ4A 3G7JA 1ZYQB 4I6XA 2B5YA 3KH9A 3MNGA 2MMAA 2FCHA 2PGTA 3L78A 4G10A 3QAVA 3MAKA 3VPQA 5IMDA 1QK8A 3HJOA 1UA5A 1W89A 1ZYEA 1V40A 2IPAA 4TN8A 2GZPA 4OMVA 18GSA 1CQGA 5IMVA 4TRXA 3OR5A 4KW6A 4WETA 3IDVA 5ID2A 1JZDA 1M9BA 1U6TA 2L6DA 2F8FA 3ME8A 3S9FA 3VLNA 3GL5A 1Z5YE 5DAKA 5IMFA 5J3RA 1IYHA 2KP2A 4K8MA 2C0GA 3FY7A 4BA7A 2H0GA 1MDKA 3VWXA 5J41A 2GLRA 2H71A 1GSSA 2VCVA 3BCIA 1RW1A 2H6ZA 1OE8A 1A8YA 2OADA 1URMA 4ZBBA 3WT2A 3UVHA 2LRCA 5LNKe 4EE0A 2BTOT 1PL2A 3ZVJD 2DJ0A 2LS5A 2OBIA 1O85A 1T00A 1B4PA 3ZMKA 1XWCA 1T3BA 4YAVA 1Z9HA 1X9WB 4HU7A 2R5GA 1LU4A 4YH2A 3TKSE 5ECSA 1OKDA 4KGIA 4AGSA 4MJCA 3KMNA 3GL3A 3EMXA 3CYNA 6GSXA 1VF4A 1T4YA 3IBHA 2H1DA 4MZBA 2F51A 3IV4A 9GSSA 2C0FA 2KP1A 4TXVA 5J9CA 3KP9A 2XPDA 2LUSA 5C04A 1EEMA 3C1RA 3D4TA 2GVPA 1O81A 5CREA 4LA1A 1ERUA 1GUHA 2PVOC 1Q4JA 4I2UA 1T4ZA 3GSSA 1JZOA 4NV5A 2HFDA 6GSWA 2BJXA 3EYTA 4MABA 4HZ4A 1WP0A 2CZ3A 1VRSD 2R3XA 1A24A 4AJ8A 2X8GA 4JBBA 5ELGA 4NV2A 4WF5A 5CRGA 3RDWA 1OC3A 3P8WA 3KGKA 3Q74A 2LJKA 3ZMLA 1V57A 4EDZA 5IQYA 3GKXA 1TI1A 3LFLA 1H4OA 1VGLA 3E3EA 2L4QA 1B8XA 2OE3A 2GSSA 1F3AA 4J2FA 1EGOA 4ZBDA 2GQLA 2YV7A 4TXOA 2R2JA 3FR6A 1SKSB 2C1YA 3GA4A 1Q98A 1XW9A 4MCUA 1PD21 3ED3A 4HZ2A 5JWQB 4K7IA 3JCML 4ISDA 2N5AA 4POKA 1M9AA 1EEJA 3L9UA 1LJRA 3D4MA 2X8CA 4WXTA 2YWOA 2GZYA 3VWVA 1YEXA 1YY7A 3KIJA 2FD3A 2RLIA 1TP9A 2IN3A 4KB3A 4GQCA 3P7XA 4LL1B 2I3YA 2DIZA 5ECPB 2H6YA 4ECCA 4TOPA 6GSYA 2ZNMA 3GKNA 3N5OA 3QR6A 4E8HA 3K8NA 3D0ZA 1TK8B 5EVOA 2AB6A 3KM6A 3CBUA 2YP6A 2PERA 4ACSA 2VL3A 5DBQA 3W8JA 4CDOA 3APQA 5JCUA 2YJ7A 4IELA 3W6GA 4F0CA 5D9TA 1TU8A 1A0RP 3US3A 2NVLA 2NPBA 5H5RA 3C73A 2IMFA 3H93A 4P3YB 1DUGA 5HR1A 3WT1A 4FH8A 3NIVA 1MEKA 3AY8A 1BEDA 3H79A 4IBPA 4I97A 1U3IA 1PL1A 2CZ2A 2JACA 3HKRA 1A2MA 4GCIA 17GSA 2H73A 4F03A 1WIKA 3APOA 1FOVA 2DLXA 3TCOA 5CAXA 1O8WA 2AV4A 2NBSA 4L8EA 2YZUA 1ACVA 1PA3A 5JWRB 1ERWA 3UMAA 2N5FA 5D9XA 5G30A 2B7JA 2GTUA 4MDCA 1PSQA 1U3AA 4XS4A 3F8UA 2LNTA 3KP8A 2MMZA 2RM5A 5ECLB 2DBCA 4IP6A 3VWUA 2WFCA 3EE2A 3KZQA 4IQAA 3TB2A 5CNWA 5ECMB 4IJIA 5IMAA 1AC1A 1PX7A 2HYXA 5DJLA 1EV4A 2B7KA 3J7Yk 2IMEA 2MBTA 1WPIA 2BMXA 4TW5A 4RUVA 1WWJA 2E0QA 2DSAA 4K0GA 3IA1A 1WOUA 4IN0A 5CYYA 4KE3A 1GTUA 1G7OA 3TKSC 5AGYA 3A2VA 1LBKA 2TIRA 4HDEA 2OE0A 4EF0A 1RK4A 5HFGA 1FO5A 1QUWA 3UBKA 3DD3A 3M9JA 4EC0A 2OACA 1JZRA 1ERTA 4O32A 2VL2C 1FG4A 4MPFA 2M80A 2TRXA 3BJ5A 2GZZA 2JL4A 1GRXA 3I9V2 1R7HA 1M2BA 2ES7A 3VURA 1ZOFA 1DSBA 5B7CA 2I1UA 2VLVA 1O8XA 4V2NA 3FZ5A 5C00A 3D5JA 5INYA 4ID0A 3P90A 4GRFA 4POMA 1GSDA 4ML6A 1X5EA 3NZNA 1A2LA 4PURA 3FZAA 2HE3A 3GKMA 3DMLA 3BCKA 4K7NA 3UOMA 4Q5FA 5F07A 4FYCA 2AJQB 1E2YA 3M1GA 2OJLA 4GXZA 3WD6A 3CXGA 2AHEA 2HZFA 2AYTA 1ZMAA 3GUSA 1K0DA 4AJ7A 4K6XA 1SYRA 1XVWA 2ZCTA 3IRAA 4K7OA 3QMXA 3EU4A 3IC4A 4KNDA 3TRQA 3VI5A 1XPVA 5GZZB 5DALA 5ECQB 1NM3A 2I9HA 5IOXA 4N30A 1EP8A 3A5WA 3GTUA 5A4UA 1YJ6A 4TR0A 1NHOA 5AISA 4GQFA 5LD0A 3A3TA 4TKYA 20GSA 3TKRA 2EIRA 1GWCA 2LRNA 4KSMA 4IGJA 3HA9A 3F4TA 2B1LA 4HOJA 5KN2A 3CTGA 4LLRA 4NHZA 4XS6A 3UBLA 3IE3A 4OD7A 3UAPA 4WF4A 1TTZA 4WKWA 3QFBC 2H6XA 4PX1A 1XOBA 5DVBA 2VAFA 4MLYA 3NOFA 3LYPA 4MJEA 4BWSA 4PQ1A 3A2WA 4DSSB 1GUMA 1VF3A 2H01A 4KDYA 1OC8A 3WGEA 1XCCA 2G0FA 1A23A 2VCTA 1X5DA 4X0XA 1Z6NA 1OAZA 3UIWA 2VO4A 5D93A 2C80A 3GX8A 4BL7A 5G31A 4MF6A 3DWVA 1PN9A 3PGTA 4KX4A 5HQPA 1F2EA 4OFTA 4RQXA 2L59A 3F3QA 2LJRA 3FZ9A 1SENA 3L9VA 4AF2A 1BX9A 2C0EA 3ZVJA 5HFKA 4EUYA 1W4VA 1XWAA 4MMMA 2V1MA 4N0VA 2AAWA 4NAXA 2CX3A 1B9XC 3DGQA 1M7TA 4PNFA 5G5FA 2YANA 3V1WA 3TDGA 4FIWA 1GNWA 5JCGA 4OWYA 1YEPA 3TGZA 2DJ2A 1JLWA 4HI7A 4JZQA 4N11A 1A0FA 4IS0A 3G7IA 2CAQA 2F3MA 1GNEA 4YQMA 1OVNA 5FWGA 3KXOA 4JRRA 5L71A 3DVWA 3RAZA 1TRUA 2XC2A 2IWTA 3M9KA 1A8LA 1M2DA 1YDKA 3GX0A 1XVQA 2FY6A 2FWEA 2I81A 3ZZXA 1USBA 2ON7A 2CVDA 2PVQA 1F3BA 4HQZA 3HVVA 3ZLPA 1TRSA 2P5RA 3E9JB 3Q19A 2GT5A 3U6VA 2XBQA 3EINA 2RIIA 1EP7A 4I5QA 5J9BA 1U88A 1R5AA 1ST9A 1X5CA 3W8SA 1QMVA 4IJ3A 5F8BA 2GDRA 1NW2A 3A2XA 1XWGA 1JZWA 2QKEA 4O92A 2V6OA 4HS1A 4GSSA 1YF0A 5F0GA 3HDCA 2K6VA 5J4UA 14GSA 2P0GA 3WYWA 3TRPA 4K1FA 3VFIA 1GH2A 2QGVA 2VUPA 5ECIB 5CP1A 3O3TA 3HCZA 1PQNA 3DXBA 1R4WA 4K2DA 2VD1A 1XIYA 2JU5A 1N8JA 1B4QA 3CSIA 3FR3A 1HQOA 4MP4A 5IO2A 2HSYA 1XBSA 4DEJA 5GSTA 2H72A 1V98A 1X9SB 4FO5A 1M99A 2MMNA 2H8LA 4L0UA 4HQSA 5COHA 4X1UA 4IKHA 2R4VA 3F4RA 3TUEA 1EWXA 1TKDB 3M0FA 4D73A 1AW9A 1BAYA 4LL4B 2HSHA 2YWMA 3F0IA 2H1AA 3FKFA 4V2LA 4ZXGA 3IAM2 6GSTA 1B48A 2C3QA 3ZIJA 5HFIA 2ZUPA 3EWLA 2KUCA 3RHCA 1DE2A 6GSSA 1JHBA 2L57A 2MYGA 5D9WA 3P2AA 2FUG2 1EZKA 2YCDA 2J9HA 4MZCA 1ML6A 3IK7A 1X0RA 3TJKA 2LTKA 2VCZA 3CSJA 1SKWB 2FA4A 4KAEA 3TKQA 3U5RE 1Y25A 2V32A 2RUEA 2FWGA 3H4KA 1TI3A 4JR6A 5DAKB 3WGDA 3M8NA 4ILFA 3GN3A 2L5LA 2H66A 1S3AA 2C0DA 3EVIA 2WDUA 3KTLA 4F9ZA 4CW9A 3GHAA 16GSA 4RQRA 2C3TA 2WCIA 5IPHA 1AQVA 2FWFA 3ZIVA 2HNLA 3VK9A 5G1LA 5ECOB 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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