4XTSA

Salmonella typhimurium ahpc t43a mutant
Total Genus 51

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
160
structure length
160
Chain Sequence
SLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFAFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAH

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
S1 (5-6)TII1 (2-5)S10 (129-135)EMPTYTI3 (125-128)3H1 (25-28)S2 (11-16)TI1 (98-101)TII2 (28-31)S5 (65-71)S4 (32-37)TII3 (40-43)AH2 (75-84)AH1 (48-63)O1 (46-48)3H2 (86-90)TIV2 (112-115)S6 (94-97)AH3 (102-107)TI2 (111-114)S7 (110-111)S8 (116-117)O2 (118-120)TI4 (137-140)S9 (120-125)S3 (19-24)AH4 (144-159)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
publication title Salmonella typhimurium AhpC C165S mutant
rcsb
molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
total genus 51
structure length 160
sequence length 160
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L, M, N, O, P, Q, R, S, T
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2015-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4xtsA00
4MJAA 5H5SA 2A2SA 1FB0A 3DEXA 2YOIA 3E0UA 2NVLA 3GUSA 3KTBA 3QFBC 1Z6NA 4IVFA 5AIVA 1ZMAA 3LG6A 1MDIA 2VCZA 3NZNA 5EL8A 2GVPA 2GTUA 4PGTA 1YJ6A 5IMDA 2RM5A 3H93A 2JZTA 4KA0A 3U6VA 3FZ9A 2R5GA 3BD2A 3VPTA 3MWHA 2YWMA 1TDIA 2O85A 2C1YA 1OVNA 2I1UA 5DJLA 4HS1A 4OFNA 1GLQA 2OKAA 2OJLA 3EMPA 1G7OA 2C80A 2LQOA 3QCPA 3UVTA 1K0NA 4ML1A 1DE2A 2B3SA 6GSXA 3GH9A 3IDVA 4KSMA 4EDYA 1ZL9A 4TR1B 14GSA 2I9HA 3G7IA 4O32A 5GSSA 1HNCA 2HZFA 1V9WA 2B5XA 4ACSA 5A5KA 1TK0B 1IYHA 1A23A 1JHBA 7GSSA 3F63A 4WF4A 2A4VA 2DLXA 2VUPA 4Z7XA 1BEDA 1HQOA 3TKSA 4LL1B 1YY7A 1LU4A 1PL1A 4ECBA 1DUGA 3KEBA 1Z9HA 1B48A 5IQYA 1GSYA 2I81A 3IE3A 4TOPA 3F4TA 4ZBAA 1TRVA 3QAGA 4HQSA 4RI7A 1RW1A 4HUAA 1T3BA 2H70A 3ZMLA 5DALB 4F03A 3VFIA 2ON5A 3DXBA 1CQHA 3BCKA 3GTUB 2YANA 5D96A 1T4ZA 2HZEA 3TUEA 2REMA 2H30A 1O8XA 1Z3EA 1TRWA 3HVSA 6GSWA 3KM6A 12GSA 2K8SA 4MF5A 4QL9A 1DSBA 2H19A 3KMOA 1UN2A 3UAPA 5A4WA 3QFAC 4HI7A 1TJDA 1SYXA 1K3OA 2WCIA 4G10A 1THOA 3HXSA 3KTLA 1GSSA 1TRUA 1W89A 5D8IA 5A4UA 1PQNA 3F4RA 1GULA 1SK2A 2IFQA 2HE3A 4O7HA 5IMCA 3MDKA 3A5WA 1EWXA 4AJ6A 1K0DA 2FWHA 1B9XC 5CRWA 1EP8A 3FW2A 2L5OA 5ECLB 2GSTA 3WT2A 1K3LA 6GSYA 1TOFA 3ME8A 1ZCPA 4TXOA 5HR3A 4NXIA 1ABAA 4Q5QA 2GSSA 2JADA 3TKRA 4NMUA 2K6VA 3M9KA 3TCOA 3LYPA 4KW6A 2IJYA 3GKMA 2B5EA 5DAKB 1GUMA 1AQVA 1YF0A 5D9XA 2QGVA 2XPEA 1QFNA 4MJEA 4MZWA 4TR3A 3NIVA 2C3TA 4HZ4A 2V2GA 1T8EB 2JSZA 2C3NA 5FWGA 3A2VA 3M9JA 3VWVA 2LSTA 5G1KA 5JWOB 4EUYA 17GSA 5E59A 1X5EA 2CAQA 4MP4A 1J9BA 4ZBDA 4K0NA 2LEGA 9GSSA 4PX1A 3GX8A 2PU9C 3HJPA 3D5JA 5EPFA 5DVBA 4ZXGA 4JEDA 2G2QA 4PXOA 1U6TA 2C0DA 4TRXA 3ZFLA 2DMMA 3TGZA 2GZZA 3ZL5A 1TK5B 2HZEB 4V1Ap 1T00A 5ECHB 3ISOA 4HU7A 1G6WA 3LJRA 3N5OA 1H75A 3GHAA 2JACA 1NM3A 4FO5A 1B4QA 4NHZA 1RQMA 3G9BA 4I2UA 2CX3A 4AJ7A 4O92A 1OC8A 1WE0A 2HXKA 3JCML 4JZQA 3GKNA 4NWYA 1SL0B 2I4AA 1V58A 1ILOA 1K0OA 2H1DA 2HRFA 3CBUA 3VK9A 1VRSD 3Q74A 2OA7A 1PRXA 3O76A 2PUKC 1ZGNA 4J56E 2RUFA 2IL3A 4EVMA 2V6KA 1FVKA 4XCSA 2F9SA 4LMWA 1WJKA 1SKRB 4MABA 2MYGA 3LEFA 1YEPA 5LCZA 4AJ8A 4K0GA 3DGQA 2L6CA 3ZFBA 3C1RA 1JLWA 4FYBA 4OFMA 3F4SA 16GSA 2VCTA 5LNKe 2F8FA 2P0GA 2O8VB 1Y6EA 3D4MA 1G0TA 2DJ0A 2IWTA 5J41A 1QXHA 3WT1A 3LXTA 3VPQA 1PD21 1PMTA 5H5RA 1OKTA 3FYGA 4JR4A 2HLSA 5CO3A 3TJKA 3TKSC 5IM9A 3HY2A 2H0IA 4EF0A 4DVCA 5J9BA 2QC7A 5KN0A 2MMAA 1B4PA 2PN8A 4J2FA 2JU5A 2C3QA 4F0CA 2O7KA 4TW5A 4Q5RA 3TDGA 3TRQA 3WGDA 2H8LA 4RUVA 3W6GA 1GUHA 3GFKA 4MA9A 1A0RP 5G2ZA 4IQAA 1OKDA 1UC7A 3KJYA 5HR1A 2FHEA 1TXXA 2LRCA 5D9VA 1WOUA 2B6MA 4RQRA 4RQXA 2B1LA 4JE1A 5IMVA 2H76A 2KOKA 5CYYA 3ME7A 2RM6A 3I43A 4N0VA 1BAYA 1JZOA 5CREA 2X8CA 1F6MC 1VF3A 3EU4A 4IKHA 2VLVA 5IMAA 1WP0A 13GSA 2LNTA 2HNLA 3UIWA 1H4OA 2CZ3A 3RDWA 4FYCA 2VAFA 5AISA 2OE0A 1SJZA 2NPBA 3FZ4A 2P5RA 5B8BA 4G2EA 1CQGA 2B7JA 5B6NA 3QMXA 2C0EA 3N9JA 4PQHA 2BMXA 3HCZA 5CP1A 3KP8A 4EDZA 3ERFA 5FT3A 3TOUA 1Z7RA 3CSHA 1FHEA 1ON4A 4KX4A 3Q18A 4G19A 5DCHA 22GSA 4JU5A 1JZDA 3F0IA 4GQFA 2H0HA 3BCIA 4N0ZA 4ZB9A 3VWWA 3L78A 3EU3A 4HOJA 1GH2A 1SL2B 4XTSA 3IBHA 1J08A 2MMNA 4BL7A 4PUAA 1FO5A 5ELGA 4FH8A 5INYA 4KDYA 2L57A 1GSQA 2MMZA 1ERTA 4BWSA 2R4VA 4TVEA 2L59A 4MMMA 5DCGA 3RBTA 2IN3A 5F07A 5ENUA 1GSFA 5HFKA 5ECSA 4CHSA 2LUSA 4K1FA 4V1Ag 3QR6A 8GSSA 4L5LA 4EO3A 2CVBA 2EIQA 2EC4A 5DQYA 2PMTA 2PPTA 3GH6A 4ECIA 1KTEA 2FWFA 1SKWB 1GNWA 1VF4A 2KP1A 2OBKA 1A8LA 1QMVA 3UJ1A 4IP1A 5GZZB 1AXDA 4JRRA 4ILFA 4LA1A 3P90A 1X0RA 3IAS2 1SD8A 1VF2A 1ZOFA 4BWQA 2H72A 4IBPA 4YQUA 3IAM2 3F6FA 3GKXA 4IELA 3HZ8A 3KP9A 1QGVA 4ZL8A 1A2LA 1GSDA 1EOHA 2PERA 4OO4A 4TXVA 4O5RA 1AAZA 5A4VA 4IJ3A 3UBKA 4KGIA 3GURA 4KNDA 1EGOA 4CW9A 1LJRA 3UMAA 2H75A 4PQIA 2LV3A 2VCVA 3FY7A 1U87A 3TB2A 1GTUA 2H1AA 3DVXA 1OE7A 4V2NA 4NV5A 3I6AA 3IHQA 5GAPD 5KN1A 3SBCA 2H66A 4GSSA 3ZYWA 4QQ7A 4WF5A 4MPFA 3LYKA 1XWCA 2H0GA 3RHBA 2AB6A 3WD6A 3KH9A 4YAVA 2KP2A 4IW9A 5F05A 5IPGA 1QK8A 5D73A 3CMIA 1I9DA 5AIXA 2DJJA 4NAXA 3SWLA 3M8NA 3IRAA 5ECKB 3LSZA 2HT9A 2AHEA 1Q98A 4HU9A 4TN8A 3G7JA 1HYUA 1OYJA 5GAND 2L6DA 3ERWA 1USBA 1X5CA 5HQPA 5ABRA 4XS4A 2KHPA 5AGYA 1FVJA 4X0XA 1PGTA 3M0FA 5ECNB 1O6JA 3FR6A 2LJAA 1SU9A 1U88A 4ZBBA 3DRNA 3LORA 2YP6A 4L5OA 3KZQA 4DEJA 3D21A 2L5LA 2CT6A 1V40A 4D73A 4CDOA 4POKA 1XVQA 1K0AA 2N5AA 2ON7A 2FNOA 1AC1A 1TW9A 1QUWA 1V57A 1NHYA 1X5DA 5IMFA 1Y25A 5ECOB 4ULXA 1MEKA 2M46A 3F3QA 1R7HA 1WIKA 2H6XA 1S3CA 1OC9A 1M2DA 4OFTA 4WR5A 2YCDA 2VO4A 3FHKA 1SJ6A 2H6ZA 4MJBA 5COHA 2GT6A 1O81A 1WPIA 3F8UA 1X9WB 2IMFA 2LKUA 2WZ9A 1GTAA 2M80A 1VGLA 5ID2A 1BG5A 4WEYA 1SYRA 3TRPA 19GSA 2N5BA 1M7TA 2VM1A 2WULA 2YPMA 5AN1A 4LL4B 4OD7A 3MSZA 5EY6A 3ZLPA 1R4WA 4K2DA 2X99A 1NSWA 1A24A 2LQQA 4MJCA 5LD0A 5C04A 1X9SB 2HI7A 1TK8B 4N10A 4TR0A 3TKSE 3GSTA 2CZ2A 1TI3A 2B7KA 4IQ1A 4YQMA 1MDKA 4XRAA 2DJ2A 4N30A 3LFLA 1THXA 2P5QA 2YV7A 5F8BA 1AQXA 2HRNA 1PA3A 3RPNA 1XOBA 1EZKA 3IV4A 3A2WA 2IFQB 1PKZA 2VL2A 3APOA 1XW6A 1NHOA 1HNAA 3UL3A 3APSA 4RI6A 1XZOA 1XW5A 1T7PB 1BQ7A 4I6XA 2LRTA 2H73A 5IO2A 2LTKA 2VCQA 2L4CA 3GYKA 4FIWA 2RUEA 1A8YA 1Q4JA 2D2ZA 3GX0A 1SD9A 2ZNMA 2R6KA 3UBLA 4TXOB 2BJXA 1PX7A 3H8QA 3Q19A 2GDRA 1HNBA 3DVWA 5H5QA 3E3EA 4DSSA 3FEUA 1GNEA 4QL7A 2E2MA 5JCGA 1X9MB 5IOXA 4ISDA 3W8SA 1GWCA 1XXUA 2P31A 2XPDA 1M2AA 2ES7A 2FLSA 3O3TA 1AW9A 5JWRB 3UOMA 4KCAA 1ZYEA 2FA4A 3EE2A 1BX9A 1EP7A 4BVYA 3IC4A 3ED3A 4POMA 4I8BA 4GQCA 4EKZA 1EGRA 2PWJA 3DIEA 3HYPA 3I9V2 3VI7A 3US3A 3L9SA 3IA1A 2TRXA 2FCHA 2H71A 3P7XA 3W8JA 3EWLA 1O85A 2TRCP 4MZCA 3M3MA 2YV9A 3FRCA 3EURA 4WBRD 4K7NA 2IIYA 1GL8A 1BYEA 3KIJA 1EEJA 3FZ5A 4K8MA 1K3YA 1XVWA 4TR4A 1Z7PA 3R2QA 1XWGA 3PR8A 5HR2A 3F9UA 4AGSA 2GZYA 1V2AA 2LJRA 1VF1A 3GV1A 4H86A 1U3AA 3CTFA 1XWAA 1WRYA 3FR9A 4N11A 2V6OA 4EL1A 3HD5A 1KNGA 1MD3A 4J57E 2X64A 5J3RA 1UA5A 3HJMA 4JR6A 2OE3A 2C8UA 4I5QA 1DE1A 4YAPA 4HZ2A 2GQMA 3KCMA 3MAKA 2F8AA 1PL2A 4MDCA 3C1SA 3HZ4A 4TR1A 2Z9SA 4F9ZA 3HVXA 4KDXA 4NPBA 1GRXA 5CRDA 2G0FA 1T1VA 2MZCA 2C4JA 2VIMA 1YF1A 2CVDA 2WGRA 3EVIA 2YJ7A 2HSYA 3CRTA 3BJ5A 2YN1A 4F0BA 1ZYQB 4X1UA 2NTOA 4KE3A 3TKPA 3GRXA 1N2AA 5G5FA 3CYNA 3TJBA 2MBTA 2XC2A 2V1MA 2M72A 5CRGA 2OBIA 3ZIVA 3RAZA 2LNSA 2F3MA 1GP1A 3M1GA 2YWOA 4MK3A 3EC3A 2DC5A 2NDOA 1YDKA 1TKDB 3GIXA 3F3RA 2V32A 4F2IA 5DJMA 1TRSA 1F9MA 1TU7A 3U5RE 3RPPA 1ZZYA 1OE8A 2LRNA 4E8EA 5DALA 4OO5A 4I97A 2ZUPA 3IK7A 3GTUA 1F3AA 4P3YB 4KDUA 4K9ZA 1TTZA 2LS5A 2A2RA 1ERUA 1U3IA 3FZAA 5E4WA 4IS0A 2LJKA 5C00A 4XS6A 5CRHA 2VL9A 2WJUA 2WRTA 2WS2A 2H01A 3LXZA 2HYXA 2OACA 4NV2A 5IIZA 4DSQA 3BOAA 2X8HA 3ZREA 2JZSA 3C7MA 2GS3A 3WGEA 5GSTA 1JZRA 2YWNA 3LGCA 3WYWA 2CA8A 2J9HA 1BJXA 2GGTA 4OCFA 2VLTA 3H79A 5L71A 4MCUA 5JWQB 1EV4A 4K7OA 2E0QA 3FR3A 1KEBA 3TJGA 1F37A 2H1GA 2O89A 1HD2A 3UARA 1MD4A 1SKSB 2VCWA 2C0GA 4BA7A 3HJOA 1YKAA 1EOGA 5IOWA 4PUFC 2GZPA 2CAIA 4XS1A 2DIZA 1SK0A 3H4KA 5ECIB 5G5EA 3L9UA 5ECPB 4ZIJA 4V2MA 3PGTA 3ZMKA 4KSOA 3GNJA 3VI5A 4OMVA 4K7IA 2K9FA 3EYTA 2DJ1A 2VL2C 4GCIA 1QQ2A 3QOUA 5DAKA 1E2YA 4ECCA 2AAWA 2IMKA 1WMJA 2GLRA 1NW2A 3OR5A 5F0GA 1TU8A 3DYRA 3IR4A 2DBCA 3GA4A 2YNXA 1V98A 4L8EA 2VD1A 2N5FA 4EXJA 4G9HA 3A3TA 3DD3A 1JZWA 1R5AA 1Z5YE 3DKSA 2IMDA 3TRXA 11GSA 2CQ9A 5ELAA 4ZILA 3D22A 1ERVA 1AUCA 4BVXA 6GSVA 2K8VA 1M9AA 5KN2A 3CXGA 2AJQB 1XWBA 4POBA 3Q6OA 3K8NA 1PSQA 5G30A 1I5GA 3FKFA 2H6YA 4WBJA 3ZVJD 1G6YA 2QKEA 5IPHA 1B9YC 1TI1A 2C0FA 2QSIA 5CAXA 4WR4A 2GSQA 1EEMA 1ERWA 1SL1B 3CTGA 3QAWA 4AF2A 5CNWA 2FWEA 3CRUA 1O73A 3TKQA 4ECJA 1LBKA 1EV9A 1Z6MA 3D4TA 2YWIA 3J7Yk 4IHUA 1J0FA 3L4NA 2AUVA 2VM2A 3ZTLA 3QDNA 5J5NA 1MDJA 4XIHA 2H1BA 5J9CA 3D0ZA 4LMVA 5B8AA 2F51A 2GQLA 5D93A 2HFDA 4ID0A 5ECMB 1GSEA 2NBSA 2TIRA 1OC3A 1PX6A 3MNGA 4ZL9A 1YQ1A 1MTCA 5JCUA 2CX4A 4GSNA 2FUG2 4PQ1A 1C72A 1XIYA 2JSYA 2E7PA 2ZCTA 10GSA 1FB6A 6GSUA 1GTBA 3C73A 4MF6A 3I69A 1A2JA 3IXRA 4OCEA 2MMOA 2R2JA 4MLYA 4MZBA 3QD9A 3APQA 2B5YA 2IMEA 2R3XA 3TOTA 1URMA 4L0WA 3LQ7A 3IPZA 3NOFA 1R26A 3EMXA 3TJJA 4EC0A 3V1WA 2DMLA 1ACVA 3RHCA 1WWJA 4KH7A 2XBQA 4YH2A 5IMZA 1G7EA 2PBJA 2XHFA 4MH2A 4PURA 2KLXA 5EVOA 3PINA 4MH3A 2WDUA 3TJFA 3HVVA 4XHMA 5D9WA 20GSA 4WETA 3ZZXA 2GT5A 2I3YA 1KBNA 2CVKA 4Q5NA 1XCCA 6GSTA 2V41A 2YZUA 2ALBA 2J23A 3VURA 1XOAA 2OADA 2KUCA 4ML6A 5G31A 4ZB8A 1AIUA 4HDEA 1A2MA 2RIIA 2VD0A 5FHIA 3A2XA 3GKKA 4DSRA 3IOSA 4GXZA 1XBSA 1XW9A 3KGKA 4HJMA 2HSHA 3IK9A 4IN0A 2WB9A 3KH7A 2O87A 5G1LA 3ERGA 3CSIA 3VWUA 3VWXA 5KN3A 1FOVA 3ZRDA 4GTUA 1S3DA 3EINA 4E8HA 4XS4B 5J4UA 3GSSA 1YKCA 2DJKA 1GTIA 4V2LA 1YEXA 1ML6A 1K0MA 5DQSA 1GSUA 2VLUA 1DBYA 3KMNA 4JBBA 1XWKA 2GSRA 2YJHA 1SK1A 2L4QA 3G7YA 4MPGA 1M0UA 2WFCA 3GL5A 4D73B 4ZB6A 2FD3A 6GSSA 4GF0A 1T4YA 1N8JA 4YQVA 2VL3A 2DIYA 5B6MA 4XRDA 1GUKA 3ZVJA 1OC9B 4OWYA 5F06A 18GSA 3F6DA 4TKYA 4WKWA 1AQWA 2OE1A 3C8EA 2MBSA 5ECQB 2DSAA 3E9JB 2EIRA 5HFIA 1S3AA 1F2EA 5DDLA 2K18A 4HJ2A 3VLNA 1IYIA 5ID2B 4BPYA 3HKRA 1FW1A 3L9VA 4GRFA 1M99A 2FWGA 3D6IA 4POLA 1SJIA 2IPAA 2RLIA 4GSTA 2AV4A 3AY8A 2H74A 3KD0A 1PN9A 3BBYA 3DWVA 1O7UA 1PKWA 2FY6A 4FYUA 1RK4A 4NHWA 4GWRA 3ZITA 4HEA2 3HDCA 2EIOA 1JFUA 2VCXA 5ECRB 5HR0A 2PVOC 3O6TA 1FG4A 4IP6A 1A0FA 1M9BA 2JL4A 1E6BA 1UVZA 4Q5FA 1GLPA 1ST9A 2DJ3A 5JCWA 4F82A 3WGXA 3ZIJA 2X8GA 4KAEA 1YZXA 1TP9A 2XBIA 3LWAA 1FAAA 3GMFA 1XPVA 4KB3A 2PVQA 4PNFA 2VOCA 4ZL7A 3L0HA 3CSJA 4K6XA 2JZRA 2GQKA 2IMIA 3P8WA 4I2TA 2B1KA 4L0UA 2FGXA 5B7CA 3H1NA 4PNGA 1XFLA 3P2AA 1W4VA 4WXTA 1OAZA 4DSSB 3S9FA 1M2BA 3HA9A 3QPMA 4KCEA 2R37A 5DBQA 5HFGA 1SENA 4X43A 4MF7A 3QAVA 5KEJA 2AYTA 1R5PA 4HQZA 2FA8A 4IJIA 3FK8A 3GN3A 3PH9A 4LLRA 1JLVA 1K0BA 1O8WA 3GL3A 4KUNA 2PGTA 1K0CA 5IO0A 3C71A 3DMLA 4EE0A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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