4Z7XA

Mdba protein, a thiol-disulfide oxidoreductase from actinomyces oris.
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
sequence length
211
structure length
211
Chain Sequence
FPAPSEGLATAKANQGGIPKQVLSDASWTYGEGAALDTVAASAPVLDIYFDYSCSHCAQFEGLHTQEINQLLSDKKITLALHPCKLLQQEWTSVVMNAMGVVLDEAPAQSLSFHNAAFEIFSQAIQTKNQSNMTVEGLVAAAAKVNVPKEVSAKFKAAVDSDKYGKWVKLGDEAFKARELEGTPTVFFKGEKVDLNKLQTPTSLTELVTGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A Disulfide Bond-forming Machine Is Linked to the Sortase-mediated Pilus Assembly Pathway in the Gram-positive Bacterium Actinomyces oris.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MdbA
molecule tags Oxidoreductase
source organism Actinomyces oris
total genus 72
structure length 211
sequence length 211
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-04-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13462 Thioredoxin_4 Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z7xA00
2CX3A 4PXOA 4LLRA 1U3AA 3DRNA 3U5RE 2FWGA 1GLPA 4OCFA 3F6DA 3EYTA 3LYPA 2KOKA 1NM3A 3CTFA 2AB6A 2RIIA 1ST9A 1GSDA 4I2TA 1O7UA 2AUVA 3GIXA 4EXJA 3A2VA 2L57A 2FNOA 5JWQB 2CX4A 4ML6A 1SENA 3C8EA 1VGLA 3BJ5A 1R5PA 1J08A 1WE0A 1O81A 2IMFA 4HS1A 2JADA 4ZBBA 2OE0A 4MABA 3C1SA 3C73A 2WCIA 2O87A 2PUKC 1TTZA 1V98A 4TR4A 4HJ2A 2N5FA 3HZ4A 3GRXA 3Q74A 4ZB9A 1TP9A 2PGTA 3GV1A 5CRDA 1MDIA 3I43A 1S3AA 4HQSA 3WGDA 4HDEA 4FH8A 2V2GA 5ID2B 1BAYA 5D93A 1YEXA 4FIWA 4HZ4A 4OO5A 2WDUA 1MEKA 3ME8A 4L0UA 4MF6A 1I5GA 3TKSC 1W4VA 4H86A 2O85A 1GULA 4GSTA 4V2LA 1ZZYA 3A2XA 3N5OA 3Q6OA 3A5WA 1UA5A 4KAEA 2OKAA 3QD9A 3F3QA 1XW6A 4LMWA 2BTOT 2LQOA 4TXOB 4X0XA 2E0QA 4O7HA 2E7PA 1EGRA 3KMOA 5G31A 3LGCA 5B6NA 2HZFA 5DJMA 3GTUA 2H0GA 4HU9A 2OJLA 3APQA 5F8BA 3CXGA 1GSYA 3TJBA 1X9WB 4WR5A 4V1Ag 5D73A 4N11A 1PN9A 4I6XA 1T8EB 2IMKA 2RLIA 1K0DA 2CVDA 1GSEA 4TXOA 3FY7A 4MF7A 3J7Yk 5DBQA 3A2WA 3IDVA 3TRQA 4PQHA 2B5XA 4ZL7A 2RUFA 5G5EA 2VD0A 1O8WA 2ES7A 5ECNB 1M9BA 5GSSA 4MMMA 2LNTA 2VAFA 3EINA 3RPPA 2LJRA 4ZILA 2L4QA 1YF0A 4FYCA 4KA0A 3IXRA 2R37A 4XRDA 5ELAA 2OA7A 3C71A 4V1Ap 1XVQA 2CAQA 3UVTA 4HEA2 2JZSA 1U88A 1GL8A 2L6DA 2IN3A 4KB3A 3UBLA 1YDKA 3ZZXA 11GSA 3I69A 1B4QA 4KH7A 3ZFLA 3HVVA 3P8WA 2VCZA 3F4TA 2K9FA 3NIVA 3EVIA 2GSSA 5ECOB 2AJQB 1R7HA 1TRVA 4OFMA 2GS3A 2IFQB 4OMVA 5HR3A 4MA9A 4N0ZA 4PURA 2R5GA 2KLXA 3FZAA 1MDKA 3P7XA 2B5YA 3UMAA 3NOFA 3WT2A 2A2RA 2VM2A 3GUSA 2IL3A 4MZCA 2PU9C 2PWJA 1SD9A 3L4NA 1AQVA 2F9SA 3FR6A 2AV4A 1EV9A 1GSSA 1M2DA 1IYHA 2CZ2A 1TW9A 2A2SA 2X8HA 3UBKA 3HZ8A 2GGTA 1EEJA 1M2BA 3TB2A 5DALA 2OACA 2C3NA 3BBYA 3HDCA 2CAIA 4GWRA 1LU4A 1GUHA 4L8EA 3L0HA 4K0NA 1BYEA 4KX4A 1PA3A 2YN1A 5IMDA 1Z5YE 3GYKA 3BOAA 1PQNA 3IK7A 5HFGA 2YWMA 1ZOFA 3CMIA 1OE7A 3EC3A 3IAS2 2H6XA 4N10A 2L6CA 2LRCA 3HCZA 4QQ7A 5F05A 3F9UA 4ILFA 2QC7A 1GUKA 3IA1A 3LQ7A 3AY8A 5A4WA 2NDOA 5AISA 4XRAA 4TR0A 3J7Yb 4G19A 4JBBA 4CHSA 4KUNA 5DJLA 3A3TA 2ON7A 3DVXA 1TU7A 3VK9A 1A2LA 2B1KA 2VL2A 3MWHA 2IPAA 2QKEA 4F82A 2EIRA 4FYBA 2EC4A 3EE2A 2NPBA 18GSA 4JZQA 3KH7A 2PVOC 5HR2A 5FWGA 3KTLA 1SL1B 1WWJA 4HZ2A 1R4WA 1AIUA 1V57A 4YQVA 3DGQA 2GVPA 4MDCA 1T4ZA 4K7NA 2H75A 4ZIJA 2K8SA 4O5RA 1U87A 3DMLA 5D9WA 3TKPA 3ZITA 3OR5A 2MBSA 3GL5A 1PGTA 4ULXA 3TOTA 4NV2A 3O3TA 2YCDA 1BQ7A 5HQPA 2JL4A 1IYIA 1A0RP 1YQ1A 1NW2A 2KHPA 2R4VA 1MDJA 1A8YA 3F6FA 4HJMA 1RW1A 3DVWA 2VCXA 2V1MA 1RQMA 4MPFA 4V2NA 1WRYA 4KDYA 1G6YA 3Q18A 4TR1A 4KCEA 2EIOA 5DAKB 1TRWA 2F51A 4TVEA 2CQ9A 5KN1A 2DIZA 2VO4A 1BEDA 1VF3A 5EL8A 4K2DA 5ECQB 1V40A 1FHEA 4TXVA 5B8AA 4J2FA 4I8BA 4F2IA 3FZ4A 3IPZA 4XS4B 3TJJA 2GQKA 1K0AA 1Z9HA 3PH9A 3P90A 3QCPA 3TRPA 1U3IA 4K7IA 4TRXA 19GSA 1GTIA 2H73A 3DXBA 2KP1A 2MMZA 2DJ0A 2JU5A 1TI1A 2LNSA 2C8UA 2JZRA 3H1NA 3HVXA 1XPVA 3VI7A 5ECPB 3IBHA 3WGEA 4JR6A 1F3AA 1EV4A 3GMFA 1AXDA 4DSSA 4NMUA 5KN2A 5DCGA 3ZLPA 2XC2A 1T7PB 1QFNA 2C1YA 4TW5A 4KSMA 4IGJA 1E2YA 1VF4A 2RM5A 3CSHA 4KCAA 1XWAA 1HNAA 3BCKA 4ZXGA 1B8XA 1A0FA 2CT6A 1GH2A 5CO3A 5J9BA 5IQYA 1SJ6A 2EIQA 4MK3A 2MMOA 2HI7A 5DDLA 2HXKA 1GP1A 4F0CA 5J5NA 2F8FA 3SBCA 2B5EA 1Z7RA 2C80A 2KUCA 5CREA 5H5SA 1F6MC 3UVHA 4GSNA 1J9BA 1EOGA 1FB6A 2C0DA 4NAXA 2DLXA 3BCIA 3FR3A 2R3XA 5FHIA 2HFDA 5IPHA 3IRAA 1H75A 4IJIA 4MJBA 4KDUA 2CVBA 1GSUA 1CQGA 2ALBA 3L9VA 4NHWA 4YQMA 3W6GA 3GKNA 2VIMA 1M7TA 5KN3A 2DJJA 3UARA 2LEGA 3ZFBA 3ERFA 1ACVA 3JCML 3FRCA 3QMXA 3U6VA 5D96A 4DSRA 2CVKA 4CW9A 1AW9A 3ZVJD 1XW9A 4ECBA 2H1GA 6GSXA 1TK0B 4NXIA 2V41A 3I9V2 2DC5A 2XPEA 2IMDA 2GSTA 3KIJA 1TU8A 4BVYA 4FO5A 5IPGA 4MH2A 4ECIA 1SK2A 20GSA 2B7KA 1OAZA 3HVSA 1Z6MA 2P0GA 1B9XC 1C72A 5IO0A 3VURA 3DWVA 4ZB6A 1YEPA 3FZ9A 4PNFA 1GUMA 1HQOA 3QAGA 4DEJA 4MZWA 1OC8A 1FVJA 3LG6A 2GQLA 1BJXA 1I9DA 1ZL9A 3TGZA 2M46A 4JR4A 3F3RA 2I3YA 1T4YA 2AYTA 2H19A 3R2QA 1XFLA 3ZL5A 5GZZB 2IIYA 2HNLA 5ID2A 1XOBA 4WBRD 1XXUA 3MNGA 4J56E 5EVOA 4RQXA 4HUAA 1QGVA 4L0WA 4TR3A 2H72A 4PNGA 1SD8A 3ZTLA 1HD2A 1OKDA 3TDGA 3E0UA 3DD3A 5GAPD 2GZPA 4KSOA 1EWXA 1X0RA 4TN8A 5JCUA 3VWUA 2V6OA 4K0GA 1X5CA 5J3RA 4GQFA 2AHEA 1SJIA 3HHVA 4CDOA 3ZREA 5ECHB 2VL2C 1DBYA 1FW1A 3CTGA 1X5DA 3QFAC 2C4JA 3VPQA 3DYRA 3UJ1A 2GLRA 4DSQA 3QPMA 2C3TA 3TJKA 1G7EA 5D9VA 2MMNA 4EDYA 1Y25A 2HLSA 2X8CA 2G2QA 3D4TA 4YAVA 1T3BA 2O89A 1V9WA 1T1VA 2REMA 2ZUPA 1DSBA 3EMXA 4RQRA 3LORA 1EEMA 4L5LA 2H71A 5GAND 3S9FA 4XS6A 17GSA 4EDZA 1N2AA 1A24A 1B9YC 5IMAA 4XIHA 3TUEA 1DE2A 2LUSA 3MDKA 1NSWA 3ZMKA 1A2JA 2CA8A 4WR4A 4BL7A 2H1BA 1MTCA 2GT5A 2P31A 1K3LA 1W89A 3D4MA 3FKFA 4ECJA 4BVXA 2VD1A 2GSQA 5C00A 3DKSA 2IFQA 2YV7A 4MCUA 3H4KA 3DIEA 3KCMA 1EGOA 4KNDA 2BJXA 4JEDA 1BG5A 4OFNA 2F8AA 1SL0B 4RUVA 3M1GA 1RK4A 3GX8A 3KEBA 1O73A 1A8LA 16GSA 4ISDA 5CAXA 2LQQA 4X1UA 1DUGA 1K3YA 2MYGA 3GFKA 1OC3A 2DJ3A 1ERVA 2B6MA 4ZL9A 4KDXA 3TKSE 1K0CA 2YZUA 2H74A 4O92A 1THOA 4MH3A 2JACA 4WKWA 1GNEA 2GZZA 1SU9A 4I5QA 4HQZA 4NWYA 3ERGA 3LXZA 2D2ZA 1EOHA 4IN0A 5LNKe 4PUAA 4XCSA 4AJ7A 1XBSA 2H1AA 3QAWA 3VFIA 1UC7A 5KN0A 2CZ3A 5H5RA 4AF2A 2N5AA 3ZIVA 4XS1A 1WMJA 5A4VA 2XBQA 2PN8A 2HRFA 2TRCP 1S3DA 3W8JA 1JFUA 1ON4A 5IIZA 3UIWA 5G1LA 3US3A 4QL7A 3FZ5A 1QUWA 3O6TA 2WB9A 2HT9A 4OFTA 2R2JA 1M99A 3H93A 1FOVA 1U6TA 5ELGA 2HZEB 2VM1A 1M0UA 2WFCA 4IQAA 1JZOA 1K0BA 2WRTA 3G9BA 8GSSA 3C1RA 3VI5A 3RBTA 2I4AA 5AIXA 5ECIB 3F0IA 5HR0A 3E3EA 2FHEA 2QGVA 3WYWA 3GH9A 2I1UA 3QFBC 4K9ZA 5IMFA 1TXXA 2YJHA 1TOFA 1SKRB 5ECMB 2NTOA 3ZIJA 4PQIA 1XW5A 3LEFA 5DVBA 4DVCA 1SKWB 2NVLA 1FVKA 2OBIA 2HZEA 2L59A 4D73B 2H30A 4NV5A 4AJ8A 3RAZA 2GTUA 3ZYWA 2VLTA 4POKA 1JHBA 2H0IA 3IE3A 1JLWA 1S3CA 2Z9SA 3VPTA 2LTKA 5FT3A 1YKAA 2I9HA 3F4RA 4AJ6A 3KH9A 1Z7PA 1ZYEA 1GLQA 3G7IA 5AGYA 2LJAA 3KZQA 1ZMAA 4YQUA 5B7CA 3WGXA 4D73A 4RI7A 3M0FA 4IVFA 2FGXA 4N30A 3KJYA 3LSZA 3QAVA 4EO3A 1OC9B 3GSSA 2YWIA 1J0FA 4K7OA 1PX6A 3GA4A 2WS2A 2GT6A 4J57E 5DAKA 3RPNA 4WETA 3HYPA 1DE1A 5ECSA 4WEYA 1XCCA 2FA4A 4KW6A 1YF1A 9GSSA 3D5JA 5G1KA 1G0TA 2V6KA 3Q19A 3ZRDA 2VCWA 3CYNA 2DIYA 4XS4A 1MD4A 2IMEA 1K3OA 4EF0A 1XWGA 3TJGA 2E2MA 4EUYA 2M72A 4JU5A 3LJRA 2VCVA 5HFKA 3TRXA 4MJEA 2KP2A 2L4CA 1WOUA 2B7JA 2C0EA 4KGIA 3FW2A 1ILOA 1HNCA 1SK1A 3M9KA 4AGSA 3FYGA 4Q5QA 5CYYA 5ECKB 2VCTA 3IK9A 2B1LA 3QR6A 1GSQA 4EVMA 4OO4A 3QOUA 4HI7A 10GSA 4MP4A 3F4SA 1WJKA 4HOJA 1AUCA 1FO5A 2YWNA 2H76A 2WJUA 1B48A 2YV9A 2TIRA 3KTBA 3PGTA 2HSHA 2X64A 1PSQA 3IAM2 3FEUA 1E6BA 1URMA 2LSTA 3UAPA 4BWQA 3C7MA 3TJFA 4GSSA 2OE1A 5F06A 1SYRA 5EPFA 4JRRA 1SJZA 3CRTA 3VWXA 5IOWA 5CP1A 1TRSA 5JCGA 14GSA 1FAAA 3UL3A 5F07A 1PX7A 1XWBA 2FWFA 2FA8A 3HJMA 1TKDB 4Q5RA 2FCHA 1F3BA 1GWCA 4IP6A 4LL1B 4X43A 2DJ2A 1PD21 2MBTA 1V58A 3L78A 1OYJA 2GDRA 2I81A 4MZBA 2DJ1A 1VRSD 2N5BA 2TRXA 3WD6A 1O85A 4K1FA 4TOPA 3HD5A 2H01A 2LJKA 2LRTA 4IQ1A 5L71A 1ML6A 2DBCA 2DMLA 1XIYA 3UOMA 4YAPA 1OVNA 2O8VB 3HY2A 3QDNA 1N8JA 4F0BA 1V2AA 2HRNA 4POMA 2OE3A 3RHCA 4PQ1A 2LS5A 3HJPA 1JZRA 2C0FA 3P2AA 2DSAA 3GTUB 3M3MA 4WF4A 2FLSA 4K6XA 1H4OA 4OD7A 2P5RA 3IC4A 3L9UA 1OE8A 3EMPA 1GTBA 3APSA 3L9SA 3KD0A 5DQSA 3EWLA 3HJOA 2X8GA 1WIKA 4BPYA 1QMVA 2YNXA 4G10A 1KTEA 3MSZA 4P3YB 2C0GA 5ECRB 2B3SA 5KEJA 1YKCA 1ZGNA 3F8UA 3GKMA 5G5FA 4IHUA 4Q5FA 4ECCA 1Q4JA 13GSA 1X9SB 3KP9A 1AQXA 4ZBDA 1X5EA 3ME7A 2P5QA 2PBJA 2FWHA 5AIVA 2H6YA 2BMXA 4MLYA 5CRHA 5B8BA 1BX9A 3UEMA 5ECLB 5D9TA 2JSZA 1QK8A 3GX0A 4GF0A 1GSFA 22GSA 3GURA 2NBSA 1KBNA 5LCZA 1ERUA 4WBJA 2H8LA 6GSSA 4IKHA 5E59A 3ZMLA 2WGRA 2MMAA 2PVQA 1USBA 2VLVA 5ABRA 2YP6A 3KMNA 1SK0A 4IS0A 4IELA 5IMVA 2ON5A 3TCOA 2PPTA 2LRNA 1UVZA 3ERWA 1NHOA 5GSTA 3M8NA 3N9JA 1YZXA 4FYUA 4GRFA 1R5AA 5D8IA 2FUG2 4IBPA 2FD3A 5IM9A 3LWAA 2FY6A 3LYKA 4EL1A 6GSVA 3CRUA 1VF2A 2H66A 4GQCA 4N0VA 4LA1A 1EZKA 5IMZA 1XWCA 1YY7A 2VOCA 4XHMA 4I2UA 5A5KA 1A2MA 1ABAA 1M2AA 5DCHA 1PL2A 3ZVJA 2HSYA 1K0MA 2IMIA 5J4UA 5E4WA 1KEBA 5CRWA 1AAZA 2ZCTA 2H70A 1Z3EA 1SYXA 1YJ6A 1WPIA 2WZ9A 5DALB 3VWWA 1GRXA 12GSA 2LV3A 1LBKA 1CQHA 1PMTA 1WP0A 4Z7XA 1PRXA 4K8MA 2K18A 1GNWA 1PKZA 4JE1A 4ZB8A 5JWRB 3HXSA 4V2MA 2K8VA 3TKSA 1SL2B 3BD2A 3EU4A 4POLA 3KM6A 1ZCPA 4MJAA 3D21A 5COHA 1Q98A 4OCEA 1PKWA 3KXOA 5HR1A 1T00A 1HYUA 1TK5B 3GH6A 4EKZA 2RUEA 4YH2A 3V1WA 1FG4A 3GKKA 1G6WA 3TOUA 2R6KA 2PMTA 4Q5NA 4LMVA 4LL4B 4WF5A 2XBIA 5AN1A 1Z6NA 2LKUA 3HKRA 1VF1A 2A4VA 3GKXA 1TJDA 1MD3A 2XPDA 3RHBA 1R26A 4BA7A 2PERA 2JSYA 6GSWA 5JWOB 4TKYA 2X99A 2JZTA 4E8EA 2YPMA 4IP1A 1OKTA 5INYA 3G7JA 3LXTA 2G0FA 1EP7A 4F03A 2YJ7A 1K0OA 1QXHA 3GHAA 1XOAA 2O7KA 3G7YA 3KGKA 4EC0A 2YOIA 5CNWA 3FR9A 1NHYA 5C04A 2H1DA 2L5OA 3CSJA 3FK8A 2CV4A 3GN3A 4QL9A 1GTUA 4G2EA 4ZL8A 3PINA 1ZYQB 3D0ZA 3IHQA 6GSTA 5F0GA 4O32A 1ERWA 4PUFC 4I97A 1GTAA 5G30A 4TR1B 1O6JA 5EY6A 1F9MA 3KP8A 1KNGA 2GSRA 5JCWA 1HNBA 2MZCA 4PX1A 2J9HA 1SKSB 4XTSA 1XWKA 3GNJA 3TKQA 1THXA 2H6ZA 5J9CA 3H79A 4NPBA 1K0NA 3ISOA 3M9JA 4WXTA 1TDIA 3D22A 2ZNMA 4G9HA 1TRUA 2HE3A 5ENUA 1XVWA 2J23A 1M9AA 3E9JB 5A4UA 3IV4A 4IW9A 1JLVA 1XZOA 6GSUA 1JZDA 3GL3A 2L5LA 5CRGA 2VCQA 5G2ZA 4F9ZA 7GSSA 3F63A 4BWSA 2OBKA 5DQYA 3I6AA 4ZBAA 3DEXA 3CBUA 4L5OA 3CSIA 1JZWA 2DMMA 1PL1A 4DSSB 1X9MB 3VLNA 1AC1A 3WT1A 3IOSA 4OWYA 5D9XA 4GXZA 2FWEA 1TK8B 4EE0A 4MF5A 4ACSA 1LJRA 2DJKA 3H8QA 3K8NA 2RM6A 6GSYA 2M80A 3D6IA 1UN2A 3FHKA 2F3MA 4GLTA 3W8SA 1OC9A 3APOA 1Y6EA 5LD0A 3GSTA 1TI3A 5B6MA 4RI6A 1F2EA 3TKRA 2HYXA 3RDWA 4PGTA 4IJ3A 5IOXA 1O8XA 1FB0A 3MAKA 2V32A 2K6VA 5HFIA 2AAWA 3HA9A 4GTUA 2VLUA 2VL3A 4HU7A 3IR4A 2YZHA 2C3QA 4MPGA 2YWOA 3VWVA 4NHZA 2VUPA 5H5QA 4ML1A 5IMCA 1F37A 2IJYA 4GCIA 3EURA 1G7OA 2GZYA 3ED3A 2GQMA 3LFLA 4POBA 1A23A 5J41A 2WULA 3SWLA 2YANA 2XHFA 1B4PA 3O76A 4ID0A 1AQWA 4MJCA 1QQ2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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