4ZIJA

Crystal structure of e.coli dsba in complex with 2-(4-iodophenylsulfonamido) benzoic acid
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
188
structure length
188
Chain Sequence
AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Determination of ligand binding modes in weak protein-ligand complexes using sparse NMR data.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein DsbA
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Escherichia coli
total genus 65
structure length 188
sequence length 188
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4zijA00
4YQUA 2GZPA 3LQ7A 1TRSA 4CW9A 1DBYA 4QQ7A 5D73A 2LUSA 3IAS2 5JWRB 1PRXA 2MMAA 1XWKA 2C4JA 2WULA 3KMOA 1XFLA 1XVQA 3APOA 3WYWA 3UIWA 5IM9A 3CSIA 4I8BA 3HHVA 1VF2A 1IYIA 5E59A 5G30A 2CT6A 4IHUA 1WP0A 1JZOA 1VF3A 3LGCA 2R5GA 2OBIA 1ZMAA 2XPDA 1M2BA 3D21A 4FIWA 3C71A 3IOSA 2GVPA 1TW9A 3ZYWA 4ECIA 5B7CA 2IN3A 3LXZA 5E4WA 4F03A 2ZUPA 1URMA 4HI7A 4OO5A 2VO4A 4GSTA 4HJMA 5JWOB 4ZL7A 1S3AA 1K0NA 4F0CA 5CRGA 1OE8A 2H30A 1SJZA 2DIYA 6GSXA 3N9JA 2F3MA 4MZWA 2N5AA 18GSA 3CBUA 5ENUA 5EY6A 3LFLA 1SKWB 4BVXA 5IO2A 3Q18A 2V6OA 4H86A 3DD3A 4TXOB 1SKRB 4HDEA 4K7NA 4TXOA 5HR3A 2BJXA 2L4CA 1VGLA 1YDKA 4EC0A 5D9VA 2MMNA 3GN3A 1G6YA 1YZXA 5CNWA 4MH3A 4YAPA 1TI3A 3BCIA 4TN8A 5ECNB 2EIOA 4GXZA 1WWJA 3Q6OA 4EKZA 2KLXA 2GZYA 4XS6A 3M9KA 2X99A 3TKQA 4N0VA 4E8HA 3L9SA 3TCOA 2P0GA 2AB6A 1V2AA 2A2RA 2I81A 2FA8A 2K9FA 2FUG2 3QD9A 1K0CA 4ISDA 5IMCA 2FY6A 3H79A 4OD7A 2BMXA 1JHBA 4F2IA 4MPGA 4ZILA 5D8IA 2HRFA 3QFAC 3IA1A 5C00A 3LSZA 1PL1A 1R5PA 2VD1A 2MBTA 2YP6A 1BEDA 1GLPA 3D5JA 4NAXA 3UL3A 4GLTA 3E0UA 1PL2A 2KUCA 2DSAA 2LQQA 1B4QA 2IFQB 2YANA 4KDUA 3C7MA 3LG6A 3CTFA 3ME8A 1NHOA 2IFQA 1OAZA 2X8CA 5JCUA 1VF1A 1DE2A 2AHEA 4WR4A 3QR6A 1JZDA 2LJAA 1F3AA 4PNFA 4NV2A 1WJKA 2FWEA 3O6TA 5DJLA 5ECRB 4KDXA 4E8EA 1G0TA 1ZZYA 1Z7RA 2GGTA 5F06A 2PWJA 3F3QA 1YY7A 2YN1A 2DJ0A 4MCUA 5DCGA 4TXVA 1X9MB 5IMFA 12GSA 4RQRA 3DKSA 1MDKA 3TGZA 1GSFA 3QOUA 4LLRA 5ECMB 4F9ZA 5DAKB 1KNGA 4EDZA 2YCDA 17GSA 1K0DA 3GKKA 2C3QA 2AUVA 2L5LA 3TRXA 5ID2B 1EGOA 4K1FA 4V1Ag 1XBSA 3HXSA 1E2YA 2F8FA 2R37A 1XW6A 3DGQA 1ML6A 3L4NA 4OFNA 1MD3A 2HYXA 3GKXA 3P7XA 1R7HA 2IMDA 3KMNA 2X8HA 2R2JA 2NVLA 4L8EA 4N30A 1TK5B 5AIXA 1TU8A 1ZOFA 1BYEA 3GIXA 1A23A 3EWLA 4G2EA 2GT6A 4K2DA 1H75A 5D96A 3VWXA 1OC9B 1XOBA 1TK0B 1XW9A 4MDCA 2XHFA 1SENA 2AYTA 2VLTA 1SL1B 4BVYA 1J0FA 1R5AA 3A2WA 7GSSA 4TR1B 5KN3A 4TR3A 3TB2A 2B5YA 4KW6A 4ZBBA 4N11A 3FZ4A 1X9WB 3UVTA 3HJOA 1RW1A 1XPVA 4NMUA 4ML1A 2CAQA 3F4RA 2GLRA 4FYCA 2IMFA 2FNOA 1GUHA 5J41A 2DJKA 2BTOT 4HZ4A 3TKSC 1J08A 2MBSA 3GKMA 3ZVJD 5G31A 1R26A 16GSA 1FB0A 1YJ6A 3ERGA 2P5RA 1F3BA 4F0BA 2CVDA 5H5SA 4TKYA 5KN0A 4AJ8A 1O81A 3ZIJA 5CP1A 3FKFA 1M7TA 2AJQB 1AIUA 2L5OA 4OWYA 3VWVA 4IGJA 1B9YC 1T8EB 1O8XA 4QL9A 4O92A 1NHYA 2CX3A 4K0GA 1KTEA 3FYGA 5IOWA 2K8VA 2HXKA 3MWHA 2JACA 3DXBA 4HU7A 1GSDA 1X5DA 5G2ZA 4PX1A 4XIHA 4L5OA 5KN2A 3KCMA 1AUCA 3RAZA 1QXHA 8GSSA 2VCQA 3L9UA 3MNGA 2RM6A 1ST9A 5HFKA 3RHBA 4EF0A 3G9BA 2YWMA 1FG4A 1OVNA 9GSSA 2DIZA 1WMJA 2H8LA 4MJEA 1XXUA 3TUEA 2H1DA 3H8QA 2H6ZA 2PVQA 2HRNA 2LNSA 4K8MA 1PX7A 3GSTA 3GNJA 4BWSA 1ZYQB 3FZAA 2VCXA 4V2MA 4J56E 3ZRDA 1ABAA 4MK3A 1EEMA 2R4VA 3KM6A 5CRDA 4X1UA 1JLVA 2EIRA 3F8UA 4NV5A 4KDYA 3EU3A 2ES7A 4IELA 1PN9A 2VM1A 5ELAA 2IMEA 3A2XA 3N5OA 4J2FA 4MA9A 2F8AA 1U87A 1USBA 2O7KA 11GSA 3IAM2 3FW2A 1XWAA 1NW2A 5IMVA 2C80A 1XW5A 3QAVA 19GSA 1FAAA 2C3TA 5DBQA 3WT1A 1XCCA 2JL4A 4Q5RA 4RI7A 3ED3A 3VFIA 3ZL5A 3PH9A 1F2EA 1XWGA 4IP1A 1A0FA 4IQ1A 1TJDA 4OFTA 1FO5A 2B1KA 3ZIVA 4LL1B 3EE2A 3G7JA 4WEYA 1PX6A 3WGDA 4WBRD 3IPZA 4Q5QA 2YJHA 3C1RA 1Y25A 5A5KA 3FHKA 3D6IA 2CX4A 3GH6A 2WFCA 2OE1A 4KCAA 3VK9A 1EOHA 3NIVA 4EUYA 2PVOC 1EOGA 1T4ZA 3DMLA 2FGXA 1RQMA 2KOKA 4YH2A 4WETA 6GSTA 5DDLA 4K7IA 1T7PB 3ZMLA 4OFMA 5CRWA 1XIYA 5JCWA 4OMVA 2I4AA 1OKDA 4POKA 2H1AA 1O73A 1PMTA 1F6MC 4KAEA 1ZCPA 3HCZA 1ZGNA 1T1VA 3FR3A 5H5RA 3WT2A 4WF5A 1CQHA 5GSTA 3LWAA 3HZ4A 4EO3A 4ECBA 3FRCA 3KEBA 1GTIA 1YF1A 1K0MA 1M2DA 2H76A 4NHWA 1TRVA 5INYA 2C0DA 4L0WA 1ZL9A 1GSQA 2PN8A 4HQZA 2LS5A 2YNXA 3HZ8A 3IDVA 1SJ6A 4HUAA 1THOA 2GSTA 5GSSA 3FZ5A 1TK8B 1EP7A 3ISOA 4XTSA 5CRHA 2YOIA 3QFBC 2V2GA 2RUFA 2YJ7A 5COHA 1WIKA 1PA3A 3CSHA 2YZUA 5IIZA 1SYRA 4WR5A 3KH9A 1ERUA 4ULXA 4ID0A 2DJ1A 2H75A 4ZBDA 4RUVA 5DALB 1GSSA 5KEJA 3LYPA 1BJXA 4Q5FA 5DALA 4MABA 1H4OA 3TOUA 4V2LA 5ELGA 2AAWA 2WCIA 3BOAA 1VF4A 5FHIA 1B9XC 4MF6A 1EEJA 3HVSA 3O3TA 3E3EA 4JR4A 5CREA 2OBKA 3I6AA 5J9BA 3TKRA 1GTBA 5FT3A 1UA5A 4EXJA 1E6BA 1I5GA 3I69A 3MDKA 4WF4A 1A2JA 3C8EA 1TKDB 2J23A 2GZZA 2WDUA 3VLNA 5CYYA 2RLIA 1YKCA 3TJFA 1HQOA 1LJRA 3G7YA 2J9HA 3KTBA 2FLSA 3WD6A 4HU9A 2V6KA 2QC7A 5J3RA 2RIIA 4YQMA 3IC4A 3D0ZA 5AISA 1Z6NA 3HKRA 2VCZA 3TJJA 1QMVA 1ERTA 2H66A 4MZCA 1SD8A 2LJRA 3M8NA 4FH8A 1U3IA 4OCFA 3TRPA 3VI5A 2EC4A 2JU5A 1GL8A 4XHMA 4YQVA 2E2GA 3F6FA 3F3RA 1WE0A 1ON4A 1A8LA 3F4SA 3GFKA 4AF2A 10GSA 2YZHA 20GSA 1ACVA 3ME7A 2VCWA 2FA4A 5ECLB 1BG5A 2FWHA 3IBHA 2LNTA 5B8BA 1O85A 1GLQA 5ECSA 1TDIA 4PXOA 4GF0A 2LEGA 3GX8A 2C8UA 5ECPB 2H6XA 4V2NA 1R4WA 3KP8A 6GSSA 1PQNA 3H93A 1SU9A 5DAKA 2YV7A 2H0IA 1J9BA 3HYPA 2B7KA 1QUWA 4ZL8A 4NHZA 4PQIA 5ID2A 3J7Yb 4IVFA 1LU4A 2TRXA 5ECOB 2XBIA 1GNEA 1TOFA 3CRUA 2HLSA 3W6GA 4BL7A 2ON5A 5JCGA 3H4KA 3M0FA 3GHAA 2A4VA 4KA0A 2FHEA 3NZNA 1JLWA 3F0IA 4ZL9A 1OC8A 1NSWA 3A3TA 2KP1A 2DJ2A 2OE3A 1PGTA 3F6DA 1YEXA 2WZ9A 5CO3A 1OC9A 1Q4JA 1QFNA 1V58A 3AY8A 2ALBA 1TU7A 4K9ZA 4TR1A 2HSHA 4KSMA 3EURA 3UAPA 1ERVA 5GAPD 4LA1A 3HVXA 3ZREA 2C0EA 3IRAA 4WXTA 2MZCA 2VCTA 1K3OA 1GWCA 3KGKA 3IV4A 3RBTA 1GTUA 2YWNA 4LMVA 1XOAA 4ECJA 2CV4A 2XC2A 1MDJA 3PR8A 5FWGA 2QKEA 2F9SA 3DVWA 2VL2A 2M46A 5AGYA 2M72A 2VL9A 5IMAA 3EMPA 4PURA 3VPTA 3V1WA 2GQLA 1GP1A 2FWGA 3G7IA 4KH7A 1V40A 5F05A 2B5XA 4AJ7A 3UBKA 2CVBA 3IHQA 1GSEA 3M9JA 3CYNA 2YWIA 4MP4A 1AQXA 2JZTA 2HZFA 1FB6A 1SD9A 4JBBA 1FOVA 4JE1A 2PUKC 3APSA 1V57A 2LRCA 1XWBA 3MAKA 4AJ6A 2E7PA 1K0BA 3EMXA 2E0QA 5DJMA 3U6VA 2LKUA 5ECQB 1QQ2A 4PUAA 3DEXA 2V32A 1V98A 3NOFA 1U3AA 6GSVA 4Q5NA 3EYTA 1MDIA 5HFIA 5G5EA 3GTUB 3LEFA 2XPEA 3IR4A 3Q74A 2PU9C 1ILOA 2WJUA 3GTUA 4I97A 2CQ9A 1Z6MA 4WKWA 4RI6A 4KUNA 1XVWA 2V41A 4DSRA 2JZRA 3IE3A 1QK8A 1AXDA 1YEPA 2I3YA 3D4TA 2PGTA 2DJJA 4NPBA 5J5NA 1YQ1A 4KSOA 1W89A 2O87A 4MJCA 5GZZB 1O8WA 1GULA 1A0RP 4K7OA 2R3XA 2IL3A 2ON7A 1KBNA 4MJBA 3CSJA 4QL7A 1FW1A 3FY7A 3QMXA 3ZFLA 3CRTA 5IMZA 1PSQA 3KTLA 1Q98A 4D73B 5B6MA 5HR0A 4POLA 4P3YB 2IIYA 2L57A 1OC3A 2LQOA 5C04A 4MPFA 5D93A 3RPPA 4IN0A 4TR4A 1JZRA 1X5CA 4TR0A 1VRSD 1WRYA 1JFUA 4F82A 2F51A 3LXTA 3GL5A 4IP6A 3GA4A 4DVCA 5ECIB 4IJIA 3KZQA 2H70A 2H0GA 4TW5A 1TP9A 4LL4B 3M3MA 3HJMA 4KGIA 3O76A 5J9CA 1AQWA 4ECCA 3P90A 2VL2C 6GSUA 1OE7A 5CAXA 1EP8A 4OO4A 3GSSA 1V9WA 5L71A 4L5LA 3GRXA 5LNKe 2ZNMA 1GTAA 4V1Ap 1KEBA 1AQVA 2V1MA 3KIJA 2PPTA 4G9HA 2X8GA 4K6XA 1BX9A 5G5FA 5B6NA 4MLYA 2JZSA 3GL3A 3QDNA 1EZKA 3ZFBA 5DQSA 3HD5A 2VIMA 1OYJA 3CMIA 4XCSA 2L6DA 3ZLPA 4KE3A 2K6VA 1A2LA 1SYXA 4XRAA 4J57E 1EV9A 2RUEA 3GH9A 1K3YA 5F8BA 1K0AA 2YPMA 4ZB6A 4FO5A 2GQMA 3ZVJA 3DRNA 2OA7A 2GSRA 2B5EA 4BWQA 1TTZA 4I6XA 4CHSA 1BQ7A 4Z7XA 3GV1A 1T3BA 2B7JA 2DC5A 1PD21 1OKTA 2QGVA 5LCZA 3UOMA 2FCHA 1SK1A 1W4VA 2WS2A 1TRUA 3K8NA 4WBJA 1LBKA 2DJ3A 5ECKB 4XS1A 1N2AA 1G7OA 5HR1A 5EVOA 4POMA 3FK8A 3TJKA 3W8JA 2GS3A 3UBLA 2YV9A 4MH2A 5G1KA 1HD2A 4I2UA 5H5QA 1TI1A 4JZQA 2WB9A 2O85A 4IJ3A 1AW9A 2VOCA 3P2AA 3EC3A 2G0FA 3HVVA 2LRNA 1NM3A 5KN1A 4DSQA 5GAND 5D9XA 1XWCA 2HI7A 4HEA2 4MMMA 1Z3EA 2GDRA 1FVKA 5IPHA 5HQPA 5DQYA 4TVEA 3GURA 2DBCA 2L4QA 3ZMKA 1T4YA 3EU4A 5DVBA 1WOUA 1B48A 3TKPA 1X5EA 4YAVA 6GSYA 3S9FA 3BJ5A 6GSWA 2D2ZA 3QAWA 3U5RE 1AAZA 2E2MA 3A5WA 22GSA 1SK0A 1GH2A 4ZXGA 4O5RA 2EIQA 2IJYA 4FYUA 2A2SA 2CAIA 3R2QA 3UVHA 1AC1A 1X0RA 1X9SB 5A4WA 5AIVA 1SJIA 2JADA 3KD0A 13GSA 1M9BA 1U6TA 4HS1A 4ZB8A 1A2MA 3TKSA 2REMA 3UJ1A 5A4UA 2MMZA 1TRWA 3D22A 4HJ2A 3M1GA 5LD0A 3RPNA 1EV4A 3VURA 1MTCA 3KXOA 3FZ9A 2OADA 3DVXA 4ML6A 5G1LA 2H71A 2HSYA 3SBCA 2MMOA 1Z9HA 2P5QA 5JWQB 3L9VA 4L0UA 1PKZA 4MJAA 2DLXA 3HA9A 2DMLA 4KCEA 2CA8A 2K8SA 3L0HA 3US3A 2GQKA 3VPQA 1Z5YE 1Y6EA 4GRFA 1THXA 5HFGA 2KP2A 1MD4A 4HQSA 2C0GA 2H6YA 3FR6A 5A4VA 2FD3A 2IMKA 3MSZA 3Q19A 1G7EA 1SK2A 1O7UA 4GSNA 1I9DA 2XBQA 4ZB9A 2OACA 5AN1A 2TRCP 5IOXA 4OCEA 2VM2A 3OR5A 2O89A 4N0ZA 1HNAA 3TDGA 4BPYA 4EVMA 4KNDA 2C3NA 4JU5A 1ZYEA 1C72A 2K18A 3IXRA 1UC7A 3J7Yk 3WGEA 3BBYA 1B8XA 2IPAA 1YKAA 3F63A 3CXGA 4IKHA 2VD0A 4G19A 2X64A 1K0OA 4PQ1A 2H72A 2NBSA 2WRTA 3DIEA 2PBJA 1HNBA 1RK4A 4JEDA 2B6MA 4O32A 1SL2B 2HT9A 5EL8A 5HR2A 5IQYA 4PUFC 1T00A 1M99A 4ILFA 1EWXA 3UEMA 3TRQA 4ZIJA 4DSSB 2Z9SA 1SL0B 2OE0A 2HNLA 3LJRA 5J4UA 2M80A 3KJYA 4DSSA 4N10A 4RQXA 14GSA 2VAFA 1YF0A 2VCVA 1WPIA 1N8JA 4PGTA 2DMMA 3EINA 2LJKA 1GUKA 1Z7PA 2NPBA 4GWRA 2LTKA 2L6CA 4EL1A 3KP9A 4POBA 1PKWA 2O8VB 1M2AA 2I1UA 3LORA 4HOJA 3GYKA 3A2VA 1GUMA 2HFDA 4KX4A 3GMFA 3GKNA 4ZBAA 1GNWA 3BCKA 1S3DA 4NWYA 4O7HA 4I2TA 2JSYA 1A8YA 1DSBA 2H1GA 4AGSA 1HYUA 1A24A 1IYHA 2OJLA 4LMWA 4ACSA 4TOPA 1HNCA 3HY2A 2HE3A 4HZ2A 4PNGA 2QSIA 3TJGA 1S3CA 5IMDA 2H01A 1SKSB 1JZWA 3E9JB 4GTUA 2AV4A 2IMIA 1ERWA 3FR9A 4X43A 3PGTA 4I5QA 4MF5A 2VUPA 3KH7A 4X0XA 3HJPA 4BA7A 3C73A 3ZTLA 3UMAA 3GUSA 4MF7A 2PERA 2CZ3A 3ZITA 2H0HA 2VLVA 1UN2A 3GX0A 4DEJA 3TJBA 3F4TA 2RM5A 4K0NA 5EPFA 2LRTA 5DCHA 2ZCTA 1M0UA 2LSTA 2H74A 3L78A 4GCIA 1GSUA 2N5BA 2P31A 5IPGA 3H1NA 2H73A 3JCML 1DE1A 1G6WA 3ERFA 4EE0A 1CQGA 1UVZA 1U88A 1EGRA 4IS0A 5D9WA 1O6JA 5D9TA 1B4PA 2PMTA 2C0FA 3WGXA 3RDWA 2L59A 3TKSE 3QCPA 2KHPA 3APQA 2CVKA 3IK9A 4FYBA 3UARA 4MZBA 2JSZA 2NDOA 1K3LA 3LYKA 3I43A 2IWTA 2VLUA 5F0GA 3FEUA 3HDCA 3CTGA 2GT5A 4IBPA 3DWVA 2H1BA 3W8SA 3VWWA 5F07A 3VWUA 3BD2A 3PINA 1F37A 2OKAA 3QAGA 3TOTA 1FVJA 1GRXA 2HZEB 3D4MA 4GQCA 2LV3A 3VI7A 2WGRA 2N5FA 2TIRA 4IW9A 4JRRA 2HZEA 3EVIA 2NTOA 3P8WA 4D73A 1BAYA 5ABRA 1QGVA 2I9HA 2B1LA 2H19A 2CZ2A 3SWLA 3ZZXA 4GSSA 4JR6A 1M9AA 4XS4B 2MYGA 1GSYA 2GSQA 3F9UA 4XS4A 4PQHA 2B3SA 3DYRA 4GQFA 3RHCA 2GSSA 3IK7A 1XZOA 2R6KA 4G10A 4XRDA 4KB3A 4NXIA 2GTUA 2YWOA 4CDOA 1DUGA 2C1YA 4IQAA 5B8AA 4EDYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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