4ZILA

Crystal structure of rv2466c and oxidoreductase from mycobacterium tuberculosis in its reduced state
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
sequence length
213
structure length
210
Chain Sequence
KSVADFWFDPLCPWCWITSRWILEVAKVRDIEVNFHVMSLAILNENRDDLPEQYREGMARAWGPVRVAIAAEQAHGAKVLDPLYTAMGNRIHNQGNHELDEVITQSLADAGLPAELAKAATSDAYDNALRKSHHAGMDAVVGTPTIHVNGVAFFGPVLSKIPRGEEAGKLWDASVTFASYPHFFELKRTRTEPPQFDKLAAALEHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Redox State Regulates the Conformation of Rv2466c to Activate the Antitubercular Prodrug TP053.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DSBA oxidoreductase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mycobacterium tuberculosis (h37rv)
total genus 72
structure length 210
sequence length 213
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4zilA00
2L59A 3D0ZA 3Q18A 1M7TA 2JADA 5AISA 5G30A 2V1MA 2I81A 1M2BA 4PQ1A 1GUMA 4I5QA 4GLTA 3LXTA 4NMUA 2JSZA 4K7IA 1TXXA 3J7Yb 2AAWA 6GSUA 1BJXA 2PVOC 4GF0A 5FHIA 3P90A 4JE1A 2QGVA 18GSA 1ZGNA 5IMFA 2AHEA 3KIJA 4DSQA 4O5RA 2H19A 1N2AA 1U87A 2F9SA 2DC5A 4TXOA 4POBA 1SKRB 5EL8A 4WBRD 1R7HA 1MD3A 6GSWA 3E9JB 5J41A 1GRXA 2YJHA 4ZBDA 2N5FA 1VRSD 3BOAA 5HR2A 2VIMA 4KCAA 1K0DA 3KD0A 4V2NA 5HR3A 5GZZB 6GSSA 2O87A 3C8EA 3ME8A 4ECBA 3IK9A 1SYXA 4WETA 3GTUA 5HFIA 3TKSC 2LJKA 3IPZA 3NOFA 1ZYQB 2DIYA 4KSOA 4LLRA 4EXJA 2AB6A 3A3TA 2YWNA 1QFNA 3FK8A 3M9JA 4OFTA 2OACA 3ZIJA 1X9MB 1M2DA 4YQUA 1Z7RA 5GAND 3KXOA 1XOBA 1XWAA 3ERWA 1G6YA 2DBCA 3I69A 3MAKA 3Q6OA 3LG6A 2XPEA 4ISDA 4IN0A 1QQ2A 3GH9A 2H76A 5GSTA 1EEJA 1SJZA 2AYTA 1TW9A 1RW1A 2B7JA 5DCHA 4DSSB 3KTBA 2PUKC 5A5KA 2FWGA 3DGQA 2K8SA 1EP7A 1QMVA 2TIRA 2X64A 2KLXA 5HFGA 3N9JA 2PBJA 2WZ9A 2RM5A 3EURA 2H74A 4HZ4A 3WYWA 4PNGA 1XVWA 5HFKA 4BPYA 1B4PA 1LU4A 3V1WA 1O6JA 4LA1A 1AQVA 1A2JA 3GHAA 3A2XA 2WS2A 1GSEA 3E3EA 4OFMA 4MZCA 2FA4A 2MBTA 2L6CA 3C7MA 3EINA 4MZWA 4JRRA 1OE8A 2NVLA 3CSHA 3IBHA 4XS4B 1SD8A 2GQKA 3EVIA 3LFLA 5F06A 2V6OA 2MMAA 4RUVA 3I6AA 2VAFA 2YZHA 1EV9A 4PX1A 5KN1A 1XOAA 4WR4A 2DIZA 5JCUA 3HYPA 3P8WA 5H5SA 3TKSE 1J08A 3UEMA 2HZEA 4LL4B 4TW5A 1JZRA 3KMOA 4L5LA 3F4SA 1V9WA 3LXZA 5IMVA 2C3NA 3HVXA 1OC9A 2B5XA 4F0BA 4P3YB 3GSSA 3EU4A 1V2AA 4TR1B 2H73A 1FAAA 3KP9A 4I6XA 5ID2B 4MLYA 3VK9A 2JZTA 3GKKA 2WGRA 1PD21 3TKPA 2FUG2 1K3OA 4ECIA 4K6XA 1K0NA 1PX7A 2J9HA 3GURA 3HHVA 1XWGA 2VCXA 3D4MA 1WP0A 3RBTA 5CRDA 4CHSA 1ZL9A 1XZOA 2WB9A 3TJBA 5LCZA 2K18A 5AIVA 2H6ZA 5HR0A 2CV4A 3F9UA 5IO2A 1X5CA 2FA8A 1K0CA 1MDJA 2R37A 5DBQA 3C1SA 3TOTA 5DVBA 4PUAA 4Q5QA 1MTCA 3QAWA 4K0NA 5J4UA 2VLVA 1EWXA 5ECQB 4WF4A 4IP1A 1WWJA 2GQLA 3RPPA 4WR5A 3C71A 4EDZA 4K2DA 2FGXA 2L5OA 1TRSA 1S3DA 1O8XA 1HNAA 2M46A 4TOPA 3KP8A 3M9KA 4D73A 4MF6A 2VCTA 2O8VB 4G19A 1GLQA 4LMVA 2C3TA 2MMNA 3GSTA 2IN3A 2IWTA 2RLIA 4J2FA 2X8GA 1OKDA 4XRAA 2LS5A 2EIRA 3ZIVA 4N0VA 1WJKA 3M8NA 3GKNA 4I2TA 5A4VA 5DAKA 2F8FA 4WKWA 2N5BA 4POMA 3NIVA 19GSA 2H01A 4HJ2A 3APOA 3PGTA 3RHBA 3QCPA 1AC1A 3CRUA 5GSSA 1K3YA 1OYJA 3IAS2 4TXOB 1F3AA 5CO3A 4K7NA 1YDKA 1QUWA 4Z7XA 4L0UA 3SBCA 4MJBA 3O3TA 4MJEA 5CP1A 3JCML 1A2MA 1I5GA 3F4TA 1YF0A 2G2QA 1B48A 4PURA 3GTUB 3ZMLA 2YN1A 3E0UA 4NV2A 5D8IA 1KNGA 2OBKA 3DD3A 1GUKA 1GULA 2H1GA 3HY2A 4F82A 2OKAA 2IFQB 2L4CA 3UBLA 3DKSA 3P2AA 4N10A 1RQMA 1SKWB 2VD0A 3VPQA 3UBKA 1PKWA 2MBSA 4CW9A 1YEPA 1PN9A 3M0FA 1A8LA 1OKTA 4IQAA 2DMLA 1M0UA 1QXHA 5AN1A 4G9HA 3LGCA 3ZFLA 3MDKA 4MA9A 2LQOA 4MPGA 2VL9A 4IKHA 2IMDA 1EGOA 2H8LA 3MWHA 2K9FA 4HQSA 1VF4A 4IGJA 1ML6A 4FH8A 2OE1A 3HVVA 4NAXA 2HZFA 1J0FA 6GSVA 1GH2A 1YZXA 3O6TA 4EO3A 5ECSA 2LKUA 2P0GA 4MJCA 1VF3A 2XHFA 3KMNA 1TKDB 2VCQA 1GSYA 2QSIA 3HVSA 4HOJA 3ERFA 4X0XA 5G1KA 1ST9A 4QQ7A 4NXIA 3TGZA 2LRTA 3H1NA 2NDOA 2YCDA 5IIZA 1Y25A 1DSBA 2M72A 3HZ4A 3FR3A 3GUSA 2B7KA 3BBYA 3GN3A 2I3YA 3GKMA 4KH7A 3IHQA 1WPIA 1HQOA 2ON5A 2NPBA 1GL8A 4EC0A 2XBIA 4ECJA 1YEXA 1PA3A 2C0DA 3DEXA 1JZWA 3UVHA 3H79A 3TJJA 2LNTA 2R5GA 4Q5FA 3VPTA 1TJDA 1OVNA 3IXRA 2YWOA 2YV9A 5DQYA 3HA9A 4TVEA 1GSQA 1EP8A 4FO5A 4PNFA 3ZMKA 3CSJA 4ZXGA 2V32A 2H72A 1T4ZA 3VWWA 1YQ1A 1E6BA 5J5NA 4L8EA 3F63A 1ZOFA 3KGKA 4H86A 1OC9B 3FZ9A 3QD9A 3GL5A 2FHEA 2YPMA 5D9TA 2CZ3A 1XIYA 1K0AA 2PVQA 1X5EA 3D6IA 2YV7A 3VLNA 1NSWA 1MEKA 3GYKA 3L4NA 4MZBA 4HZ2A 4GSTA 1B4QA 2X8CA 5IMZA 5JWOB 4AJ7A 3CRTA 4EKZA 3QOUA 3IA1A 5INYA 3F6FA 3G7JA 1AQWA 1B9YC 1K0BA 1TU7A 4IBPA 2QKEA 4KDXA 1T00A 3W8SA 4X43A 5IMDA 2OE0A 1AQXA 2KOKA 4WXTA 3FEUA 3MSZA 4ULXA 4PXOA 5IOWA 2IPAA 3UMAA 2I1UA 4IW9A 4RI7A 2VLUA 4FIWA 2XBQA 2LRNA 1GUHA 1BX9A 2XPDA 4JEDA 2J23A 5DCGA 1K0OA 2YZUA 3ZL5A 2YP6A 2PGTA 1ILOA 5G31A 2VM1A 20GSA 1V98A 1X5DA 2CVDA 4GSSA 5F07A 4MCUA 1FB6A 2HLSA 2OA7A 2ZUPA 4OO4A 5D9XA 2HRFA 2H1DA 2V6KA 4D73B 1YKCA 1IYIA 1HYUA 1M9BA 1U3AA 2VCVA 5E59A 3C73A 5COHA 1W4VA 4DSRA 5F8BA 1T3BA 1YJ6A 1S3CA 4L0WA 4LMWA 3RHCA 2N5AA 1SYRA 2IMFA 3ED3A 5CRWA 3GNJA 2X99A 2BTOT 4MMMA 6GSXA 1Z3EA 3H4KA 2WDUA 2C3QA 1Q4JA 1EOHA 1SJ6A 2GT6A 2MMOA 1GWCA 5G5FA 4LL1B 3FZ4A 4JR6A 4Q5NA 4POLA 1SD9A 4MPFA 1XPVA 1J9BA 4NHZA 2VOCA 4EUYA 3HD5A 4K8MA 3W8JA 1VF1A 1GLPA 1U6TA 4EDYA 3KCMA 1R5AA 1JFUA 3CSIA 2YWMA 4Q5RA 5JWRB 3HDCA 4RI6A 5J9BA 5IOXA 2C4JA 2P5RA 11GSA 1XFLA 3LORA 5IPHA 3ZREA 4OO5A 1M9AA 1B8XA 5B8BA 1PSQA 2H1AA 1I9DA 5F0GA 1Z6MA 4QL7A 3ZYWA 1SK0A 3HKRA 1PL2A 4GQFA 1NM3A 1OE7A 1FB0A 2GZPA 2RM6A 2VL2A 4IS0A 1GTIA 2L5LA 1PKZA 5H5QA 1FOVA 1T4YA 5D9VA 5A4UA 3KH9A 4KSMA 1XWKA 1T1VA 2WJUA 4PUFC 5D96A 1F2EA 4J56E 4N11A 5KN3A 3GFKA 3BD2A 3TRQA 5DALB 2LJAA 1Z5YE 3ME7A 1TI3A 4OCEA 4HJMA 4MJAA 3QMXA 2C8UA 3A2WA 4YH2A 2GS3A 4AF2A 2O89A 4ZIJA 4GRFA 2GT5A 1U88A 3TUEA 4PGTA 1PGTA 1MDKA 1THOA 4OWYA 2I9HA 2RUFA 1WRYA 2CQ9A 3LQ7A 4DEJA 1TRVA 4ZB6A 3CMIA 4HEA2 3M3MA 1SK2A 2GTUA 1X9SB 4IJ3A 3GX0A 1TK5B 2K6VA 5D93A 1R26A 1WIKA 3W6GA 4AJ8A 2PWJA 2P5QA 2MMZA 4NV5A 4XTSA 4IELA 1AIUA 4RQXA 1AW9A 1NHOA 2G0FA 2HFDA 4HUAA 4HU9A 3WGEA 5CAXA 17GSA 2RIIA 4MABA 3U6VA 3TDGA 3MNGA 2GVPA 3CTFA 3US3A 5KN0A 5IPGA 4KAEA 2HE3A 5JCGA 4KDUA 3G9BA 5EVOA 16GSA 1SKSB 1TDIA 2X8HA 1F6MC 2E2GA 1RK4A 3L9VA 4BL7A 2HRNA 3IR4A 3UJ1A 2TRXA 1UA5A 1A0RP 4KNDA 2WFCA 3F3RA 1O85A 4IJIA 2R6KA 1ERUA 4O32A 4BVYA 1FG4A 3FHKA 3RAZA 4HDEA 4G10A 2EIOA 3TB2A 1SENA 2OE3A 2VD1A 4BVXA 1F37A 3QDNA 3DVWA 5DQSA 3ZITA 3KJYA 4FYCA 4XS1A 3LEFA 4XRDA 1JZDA 5LD0A 2XC2A 1TRWA 2FWHA 1TOFA 2HI7A 4MF7A 4ZBAA 3QPMA 2B5YA 1ABAA 4IVFA 1A0FA 1ERVA 2CVBA 4ZL8A 3EE2A 2FLSA 4JR4A 5ELAA 1JHBA 1S3AA 3LYKA 2KP1A 2L6DA 4BWSA 2IMEA 3GKXA 1USBA 1QGVA 4V1Ap 5JWQB 1XBSA 2OJLA 1M2AA 5ABRA 1K0MA 5H5RA 2GLRA 4PQIA 2KUCA 1BYEA 1HNBA 3FYGA 3UAPA 4XS4A 3LJRA 3A2VA 1XXUA 1GSUA 1HD2A 2LV3A 2GQMA 4V1Ag 3H8QA 2E0QA 3HCZA 1DUGA 2QC7A 4WBJA 2IL3A 3IC4A 4GXZA 4GSNA 2IMIA 5CRHA 2CA8A 2DJ3A 5B8AA 4KW6A 1EZKA 3DVXA 4XS6A 2CT6A 3GL3A 1GSDA 2AV4A 3ZRDA 3FY7A 4J57E 4OMVA 2ALBA 1BEDA 2WRTA 2O85A 2AJQB 1UVZA 3IAM2 4MP4A 1E2YA 1GTAA 1AXDA 3HZ8A 4ECCA 1SK1A 1OAZA 3QAGA 3F4RA 12GSA 1EGRA 1GNEA 1G0TA 1O8WA 2H75A 5KEJA 1PMTA 2GSQA 2YJ7A 2GZZA 2HYXA 1DE2A 3PINA 3IE3A 1XWBA 3KTLA 3Q74A 3BCKA 4IP6A 3TJGA 1V57A 1YY7A 3IDVA 5FT3A 3PR8A 3ERGA 13GSA 4KGIA 1R5PA 3CXGA 3U5RE 2FY6A 5CNWA 3UVTA 3AY8A 2VLTA 4F03A 4YAPA 1EOGA 4YQVA 4TXVA 3QAVA 2HZEB 1LJRA 3IV4A 5HR1A 3HJPA 4K9ZA 2LNSA 4K7OA 2BMXA 4GTUA 3EYTA 5DJLA 2H66A 4G2EA 1MDIA 2EC4A 3KM6A 4YAVA 2C0EA 2WCIA 5EY6A 2LTKA 2NBSA 8GSSA 3TKRA 5G5EA 1QK8A 5DDLA 3DRNA 1K3LA 3TOUA 1SU9A 3F8UA 1G7EA 4EL1A 5IM9A 3I43A 4POKA 1FVJA 5AGYA 3ZVJD 3ISOA 2C1YA 4ILFA 2YOIA 3FW2A 3OR5A 5ELGA 1KEBA 3VWXA 5ECOB 3UARA 4MK3A 4WF5A 4BWQA 5B6NA 1GSSA 4KUNA 1OC3A 2LRCA 4K0GA 2WULA 3QFAC 2F51A 1U3IA 4F2IA 3VURA 3TJKA 2L4QA 2GGTA 5A4WA 4MH2A 2B6MA 3ZTLA 2JSYA 3LSZA 2OADA 1B9XC 1XW9A 5DJMA 1GTUA 2C0GA 3FR6A 1O73A 4L5OA 1IYHA 4TR0A 5E4WA 3WT1A 3FZAA 2IFQA 1R4WA 2V41A 5ECIB 3GMFA 2KHPA 1KBNA 4QL9A 5G2ZA 3UOMA 5ECLB 4XHMA 1PQNA 2B3SA 2VUPA 3GV1A 1SL0B 4ZL9A 5DAKB 5CRGA 1SL2B 4KX4A 1TK0B 3GH6A 2I4AA 2C0FA 2CZ2A 2M80A 2DMMA 3LWAA 2IMKA 4ML6A 4ZBBA 3ZZXA 2O7KA 2KP2A 2YNXA 4XIHA 3RDWA 4DVCA 3KZQA 2AUVA 4JZQA 3CYNA 1O81A 1A8YA 3GRXA 4HQZA 4IQ1A 1ERTA 3J7Yk 2A2RA 1V58A 1XWCA 2HXKA 2B1KA 2F8AA 3UIWA 3TJFA 1DE1A 3L78A 3S9FA 5AIXA 3D22A 2ZCTA 1JLWA 3EWLA 2BJXA 3VI7A 2MZCA 1PX6A 1VGLA 4MH3A 1LBKA 4F0CA 3EC3A 3R2QA 2DJ2A 2DSAA 1WOUA 2H6YA 1Z6NA 3P7XA 2OBIA 1VF2A 2B5EA 4MDCA 4ZILA 3GX8A 2JZSA 4EF0A 1XW6A 2VM2A 1KTEA 2CX3A 1V40A 1TTZA 2C80A 5F05A 2RUEA 2LEGA 3TKQA 4OD7A 3CTGA 3K8NA 2ES7A 5KN2A 1BAYA 3FKFA 2YANA 4I8BA 1WE0A 1UN2A 3EU3A 3D4TA 1SL1B 1FO5A 1M99A 3TRPA 1T7PB 2DJ0A 2REMA 2R2JA 4GQCA 4GWRA 4NWYA 5D73A 2L57A 2FWFA 4E8EA 1TRUA 1G6WA 5J9CA 4CDOA 1OC8A 1W89A 4V2MA 3HJOA 2E7PA 2CAIA 1Z7PA 2HSHA 4O92A 4N0ZA 5JCWA 5IMAA 2H6XA 1F3BA 1F9MA 14GSA 2LUSA 2A2SA 1THXA 2DLXA 1GNWA 1AAZA 4TKYA 1JZOA 2R4VA 3PH9A 4KB3A 3DWVA 2VL2C 3UL3A 1ZYEA 3VFIA 4JU5A 2TRCP 3A5WA 1ZMAA 1EEMA 3ZVJA 4ZL7A 2DJKA 2H0GA 3G7IA 5ECNB 2Z9SA 5ECMB 1MD4A 4FYUA 2CAQA 4O7HA 4NHWA 5ECHB 4V2LA 2VL3A 5IQYA 1A2LA 3O76A 2CX4A 2H70A 3L9SA 3WGDA 1YKAA 3RPNA 1DBYA 2LSTA 3KEBA 3WD6A 4N30A 5ENUA 1NW2A 4KCEA 2LJRA 3TCOA 2DJ1A 3IOSA 2H30A 4OFNA 2LQQA 4ACSA 1Y6EA 3F0IA 3DIEA 1XVQA 2IIYA 4TN8A 3F6DA 4F9ZA 4XCSA 4EE0A 2GZYA 2V2GA 4I97A 6GSTA 1FVKA 3IK7A 1EV4A 1O7UA 2PU9C 1GP1A 5G1LA 1Z9HA 5D9WA 6GSYA 1T8EB 3BCIA 3TRXA 4I2UA 3APQA 4DSSA 2JACA 2GSSA 3G7YA 2FD3A 2H71A 2VO4A 4FYBA 4TR4A 5ECRB 5EPFA 1ON4A 4ML1A 2PMTA 1H75A 2FNOA 2GDRA 2YWIA 2F3MA 1TU8A 5GAPD 4K1FA 1AUCA 4JBBA 1Q98A 5J3RA 1H4OA 3VWUA 2K8VA 2VCWA 5L71A 3NZNA 3WT2A 7GSSA 1TI1A 1TK8B 4OCFA 5ECKB 2JU5A 3FZ5A 3DYRA 3SWLA 3L0HA 2ZNMA 1X9WB 1FW1A 2FWEA 2JL4A 1GSFA 2H0HA 10GSA 4AJ6A 1PL1A 5B7CA 1UC7A 3I9V2 1GTBA 3QFBC 3LYPA 4AGSA 2NTOA 3IRAA 4KE3A 3FR9A 3DMLA 4MF5A 2ON7A 2IJYA 3ZLPA 1ZCPA 1SJIA 2HSYA 3L9UA 3VI5A 1CQGA 3H93A 4TR1A 2HT9A 4NPBA 4BA7A 5B6MA 2PN8A 4ZB9A 2PPTA 3HXSA 5DALA 1G7OA 4RQRA 5ID2A 1XCCA 4ID0A 1A23A 3EMPA 2HNLA 3KH7A 2A4VA 2P31A 2GSRA 9GSSA 4HI7A 4GCIA 4IHUA 2H1BA 3HJMA 3Q19A 2VCZA 2D2ZA 4TR3A 5IMCA 4E8HA 1HNCA 1WMJA 3GIXA 1A24A 2JZRA 1XW5A 3VWVA 3D5JA 4X1UA 1PRXA 4PQHA 1NHYA 1JLVA 4KA0A 4TRXA 1BQ7A 2MYGA 2B1LA 3D21A 3ZFBA 1X0RA 2R3XA 3M1GA 1CQHA 4HS1A 4EVMA 4HU7A 3WGXA 2FCHA 1TP9A 2EIQA 2DJJA 3GA4A 3F3QA 5LNKe 3QR6A 5CREA 1ERWA 4YQMA 5C00A 3TKSA 2GSTA 2CVKA 3EMXA 3CBUA 5C04A 2PERA 1N8JA 2E2MA 1C72A 1ACVA 3FRCA 2H0IA 4ZB8A 3DXBA 3BJ5A 1FHEA 5HQPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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