4ZILA

Crystal structure of rv2466c and oxidoreductase from mycobacterium tuberculosis in its reduced state
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
sequence length
213
structure length
210
Chain Sequence
KSVADFWFDPLCPWCWITSRWILEVAKVRDIEVNFHVMSLAILNENRDDLPEQYREGMARAWGPVRVAIAAEQAHGAKVLDPLYTAMGNRIHNQGNHELDEVITQSLADAGLPAELAKAATSDAYDNALRKSHHAGMDAVVGTPTIHVNGVAFFGPVLSKIPRGEEAGKLWDASVTFASYPHFFELKRTRTEPPQFDKLAAALEHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Redox State Regulates the Conformation of Rv2466c to Activate the Antitubercular Prodrug TP053.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DSBA oxidoreductase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mycobacterium tuberculosis (h37rv)
total genus 72
structure length 210
sequence length 213
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4zilA00
1B8XA 3M8NA 3ME7A 3MNGA 2HFDA 1J9BA 3UIWA 1TRWA 1UN2A 3RBTA 4ZBDA 5ECSA 1NSWA 4I6XA 1F37A 1K3OA 2HYXA 2JADA 5CRDA 2B5YA 4TRXA 1W4VA 1FOVA 4TR1A 3QFAC 1GSFA 2WFCA 2QKEA 2H66A 5GSSA 3M9KA 3UVTA 3IAM2 4XS4A 1TRVA 5D8IA 1TOFA 3VK9A 2H8LA 1QK8A 1M99A 4K2DA 4MK3A 2MYGA 2OJLA 1DBYA 1SK2A 5IOWA 3CRTA 1HD2A 1NHOA 3ERFA 4GCIA 2GSQA 1OE8A 1XWKA 4K8MA 4TKYA 1GNEA 1SK1A 1JZRA 1Z9HA 1UC7A 2DMLA 1ZMAA 2LRNA 4ZB6A 2JACA 3CBUA 4NHZA 1EGRA 2K9FA 3Q74A 1QXHA 2MZCA 5B6MA 2GS3A 4LL1B 1GH2A 4G9HA 3V1WA 5HFGA 2L4CA 4KCAA 4DSRA 1GUHA 4HU7A 4HJ2A 1TRUA 5DVBA 2LQQA 1M2DA 3C73A 3TUEA 3M9JA 1Z3EA 2P31A 5ECKB 2RIIA 1K0AA 3L0HA 3ZMLA 4K1FA 1SL2B 4HOJA 4IBPA 2XHFA 5EPFA 3GURA 4K7OA 4IP6A 4OO4A 3FZ5A 4JU5A 1XVQA 3F4TA 1YQ1A 2IMFA 12GSA 2CZ3A 5F0GA 2I9HA 2DJ1A 4AJ8A 2VM2A 4PNGA 1U3IA 3D6IA 2JSZA 4JEDA 3FY7A 3KTBA 4MZBA 5HR3A 1XWAA 3CSIA 5D73A 4MF5A 3VFIA 1YDKA 4OWYA 2H6XA 2G2QA 1XW9A 3H8QA 5IPGA 4TN8A 3TJKA 1SYRA 4MJAA 4KCEA 2E7PA 2KLXA 5ELGA 1UVZA 5J5NA 2X8CA 4WBJA 4YQVA 3VWUA 1DSBA 2H71A 4BVYA 2K8SA 4HQSA 1VRSD 2YWNA 1SKSB 2YWMA 3GN3A 3NOFA 4YAPA 2IWTA 4IP1A 5IMCA 17GSA 2C3QA 1X0RA 4X0XA 5C04A 4ZBBA 3US3A 3DYRA 3LG6A 1PRXA 1LJRA 3QAWA 5AN1A 2CA8A 3F4RA 4CW9A 2IIYA 5ECOB 2YNXA 5ECHB 4Z7XA 2LNTA 3APQA 1URMA 4FH8A 3BD2A 2VL9A 1SU9A 4GTUA 2B6MA 2I4AA 3F8UA 1AQWA 3M0FA 2IFQA 5EY6A 3WGXA 1MDKA 1I5GA 1QGVA 2LRTA 4RI7A 3TKSA 4MZCA 5KN2A 8GSSA 1M9AA 1U3AA 5KEJA 2GQLA 1JFUA 3GRXA 5DCGA 16GSA 2H1BA 2XBIA 1A2JA 4DSSA 2FNOA 5D9WA 3ERGA 5G31A 3PH9A 3VI5A 1FB6A 3VI7A 3UL3A 3DVWA 4EKZA 4ZL8A 2DJ0A 2R3XA 1EOHA 4IVFA 1AC1A 1M9BA 1F9MA 2V6KA 4ZL9A 3HY2A 2CAIA 4PQIA 2JL4A 3D21A 3RHBA 5IIZA 1ZYEA 3C8EA 3I6AA 4K9ZA 1AIUA 1AAZA 3QFBC 2P5RA 1K0MA 5JWOB 3WT1A 4N11A 2YJ7A 4ACSA 1E6BA 3TOUA 3TJGA 1Z6MA 3TCOA 3ZIJA 4EC0A 4ZILA 4PQ1A 2EC4A 6GSWA 3N9JA 5IQYA 3GL3A 1TU7A 3HJPA 4HS1A 4PGTA 4XRAA 1YY7A 1A0RP 3EURA 2VL2A 3ERWA 4KW6A 1V2AA 2R37A 3D4TA 2CVBA 4FYUA 4D73A 1USBA 1O8WA 3IK7A 9GSSA 4JR4A 5IPHA 3GX8A 4MP4A 4NHWA 1VF1A 2VD0A 4ML6A 5DAKB 2H1DA 5DJMA 5AIVA 4WR5A 4POKA 3IA1A 2NTOA 3BJ5A 4EL1A 1PN9A 4I2TA 4KGIA 3BCKA 4HI7A 1PX7A 3QOUA 3ZTLA 2P5QA 4ZB9A 1CQGA 4K7IA 3UBLA 2O89A 3O3TA 4KDUA 3ZL5A 1IYHA 1HYUA 2DJ3A 1KTEA 4ZBAA 5D9TA 4KB3A 3WGEA 1SKWB 4O5RA 2AHEA 4L5LA 1EV9A 1MDIA 3GTUA 3FR9A 5G1LA 1WPIA 4MJCA 1GULA 2GSRA 4K0NA 3LQ7A 5L71A 2RLIA 1VF4A 3GKKA 2MBSA 2EIOA 2P0GA 3GX0A 3QPMA 2ON5A 2GVPA 1K0CA 1WIKA 4KSOA 4RQXA 5F05A 4BL7A 2OKAA 1SKRB 1JHBA 1H4OA 4DEJA 4MA9A 5D9VA 1GSYA 3HVSA 3EC3A 3IR4A 4OD7A 3G7IA 3UJ1A 3I9V2 1U88A 4WR4A 1BG5A 4MF7A 2CX3A 3FK8A 4QL9A 7GSSA 1TJDA 2VM1A 4YH2A 3LXTA 3P8WA 3TJJA 4NWYA 2OA7A 4J57E 5H5QA 4O32A 2L59A 1K3LA 3EVIA 4XIHA 4LLRA 5DJLA 3GFKA 1SJIA 4GSSA 1ZYQB 3LFLA 4LMVA 3ZRDA 1TDIA 2AJQB 5JCGA 1B48A 4OO5A 1LBKA 4ULXA 1SL0B 4RI6A 1BJXA 4TVEA 2MMAA 1EEJA 3GSSA 3D0ZA 2F3MA 4QQ7A 1THOA 3A5WA 4MF6A 1VF2A 4XRDA 1XIYA 1T8EB 4F03A 2TRCP 3G7JA 4KUNA 2H76A 4Q5RA 3TB2A 4GSTA 2KOKA 1TU8A 4N0ZA 3DKSA 1SENA 4N0VA 6GSTA 3HJOA 2B1KA 5JWRB 2I3YA 4PQHA 4GQFA 4JBBA 1G0TA 2R6KA 3GA4A 4MH3A 1GSUA 2CV4A 1A8LA 3GSTA 2NBSA 5DDLA 2H70A 1WP0A 5HR1A 4F9ZA 4MZWA 3O76A 3SBCA 2RM6A 1BAYA 4FYCA 2KHPA 2ZUPA 4GXZA 2FWHA 1GTIA 4GF0A 5ECNB 2VCXA 4O92A 4TXOA 4OFTA 1C72A 1GP1A 1T7PB 1AUCA 1AQXA 1A2LA 5IOXA 5A4WA 3ZIVA 3HZ8A 4KNDA 5FWGA 5J4UA 2VCQA 3IE3A 5CYYA 5ECRB 1MEKA 5DALB 2PBJA 4ECJA 1Q4JA 6GSXA 2H0IA 3IV4A 4ECIA 4MPFA 4HZ2A 5H5RA 2F8AA 4HEA2 2CQ9A 2IMKA 3WD6A 3EYTA 2GZYA 3SWLA 3CRUA 1HNCA 1RQMA 4POBA 1JZOA 1SK0A 1A2MA 3ZFBA 2L5OA 3FKFA 1G6YA 5AIXA 1PMTA 10GSA 5JCUA 4GRFA 3IBHA 4ID0A 3DRNA 2E0QA 3O6TA 5JWQB 6GSVA 3LSZA 2VCTA 3FZ4A 2AB6A 2YZUA 2EIQA 3G7YA 3QAGA 4XS4B 3DVXA 3KGKA 3LYKA 3UARA 1GL8A 2V2GA 2OE1A 3FR3A 3F3QA 2DIYA 2DJ2A 4PNFA 4GLTA 2YPMA 1X9SB 2JZTA 4X1UA 5D93A 3GH9A 2YV9A 5CAXA 2H6ZA 3BCIA 3DD3A 4GQCA 3W8SA 3KIJA 1WOUA 2GT6A 4BPYA 3GNJA 3N5OA 1EZKA 2GSTA 3KEBA 1ERUA 1S3AA 1W89A 2DBCA 2N5AA 5INYA 3ZYWA 3ZREA 4IQAA 3KTLA 2IL3A 1OKDA 4I8BA 2LRCA 1I9DA 2OE3A 3A2XA 2ES7A 2H73A 4K7NA 4XCSA 3C7MA 2WS2A 1G7OA 1OVNA 2PVOC 4WBRD 4L8EA 3HVXA 14GSA 1PQNA 3E9JB 5LNKe 4HDEA 3TKSC 5EVOA 1F3AA 3IPZA 2YCDA 3C1SA 5B7CA 1R5PA 5KN0A 1BQ7A 4IS0A 5DQSA 1ST9A 3W6GA 3H4KA 1Z7RA 5EL8A 1X5DA 5G2ZA 1DE1A 2DMMA 3GKMA 3TRXA 3FHKA 2MMZA 2VIMA 2DJKA 3IC4A 2PU9C 1JZDA 4G10A 3TJBA 2H30A 1O6JA 4ISDA 2LJRA 4XHMA 4O7HA 4F2IA 2J9HA 3DIEA 1X5CA 2F51A 3DGQA 4MDCA 4BWQA 1YF1A 2A2SA 3F6FA 4PURA 1XXUA 1OE7A 4OCEA 5ECQB 2MMNA 1LU4A 4MABA 5J9CA 2HZEA 1YEPA 2C4JA 3HA9A 2B1LA 2LUSA 2REMA 1XPVA 2VLTA 1TXXA 1E2YA 4NAXA 3GMFA 2VUPA 2K8VA 1YKCA 2VL2C 3EMPA 1JLWA 4IN0A 1TK0B 1TKDB 3ZVJD 1A24A 4J56E 1XOAA 4HJMA 1GLQA 4ZB8A 1XW6A 1NW2A 2V1MA 2PWJA 3EU4A 1ERWA 2VAFA 3IXRA 2PUKC 1PX6A 3GV1A 3F6DA 2IFQB 2QC7A 3UVHA 1SJ6A 5ECLB 3LGCA 1X5EA 4NV5A 1MDJA 2DSAA 4FIWA 4WF5A 1GNWA 4IJIA 4L0UA 4DSSB 3QAVA 2JSYA 3DEXA 2VD1A 1NM3A 1PKWA 3L4NA 2A4VA 4TR0A 4OMVA 1M7TA 3GIXA 1TRSA 1A8YA 3QDNA 1FB0A 2H0GA 3GYKA 1HNBA 2O87A 3HXSA 2Z9SA 5G5EA 2BTOT 3FR6A 1ERTA 1HNAA 2IPAA 4GSNA 3KP9A 3MAKA 3M1GA 3GL5A 4N30A 2M46A 5IM9A 2FA8A 2X99A 3GHAA 2GTUA 3IAS2 2NDOA 1X9MB 5FT3A 4POMA 1WWJA 4NPBA 3F63A 2OBIA 2V41A 1PA3A 1CQHA 2HI7A 1XBSA 2GT5A 2RUFA 3APSA 2XPDA 2XBQA 1ILOA 3ZVJA 4MH2A 3TKQA 2HLSA 4J2FA 3NZNA 1T1VA 5CNWA 2L6DA 1T3BA 2H6YA 4NXIA 5A5KA 2H1GA 1Y6EA 4POLA 4BWSA 2NPBA 1FW1A 2KP2A 3F4SA 4NV2A 2JZRA 5LCZA 4KDXA 4D73B 5AGYA 2WDUA 4K0GA 1OC9B 1DE2A 2GZZA 1K0DA 2MBTA 3BBYA 18GSA 3CYNA 5ID2A 2X64A 2F9SA 1V57A 2V6OA 1R7HA 3D22A 3U6VA 1O85A 3DMLA 1XZOA 2WGRA 1GLPA 2FHEA 1GTAA 3GTUB 4HUAA 2K18A 1FO5A 5F8BA 3CSHA 2WULA 5GSTA 4KSMA 1HQOA 3EE2A 5CP1A 3E3EA 3CMIA 5AISA 5IO0A 2PN8A 4E8HA 3C1RA 5D96A 3VURA 1ZL9A 2XPEA 1K0BA 3KXOA 1O73A 1WJKA 2FD3A 2IN3A 2GQKA 4AJ7A 2H19A 4G19A 4QL7A 3LYPA 3QMXA 3UAPA 2C0GA 6GSUA 3ZLPA 3UMAA 3CTGA 5F06A 4MLYA 3D4MA 1ML6A 4EO3A 2JZSA 2LJKA 4V1Ap 3H79A 4V2NA 1NHYA 5J41A 2L6CA 2R5GA 3TRQA 4WXTA 2B7JA 4EXJA 5CRGA 13GSA 3VWVA 3UOMA 2HE3A 2PVQA 2C80A 1G7EA 1YKAA 2J23A 4V2LA 3P7XA 1OAZA 3J7Yk 2FLSA 3FZAA 3L9UA 3VPTA 1R26A 3CSJA 2E2MA 4IJ3A 3Q6OA 2H75A 1VF3A 2HZFA 3GKXA 1ZOFA 1O8XA 2C0DA 3FW2A 1YF0A 4TW5A 3HCZA 2I81A 3QR6A 2GGTA 2CX4A 2NVLA 4JR6A 4ZL7A 5CO3A 2I1UA 5HR0A 4FO5A 3ME8A 5CREA 4KH7A 2GLRA 4OCFA 3S9FA 1F3BA 5CRHA 1QUWA 3KD0A 2YWIA 4E8EA 2QGVA 2C0FA 3DXBA 1B4QA 2AUVA 2C3TA 2FWEA 1QFNA 1EOGA 4TR3A 5IMZA 5GZZB 3TKSE 2AAWA 2PERA 3A2VA 1T4YA 5ECPB 4KDYA 3HZ4A 3ED3A 1ZGNA 3PGTA 1R4WA 1M2AA 3BOAA 5F07A 1ZZYA 4LA1A 1PSQA 2DLXA 2C3NA 2R2JA 5ABRA 1PGTA 4WF4A 3CXGA 2DIZA 3C71A 4TXOB 1V9WA 2HNLA 2JU5A 1FG4A 1EP7A 1SD8A 2HSHA 2LEGA 3RPNA 3LEFA 5C00A 1XCCA 3HJMA 4Q5NA 1N8JA 1YZXA 1ABAA 3EU3A 2LS5A 4IGJA 1T4ZA 3FRCA 1SL1B 22GSA 1AXDA 2ALBA 3Q19A 3KZQA 2CAQA 5J9BA 3FEUA 2B5XA 4Q5QA 4TR1B 4F82A 3PR8A 4WETA 4L0WA 4YQMA 4AJ6A 3QD9A 5B8BA 4YQUA 1SJZA 20GSA 2YZHA 2YV7A 3WYWA 2WRTA 2G0FA 5ECIB 2H01A 4IKHA 3GKNA 1V40A 4JZQA 1X9WB 3E0UA 2OADA 2WZ9A 5JCWA 2VCZA 1JLVA 1RW1A 3HYPA 3IK9A 2B3SA 2YANA 4EDYA 1OC8A 2PMTA 2X8GA 3FYGA 1GSSA 4G2EA 3K8NA 3A3TA 2YOIA 1EEMA 4CDOA 1BEDA 4MMMA 4V1Ag 1B9XC 4HZ4A 5A4UA 5B6NA 1GTUA 3ISOA 4ECBA 3HVVA 5ECMB 3I69A 1YJ6A 5KN1A 3VLNA 5HFKA 2BMXA 2TRXA 3F0IA 1TP9A 2C1YA 4MJBA 1U6TA 3L9VA 1J0FA 2C0EA 2EIRA 4WEYA 3KH7A 1MD4A 1ACVA 4BVXA 4RUVA 5IO2A 1GSDA 3HHVA 2L57A 2LSTA 4CHSA 2VCWA 2YP6A 2FGXA 4X43A 3HDCA 2L4QA 3J7Yb 2X8HA 3GUSA 4DSQA 4K6XA 5IMFA 1WRYA 3ZMKA 3EWLA 4Q5FA 5IMDA 5E59A 1H75A 1KNGA 5A4VA 2D2ZA 2DJJA 1O7UA 4EUYA 1QMVA 2AV4A 1GUKA 1IYIA 3U5RE 2M72A 3WT2A 1Z7PA 2YN1A 1K3YA 1V98A 6GSYA 2VO4A 5CRWA 4HU9A 2VL3A 4XTSA 2OE0A 3RAZA 1U87A 2IMIA 3TOTA 3HKRA 2BJXA 3VPQA 2B5EA 2TIRA 3LORA 3JCML 1OC3A 2CZ2A 1XOBA 1XWBA 1KBNA 1Z5YE 1V58A 4KAEA 2LTKA 4N10A 1PL1A 2FA4A 5H5SA 1N2AA 1TI1A 1YEXA 3L78A 4ZXGA 3F3RA 4I5QA 1OKTA 3EINA 2FY6A 3VWXA 4XS6A 3KM6A 1TW9A 5IMVA 5ELAA 2ZCTA 2OACA 3D5JA 3Q18A 5G30A 3LJRA 1QQ2A 1Q98A 6GSSA 2H1AA 2ZNMA 2HZEB 3KP8A 4WKWA 5B8AA 1XVWA 4ECCA 1F2EA 2IMDA 1THXA 4FYBA 2N5BA 4OFNA 2IMEA 5D9XA 3F9UA 4H86A 1AW9A 4AF2A 4GWRA 3KH9A 1GTBA 1WMJA 2E2GA 3UBKA 3TJFA 5DCHA 2O7KA 1Y25A 4AGSA 2O85A 3TDGA 2AYTA 1XWCA 2VLUA 1FVJA 3MWHA 1BYEA 4F0BA 3GH6A 4JE1A 1B9YC 1TTZA 2PPTA 3NIVA 4PUAA 3TKRA 3RPPA 2VLVA 4ML1A 4EF0A 5DAKA 2RUEA 2GQMA 4XS1A 1BX9A 2VOCA 4KA0A 2L5LA 2FWGA 5E4WA 2FCHA 1GSEA 2LQOA 3MSZA 2F8FA 5ENUA 3ZFLA 2B7KA 2M80A 4L5OA 2GSSA 4LMWA 3EMXA 5HQPA 5DQYA 1S3DA 3KMOA 1O81A 1VGLA 2CVDA 1OC9A 4LL4B 1EP8A 2LKUA 2IJYA 2YWOA 11GSA 3W8JA 4P3YB 4PUFC 1A0FA 2CT6A 1J08A 3WGDA 1TK8B 1A23A 3ZITA 2OBKA 1KEBA 4ZIJA 1FHEA 1RK4A 2H72A 5KN3A 2C8UA 1SYXA 4RQRA 3KMNA 4IHUA 3LWAA 3QCPA 4MJEA 1EGOA 2WCIA 2LNSA 5G1KA 4PX1A 2O8VB 1M0UA 3KCMA 3IOSA 3TGZA 3TKPA 4KE3A 1XFLA 2HRFA 3H1NA 3PINA 2ON7A 4OFMA 1WE0A 4NMUA 2MMOA 3LXZA 5COHA 3VWWA 2HSYA 2FWFA 2WJUA 3IRAA 5HR2A 1F6MC 2GDRA 1XW5A 5ID2B 1GRXA 2H74A 1K0OA 3P2AA 1PL2A 4F0CA 1ERVA 2V32A 1GUMA 1B4PA 4KX4A 2N5FA 3APOA 3G9BA 3RDWA 2DC5A 4IQ1A 4HQZA 4EDZA 2YJHA 3R2QA 5IMAA 1FVKA 3L9SA 4MPGA 4EE0A 1ON4A 4V2MA 3AY8A 1MD3A 3CTFA 4ILFA 1K0NA 4IELA 2VCVA 3UEMA 3I43A 3ZZXA 2LJAA 5HFIA 2HRNA 1OYJA 1T00A 1ZCPA 1EWXA 1PD21 1MTCA 3OR5A 1GSQA 3KJYA 2XC2A 3DWVA 1AQVA 1XWGA 1TK5B 2PGTA 1GWCA 3HD5A 3RHCA 4EVMA 1PKZA 2A2RA 2R4VA 4TOPA 1S3CA 2HT9A 1G6WA 5FHIA 1Z6NA 2H0HA 2WB9A 1DUGA 1FAAA 5DBQA 2LV3A 3A2WA 2K6VA 1SD9A 4BA7A 5GAPD 2QSIA 3H93A 19GSA 5LD0A 4PXOA 3IHQA 2HXKA 5G5FA 4TXVA 4JRRA 3TRPA 1R5AA 3IDVA 3M3MA 4IW9A 2FUG2 2CVKA 1TI3A 1EV4A 4TR4A 4YAVA 1UA5A 2GZPA 4MCUA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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