4D73A

X-ray structure of a peroxiredoxin
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
180
structure length
171
Chain Sequence
IKENDLIPNVKVMIDVRNMNPNDFTSIDTHELFNNKKILLISMPGAFTPTSTKMIPGYEEEYDYFIKENNFDDIYCITNNDIYVLKSWFKSMDIKKIKYISDGNSSFTDSMNMLVDKSNFFMGMRPWRFVAIVENNILVKMFQEKDKQHNIQTDPYDISTVNNVKEFLKNN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Plasmodium Falciparum Antioxidant Protein Reveals a Novel Mechanism for Balancing Turnover and Inactivation of Peroxiredoxins
pubmed doi rcsb
molecule keywords 1-CYS PEROXIREDOXIN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Plasmodium falciparum
total genus 61
structure length 171
sequence length 180
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2014-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4d73A00
1GSEA 1W89A 1PN9A 2O89A 4IW9A 3UBLA 4EC0A 19GSA 4TR0A 2IMEA 2R4VA 1GTIA 3LG6A 2PU9C 1OE8A 4HU9A 1K3OA 5H5RA 4KDUA 1YY7A 1B9YC 1XIYA 2P5RA 5C00A 4N11A 2AB6A 3FRCA 1ABAA 1C72A 1BAYA 1FVJA 3IA1A 4WETA 1R4WA 3P2AA 3EE2A 3KTBA 4IBPA 5IPHA 1ILOA 1T00A 2H72A 1Z9HA 2DBCA 2V32A 3IAM2 3VWUA 1A8YA 2O7KA 1B4QA 4XS4B 4NHZA 4EUYA 5J41A 3VI5A 2JL4A 3KM6A 5DAKA 2CQ9A 1TDIA 4K6XA 4FYUA 1RW1A 1UA5A 1KTEA 2PN8A 3F0IA 2VD0A 2WS2A 4MH3A 3ME8A 1V9WA 3GX0A 4TOPA 1SL0B 2WRTA 2HXKA 2OBKA 3PR8A 2GSRA 4AGSA 4HEA2 4MF6A 5A4WA 3WGXA 3C71A 4MJEA 1TW9A 5DCHA 3GYKA 5IMFA 3PINA 5KN0A 3QFAC 4BL7A 4J2FA 4ZBAA 2WDUA 3ZITA 3A2WA 4X1UA 4NV5A 5ELGA 1OC9B 3LSZA 4K7IA 2MYGA 4MABA 5B6NA 3DIEA 1LU4A 3IDVA 1EV4A 1AQWA 20GSA 4IQAA 1TKDB 2GGTA 2C3TA 2H1DA 2FA4A 1ZMAA 4TKYA 4H86A 2VL2A 5IMDA 2CVDA 2PWJA 3C7MA 3IR4A 1V57A 3Q19A 3VWXA 4G19A 5GZZB 4NAXA 4JZQA 4GSNA 3GSTA 4TXOA 5IIZA 1Z7PA 2YPMA 6GSXA 3J7Yk 1SKSB 1RQMA 2HSHA 3BJ5A 2YJHA 2H6YA 1GTUA 3TJKA 4OO4A 1X9SB 2IMDA 1PX7A 1J08A 4MJAA 2OE3A 1QQ2A 4ML6A 3GTUB 1LJRA 3KP8A 1M2DA 4Z7XA 2HZFA 2HYXA 4G10A 2ZNMA 4ML1A 5JCUA 1YF0A 3HVXA 3DMLA 4K7OA 1GTAA 2KLXA 1GLQA 4RI7A 2H70A 4HZ2A 3WYWA 3ZVJD 4JRRA 2IFQB 4NV2A 4QL7A 1R7HA 3UMAA 4OCFA 2H30A 4G9HA 3CYNA 2JSYA 2VCZA 5IM9A 4BPYA 4WF5A 1E2YA 4KUNA 3F3RA 4MP4A 1O6JA 1AQXA 2DMMA 2YN1A 5H5SA 2TRCP 3PGTA 5J4UA 4IKHA 1DBYA 3KGKA 3APOA 3LYKA 2H1GA 5EY6A 2OBIA 2B7KA 4TR3A 3KH9A 4LL4B 4FYCA 5JWQB 2B1LA 2VO4A 2TIRA 4PNFA 3F4RA 1F2EA 3M9KA 3KH7A 1NHOA 2N5FA 3FEUA 4HU7A 5D9XA 3HZ4A 5AN1A 5J3RA 1MEKA 2VCVA 2FLSA 3APQA 1ERVA 3L9VA 2LQOA 1OAZA 1UC7A 3VI7A 2N5BA 2RUFA 1GUMA 2CZ2A 3MWHA 3GIXA 3TKSC 1TP9A 2LJKA 2OE0A 3QAVA 1OKDA 5ECIB 2L5LA 4GCIA 2NDOA 2IJYA 4I6XA 3IBHA 2V41A 4F0BA 2E0QA 4JEDA 3U6VA 1BG5A 1R26A 2R2JA 2ZUPA 2V6OA 4POBA 4HZ4A 1SD8A 1R5PA 2E7PA 1U87A 2B5EA 1M9AA 4EE0A 4IN0A 3GHAA 3GA4A 3UOMA 3ZVJA 2YZHA 3H1NA 1GNWA 4KNDA 2LKUA 5JCWA 12GSA 5AISA 2P31A 2YWOA 3S9FA 2WB9A 3FZ4A 2MMAA 2GS3A 2F9SA 1XWKA 1OC8A 4OWYA 1I5GA 3CBUA 4XIHA 3I9V2 2FNOA 3N5OA 2H1AA 2FGXA 5CO3A 4KX4A 3EINA 1SYXA 3RDWA 6GSVA 4L0WA 4MZWA 4N0VA 4ZXGA 2O87A 2MZCA 5DAKB 1XVQA 1T8EB 3BCIA 2VL9A 4JR4A 1DE1A 3KD0A 3GL3A 4KAEA 5CREA 3FYGA 5J5NA 4LLRA 1ON4A 1K0MA 3ERGA 4XTSA 3GKNA 1DSBA 3DRNA 2VIMA 5DCGA 1R5AA 5DDLA 2VM1A 4ACSA 1HNAA 5AIVA 5GSTA 4BA7A 3APSA 3HYPA 3HHVA 1XW5A 1SJIA 1X5DA 2VLTA 3LYPA 3C8EA 3ZFLA 3LJRA 2J23A 5L71A 3EMXA 3WGEA 3D4TA 2I81A 3QAWA 1NM3A 1PKWA 1XXUA 1GSUA 2CAQA 4MPFA 4JBBA 3KMNA 1EP7A 4KCEA 6GSYA 4L5OA 4KH7A 4TXOB 4GXZA 2VD1A 1WP0A 4LL1B 4AF2A 1JZDA 1EGRA 3EURA 2B5YA 1NSWA 4PX1A 5C04A 4I2UA 5DALA 5B7CA 2VL3A 5G1KA 3LWAA 1WRYA 3DXBA 5DBQA 3E3EA 3KIJA 1FVKA 4BWSA 5IQYA 4PNGA 4TW5A 1QK8A 1G7OA 1GRXA 3NIVA 1OVNA 1A8LA 4JU5A 1GH2A 3U5RE 1YF1A 1A2LA 4WF4A 3VLNA 3HZ8A 4PUAA 3ZL5A 1XWGA 3KTLA 5ELAA 2HLSA 4KW6A 4OCEA 2GLRA 3HKRA 4HJMA 3IK9A 4MJCA 2X8HA 4KDYA 3GMFA 3VWWA 1PRXA 4G2EA 4POLA 4E8HA 4LMWA 3CTGA 2NVLA 4MLYA 5EPFA 4XRDA 4XS1A 2X8CA 2GSTA 3QMXA 3TUEA 1ML6A 4EO3A 4P3YB 2HT9A 1K0NA 3LXZA 4POMA 5ECSA 3E0UA 3GKXA 3SBCA 2PVQA 3KMOA 1FB0A 2Z9SA 4IVFA 1F6MC 3GL5A 1XBSA 1A24A 1SK0A 2M80A 1GUKA 5E59A 4F82A 2KOKA 4WEYA 2YOIA 5HR1A 4F0CA 1ZOFA 2KHPA 3F63A 3H93A 3HXSA 5F05A 2H0GA 4NMUA 1HNBA 1EOHA 3TKRA 1OYJA 5CRWA 1DUGA 1S3DA 4ZL8A 4MZBA 8GSSA 3HJMA 1B4PA 1GSYA 3I69A 3CSIA 2HI7A 2E2GA 2IN3A 3DVXA 1WJKA 2LS5A 5ECOB 2PGTA 1T7PB 2HE3A 4YQVA 1TK0B 2YJ7A 4ZB8A 4I8BA 2J9HA 3VPQA 2XBIA 1USBA 1NW2A 1JLWA 17GSA 1XOAA 1CQHA 1PKZA 3A5WA 3L78A 3DGQA 1EGOA 5CYYA 4KCAA 2H75A 1BEDA 4ID0A 4KDXA 3LQ7A 5FT3A 1AQVA 2L6DA 2GSSA 3ZMLA 1ERTA 2RIIA 3US3A 1A2JA 3O3TA 4YQMA 14GSA 2JZRA 5IMAA 3FR9A 2OADA 4GSTA 2GTUA 3P8WA 1TU8A 4OFMA 2H71A 2VUPA 2X99A 4Q5NA 1V40A 5F0GA 5CRGA 1VF4A 2R3XA 1VF3A 1EV9A 1J9BA 1K0BA 5ENUA 2K18A 2YANA 4J57E 2WGRA 4ZL9A 2C8UA 4ILFA 2LV3A 2V1MA 3IXRA 4GLTA 3VPTA 1Q98A 1U3AA 4CHSA 1O8XA 2H73A 2M72A 3G9BA 1SK2A 3IAS2 3E9JB 1GNEA 3C73A 5HQPA 1XWBA 3UVHA 2DC5A 2RUEA 4EDZA 1VF1A 3I6AA 1XFLA 3G7JA 2QKEA 3WT2A 2GDRA 5ECQB 3QFBC 3QCPA 1K0OA 1QFNA 4ECJA 1JHBA 2L4CA 3C1SA 2FCHA 4DSSA 6GSUA 3F6FA 1FO5A 1GULA 3Q18A 2YWMA 1M0UA 2EC4A 5G5FA 2JU5A 3OR5A 1PSQA 4BWQA 5D8IA 5DALB 1Z3EA 2ZCTA 2LNSA 2IMKA 5ID2A 2YP6A 3F9UA 2H76A 4V2LA 4TXVA 1GSSA 1WOUA 3G7YA 2WZ9A 2VM2A 1SKWB 4ISDA 2A2RA 3ZYWA 1HYUA 1FB6A 1HNCA 2CX3A 3EVIA 2DIYA 4NWYA 2HRFA 1T4YA 1YDKA 3EU4A 2CA8A 4KE3A 3F6DA 1FOVA 4K0GA 3G7IA 5ECHB 2LRTA 2AHEA 5HR0A 2H0IA 4WR5A 4IELA 2B5XA 2LRNA 2PMTA 10GSA 4I5QA 4FO5A 1B48A 1YKAA 3MSZA 4ECBA 1K0DA 1XPVA 1U88A 4IHUA 1IYHA 3IC4A 4HI7A 5KEJA 1RK4A 1Y25A 2DJ1A 5CNWA 3ZZXA 3D22A 4K1FA 4DEJA 4HQZA 5IMCA 1XWCA 2MMOA 5KN3A 2JZSA 5DJMA 1F37A 5DQSA 2H1BA 3FZ9A 2CT6A 3M3MA 1GP1A 4QQ7A 4F03A 5AIXA 1JZWA 2PPTA 4O7HA 3ZRDA 3L9UA 5DQYA 2GSQA 2FWHA 2D2ZA 4RUVA 1A0RP 3D21A 3KZQA 3TCOA 2R37A 2LEGA 1PL2A 3ZLPA 2K8VA 4Q5QA 1BJXA 2MBTA 2BTOT 4IGJA 4EVMA 6GSWA 3KP9A 2NBSA 1PMTA 2DJKA 1PL1A 2DJ3A 1N2AA 2PERA 4Q5RA 5IMVA 1H75A 2RM6A 4BVXA 1GSQA 1M99A 3GH9A 3Q74A 3EYTA 2I3YA 1K3YA 2L6CA 4L5LA 5IO0A 1F9MA 4IS0A 4OMVA 1UN2A 1X5EA 6GSSA 1OE7A 1G6YA 1Z6NA 3BCKA 2C0EA 1MD3A 1SU9A 1YEXA 2FY6A 3ERWA 4AJ7A 1THOA 2B6MA 4V2NA 1TK8B 1ACVA 3TRQA 1DE2A 2B7JA 3H8QA 1O81A 3RHBA 4NXIA 5G2ZA 5A4UA 1V2AA 3HY2A 3GH6A 5IO2A 1EP8A 1OC3A 4TR1A 4YQUA 1XW6A 2GVPA 3A2VA 2F3MA 4K8MA 1BYEA 4DSQA 1YQ1A 3RPPA 3QDNA 4X0XA 3H4KA 3FK8A 2RM5A 1N8JA 2O85A 2XC2A 2KUCA 3F8UA 5CP1A 1U3IA 5G5EA 3ZFBA 4ZIJA 4IP1A 6GSTA 1S3CA 7GSSA 2KP2A 2R5GA 2GZYA 2GT6A 3O76A 1SK1A 5A4VA 3FY7A 5G1LA 5LNKe 3HD5A 1A23A 1TTZA 2FWEA 2H8LA 2FWFA 4IP6A 3GKMA 3UBKA 3M0FA 1MD4A 3TOTA 1WMJA 5HR2A 4DSSB 4ZBBA 2DJ0A 5HFGA 4E8EA 1IYIA 1SL1B 1X5CA 3KJYA 1FHEA 5J9CA 4JE1A 3A2XA 2VLUA 2QC7A 3HJOA 5ID2B 4N0ZA 2DJ2A 1I9DA 3D5JA 3RPNA 4MDCA 2PBJA 3DEXA 3F4TA 4V2MA 2MBSA 1PA3A 3FKFA 4OFTA 1M2AA 1JLVA 5AGYA 2LNTA 1PQNA 2GQKA 3TB2A 3ZREA 4KB3A 4EXJA 5D93A 2CAIA 3NZNA 4WKWA 1HD2A 1EZKA 4FH8A 3FZAA 1K3LA 1GUHA 1TJDA 2X64A 5KN1A 1ZYEA 2F51A 5D73A 4N30A 4RI6A 5J9BA 2IPAA 1ERUA 1LBKA 2H6XA 1XZOA 2FHEA 1BX9A 2G0FA 1QGVA 1F3BA 3MAKA 1MTCA 3QR6A 2OJLA 4Q5FA 4GRFA 1F3AA 1H4OA 5IMZA 2H74A 1A2MA 2MMZA 1SENA 3HCZA 2WCIA 1AUCA 2DJJA 5LCZA 3IHQA 2AUVA 2DSAA 3TKQA 2A2SA 4PQHA 1PGTA 4K0NA 2REMA 3LXTA 1T3BA 2E2MA 4F9ZA 4YAPA 3ZMKA 4HJ2A 3MDKA 2YCDA 1JFUA 1VF2A 1ZYQB 1GLPA 3D4MA 1E6BA 1V98A 4IJIA 4TN8A 1KNGA 3TKSA 2C4JA 1QMVA 1XOBA 2OKAA 1B8XA 3ISOA 4KGIA 3P7XA 4XS6A 3QAGA 1XWAA 1EEMA 2N5AA 4MA9A 4HQSA 4GF0A 3R2QA 4FIWA 5LD0A 2K8SA 4GTUA 4OFNA 2HZEA 3CSHA 5CRDA 3HJPA 3IV4A 1TRWA 2EIOA 5EL8A 2ALBA 1AW9A 1AAZA 3PH9A 4D73A 1FG4A 1VGLA 4GQFA 4OD7A 1WE0A 4LA1A 3FHKA 1PD21 3QD9A 2DIZA 2IMFA 2MMNA 2TRXA 2GZZA 5G30A 5H5QA 3N9JA 3GV1A 1O73A 3EWLA 3W8SA 3HA9A 3VFIA 2YWNA 4KSMA 2EIQA 2AV4A 3BBYA 22GSA 4NHWA 1URMA 1WPIA 4EL1A 3HVSA 3DWVA 2YWIA 4EKZA 5FHIA 2VCQA 4ZILA 1ZCPA 3DKSA 4TR1B 4MJBA 4HS1A 1AC1A 2XPDA 4MF7A 4RQRA 2HRNA 2YV7A 1AIUA 4F2IA 4KSOA 2VLVA 2OA7A 4MH2A 2H66A 3F4SA 2VCTA 4O92A 4I97A 2YZUA 5ECLB 2AJQB 5IOWA 5CAXA 1TU7A 3ZIJA 4V1Ap 3BD2A 1FAAA 4O5RA 3DVWA 2CX4A 16GSA 2HNLA 1XCCA 5JWOB 1ZGNA 2WULA 1JZRA 3GUSA 1TK5B 3WD6A 1JZOA 2LQQA 4GWRA 2L4QA 2P0GA 4WR4A 5ECMB 1TXXA 2JSZA 2R6KA 2LJRA 1ERWA 2IWTA 2BMXA 1G6WA 1SKRB 3TRXA 3VK9A 3QOUA 2GZPA 2CVKA 4TRXA 3GURA 4AJ8A 3ERFA 3WGDA 4PURA 4DVCA 3AY8A 1X9WB 3A3TA 4TR4A 3GX8A 5ECKB 3UEMA 4WBRD 1XVWA 1X9MB 3M8NA 5FWGA 4CDOA 3FZ5A 4ECIA 2CZ3A 3F3QA 2BJXA 3CRTA 4WBJA 1EOGA 2HSYA 3L4NA 3UARA 5DVBA 1TRSA 2H19A 4PUFC 1Z7RA 4MK3A 2F8FA 1GSFA 2A4VA 3TRPA 4ZL7A 3KEBA 2IIYA 5IOXA 3Q6OA 1X0RA 3ME7A 3JCML 4LMVA 1HQOA 3TGZA 1MDJA 5EVOA 2C80A 4YH2A 1TI1A 2M46A 4JR6A 1SD9A 1KEBA 4N10A 2F8AA 4XRAA 5G31A 5B8AA 3RBTA 3RAZA 3LGCA 4PQ1A 3LFLA 4WXTA 1O8WA 2VCXA 2ON7A 3J7Yb 2V6KA 2AAWA 3CXGA 4GQCA 1UVZA 2KP1A 1MDIA 1O85A 1SJZA 1GWCA 3HVVA 1BQ7A 5HFKA 3VWVA 5HR3A 5INYA 2P5QA 2HFDA 2L5OA 1YJ6A 2B3SA 5D9WA 5ABRA 2NTOA 2WJUA 2LUSA 3K8NA 11GSA 3UAPA 5GSSA 4ULXA 1A0FA 3IOSA 3I43A 3DYRA 5JWRB 2H0HA 1SJ6A 1KBNA 4MMMA 3QPMA 3DD3A 2IL3A 1YEPA 2JZTA 3LEFA 1W4VA 3D0ZA 2JACA 2NPBA 1PX6A 3V1WA 4TVEA 4YAVA 4OO5A 3TKPA 3UVTA 5F07A 3IRAA 3GN3A 1QXHA 3ZIVA 1AXDA 3GRXA 2OACA 4MF5A 4HUAA 2PVOC 4XS4A 3SWLA 3UIWA 3FW2A 2HZEB 4KA0A 3TJBA 2C1YA 3IE3A 3GNJA 1TI3A 1K0CA 4D73B 2OE1A 2CV4A 3H79A 5ECPB 4MZCA 1EWXA 2VOCA 2IMIA 5IPGA 3EMPA 2YV9A 1NHYA 2GQLA 1G7EA 4MPGA 3UL3A 4QL9A 2LTKA 1B9XC 5KN2A 5E4WA 1SYRA 2VCWA 2B1KA 3CTFA 2XHFA 1GSDA 2VL2C 1GL8A 1S3AA 4J56E 4K2DA 1OC9A 2JADA 4GSSA 1M9BA 3ED3A 2C3QA 2GQMA 4IQ1A 4RQXA 5B8BA 2I1UA 9GSSA 4XHMA 1QUWA 1T1VA 1YZXA 4IJ3A 2FWGA 3W6GA 2YNXA 1T4ZA 5D96A 2C0FA 5B6MA 4HDEA 13GSA 2V2GA 3KXOA 18GSA 5D9TA 3M1GA 5COHA 4X43A 4NPBA 4MCUA 4O32A 2LRCA 2XBQA 3NOFA 3L9SA 4ECCA 3UJ1A 2CVBA 3VURA 3ZTLA 3LORA 4DSRA 4EF0A 1TRUA 1Z5YE 2DLXA 3MNGA 2G2QA 1YKCA 2K9FA 2I4AA 3GTUA 3IK7A 4PXOA 5GAPD 2L59A 1TOFA 1GTBA 4EDYA 3M9JA 1CQGA 4XCSA 1TRVA 2C0GA 3KCMA 1MDKA 2ON5A 1V58A 4FYBA 3GFKA 3TKSE 3P90A 3IPZA 1WIKA 2H6ZA 1ST9A 5DJLA 1K0AA 4ZB6A 4I2TA 1EEJA 1ZZYA 3O6TA 2VAFA 2IFQA 3FR6A 2H01A 1U6TA 4L8EA 2DMLA 5A5KA 2FD3A 2GT5A 2L57A 2LSTA 1SL2B 5F06A 2PUKC 3BOAA 3EU3A 1M7TA 3TOUA 1M2BA 2X8GA 4POKA 4ZBDA 2QSIA 4PGTA 4V1Ag 2LJAA 4PQIA 3CRUA 2RLIA 5HFIA 1OKTA 3RHCA 1VRSD 2O8VB 2AYTA 1THXA 3EC3A 3TJFA 3TJJA 3TJGA 5ECNB 3CMIA 4CW9A 3GSSA 3CSJA 1O7UA 3TDGA 2WFCA 2K6VA 3L0HA 1WWJA 2EIRA 4L0UA 2XPEA 5JCGA 4BVYA 3HDCA 3D6IA 1ZL9A 3C1RA 1Q4JA 2QGVA 4HOJA 1FW1A 5CRHA 3GKKA 4AJ6A 2I9HA 1G0TA 3WT1A 2FUG2 2C3NA 3W8JA 2ES7A 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