4D73 | Genus

Total Genus 61

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	61
sequence length	180
structure length	171
Chain Sequence	IKENDLIPNVKVMIDVRNMNPNDFTSIDTHELFNNKKILLISMPGAFTPTSTKMIPGYEEEYDYFIKENNFDDIYCITNNDIYVLKSWFKSMDIKKIKYISDGNSSFTDSMNMLVDKSNFFMGMRPWRFVAIVENNILVKMFQEKDKQHNIQTDPYDISTVNNVKEFLKNN

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Plasmodium Falciparum Antioxidant Protein Reveals a Novel Mechanism for Balancing Turnover and Inactivation of Peroxiredoxins pubmed doi rcsb
molecule keywords	1-CYS PEROXIREDOXIN
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Plasmodium falciparum
total genus	61
structure length	171
sequence length	180
ec nomenclature	ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date	2014-11-19

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF08534	Redoxin	Redoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4d73A00

1OKTA 2KOKA 4V1Ap 4EDZA 3TKQA 2JSYA 2P5QA 3DD3A 4KH7A 1YKCA 4MPFA 1ERUA 3HY2A 1U3AA 1G0TA 3HHVA 1SL0B 2L6CA 5EL8A 2B5YA 2E7PA 1GH2A 3DIEA 4XS4A 5E59A 2OE1A 4V1Ag 4HS1A 2WB9A 3ME7A 3ME8A 2E0QA 3GRXA 1FB0A 2XBQA 1KEBA 3HJOA 1TW9A 1QGVA 2K9FA 1LBKA 1PX7A 4KGIA 4TR3A 2K8VA 2V2GA 2B7KA 1N2AA 1Z5YE 2LV3A 3WT1A 1PGTA 5DJMA 1TU8A 3GSSA 4PNGA 1XPVA 1YQ1A 3UJ1A 1XCCA 1K0OA 5JWQB 1V9WA 3A5WA 4BWQA 5J4UA 4V2NA 3ED3A 2CVBA 3FR3A 4MF7A 1K3YA 5ECKB 2C0FA 2CA8A 2VCQA 3VLNA 2J23A 2ON5A 3P7XA 4FO5A 3J7Yk 4EE0A 2C4JA 1XXUA 4HQSA 5LCZA 3ZVJA 3Q19A 5C00A 2K8SA 5ENUA 1YDKA 5B6NA 5A4UA 2C8UA 3M9KA 4ZIJA 3D4TA 1KNGA 2CZ3A 4XIHA 5IIZA 4K0GA 2VCWA 3Q18A 3KTLA 2O7KA 2CAQA 5AIXA 3CBUA 4ML1A 1ILOA 1N8JA 3MNGA 4WKWA 4IQ1A 2VCTA 5IPHA 5IQYA 2D2ZA 2R2JA 1TXXA 3ZIVA 2P5RA 3P2AA 1ERVA 2C3TA 2P0GA 4JEDA 2ZNMA 5DQSA 1EV4A 3FK8A 3UBKA 1XVWA 3VURA 2C0EA 5F05A 4XS1A 4F0BA 1F3BA 2H75A 5HFKA 2VL2A 3SBCA 2B1KA 1T1VA 1J08A 4MZBA 2GZYA 5LD0A 2GS3A 1AC1A 1EOGA 6GSSA 1K3LA 2KP2A 3HCZA 2O8VB 1CQHA 1PN9A 5D9VA 19GSA 5F06A 1QFNA 4ZB6A 4WEYA 5B8AA 2X99A 3GIXA 5DAKB 3GH6A 2HZEB 1SKRB 3EINA 1R7HA 4ZILA 3PH9A 1SD9A 2H66A 1GTUA 2YP6A 5IMFA 3I43A 4TVEA 2LJKA 5G5FA 1C72A 3APQA 2NVLA 1RQMA 1JZDA 4I5QA 1JZOA 2C80A 2E2MA 3M1GA 2R3XA 3HDCA 4OCFA 4MPGA 3KZQA 2VLVA 3CXGA 4IKHA 1YY7A 1HNCA 3IR4A 3US3A 4ZL9A 2PUKC 3VPQA 2FCHA 1M2DA 1MDIA 3LJRA 4RQRA 5ELAA 1V40A 2N5FA 1TI1A 3TJKA 1M2BA 3MDKA 1X9WB 3GURA 4Q5RA 3QR6A 2HLSA 4QL7A 4OFTA 6GSXA 1T4YA 5DCGA 1PL1A 4FYCA 1OKDA 2CV4A 4IJ3A 1QK8A 4DSSA 3P90A 3E3EA 2AHEA 1PRXA 1NM3A 4IGJA 4TR0A 3RPPA 5HR1A 4ECBA 3TKRA 3BOAA 3TDGA 3FRCA 3KIJA 4MJAA 3IA1A 4GLTA 1T7PB 2NTOA 2DMMA 3G7JA 2VIMA 3CRTA 4TR4A 4Q5QA 2GQLA 1XZOA 5DALA 3WGEA 1OC3A 2OE3A 2L5LA 5E4WA 1A2MA 3UVTA 1SKWB 2DLXA 1SK2A 4X43A 2FNOA 2DJKA 2H8LA 4PUAA 4HZ2A 1WIKA 2HSYA 4MZWA 4KX4A 2GVPA 1I5GA 2AUVA 4LLRA 4KDUA 1O85A 1LJRA 2MMZA 1YZXA 3RBTA 1AIUA 1X9SB 3ZMKA 1WJKA 11GSA 2FA4A 2DJJA 5KEJA 2HNLA 4RI7A 1EZKA 1TKDB 1AXDA 2TIRA 5ECNB 3GMFA 4GCIA 4ACSA 2RLIA 2YPMA 1VGLA 2REMA 1YEXA 3IAM2 2PERA 3C71A 22GSA 4FH8A 3TGZA 1O73A 1UN2A 3TRPA 5CREA 2DJ1A 5D93A 3IOSA 4WF5A 2AB6A 4POBA 4TOPA 5H5SA 4I97A 3APOA 4ZBDA 1I9DA 4TW5A 1K0MA 3H93A 2WULA 2M80A 4K7IA 3TKPA 3F4TA 1QQ2A 5DVBA 6GSTA 3QFBC 3ERFA 1GTAA 5C04A 3BCKA 2H72A 1XBSA 2IMDA 3WGXA 2V32A 1O7UA 1WPIA 1S3CA 4KDYA 2WJUA 1AAZA 4BPYA 6GSUA 3FYGA 1KBNA 4PX1A 3UARA 4XRDA 1JZRA 4GF0A 2IPAA 1M9AA 5KN3A 5IMVA 2IMFA 2RIIA 4KAEA 2XPEA 1ML6A 2X64A 4OCEA 3UL3A 1Z7RA 1W89A 4K9ZA 3DRNA 4IP1A 3L0HA 4CW9A 2P31A 2XPDA 3H1NA 2K18A 1BEDA 1R26A 2FWHA 2PPTA 3FR9A 2GT6A 3ZFLA 2CZ2A 4TRXA 1A24A 2B5XA 4KCAA 2KP1A 2DMLA 2GQMA 3F0IA 3GKXA 5GAND 2V6OA 4GQFA 3CSHA 1QMVA 3TOUA 1X9MB 3QFAC 1W4VA 2FA8A 4YQMA 2WZ9A 3LXZA 2VUPA 3LSZA 4MDCA 4F0CA 3ZIJA 1U6TA 2MZCA 1TK0B 1A2JA 5KN1A 2MMNA 2N5BA 3MSZA 1EWXA 4X0XA 3ZYWA 1GLQA 1XWCA 2LJAA 4YQVA 1V57A 3FZ9A 1ON4A 1OE8A 3DVWA 4OO5A 1K0AA 3EYTA 4BL7A 3DEXA 3F6DA 1O8XA 2PN8A 5IMZA 5H5RA 1GTBA 4AF2A 1GSYA 1EOHA 2NDOA 3VWUA 4IBPA 4IN0A 2IFQB 2FWFA 1EGOA 4NV2A 4MP4A 3LWAA 1TK5B 1V2AA 2JACA 1K3OA 3FZ4A 5GAPD 1O6JA 2CQ9A 3DMLA 5JCUA 4XCSA 5D9XA 3GKKA 4JBBA 1DBYA 1Z7PA 1ZOFA 5A5KA 1FOVA 3HZ4A 1U87A 3MAKA 4DSQA 1G7OA 4I6XA 1WMJA 3TKSA 1USBA 4PQ1A 4Z7XA 3LQ7A 5A4WA 1F2EA 5AGYA 1PKWA 2H0GA 3HVXA 3VWVA 3LYPA 4D73B 4MCUA 1K0CA 3HXSA 4WETA 2VCXA 2YWIA 4K7OA 3FZ5A 2GLRA 4QL9A 1XOBA 3ZLPA 5A4VA 3GFKA 1BAYA 3UBLA 2VAFA 1BJXA 1GUHA 1HYUA 5F0GA 5ECOB 1NHOA 5GSSA 2KLXA 4G10A 3UIWA 2H71A 2RM6A 3J7Yb 2AV4A 1HQOA 4J57E 1G6YA 2R37A 2FWGA 5ECHB 4RUVA 3EE2A 3VI5A 2HFDA 2VCVA 5ID2B 5CRHA 4OMVA 1GTIA 3WD6A 1QUWA 1RK4A 1OC8A 2VO4A 1PMTA 4K0NA 2R4VA 1B48A 3E0UA 1O8WA 3ERWA 1S3AA 1VF3A 3VPTA 3U5RE 5ABRA 1Z6NA 2JZSA 4YH2A 4TR1B 1IYIA 1OC9B 5D9TA 1V58A 1MD3A 3EURA 3DVXA 5G2ZA 1U3IA 3RHBA 2AYTA 1OYJA 1A8YA 1XFLA 4HJMA 3QMXA 1ZYEA 3LFLA 1G7EA 4XS4B 2CAIA 6GSWA 2OACA 4X1UA 4KA0A 4GSSA 1GSDA 1OAZA 2LRTA 4G19A 2IJYA 2DJ2A 3U6VA 3KTBA 2H19A 2H1BA 3W8JA 3M9JA 1UA5A 1M0UA 2G2QA 4LL4B 2M72A 2AAWA 2PBJA 1TDIA 4GSNA 4F03A 3LG6A 4EL1A 2FD3A 3OR5A 4PGTA 4DVCA 3DYRA 5IOWA 2N5AA 4MABA 1TTZA 1NW2A 4OO4A 1MTCA 2B5EA 5ELGA 1F3AA 3EWLA 2O89A 4P3YB 3TRQA 2H1DA 2O87A 3E9JB 2GQKA 4KB3A 3D0ZA 4TXOB 2HT9A 3SWLA 4HOJA 2AJQB 3R2QA 1X0RA 3GTUA 1F9MA 2KHPA 3QCPA 2WCIA 1ZL9A 3IDVA 4MZCA 4H86A 2I81A 4I2UA 3H8QA 2HI7A 3FY7A 3TCOA 3GNJA 3D22A 3ERGA 5FT3A 3KM6A 2E2GA 5D8IA 2ES7A 1A23A 3UEMA 4ID0A 3LGCA 3G9BA 4I2TA 2F51A 2DJ3A 4NWYA 4TXVA 3QPMA 4K7NA 5AIVA 4WF4A 4IW9A 1GNWA 2FWEA 2NPBA 1GSSA 1Y25A 4RQXA 3TKSE 1JFUA 3LEFA 2IMEA 5DQYA 3Q74A 4O5RA 4ECIA 5CRDA 4DEJA 4I8BA 3O3TA 5ECIB 2DJ0A 2VLTA 5IO2A 4ZL7A 4O92A 1AQVA 4K2DA 3QOUA 3C1SA 3HA9A 4K1FA 1E6BA 3HZ8A 1M9BA 2GGTA 1GULA 1MDKA 2PWJA 4HU7A 3CYNA 1NSWA 4IELA 2PVOC 2WFCA 2YN1A 5IO0A 3F63A 4F82A 20GSA 2I3YA 3IAS2 3VWWA 1Z9HA 2LNTA 1ZZYA 3TB2A 1MD4A 4E8EA 4NV5A 4KDXA 4KE3A 1R4WA 1EP8A 3KP9A 1WRYA 2IN3A 3TRXA 1EEJA 1H75A 4NAXA 5F07A 2KUCA 4EUYA 2GSRA 3FR6A 4POMA 1CQGA 4QQ7A 3GKNA 4IS0A 1XOAA 2PGTA 1AQWA 1OVNA 3CRUA 4IQAA 2TRCP 5AN1A 2WRTA 5IM9A 4FYBA 1BQ7A 1JZWA 1J9BA 3IRAA 3O6TA 1B4PA 5EVOA 1K0BA 4EVMA 3H79A 4BVXA 4YQUA 1YF0A 4EDYA 3TJJA 3D4MA 2F8AA 2LNSA 5CO3A 5G1KA 2JL4A 3IHQA 1XWAA 5J41A 1GSUA 5ECMB 3A2VA 1YEPA 1FB6A 4MH3A 5DJLA 4EKZA 1ERTA 4N0VA 4ZXGA 2I4AA 4XTSA 3KMNA 4J2FA 10GSA 2H01A 3GL5A 5EPFA 1YKAA 2L59A 4L5OA 3A3TA 4JRRA 2DIYA 5HFGA 2J9HA 3F3RA 3I9V2 4ZL8A 1TU7A 1SL2B 4CHSA 1PSQA 2GSSA 1TOFA 3L9UA 3IK7A 13GSA 1YF1A 1XVQA 2DSAA 3WT2A 1Z6MA 2HRFA 4GRFA 4GWRA 5B8BA 5CYYA 3FW2A 4N11A 2X8CA 2ON7A 2HE3A 5ECSA 3PINA 4ISDA 3W6GA 4NPBA 2QGVA 12GSA 2JZRA 1FO5A 1Z3EA 4L0UA 5DBQA 4PURA 3I69A 4BWSA 8GSSA 2G0FA 3FHKA 3KMOA 3GKMA 1XIYA 2GZZA 2YANA 2BJXA 1FVJA 4XRAA 2VL9A 5J9CA 3VFIA 1JLWA 1A0FA 2OBKA 4N10A 3K8NA 1SJ6A 3KH9A 2NBSA 1BYEA 1VRSD 4MF6A 2M46A 2GSTA 5DALB 1EEMA 1EP7A 2H1AA 2OKAA 4YAVA 3CTFA 2C3QA 2L4CA 3ZTLA 4POLA 3F4SA 5INYA 1TK8B 3F3QA 1GWCA 2JSZA 1TP9A 1FHEA 3W8SA 3ZL5A 5DDLA 5KN0A 14GSA 3ZZXA 3N9JA 3FEUA 1WWJA 2F9SA 1GL8A 3NIVA 3MWHA 3HYPA 4KW6A 1GUMA 1SYRA 5FWGA 5J5NA 3KP8A 2LEGA 3GN3A 1GNEA 3CMIA 2MMAA 4PQHA 1SENA 2DC5A 3QD9A 4Q5NA 2OADA 1DE2A 4BA7A 1VF2A 1F37A 4HI7A 2YV9A 2IMKA 3HJPA 3D6IA 1U88A 3D21A 2LRNA 2FLSA 3M3MA 3JCML 3F9UA 3Q6OA 5CRWA 5GZZB 2HRNA 2R5GA 4MJBA 1WOUA 2VD1A 4ML6A 1F6MC 1SU9A 2IMIA 3IC4A 3GA4A 1ST9A 3L78A 2C0DA 3QAWA 1XW5A 2B6MA 2H6YA 1AQXA 2XC2A 3QAVA 4WBRD 2H1GA 5HQPA 3P8WA 3GX8A 1FW1A 1B4QA 3ISOA 5J9BA 2XHFA 1ABAA 1GSQA 2CX3A 2F3MA 2JU5A 3DKSA 2RUEA 5IMCA 2OA7A 1O81A 2HXKA 3ZFBA 3CTGA 1WP0A 1SD8A 2PU9C 16GSA 3IV4A 3F8UA 3GYKA 4EF0A 3QDNA 3KGKA 1V98A 4FIWA 4HEA2 2EIOA 1A8LA 1THXA 5COHA 1SL1B 5ECPB 1DUGA 1GSEA 1R5AA 1UVZA 1BG5A 4MA9A 2MYGA 4F9ZA 4JU5A 5D73A 2LS5A 9GSSA 4KSMA 5DAKA 4L5LA 3TJBA 1VF4A 3L9VA 2HZEA 5IMAA 3HKRA 4EO3A 2GDRA 3HD5A 1QXHA 2H30A 1GLPA 4TXOA 6GSYA 3RDWA 2LJRA 3VK9A 2GSQA 4AJ7A 4ZB9A 3IE3A 4GXZA 2V1MA 4ULXA 4G9HA 2VOCA 2Z9SA 5CAXA 4AGSA 4L8EA 5B6MA 1GP1A 1T00A 2ZCTA 4E8HA 5ECQB 1THOA 2B3SA 4ECJA 3RHCA 2QSIA 1ZYQB 3GL3A 3BJ5A 1SJIA 1TJDA 2MMOA 3GX0A 1URMA 2VL2C 4LMWA 4HQZA 3I6AA 5JWOB 4MH2A 1NHYA 1M7TA 2FGXA 4O7HA 3EVIA 1K0DA 4HUAA 3TJFA 2YCDA 1FAAA 2OBIA 1B8XA 1MEKA 4IP6A 4OWYA 5DCHA 2C3NA 3DWVA 4ZB8A 2HYXA 4AJ6A 5CRGA 5IOXA 1TRVA 3CSJA 1SKSB 1EV9A 2V41A 1ZGNA 1Q4JA 2GTUA 1XWGA 2ALBA 2ZUPA 4L0WA 2YOIA 2JADA 2YZHA 6GSVA 1GSFA 2VD0A 2X8GA 1ZMAA 3FKFA 5B7CA 5HR2A 3A2XA 4K8MA 4LA1A 4O32A 4XS6A 2BTOT 4PQIA 4WXTA 2GT5A 1DSBA 3HVVA 2MBTA 3IK9A 4J56E 2WGRA 4NMUA 4CDOA 1M2AA 3EMXA 2LQQA 3L4NA 1S3DA 3BD2A 1E2YA 3PGTA 4ECCA 4LL1B 5JCWA 1JHBA 4AJ8A 1X5CA 4GQCA 4LMVA 3AY8A 2H73A 3D5JA 1LU4A 2YJ7A 3DXBA 4WR5A 1IYHA 2JZTA 4NHZA 2YJHA 3FZAA 1PKZA 2CT6A 5ECLB 3S9FA 3C73A 4NHWA 4GSTA 1FVKA 3H4KA 4G2EA 3VI7A 2X8HA 2K6VA 2YWOA 2OE0A 3HJMA 2VM2A 1GUKA 2B1LA 1X5EA 2BMXA 1FG4A 2VL3A 3LXTA 5JCGA 2A2RA 1BX9A 1TI3A 3WGDA 2H6XA 2EIRA 1SK1A 3GSTA 2IIYA 3BCIA 1H4OA 2CVKA 1A2LA 3EC3A 5G31A 3IBHA 1UC7A 4POKA 2HZFA 4PXOA 4DSRA 3L9SA 3DGQA 2C0GA 2IL3A 2XBIA 5CP1A 2L4QA 3NZNA 3PR8A 3ZVJD 1HNAA 2LTKA 3ZITA 2TRXA 1PL2A 3V1WA 2FHEA 2LKUA 2H70A 3IXRA 3WYWA 5IMDA 2QC7A 4EXJA 4MMMA 3ZREA 2LRCA 3O76A 4HDEA 2FY6A 2IWTA 2B7JA 2L57A 4V2LA 2YWMA 17GSA 3LORA 4JE1A 3KXOA 2HSHA 5HR3A 4KSOA 1JLVA 1PQNA 4OFNA 5HFIA 3IPZA 2QKEA 3VWXA 1PD21 3UOMA 3GV1A 3UAPA 2A4VA 3KD0A 1B9YC 2MBSA 5H5QA 4FYUA 4GTUA 1PA3A 2DBCA 1ACVA 1HNBA 5KN2A 1G6WA 5IPGA 3APSA 3GTUB 5ECRB 1GRXA 5L71A 5EY6A 1YJ6A 5F8BA 1K0NA 4PUFC 5GSTA 1OE7A 1ERWA 5G5EA 5LNKe 4KUNA 5G1LA 1T4ZA 1M99A 2WS2A 2LQOA 4PNFA 4ZBBA 1ZCPA 2DIZA 4RI6A 1T8EB 1SJZA 4N0ZA 2LSTA 2RM5A 5AISA 2H76A 3KEBA 3ZMLA 1HD2A 5G30A 2PMTA 2CVDA 4OFMA 1SYXA 5CNWA 1MDJA 2VCZA 2O85A 4JR4A 1Y6EA 3BBYA 4HZ4A 3M0FA 3C8EA 5HR0A 5FHIA 3CSIA 4TKYA 3KH7A 2IFQA 3KJYA 4V2MA 4MF5A 2WDUA 4MJCA 4ILFA 3NOFA 3C7MA 3HVSA 4IJIA 1R5PA 4DSSB 3ZRDA 2H0IA 1XWKA 4TN8A 3GH9A 2RUFA 3GHAA 4NXIA 1AW9A 2L6DA 4ZBAA 5JWRB 1SK0A 2H6ZA 1X5DA 2V6KA 1XW9A 2H0HA 2I1UA 4XHMA 2H74A 5D9WA 4EC0A 1PX6A 2FUG2 3A2WA 4WR4A 1KTEA 2R6KA 3TOTA 3RAZA 1AUCA 4WBJA 3EMPA 1DE1A 1RW1A 1VF1A 4D73A 4IVFA 4MK3A 1B9XC 4F2IA 4MJEA 2EIQA 7GSSA 1J0FA 2I9HA 18GSA 3G7IA 3GUSA 4YAPA 4OD7A 1XWBA 2F8FA 3LYKA 2VM1A 4JZQA 3RPNA 3C1RA 5D96A 3UVHA 1EGRA 2CX4A 3QAGA 4K6XA 2YV7A 2YWNA 2LUSA 1WE0A 1T3BA 1TRWA 3F4RA 4KNDA 4HU9A 3EU3A 2C1YA 4HJ2A 2VLUA 1A0RP 2L5OA 5ID2A 1TRUA 2OJLA 2GZPA 3TUEA 2PVQA 5J3RA 3KCMA 2EC4A 3EU4A 3N5OA 1Q98A 4JR6A 3F6FA 3TKSC 4KCEA 1XW6A 3M8NA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4D73A

Total Genus

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structure length

Chain Sequence

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Chord Diagram

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