4D73A

X-ray structure of a peroxiredoxin
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
180
structure length
171
Chain Sequence
IKENDLIPNVKVMIDVRNMNPNDFTSIDTHELFNNKKILLISMPGAFTPTSTKMIPGYEEEYDYFIKENNFDDIYCITNNDIYVLKSWFKSMDIKKIKYISDGNSSFTDSMNMLVDKSNFFMGMRPWRFVAIVENNILVKMFQEKDKQHNIQTDPYDISTVNNVKEFLKNN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Plasmodium Falciparum Antioxidant Protein Reveals a Novel Mechanism for Balancing Turnover and Inactivation of Peroxiredoxins
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Plasmodium falciparum
molecule keywords 1-CYS PEROXIREDOXIN
total genus 61
structure length 171
sequence length 180
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2014-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4d73A00
2L6CA 3ERGA 2JZTA 1AQVA 4E8HA 1U6TA 4TR4A 4MPGA 4MABA 4HQSA 2K18A 3UBLA 3VPTA 2MBTA 3D4MA 1GNEA 3TJGA 4HZ2A 1N8JA 3LJRA 2H0HA 1TTZA 2QGVA 1ZOFA 4D73A 1QGVA 2YWIA 3PINA 2L4QA 4F0CA 2VCWA 2HI7A 2YANA 1XWCA 1JZRA 4N11A 2DMMA 1GL8A 2DMLA 3HA9A 2C4JA 4GSSA 2LUSA 5ID2A 2FWFA 1M99A 4GQFA 5DALB 3GH6A 3VFIA 5DJMA 1XPVA 1XFLA 2MMNA 5C04A 1K3OA 18GSA 4YQMA 3L78A 2VM1A 2B5YA 5KN1A 2DLXA 5IO0A 2CZ3A 4NPBA 1WWJA 2WRTA 1WJKA 3L4NA 1NHOA 1SK2A 1ERTA 1K3LA 2C0GA 4K6XA 5ELAA 1V98A 4GQCA 2X8HA 3ZMKA 1RW1A 2LJRA 1X5EA 1EP7A 4ZILA 2F51A 5GZZB 5DAKB 1GWCA 3D6IA 2JSZA 1QMVA 3EINA 2KOKA 1LBKA 4OD7A 2IMEA 1GTIA 1V40A 1MTCA 4HU7A 4KSMA 2H0GA 2FGXA 1EOHA 1TI1A 1B9YC 1ILOA 4DSSA 4LA1A 1SKRB 3IDVA 5F06A 1OC9A 2VL9A 3QFAC 3GIXA 2VO4A 4MZCA 4TR1B 7GSSA 4ML6A 1ST9A 1Z7RA 3GX8A 1AW9A 3MNGA 4JBBA 1JHBA 1O7UA 4KH7A 4BVXA 3J7Yk 3P8WA 5A4WA 1V2AA 4O7HA 2ON5A 4NHWA 2H66A 2M72A 3WT1A 3V1WA 1PQNA 2WFCA 1GSDA 3M9KA 3KTBA 2LQQA 4IP1A 3K8NA 5D96A 1G6WA 4GSTA 2G0FA 2D2ZA 1PKZA 3IA1A 4RUVA 1PA3A 3DRNA 3J7Yb 3RPPA 1SU9A 3D0ZA 3FR3A 3TKPA 4ZB9A 5G1LA 1AIUA 4OMVA 1K0OA 3GURA 1QUWA 4EXJA 2LRNA 2MZCA 4XS4B 5KN0A 1BAYA 4ZL8A 2DIZA 1QFNA 3D4TA 3RHBA 3G7IA 5J4UA 1VF2A 2L5OA 2VL2A 2V6OA 3CXGA 4K7OA 3KGKA 2VCVA 3U6VA 1FHEA 3IC4A 2ES7A 4RI7A 2J9HA 5J41A 2GQKA 4L5LA 1LU4A 4WR4A 1YKAA 2HXKA 4Q5NA 1JFUA 4J2FA 3APSA 3KH9A 2CVBA 4CDOA 1OKTA 2VCXA 2IIYA 4GLTA 3TCOA 4NV2A 3HYPA 2LQOA 2MMOA 4ZL9A 1T4ZA 1EGOA 2DIYA 4PURA 1HD2A 2YPMA 1VRSD 2DBCA 4TVEA 3GL5A 2B6MA 1X9SB 4I6XA 5LCZA 4IS0A 1A24A 5ECHB 4POLA 3VK9A 2P5QA 1U3AA 3IBHA 2DJ2A 3LFLA 5JCWA 4PQHA 4NHZA 4KUNA 3TOUA 3APQA 3DWVA 3UOMA 3UVTA 2GT5A 2AV4A 4PQIA 4F03A 1ZCPA 3EWLA 2X99A 1O8XA 5D9WA 3KP8A 3MWHA 2RUFA 5ID2B 4X43A 4EUYA 4KDUA 3UIWA 4DSRA 2FUG2 3ZFBA 5J5NA 4EC0A 1XIYA 1ERVA 1G6YA 3TKRA 2OJLA 2GDRA 2C80A 1Z5YE 1A2LA 2V1MA 4XS1A 3ME7A 5F0GA 2L59A 4N0ZA 1PL1A 3L9VA 3CRTA 4ML1A 1NSWA 5IM9A 1EEMA 3A2WA 4IBPA 2P31A 4MA9A 4FYCA 1KEBA 1WRYA 2KUCA 1EP8A 3IV4A 1ERWA 5A4UA 5DJLA 2E0QA 4DSQA 3F0IA 3CSHA 1GH2A 3QOUA 4K0NA 2GSSA 5ECMB 4XHMA 4TXOA 1SENA 4PUFC 4QL7A 3HCZA 1LJRA 3D22A 5JCUA 2H30A 3GA4A 1M9BA 4V1Ag 1X0RA 4I5QA 5JWOB 4IVFA 5DCGA 1I9DA 4AF2A 4F2IA 2MMZA 3A5WA 3UAPA 2JADA 1E6BA 4YAPA 1DE2A 2B7JA 3ED3A 1K0NA 1OYJA 4IJ3A 1ML6A 2LNTA 13GSA 3GSSA 2WULA 1EEJA 1YQ1A 1TK0B 2VCTA 4PGTA 3GV1A 4MMMA 3Q19A 2GZZA 4ZL7A 3D5JA 2VAFA 1GUKA 1SJZA 2F9SA 4KAEA 3FZ4A 1X9MB 4GSNA 1DBYA 4TOPA 3VLNA 2N5FA 3LWAA 5KN3A 4QL9A 1C72A 1WOUA 3KP9A 2OBIA 4MP4A 1XOBA 5IMDA 5AGYA 2IMIA 4MLYA 4BA7A 1T00A 3H1NA 3FR9A 3CMIA 1GSUA 1F9MA 2K9FA 4PQ1A 1EZKA 2HSHA 5F8BA 2PU9C 2C3TA 1NM3A 4FYBA 1R7HA 4O32A 2LNSA 2O7KA 2FWEA 4EO3A 2A2SA 4LL4B 1T7PB 3BCKA 3Q74A 1EOGA 2R37A 2CVKA 3TRQA 3KXOA 3UL3A 4HEA2 5CRHA 2RIIA 2M80A 5A4VA 1XZOA 3TDGA 4LMVA 3PH9A 1SYRA 4WXTA 4N30A 3S9FA 1M0UA 4K7IA 1W89A 4F9ZA 1YF0A 1YEXA 5E59A 1B4QA 1MDJA 2AJQB 5D9XA 2B5EA 2VL2C 2MMAA 3TOTA 3C71A 4WF4A 5FWGA 1THXA 1GSYA 1K0AA 1Z9HA 3FEUA 2B5XA 1HNBA 4TR3A 1B8XA 1Y25A 1GSSA 3EURA 3NOFA 1GTBA 1XWKA 1JZDA 3ZMLA 3QFBC 1ZYEA 1JZWA 3O76A 3GKNA 4XRAA 3M9JA 5G31A 2XC2A 2V32A 2CX4A 5HFKA 3F6FA 3IK7A 1AQWA 2HZFA 3UARA 3LYKA 1FG4A 2PWJA 2XBQA 4F0BA 4V1Ap 1SKSB 2FA8A 4EDYA 6GSSA 3CYNA 3QR6A 1M9AA 5IOWA 1KNGA 2YWNA 1SJ6A 2EIOA 3DD3A 2HLSA 3PR8A 5AISA 2GQMA 1PRXA 4XS6A 3EU3A 1HYUA 2FWHA 2ZCTA 3F4SA 4K7NA 1WMJA 3W8SA 3EMXA 4OO4A 2OKAA 5H5SA 3DYRA 5G30A 1T1VA 5GSSA 4J56E 2ON7A 4YQVA 4WF5A 5ECSA 3GRXA 1MD4A 1PD21 4IN0A 3NIVA 2EIRA 2OE0A 2AB6A 6GSWA 2VUPA 2O85A 2B3SA 1FVJA 4N0VA 4FYUA 1FAAA 2CT6A 3HY2A 4TXOB 16GSA 2HZEA 1X9WB 1EV4A 2E2GA 2H6XA 1ZGNA 2TRCP 4MZWA 20GSA 1K0MA 3DKSA 5J9BA 1T8EB 1A2MA 3C7MA 2PVOC 1V58A 2I4AA 4RI6A 4G9HA 2N5AA 1GNWA 1YJ6A 2LEGA 3CTGA 4P3YB 2NBSA 4KE3A 1XW6A 3RDWA 1MDIA 1R5PA 4DVCA 4MCUA 2PUKC 3O3TA 2X8GA 1RK4A 1AUCA 3A3TA 4IELA 3QAWA 4KB3A 4G2EA 3HXSA 4I2UA 3IXRA 5IPGA 3TRXA 4MJCA 5HFGA 4V2MA 4NV5A 4GXZA 1TKDB 1I5GA 1A23A 4X0XA 2XBIA 2ZNMA 2LS5A 3A2XA 1GLQA 5CNWA 5ECOB 5F05A 1PN9A 1S3AA 3F8UA 3AY8A 9GSSA 3H4KA 2PBJA 4KX4A 1TI3A 2CX3A 3GN3A 2HRFA 3TRPA 2IFQB 3D21A 3FW2A 1XXUA 2XPDA 2OACA 1AAZA 2P0GA 4KCEA 1XW5A 1Q4JA 3KCMA 5F07A 4IKHA 4XRDA 3TGZA 2CAIA 4O92A 3HJPA 4BWSA 1BJXA 3UBKA 14GSA 3IOSA 4ULXA 3BOAA 3FHKA 3H93A 5J9CA 2GLRA 4HDEA 4ZBBA 2C8UA 3CTFA 1ACVA 1QK8A 4MF7A 1GLPA 4KCAA 1YEPA 4MH2A 3ZFLA 4XTSA 5DQSA 3KD0A 5GAND 3GTUA 2H1DA 1SKWB 4IP6A 4FIWA 1F3AA 4L0UA 3GKXA 1XWGA 2YZHA 2C3QA 5IMAA 5L71A 4K8MA 1SD9A 1X5DA 3QAGA 3ZLPA 3MAKA 1QXHA 2BJXA 3WGXA 2F3MA 1TDIA 3JCML 4POBA 1EWXA 1O81A 5GAPD 3HJMA 3IE3A 2CAQA 1MDKA 5EVOA 5E4WA 3TJFA 2I3YA 3FYGA 2AHEA 2L6DA 2C1YA 1VGLA 4G19A 3DEXA 4L0WA 3LQ7A 3KH7A 3I6AA 2REMA 2L5LA 3QCPA 2H6YA 1G0TA 2GGTA 3M3MA 4HOJA 1Z3EA 6GSYA 2HRNA 4D73B 3L0HA 4Q5RA 1XW9A 2JZRA 4JZQA 1JZOA 22GSA 2OBKA 4NWYA 5B8AA 3GNJA 3TKQA 1F2EA 4FO5A 4K9ZA 5KEJA 2YJHA 1SL1B 2FY6A 2OE3A 2X64A 3M8NA 1TU7A 2IMFA 3I43A 1Y6EA 2VCZA 3ERWA 1B9XC 4PUAA 3WT2A 2KLXA 1SJIA 2E2MA 5D9TA 2N5BA 1A2JA 3P90A 4MZBA 4G10A 5H5QA 1MEKA 2HZEB 2LRTA 1IYIA 1K0BA 2GSTA 2VL3A 3WYWA 2I81A 5JCGA 3QAVA 3F3RA 2BTOT 2LJAA 4JE1A 1USBA 1PX6A 1K0DA 1W4VA 5HR2A 5IQYA 3QDNA 1TK5B 1ZZYA 4AJ8A 4H86A 4MF5A 1HNCA 3VURA 4HUAA 1PGTA 4DSSB 1F37A 3W8JA 3IPZA 3L9UA 4HU9A 1YZXA 2H1BA 1OC9B 5JWQB 4RQRA 4X1UA 4FH8A 4MH3A 1UVZA 3FZAA 4V2LA 2LRCA 1SD8A 3ZVJA 1XVWA 2HYXA 2F8FA 2HSYA 2KP2A 1N2AA 1J9BA 1R26A 2V41A 1JLWA 4KSOA 2C3NA 2IMKA 3ZL5A 1GUMA 2YJ7A 1BYEA 2PERA 4OFTA 2VCQA 1ABAA 1TW9A 3SWLA 2O8VB 2WJUA 2DJJA 2H70A 3BCIA 4Z7XA 1AC1A 3TJJA 3GUSA 1TRSA 3QMXA 5G5FA 2R6KA 5HR1A 3TJBA 1M2AA 2C0DA 4YQUA 3DVWA 1FO5A 4HZ4A 4Q5FA 1R4WA 4EF0A 2JSYA 5B6MA 3H79A 2WDUA 4AJ7A 2LV3A 3LEFA 5G5EA 1TK8B 4TR1A 4IQ1A 3MSZA 3HJOA 3VWWA 2M46A 1EGRA 2YZUA 4ILFA 3EYTA 4PXOA 2WB9A 3LSZA 1BG5A 5DCHA 3ZTLA 1U88A 1PMTA 4KDXA 2K8VA 2H72A 5IPHA 2B7KA 1XWAA 2O89A 2K6VA 2IN3A 1GSEA 1FOVA 2H74A 2GTUA 3ERFA 3VWVA 3BJ5A 1TRWA 1BEDA 3C73A 3LYPA 4LL1B 1HQOA 1J0FA 2GS3A 4ECCA 1AQXA 3TB2A 1M2DA 2H8LA 5EPFA 2CQ9A 1CQHA 2CZ2A 3KMOA 5IMFA 3DVXA 4AJ6A 3QD9A 5GSTA 2GSRA 4MPFA 4K2DA 1SL2B 1OKDA 3ZIVA 1DUGA 3UJ1A 1TP9A 3VI5A 4O5RA 2C0EA 1UN2A 1DSBA 2YWOA 1YKCA 5ECQB 3Q6OA 2RLIA 5ABRA 10GSA 2FLSA 1ZYQB 4ECJA 3GHAA 3GL3A 5HFIA 3GMFA 4MJAA 11GSA 1GTAA 2PVQA 4NXIA 2LKUA 1XOAA 2DSAA 4ECIA 1BX9A 3EC3A 4WKWA 4KW6A 5INYA 3ME8A 2TRXA 5IMVA 3ZITA 3MDKA 4TKYA 2CA8A 3FKFA 3CSIA 5B8BA 3WGEA 3KMNA 3HD5A 3IR4A 4HQZA 2IL3A 1PL2A 1V9WA 4OFNA 1A0RP 1M2BA 1TXXA 3E0UA 1O85A 2YN1A 3W6GA 2H75A 2IWTA 3KZQA 4MF6A 4EE0A 2I9HA 2L57A 5IO2A 3P2AA 3VWUA 2Z9SA 5HR3A 3DIEA 4MJEA 5CRGA 3IK9A 2H6ZA 5B7CA 2IJYA 2OADA 2YNXA 1XWBA 4TRXA 5G1KA 2JU5A 4GF0A 1Z6MA 4TN8A 2FCHA 4MK3A 3U5RE 4WR5A 1SYXA 5A5KA 2I1UA 2OA7A 2H19A 2QKEA 1F6MC 1G7EA 1WIKA 1TRUA 2NPBA 4PX1A 1VF1A 4WETA 3FZ5A 4JU5A 5ENUA 2H71A 5B6NA 3QPMA 3RAZA 1X5CA 2PPTA 3P7XA 5AIXA 1SK0A 2PMTA 1A8YA 5ECKB 2QSIA 3IRAA 1XBSA 5IMZA 1YDKA 2VM2A 1U3IA 4I97A 3G9BA 4CHSA 3DGQA 2HNLA 1VF3A 3PGTA 3M0FA 3E9JB 3F63A 2AAWA 3N5OA 3I69A 3FRCA 3UEMA 3TKSE 3DMLA 3EMPA 4HJ2A 3RBTA 2F8AA 1UC7A 2IMDA 4ACSA 3VWXA 2FA4A 3EU4A 4L5OA 2GSQA 2B1KA 1OC3A 1B4PA 4IJIA 1DE1A 2WZ9A 1TRVA 1ERUA 1TU8A 4OFMA 3FR6A 3HVXA 4XIHA 2DJKA 4F82A 4POKA 4J57E 1F3BA 4JEDA 2FHEA 1NHYA 3C8EA 1V57A 3HKRA 5EL8A 4ZB6A 5CP1A 2AUVA 5CAXA 1TJDA 3HZ4A 3TUEA 1Q98A 3E3EA 3ZVJD 2VIMA 2H73A 5KN2A 4IQAA 1KTEA 3KEBA 2HT9A 5FT3A 5CRDA 5JWRB 3HVVA 4L8EA 3R2QA 3LG6A 2AYTA 1G7OA 5D73A 3O6TA 2XPEA 1Z7PA 3IAS2 4YH2A 5J3RA 2XHFA 4IGJA 4BWQA 1BQ7A 2RM5A 4ZB8A 3FY7A 2L4CA 4ISDA 2VD1A 2YV9A 3BBYA 4ID0A 1PKWA 4PNGA 3EE2A 3RPNA 2VLVA 5CYYA 3HVSA 5HR0A 2G2QA 1O73A 3EVIA 17GSA 2NTOA 3G7JA 2FWGA 2EIQA 2YP6A 2WGRA 5FHIA 3GX0A 2KP1A 4KGIA 1E2YA 1ZMAA 4NAXA 1RQMA 4JR4A 2LTKA 5ECLB 2H0IA 5EY6A 4K1FA 5D8IA 5ECIB 5IIZA 4TW5A 3N9JA 5HQPA 1PX7A 1ZL9A 4V2NA 2BMXA 1J08A 1VF4A 3A2VA 4XCSA 2FD3A 4KNDA 3KTLA 2DC5A 3UMAA 1H75A 3TKSA 3ZYWA 1H4OA 3TJKA 5COHA 4TXVA 1IYHA 2RUEA 4TR0A 2VOCA 3VI7A 2YOIA 2V2GA 5LD0A 1O6JA 5DVBA 3NZNA 12GSA 2GZYA 1K0CA 1XCCA 1B48A 3ZRDA 4JRRA 4IHUA 1GUHA 4I2TA 2E7PA 5ECRB 2C0FA 2LSTA 5ECPB 2H76A 3LGCA 3F4RA 1M7TA 2OE1A 1YF1A 3C1RA 3GKKA 1S3DA 4CW9A 4QQ7A 5LNKe 4WEYA 2NVLA 1THOA 4KA0A 1OE8A 3F6DA 4YAVA 3LXTA 6GSUA 1OAZA 1T3BA 3F9UA 2VD0A 4MDCA 3OR5A 1JLVA 1EV9A 1FB0A 4DEJA 3C1SA 3KJYA 2YCDA 3GYKA 1OC8A 1KBNA 5CRWA 4ZBAA 3DXBA 4AGSA 1GRXA 4PNFA 2LJKA 2R5GA 3WGDA 5ECNB 4BPYA 2RM6A 3GFKA 1URMA 5CO3A 4ECBA 2PN8A 1GP1A 5DALA 3ZIJA 2A2RA 4GWRA 3Q18A 2TIRA 1GSFA 2DJ1A 6GSTA 4ZBDA 3F4TA 3UVHA 2R3XA 2JACA 1R5AA 2ALBA 1YY7A 1WE0A 3FK8A 2EC4A 5DQYA 4N10A 4LMWA 1T4YA 19GSA 5DAKA 4ZIJA 1O8WA 4OCFA 4OO5A 1PSQA 1AXDA 5IMCA 2FNOA 3CSJA 2A4VA 3KIJA 5DBQA 1FW1A 4LLRA 2DJ0A 2JZSA 5C00A 4I8BA 3L9SA 2YWMA 3SBCA 2R4VA 2HFDA 2VLUA 2H1GA 3IAM2 2CV4A 4EVMA 2GT6A 3VPQA 2MBSA 4BL7A 4EL1A 3G7YA 2J23A 1FVKA 2P5RA 1K3YA 5DDLA 2IPAA 4K0GA 1SK1A 3WD6A 3FZ9A 2HE3A 2GQLA 3US3A 4WBJA 2DJ3A 1QQ2A 3GSTA 3HDCA 6GSVA 4HJMA 4HI7A 2ZUPA 4POMA 3LORA 2NDOA 2GZPA 1S3CA 4GTUA 3ZZXA 2CVDA 5AIVA 4MJBA 5G2ZA 4NMUA 4KDYA 1GSQA 1A8LA 1OVNA 3GTUB 2O87A 3F3QA 2PGTA 3M1GA 3HHVA 4WBRD 2MYGA 4RQXA 3GKMA 1MD3A 2IFQA 4XS4A 1Z6NA 4BVYA 4OCEA 3HZ8A 2V6KA 4Q5QA 2H1AA 2H01A 2YV7A 3GH9A 5IOXA 3APOA 3KM6A 1WPIA 5ELGA 2R2JA 3ZREA 4OWYA 1UA5A 2KHPA 2K8SA 2VLTA 3H8QA 4EDZA 5CREA 4IW9A 1NW2A 1WP0A 2JL4A 5D9VA 3I9V2 5H5RA 4ZXGA 1SL0B 2QC7A 4GCIA 3IHQA 1TOFA 2WS2A 8GSSA 4E8EA 3LXZA 5AN1A 3TKSC 1HNAA 2WCIA 1CQGA 5D93A 1GULA 3ISOA 1U87A 4GRFA 3BD2A 2GVPA 3CBUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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