4D73B

X-ray structure of a peroxiredoxin
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
175
structure length
170
Chain Sequence
DLIPNVKVMIDVRNMNNISDTDGSPNDFTSIDTHELFNNKKILLISMPGAFTKMIPGYEEEYDYFIKENNFDDIYCITNNDIYVLKSWFKSMDIKKIKYISDGNSSFTDSMNMLVDKSNFFMGMRPWRFVAIVENNILVKMFQEKDKQHNIQTDPYDISTVNNVKEFLKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Plasmodium Falciparum Antioxidant Protein Reveals a Novel Mechanism for Balancing Turnover and Inactivation of Peroxiredoxins
pubmed doi rcsb
molecule keywords 1-CYS PEROXIREDOXIN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Plasmodium falciparum
total genus 57
structure length 170
sequence length 175
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2014-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4d73B00
4BL7A 1TOFA 3FK8A 1DSBA 3PH9A 3TKSA 3QAWA 2TIRA 1R5PA 2K6VA 4MF7A 4N0VA 5JCWA 3HJOA 1SYXA 2VL2A 1W89A 4JBBA 2GSQA 4E8HA 3W6GA 3L9UA 5DCHA 1A0FA 1M99A 1R7HA 1NHOA 1TI1A 4MMMA 4GSNA 3BJ5A 4YQUA 4OFNA 1F9MA 4YQMA 10GSA 2IFQA 1O6JA 2IIYA 2NDOA 1FB6A 1TK8B 1ABAA 4KB3A 5DJLA 2P0GA 2O7KA 2YZUA 2VM1A 2WFCA 3ZL5A 4WXTA 2OE3A 5IMZA 2LJKA 1F6MC 1YEPA 5KN2A 3N5OA 4PGTA 4TRXA 1QXHA 1TU8A 5CO3A 3IDVA 4WF4A 5D73A 2IWTA 2GSTA 3G7JA 1GLQA 1U6TA 3P2AA 2H66A 5KN0A 3GNJA 2GGTA 3RPPA 2B5YA 4PNFA 1T4ZA 4MZWA 1BEDA 4MA9A 5IMFA 4IQAA 3VLNA 4IW9A 3LJRA 4IP6A 3VURA 4MJCA 4K6XA 4K7OA 4NAXA 2CA8A 3CSJA 1ZMAA 5B6NA 2YNXA 2EIRA 2LTKA 4DEJA 3C1SA 3TRPA 1WPIA 1V40A 2YV9A 1LBKA 1F37A 2HZEA 1MDJA 2HLSA 3VWWA 3WT1A 1XW9A 1TKDB 3RDWA 2JSYA 5E4WA 6GSYA 1SKRB 5A4WA 2VCQA 2OA7A 4TKYA 3TJFA 4KE3A 3GV1A 4WETA 2P5QA 5AGYA 1YKAA 3TRXA 1VGLA 2JL4A 1TRSA 2BMXA 1SK0A 4X1UA 1YKCA 3F4RA 4KDYA 1C72A 3ZITA 6GSWA 1T3BA 1TP9A 1TRVA 5CNWA 5ECNB 2FNOA 2DMLA 2DBCA 2VCZA 1AIUA 4YQVA 3M9KA 2R4VA 2X8CA 2L5OA 1SL1B 2AV4A 5F05A 3IAM2 3TJKA 5JWQB 4HEA2 3QMXA 1URMA 3P8WA 3C71A 1X5EA 3QD9A 2HRNA 1GNWA 4FH8A 5D8IA 4I5QA 4NMUA 1CQHA 4KDUA 3SWLA 3RAZA 4KSMA 1ZGNA 1AW9A 2MMZA 4RI6A 5D9WA 3VWXA 2JZRA 1MDKA 3GL5A 3IK9A 3FZAA 1YZXA 4NPBA 4ZBDA 2K8VA 1MD3A 4EC0A 2ON7A 1XIYA 2F51A 2K8SA 2B3SA 3VI7A 3HA9A 3EVIA 1IYHA 2YWIA 2WCIA 4NHZA 1XW6A 5DVBA 2H19A 1XWBA 4PUAA 4XHMA 2CVDA 11GSA 2WJUA 3LORA 1U3IA 1UC7A 4V1Ap 4F9ZA 2X8HA 3VFIA 2L4QA 1MD4A 4V1Ag 4NXIA 2CV4A 3GSTA 2QKEA 1U3AA 2LRCA 2VL3A 5CRDA 5C00A 4BWSA 1AAZA 3C8EA 4EKZA 2AHEA 3VI5A 5G31A 1GH2A 2H0GA 3QFAC 4YAVA 1AC1A 5B7CA 1UVZA 3F9UA 2WULA 3UARA 4G9HA 3TKSC 3ZIJA 1S3DA 2CX4A 2GSRA 2ALBA 4L5LA 6GSXA 2C0EA 1K0DA 2GT5A 4N10A 2OKAA 2VCTA 5JWRB 3O6TA 1JLWA 2P5RA 3IC4A 4PNGA 3UL3A 2G2QA 1E6BA 1DE1A 3Q18A 3I9V2 5AIXA 4CW9A 3L4NA 1EV4A 3BOAA 2HSYA 17GSA 3C73A 1WIKA 1YJ6A 4LMWA 4TN8A 2O87A 2VD0A 1A2MA 3KMOA 1WWJA 1A2JA 2B1LA 1V2AA 4GWRA 3DWVA 4XRDA 2GDRA 4Q5QA 4K8MA 1B8XA 2OJLA 1EEJA 3DIEA 4ZILA 5ABRA 2YPMA 4KUNA 4TR4A 3KCMA 1GLPA 3CMIA 2HXKA 3KXOA 1NSWA 3H4KA 3TB2A 1WMJA 3KMNA 5F0GA 3A5WA 3M1GA 4EVMA 1S3CA 5DCGA 3TKPA 2V6KA 1V9WA 2VL9A 4MPFA 5G5FA 3AY8A 3GHAA 1T8EB 1T4YA 16GSA 3LYKA 3GMFA 3LG6A 1QFNA 3PINA 3EC3A 1JZOA 2Z9SA 1A2LA 1O8WA 5HR1A 2IL3A 3APSA 3GKNA 1SENA 2H6YA 3LSZA 3CRTA 5ECHB 2TRCP 3GYKA 3G7IA 4JU5A 4JEDA 5HQPA 4POMA 4AJ7A 1EOGA 2P31A 1WRYA 3KJYA 3QR6A 1O73A 4EXJA 2H72A 4XCSA 2AJQB 3UVHA 2H76A 4MABA 2CQ9A 1YQ1A 1Z6MA 2HI7A 4BA7A 1XPVA 4RI7A 3QAVA 2JADA 2FUG2 4EDYA 2LRTA 4HUAA 5ECIB 1SJIA 3PR8A 1A0RP 3QCPA 1EZKA 4D73A 3LFLA 5LCZA 3TOUA 3UJ1A 3ZMKA 4KDXA 1SKSB 2H71A 1K0OA 2C3QA 1ST9A 2KP2A 4MCUA 3FW2A 4FO5A 5EL8A 4WEYA 4ECCA 5A4UA 4KGIA 4WF5A 1X5DA 1TU7A 2AUVA 3HZ4A 4MF5A 1AQVA 4X43A 4I2UA 1U87A 4MK3A 4HU9A 3KM6A 5COHA 2CZ3A 1XCCA 4HJ2A 1YY7A 3GSSA 4TW5A 4KSOA 2FA8A 3I43A 1PN9A 5ECOB 4WR5A 3FZ9A 1JZDA 3KTLA 4TOPA 2IJYA 4EO3A 3GN3A 4FYUA 4ECBA 4EF0A 1PRXA 2MMOA 4EDZA 3HCZA 2IPAA 2I9HA 2MMAA 1G6WA 1QMVA 3LQ7A 4HJMA 4J56E 1LU4A 1V58A 1HNAA 2FHEA 3IV4A 4ISDA 1T1VA 1YEXA 1PD21 3TKRA 1J0FA 3UMAA 5AISA 1OVNA 4ZB6A 4TR3A 1G0TA 1EV9A 2H75A 2V41A 4MLYA 2HE3A 4PQIA 1OKTA 2HNLA 4IN0A 3ZYWA 3JCML 1KBNA 3H79A 1M0UA 3KTBA 1GSYA 3NZNA 1OAZA 4ULXA 2PGTA 4OWYA 1OC9B 3HVVA 3MWHA 4WBRD 1H4OA 3UBLA 1R26A 4XTSA 3GUSA 1Q4JA 5A4VA 2NBSA 4ZL7A 3HHVA 2R3XA 8GSSA 2XPDA 1RQMA 3R2QA 5ECMB 1TK0B 1XXUA 1QQ2A 4K7NA 3GX8A 3RBTA 2HYXA 3QOUA 4OFTA 2WB9A 1PL1A 1R5AA 5J3RA 2QSIA 1HNBA 4MDCA 4QQ7A 3GH9A 4DVCA 6GSTA 4MJEA 2DJKA 6GSVA 4OCFA 5IMVA 1PA3A 1X9WB 1PX7A 1ZZYA 1THXA 2LUSA 3F6DA 4PUFC 4OO5A 2RLIA 2CT6A 3KP9A 4IVFA 3VWUA 2DIYA 2OE0A 2LQQA 4I2TA 2IMFA 5GAND 1F3AA 4K9ZA 5IQYA 4BVXA 4OO4A 2EC4A 3ZREA 5B8AA 1FVKA 6GSUA 4G10A 2DSAA 5JWOB 4IS0A 2NVLA 4MH2A 4K0NA 1ERVA 3UBKA 1B4PA 3J7Yk 1AQXA 2JZTA 1YDKA 2WDUA 1VF1A 4QL7A 3UEMA 5G30A 4FYCA 1SU9A 1MEKA 4F0BA 2YP6A 2I3YA 2N5BA 3G9BA 3DD3A 2IMDA 3TUEA 5IIZA 2DJ0A 3VPTA 1OE8A 4O32A 1S3AA 2GS3A 4ZB8A 3ZIVA 3GURA 2E0QA 3F6FA 1AQWA 1SYRA 1HD2A 3QDNA 5DAKB 1RW1A 5HR0A 2YWNA 4I8BA 1FOVA 4AF2A 1GULA 4MF6A 1GTIA 1X5CA 3CXGA 1PL2A 3A2XA 22GSA 5D9VA 1I9DA 3D4TA 4F03A 1A8LA 3GL3A 4AJ8A 1SK2A 2XHFA 3W8SA 5ECPB 1RK4A 3E0UA 1TTZA 2XC2A 5ECQB 5GAPD 2MBSA 3HVSA 3HDCA 1T7PB 1A8YA 2FWHA 3HJMA 1QK8A 1R4WA 1ML6A 2H8LA 5ENUA 3ERWA 1X9SB 2HT9A 2H73A 2M80A 19GSA 3BBYA 3DVXA 5JCUA 4NV2A 5D9XA 4HZ2A 5ECRB 1Z9HA 3Q6OA 4DSSB 2ZNMA 1XFLA 1T00A 2R6KA 1GUKA 2C3TA 5EVOA 2YV7A 4ML6A 2AYTA 3IK7A 1PX6A 3GA4A 2CAIA 2FD3A 4GXZA 5H5QA 3GKXA 2LQOA 4IP1A 1TRUA 5GSSA 4ECIA 1XVWA 2X99A 1O8XA 3EYTA 1JHBA 1TW9A 3C1RA 4EE0A 7GSSA 1EP8A 2LV3A 4PQHA 3APQA 1GL8A 1XW5A 2AAWA 1A23A 2HRFA 2HZFA 1Z5YE 2M72A 18GSA 2IMIA 2YJHA 4GCIA 4MZCA 3ME7A 4F0CA 3LXZA 4TR1B 4HDEA 5H5RA 4F2IA 4GSSA 3ZVJA 2N5FA 5LNKe 4ZBAA 5J9CA 5ELGA 3UVTA 4O92A 1Y25A 4MH3A 2VOCA 4YAPA 3EWLA 1GUMA 2N5AA 4G19A 4NHWA 4ZIJA 1HNCA 3D6IA 4L8EA 3IBHA 1K0AA 2B1KA 2GQMA 2ZUPA 2H0IA 1E2YA 5DBQA 3OR5A 4XS4B 3M8NA 4PX1A 3ZLPA 5CAXA 1LJRA 4KNDA 2OBKA 2AB6A 3HZ8A 3GKMA 4TXOB 5J5NA 4BPYA 4KH7A 2D2ZA 2RUEA 4JZQA 5J9BA 4DSQA 5DDLA 2C80A 4IQ1A 3TJGA 2HSHA 3HXSA 4P3YB 5HFGA 2VLTA 4QL9A 1BX9A 2PBJA 1K3OA 3MAKA 5D96A 1EP7A 2FGXA 1J08A 20GSA 3LWAA 1Q98A 5HR2A 2GQLA 12GSA 1NHYA 5HFIA 2F9SA 1THOA 3IRAA 3RHBA 3APOA 4KCAA 2DLXA 1XZOA 2EIQA 2VM2A 3EU4A 3M3MA 3GRXA 4GQFA 3G7YA 1Z3EA 4POBA 4V2NA 1ERWA 1EWXA 1GSEA 4IGJA 2XPEA 4G2EA 3U5RE 2WGRA 3EURA 2F3MA 4ILFA 5ID2B 2KUCA 1GNEA 4LMVA 2RM5A 5F07A 4WR4A 3ERGA 1PQNA 2DMMA 5DQYA 3HYPA 5HFKA 2J23A 1ERTA 5GZZB 1MDIA 4ID0A 5CREA 1GWCA 3GTUB 1QGVA 2VUPA 2VO4A 4JR4A 2YZHA 2QGVA 2LNSA 3ZRDA 2LEGA 4POLA 3IXRA 2I81A 2CX3A 3FRCA 3LGCA 1SK1A 2BTOT 4GLTA 5AIVA 2WZ9A 2HFDA 2TRXA 4HS1A 4PURA 1FHEA 3WT2A 2L5LA 4GTUA 2I4AA 5FT3A 2YCDA 2DIZA 3EU3A 2NTOA 2B6MA 3E9JB 5D93A 2L57A 1ZCPA 4ZL9A 3EE2A 2F8AA 13GSA 3ZFBA 4WBJA 4GSTA 1G6YA 3TKSE 1FW1A 3UOMA 1JFUA 3FKFA 4LL1B 3CTGA 2BJXA 5IM9A 3GH6A 1PMTA 2DJ1A 1OE7A 2V1MA 5CRWA 3TJJA 2CZ2A 3HVXA 1CQGA 1PSQA 3F0IA 3DRNA 3KP8A 3Q74A 1OC9A 3CBUA 4HOJA 1ZL9A 4PQ1A 3IA1A 1SJ6A 1AXDA 1V98A 1K3YA 1ON4A 2IMKA 2OBIA 4V2MA 4POKA 5IMCA 5ELAA 5IOXA 5EY6A 5IPGA 1BJXA 3CRUA 4IJIA 2ZCTA 3IOSA 2OACA 2PMTA 3F8UA 2LS5A 1TI3A 3K8NA 5J4UA 4KCEA 5CRGA 2DJJA 4ECJA 1O81A 2ON5A 4RQRA 1X9MB 3SBCA 5DALB 2CVBA 1SD8A 2V2GA 1JZWA 2KP1A 1USBA 3D21A 4BWQA 2GSSA 2E2MA 3NIVA 1ILOA 1I5GA 4IELA 2FCHA 1GUHA 4TR0A 1WOUA 1IYIA 2GQKA 1QUWA 4Q5RA 1M7TA 2F8FA 5C04A 3LXTA 2OE1A 2R37A 3EMXA 3TKQA 1NM3A 3TOTA 1U88A 4FYBA 3ZMLA 4X0XA 4Q5NA 5B6MA 3VWVA 2GZYA 4K7IA 1GRXA 1HYUA 1XOBA 2L6CA 5IO0A 3FHKA 5IPHA 4GF0A 4L0UA 3ZZXA 1J9BA 2PU9C 2PERA 2E7PA 4ZL8A 3Q19A 1Z6NA 4OFMA 4HU7A 2YWOA 3I6AA 1O85A 5EPFA 1PKWA 1Z7PA 3V1WA 1K0BA 1K0MA 1VF2A 2I1UA 2VD1A 2H70A 3J7Yb 3GIXA 2LNTA 3HJPA 3FR6A 2VLUA 5F06A 5DAKA 3QAGA 2H1DA 1GTAA 1VF4A 3HY2A 14GSA 2MZCA 4K2DA 2XBIA 2PPTA 2VIMA 5IOWA 3A3TA 2MBTA 5GSTA 4I97A 3ERFA 2H74A 5HR3A 2DC5A 3WGXA 4ZBBA 3KD0A 1XVQA 4J57E 2VCVA 5G2ZA 3LYPA 6GSSA 2YOIA 2L6DA 3FY7A 1SKWB 1GP1A 3ED3A 1PKZA 2XBQA 4JRRA 1Y6EA 4JR6A 5KN1A 1B9YC 2GVPA 3RHCA 2IMEA 4CHSA 1DUGA 2C0GA 5CYYA 3UIWA 4OD7A 4J2FA 4N30A 1M9AA 1BYEA 2C1YA 3KIJA 4DSSA 1ACVA 3KH7A 1GTBA 4IKHA 1Z7RA 2PUKC 4ML1A 3M0FA 2IFQB 1KNGA 4LA1A 1K3LA 4AJ6A 2K18A 2M46A 1FO5A 1JZRA 3BD2A 1KTEA 3DXBA 2L4CA 4KW6A 3MNGA 3FYGA 3N9JA 2ES7A 2C4JA 4MZBA 1XWGA 3CTFA 2V32A 1EGRA 3A2WA 1SL0B 3DVWA 1SJZA 3FZ4A 2A4VA 3H8QA 4TR1A 5ECSA 4V2LA 1TJDA 5AN1A 2GZZA 2OADA 3I69A 3W8JA 1B48A 3O3TA 1FG4A 1DBYA 1SL2B 1OKDA 4EL1A 2X64A 4YH2A 4N0ZA 2YJ7A 1FB0A 2QC7A 1EGOA 5E59A 1TXXA 2C0FA 3BCKA 4L5OA 3TGZA 1UA5A 1UN2A 2HZEB 2H01A 3QPMA 4K1FA 3IR4A 1WJKA 2YWMA 5ECKB 1ZYQB 4ZXGA 4MPGA 3IE3A 1BAYA 3TDGA 2VCXA 4WKWA 2RM6A 3D5JA 3RPNA 2H1GA 2MYGA 4K0GA 3HKRA 3L0HA 5DJMA 4XS4A 1GSDA 2C3NA 1G7EA 1N8JA 2R2JA 1M2AA 4EUYA 3EMPA 3IPZA 5L71A 1GSSA 4TXOA 1FAAA 3FEUA 3FZ5A 3H1NA 4ZB9A 4JE1A 2O85A 5CP1A 1XWAA 3NOFA 3TRQA 2YN1A 3KEBA 3BCIA 3WD6A 2LSTA 2VAFA 1TRWA 4Z7XA 1KEBA 1JLVA 1F3BA 1NW2A 4KAEA 4HQSA 2FWEA 3LEFA 4XS6A 1EOHA 2KOKA 4L0WA 2O8VB 1DE2A 3F3QA 2B7JA 3P90A 3US3A 1A24A 5JCGA 3D4MA 2C8UA 3MDKA 4PXOA 2YANA 3IAS2 2FLSA 5F8BA 3CYNA 2FA4A 4IJ3A 3FR9A 3CSHA 4MP4A 1ZOFA 3WYWA 4F82A 2FWGA 2CAQA 5LD0A 2JU5A 2G0FA 2B7KA 1PGTA 3DMLA 2FWFA 3E3EA 1B9XC 3F3RA 5KEJA 5ID2A 1F2EA 1YF0A 4XIHA 2VL2C 1WE0A 1GSFA 1OC8A 3EINA 3GTUA 2GZPA 5A5KA 2PWJA 5G1LA 1K0NA 1GSUA 3QFBC 4IBPA 5IO2A 1GTUA 3KZQA 3H93A 5FWGA 5IMAA 4Q5FA 2PVOC 2VLVA 1G7OA 2JACA 3KH9A 3ZTLA 1XWCA 2H6XA 5ECLB 1AUCA 1WP0A 2PN8A 2EIOA 3D0ZA 2MMNA 4RQXA 4CDOA 4TVEA 5KN3A 3L78A 3F63A 3WGDA 1N2AA 2O89A 3ZVJD 1OC3A 3VPQA 1TDIA 2X8GA 2B5EA 4LL4B 3L9SA 2FY6A 2A2RA 2GLRA 3MSZA 2REMA 2IN3A 2LJAA 3DGQA 3M9JA 3ZFLA 1H75A 2E2GA 2VCWA 3TJBA 5D9TA 1HQOA 5INYA 2DJ3A 5J41A 4HQZA 1M2DA 1ZYEA 5G1KA 1FVJA 3FR3A 1B4QA 4IHUA 5B8BA 3GX0A 1EEMA 4HI7A 1TK5B 4O7HA 2GTUA 5H5SA 2H1AA 3UAPA 2PVQA 4NWYA 4KA0A 1O7UA 1XWKA 4XRAA 2NPBA 3P7XA 2K9FA 3O76A 1MTCA 1VF3A 1M2BA 2A2SA 3CSIA 5G5EA 4FIWA 1SD9A 4H86A 3DEXA 2H6ZA 3U6VA 5DALA 2LRNA 4XS1A 2LJRA 2H30A 4I6XA 4MJBA 4NV5A 1GSQA 2C0DA 4GRFA 2LKUA 1VRSD 2R5GA 3S9FA 2WS2A 4LLRA 5DQSA 4N11A 3D22A 2J9HA 2KHPA 1X0RA 1XBSA 2DJ2A 4ACSA 3PGTA 4BVYA 2WRTA 3DKSA 1K0CA 4DSRA 2CVKA 3VK9A 5FHIA 2JSZA 2L59A 3TCOA 2V6OA 3GFKA 4OMVA 1BQ7A 4KX4A 1W4VA 3WGEA 9GSSA 1M9BA 5CRHA 2RUFA 3L9VA 1V57A 2GT6A 4MJAA 3ISOA 2H1BA 3ME8A 3F4SA 3IHQA 3A2VA 4AGSA 3KGKA 2RIIA 3DYRA 3C7MA 4E8EA 2KLXA 4GQCA 1XOAA 2H0HA 1OYJA 4OCEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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