4D73B

X-ray structure of a peroxiredoxin
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
175
structure length
170
Chain Sequence
DLIPNVKVMIDVRNMNNISDTDGSPNDFTSIDTHELFNNKKILLISMPGAFTKMIPGYEEEYDYFIKENNFDDIYCITNNDIYVLKSWFKSMDIKKIKYISDGNSSFTDSMNMLVDKSNFFMGMRPWRFVAIVENNILVKMFQEKDKQHNIQTDPYDISTVNNVKEFLKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 1-CYS PEROXIREDOXIN
publication title Plasmodium Falciparum Antioxidant Protein Reveals a Novel Mechanism for Balancing Turnover and Inactivation of Peroxiredoxins
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 57
structure length 170
sequence length 175
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2014-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4d73B00
3LG6A 2P5QA 5IMZA 1ACVA 4HI7A 4F03A 4ZILA 3IV4A 4JZQA 2L4QA 3UVTA 3VPQA 4K0GA 1GH2A 4IP6A 4YQMA 2IFQA 1SJZA 1SJIA 2A4VA 4I2UA 1RQMA 2VCXA 2NPBA 5ECMB 2F9SA 2JU5A 3KP9A 4MLYA 1GP1A 2I3YA 4ECIA 1A23A 3KIJA 1U87A 2L4CA 1OKTA 3GH9A 2GT6A 2GS3A 1CQGA 4WF4A 4KSMA 4F82A 1EGRA 3GTUA 4DSSB 1EOGA 1AQWA 2AYTA 2YWIA 3TKRA 3QOUA 3HZ8A 5C04A 4MDCA 2IMKA 2OADA 3D21A 3ZMLA 4PX1A 4J56E 2EIRA 1BG5A 2JZTA 3FY7A 14GSA 4KDXA 1OYJA 1AC1A 2HT9A 2BMXA 5G2ZA 4AJ6A 4K0NA 2K9FA 2REMA 3CTGA 1TI3A 2L5LA 2WFCA 5JWQB 4IGJA 1I5GA 1LU4A 4O32A 3F6FA 2VM2A 2E2MA 4N11A 1Y25A 4TOPA 3BCIA 4L5LA 4DEJA 2E2GA 1GTUA 2P5RA 2L6DA 2C0DA 3FR9A 2JSYA 4OCEA 4E8EA 2H71A 2DJ1A 4JEDA 5CRDA 1PQNA 2IIYA 2PMTA 3TKPA 3ZYWA 22GSA 4AGSA 1WPIA 2NBSA 2OACA 1TJDA 3RHBA 1X9MB 5KN1A 1M9AA 4IQ1A 2DIYA 2FCHA 4DSSA 3KZQA 2QSIA 2YZUA 1R26A 1O8WA 2YN1A 3G7YA 3D6IA 3VLNA 4WKWA 3VWUA 4L5OA 3G7IA 2CVBA 4YQUA 2B1KA 1AQVA 3ZMKA 3HY2A 5IOWA 1ON4A 2A2SA 2OE0A 3C1SA 2IPAA 4NWYA 2PGTA 2OKAA 5LD0A 2H1GA 3UARA 4V2NA 1O81A 4V1Ag 1XXUA 5CRHA 2LSTA 1M7TA 1GUKA 4LA1A 4GSSA 1KEBA 5IPGA 3BD2A 17GSA 5G5EA 3TKSA 4F9ZA 4J57E 4EDYA 2GSRA 2IJYA 1ZMAA 2CZ2A 3GHAA 3I69A 1GSYA 3WT1A 4WR5A 1ZZYA 2B5XA 4MP4A 3WT2A 1MD4A 1X5DA 4Q5FA 3TRQA 4MK3A 1WWJA 4IELA 2AUVA 1K0OA 3IAM2 2WGRA 3L9VA 1SU9A 4ECBA 4KDYA 4TR3A 3H1NA 2LV3A 3KGKA 3L0HA 4XRAA 3A5WA 1FOVA 4XHMA 1PKZA 3ZREA 1R5PA 1QXHA 3C73A 3HVVA 3IC4A 4KW6A 3IK7A 2D2ZA 5AGYA 2KP2A 2JACA 1JZDA 2YJ7A 2YP6A 2CZ3A 4GTUA 1QFNA 3C1RA 3VPTA 3P7XA 1A0RP 5HR3A 4EKZA 13GSA 5HFKA 5L71A 1AUCA 1YEPA 3F4SA 3VWXA 2YANA 4EVMA 5AN1A 2RUFA 5ELGA 1UA5A 3M0FA 2YPMA 2VO4A 2ON7A 2F51A 1YJ6A 1YKAA 3AY8A 1PL2A 2LJKA 5HFGA 3IA1A 5FWGA 2LNSA 3O3TA 2OJLA 1SKRB 1XPVA 4ILFA 3QPMA 1ZGNA 2C80A 2PVQA 5DBQA 3TRPA 4L0WA 1U88A 1EV4A 3FW2A 12GSA 4FYUA 1ILOA 1USBA 3TRXA 3D0ZA 4WR4A 3EC3A 2FD3A 3UBLA 1TOFA 3WGXA 4XIHA 2YOIA 2VOCA 1FVKA 2C0EA 2TRCP 2LUSA 4I2TA 2V2GA 4P3YB 4TR1B 5ECRB 2QGVA 3FZ5A 1K3LA 2G2QA 5KEJA 1FHEA 1O85A 5GSSA 2FWGA 3GKMA 3TJBA 3VWWA 2MZCA 3TJKA 3RDWA 3CSHA 2MMOA 2GQKA 2HI7A 5IIZA 3HDCA 1Z5YE 2LKUA 2R5GA 3DVWA 3LWAA 4NAXA 2H1AA 2XPEA 1Y6EA 3I9V2 1N8JA 4ZL8A 1BAYA 3A3TA 3CRTA 4OCFA 1R5AA 1MDJA 5ID2B 1KBNA 1S3AA 2H01A 2RLIA 5G30A 2IWTA 3TOUA 1THOA 2MBTA 2GSQA 3KM6A 2CA8A 5D96A 3DXBA 2EIOA 4K6XA 1MDIA 3H8QA 3IE3A 4ZBAA 4ULXA 1GLPA 2LJRA 3ERFA 3KJYA 3E9JB 2VLVA 3LXTA 2YZHA 5COHA 1ML6A 2JZRA 3GRXA 4AJ8A 5HR2A 4IBPA 4RI6A 2VCQA 1ZYQB 1B9XC 2PUKC 4JRRA 3R2QA 5ECNB 4OFNA 4X0XA 1HYUA 4EE0A 1W4VA 1XZOA 1J08A 4TR1A 3EWLA 1A2LA 2CX3A 1FW1A 3RBTA 5J9CA 4O92A 2CX4A 1DE1A 2MMNA 1AQXA 6GSXA 4TKYA 2GGTA 4ZBBA 3ZZXA 1AW9A 1BQ7A 2X99A 3UEMA 4HU9A 4KSOA 4QL9A 5ID2A 3QCPA 1AIUA 2H1DA 4IN0A 2YWMA 4CHSA 3TKSC 3VI7A 2NTOA 4PQHA 2GZZA 1F9MA 2H8LA 1NSWA 5A4UA 5J4UA 2K8SA 4I8BA 1PN9A 2H6ZA 3G9BA 3P8WA 1JLVA 4EC0A 5IO2A 4N30A 1V57A 3H93A 1F3AA 18GSA 2ALBA 4QL7A 1XWKA 2R3XA 4MF7A 3SBCA 3F6DA 1HD2A 1E6BA 4K2DA 2K6VA 3GSTA 2DC5A 2HFDA 2DIZA 2GQLA 3IHQA 1CQHA 3DVXA 1TKDB 2J9HA 1AXDA 2H0HA 1XWGA 2KLXA 2E7PA 1XWAA 4KH7A 4KUNA 7GSSA 1A2MA 2B7KA 3A2XA 3E0UA 4I97A 5D8IA 3VWVA 2LNTA 2B5YA 3UOMA 1TK8B 3BBYA 4ZL7A 2C3TA 2OBIA 4TW5A 3DGQA 2HYXA 2O7KA 4BVXA 4EO3A 4ZB6A 1V98A 2HLSA 3EMPA 1BEDA 1GSUA 1GSSA 1O6JA 5G1LA 3FKFA 1K0NA 2PPTA 2H1BA 5IPHA 4BL7A 4DSQA 1DSBA 3GUSA 1O73A 1SD8A 5HR1A 1JLWA 3GN3A 3GKNA 3WD6A 2H74A 2WDUA 4HEA2 2BJXA 4G2EA 1OC3A 5EL8A 3LEFA 3O76A 4TVEA 2JL4A 3KH7A 1X5CA 3DRNA 3EURA 3CSIA 2PU9C 4OWYA 1G7EA 1VGLA 4JU5A 3EMXA 1S3CA 6GSUA 3DIEA 1SJ6A 3GL3A 2F3MA 1Z3EA 1U3IA 5IMFA 2C8UA 3GX0A 3NIVA 4G19A 1JHBA 1BYEA 1IYIA 2FA8A 2LTKA 4KA0A 3UJ1A 3ME8A 3HJPA 1QK8A 3KCMA 5INYA 2FUG2 3Q6OA 3APOA 5CNWA 3GL5A 2IMEA 2V32A 3GYKA 4GSTA 3H4KA 2RM6A 2R37A 1FO5A 3CBUA 3LYKA 2B6MA 1F3BA 4HS1A 2HSYA 3CSJA 1FB6A 3CYNA 2CAIA 1K0AA 2GDRA 1TRSA 5CO3A 2GSSA 2FA4A 4CDOA 2DMMA 3M9JA 1SK2A 4L8EA 1GTIA 4HOJA 5JWRB 4EDZA 1UC7A 5DJMA 3UIWA 1TI1A 5B8AA 5DCGA 3FEUA 3MWHA 2C4JA 4LL1B 3MAKA 3F3QA 3KTLA 2CT6A 2HZEB 4I5QA 2WRTA 3ZIVA 1SENA 3HJOA 4YAPA 1ERTA 1FVJA 1YZXA 1Z6NA 1PKWA 1XW9A 4YQVA 4ISDA 2FWEA 3W6GA 3ME7A 4PUAA 2LRCA 3IK9A 5GAPD 3MNGA 4ZBDA 1T7PB 2XPDA 4FIWA 1YY7A 1G7OA 1OC9B 5LCZA 1ERWA 2VL9A 1EWXA 4K7IA 4FH8A 5DALA 2H70A 4N0VA 2AHEA 3RPNA 3GMFA 2M72A 4OO5A 3UMAA 1K0BA 2VAFA 2FLSA 3HXSA 2X64A 5G5FA 3M1GA 5H5SA 3ZFLA 4HDEA 3TB2A 5B6NA 3TCOA 1TXXA 3ERGA 3KTBA 1TRUA 4K1FA 3HA9A 5DQYA 4LMVA 1GSEA 3FZ9A 1YEXA 1R4WA 3BCKA 5F0GA 1HNBA 3TKSE 2P0GA 2WB9A 1KNGA 5DCHA 4TXOA 3KH9A 3U6VA 2LRNA 4OFMA 4ZXGA 3GH6A 1WRYA 6GSSA 4POBA 1PX6A 4ZB9A 2C0FA 1QMVA 3TJJA 2KUCA 3W8JA 4EF0A 8GSSA 3DMLA 3D22A 1XOBA 2HZEA 2VL2C 3US3A 3E3EA 5ECHB 2B1LA 4GQCA 3IAS2 5ECKB 2H76A 2CVDA 1WMJA 4OFTA 4GRFA 1TDIA 1LJRA 4PQ1A 2EIQA 1WP0A 2WS2A 2V41A 4TR4A 2TIRA 3LORA 4HUAA 1TTZA 1NM3A 3UAPA 1OC9A 3IRAA 3F4TA 2L59A 3QAGA 3PR8A 3HYPA 4IW9A 4NV2A 4MJBA 3D4MA 3TGZA 2FWFA 1XFLA 3ZRDA 2YV9A 2H0GA 3L78A 1THXA 3HZ4A 2VCTA 4ZL9A 2RM5A 1EOHA 1XIYA 1F2EA 4GCIA 5CREA 2ES7A 3OR5A 5ECSA 4V2MA 1AAZA 1NHYA 4GF0A 2O87A 2YWNA 3A2WA 3IOSA 4LLRA 2R4VA 3NOFA 5E59A 5IOXA 1GUHA 3C7MA 5GAND 4NHWA 4IJ3A 1TK5B 5J5NA 1M9BA 5JCGA 4MCUA 6GSYA 2HZFA 4KDUA 1N2AA 4MMMA 4Q5RA 1YKCA 3QAVA 1GL8A 2GZPA 3QD9A 1OE8A 1K0MA 1XVWA 4NPBA 1M2BA 4MF5A 2HRNA 1YDKA 2G0FA 1OAZA 5CRGA 1LBKA 2O89A 4ML1A 2OE1A 2VD1A 4JR4A 3FZ4A 3ED3A 3M3MA 2VM1A 4GQFA 3FYGA 4WBRD 3GNJA 2H72A 3Q18A 4MZWA 4TRXA 1ZOFA 3GX8A 2LS5A 1C72A 4XRDA 3RAZA 3PH9A 2IMIA 1VF4A 2FY6A 2H6YA 4WBJA 2KP1A 2DJ3A 5HR0A 5A4VA 2O85A 2YJHA 5LNKe 3HCZA 2GQMA 4POLA 2I81A 1OC8A 3Q74A 2DLXA 4FO5A 3QMXA 3IDVA 2WJUA 3TJGA 1PL1A 1A24A 1A2JA 2LJAA 2LRTA 2PVOC 2YCDA 2PBJA 5FT3A 1WE0A 3MSZA 1XW6A 4OMVA 5D93A 3TDGA 1F37A 1G6YA 3LGCA 1ZYEA 1JZWA 1B9YC 1DE2A 3GKXA 2YV7A 4HZ2A 2ZCTA 3L4NA 1SL1B 5A4WA 2DSAA 3LQ7A 1U6TA 3L9SA 2HE3A 3DWVA 1R7HA 1OVNA 1A0FA 3EYTA 3WGDA 4K8MA 4XS6A 2FHEA 4RQRA 1PA3A 4BPYA 4WF5A 5DJLA 4NHZA 1URMA 2M80A 3EVIA 4XS4B 3D5JA 2FGXA 1QUWA 4HU7A 1VF2A 1PGTA 1U3AA 3GFKA 3QFAC 4MZCA 2MMAA 1GULA 1XW5A 5F8BA 1EV9A 2AB6A 2GSTA 3TKQA 1MD3A 4IQAA 3ZIJA 2CV4A 3KMOA 2VD0A 3PGTA 1TW9A 2JADA 3L9UA 2X8GA 1V58A 2V6KA 4MJCA 3NZNA 4AJ7A 5B6MA 1GUMA 5JCUA 4EUYA 4F0CA 4O5RA 1VF1A 2QKEA 2VL2A 1X0RA 3V1WA 4K7OA 4HZ4A 4MH3A 1GNEA 1HQOA 4TR0A 2H73A 4F0BA 2GTUA 5ECOB 5IQYA 2M46A 1FB0A 1B8XA 4HJ2A 1XCCA 5F06A 2X8HA 2C3QA 3QAWA 1MEKA 2B3SA 1JFUA 2AAWA 3CRUA 2OBKA 2YWOA 4BVYA 2ON5A 3VFIA 4NXIA 3IPZA 2VCZA 3GSSA 4DVCA 2I4AA 5AIVA 1TU7A 1K3YA 4LMWA 2AV4A 3KMNA 1DBYA 4XS4A 1M99A 4MABA 4Q5NA 1ZL9A 3ERWA 2C3NA 1TK0B 4IS0A 4HQZA 2B7JA 2ZNMA 2DJ2A 3KXOA 1TRWA 2VLUA 3N9JA 4AF2A 4BWSA 1K0CA 5AIXA 1V40A 1HNAA 3UBKA 4JBBA 1RW1A 4ZIJA 1JZOA 3C8EA 4RUVA 1YF1A 3SWLA 1RK4A 3GURA 5IMAA 3H79A 1SK0A 2BTOT 4YH2A 1EEJA 1V9WA 2WCIA 2H0IA 1ERVA 1H75A 5A5KA 2KHPA 2GVPA 1JZRA 1Z6MA 1EEMA 1SK1A 3KD0A 3DYRA 4PNFA 3QR6A 2L5OA 5CYYA 4MPGA 5ENUA 5ABRA 1K3OA 3FR3A 2K18A 3FHKA 2I1UA 1TRVA 2L6CA 5D9XA 1H4OA 4ECCA 4IJIA 1BX9A 4KNDA 3EU4A 1O7UA 5DALB 4N0ZA 3RPPA 4IKHA 1GSDA 4E8HA 3FRCA 1O8XA 1J0FA 2R2JA 2A2RA 5H5RA 4WXTA 1SKSB 4V2LA 2ZUPA 1GNWA 4DSRA 4G10A 1J9BA 1Z9HA 3TOTA 2IMFA 1M0UA 3HKRA 3CXGA 1WIKA 5F05A 2PERA 1OE7A 16GSA 4TXOB 1PD21 2XC2A 4QQ7A 1S3DA 1TP9A 5IMDA 3DD3A 1IYHA 4KE3A 4GWRA 4ML6A 1M2AA 1Q4JA 2DJJA 2GLRA 4G9HA 3GKKA 1I9DA 2MMZA 2HNLA 4D73B 3DKSA 1MTCA 3M8NA 1EGOA 1E2YA 1UVZA 1GRXA 5ECPB 2VL3A 2CVKA 4NMUA 3HVXA 1GSQA 4KCEA 2PN8A 11GSA 3A2VA 2PWJA 3ISOA 1QQ2A 1FG4A 4L0UA 1YQ1A 4IVFA 4F2IA 1KTEA 2F8AA 2HRFA 2F8FA 1Z7RA 4OD7A 3CMIA 4MPFA 4OO4A 4PURA 1X9SB 1EP7A 4XCSA 1BJXA 3ZITA 2AJQB 2DJ0A 3LXZA 2HSHA 5J9BA 3N5OA 3D4TA 5B8BA 5H5QA 1YF0A 2P31A 4J2FA 1FAAA 2CAQA 5DQSA 3APSA 2V1MA 4NV5A 4X43A 5DAKB 1MDKA 4PGTA 2QC7A 2N5BA 3G7JA 3QFBC 4K9ZA 4CW9A 4EXJA 2VUPA 4EL1A 1X9WB 3FK8A 5E4WA 2WULA 5EVOA 1B4PA 2C1YA 3KEBA 1V2AA 2H66A 3QDNA 5IM9A 3JCML 2LEGA 5D9TA 2OE3A 3EU3A 4WETA 1T3BA 1ZCPA 3F0IA 1GTBA 3F8UA 3Q19A 3WGEA 5GZZB 4WEYA 4D73A 4YAVA 4LL4B 2C0GA 2O8VB 1T8EB 3O6TA 2K8VA 2HXKA 5D9VA 1QGVA 4PUFC 3ZVJD 1PX7A 2NVLA 1OKDA 2NDOA 5ECQB 3ZTLA 4BWQA 5CAXA 1T00A 4GXZA 3VI5A 3LJRA 5AISA 3UL3A 4POKA 1T1VA 9GSSA 4BA7A 5CRWA 2JSZA 1T4YA 5HFIA 2DBCA 5EPFA 3J7Yk 3LFLA 4PNGA 3ZFBA 2FNOA 2IN3A 2IMDA 1GSFA 3F4RA 1GLQA 2GZYA 1G6WA 5DAKA 20GSA 4HJMA 2J23A 2MBSA 3IXRA 3W8SA 3ZVJA 5KN3A 3BOAA 5ELAA 1NHOA 2DMLA 3I6AA 1XWCA 4HQSA 3LYPA 4XTSA 1EZKA 3HHVA 4RQXA 5HQPA 4POMA 1PMTA 1VF3A 4ECJA 1HNCA 3K8NA 1K0DA 3TJFA 4JR6A 3DEXA 2EC4A 1B48A 1XVQA 1SYXA 1W89A 3ZLPA 2MYGA 1TU8A 1ERUA 4TXVA 1GWCA 4V1Ap 3WYWA 2XBIA 3EE2A 3VK9A 1A8LA 5ECLB 2VLTA 3HJMA 2RIIA 4K7NA 4GSNA 4MH2A 1DUGA 3P90A 3M9KA 4PXOA 1GTAA 4I6XA 1NW2A 5CP1A 3CTFA 3HVSA 4JE1A 1VRSD 4MJAA 3KP8A 1SL0B 2H75A 4ID0A 4KCAA 1XOAA 3GIXA 2JZSA 3IBHA 6GSVA 4GLTA 5DDLA 4X1UA 3BJ5A 1ST9A 4Q5QA 3I43A 5ECIB 1PRXA 6GSTA 5KN0A 5DVBA 2TRXA 1SYRA 2LQQA 2N5FA 2I9HA 2N5AA 4O7HA 3C71A 4N10A 1A8YA 5IMVA 2H30A 4IHUA 2DJKA 1WJKA 2KOKA 3FZAA 1G0TA 1ABAA 4KX4A 5KN2A 3F9UA 3MDKA 2VCWA 19GSA 1XBSA 5C00A 1SKWB 2CQ9A 4IP1A 4H86A 4XS1A 1M2DA 5B7CA 4ZB8A 2WZ9A 1SD9A 4MJEA 5EY6A 4MF6A 3TUEA 3ZL5A 3EINA 3F3RA 2LQOA 4MA9A 5F07A 2FWHA 5J3RA 1WOUA 3VURA 6GSWA 4RI7A 2VIMA 3P2AA 3PINA 3FR6A 4KGIA 2YNXA 2IFQB 5D73A 2VCVA 4KAEA 2IL3A 2H6XA 3J7Yb 5GSTA 1EP8A 2H19A 4KB3A 3IR4A 2OA7A 3GA4A 1Q98A 5G1KA 4FYBA 3UVHA 3RHCA 1B4QA 1T4ZA 3GTUB 2E0QA 3U5RE 5JCWA 2B5EA 4ACSA 3F63A 4Z7XA 1UN2A 5FHIA 4TN8A 1XWBA 1X5EA 2XHFA 3GV1A 3S9FA 5D9WA 2RUEA 2X8CA 4MZBA 2L57A 5J41A 10GSA 2R6KA 2Z9SA 3APQA 5JWOB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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