4DVCA

Structural and functional studies of tcpg, the vibrio cholerae dsba disulfide-forming protein required for pilus and cholera toxin production
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
184
structure length
184
Chain Sequence
SNAAQFKEGEHYQVLKTPASSSPVVSEFFSFYCPHCNTFEPIIAQLKQQLPEGAKFQKNHVSFMGGNMGQAMSKAYATMIALEVEDKMVPVMFNRIHTLRKPPKDEQELRQIFLDEGIDAAKFDAAYNGFAVDSMVHRFDKQFQDSGLTGVPAVVVNNRYLVQGQSAKSLDEYFDLVNYLLTLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein DsbA
publication title The 1.2 A resolution crystal structure of TcpG, the Vibrio cholerae DsbA disulfide-forming protein required for pilus and cholera-toxin production
pubmed doi rcsb
source organism Vibrio cholerae
total genus 61
structure length 184
sequence length 184
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-02-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4dvcA00
3KMNA 1TI3A 3D0ZA 1XVWA 4JR6A 1NHYA 4MCUA 3AY8A 3PGTA 4IN0A 3LFLA 2LJAA 3N5OA 1ZGNA 4N0ZA 1QK8A 4K9ZA 4O5RA 3CTGA 2H8LA 3H4KA 1K0BA 4YQVA 2WRTA 1JLWA 2V2GA 1JZOA 2VCZA 4AJ7A 3GV1A 4GSTA 2IWTA 3UARA 4ISDA 3TJJA 3PR8A 3CXGA 1A8LA 4MLYA 4XS1A 4FO5A 2K18A 4KW6A 20GSA 3FYGA 2H1GA 3GUSA 5IO0A 2K8SA 5IIZA 3PINA 4L0WA 4WETA 4PNGA 2H0HA 3W8SA 2LJRA 1U3IA 1PKZA 3ZRDA 1X9MB 2LRTA 3LXZA 1A2MA 5DJMA 1YKCA 4ML1A 1EZKA 2DLXA 2LQOA 1BEDA 1G6WA 2F51A 1N2AA 2V32A 3APQA 4IHUA 4I5QA 2GTUA 4JE1A 3KZQA 3KTLA 2VM2A 3DD3A 1M2AA 2GGTA 1F2EA 4MPFA 11GSA 4J2FA 4KCAA 4ZILA 4IVFA 1X5CA 2R6KA 1H4OA 5IPGA 3UBLA 2VM1A 4MJCA 3FKFA 1GNEA 4ACSA 2GVPA 4TKYA 1W4VA 3UVHA 1V2AA 2ON7A 3D5JA 3U5RE 1DE1A 1JZDA 1YKAA 1A0FA 1NSWA 5CRDA 2TRXA 1XWAA 4XHMA 4IGJA 4FIWA 1AXDA 2HRFA 4G9HA 1FB6A 1KNGA 2X8HA 4GSSA 1S3DA 5ECHB 1SKWB 2O89A 5D9WA 1ST9A 3H79A 2P31A 3MNGA 3VPQA 2KP2A 1SKRB 1CQGA 3Q6OA 3QAVA 4H86A 1OE7A 3WGDA 4OWYA 3ME8A 1PRXA 1EEMA 5FHIA 3ZIVA 3IDVA 3ME7A 3L9UA 6GSVA 3LORA 2H66A 1XVQA 3FW2A 2AAWA 1LU4A 2OE0A 3CRUA 1T8EB 3UOMA 5DQYA 3C71A 3GKKA 5DALB 1OAZA 1R7HA 2FA4A 2C0FA 2Z9SA 3EMXA 3EU4A 4NXIA 2CZ3A 2IMIA 2I9HA 3QR6A 3M8NA 5KN0A 5IMAA 4JEDA 3GRXA 2F8AA 4GXZA 1JFUA 3D22A 4HDEA 1PA3A 2YZHA 4K1FA 4EDYA 1F3AA 2IJYA 1JZWA 2P5RA 4KB3A 3TB2A 1SD8A 3GN3A 3GH9A 3LQ7A 1OE8A 3EE2A 1ZOFA 1ERUA 3F4SA 1VF1A 1GSQA 2FUG2 3RPPA 1TDIA 4MABA 1VF2A 2NPBA 3IE3A 1TK8B 2H76A 3HDCA 1ERTA 2KOKA 2R37A 4YAVA 3TOUA 5F0GA 3KH9A 5EVOA 5IO2A 5IMZA 2H74A 1YDKA 4GQFA 4POLA 3BCIA 5G1KA 1F9MA 1BG5A 4PXOA 4KE3A 1ON4A 1T00A 2PMTA 5AISA 5DALA 2CVDA 1WP0A 2YNXA 3F4TA 1IYIA 4WBJA 1A2JA 4HEA2 1GUMA 2VCTA 1CQHA 4MZBA 1I5GA 3WGXA 2HRNA 2HZEB 3FZAA 5B7CA 2DJJA 2B5YA 3C8EA 3IXRA 4G19A 4PQHA 2OBKA 5JWRB 4TR3A 1GRXA 2GS3A 3V1WA 3CMIA 1GSFA 1EV9A 4N10A 2KLXA 1VF4A 3ZVJD 2MMAA 4FYUA 4K2DA 2BTOT 5DCGA 3M9JA 2VCQA 3NIVA 4MPGA 9GSSA 4TR4A 2C8UA 1TU8A 2VO4A 3KGKA 4IJIA 2QSIA 4HU9A 1S3CA 2LQQA 2CT6A 2DIYA 2VLUA 3E9JB 4MA9A 2VCVA 4TOPA 3WGEA 1GL8A 2JSYA 3FR9A 5HFGA 1GWCA 2PERA 5G2ZA 5IOXA 1X5DA 4I6XA 2L4CA 2VLTA 3L0HA 1THOA 1GLPA 5ECSA 1TKDB 3ZYWA 3OR5A 4GWRA 4J57E 5CO3A 4I2TA 3EMPA 2XHFA 3BJ5A 5C04A 1Z6NA 2LRNA 3GIXA 2HZEA 4JU5A 2B7JA 2OACA 3HY2A 3GTUB 1KTEA 2GZPA 3J7Yk 1RW1A 2DSAA 5JCUA 2C80A 5FWGA 1SYRA 2B1LA 2F9SA 2KUCA 2VD0A 4O32A 2H6YA 1WE0A 4HZ4A 3QCPA 5J9BA 1EP8A 1K3LA 3DGQA 3GURA 3HA9A 1G7OA 4ZB6A 2B5XA 2FWEA 2GQMA 1OC8A 4G2EA 3DMLA 2YV7A 5ELGA 2I3YA 1YZXA 3IK9A 2CVBA 1KEBA 3FZ4A 3VK9A 4LLRA 3HZ8A 4OFMA 4J56E 1O6JA 2EC4A 4KDYA 2LJKA 1Y25A 4GRFA 4ZB9A 4GTUA 5AIXA 1X0RA 3KIJA 2IPAA 4IW9A 1PL2A 2LNTA 2XBIA 3GHAA 1SL2B 5H5RA 5IMDA 4PUFC 1A23A 5DDLA 2YP6A 1GLQA 22GSA 1GSSA 2YV9A 3GTUA 3IAS2 1WRYA 1O7UA 2I4AA 3I6AA 1WPIA 2GZYA 5EY6A 4X1UA 1OC3A 1B48A 3A2XA 3VURA 1K0OA 4NV2A 4XS6A 5AN1A 3KTBA 5AIVA 1A24A 1Z7RA 1M9BA 1G0TA 4AGSA 4EDZA 1MDKA 4DSSB 2JZSA 4ZBDA 1TW9A 1AC1A 1E6BA 2N5FA 4HQSA 2YWMA 2HI7A 1J9BA 5ID2B 3GX8A 4IP1A 4POMA 1URMA 3RHCA 3N9JA 2YWIA 2FWFA 4TR0A 1TI1A 4MH3A 4IS0A 1ML6A 5DQSA 1K0DA 5G5EA 3ZMLA 1A2LA 6GSYA 2PUKC 3A3TA 1AAZA 5J5NA 4MJBA 3APOA 2C3TA 1O81A 1LJRA 2F8FA 5INYA 2WGRA 3UEMA 3M0FA 3MDKA 5G5FA 4WEYA 4FYCA 2FGXA 1OKTA 1MDIA 3VLNA 4MZCA 1U87A 3DEXA 3EU3A 3D4TA 3TRXA 3HD5A 5A4UA 4FH8A 2YOIA 2GSRA 1SK0A 4XCSA 1FOVA 5CRWA 3D6IA 3HVVA 5JCWA 2E7PA 3MAKA 4OCFA 2E0QA 1AQVA 5ECKB 3HJPA 2M80A 2CVKA 3EYTA 2B1KA 1TXXA 2CQ9A 14GSA 4ULXA 3QFAC 3L4NA 3IAM2 3TUEA 2K6VA 1K0MA 4DSSA 5FT3A 1YJ6A 3Q19A 4I2UA 2IMEA 5ID2A 3F8UA 2YWNA 4LMVA 3ZZXA 1HNBA 5G30A 2P5QA 2AJQB 4LA1A 4Q5QA 2EIRA 2IL3A 2TIRA 2LTKA 3QDNA 4GLTA 2C4JA 5ECQB 2N5AA 3HXSA 2XPDA 4ZBAA 4K0GA 1XZOA 4QL9A 3ZVJA 1MEKA 3LYKA 1GSDA 3VPTA 4OO5A 5A4WA 5C00A 1GTAA 2REMA 1X9SB 3TKQA 4XIHA 2MBSA 3WYWA 1HD2A 4MMMA 4KA0A 4DVCA 4ZBBA 3US3A 3TKSE 2WJUA 2VL2C 2VCXA 5HR1A 5ECNB 2VIMA 5IPHA 1T4YA 3GKMA 3CYNA 3QD9A 4ML6A 1SU9A 2RUFA 1K0NA 1GP1A 2WDUA 3KJYA 3H93A 5JCGA 3F0IA 1K3YA 1M2BA 1AQWA 1HNAA 1UA5A 4N30A 3K8NA 3CSJA 1SD9A 1AW9A 2VUPA 2X8CA 3LGCA 2YZUA 2L5OA 1GSEA 2GSQA 1B8XA 4K8MA 4V2LA 4LL1B 3ZITA 1V40A 5J4UA 5D96A 4ECIA 1FVKA 1BQ7A 1SKSB 3BD2A 2DIZA 1GTUA 4NWYA 3DKSA 1A0RP 3VI7A 4K6XA 2HT9A 2A2SA 2FY6A 2L59A 1OC9B 1PN9A 1Q4JA 3GH6A 1GTIA 2HXKA 2LUSA 1XW9A 3TKSC 4POKA 3IK7A 3M1GA 4ID0A 1HNCA 4WF4A 2NDOA 1FAAA 4ZIJA 1FW1A 4PX1A 2H30A 1VF3A 5KEJA 1EGRA 2ALBA 3S9FA 1SJZA 4V1Ap 1SYXA 1NM3A 2K8VA 1ILOA 4NAXA 3M9KA 1JZRA 3TJFA 1TRSA 1X5EA 2A4VA 4F9ZA 2QGVA 2X8GA 4MF6A 1AUCA 1JLVA 3O6TA 1THXA 3F6DA 1MD4A 3GL5A 17GSA 2IFQB 1SK2A 2FD3A 4RQXA 3ZMKA 4AF2A 2XC2A 1Q98A 2CAQA 3KCMA 1M2DA 2GT6A 3W6GA 3KD0A 1AIUA 2IMDA 4MK3A 6GSWA 2VD1A 4KSOA 2L57A 5AGYA 5KN1A 1OC9A 5A5KA 4ILFA 1PMTA 1FB0A 3P2AA 4PUAA 6GSXA 1TRWA 2R5GA 2FWHA 1F3BA 5ECRB 2PBJA 1YF1A 4AJ6A 3EC3A 5KN3A 2HLSA 4EUYA 5IMVA 4NMUA 2AUVA 3GL3A 3GFKA 5L71A 3HYPA 3W8JA 1TRUA 1XWGA 5D8IA 4EF0A 2H6XA 4Q5RA 4HS1A 2O7KA 1XBSA 1FG4A 3O76A 4XRAA 12GSA 4K7IA 2GT5A 4L8EA 2IN3A 4WF5A 5GAND 4AJ8A 1ACVA 3G9BA 2DJ0A 4NHWA 2PN8A 1WOUA 2V6KA 3ERFA 4K0NA 4MF5A 5ELAA 1SL0B 2NBSA 3L9SA 2IFQA 4PGTA 5EPFA 3MWHA 4OFNA 1DSBA 1HQOA 4K7NA 2L4QA 1QUWA 1QFNA 3SBCA 3A2WA 2YCDA 5ECPB 5GAPD 3FEUA 3RHBA 2FNOA 1TK5B 2IMKA 3JCML 2J9HA 1K0CA 3TKRA 3KP8A 3P7XA 4KSMA 4PQ1A 3HJMA 4FYBA 1XFLA 2JADA 2R2JA 5CYYA 3PH9A 5D9XA 2PGTA 3ZFLA 2IIYA 1Z3EA 4E8HA 4ZL9A 3Q18A 5E4WA 3HKRA 4F03A 3TCOA 1NHOA 2H1AA 2AV4A 5H5QA 1UN2A 6GSSA 19GSA 2JACA 2NTOA 1TOFA 2PVOC 1ZMAA 2HFDA 4PURA 4YH2A 3VFIA 1SENA 2YJHA 1OKDA 4GQCA 4LL4B 1G6YA 3KMOA 3EWLA 3FHKA 5DAKA 1YY7A 5D9VA 2B5EA 3SWLA 2R3XA 2V6OA 4RI7A 3R2QA 4TXOB 5H5SA 1MD3A 3C73A 4KDUA 2FCHA 3ZTLA 1WMJA 2GZZA 2VL2A 3G7YA 5B8AA 2CX4A 4GSNA 3TOTA 2OA7A 1PGTA 3DXBA 2RIIA 2ES7A 2VL9A 2H72A 3VWVA 2LRCA 1DBYA 2AHEA 3LWAA 4IBPA 1EV4A 5DVBA 2GSTA 3QFBC 1FO5A 3TJKA 3EURA 3HZ4A 1TP9A 4KGIA 1WWJA 1U88A 1H75A 2FA8A 2X99A 4ZB8A 2JU5A 4GCIA 1A8YA 3APSA 2OKAA 4RQRA 4MZWA 1RK4A 5J41A 1YQ1A 1G7EA 4WBRD 18GSA 1RQMA 4HOJA 3ED3A 2KP1A 5B6MA 2PU9C 2OE1A 3A2VA 5CP1A 2JZRA 4F0BA 2DBCA 3EINA 4TR1B 4GF0A 1JHBA 2VL3A 1ABAA 1R5PA 2HE3A 3G7JA 3GX0A 4TXOA 5CRGA 4TVEA 3TKSA 5E59A 1BYEA 3UJ1A 16GSA 1TU7A 4KUNA 2LKUA 2C0DA 1X9WB 1J08A 1VGLA 5J3RA 4YQUA 2O87A 3IR4A 1GH2A 5HR2A 2OBIA 3TDGA 7GSSA 4EKZA 3VI5A 1SJ6A 2MZCA 5F06A 2YPMA 2H75A 2M72A 4D73A 1XW5A 3TJBA 4XS4B 3GKNA 5G31A 5LD0A 2H6ZA 4HU7A 1M9AA 5B6NA 1R26A 1U3AA 2O85A 2X64A 4QQ7A 2CAIA 4CW9A 1C72A 3GA4A 3RPNA 1EOGA 1GSUA 4RI6A 1TRVA 1K0AA 1IYHA 2WULA 4BL7A 1R5AA 3F3QA 3GSSA 8GSSA 1XOBA 1GUKA 2DJ3A 4L5OA 5DBQA 3D21A 3E3EA 4TR1A 4KNDA 1NW2A 4KAEA 3FR3A 1E2YA 1Z5YE 1PD21 3UL3A 2IMFA 4KH7A 4DSQA 4HUAA 1Z9HA 4O92A 2OE3A 2WZ9A 3QOUA 2ZUPA 3U6VA 4XTSA 4OD7A 4P3YB 3NOFA 2PWJA 4V2MA 2DC5A 2MBTA 3D4MA 4L5LA 1TK0B 2OJLA 4XS4A 2H70A 6GSTA 4KCEA 1O73A 3ZIJA 2C1YA 1XWKA 4WR4A 3DWVA 2QC7A 3HJOA 2H01A 2MMNA 2H0GA 1N8JA 5CAXA 5ECOB 2XBQA 2GDRA 4TW5A 1U6TA 1V9WA 2RUEA 1KBNA 4ZL7A 3MSZA 2WCIA 3QPMA 3FZ5A 3UIWA 4KX4A 1ERVA 4BWSA 1SK1A 4JRRA 1PX7A 1QXHA 1R4WA 2MMOA 1F6MC 2E2MA 4E8EA 2F3MA 2KHPA 5CNWA 3TJGA 4IP6A 1DUGA 3EVIA 5HFKA 4F82A 2L6DA 4ZL8A 2YWOA 5DCHA 3TRQA 2V1MA 5ABRA 4BWQA 3C1SA 5D9TA 2P0GA 4EE0A 3E0UA 1B9XC 1EP7A 2MMZA 4G10A 1GUHA 2LSTA 2DJ1A 3UVTA 4WXTA 2YANA 5D93A 4I8BA 1XCCA 2WB9A 4Q5FA 4IELA 1XOAA 4BVYA 5GSTA 1EOHA 3O3TA 3I43A 3RAZA 4EL1A 3LJRA 5ENUA 1GTBA 3H8QA 2H19A 2WS2A 3BBYA 3F9UA 2CV4A 3H1NA 2ZNMA 3IRAA 1BJXA 1WJKA 4ECBA 2G0FA 3FK8A 5IQYA 5ECLB 4K7OA 4TXVA 3VWWA 2H0IA 5J9CA 2RM6A 2R4VA 1DE2A 3HCZA 3KP9A 3LG6A 4N0VA 1PSQA 3HVXA 3NZNA 3LEFA 5GSSA 3LXTA 2O8VB 3C7MA 4EVMA 3ZL5A 2GQLA 1TTZA 2DJ2A 2YN1A 2DJKA 5LNKe 2H73A 4BVXA 1K3OA 1MTCA 4ECJA 1PX6A 3DVWA 4TRXA 4NPBA 2FHEA 3FZ9A 1PKWA 4EO3A 3ISOA 3A5WA 2GLRA 1ERWA 2FLSA 4V2NA 1GULA 4KDXA 4YQMA 4ZXGA 1YEXA 4ECCA 4MH2A 2XPEA 1M99A 2LNSA 4JR4A 1ZZYA 1EEJA 2V41A 3P90A 1BX9A 2HSHA 3ERGA 1USBA 2GQKA 3WT1A 3GNJA 3GKXA 4X0XA 2B3SA 2K9FA 3IV4A 2EIQA 2H71A 5G1LA 1ZL9A 5F05A 3TKPA 3I69A 5ECMB 3UMAA 4MF7A 4DSRA 1Z6MA 3TGZA 1ZYEA 1TJDA 4WKWA 1GNWA 2H1DA 3RBTA 3HVSA 2VCWA 4OO4A 1FVJA 2EIOA 5D73A 3C1RA 4BA7A 4WR5A 5DAKB 1XPVA 3DVXA 1UVZA 4NHZA 4PQIA 1T3BA 3LSZA 4EC0A 2PPTA 3M3MA 1S3AA 3I9V2 3CBUA 3QAWA 3CSIA 2RLIA 4YAPA 5F8BA 1AQXA 2QKEA 2C0GA 1OYJA 1Y6EA 3J7Yb 3BCKA 4N11A 4IQAA 1FHEA 4OCEA 4Q5NA 5HR0A 5CREA 1T4ZA 4X43A 1SL1B 2C3QA 3RDWA 4IQ1A 4EXJA 3IC4A 1B4QA 2VLVA 1EWXA 1T7PB 4I97A 3QAGA 5IM9A 2M46A 4POBA 2JZTA 1PL1A 13GSA 2CZ2A 1ZYQB 2JSZA 5IMFA 3QMXA 3VWUA 2CA8A 2NVLA 1T1VA 4MJAA 2L6CA 4HJMA 3CSHA 5F07A 5GZZB 3CTFA 5JWOB 4MDCA 2C0EA 1M7TA 1VRSD 1B9YC 3F3RA 5A4VA 3G7IA 3KM6A 2PVQA 4L0UA 1V98A 3KXOA 2CX3A 3GSTA 5EL8A 10GSA 4RUVA 5COHA 3HHVA 1V58A 2LS5A 2DMMA 6GSUA 2H1BA 4DEJA 2WFCA 4IJ3A 1J0FA 2HSYA 1B4PA 3KEBA 3L78A 3IHQA 3F63A 2I1UA 1PQNA 3IOSA 1XWCA 2BMXA 2JL4A 2L5LA 4HI7A 4O7HA 5B8BA 3F6FA 2HZFA 1QMVA 1OVNA 4QL7A 4TN8A 2RM5A 2VOCA 3ERWA 2VAFA 1M0UA 4CDOA 1O85A 2ZCTA 4F0CA 1XIYA 5JWQB 1HYUA 4D73B 1I9DA 2GSSA 2ON5A 3WT2A 4HZ2A 4NV5A 3TRPA 3WD6A 5HQPA 1W89A 4LMWA 1XXUA 3FR6A 5KN2A 1GSYA 1YF0A 3DYRA 2E2GA 3FY7A 3IPZA 3FRCA 5CRHA 2B7KA 2FWGA 1F37A 1ZCPA 4MP4A 5LCZA 2D2ZA 4IKHA 5IMCA 2A2RA 2HYXA 1LBKA 1WIKA 1YEPA 2OADA 3BOAA 3DIEA 4HQZA 4OFTA 3UBKA 2BJXA 3ZREA 4BPYA 3P8WA 3IBHA 5HR3A 4V1Ag 2AB6A 1MDJA 2MYGA 3L9VA 4MJEA 3KH7A 4JBBA 4OMVA 2LV3A 3GMFA 3CRTA 3LYPA 4JZQA 5ECIB 2YJ7A 1XW6A 3F4RA 1V57A 3GYKA 4PNFA 2N5BA 1QQ2A 1Z7PA 1SJIA 1UC7A 3ZFBA 5DJLA 2C3NA 5IOWA 3VWXA 2TRCP 3Q74A 1EGOA 4HJ2A 1BAYA 2J23A 1QGVA 2AYTA 1XWBA 4XRDA 5HFIA 1O8XA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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