4EVMA

1.5 angstrom crystal structure of soluble domain of membrane-anchored thioredoxin family protein from streptococcus pneumoniae strain canada mdr_19a
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
138
structure length
138
Chain Sequence
EVADFELMGVDGKTYRLSDYKGKKVYLKFWASWCSICLASLPDTDEIAKEAGDDYVVLTVVSPGHKGEQSEADFKNWYKGLDYKNLPVLVDPSGKLLETYGVRSYPTQAFIDKEGKLVKTHPGFMEKDAILQTLKELA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Thioredoxin family protein
publication title 1.5 Angstrom crystal structure of soluble domain of membrane-anchored thioredoxin family protein from Streptococcus pneumoniae strain Canada MDR_19A
rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 43
structure length 138
sequence length 138
ec nomenclature ec 1.8.4.-:
pdb deposition date 2012-04-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4evmA00
3H8QA 5G31A 1NW2A 2V6OA 2CX3A 3Q74A 4KCEA 4NHWA 2AV4A 2L5OA 4WXTA 1CQHA 3GSSA 3UARA 5JWOB 2VUPA 2VLVA 1GLQA 3DRNA 1G6YA 1YDKA 3P2AA 2CAIA 4AJ7A 2X8GA 1XFLA 2HRFA 4WBJA 2O7KA 2AJQB 2H70A 2IL3A 4XIHA 1PRXA 3US3A 2F3MA 1PQNA 2WJUA 1XXUA 4DSQA 1TI1A 4ZL7A 1EOHA 4ZL8A 5IPHA 3TCOA 4IHUA 4KCAA 5JCUA 1GTAA 2V32A 3GKNA 5COHA 1K0MA 4MABA 5H5QA 1B8XA 5J9CA 3G7JA 4PUFC 3HYPA 3FY7A 3RDWA 4IW9A 2VL9A 1B4QA 2V1MA 4PUAA 3GKXA 4WKWA 1ABAA 4O7HA 3H93A 5ECQB 3KM6A 1GSEA 1LJRA 3I43A 2JL4A 4P3YB 3H4KA 5IPGA 2TRCP 2NPBA 4IP6A 1JFUA 3VLNA 3M1GA 4L0UA 3VI5A 5IIZA 2VO4A 3GMFA 5F05A 1TRVA 2YNXA 5KN2A 1SKSB 2GZPA 4GF0A 4BVXA 5CYYA 3MSZA 2VM1A 5J41A 1XVWA 2DBCA 5DBQA 1A8YA 5FWGA 1QK8A 1J9BA 2VCQA 1HYUA 4LL1B 3J7Yb 3IV4A 5D96A 4HZ4A 2ES7A 4NAXA 1ON4A 4ZXGA 3DIEA 1U3IA 1GSDA 4ZB9A 2LQOA 5J3RA 2KOKA 2YPMA 2H30A 3UVHA 5CRWA 2XPDA 4XS4B 4YH2A 4NHZA 4HQSA 3TDGA 2DJ0A 1PSQA 4L5OA 1B9YC 3GURA 4MH3A 22GSA 4IJ3A 3L78A 2E2GA 4J56E 1HNCA 1URMA 3MWHA 1M2DA 3HZ4A 1A0FA 2MMOA 3GL5A 5CREA 3QPMA 4HOJA 1O8WA 3G7IA 1XWBA 1DUGA 3QOUA 2EC4A 3DEXA 4HZ2A 4ML1A 1G6WA 2VL2C 4GSSA 5KN0A 1MEKA 4XHMA 1SENA 3ED3A 1O8XA 2P5QA 1K0NA 1PKWA 1I5GA 2FLSA 3I9V2 2IMFA 5DVBA 3ZYWA 2N5FA 5L71A 1GSQA 3HCZA 4KH7A 1CQGA 3GSTA 2I9HA 3H79A 5ID2A 1Z6NA 3EWLA 4ACSA 2ON7A 4OFNA 2LEGA 5D8IA 2YP6A 1UA5A 3BCIA 3IOSA 3PGTA 4ISDA 1B9XC 3GHAA 1B48A 3QMXA 1WRYA 4G19A 3RBTA 4ECBA 5DALA 5JCWA 4O5RA 1HNAA 3UAPA 1A23A 2BJXA 2B3SA 3TJJA 4QQ7A 5GAND 1THOA 1TXXA 4FYUA 3GTUA 3TOTA 5DALB 1TRSA 3QAVA 4EO3A 3C71A 5J4UA 1SYRA 2VIMA 1UVZA 4MJEA 4OFTA 2YZUA 3IE3A 4GCIA 1SJ6A 4X43A 4I2TA 1BJXA 5D73A 2CT6A 2FWHA 1R5PA 4IQAA 20GSA 2YWOA 4KSMA 3ME7A 1R4WA 3VPTA 4KUNA 1IYIA 2WCIA 1VF1A 3IPZA 2H8LA 4ILFA 2PMTA 4JR4A 1LU4A 2HZEB 5LD0A 3KXOA 2C8UA 2FCHA 3KEBA 2B5YA 3ERWA 1FOVA 2ON5A 2O85A 1GUHA 1EV4A 2JZTA 2C80A 1Z7PA 3R2QA 4HU7A 5GSTA 1NHYA 1F9MA 1E2YA 4FH8A 1J08A 2YJ7A 4FIWA 2PGTA 1PD21 2PVQA 4TXOA 2GSRA 6GSUA 3C73A 1WE0A 3GV1A 4PX1A 3O3TA 5A5KA 4MDCA 4I2UA 4BWQA 3HDCA 2VCVA 1UN2A 3HA9A 4GXZA 1OC3A 4NV5A 4LLRA 4GQCA 3LJRA 3TRXA 4TN8A 3A2XA 3CTGA 2ZCTA 3CSJA 2LRNA 2R4VA 3D21A 5F06A 1OAZA 5GSSA 2H73A 3FEUA 2L6CA 2CX4A 4E8EA 1GUMA 1T4ZA 2OADA 5KEJA 1V98A 3L0HA 5B6NA 4MLYA 1W89A 2IWTA 2EIRA 2WZ9A 1NSWA 3FK8A 4EF0A 1AW9A 4MMMA 2AB6A 8GSSA 2XBQA 5IQYA 3N5OA 1TOFA 1H4OA 1YF0A 2XPEA 3FW2A 5J9BA 3VFIA 1N8JA 1TTZA 1XOAA 3VPQA 2AUVA 1YY7A 5ECRB 2B5EA 3GN3A 3LSZA 3F4RA 1JLWA 3M9KA 2FNOA 2LNSA 5EPFA 2FHEA 3KP9A 1F3BA 1JZWA 1R26A 5D9VA 2B1KA 3SWLA 2GZZA 4XCSA 2GT6A 4CDOA 5CRGA 1FAAA 3UIWA 3IC4A 3CXGA 4X1UA 1TU7A 3BCKA 4G10A 1GTBA 3KTLA 4K8MA 1V2AA 4V2LA 4V1Ag 3GA4A 2K18A 5ELGA 5D9XA 3IAS2 3QFAC 2MMZA 3FKFA 1SKRB 2X99A 3WYWA 5DQYA 2H1GA 2KP2A 3P8WA 3ZIVA 1YKCA 2JSZA 1TP9A 4O92A 3FZ9A 4MPGA 5B8AA 4XTSA 5IMZA 1JLVA 1YQ1A 2HI7A 2VD1A 4WETA 1V9WA 4KB3A 4RQXA 2FA4A 5ECNB 3KH9A 2HZFA 3DGQA 5KN3A 1TJDA 5ECLB 4ULXA 2IMKA 1SD9A 4D73A 5IO2A 2C0GA 2DMMA 3UEMA 1ZYQB 6GSSA 4L5LA 5LCZA 2VL2A 3CSIA 1W4VA 1T00A 4K6XA 5ECKB 3L9VA 3KCMA 3LG6A 4LMWA 4WR5A 4F03A 1M9AA 1Z7RA 4D73B 1S3DA 4K0NA 5HR2A 5ECHB 2C1YA 1OE7A 4MJAA 1USBA 2CVBA 3HVVA 2GDRA 2CQ9A 4F0CA 4QL9A 4J2FA 5H5RA 2CAQA 3E0UA 3ZFLA 1OYJA 4EDYA 3E3EA 4ECCA 1XIYA 3TKSE 4V2NA 3UBKA 3Q18A 3HJOA 1ZL9A 1O85A 2MMAA 1U87A 2DC5A 3DVWA 3TRQA 5JCGA 2IN3A 1ERWA 1TRWA 4IJIA 2B7KA 6GSVA 3M8NA 2YV7A 3U5RE 1K3LA 2YOIA 3DXBA 4BPYA 1O7UA 2P0GA 2TRXA 4N0ZA 2HSHA 1SJZA 1YEPA 3QAGA 4ECIA 3DMLA 4OO5A 5A4UA 4JR6A 1AAZA 3GRXA 2OKAA 3HJPA 4XRDA 2L6DA 2R6KA 4JU5A 3ZL5A 2H66A 1SKWB 2BTOT 1VF3A 2OE0A 3UVTA 1GTUA 5FT3A 4IBPA 3ZVJA 3PR8A 2J9HA 2E0QA 4RI6A 5J5NA 2DJ2A 4WR4A 3KJYA 2GZYA 2EIOA 4K1FA 2RUEA 2C3TA 2DSAA 2HLSA 1K0AA 2H72A 3TJFA 2L4QA 4EKZA 5G5FA 1N2AA 1KBNA 2LNTA 18GSA 2R3XA 2R37A 4EVMA 1TW9A 1V58A 3G7YA 4HS1A 9GSSA 1X5DA 1K0OA 3F63A 3D6IA 2HFDA 3I6AA 1O73A 4V1Ap 4KE3A 2MBSA 3MNGA 3EU4A 5D9WA 4OD7A 1GL8A 1GTIA 3TKRA 2O8VB 2FWGA 4ZILA 2WRTA 1QGVA 2C0DA 3EVIA 3LFLA 4JRRA 3W8SA 1R7HA 1FB0A 4XS4A 1WMJA 1JZOA 2JSYA 1BQ7A 2LRCA 1WIKA 4K7NA 4GSTA 2RIIA 3KD0A 2B5XA 3IAM2 1Q4JA 2QC7A 3VURA 1X0RA 1EEMA 3VWUA 4ZB8A 1BG5A 4ZBBA 3GNJA 1TRUA 1X9MB 2YWIA 1OKDA 1B4PA 2OBIA 1SK2A 1O6JA 2V41A 1SU9A 3CBUA 5ECSA 4L8EA 2QKEA 5DAKB 1OC8A 4HEA2 3U6VA 4TRXA 3TUEA 4PNGA 1K3YA 5EL8A 6GSXA 3EURA 3K8NA 4KGIA 4POBA 3ZMKA 1Y25A 5CRHA 3FYGA 4OWYA 1FW1A 5GAPD 4I97A 3EYTA 1XWAA 2GLRA 1F37A 4BL7A 1Q98A 1MD3A 1ZYEA 2VAFA 4KDXA 3P7XA 5G2ZA 1JZDA 5C00A 2B7JA 2VOCA 2M46A 2R5GA 1ZMAA 2PU9C 4G2EA 4CW9A 2KLXA 4IGJA 2LJKA 4MCUA 1AC1A 1SL2B 4POLA 3M3MA 1T8EB 2C4JA 3LYKA 2PBJA 3EU3A 4MF5A 2YZHA 1BYEA 2H0HA 1MDIA 3QAWA 4OCFA 3G9BA 2C0EA 1T4YA 5CAXA 1OE8A 2HYXA 5DCHA 1RK4A 1S3CA 3IXRA 4NMUA 1K0DA 1XBSA 3C1RA 3J7Yk 1DE2A 11GSA 2N5BA 4K7OA 1XWKA 1GUKA 4TVEA 3UL3A 3A3TA 1IYHA 1F2EA 2K8VA 4K2DA 5E4WA 2LQQA 1ILOA 3H1NA 2EIQA 1S3AA 2C0FA 5ECOB 3HHVA 2ZNMA 4POKA 2HZEA 2RLIA 5AGYA 1ZCPA 2OE1A 3D0ZA 3DWVA 2RM5A 3LORA 1GNEA 3GFKA 3GUSA 5AIXA 2GSTA 5CRDA 2A2SA 2PERA 2H19A 3FHKA 3ZFBA 2GQLA 2FY6A 1U6TA 3CYNA 1R5AA 4NWYA 4DSSB 4J57E 3F6DA 5G5EA 3TRPA 4ZBAA 1QQ2A 1QXHA 1GP1A 3V1WA 5LNKe 1K0BA 2C3NA 3IA1A 1SL0B 1U3AA 4TKYA 4BA7A 2HT9A 1SK0A 3KH7A 2D2ZA 4IS0A 4N30A 4OCEA 2JADA 1E6BA 1SYXA 4GRFA 4Q5QA 2H1BA 1QFNA 3EC3A 2CA8A 1M9BA 3D5JA 3WT1A 1VRSD 3CMIA 1Y6EA 4XS1A 3L4NA 2XC2A 5B8BA 3VI7A 2RM6A 2HRNA 2OA7A 1MDKA 3ME8A 1DBYA 2A2RA 1WOUA 1MTCA 5HQPA 3AY8A 2GS3A 4JEDA 3TJGA 1PA3A 2L4CA 3TKSC 1TKDB 1Z9HA 3HKRA 5IMVA 1NM3A 2MBTA 2K9FA 3D22A 2H6XA 3LXTA 2CVKA 5E59A 5IM9A 3DKSA 5H5SA 4TW5A 5EY6A 5HFIA 2M72A 4MPFA 3M9JA 2GSSA 3C1SA 3TJKA 2P31A 4EC0A 2IFQB 5JWRB 1ZZYA 1ZGNA 3L9SA 4XS6A 2XHFA 1FVJA 3A2WA 4WBRD 1GRXA 1TI3A 3IRAA 1MDJA 4IN0A 5IMDA 5A4VA 4TXVA 3W6GA 1GH2A 1DE1A 1ERTA 5D9TA 3UMAA 5DCGA 1GSFA 4GTUA 1C72A 2G2QA 2DIZA 4LMVA 2HE3A 4X0XA 4HDEA 3FR9A 4PNFA 4YAPA 2M80A 2BMXA 3BBYA 3F3RA 5ENUA 4Q5RA 3ZVJD 3DYRA 3I69A 5KN1A 4GQFA 4MZBA 1JZRA 4BVYA 2H6YA 1EWXA 3WT2A 4NXIA 2PWJA 4ZB6A 2H0IA 1TK8B 4FO5A 1YKAA 2YWMA 4KAEA 4OO4A 2DIYA 3FR6A 3IHQA 4AGSA 2LUSA 3RPNA 2DJ3A 5B6MA 4LA1A 2LSTA 4MP4A 4WF5A 4I8BA 2JZSA 2I3YA 1GNWA 3LWAA 2F9SA 1PX6A 1GSUA 2VLUA 4MK3A 4ML6A 2LV3A 5C04A 2X8CA 4HJ2A 1M99A 4RUVA 5EVOA 1WWJA 4PURA 2WDUA 2C3QA 1ERUA 3QR6A 3GX8A 1BAYA 4TR4A 4HJMA 2PVOC 3WGEA 2YV9A 2WFCA 2IPAA 1ACVA 1GULA 4FYCA 1EGOA 4TR1B 5CP1A 2LJAA 2L57A 1XW9A 1LBKA 5ECIB 1M0UA 2VM2A 1AQXA 1Z3EA 1F3AA 2GSQA 2X8HA 3C8EA 1SD8A 2K6VA 4TR0A 3DD3A 5IOXA 2LJRA 4IP1A 1GLPA 2G0FA 1JHBA 1GSSA 4XRAA 2OACA 4YQVA 1TK0B 1XW6A 4YAVA 2H76A 4K9ZA 1GWCA 1ML6A 2R2JA 3DVXA 1ERVA 1A0RP 2FGXA 3WD6A 2JU5A 5FHIA 1Z5YE 2FA8A 4KX4A 2F8AA 3KZQA 2H01A 2O87A 1EP7A 4O32A 5G1KA 3O76A 2NTOA 3GKKA 1VF4A 4IVFA 1XW5A 2ALBA 2Z9SA 2H0GA 1A24A 5F07A 4F2IA 3TJBA 4TOPA 6GSTA 1X9WB 2IIYA 4Z7XA 1V40A 3RAZA 5ELAA 3HXSA 3F8UA 2MMNA 4ECJA 2L59A 2RUFA 3HVXA 4L0WA 2DMLA 17GSA 2VCXA 2PN8A 1YEXA 2I4AA 1O81A 3HD5A 1A8LA 3KMNA 3KMOA 3QCPA 2VCZA 2OE3A 2F8FA 1G0TA 5HFKA 1PMTA 2AAWA 3LXZA 3TKQA 3ZZXA 1EP8A 1U88A 1PL2A 3ERGA 4HU9A 1EOGA 1X5EA 1PGTA 1XWCA 2FWEA 2YN1A 3RHBA 4KNDA 2CV4A 3PH9A 5ECPB 1XWGA 3F0IA 1WP0A 4NV2A 4F0BA 4KW6A 4EE0A 1TDIA 4BWSA 1YF1A 3L9UA 4FYBA 2XBIA 3IDVA 5A4WA 1QMVA 4DEJA 2NDOA 3Q6OA 4Q5FA 4ZBDA 3ZIJA 4OFMA 4LL4B 2WGRA 1PL1A 2AHEA 3W8JA 2QGVA 4N0VA 4K0GA 1FO5A 3QDNA 5DAKA 3OR5A 4IQ1A 3M0FA 3TKSA 2QSIA 3E9JB 2O89A 2CVDA 5HR3A 1YJ6A 1KEBA 5ABRA 2I81A 4MZWA 4MF6A 2K8SA 2JACA 1FB6A 2X64A 2FD3A 2H74A 3VWVA 2OJLA 5D93A 3F4SA 1X5CA 3O6TA 4NPBA 1X9SB 4N11A 2HXKA 1QUWA 2YCDA 3LQ7A 2HNLA 2FUG2 3WGDA 2JZRA 4MJCA 3TB2A 3GIXA 3EMPA 2V6KA 4IKHA 1NHOA 1AIUA 1AUCA 3GL3A 3EMXA 4Q5NA 3IR4A 1TK5B 2YANA 3APSA 2NBSA 2NVLA 5IMFA 4QL7A 3VK9A 4PQHA 5ECMB 1I9DA 1HNBA 4JZQA 4GLTA 5IOWA 1WPIA 3Q19A 4HQZA 3HZ8A 4K7IA 3CSHA 2E2MA 3UOMA 2REMA 4EL1A 5ID2B 4JE1A 4ZIJA 1A2LA 3KIJA 2IMIA 16GSA 1HD2A 2KHPA 2A4VA 2FWFA 1ST9A 2P5RA 2LTKA 1K3OA 5CO3A 3FZ4A 1KTEA 1THXA 2DJJA 1VF2A 2WB9A 3HY2A 3GYKA 1RW1A 1ZOFA 1M2BA 2H6ZA 1BX9A 1PN9A 2VCWA 3D4TA 3GTUB 4WF4A 5IMAA 4ID0A 4DSSA 1WJKA 4EDZA 4F9ZA 3NOFA 4HI7A 2VCTA 3ISOA 1PKZA 2KP1A 2J23A 5IMCA 2VL3A 3WGXA 1AQVA 3GH6A 1J0FA 3A5WA 2PPTA 3APOA 3S9FA 1SL1B 1AXDA 5DJMA 2DJKA 5AISA 4AF2A 2B1LA 3ERFA 5INYA 1EGRA 1UC7A 3IK7A 3ZITA 3F9UA 3ZMLA 3ZLPA 1RQMA 3BOAA 2H75A 2OBKA 3NIVA 1EV9A 3EE2A 2LKUA 3TOUA 1FVKA 3KTBA 4KDYA 4HUAA 2I1UA 3EINA 3GH9A 2F51A 3TKPA 3LEFA 4MZCA 5DDLA 3VWWA 3ZRDA 1TU8A 5JWQB 5G30A 4EXJA 1A2JA 2H1DA 3BD2A 1XZOA 5DJLA 4H86A 1Z6MA 5B7CA 2MYGA 2H71A 3BJ5A 4PGTA 1SJIA 2WS2A 3P90A 3FR3A 3UBLA 4WEYA 4TXOB 2LRTA 3ZREA 2KUCA 2LS5A 1VGLA 3MAKA 1M7TA 2YJHA 4YQMA 2GGTA 4ZL9A 2IFQA 2GQKA 1T7PB 12GSA 2VLTA 1XPVA 1G7EA 1XVQA 2DJ1A 4G9HA 14GSA 4PXOA 4F82A 3PINA 3APQA 1PX7A 1HQOA 1T3BA 4RQRA 4MF7A 3TGZA 3GKMA 1H75A 4KSOA 3HJMA 2L5LA 2GQMA 3FRCA 5CNWA 5F8BA 3FZ5A 2TIRA 3LGCA 2IMDA 1YZXA 2MZCA 1A2MA 1XOBA 4DVCA 5IO0A 5GZZB 2IJYA 4V2MA 4E8HA 2WULA 3IBHA 3D4MA 1OKTA 1M2AA 13GSA 4EUYA 19GSA 4MA9A 6GSYA 1XCCA 4PQ1A 1T1VA 3NZNA 3N9JA 1G7OA 1FHEA 5AN1A 2IMEA 4POMA 1SK1A 3KGKA 3ZTLA 1KNGA 2N5AA 4GWRA 3LYPA 3VWXA 3KP8A 2HSYA 1EEJA 4CHSA 3IK9A 2AYTA 2GVPA 1EZKA 3C7MA 4JBBA 2CZ3A 3FZAA 4MJBA 4PQIA 6GSWA 4YQUA 1OVNA 2VD0A 2V2GA 1DSBA 2YWNA 3CRTA 1AQWA 4GSNA 3F4TA 3HVSA 2B6MA 10GSA 2H1AA 1GSYA 3CRUA 3F6FA 4AJ6A 4DSRA 1K0CA 1F6MC 3QD9A 4I6XA 4MH2A 1BEDA 2E7PA 4KA0A 5F0GA 5HFGA 4TR3A 5AIVA 5G1LA 3GX0A 2GTUA 4OMVA 2DLXA 1OC9A 3QFBC 1V57A 3F3QA 3RPPA 4I5QA 2CZ2A 4TR1A 5HR1A 5HR0A 3UJ1A 1MD4A 3JCML 7GSSA 3MDKA 3A2VA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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