4F2IA

Crystal structure of glutaredoxin-like nrdh from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 21
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
21
sequence length
84
structure length
83
Chain Sequence
TVTVYTKPACVQCSATSKALDKQGIAYQKVDISLDSEARDYVMALGYLQAPVVAGNDHWSGFRPDRIKALAGAALTAHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
molecule keywords Glutaredoxin NrdH, putative
publication title The Crystal Structure of Mycobacterium tuberculosis NrdH at 0.87 A Suggests a Possible Mode of Its Activity.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 21
structure length 83
sequence length 84
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4f2iA00
1SD9A 5FWGA 3GTUA 3ISOA 4HEA2 1YZXA 1LU4A 1NSWA 1FHEA 4NHZA 2FWGA 4X1UA 5ECRB 1T3BA 3UOMA 1SK2A 3QDNA 3VURA 4PXOA 2I81A 3D5JA 5ECMB 1G7OA 4XRDA 4POKA 5DJMA 2IMIA 1EV9A 1SYRA 5ECHB 3CBUA 5A4VA 3DEXA 2H01A 3J7Yb 4EF0A 4MF5A 4WBJA 3E0UA 2X99A 3K8NA 4J56E 4AJ6A 5DALB 1SD8A 1AAZA 1VF4A 4JR6A 2C8UA 3WGEA 1UN2A 1I5GA 2IMEA 4TW5A 4HOJA 4TR3A 2A2RA 5E59A 4EXJA 5CAXA 2DC5A 4JU5A 2YWMA 2BMXA 4N30A 1M2AA 1JZWA 4DSQA 3F3RA 3QAGA 4I5QA 4EKZA 3TJBA 2K8SA 4WETA 1O73A 4HJ2A 1K3LA 5EL8A 1GSUA 3TRQA 2R37A 2JACA 2ZUPA 4ZIJA 5CRWA 1E2YA 2CA8A 2M80A 3G7JA 4HQZA 1GUKA 2HE3A 3TKSA 1JFUA 1FAAA 13GSA 22GSA 3FZ4A 5KN3A 5AGYA 2E7PA 1N2AA 5C00A 2F9SA 1MEKA 2X8HA 2ES7A 2H73A 1RW1A 2OBIA 3FW2A 2YNXA 5CYYA 4KA0A 1JZRA 1GTIA 5H5RA 4PX1A 5A4UA 1HD2A 3M1GA 1OC9A 1SU9A 4XCSA 1N8JA 1DE2A 4L0UA 3KP8A 3FK8A 3TDGA 3IDVA 2IN3A 3EC3A 2CX4A 2HZEB 3GFKA 1EP8A 3KJYA 1EZKA 4K7NA 3P2AA 3LYPA 3G7YA 1A2LA 2WGRA 4YAVA 5ECOB 5EVOA 3GH6A 2IMDA 4WF4A 3GX0A 3CMIA 4ZB6A 3RHBA 3IC4A 6GSTA 2VLUA 2PUKC 1THXA 1FO5A 4KX4A 3DVWA 2XPEA 3MAKA 2JSYA 4TR1A 4POMA 4ML6A 3HZ8A 4D73B 4NMUA 2C4JA 1F37A 5AN1A 5A5KA 1XOAA 3WD6A 4V1Ag 1PGTA 1XCCA 2PMTA 1A2MA 2K18A 2IMFA 1S3AA 2MYGA 4GWRA 1HNBA 3KZQA 1TI3A 1Y6EA 4V1Ap 4MF7A 4TKYA 1SKSB 2V6KA 3ZVJA 5J41A 5FHIA 4KNDA 4CDOA 1GUMA 2REMA 1SYXA 4P3YB 1MDJA 5KEJA 4GTUA 5IMCA 1DUGA 3HJOA 4KUNA 2LRNA 2LRTA 5DQSA 1EWXA 5G5FA 3M0FA 5J5NA 3ZMKA 3I69A 2MBSA 4MJEA 4YH2A 4PNGA 1ERUA 1R4WA 2MMOA 3UJ1A 2N5AA 3IHQA 2DJ0A 4K0NA 4KW6A 3ZITA 6GSWA 4EL1A 1M2DA 2C1YA 2YANA 4N0VA 1TRUA 2FWEA 4KGIA 1ERTA 1GSFA 5ENUA 3RPPA 1XWGA 5G1KA 2O8VB 2R5GA 3ZFLA 5D93A 1IYIA 2PBJA 1GRXA 2V6OA 3ZLPA 1AC1A 1GSDA 2AHEA 1NM3A 2PVOC 4XS4B 3FHKA 4IS0A 3O6TA 1PSQA 2AJQB 2AB6A 3TOUA 2WULA 5HR3A 5JCUA 2H8LA 1R5AA 2NBSA 3KMOA 4GSTA 3D6IA 16GSA 3Q6OA 4NHWA 2VUPA 4BVXA 2JADA 4PQ1A 1XFLA 4MDCA 4PNFA 2VD1A 2O7KA 4HS1A 4RI6A 1OAZA 1PKWA 2DJ2A 1V40A 2JU5A 2VCXA 3L0HA 4AGSA 3CTFA 4DEJA 3EU3A 3KH9A 4IKHA 3TOTA 4RQRA 3WT1A 1JLVA 2I3YA 2TRCP 3A5WA 3MDKA 2WRTA 2XHFA 4XTSA 2E0QA 1O8WA 4K7OA 4MP4A 2HSHA 5HR2A 1GUHA 2RM5A 4OFMA 4V2MA 1UVZA 1SL1B 4HI7A 5CP1A 5ECNB 2B1KA 2O85A 3S9FA 2HLSA 3QMXA 1F3AA 4N11A 3W6GA 3NZNA 3GSSA 3NIVA 5DQYA 3WGXA 2X64A 1TXXA 4ZXGA 3TGZA 5IPHA 3EINA 3KIJA 2YJHA 1G6WA 4J2FA 2HZFA 2HRFA 1AW9A 1ST9A 3HJPA 4ZL9A 3F8UA 3TJKA 4MZBA 2AV4A 4K2DA 2D2ZA 1PD21 2HXKA 1PRXA 1U3AA 2L57A 2V32A 1QMVA 4PUAA 1TU7A 2DJKA 1M9BA 2I1UA 3TKSC 5A4WA 4KE3A 2MZCA 2JZTA 4RUVA 1ZYEA 4EC0A 4NWYA 4TVEA 2K9FA 2DIZA 2GZPA 3IAM2 4I8BA 1CQHA 1MD4A 3F3QA 3JCML 7GSSA 1OE7A 4MMMA 1TU8A 3IOSA 2VL3A 2GZYA 1W4VA 2IIYA 3TKRA 3W8JA 4NPBA 2V1MA 3FEUA 2QC7A 1ML6A 1A24A 3GNJA 4IQAA 4MJAA 5IMAA 1ILOA 2YZUA 3UMAA 1V57A 10GSA 2OACA 3RDWA 4DSSB 4ISDA 3US3A 3ZL5A 5ID2B 4KDXA 4TOPA 3VFIA 3C73A 5JWQB 3HCZA 4MPFA 2J23A 4EDZA 1EV4A 2DMMA 4PQHA 2WZ9A 1F3BA 4QL9A 4HDEA 2H71A 2CT6A 2H72A 4OWYA 1Z6MA 2FUG2 3GV1A 4NAXA 2GLRA 2NDOA 2YWNA 4MPGA 3H93A 1QGVA 4GSSA 2GT5A 2C0EA 3APQA 1DE1A 5IO0A 3F4TA 3EVIA 5JWOB 1ABAA 3CSIA 5D73A 1F6MC 3LFLA 4YAPA 1O85A 1GWCA 4EDYA 1O7UA 1QUWA 3ERFA 3HHVA 3VI7A 2P0GA 4JZQA 3C8EA 4POLA 3LORA 4OO4A 1XBSA 1V98A 4TR0A 1YDKA 2C3TA 3ZRDA 1F9MA 3AY8A 1FVKA 3GKKA 1KTEA 1GULA 3PH9A 2VM1A 3WYWA 2YZHA 4KH7A 4KSOA 1O8XA 1FG4A 1O6JA 4N0ZA 3TKSE 1Q4JA 3O3TA 2XBIA 5F06A 4K7IA 1A2JA 1ERWA 3FZ5A 3KCMA 4JBBA 4OFNA 2KOKA 4OD7A 5D9TA 4PURA 2RUEA 4KDYA 3DYRA 2VL9A 2YWOA 2IJYA 1GH2A 4TN8A 5D8IA 1XWBA 2E2GA 1K3OA 5ECIB 3CXGA 3F9UA 2VOCA 2LEGA 3GL3A 3MNGA 5B8BA 1M99A 2R3XA 2YOIA 4Q5QA 4BWSA 3V1WA 3H79A 3GURA 1EEMA 4HU9A 3CTGA 3APSA 4OCFA 1XOBA 3ZZXA 1JZDA 3HVXA 2HNLA 1FOVA 1BG5A 1I9DA 1YEPA 3L9SA 2GSRA 1B48A 4OCEA 3C1SA 5LCZA 3N9JA 4IBPA 5ECSA 2WFCA 1PL2A 1YY7A 2FWHA 4BPYA 3I9V2 5KN0A 3EU4A 3KGKA 2VCTA 4QL7A 3FYGA 1XWAA 4HQSA 4XHMA 3HA9A 1PMTA 5HQPA 6GSSA 1ZOFA 3ME7A 5ELGA 4ACSA 5G5EA 1TW9A 5ECLB 1R26A 2VL2A 2L4CA 4KAEA 3FY7A 4LL1B 4PUFC 3DWVA 2E2MA 2LUSA 4KDUA 3PINA 2ON5A 2EIQA 4IHUA 4Q5RA 1X5EA 1X5DA 3IPZA 4Q5FA 5F8BA 2CV4A 3I6AA 4F0CA 5B7CA 2FLSA 3UBKA 1XW6A 2OADA 1V58A 5B6MA 4BVYA 1UA5A 5CRDA 2HSYA 3RPNA 4LMVA 4ZL8A 3VWWA 3ERGA 4WBRD 1K0BA 4ML1A 1B9YC 5DVBA 1G7EA 4JRRA 5DAKB 2GT6A 1B4PA 3KD0A 3F6DA 1WRYA 3KEBA 4X0XA 1K0DA 2LS5A 3QR6A 2DSAA 5JCGA 5D9XA 4FO5A 2M46A 3QFBC 3DVXA 2FHEA 1XWCA 4RI7A 2FWFA 3APOA 4MCUA 2R6KA 1VF3A 1GNEA 2LNSA 2K6VA 1PKZA 4XS1A 2WB9A 3KM6A 3TUEA 4WR5A 1SJZA 4XIHA 2NVLA 4BWQA 2B7JA 2L5OA 2MMAA 3F0IA 4FYCA 1PQNA 5CRHA 4ZB8A 2H1BA 4OMVA 20GSA 2KHPA 1TK0B 2GGTA 3TCOA 3TB2A 3HDCA 1F2EA 1XVWA 1U88A 1YF1A 3UAPA 1ZZYA 5IMFA 1H75A 4HJMA 2LQOA 4XRAA 4IP6A 2FCHA 1X9MB 2TIRA 2LKUA 3HVVA 2G0FA 1M7TA 3A2WA 3DGQA 3ZIVA 3ED3A 5HR0A 3QPMA 1TTZA 19GSA 5GSTA 2EIOA 3LSZA 2VCWA 2RIIA 3FKFA 1OVNA 1WIKA 3VWVA 4E8EA 3P90A 2KP2A 2H6ZA 5G30A 3GTUB 3KH7A 4EVMA 1X0RA 1MDIA 1TDIA 4YQMA 3F4RA 3A2XA 1GLQA 3ERWA 2YP6A 1O81A 3GN3A 1RK4A 3GHAA 2VCZA 3M9JA 3U5RE 4NV2A 1BYEA 3UIWA 5JWRB 3ZREA 5DJLA 2WS2A 2AYTA 4K0GA 4MH3A 2IFQA 3GYKA 3CSHA 8GSSA 2JZSA 1T8EB 3EE2A 1GSQA 2IL3A 5INYA 4LLRA 1TRSA 3L4NA 4TXOA 2J9HA 5B6NA 1ZL9A 3DXBA 2B5EA 1GSYA 1SK1A 3NOFA 1BAYA 5IIZA 1HQOA 2CZ2A 3EYTA 2B5YA 3LYKA 3KP9A 2C3QA 6GSUA 1B9XC 2CAQA 1S3DA 2H75A 2A2SA 2IWTA 2N5FA 1QQ2A 2H66A 2LQQA 1XPVA 1ZCPA 1ERVA 1TK8B 2I4AA 1OC9B 4F82A 4LL4B 4ECIA 2HFDA 1XIYA 2F3MA 5ABRA 4L5OA 3DIEA 4K9ZA 5IMZA 2HI7A 3R2QA 2YCDA 5DALA 4ECBA 2DLXA 1DBYA 5FT3A 3TRPA 5H5QA 1J9BA 2VLTA 2IMKA 4NV5A 3D4TA 5IPGA 5COHA 3QFAC 2VAFA 3P8WA 3F4SA 2YV9A 2VL2C 4TRXA 4TR1B 3L78A 1G0TA 2LTKA 2PERA 1CQGA 2VCQA 1B8XA 2P5QA 4ZB9A 5J9CA 4MABA 3QCPA 3PGTA 4Z7XA 2OKAA 3QAWA 5D96A 2OBKA 3LXZA 5HR1A 2WJUA 5J4UA 3KXOA 1YKAA 2FY6A 4WF5A 2B5XA 5EY6A 2V2GA 4LA1A 1Z3EA 3H1NA 4EO3A 1M9AA 2GSTA 3F63A 2B6MA 5F05A 5E4WA 4YQVA 2OJLA 1R5PA 1Z9HA 3WT2A 5GZZB 1RQMA 2HZEA 2L6DA 3IR4A 3HZ4A 4F03A 5L71A 1T4YA 4I6XA 2CVKA 5LNKe 4ULXA 3VK9A 3VWUA 2G2QA 4IQ1A 3E9JB 2PN8A 2GTUA 2WCIA 5CO3A 2GDRA 1EP7A 3OR5A 4MLYA 3A2VA 3QOUA 3MWHA 2H19A 3IBHA 4D73A 2H1GA 1NHYA 5IMVA 2O87A 3G7IA 1OE8A 2FA8A 3UVTA 4CW9A 2LJKA 1AUCA 3LG6A 3EWLA 2NPBA 4N10A 4PQIA 5C04A 1V2AA 1ON4A 4MH2A 1X5CA 2BTOT 2HRNA 2C0FA 2VO4A 2FNOA 5IMDA 3TRXA 2DJJA 1WMJA 3D4MA 3HXSA 3F6FA 3GH9A 1YF0A 1SJ6A 2ZNMA 3QAVA 5GAND 3HYPA 2HYXA 4V2LA 4WXTA 4HUAA 1PX7A 1BX9A 3GSTA 3VLNA 2CQ9A 5KN1A 3IK7A 2KUCA 1LBKA 4WR4A 1VF2A 1VGLA 2B7KA 5HFKA 2VD0A 1GSEA 5DBQA 3EMPA 4O7HA 1YKCA 5DDLA 4GCIA 1J0FA 4G19A 1K0NA 3TKPA 1FB0A 3GUSA 3DRNA 3O76A 2A4VA 2Z9SA 1V9WA 1A0RP 4K1FA 3UBLA 5G1LA 2QKEA 2HT9A 2QGVA 5AIVA 1JZOA 1A8LA 4XS4A 2H1AA 2LJAA 1EGOA 4WEYA 4FYUA 1GLPA 4IELA 1HNAA 3KTLA 3J7Yk 2KLXA 2RM6A 1U6TA 3W8SA 3D22A 2AAWA 1XVQA 4GRFA 4ZILA 4I97A 1Z7RA 4HZ4A 1GTBA 1WJKA 3D0ZA 4F2IA 1AQVA 2FD3A 3FR6A 1Z5YE 5DCGA 2L59A 4AJ7A 5IOXA 1WP0A 2C0GA 3BCKA 5IOWA 4OFTA 1K0MA 2CX3A 4GQFA 1YQ1A 3TJGA 3SWLA 1OC8A 4HZ2A 1M2BA 4IGJA 1VRSD 2XPDA 5ELAA 1X9SB 2ON7A 2M72A 2TRXA 3CRUA 4MF6A 3LEFA 5J3RA 3DD3A 2N5BA 3M8NA 5F07A 2CZ3A 1X9WB 2B3SA 1OKDA 2OE1A 5DCHA 3TJFA 3HVSA 2O89A 2AUVA 2L4QA 4GXZA 3TJJA 4L8EA 4TR4A 3UEMA 1EOHA 3D21A 4O92A 1SENA 4O32A 2PWJA 2PVQA 3VI5A 1B4QA 2R2JA 4Q5NA 1EGRA 6GSXA 1HYUA 4AJ8A 4AF2A 5GAPD 4MZWA 4LMWA 2YPMA 4POBA 2XC2A 3VPQA 2F51A 3I43A 4ZBBA 3IXRA 2H0IA 4FYBA 1HNCA 2B1LA 2JL4A 1WE0A 3E3EA 4FIWA 1TRWA 3N5OA 4V2NA 1VF1A 3P7XA 3C71A 3CRTA 3RBTA 1XXUA 1XWKA 2ALBA 1WPIA 3IK9A 1T1VA 3FZAA 1BEDA 4K8MA 2X8CA 2H6YA 1OKTA 3H8QA 4DSRA 3FR3A 2H30A 4DVCA 2DJ1A 4JR4A 2LJRA 1GTAA 5J9BA 2PPTA 5H5SA 3UVHA 12GSA 1MD3A 4XS6A 5AIXA 4FH8A 4G2EA 1FVJA 1XZOA 1ZGNA 2YN1A 11GSA 1FW1A 2OE0A 6GSVA 4DSSA 2L5LA 2GQKA 3GA4A 5ID2A 2FGXA 2KP1A 3LGCA 3ZVJD 5CREA 3C1RA 3WGDA 1YEXA 1A8YA 1K0AA 3HKRA 1PA3A 1R7HA 1XW5A 1LJRA 1TJDA 3UARA 5CRGA 1AIUA 3FR9A 5G2ZA 4GLTA 1NW2A 2YWIA 4MJBA 3Q18A 18GSA 3GL5A 3G9BA 1YJ6A 3EURA 1PL1A 1A0FA 2ZCTA 2DMLA 1KEBA 4ZL7A 4CHSA 1TOFA 2X8GA 2DIYA 4PGTA 3LQ7A 1SL2B 1W89A 2MMZA 3L9VA 4HU7A 4IJIA 3LJRA 1K0CA 1URMA 3BCIA 5CNWA 2H74A 3IRAA 5LD0A 4KCEA 1JLWA 4ILFA 1K3YA 2BJXA 4ECJA 2YJ7A 4IW9A 1MTCA 4O5RA 1GNWA 3PR8A 1GTUA 2VM2A 3CSJA 3TKQA 2F8FA 2DJ3A 4E8HA 1C72A 4MK3A 5AISA 1U87A 3GKMA 4F9ZA 4EUYA 2OA7A 1Z7PA 2EC4A 2K8VA 2GSSA 3BBYA 3KTBA 1H4OA 4IP1A 3ME8A 1AQWA 2C3NA 5G31A 3ZYWA 3LXTA 2H70A 3BD2A 1XW9A 2R4VA 4GSNA 1PX6A 4MJCA 5ECPB 1THOA 3CYNA 2OE3A 9GSSA 1GP1A 4BL7A 2H0GA 2GS3A 3U6VA 1EOGA 1J08A 1ZYQB 1FB6A 2CVBA 3BOAA 3QD9A 1SJIA 2F8AA 1PN9A 5IO2A 2C80A 2VLVA 4WKWA 2XBQA 3H4KA 3MSZA 2GQLA 3IAS2 2WDUA 5ECQB 14GSA 1M0UA 1KBNA 3RAZA 4ID0A 2JSZA 2P31A 2H0HA 1Y25A 3C7MA 5B8AA 2FA4A 5HFIA 1SKRB 3HD5A 5IM9A 1IYHA 4TXVA 5F0GA 4L0WA 4JEDA 4YQUA 1AXDA 3LWAA 1U3IA 4KSMA 4ZBDA 4NXIA 3A3TA 3GKNA 4J57E 3GKXA 2RLIA 4MZCA 4ECCA 2YV7A 2LRCA 3BJ5A 5ECKB 1UC7A 3IE3A 1KNGA 4G10A 4F0BA 2QSIA 2LSTA 2VCVA 5IQYA 4GQCA 2C0DA 3HY2A 2CVDA 4ZBAA 1BJXA 3ZIJA 2GVPA 3Q74A 1T4ZA 2MMNA 3DKSA 2NTOA 5D9VA 4IJ3A 4OO5A 3ZTLA 5D9WA 1DSBA 1OC3A 3GIXA 1SK0A 3ZFBA 3KMNA 1T7PB 4IN0A 17GSA 1QK8A 1K0OA 4I2UA 3VWXA 1ZMAA 4IVFA 1SL0B 1A23A 3FZ9A 2H6XA 2DBCA 2JZRA 1GL8A 1JHBA 2VIMA 4GF0A 2MBTA 3IV4A 4KB3A 5DAKA 4MA9A 1T00A 1MDKA 1TK5B 3FRCA 3DMLA 3IA1A 1BQ7A 1WWJA 2CAIA 4QQ7A 1GSSA 4RQXA 2GZZA 5HFGA 3ZMLA 4I2TA 4G9HA 6GSYA 4BA7A 2H1DA 2PGTA 1Z6NA 4JE1A 2RUFA 1S3CA 3M9KA 2LNTA 5JCWA 1TRVA 1QFNA 1SKWB 1E6BA 1Q98A 2V41A 1ACVA 3UL3A 5EPFA 3GRXA 3GMFA 2IFQB 1TKDB 1TI1A 3SBCA 1AQXA 3Q19A 1OYJA 2IPAA 3L9UA 5GSSA 4TXOB 3VPTA 4EE0A 1TP9A 3EMXA 2H76A 1EEJA 2P5RA 2LV3A 1NHOA 2GQMA 2EIRA 4H86A 2L6CA 1WOUA 1QXHA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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